RSXC - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

RSXC - Electron transport complex subunit RsxC

UniProt:	P77611	Sequences: MLKLFSAFRKNKIWDFNGGIHPPEMKTQSNGTPLRQVPLAQRFVIPLKQHIGAEGELCVSVGDKVLRGQPLTRGRGKMLPVHAPTSGTVTAIAPHSTAHPSALAELSVIIDADGEDCWIPRDGWADYRTRSREELIERIHQFGVAGLGGAGFPTGVKLQGGGDKIETLIINAAECEPYITADDRLMQDCAAQVVEGIRILAHILQPREILIGIEDNKPQAISMLRAVLADSNDISLRVIPTKYPSGGAKQLTYILTGKQVPHGGRSSDIGVLMQNVGTAYAVKRAVIDGEPITERVVTLTGEAIARPGNVWARLGTPVRHLLNDAGFCPSADQMVIMGGPLMGFTLPWLDVPVVKITNCLLAPSANELGEPQEEQSCIRCSACADACPADLLPQQLYWFSKGQQHDKATTHNIADCIECGACAWVCPSNIPLVQYFRQEKAEIAAIRQEEKRAAEAKARFEARQARLEREKAARLERHKSAAVQPAAKDKDAIAAALARVKEKQAQATQPIVIKAGERPDNSAIIAAREARKAQARAKQAELQQTNDAATVADPRKTAVEAAIARAKARKLEQQQANAEPEQQVDPRKAAVEAAIARAKARKLEQQQANAEPEEQVDPRKAAVEAAIARAKARKLEQQQANAEPEQQVDPRKAAVEAAIARAKARKREQQPANAEPEEQVDPRKAAVEAAIARAKARKLEQQQANAVPEEQVDPRKAAVAAAIARAQAKKAAQQKVVNED	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13935
Length:	740 (661)
Sequences:	313 (209)
Seq/√Len:	8.1

ECOLI - RSXC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
89_V	110_I	5.580	1.00
248_A	266_S	4.661	0.99
284_R	290_E	4.447	0.99
239_I	254_I	4.293	0.98
353_V	357_T	4.206	0.98
119_I	289_G	3.978	0.97
399_F	404_Q	3.709	0.96
601_R	665_R	3.257	0.92
636_E	668_E	2.999	0.88
606_Q	638_Q	2.992	0.88
409_T	447_R	2.984	0.88
463_R	467_L	2.973	0.87
614_E	646_Q	2.923	0.87
45_I	314_L	2.885	0.86
253_Y	259_Q	2.862	0.85
637_Q	669_Q	2.851	0.85
85_T	112_A	2.845	0.85
638_Q	670_Q	2.806	0.84
283_K	288_D	2.788	0.84
24_E	216_N	2.776	0.83
25_M	28_Q	2.739	0.83
248_A	265_R	2.718	0.82
172_A	212_G	2.668	0.81
615_Q	647_Q	2.628	0.80
30_N	184_R	2.617	0.79
520_D	528_R	2.607	0.79
64_K	117_C	2.607	0.79
622_A	626_A	2.550	0.78
604_E	668_E	2.524	0.77
528_R	532_K	2.517	0.77
524_I	529_E	2.480	0.76
601_R	633_R	2.469	0.75
628_A	634_K	2.446	0.74
40_A	43_F	2.382	0.72
617_D	621_A	2.369	0.72
617_D	620_K	2.362	0.72
565_R	569_R	2.347	0.71
620_K	623_V	2.342	0.71
63_D	69_Q	2.339	0.71
173_A	239_I	2.245	0.68
591_V	655_V	2.200	0.66
187_Q	219_Q	2.199	0.66
616_V	648_V	2.188	0.66
627_I	631_K	2.177	0.65
147_L	356_I	2.174	0.65
304_I	325_A	2.149	0.64
629_R	634_K	2.138	0.64
318_V	351_V	2.124	0.63
625_A	629_R	2.111	0.63
630_A	634_K	2.077	0.61
67_R	293_T	2.062	0.61
170_I	279_A	2.061	0.61
479_K	482_A	2.047	0.60
399_F	402_G	2.038	0.60
620_K	628_A	2.029	0.59
166_E	207_R	2.027	0.59
561_A	570_K	2.020	0.59
559_V	565_R	2.020	0.59
97_T	107_S	2.014	0.59
180_T	216_N	2.008	0.59
590_A	654_A	2.005	0.58
553_D	557_T	2.000	0.58
521_N	531_R	1.979	0.57
561_A	565_R	1.971	0.57
629_R	632_A	1.967	0.57
521_N	528_R	1.956	0.56
40_A	313_R	1.952	0.56
654_A	664_A	1.932	0.56
587_R	651_R	1.920	0.55
659_I	663_K	1.909	0.55
259_Q	424_W	1.899	0.54
621_A	628_A	1.896	0.54
619_R	651_R	1.886	0.54
574_Q	606_Q	1.858	0.52
341_L	356_I	1.854	0.52
561_A	568_A	1.845	0.52
606_Q	670_Q	1.844	0.52
151_G	356_I	1.840	0.52
266_S	356_I	1.832	0.51
583_Q	647_Q	1.826	0.51
206_P	482_A	1.816	0.51
524_I	527_A	1.809	0.50
565_R	568_A	1.804	0.50
60_S	63_D	1.796	0.50
620_K	634_K	1.789	0.50
583_Q	615_Q	1.786	0.49
304_I	310_V	1.776	0.49
633_R	665_R	1.776	0.49
625_A	632_A	1.776	0.49
126_D	129_T	1.769	0.49
640_A	672_A	1.753	0.48
45_I	110_I	1.750	0.48
605_Q	637_Q	1.747	0.48
299_L	310_V	1.744	0.48
619_R	633_R	1.738	0.48
498_A	502_E	1.730	0.47
608_A	640_A	1.715	0.47
494_A	498_A	1.713	0.46
575_Q	607_Q	1.709	0.46
397_Y	400_S	1.707	0.46
618_P	621_A	1.700	0.46
397_Y	401_K	1.698	0.46
91_A	95_H	1.693	0.46
562_A	565_R	1.693	0.46
608_A	672_A	1.691	0.46
625_A	634_K	1.682	0.45
593_A	597_R	1.681	0.45
493_I	499_R	1.680	0.45
621_A	626_A	1.671	0.45
624_E	628_A	1.667	0.45
629_R	633_R	1.666	0.45
264_G	268_D	1.651	0.44
604_E	636_E	1.648	0.44
627_I	659_I	1.639	0.43
622_A	633_R	1.637	0.43
147_L	248_A	1.636	0.43
38_P	324_D	1.625	0.43
404_Q	479_K	1.623	0.43
248_A	252_T	1.618	0.43
607_Q	639_Q	1.614	0.42
561_A	569_R	1.599	0.42
565_R	570_K	1.596	0.42
30_N	187_Q	1.594	0.42
337_M	344_F	1.593	0.42
266_S	341_L	1.589	0.41
559_V	563_I	1.583	0.41
43_F	313_R	1.578	0.41
622_A	625_A	1.553	0.40
528_R	536_R	1.551	0.40
45_I	81_V	1.546	0.40
563_I	567_K	1.546	0.40
609_N	673_N	1.535	0.39
499_R	504_Q	1.533	0.39
582_Q	614_E	1.527	0.39
628_A	631_K	1.525	0.39
335_V	493_I	1.525	0.39
491_D	504_Q	1.518	0.39
617_D	622_A	1.511	0.38
620_K	624_E	1.507	0.38
172_A	360_L	1.507	0.38
399_F	411_H	1.500	0.38
212_G	255_L	1.499	0.38
624_E	627_I	1.498	0.38
524_I	528_R	1.498	0.38
661_R	666_K	1.497	0.38
524_I	531_R	1.487	0.37
476_E	480_S	1.485	0.37
559_V	569_R	1.485	0.37
35_R	308_G	1.483	0.37
558_A	568_A	1.481	0.37
525_I	529_E	1.478	0.37
181_A	421_A	1.475	0.37
618_P	650_P	1.470	0.37
558_A	569_R	1.467	0.37
282_V	404_Q	1.466	0.37
617_D	628_A	1.466	0.37
90_T	111_D	1.466	0.37
620_K	627_I	1.458	0.36
228_L	236_L	1.453	0.36
621_A	629_R	1.451	0.36
627_I	633_R	1.449	0.36
173_A	438_Q	1.442	0.36
392_L	436_F	1.441	0.36
135_L	203_I	1.435	0.35
158_L	447_R	1.431	0.35
592_E	656_E	1.423	0.35
620_K	632_A	1.418	0.35
625_A	630_A	1.414	0.35
566_A	569_R	1.413	0.35
587_R	619_R	1.413	0.35
554_P	557_T	1.401	0.34
119_I	123_G	1.399	0.34
623_V	628_A	1.395	0.34
620_K	626_A	1.395	0.34
559_V	562_A	1.387	0.34
660_A	663_K	1.381	0.33
57_L	311_W	1.378	0.33
147_L	266_S	1.376	0.33
212_G	411_H	1.367	0.33
559_V	568_A	1.366	0.33
266_S	444_A	1.361	0.33
121_R	289_G	1.359	0.33
646_Q	649_D	1.351	0.32
497_L	501_K	1.351	0.32
131_S	314_L	1.345	0.32
497_L	503_K	1.344	0.32
626_A	630_A	1.342	0.32
42_R	93_A	1.334	0.32
528_R	531_R	1.332	0.32
98_A	354_V	1.316	0.31
442_E	449_E	1.312	0.31
560_E	567_K	1.310	0.31
582_Q	646_Q	1.310	0.31
569_R	601_R	1.308	0.31
47_L	326_G	1.307	0.31
559_V	566_A	1.304	0.31
194_V	228_L	1.303	0.31
621_A	625_A	1.302	0.31
626_A	632_A	1.300	0.30
626_A	634_K	1.296	0.30
225_R	360_L	1.288	0.30
252_T	266_S	1.287	0.30
305_A	326_G	1.280	0.30
198_R	234_I	1.276	0.30
493_I	504_Q	1.274	0.30
299_L	304_I	1.267	0.29
524_I	542_L	1.263	0.29
336_I	400_S	1.263	0.29
623_V	626_A	1.261	0.29
528_R	542_L	1.260	0.29
304_I	307_P	1.257	0.29
657_A	664_A	1.255	0.29
627_I	634_K	1.253	0.29
228_L	455_E	1.250	0.29
624_E	634_K	1.248	0.29
617_D	634_K	1.247	0.29
547_D	605_Q	1.247	0.29
624_E	629_R	1.241	0.28
283_K	287_I	1.241	0.28
619_R	634_K	1.226	0.28
405_H	439_E	1.226	0.28
625_A	631_K	1.220	0.28
658_A	663_K	1.218	0.28
57_L	108_V	1.215	0.28
271_V	326_G	1.211	0.27
626_A	629_R	1.208	0.27
39_L	114_G	1.206	0.27
522_S	528_R	1.206	0.27
598_A	662_A	1.202	0.27
94_P	139_I	1.201	0.27
626_A	633_R	1.197	0.27
560_E	565_R	1.197	0.27
248_A	356_I	1.191	0.27
89_V	210_L	1.189	0.27
621_A	634_K	1.187	0.27
605_Q	669_Q	1.185	0.27
491_D	495_A	1.183	0.27
622_A	631_K	1.175	0.26
170_I	197_I	1.175	0.26
34_L	67_R	1.171	0.26
8_F	11_N	1.169	0.26
38_P	320_H	1.164	0.26
84_P	312_A	1.164	0.26
210_L	337_M	1.163	0.26
624_E	632_A	1.161	0.26
602_K	666_K	1.158	0.26
656_E	663_K	1.157	0.26
562_A	566_A	1.152	0.26
96_S	348_W	1.152	0.26
650_P	654_A	1.151	0.26
639_Q	671_P	1.148	0.25
84_P	90_T	1.146	0.25
620_K	635_L	1.146	0.25
255_L	346_L	1.142	0.25
567_K	570_K	1.142	0.25
277_G	395_Q	1.142	0.25
657_A	662_A	1.141	0.25
650_P	653_A	1.137	0.25
587_R	602_K	1.136	0.25
124_W	138_R	1.135	0.25
327_F	363_P	1.134	0.25
356_I	400_S	1.131	0.25
603_L	635_L	1.131	0.25
564_A	568_A	1.130	0.25
622_A	629_R	1.129	0.25
558_A	562_A	1.127	0.25
31_G	89_V	1.127	0.25
266_S	271_V	1.125	0.25
23_P	286_V	1.124	0.25
271_V	356_I	1.124	0.25
553_D	562_A	1.124	0.25
499_R	503_K	1.124	0.25
165_I	209_I	1.119	0.25
24_E	180_T	1.117	0.24
188_D	198_R	1.115	0.24
525_I	530_A	1.112	0.24
634_K	637_Q	1.111	0.24
518_R	560_E	1.111	0.24
617_D	625_A	1.107	0.24
522_S	531_R	1.106	0.24
662_A	665_R	1.104	0.24
37_V	310_V	1.104	0.24
72_T	311_W	1.099	0.24
536_R	542_L	1.096	0.24
360_L	546_N	1.095	0.24
170_I	404_Q	1.092	0.24
75_R	404_Q	1.090	0.24
10_K	252_T	1.087	0.24
625_A	628_A	1.086	0.24
147_L	407_K	1.086	0.24
198_R	265_R	1.081	0.23
658_A	662_A	1.080	0.23
521_N	529_E	1.079	0.23
66_L	139_I	1.079	0.23
269_I	469_R	1.077	0.23
188_D	258_K	1.075	0.23
296_V	311_W	1.074	0.23
558_A	561_A	1.069	0.23
619_R	622_A	1.069	0.23
655_V	662_A	1.068	0.23
591_V	623_V	1.067	0.23
493_I	497_L	1.067	0.23
121_R	290_E	1.066	0.23
172_A	186_M	1.066	0.23
165_I	450_E	1.065	0.23
43_F	112_A	1.063	0.23
658_A	665_R	1.063	0.23
39_L	375_Q	1.062	0.23
252_T	341_L	1.061	0.23
294_E	311_W	1.060	0.23
404_Q	436_F	1.059	0.23
624_E	631_K	1.056	0.23
625_A	633_R	1.052	0.23
617_D	626_A	1.052	0.23
43_F	84_P	1.052	0.23
548_A	552_A	1.051	0.23
654_A	658_A	1.050	0.22
545_T	560_E	1.049	0.22
201_A	209_I	1.048	0.22
595_I	659_I	1.045	0.22
600_A	664_A	1.042	0.22
620_K	625_A	1.037	0.22
528_R	540_A	1.036	0.22
57_L	72_T	1.034	0.22
197_I	206_P	1.033	0.22
23_P	38_P	1.033	0.22
281_A	292_I	1.032	0.22
628_A	632_A	1.032	0.22
247_G	449_E	1.029	0.22
381_S	385_D	1.026	0.22
560_E	592_E	1.025	0.22
652_K	666_K	1.023	0.22
178_Y	367_E	1.023	0.22
491_D	498_A	1.020	0.22
491_D	499_R	1.018	0.22
659_I	665_R	1.017	0.22
357_T	406_D	1.015	0.21
187_Q	471_K	1.015	0.21
77_K	212_G	1.013	0.21
406_D	579_E	1.010	0.21
42_R	95_H	1.008	0.21
611_E	639_Q	1.008	0.21
617_D	629_R	1.007	0.21
172_A	253_Y	1.005	0.21
620_K	629_R	1.005	0.21
112_A	313_R	1.004	0.21
189_C	404_Q	0.998	0.21
520_D	532_K	0.995	0.21
619_R	631_K	0.995	0.21
621_A	630_A	0.994	0.21
649_D	652_K	0.993	0.21
560_E	564_A	0.993	0.21
314_L	501_K	0.992	0.21
107_S	463_R	0.991	0.21
224_L	353_V	0.990	0.21
88_T	100_P	0.988	0.21
596_A	603_L	0.988	0.21
626_A	631_K	0.983	0.21
147_L	228_L	0.982	0.21
421_A	436_F	0.982	0.21
594_A	598_A	0.981	0.21
618_P	628_A	0.979	0.21
110_I	125_A	0.979	0.21
57_L	79_L	0.976	0.20
213_I	312_A	0.975	0.20
25_M	30_N	0.974	0.20
48_K	381_S	0.973	0.20
147_L	405_H	0.970	0.20
655_V	661_R	0.966	0.20
42_R	305_A	0.966	0.20
527_A	531_R	0.964	0.20
656_E	665_R	0.963	0.20
294_E	381_S	0.963	0.20
124_W	130_R	0.959	0.20
629_R	637_Q	0.957	0.20
559_V	567_K	0.956	0.20
628_A	637_Q	0.955	0.20
127_Y	202_H	0.954	0.20
655_V	666_K	0.953	0.20
267_S	286_V	0.947	0.20
337_M	360_L	0.947	0.20
558_A	565_R	0.943	0.20
21_H	240_P	0.942	0.20
93_A	109_I	0.940	0.19
300_T	307_P	0.937	0.19
655_V	658_A	0.936	0.19
121_R	310_V	0.930	0.19
622_A	632_A	0.930	0.19
361_L	454_A	0.927	0.19
529_E	542_L	0.927	0.19
40_A	45_I	0.922	0.19
253_Y	463_R	0.920	0.19
158_L	429_N	0.917	0.19
478_H	481_A	0.915	0.19
651_R	662_A	0.912	0.19
247_G	433_V	0.911	0.19
588_K	602_K	0.911	0.19
224_L	450_E	0.907	0.19
433_V	436_F	0.903	0.19
67_R	313_R	0.902	0.19
520_D	531_R	0.901	0.18
563_I	569_R	0.901	0.18
619_R	630_A	0.900	0.18
337_M	357_T	0.899	0.18
318_V	346_L	0.898	0.18
200_L	279_A	0.898	0.18
248_A	341_L	0.896	0.18
656_E	664_A	0.896	0.18
45_I	335_V	0.895	0.18
24_E	274_Q	0.895	0.18
194_V	234_I	0.894	0.18
550_T	554_P	0.893	0.18
552_A	558_A	0.891	0.18
557_T	561_A	0.891	0.18
657_A	660_A	0.890	0.18
553_D	559_V	0.890	0.18
319_R	350_D	0.889	0.18
658_A	661_R	0.889	0.18
499_R	597_R	0.888	0.18
84_P	314_L	0.887	0.18
436_F	439_E	0.886	0.18
172_A	471_K	0.883	0.18
585_D	588_K	0.882	0.18
49_Q	443_I	0.879	0.18
95_H	109_I	0.879	0.18
102_A	107_S	0.878	0.18
619_R	627_I	0.875	0.18
191_A	226_A	0.873	0.18
399_F	494_A	0.872	0.18
586_P	589_A	0.871	0.18
327_F	333_Q	0.871	0.18
55_G	72_T	0.870	0.18
621_A	624_E	0.870	0.18
536_R	539_Q	0.868	0.18
31_G	63_D	0.867	0.18
584_V	648_V	0.864	0.18
142_F	401_K	0.864	0.18
226_A	229_A	0.864	0.18
248_A	444_A	0.864	0.18
51_I	382_A	0.864	0.18
40_A	312_A	0.862	0.18
623_V	634_K	0.860	0.17
560_E	566_A	0.859	0.17
16_F	253_Y	0.858	0.17
453_A	526_A	0.856	0.17
656_E	661_R	0.855	0.17
622_A	628_A	0.854	0.17
649_D	654_A	0.853	0.17
102_A	327_F	0.851	0.17
590_A	600_A	0.850	0.17
521_N	524_I	0.850	0.17
595_I	600_A	0.849	0.17
23_P	145_A	0.844	0.17
481_A	485_P	0.844	0.17
195_E	198_R	0.844	0.17
215_D	241_T	0.843	0.17
29_S	216_N	0.842	0.17
337_M	399_F	0.842	0.17
28_Q	302_E	0.838	0.17
110_I	357_T	0.837	0.17
84_P	279_A	0.832	0.17
559_V	564_A	0.831	0.17
332_D	363_P	0.830	0.17
554_P	558_A	0.828	0.17
44_V	286_V	0.828	0.17
257_G	278_T	0.827	0.17
412_N	436_F	0.825	0.17
20_I	245_S	0.825	0.17
519_P	530_A	0.821	0.17
96_S	163_D	0.821	0.17
572_E	604_E	0.820	0.17
121_R	477_R	0.820	0.17
151_G	212_G	0.819	0.17
563_I	566_A	0.819	0.17
524_I	530_A	0.818	0.17
16_F	173_A	0.817	0.16
20_I	293_T	0.816	0.16
548_A	551_V	0.816	0.16
20_I	145_A	0.814	0.16
154_T	282_V	0.813	0.16
147_L	444_A	0.812	0.16
103_L	474_R	0.811	0.16
354_V	400_S	0.810	0.16
600_A	604_E	0.806	0.16
620_K	631_K	0.806	0.16
560_E	569_R	0.805	0.16
654_A	659_I	0.804	0.16
29_S	187_Q	0.803	0.16
652_K	660_A	0.803	0.16
562_A	569_R	0.803	0.16
340_P	356_I	0.802	0.16
144_V	282_V	0.801	0.16
151_G	421_A	0.801	0.16
77_K	411_H	0.800	0.16
405_H	438_Q	0.799	0.16
356_I	452_R	0.799	0.16
39_L	364_S	0.798	0.16
409_T	473_A	0.798	0.16
84_P	313_R	0.797	0.16
664_A	668_E	0.794	0.16
617_D	630_A	0.794	0.16
310_V	348_W	0.793	0.16
660_A	664_A	0.791	0.16
569_R	572_E	0.790	0.16
548_A	562_A	0.790	0.16
34_L	45_I	0.789	0.16
167_T	485_P	0.788	0.16
562_A	567_K	0.787	0.16
529_E	538_K	0.787	0.16
151_G	181_A	0.787	0.16
558_A	566_A	0.785	0.16
476_E	479_K	0.785	0.16
623_V	627_I	0.783	0.16
296_V	553_D	0.783	0.16
573_Q	605_Q	0.777	0.16
51_I	78_M	0.777	0.16
623_V	635_L	0.777	0.16
421_A	478_H	0.776	0.16
559_V	570_K	0.776	0.16
44_V	475_L	0.775	0.16
604_E	663_K	0.775	0.16
655_V	663_K	0.772	0.15
151_G	433_V	0.772	0.15
351_V	361_L	0.772	0.15
335_V	411_H	0.772	0.15
110_I	502_E	0.771	0.15
307_P	404_Q	0.770	0.15
606_Q	610_A	0.770	0.15
7_A	11_N	0.769	0.15
144_V	360_L	0.768	0.15
538_K	542_L	0.768	0.15
172_A	213_I	0.767	0.15
102_A	144_V	0.767	0.15
282_V	463_R	0.766	0.15
37_V	193_V	0.763	0.15
370_E	385_D	0.761	0.15
165_I	249_K	0.761	0.15
43_F	85_T	0.759	0.15
158_L	257_G	0.759	0.15
200_L	265_R	0.759	0.15
110_I	187_Q	0.757	0.15
45_I	84_P	0.756	0.15
561_A	564_A	0.756	0.15
528_R	534_Q	0.756	0.15
248_A	439_E	0.755	0.15
617_D	624_E	0.755	0.15
302_E	464_Q	0.755	0.15
520_D	524_I	0.754	0.15
532_K	536_R	0.754	0.15
307_P	325_A	0.753	0.15
553_D	565_R	0.753	0.15
89_V	124_W	0.752	0.15
561_A	567_K	0.751	0.15
641_N	670_Q	0.751	0.15
108_V	470_E	0.751	0.15
662_A	666_K	0.751	0.15
38_P	105_E	0.750	0.15
71_L	474_R	0.750	0.15
120_P	605_Q	0.750	0.15
155_G	227_V	0.750	0.15
266_S	439_E	0.747	0.15
222_S	225_R	0.746	0.15
167_T	411_H	0.746	0.15
151_G	172_A	0.745	0.15
408_A	438_Q	0.744	0.15
609_N	672_A	0.744	0.15
108_V	219_Q	0.744	0.15
618_P	629_R	0.743	0.15
660_A	666_K	0.743	0.15
471_K	480_S	0.743	0.15
655_V	660_A	0.742	0.15
570_K	573_Q	0.741	0.15
607_Q	671_P	0.740	0.15
13_I	239_I	0.740	0.15
89_V	370_E	0.740	0.15
558_A	563_I	0.739	0.15
156_V	248_A	0.738	0.15
147_L	308_G	0.738	0.15
181_A	442_E	0.736	0.15
553_D	558_A	0.735	0.15
596_A	600_A	0.733	0.15
23_P	77_K	0.732	0.15
160_G	462_A	0.732	0.15
184_R	308_G	0.732	0.15
56_E	254_I	0.731	0.15
135_L	160_G	0.729	0.15
72_T	481_A	0.727	0.15
278_T	414_A	0.727	0.15
116_D	313_R	0.727	0.15
181_A	274_Q	0.726	0.15
251_L	437_R	0.724	0.14
282_V	351_V	0.724	0.14
159_Q	318_V	0.723	0.14
562_A	571_L	0.723	0.14
353_V	488_K	0.722	0.14
110_I	222_S	0.721	0.14
360_L	487_A	0.721	0.14
633_R	637_Q	0.721	0.14
201_A	353_V	0.720	0.14
181_A	277_G	0.720	0.14
337_M	346_L	0.720	0.14
248_A	313_R	0.719	0.14
371_P	463_R	0.717	0.14
266_S	340_P	0.715	0.14
353_V	540_A	0.715	0.14
651_R	655_V	0.715	0.14
620_K	633_R	0.714	0.14
45_I	502_E	0.714	0.14
517_E	529_E	0.714	0.14
551_V	559_V	0.713	0.14
591_V	602_K	0.713	0.14
74_G	470_E	0.711	0.14
88_T	111_D	0.711	0.14
623_V	630_A	0.711	0.14
651_R	666_K	0.710	0.14
659_I	664_A	0.710	0.14
398_W	407_K	0.710	0.14
656_E	660_A	0.710	0.14
172_A	277_G	0.710	0.14
73_R	473_A	0.708	0.14
617_D	633_R	0.706	0.14
216_N	475_L	0.705	0.14
199_I	505_A	0.704	0.14
436_F	475_L	0.703	0.14
85_T	238_V	0.702	0.14
404_Q	408_A	0.701	0.14
51_I	421_A	0.698	0.14
102_A	563_I	0.698	0.14
652_K	663_K	0.698	0.14
158_L	475_L	0.697	0.14
619_R	626_A	0.693	0.14
617_D	623_V	0.693	0.14
273_M	474_R	0.692	0.14
529_E	536_R	0.691	0.14
592_E	600_A	0.690	0.14
568_A	571_L	0.690	0.14
618_P	622_A	0.688	0.14
619_R	625_A	0.687	0.14
145_A	462_A	0.686	0.14
25_M	184_R	0.686	0.14
528_R	561_A	0.686	0.14
657_A	661_R	0.682	0.14
463_R	469_R	0.682	0.14
156_V	446_I	0.682	0.14
550_T	558_A	0.682	0.14
34_L	450_E	0.682	0.14
29_S	300_T	0.681	0.14
529_E	539_Q	0.681	0.14
144_V	472_A	0.679	0.14
593_A	600_A	0.679	0.14
117_C	128_R	0.679	0.14
454_A	653_A	0.677	0.14
550_T	557_T	0.677	0.14
156_V	165_I	0.677	0.14
552_A	555_R	0.676	0.14
266_S	313_R	0.675	0.13
628_A	633_R	0.674	0.13
271_V	314_L	0.674	0.13
210_L	494_A	0.673	0.13
28_Q	269_I	0.673	0.13
170_I	209_I	0.672	0.13
273_M	481_A	0.672	0.13
124_W	287_I	0.672	0.13
108_V	490_K	0.670	0.13
97_T	104_A	0.669	0.13
89_V	121_R	0.667	0.13
623_V	629_R	0.667	0.13
628_A	635_L	0.667	0.13
521_N	525_I	0.665	0.13
258_K	318_V	0.664	0.13
262_H	271_V	0.664	0.13
551_V	554_P	0.664	0.13
652_K	658_A	0.663	0.13
603_L	667_R	0.661	0.13
274_Q	277_G	0.661	0.13
13_I	495_A	0.660	0.13
656_E	659_I	0.657	0.13
17_N	476_E	0.656	0.13
51_I	249_K	0.656	0.13
264_G	469_R	0.655	0.13
403_Q	479_K	0.655	0.13
257_G	308_G	0.655	0.13
254_I	589_A	0.652	0.13
265_R	439_E	0.651	0.13
203_I	409_T	0.651	0.13
608_A	611_E	0.650	0.13
55_G	98_A	0.650	0.13
13_I	254_I	0.649	0.13
72_T	273_M	0.648	0.13
118_W	460_F	0.648	0.13
441_A	474_R	0.648	0.13
20_I	462_A	0.648	0.13
357_T	476_E	0.647	0.13
654_A	657_A	0.647	0.13
115_E	128_R	0.647	0.13
267_S	384_A	0.647	0.13
536_R	558_A	0.647	0.13
255_L	321_L	0.646	0.13
414_A	443_I	0.646	0.13
519_P	528_R	0.645	0.13
654_A	663_K	0.644	0.13
552_A	556_K	0.644	0.13
144_V	406_D	0.642	0.13
527_A	530_A	0.642	0.13
363_P	367_E	0.642	0.13
17_N	253_Y	0.641	0.13
548_A	557_T	0.641	0.13
13_I	85_T	0.640	0.13
508_T	574_Q	0.640	0.13
228_L	405_H	0.639	0.13
61_V	91_A	0.639	0.13
27_T	310_V	0.637	0.13
630_A	633_R	0.637	0.13
228_L	272_L	0.636	0.13
306_R	389_A	0.634	0.13
13_I	76_G	0.633	0.13
282_V	667_R	0.633	0.13
595_I	627_I	0.633	0.13
565_R	571_L	0.631	0.13
24_E	300_T	0.631	0.13
44_V	107_S	0.630	0.13
318_V	457_K	0.630	0.13
655_V	664_A	0.630	0.13
172_A	181_A	0.629	0.13
441_A	455_E	0.629	0.13
158_L	484_Q	0.629	0.13
530_A	533_A	0.629	0.13
279_A	463_R	0.628	0.13
462_A	503_K	0.628	0.13
382_A	399_F	0.628	0.13
189_C	279_A	0.628	0.13
172_A	206_P	0.628	0.13
216_N	300_T	0.627	0.13
593_A	598_A	0.627	0.13
96_S	463_R	0.627	0.13
17_N	390_D	0.623	0.13
572_E	581_E	0.622	0.13
548_A	558_A	0.622	0.13
47_L	448_Q	0.622	0.13
208_E	235_S	0.622	0.13
400_S	408_A	0.622	0.13
34_L	252_T	0.621	0.12
181_A	266_S	0.621	0.12
496_A	499_R	0.621	0.12
44_V	110_I	0.620	0.12
9_R	208_E	0.620	0.12
211_I	254_I	0.619	0.12
529_E	532_K	0.618	0.12
665_R	670_Q	0.618	0.12
55_G	105_E	0.617	0.12
273_M	478_H	0.617	0.12
297_V	438_Q	0.617	0.12
100_P	400_S	0.616	0.12
43_F	79_L	0.616	0.12
72_T	297_V	0.616	0.12
187_Q	221_I	0.616	0.12
619_R	628_A	0.615	0.12
429_N	439_E	0.615	0.12
526_A	530_A	0.615	0.12
158_L	414_A	0.613	0.12
37_V	224_L	0.613	0.12
67_R	85_T	0.613	0.12
297_V	480_S	0.613	0.12
156_V	399_F	0.613	0.12
64_K	88_T	0.612	0.12
311_W	474_R	0.612	0.12
612_P	615_Q	0.610	0.12
554_P	563_I	0.610	0.12
20_I	74_G	0.609	0.12
25_M	302_E	0.609	0.12
283_K	290_E	0.608	0.12
623_V	655_V	0.607	0.12
584_V	616_V	0.606	0.12
235_S	348_W	0.605	0.12
27_T	193_V	0.604	0.12
308_G	346_L	0.604	0.12
192_Q	436_F	0.604	0.12
392_L	433_V	0.603	0.12
20_I	25_M	0.601	0.12
11_N	592_E	0.600	0.12
384_A	408_A	0.600	0.12
129_T	405_H	0.599	0.12
212_G	433_V	0.598	0.12
293_T	369_G	0.598	0.12
197_I	482_A	0.598	0.12
7_A	167_T	0.596	0.12
345_T	421_A	0.596	0.12
579_E	612_P	0.596	0.12
108_V	553_D	0.596	0.12
632_A	635_L	0.596	0.12
521_N	527_A	0.596	0.12
209_I	234_I	0.595	0.12
17_N	400_S	0.595	0.12
311_W	478_H	0.595	0.12
173_A	297_V	0.593	0.12
570_K	634_K	0.593	0.12
90_T	110_I	0.593	0.12
10_K	452_R	0.592	0.12
97_T	105_E	0.592	0.12
75_R	386_A	0.592	0.12
651_R	656_E	0.591	0.12
617_D	638_Q	0.590	0.12
583_Q	616_V	0.590	0.12
618_P	631_K	0.589	0.12
334_M	368_L	0.589	0.12
280_Y	381_S	0.589	0.12
134_E	353_V	0.587	0.12
402_G	411_H	0.587	0.12
363_P	493_I	0.586	0.12
248_A	267_S	0.585	0.12
14_W	327_F	0.584	0.12
312_A	587_R	0.584	0.12
80_P	172_A	0.584	0.12
144_V	413_I	0.584	0.12
39_L	43_F	0.583	0.12
23_P	193_V	0.583	0.12
237_R	423_A	0.582	0.12
518_R	525_I	0.582	0.12
114_G	313_R	0.582	0.12
239_I	456_A	0.581	0.12
563_I	570_K	0.581	0.12
658_A	666_K	0.581	0.12
79_L	125_A	0.581	0.12
136_I	203_I	0.581	0.12
586_P	650_P	0.580	0.12
93_A	319_R	0.578	0.12
335_V	349_L	0.577	0.12
543_Q	551_V	0.576	0.12
107_S	224_L	0.574	0.12
626_A	637_Q	0.573	0.12
112_A	449_E	0.572	0.12
333_Q	408_A	0.572	0.12
15_D	242_K	0.571	0.12
260_V	274_Q	0.570	0.12
142_F	227_V	0.570	0.12
47_L	413_I	0.570	0.12
223_M	227_V	0.569	0.12
627_I	630_A	0.569	0.12
436_F	444_A	0.569	0.12
598_A	607_Q	0.569	0.12
621_A	632_A	0.568	0.12
67_R	314_L	0.568	0.12
227_V	340_P	0.568	0.12
397_Y	531_R	0.568	0.12
17_N	259_Q	0.567	0.12
221_I	323_N	0.567	0.12
189_C	399_F	0.567	0.12
48_K	382_A	0.566	0.12
531_R	537_A	0.566	0.12
561_A	566_A	0.565	0.12
17_N	170_I	0.565	0.12
653_A	666_K	0.564	0.11
268_D	469_R	0.563	0.11
173_A	228_L	0.563	0.11
173_A	408_A	0.562	0.11
127_Y	192_Q	0.562	0.11
312_A	443_I	0.560	0.11
10_K	79_L	0.560	0.11
519_P	525_I	0.558	0.11
144_V	560_E	0.558	0.11
457_K	565_R	0.558	0.11
310_V	381_S	0.558	0.11
209_I	354_V	0.558	0.11
527_A	542_L	0.558	0.11
131_S	134_E	0.558	0.11
165_I	319_R	0.557	0.11
632_A	637_Q	0.556	0.11
23_P	271_V	0.555	0.11
336_I	363_P	0.554	0.11
329_P	564_A	0.554	0.11
167_T	210_L	0.553	0.11
194_V	296_V	0.553	0.11
202_H	264_G	0.553	0.11
529_E	548_A	0.553	0.11
247_G	392_L	0.552	0.11
156_V	266_S	0.552	0.11
535_A	590_A	0.551	0.11
396_L	436_F	0.551	0.11
248_A	335_V	0.548	0.11
321_L	453_A	0.546	0.11
279_A	404_Q	0.546	0.11
441_A	497_L	0.546	0.11
107_S	502_E	0.546	0.11
557_T	562_A	0.546	0.11
624_E	670_Q	0.545	0.11
519_P	537_A	0.545	0.11
369_G	452_R	0.543	0.11
284_R	288_D	0.543	0.11
79_L	311_W	0.543	0.11
406_D	412_N	0.542	0.11
166_E	282_V	0.542	0.11
549_A	556_K	0.541	0.11
639_Q	670_Q	0.540	0.11
297_V	474_R	0.540	0.11
271_V	374_E	0.540	0.11
9_R	107_S	0.539	0.11
654_A	661_R	0.539	0.11
139_I	412_N	0.538	0.11
192_Q	202_H	0.538	0.11
314_L	518_R	0.537	0.11
665_R	673_N	0.536	0.11
128_R	138_R	0.536	0.11
363_P	410_T	0.536	0.11
132_R	202_H	0.536	0.11
139_I	206_P	0.535	0.11
81_V	222_S	0.534	0.11
653_A	657_A	0.533	0.11
495_A	499_R	0.533	0.11
144_V	221_I	0.533	0.11
79_L	147_L	0.532	0.11
151_G	345_T	0.532	0.11
110_I	444_A	0.531	0.11
477_R	540_A	0.531	0.11
209_I	472_A	0.531	0.11
155_G	290_E	0.530	0.11
570_K	602_K	0.530	0.11
181_A	247_G	0.529	0.11
247_G	436_F	0.529	0.11
592_E	596_A	0.529	0.11
17_N	239_I	0.528	0.11
194_V	624_E	0.528	0.11
631_K	634_K	0.527	0.11
70_P	318_V	0.527	0.11
12_K	131_S	0.526	0.11
303_A	408_A	0.526	0.11
91_A	131_S	0.526	0.11
330_S	483_V	0.525	0.11
266_S	335_V	0.525	0.11
623_V	633_R	0.525	0.11
498_A	616_V	0.524	0.11
138_R	268_D	0.524	0.11
51_I	248_A	0.524	0.11
172_A	257_G	0.524	0.11
39_L	313_R	0.523	0.11
561_A	572_E	0.523	0.11
63_D	495_A	0.522	0.11
405_H	441_A	0.522	0.11
518_R	528_R	0.521	0.11
273_M	455_E	0.521	0.11
438_Q	481_A	0.520	0.11
172_A	224_L	0.519	0.11
334_M	345_T	0.518	0.11
144_V	404_Q	0.518	0.11
302_E	364_S	0.517	0.11
89_V	634_K	0.516	0.11
44_V	91_A	0.515	0.11
47_L	305_A	0.515	0.11
628_A	636_E	0.515	0.11
314_L	527_A	0.515	0.11
325_A	464_Q	0.514	0.11
204_L	239_I	0.514	0.11
529_E	543_Q	0.514	0.11
12_K	389_A	0.514	0.11
37_V	135_L	0.513	0.11
618_P	634_K	0.513	0.11
262_H	464_Q	0.512	0.11
293_T	482_A	0.512	0.11
579_E	603_L	0.512	0.11
548_A	553_D	0.512	0.11
351_V	360_L	0.511	0.11
663_K	667_R	0.511	0.11
522_S	529_E	0.510	0.11
589_A	600_A	0.510	0.11
333_Q	633_R	0.510	0.11
58_C	456_A	0.510	0.11
55_G	311_W	0.510	0.11
356_I	408_A	0.510	0.11
233_D	376_S	0.509	0.11
232_N	463_R	0.509	0.11
659_I	662_A	0.509	0.11
201_A	234_I	0.509	0.11
156_V	452_R	0.509	0.11
147_L	242_K	0.508	0.11
151_G	442_E	0.508	0.11
209_I	325_A	0.506	0.11
504_Q	510_P	0.506	0.11
328_C	370_E	0.506	0.11
307_P	318_V	0.506	0.11
575_Q	609_N	0.506	0.11
173_A	224_L	0.505	0.11
187_Q	252_T	0.505	0.11
539_Q	542_L	0.504	0.11
106_L	566_A	0.504	0.11
580_P	584_V	0.503	0.11
592_E	601_R	0.503	0.11
300_T	310_V	0.502	0.10
226_A	253_Y	0.502	0.10
24_E	254_I	0.501	0.10
397_Y	408_A	0.501	0.10
547_D	552_A	0.501	0.10
400_S	470_E	0.501	0.10
571_L	603_L	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4p6vA	1	0.5297	100	0.645	Contact Map
4u9oA	1	0.4014	100	0.714	Contact Map
3i9v1	1	0.4959	100	0.731	Contact Map
4rasA	2	0.5189	99.1	0.961	Contact Map
1kf6B	1	0.2324	99	0.961	Contact Map
2wdqB	1	0.2905	99	0.962	Contact Map
4ysxB	1	0.2892	98.9	0.963	Contact Map
2h88B	1	0.2932	98.9	0.964	Contact Map
2bs2B	1	0.2892	98.8	0.964	Contact Map
3cf4A	2	0.4973	98.7	0.966	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0167 seconds.