PAAZ - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PAAZ - Bifunctional protein PaaZ

UniProt:	P77455	Sequences: MQQLASFLSGTWQSGRGRSRLIHHAISGEALWEVTSEGLDMAAARQFAIEKGAPALRAMTFIERAAMLKAVAKHLLSEKERFYALSAQTGATRADSWVDIEGGIGTLFTYASLGSRELPDDTLWPEDELIPLSKEGGFAARHLLTSKSGVAVHINAFNFPCWGMLEKLAPTWLGGMPAIIKPATATAQLTQAMVKSIVDSGLVPEGAISLICGSAGDLLDHLDSQDVVTFTGSAATGQMLRVQPNIVAKSIPFTMEADSLNCCVLGEDVTPDQPEFALFIREVVREMTTKAGQKCTAIRRIIVPQALVNAVSDALVARLQKVVVGDPAQEGVKMGALVNAEQRADVQEKVNILLAAGCEIRLGGQADLSAAGAFFPPTLLYCPQPDETPAVHATEAFGPVATLMPAQNQRHALQLACAGGGSLAGTLVTADPQIARQFIADAARTHGRIQILNEESAKESTGHGSPLPQLVHGGPGRAGGGEELGGLRAVKHYMQRTAVQGSPTMLAAISKQWVRGAKVEEDRIHPFRKYFEELQPGDSLLTPRRTMTEADIVNFACLSGDHFYAHMDKIAAAESIFGERVVHGYFVLSAAAGLFVDAGVGPVIANYGLESLRFIEPVKPGDTIQVRLTCKRKTLKKQRSAEEKPTGVVEWAVEVFNQHQTPVALYSILTLVARQHGDFVD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13735
Length:	681 (662)
Sequences:	416 (206)
Seq/√Len:	8.0

ECOLI - PAAZ

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
429_T	435_A	6.574	1.00
269_V	273_Q	5.896	1.00
8_L	45_R	5.344	1.00
312_S	403_L	4.838	0.99
80_E	93_R	4.805	0.99
587_V	655_V	4.468	0.99
305_Q	407_Q	4.441	0.99
191_Q	195_K	4.192	0.98
82_F	196_S	4.017	0.97
114_G	173_L	3.838	0.97
484_L	489_A	3.770	0.96
264_V	416_A	3.712	0.96
578_G	619_K	3.656	0.95
189_L	194_V	3.626	0.95
237_G	255_M	3.618	0.95
504_T	518_K	3.552	0.95
74_H	78_E	3.542	0.94
190_T	194_V	3.476	0.94
198_V	201_G	3.471	0.94
78_E	196_S	3.390	0.93
45_R	179_I	3.358	0.93
10_G	205_E	3.318	0.92
98_V	289_T	3.167	0.90
307_L	310_A	3.103	0.89
189_L	192_A	3.077	0.89
72_A	108_F	3.074	0.89
82_F	193_M	3.056	0.89
194_V	208_I	2.871	0.85
24_H	88_Q	2.870	0.85
283_V	301_I	2.854	0.85
135_E	459_E	2.838	0.84
262_C	425_G	2.838	0.84
574_E	600_V	2.818	0.84
47_F	51_K	2.795	0.83
323_V	333_K	2.740	0.82
46_Q	49_I	2.731	0.82
34_V	184_T	2.716	0.82
567_M	580_R	2.697	0.81
586_F	590_A	2.660	0.80
147_K	252_P	2.614	0.79
553_V	567_M	2.542	0.77
124_W	491_K	2.529	0.76
579_E	620_P	2.500	0.76
379_L	401_A	2.461	0.74
554_N	558_L	2.451	0.74
189_L	201_G	2.444	0.74
622_D	657_N	2.433	0.74
168_L	172_W	2.420	0.73
428_V	452_L	2.408	0.73
308_V	403_L	2.401	0.72
413_L	441_D	2.394	0.72
196_S	201_G	2.392	0.72
190_T	201_G	2.390	0.72
430_A	455_E	2.383	0.72
194_V	201_G	2.321	0.70
153_H	178_A	2.320	0.70
86_S	96_S	2.318	0.70
164_M	193_M	2.309	0.69
280_I	315_L	2.291	0.69
126_E	144_L	2.284	0.68
171_T	178_A	2.271	0.68
76_L	79_K	2.241	0.67
49_I	54_P	2.239	0.67
451_I	509_I	2.235	0.67
279_F	301_I	2.200	0.65
268_D	434_I	2.165	0.64
375_F	378_T	2.165	0.64
625_Q	660_Q	2.157	0.64
80_E	84_A	2.148	0.63
430_A	454_E	2.108	0.62
347_Q	378_T	2.095	0.61
8_L	179_I	2.069	0.60
340_A	343_R	2.052	0.60
84_A	87_A	2.018	0.58
559_S	586_F	2.017	0.58
364_G	378_T	1.995	0.57
427_L	438_F	1.955	0.56
549_E	553_V	1.932	0.55
164_M	180_I	1.917	0.54
97_W	101_E	1.910	0.54
189_L	196_S	1.904	0.54
191_Q	194_V	1.889	0.53
194_V	199_D	1.888	0.53
161_C	193_M	1.880	0.53
263_C	450_Q	1.859	0.52
122_T	146_S	1.855	0.52
308_V	405_P	1.844	0.51
192_A	196_S	1.840	0.51
359_E	383_P	1.837	0.51
35_T	38_G	1.823	0.50
633_K	653_V	1.817	0.50
10_G	48_A	1.782	0.49
409_Q	434_I	1.782	0.49
653_V	668_I	1.767	0.48
153_H	493_Y	1.762	0.48
192_A	201_G	1.761	0.48
26_I	326_D	1.744	0.47
531_F	633_K	1.742	0.47
322_V	333_K	1.737	0.47
569_K	580_R	1.734	0.47
588_L	609_L	1.709	0.46
196_S	200_S	1.705	0.46
221_H	243_Q	1.685	0.45
190_T	196_S	1.679	0.45
111_A	627_R	1.679	0.45
347_Q	375_F	1.653	0.44
302_I	412_A	1.647	0.43
453_N	502_S	1.646	0.43
529_K	538_D	1.625	0.42
588_L	668_I	1.614	0.42
196_S	199_D	1.610	0.42
96_S	189_L	1.600	0.41
622_D	658_Q	1.599	0.41
8_L	36_S	1.595	0.41
199_D	202_L	1.585	0.41
46_Q	179_I	1.585	0.41
575_S	646_T	1.585	0.41
193_M	255_M	1.564	0.40
153_H	229_T	1.557	0.40
168_L	208_I	1.556	0.40
65_A	114_G	1.554	0.40
575_S	648_V	1.552	0.40
82_F	255_M	1.551	0.39
310_A	313_D	1.547	0.39
60_T	121_D	1.539	0.39
57_R	146_S	1.538	0.39
125_P	505_M	1.537	0.39
309_N	323_V	1.537	0.39
189_L	199_D	1.529	0.39
410_R	437_Q	1.516	0.38
531_F	616_E	1.500	0.37
74_H	196_S	1.491	0.37
408_N	411_H	1.489	0.37
189_L	200_S	1.487	0.37
194_V	198_V	1.481	0.37
74_H	77_S	1.479	0.37
579_E	619_K	1.471	0.36
616_E	668_I	1.469	0.36
190_T	200_S	1.468	0.36
190_T	210_L	1.454	0.36
263_C	426_T	1.445	0.35
21_L	30_A	1.443	0.35
454_E	457_A	1.442	0.35
82_F	237_G	1.442	0.35
569_K	620_P	1.436	0.35
393_A	420_G	1.436	0.35
301_I	426_T	1.429	0.35
192_A	199_D	1.425	0.35
78_E	82_F	1.423	0.35
180_I	193_M	1.420	0.34
141_R	512_Q	1.412	0.34
93_R	97_W	1.405	0.34
430_A	456_S	1.401	0.34
430_A	453_N	1.390	0.33
558_L	650_E	1.389	0.33
216_G	221_H	1.384	0.33
143_L	264_V	1.381	0.33
301_I	401_A	1.376	0.33
312_S	361_R	1.376	0.33
338_V	490_V	1.375	0.33
531_F	635_L	1.371	0.33
633_K	668_I	1.370	0.33
553_V	580_R	1.370	0.33
45_R	49_I	1.365	0.32
361_R	403_L	1.354	0.32
283_V	315_L	1.347	0.32
554_N	590_A	1.344	0.32
549_E	620_P	1.343	0.32
109_T	469_Q	1.343	0.32
565_A	581_V	1.341	0.32
217_D	221_H	1.339	0.32
556_A	567_M	1.338	0.31
61_F	173_L	1.334	0.31
152_V	219_L	1.334	0.31
287_M	298_I	1.330	0.31
636_K	648_V	1.327	0.31
89_T	100_I	1.326	0.31
8_L	39_L	1.322	0.31
588_L	616_E	1.320	0.31
519_V	539_S	1.315	0.31
572_A	657_N	1.308	0.30
531_F	668_I	1.307	0.30
502_S	505_M	1.307	0.30
578_G	587_V	1.304	0.30
161_C	180_I	1.304	0.30
215_A	219_L	1.300	0.30
127_D	130_I	1.294	0.30
121_D	511_K	1.293	0.30
96_S	100_I	1.290	0.30
636_K	674_R	1.289	0.30
133_S	137_G	1.281	0.29
553_V	558_L	1.267	0.29
632_R	650_E	1.264	0.29
345_D	348_E	1.263	0.29
223_D	484_L	1.260	0.29
442_A	449_I	1.258	0.29
590_A	668_I	1.253	0.29
636_K	646_T	1.247	0.28
270_T	273_Q	1.247	0.28
111_A	671_L	1.243	0.28
189_L	198_V	1.241	0.28
282_E	285_R	1.239	0.28
8_L	49_I	1.238	0.28
269_V	272_D	1.225	0.28
612_L	666_Y	1.218	0.27
191_Q	201_G	1.214	0.27
284_V	315_L	1.214	0.27
274_P	454_E	1.213	0.27
46_Q	405_P	1.213	0.27
308_V	381_Y	1.209	0.27
172_W	178_A	1.204	0.27
425_G	446_H	1.202	0.27
558_L	562_H	1.194	0.27
118_L	124_W	1.194	0.27
558_L	586_F	1.191	0.27
237_G	456_S	1.190	0.26
96_S	332_V	1.187	0.26
193_M	196_S	1.186	0.26
192_A	200_S	1.185	0.26
284_V	318_R	1.183	0.26
558_L	590_A	1.182	0.26
586_F	623_T	1.178	0.26
272_D	277_A	1.169	0.26
531_F	674_R	1.165	0.26
532_E	633_K	1.164	0.26
194_V	200_S	1.163	0.26
616_E	661_T	1.161	0.26
313_D	509_I	1.157	0.25
161_C	237_G	1.157	0.25
192_A	195_K	1.153	0.25
557_C	562_H	1.143	0.25
81_R	84_A	1.142	0.25
349_K	352_I	1.133	0.25
572_A	666_Y	1.126	0.24
133_S	302_I	1.125	0.24
648_V	671_L	1.125	0.24
407_Q	411_H	1.125	0.24
549_E	554_N	1.125	0.24
269_V	434_I	1.125	0.24
610_E	613_R	1.123	0.24
224_S	420_G	1.122	0.24
545_R	590_A	1.122	0.24
22_I	34_V	1.122	0.24
110_Y	264_V	1.120	0.24
65_A	113_L	1.116	0.24
260_L	416_A	1.116	0.24
616_E	667_S	1.113	0.24
108_F	620_P	1.113	0.24
386_D	418_A	1.112	0.24
378_T	615_I	1.110	0.24
338_V	345_D	1.109	0.24
451_I	505_M	1.100	0.24
135_E	371_A	1.098	0.24
281_R	333_K	1.093	0.24
570_I	586_F	1.093	0.24
7_F	469_Q	1.091	0.23
227_V	493_Y	1.089	0.23
643_E	646_T	1.086	0.23
211_I	315_L	1.085	0.23
59_M	67_M	1.082	0.23
267_E	434_I	1.081	0.23
554_N	557_C	1.081	0.23
519_V	627_R	1.081	0.23
216_G	220_D	1.080	0.23
526_P	651_W	1.071	0.23
121_D	146_S	1.069	0.23
73_K	108_F	1.067	0.23
66_A	652_A	1.063	0.23
552_I	620_P	1.063	0.23
648_V	668_I	1.062	0.23
554_N	586_F	1.056	0.22
229_T	255_M	1.055	0.22
559_S	576_I	1.055	0.22
546_T	623_T	1.054	0.22
66_A	120_D	1.052	0.22
195_K	199_D	1.047	0.22
111_A	336_A	1.046	0.22
5_A	610_E	1.045	0.22
84_A	328_A	1.043	0.22
590_A	648_V	1.040	0.22
111_A	610_E	1.038	0.22
113_L	130_I	1.037	0.22
184_T	187_A	1.030	0.22
58_A	535_Q	1.027	0.22
567_M	620_P	1.026	0.22
94_A	442_A	1.026	0.22
355_A	360_I	1.022	0.21
364_G	615_I	1.017	0.21
559_S	648_V	1.011	0.21
49_I	247_V	1.004	0.21
121_D	336_A	1.004	0.21
630_C	652_A	1.002	0.21
35_T	60_T	1.002	0.21
264_V	536_P	1.001	0.21
559_S	590_A	1.000	0.21
543_P	550_A	1.000	0.21
16_R	19_S	0.998	0.21
616_E	674_R	0.998	0.21
569_K	579_E	0.996	0.21
172_W	671_L	0.994	0.21
294_K	492_H	0.991	0.21
427_L	451_I	0.986	0.20
218_L	222_L	0.985	0.20
493_Y	580_R	0.982	0.20
197_I	202_L	0.981	0.20
46_Q	223_D	0.978	0.20
131_P	134_K	0.974	0.20
425_G	449_I	0.973	0.20
386_D	411_H	0.972	0.20
111_A	173_L	0.967	0.20
198_V	208_I	0.965	0.20
120_D	588_L	0.962	0.20
587_V	619_K	0.960	0.20
70_A	216_G	0.957	0.20
384_Q	387_E	0.957	0.20
197_I	487_L	0.955	0.20
26_I	633_K	0.954	0.20
171_T	285_R	0.951	0.20
108_F	468_P	0.945	0.19
416_A	446_H	0.942	0.19
113_L	487_L	0.939	0.19
195_K	201_G	0.939	0.19
520_E	538_D	0.938	0.19
627_R	630_C	0.937	0.19
19_S	184_T	0.934	0.19
178_A	653_V	0.932	0.19
202_L	550_A	0.932	0.19
262_C	428_V	0.931	0.19
73_K	93_R	0.930	0.19
654_E	662_P	0.930	0.19
75_L	104_I	0.928	0.19
588_L	671_L	0.928	0.19
195_K	409_Q	0.927	0.19
193_M	237_G	0.924	0.19
26_I	250_S	0.924	0.19
147_K	176_M	0.923	0.19
70_A	202_L	0.922	0.19
501_G	509_I	0.918	0.19
588_L	633_K	0.917	0.19
45_R	176_M	0.917	0.19
270_T	307_L	0.917	0.19
106_T	315_L	0.915	0.19
600_V	666_Y	0.909	0.19
572_A	600_V	0.908	0.18
627_R	656_F	0.908	0.18
309_N	381_Y	0.905	0.18
558_L	648_V	0.905	0.18
76_L	101_E	0.905	0.18
9_S	44_A	0.904	0.18
356_A	390_A	0.903	0.18
124_W	144_L	0.899	0.18
282_E	542_T	0.895	0.18
301_I	323_V	0.895	0.18
178_A	456_S	0.895	0.18
443_A	497_T	0.894	0.18
459_E	633_K	0.893	0.18
6_S	10_G	0.889	0.18
417_C	452_L	0.888	0.18
432_P	505_M	0.887	0.18
569_K	573_A	0.881	0.18
358_C	382_C	0.880	0.18
224_S	445_T	0.880	0.18
389_P	393_A	0.879	0.18
145_T	497_T	0.878	0.18
572_A	658_Q	0.878	0.18
237_G	625_Q	0.877	0.18
100_I	645_P	0.877	0.18
144_L	491_K	0.876	0.18
184_T	624_I	0.876	0.18
576_I	648_V	0.876	0.18
76_L	82_F	0.875	0.18
15_G	101_E	0.875	0.18
313_D	317_A	0.874	0.18
578_G	644_K	0.872	0.18
339_N	490_V	0.870	0.18
49_I	453_N	0.868	0.18
603_V	672_V	0.865	0.17
413_L	536_P	0.863	0.17
143_L	499_V	0.858	0.17
284_V	322_V	0.857	0.17
74_H	200_S	0.855	0.17
185_A	490_V	0.855	0.17
67_M	207_A	0.854	0.17
588_L	653_V	0.854	0.17
31_L	467_L	0.853	0.17
544_R	553_V	0.852	0.17
323_V	370_A	0.851	0.17
7_F	179_I	0.851	0.17
153_H	282_E	0.850	0.17
19_S	38_G	0.850	0.17
207_A	246_I	0.850	0.17
24_H	237_G	0.848	0.17
148_S	497_T	0.848	0.17
543_P	623_T	0.848	0.17
153_H	542_T	0.848	0.17
553_V	620_P	0.847	0.17
554_N	562_H	0.847	0.17
291_A	336_A	0.844	0.17
544_R	549_E	0.844	0.17
189_L	195_K	0.843	0.17
58_A	146_S	0.843	0.17
45_R	539_S	0.842	0.17
615_I	644_K	0.842	0.17
603_V	636_K	0.841	0.17
663_V	672_V	0.841	0.17
416_A	438_F	0.841	0.17
530_Y	633_K	0.840	0.17
187_A	401_A	0.838	0.17
82_F	194_V	0.837	0.17
385_P	404_M	0.837	0.17
54_P	57_R	0.833	0.17
87_A	328_A	0.833	0.17
252_P	549_E	0.832	0.17
7_F	523_R	0.831	0.17
96_S	281_R	0.831	0.17
333_K	627_R	0.831	0.17
247_V	499_V	0.830	0.17
668_I	672_V	0.830	0.17
116_R	280_I	0.829	0.17
560_G	620_P	0.828	0.17
123_L	440_A	0.824	0.16
10_G	189_L	0.822	0.16
572_A	612_L	0.821	0.16
443_A	451_I	0.820	0.16
97_W	349_K	0.820	0.16
264_V	438_F	0.819	0.16
578_G	646_T	0.818	0.16
168_L	229_T	0.816	0.16
212_C	255_M	0.814	0.16
79_K	83_Y	0.813	0.16
600_V	604_I	0.812	0.16
549_E	562_H	0.811	0.16
524_I	528_R	0.811	0.16
575_S	668_I	0.810	0.16
301_I	403_L	0.809	0.16
562_H	645_P	0.809	0.16
62_I	441_D	0.809	0.16
57_R	426_T	0.808	0.16
467_L	489_A	0.806	0.16
285_R	456_S	0.803	0.16
571_A	666_Y	0.802	0.16
273_Q	430_A	0.802	0.16
289_T	332_V	0.800	0.16
616_E	633_K	0.799	0.16
48_A	52_G	0.797	0.16
66_A	70_A	0.796	0.16
26_I	393_A	0.794	0.16
553_V	562_H	0.793	0.16
133_S	471_V	0.793	0.16
279_F	449_I	0.792	0.16
575_S	636_K	0.791	0.16
381_Y	559_S	0.786	0.16
385_P	402_T	0.786	0.16
36_S	211_I	0.786	0.16
81_R	137_G	0.785	0.16
546_T	621_G	0.784	0.16
633_K	674_R	0.784	0.16
436_R	453_N	0.783	0.16
242_V	535_Q	0.780	0.16
35_T	456_S	0.779	0.16
153_H	653_V	0.778	0.15
120_D	635_L	0.778	0.15
139_A	501_G	0.777	0.15
24_H	511_K	0.777	0.15
22_I	338_V	0.775	0.15
491_K	540_L	0.775	0.15
241_R	622_D	0.773	0.15
315_L	493_Y	0.772	0.15
8_L	630_C	0.771	0.15
18_R	21_L	0.770	0.15
229_T	252_P	0.769	0.15
185_A	188_Q	0.768	0.15
24_H	104_I	0.767	0.15
133_S	237_G	0.764	0.15
570_I	575_S	0.763	0.15
115_S	262_C	0.762	0.15
610_E	650_E	0.762	0.15
89_T	287_M	0.760	0.15
545_R	612_L	0.759	0.15
184_T	611_S	0.759	0.15
616_E	653_V	0.759	0.15
62_I	65_A	0.757	0.15
67_M	202_L	0.757	0.15
207_A	404_M	0.757	0.15
349_K	380_L	0.756	0.15
549_E	648_V	0.756	0.15
94_A	98_V	0.754	0.15
79_K	97_W	0.754	0.15
570_I	648_V	0.753	0.15
610_E	642_E	0.752	0.15
345_D	450_Q	0.751	0.15
576_I	636_K	0.750	0.15
455_E	504_T	0.750	0.15
241_R	324_V	0.749	0.15
513_W	588_L	0.749	0.15
559_S	562_H	0.748	0.15
120_D	171_T	0.747	0.15
385_P	405_P	0.746	0.15
452_L	457_A	0.746	0.15
586_F	648_V	0.745	0.15
85_L	620_P	0.744	0.15
29_E	88_Q	0.742	0.15
100_I	189_L	0.742	0.15
352_I	356_A	0.741	0.15
574_E	645_P	0.741	0.15
572_A	622_D	0.740	0.15
46_Q	216_G	0.739	0.15
139_A	456_S	0.738	0.15
19_S	439_I	0.738	0.15
190_T	199_D	0.736	0.15
549_E	567_M	0.734	0.15
68_L	509_I	0.733	0.15
658_Q	666_Y	0.733	0.15
153_H	227_V	0.732	0.15
35_T	417_C	0.731	0.14
538_D	633_K	0.731	0.14
113_L	144_L	0.731	0.14
541_L	625_Q	0.729	0.14
82_F	192_A	0.729	0.14
484_L	587_V	0.728	0.14
336_A	414_Q	0.728	0.14
123_L	674_R	0.727	0.14
264_V	623_T	0.726	0.14
600_V	612_L	0.726	0.14
487_L	491_K	0.725	0.14
578_G	661_T	0.725	0.14
73_K	115_S	0.725	0.14
652_A	666_Y	0.724	0.14
143_L	321_K	0.723	0.14
100_I	193_M	0.723	0.14
425_G	428_V	0.722	0.14
471_V	494_M	0.722	0.14
570_I	574_E	0.722	0.14
118_L	607_Y	0.721	0.14
347_Q	376_P	0.721	0.14
60_T	122_T	0.720	0.14
172_W	255_M	0.720	0.14
57_R	333_K	0.718	0.14
322_V	332_V	0.718	0.14
4_L	187_A	0.718	0.14
531_F	588_L	0.716	0.14
128_E	280_I	0.716	0.14
285_R	315_L	0.715	0.14
237_G	257_A	0.714	0.14
101_E	250_S	0.714	0.14
619_K	644_K	0.714	0.14
394_T	506_L	0.714	0.14
80_E	100_I	0.713	0.14
544_R	557_C	0.713	0.14
417_C	453_N	0.713	0.14
531_F	653_V	0.713	0.14
268_D	674_R	0.713	0.14
124_W	272_D	0.712	0.14
82_F	168_L	0.711	0.14
61_F	379_L	0.710	0.14
129_L	673_A	0.710	0.14
301_I	453_N	0.709	0.14
301_I	627_R	0.708	0.14
85_L	630_C	0.706	0.14
24_H	255_M	0.706	0.14
605_A	673_A	0.705	0.14
607_Y	610_E	0.705	0.14
513_W	635_L	0.705	0.14
590_A	645_P	0.704	0.14
116_R	130_I	0.703	0.14
283_V	630_C	0.703	0.14
137_G	459_E	0.703	0.14
607_Y	613_R	0.703	0.14
7_F	316_V	0.703	0.14
544_R	574_E	0.701	0.14
141_R	436_R	0.701	0.14
484_L	547_M	0.701	0.14
310_A	567_M	0.700	0.14
176_M	227_V	0.700	0.14
554_N	648_V	0.700	0.14
616_E	644_K	0.699	0.14
118_L	665_L	0.698	0.14
176_M	211_I	0.698	0.14
643_E	648_V	0.698	0.14
554_N	650_E	0.697	0.14
370_A	391_V	0.697	0.14
124_W	242_V	0.696	0.14
63_E	453_N	0.695	0.14
360_I	378_T	0.695	0.14
229_T	254_T	0.694	0.14
186_T	338_V	0.691	0.14
605_A	622_D	0.690	0.14
382_C	402_T	0.690	0.14
520_E	630_C	0.690	0.14
193_M	197_I	0.689	0.14
622_D	663_V	0.688	0.14
350_V	378_T	0.688	0.14
643_E	659_H	0.687	0.14
553_V	557_C	0.686	0.14
662_P	665_L	0.686	0.14
78_E	413_L	0.686	0.14
185_A	499_V	0.686	0.14
624_I	662_P	0.685	0.14
610_E	643_E	0.684	0.14
123_L	432_P	0.683	0.14
62_I	581_V	0.681	0.14
66_A	630_C	0.680	0.13
24_H	27_S	0.679	0.13
545_R	605_A	0.679	0.13
58_A	123_L	0.679	0.13
456_S	501_G	0.678	0.13
312_S	381_Y	0.678	0.13
207_A	271_P	0.677	0.13
394_T	546_T	0.677	0.13
178_A	633_K	0.677	0.13
191_Q	409_Q	0.676	0.13
267_E	338_V	0.675	0.13
657_N	666_Y	0.675	0.13
211_I	218_L	0.674	0.13
312_S	408_N	0.673	0.13
281_R	366_A	0.673	0.13
364_G	367_D	0.672	0.13
143_L	424_A	0.672	0.13
35_T	349_K	0.671	0.13
655_V	663_V	0.671	0.13
22_I	610_E	0.670	0.13
96_S	401_A	0.670	0.13
553_V	634_T	0.670	0.13
509_I	599_G	0.669	0.13
124_W	454_E	0.668	0.13
118_L	239_M	0.667	0.13
544_R	590_A	0.667	0.13
274_P	455_E	0.666	0.13
287_M	401_A	0.663	0.13
15_G	82_F	0.663	0.13
580_R	620_P	0.663	0.13
283_V	499_V	0.662	0.13
556_A	581_V	0.662	0.13
336_A	664_A	0.662	0.13
260_L	446_H	0.661	0.13
215_A	345_D	0.660	0.13
5_A	14_S	0.659	0.13
148_S	417_C	0.659	0.13
80_E	405_P	0.658	0.13
512_Q	632_R	0.658	0.13
549_E	580_R	0.658	0.13
79_K	93_R	0.658	0.13
245_N	499_V	0.658	0.13
62_I	116_R	0.657	0.13
173_L	588_L	0.657	0.13
539_S	588_L	0.657	0.13
587_V	624_I	0.656	0.13
600_V	667_S	0.656	0.13
78_E	199_D	0.655	0.13
284_V	321_K	0.655	0.13
141_R	426_T	0.654	0.13
62_I	130_I	0.653	0.13
98_V	653_V	0.651	0.13
513_W	575_S	0.650	0.13
306_A	310_A	0.650	0.13
257_A	668_I	0.650	0.13
572_A	575_S	0.650	0.13
345_D	529_K	0.649	0.13
558_L	668_I	0.649	0.13
343_R	375_F	0.648	0.13
633_K	644_K	0.647	0.13
550_A	554_N	0.647	0.13
23_H	499_V	0.647	0.13
34_V	616_E	0.647	0.13
350_V	380_L	0.647	0.13
558_L	579_E	0.646	0.13
504_T	507_A	0.645	0.13
530_Y	536_P	0.645	0.13
107_L	131_P	0.645	0.13
541_L	656_F	0.644	0.13
556_A	634_T	0.644	0.13
239_M	264_V	0.643	0.13
189_L	193_M	0.643	0.13
348_E	352_I	0.643	0.13
126_E	655_V	0.642	0.13
30_A	33_E	0.642	0.13
375_F	579_E	0.642	0.13
153_H	172_W	0.641	0.13
73_K	587_V	0.640	0.13
225_Q	402_T	0.640	0.13
200_S	449_I	0.640	0.13
615_I	650_E	0.638	0.13
338_V	533_E	0.637	0.13
438_F	509_I	0.637	0.13
360_I	444_R	0.637	0.13
143_L	302_I	0.636	0.13
45_R	499_V	0.635	0.13
411_H	457_A	0.635	0.13
123_L	633_K	0.635	0.13
263_C	425_G	0.634	0.13
598_A	601_G	0.634	0.13
369_S	408_N	0.633	0.13
350_V	393_A	0.632	0.13
636_K	643_E	0.631	0.13
98_V	465_S	0.631	0.13
650_E	667_S	0.631	0.13
578_G	590_A	0.631	0.13
119_P	186_T	0.631	0.13
96_S	338_V	0.630	0.13
362_L	376_P	0.630	0.13
145_T	148_S	0.630	0.13
94_A	97_W	0.629	0.13
587_V	607_Y	0.629	0.13
345_D	632_R	0.629	0.13
554_N	615_I	0.628	0.13
425_G	438_F	0.628	0.13
350_V	573_A	0.628	0.13
222_L	578_G	0.628	0.13
311_V	336_A	0.627	0.13
507_A	514_V	0.627	0.13
568_D	601_G	0.627	0.13
266_G	314_A	0.627	0.13
107_L	468_P	0.626	0.12
590_A	671_L	0.626	0.12
137_G	202_L	0.626	0.12
67_M	70_A	0.624	0.12
152_V	220_D	0.624	0.12
574_E	658_Q	0.624	0.12
34_V	54_P	0.623	0.12
72_A	310_A	0.623	0.12
254_T	257_A	0.622	0.12
252_P	553_V	0.621	0.12
96_S	197_I	0.621	0.12
15_G	578_G	0.621	0.12
311_V	509_I	0.620	0.12
225_Q	446_H	0.619	0.12
219_L	222_L	0.618	0.12
184_T	345_D	0.617	0.12
554_N	559_S	0.617	0.12
269_V	587_V	0.617	0.12
326_D	394_T	0.616	0.12
553_V	650_E	0.616	0.12
72_A	465_S	0.615	0.12
247_V	453_N	0.615	0.12
15_G	255_M	0.614	0.12
168_L	611_S	0.613	0.12
570_I	599_G	0.613	0.12
172_W	237_G	0.613	0.12
78_E	93_R	0.612	0.12
184_T	661_T	0.612	0.12
590_A	624_I	0.612	0.12
120_D	531_F	0.611	0.12
45_R	77_S	0.611	0.12
646_T	652_A	0.610	0.12
13_Q	17_G	0.610	0.12
544_R	570_I	0.610	0.12
208_I	364_G	0.609	0.12
211_I	662_P	0.608	0.12
19_S	212_C	0.608	0.12
123_L	456_S	0.608	0.12
544_R	623_T	0.607	0.12
558_L	576_I	0.607	0.12
31_L	550_A	0.607	0.12
84_A	660_Q	0.607	0.12
357_G	382_C	0.606	0.12
179_I	413_L	0.606	0.12
94_A	285_R	0.606	0.12
179_I	211_I	0.605	0.12
263_C	350_V	0.605	0.12
171_T	510_S	0.604	0.12
257_A	672_V	0.603	0.12
667_S	671_L	0.603	0.12
202_L	440_A	0.602	0.12
97_W	405_P	0.602	0.12
211_I	215_A	0.601	0.12
626_V	660_Q	0.601	0.12
6_S	484_L	0.600	0.12
113_L	117_E	0.599	0.12
191_Q	199_D	0.599	0.12
58_A	70_A	0.599	0.12
326_D	609_L	0.599	0.12
27_S	513_W	0.599	0.12
277_A	490_V	0.599	0.12
616_E	652_A	0.598	0.12
172_W	417_C	0.597	0.12
190_T	198_V	0.597	0.12
622_D	636_K	0.596	0.12
97_W	196_S	0.595	0.12
609_L	615_I	0.595	0.12
417_C	652_A	0.595	0.12
301_I	630_C	0.595	0.12
49_I	70_A	0.595	0.12
59_M	534_L	0.593	0.12
619_K	646_T	0.593	0.12
645_P	648_V	0.591	0.12
574_E	648_V	0.591	0.12
574_E	657_N	0.590	0.12
125_P	510_S	0.590	0.12
153_H	171_T	0.587	0.12
620_P	671_L	0.586	0.12
93_R	101_E	0.585	0.12
170_P	666_Y	0.585	0.12
358_C	402_T	0.584	0.12
7_F	29_E	0.584	0.12
76_L	97_W	0.583	0.12
505_M	530_Y	0.583	0.12
13_Q	42_A	0.582	0.12
303_V	311_V	0.580	0.12
586_F	650_E	0.580	0.12
612_L	648_V	0.580	0.12
580_R	601_G	0.579	0.12
554_N	668_I	0.579	0.12
586_F	646_T	0.579	0.12
82_F	247_V	0.578	0.12
611_S	667_S	0.578	0.12
215_A	529_K	0.578	0.12
197_I	458_K	0.577	0.12
550_A	553_V	0.576	0.12
579_E	650_E	0.575	0.12
452_L	538_D	0.574	0.12
658_Q	671_L	0.574	0.12
263_C	515_R	0.573	0.12
553_V	668_I	0.573	0.12
45_R	146_S	0.572	0.12
280_I	311_V	0.572	0.12
218_L	221_H	0.572	0.12
44_A	150_V	0.570	0.12
59_M	193_M	0.569	0.12
6_S	382_C	0.569	0.12
125_P	471_V	0.568	0.11
636_K	668_I	0.568	0.11
19_S	345_D	0.567	0.11
557_C	570_I	0.567	0.11
49_I	120_D	0.566	0.11
111_A	487_L	0.566	0.11
452_L	470_L	0.566	0.11
123_L	237_G	0.565	0.11
282_E	633_K	0.565	0.11
250_S	404_M	0.565	0.11
432_P	453_N	0.564	0.11
571_A	600_V	0.563	0.11
601_G	664_A	0.563	0.11
247_V	443_A	0.562	0.11
123_L	171_T	0.561	0.11
185_A	339_N	0.559	0.11
576_I	646_T	0.558	0.11
361_R	381_Y	0.558	0.11
212_C	660_Q	0.558	0.11
9_S	134_K	0.558	0.11
450_Q	460_S	0.557	0.11
567_M	579_E	0.557	0.11
6_S	188_Q	0.557	0.11
275_E	454_E	0.557	0.11
85_L	168_L	0.556	0.11
172_W	674_R	0.556	0.11
25_A	86_S	0.555	0.11
153_H	385_P	0.555	0.11
282_E	385_P	0.554	0.11
63_E	128_E	0.553	0.11
375_F	615_I	0.553	0.11
245_N	269_V	0.553	0.11
189_L	202_L	0.553	0.11
529_K	581_V	0.553	0.11
144_L	229_T	0.552	0.11
351_N	573_A	0.552	0.11
124_W	305_Q	0.552	0.11
100_I	484_L	0.551	0.11
214_S	515_R	0.551	0.11
549_E	668_I	0.551	0.11
267_E	409_Q	0.550	0.11
153_H	285_R	0.549	0.11
518_K	623_T	0.549	0.11
257_A	467_L	0.549	0.11
7_F	12_W	0.549	0.11
70_A	264_V	0.548	0.11
104_I	618_V	0.548	0.11
249_K	404_M	0.548	0.11
257_A	428_V	0.547	0.11
558_L	615_I	0.546	0.11
211_I	243_Q	0.545	0.11
279_F	283_V	0.545	0.11
49_I	179_I	0.545	0.11
363_G	366_A	0.545	0.11
143_L	219_L	0.544	0.11
216_G	449_I	0.544	0.11
562_H	648_V	0.543	0.11
553_V	590_A	0.543	0.11
252_P	513_W	0.542	0.11
283_V	287_M	0.542	0.11
185_A	616_E	0.542	0.11
205_E	568_D	0.539	0.11
587_V	671_L	0.539	0.11
351_N	673_A	0.539	0.11
8_L	42_A	0.538	0.11
190_T	370_A	0.538	0.11
512_Q	515_R	0.538	0.11
269_V	484_L	0.538	0.11
645_P	668_I	0.537	0.11
272_D	401_A	0.537	0.11
635_L	674_R	0.536	0.11
302_I	610_E	0.536	0.11
48_A	458_K	0.536	0.11
576_I	586_F	0.536	0.11
152_V	587_V	0.536	0.11
7_F	48_A	0.535	0.11
169_A	424_A	0.535	0.11
559_S	636_K	0.535	0.11
93_R	453_N	0.534	0.11
529_K	671_L	0.534	0.11
471_V	497_T	0.533	0.11
246_I	287_M	0.533	0.11
227_V	404_M	0.533	0.11
135_E	458_K	0.532	0.11
198_V	202_L	0.532	0.11
357_G	610_E	0.532	0.11
487_L	540_L	0.532	0.11
665_L	668_I	0.531	0.11
539_S	579_E	0.531	0.11
97_W	189_L	0.530	0.11
321_K	333_K	0.530	0.11
622_D	672_V	0.529	0.11
657_N	663_V	0.529	0.11
312_S	359_E	0.529	0.11
36_S	459_E	0.529	0.11
567_M	610_E	0.528	0.11
43_A	347_Q	0.528	0.11
379_L	673_A	0.527	0.11
124_W	634_T	0.527	0.11
52_G	235_A	0.527	0.11
364_G	489_A	0.527	0.11
575_S	622_D	0.527	0.11
83_Y	96_S	0.527	0.11
340_A	662_P	0.527	0.11
32_W	127_D	0.526	0.11
122_T	662_P	0.526	0.11
513_W	579_E	0.526	0.11
636_K	644_K	0.526	0.11
224_S	643_E	0.525	0.11
67_M	110_Y	0.525	0.11
417_C	470_L	0.525	0.11
196_S	202_L	0.524	0.11
313_D	418_A	0.524	0.11
262_C	328_A	0.523	0.11
132_L	471_V	0.523	0.11
274_P	330_E	0.522	0.11
309_N	408_N	0.522	0.11
207_A	338_V	0.522	0.11
26_I	336_A	0.521	0.11
436_R	587_V	0.521	0.11
216_G	223_D	0.521	0.11
14_S	289_T	0.520	0.11
147_K	558_L	0.520	0.11
536_P	654_E	0.520	0.11
45_R	129_L	0.520	0.11
147_K	562_H	0.519	0.11
424_A	484_L	0.519	0.11
37_E	317_A	0.519	0.11
513_W	653_V	0.519	0.11
382_C	385_P	0.519	0.11
115_S	121_D	0.518	0.11
221_H	441_D	0.518	0.11
468_P	552_I	0.517	0.11
46_Q	360_I	0.517	0.11
562_H	575_S	0.516	0.11
668_I	671_L	0.515	0.11
345_D	353_L	0.515	0.11
317_A	320_Q	0.515	0.11
355_A	358_C	0.515	0.11
49_I	405_P	0.514	0.11
49_I	320_Q	0.513	0.11
136_G	311_V	0.512	0.11
272_D	324_V	0.512	0.11
250_S	405_P	0.511	0.11
587_V	590_A	0.511	0.11
316_V	660_Q	0.511	0.11
72_A	468_P	0.511	0.11
173_L	490_V	0.510	0.11
180_I	603_V	0.509	0.11
549_E	575_S	0.509	0.11
9_S	611_S	0.508	0.11
609_L	624_I	0.508	0.11
31_L	353_L	0.507	0.11
89_T	336_A	0.507	0.11
572_A	667_S	0.507	0.11
187_A	343_R	0.507	0.11
199_D	411_H	0.506	0.10
82_F	211_I	0.506	0.10
568_D	580_R	0.505	0.10
172_W	452_L	0.504	0.10
544_R	558_L	0.504	0.10
134_K	411_H	0.504	0.10
315_L	379_L	0.504	0.10
403_L	413_L	0.503	0.10
612_L	652_A	0.503	0.10
667_S	674_R	0.503	0.10
170_P	586_F	0.503	0.10
147_K	404_M	0.502	0.10
212_C	451_I	0.502	0.10
107_L	271_P	0.501	0.10
237_G	603_V	0.501	0.10
164_M	283_V	0.500	0.10
309_N	362_L	0.500	0.10
605_A	646_T	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2y53A	2	0.7533	100	0.671	Contact Map
3ek1A	5	0.6902	100	0.694	Contact Map
4pz2A	4	0.7004	100	0.695	Contact Map
1a4sA	4	0.7004	100	0.695	Contact Map
4pxlA	4	0.699	100	0.695	Contact Map
4wj9A	4	0.6975	100	0.695	Contact Map
1wndA	4	0.6858	100	0.696	Contact Map
4nm9A	2	0.7107	100	0.696	Contact Map
4yweA	5	0.6872	100	0.696	Contact Map
4qf6A	4	0.6902	100	0.697	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0168 seconds.