PTFX1 - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTFX1 - Multiphosphoryl transfer protein 1

UniProt:	P77439	Sequences: MLTIQFLCPLPNGLHARPAWELKEQCSQWQSEITFINHRQNAKADAKSSLALIGTGTLFNDSCSLNISGSDEEQARRVLEEYIQVRFIDSDSVQPTQAELTAHPLPRSLSRLNPDLLYGNVLASGVGVGTLTLLQSDSLDSYRAIPASAQDSTRLEHSLATLAEQLNQQLRERDGESKTILSAHLSLIQDDEFAGNIRRLMTEQHQGLGAAIISNMEQVCAKLSASASDYLRERVSDIRDISEQLLHITWPELKPRNKLVLEKPTILVAEDLTPSQFLSLDLKNLAGMILEKTGRTSHTLILARASAIPVLSGLPLDAIARYAGQPAVLDAQCGVLAINPNDAVSGYYQVAQTLADKRQKQQAQAAAQLAYSRDNKRIDIAANIGTALEAPGAFANGAEGVGLFRTEMLYMDRDSAPDEQEQFEAYQQVLLAAGDKPIIFRTMDIGGDKSIPYLNIPQEENPFLGYRAVRIYPEFAGLFRTQLRAILRAASFGNAQLMIPMVHSLDQILWVKGEIQKAIVELKRDGLRHAETITLGIMVEVPSVCYIIDHFCDEVDFFSIGSNDMTQYLYAVDRNNPRVSPLYNPITPSFLRMLQQIVTTAHQRGKWVGICGELGGESRYLPLLLGLGLDELSMSSPRIPAVKSQLRQLDSEACRELARQACECRSAQEIEALLTAFTPEEDVRPLLALENIFVDQDFSNKEQAIQFLCGNLGVNGRTEHPFELEEDVWQREEIVTTGVGFGVAIPHTKSQWIRHSSISIARLAKPIGWQSEMGEVELVIMLTLGANEGMNHVKVFSQLARKLVNKNFRQSLFAAQDAQSILTLLETELTF	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG14151
Length:	831 (663)
Sequences:	748 (511)
Seq/√Len:	19.9

ECOLI - PTFX1 PTFX2 PT1P PT1
BACSU - PT1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
287_G	329_L	7.815	1.00
602_H	630_D	7.555	1.00
509_L	554_E	6.394	1.00
433_A	438_I	6.341	1.00
480_R	517_K	5.906	1.00
595_Q	599_T	5.811	1.00
266_I	287_G	4.686	1.00
419_E	488_R	4.459	1.00
508_I	555_V	3.982	1.00
569_L	593_M	3.977	1.00
597_I	608_V	3.814	1.00
266_I	329_L	3.767	1.00
610_I	629_L	3.764	1.00
609_G	631_E	3.730	1.00
661_A	673_L	3.672	1.00
545_C	593_M	3.657	1.00
560_I	597_I	3.506	1.00
483_L	515_I	3.356	1.00
311_L	331_A	3.347	1.00
512_K	554_E	3.321	1.00
82_Y	87_F	3.261	1.00
419_E	481_T	3.251	1.00
154_R	209_G	3.154	0.99
131_L	327_A	3.149	0.99
517_K	521_E	3.140	0.99
503_H	543_S	3.106	0.99
469_V	511_V	3.101	0.99
376_K	651_S	3.042	0.99
480_R	518_A	3.036	0.99
518_A	521_E	3.023	0.99
373_R	650_D	3.008	0.99
576_N	579_V	3.007	0.99
73_E	77_R	2.947	0.99
311_L	336_L	2.873	0.99
30_Q	71_D	2.825	0.99
622_P	654_C	2.713	0.98
616_G	642_V	2.705	0.98
466_Y	474_E	2.695	0.98
539_V	544_V	2.668	0.98
57_T	63_C	2.666	0.98
439_I	609_G	2.652	0.98
451_I	455_N	2.642	0.98
31_S	71_D	2.574	0.98
390_A	394_F	2.551	0.98
8_C	57_T	2.536	0.97
487_L	515_I	2.509	0.97
8_C	63_C	2.481	0.97
496_Q	534_T	2.418	0.97
460_E	575_N	2.417	0.97
666_S	669_E	2.413	0.97
427_Q	431_L	2.409	0.97
29_W	75_A	2.399	0.96
147_A	150_Q	2.309	0.96
665_R	669_E	2.307	0.96
445_I	451_I	2.303	0.96
419_E	484_R	2.275	0.95
584_N	671_E	2.263	0.95
546_Y	593_M	2.240	0.95
5_Q	62_S	2.235	0.95
206_Q	210_A	2.214	0.94
661_A	664_C	2.206	0.94
505_L	551_F	2.186	0.94
598_V	608_V	2.140	0.93
572_V	582_L	2.135	0.93
616_G	634_M	2.132	0.93
224_S	239_R	2.130	0.93
230_Y	576_N	2.116	0.93
379_D	607_W	2.094	0.93
166_L	185_L	2.019	0.91
664_C	673_L	2.017	0.91
544_V	551_F	2.017	0.91
376_K	630_D	1.991	0.90
515_I	535_L	1.961	0.90
117_L	314_L	1.945	0.89
276_Q	331_A	1.945	0.89
473_P	510_W	1.922	0.89
381_A	400_G	1.884	0.88
626_G	658_A	1.866	0.87
7_L	62_S	1.861	0.87
328_V	348_Y	1.857	0.87
390_A	433_A	1.852	0.87
386_T	389_E	1.813	0.86
423_F	488_R	1.795	0.85
22_L	46_A	1.790	0.85
505_L	554_E	1.780	0.85
313_G	489_A	1.776	0.84
539_V	551_F	1.764	0.84
625_L	646_L	1.757	0.84
5_Q	64_S	1.737	0.83
377_R	399_E	1.732	0.83
413_R	421_E	1.720	0.82
607_W	631_E	1.718	0.82
278_L	310_V	1.696	0.82
230_Y	233_E	1.691	0.81
400_G	437_P	1.689	0.81
163_A	189_Q	1.689	0.81
389_E	544_V	1.687	0.81
440_F	486_I	1.678	0.81
447_G	463_F	1.678	0.81
69_G	72_E	1.658	0.80
484_R	525_D	1.648	0.80
601_A	608_V	1.646	0.80
390_A	438_I	1.631	0.79
435_D	494_N	1.630	0.79
486_I	495_A	1.623	0.79
480_R	514_E	1.623	0.79
14_L	22_L	1.613	0.78
268_V	639_I	1.591	0.77
450_S	575_N	1.589	0.77
26_C	33_I	1.585	0.77
656_E	660_Q	1.582	0.77
506_D	666_S	1.580	0.77
404_F	429_V	1.579	0.77
420_Q	424_E	1.571	0.76
80_E	84_Q	1.570	0.76
598_V	602_H	1.568	0.76
382_A	393_A	1.564	0.76
445_I	493_G	1.562	0.76
288_M	636_S	1.561	0.76
384_I	390_A	1.558	0.76
341_N	344_V	1.558	0.76
65_L	83_I	1.554	0.75
512_K	516_Q	1.553	0.75
664_C	669_E	1.550	0.75
163_A	185_L	1.532	0.74
233_E	466_Y	1.527	0.74
304_R	401_V	1.516	0.74
181_L	647_R	1.513	0.73
152_S	202_T	1.511	0.73
394_F	436_K	1.504	0.73
652_E	655_R	1.503	0.73
333_C	338_I	1.503	0.73
423_F	427_Q	1.501	0.73
546_Y	569_L	1.484	0.72
167_N	171_R	1.470	0.71
30_Q	70_S	1.462	0.71
537_I	623_L	1.459	0.71
420_Q	488_R	1.450	0.70
549_D	603_Q	1.447	0.70
342_D	346_G	1.446	0.70
128_V	345_S	1.437	0.69
6_F	88_I	1.435	0.69
499_I	511_V	1.423	0.69
240_D	275_S	1.422	0.69
309_P	417_P	1.420	0.68
472_Y	479_F	1.419	0.68
145_I	207_G	1.417	0.68
234_R	237_D	1.409	0.68
623_L	674_L	1.404	0.68
396_N	640_P	1.400	0.67
545_C	610_I	1.399	0.67
595_Q	659_R	1.384	0.66
440_F	495_A	1.380	0.66
314_L	318_A	1.373	0.66
217_E	221_A	1.373	0.66
401_V	489_A	1.368	0.65
545_C	606_K	1.365	0.65
132_T	261_L	1.364	0.65
545_C	569_L	1.361	0.65
274_P	399_E	1.358	0.65
573_D	597_I	1.357	0.65
69_G	75_A	1.348	0.64
286_A	472_Y	1.346	0.64
474_E	578_R	1.341	0.64
32_E	45_D	1.339	0.64
296_T	590_F	1.338	0.64
72_E	89_D	1.334	0.63
121_V	331_A	1.329	0.63
326_P	345_S	1.327	0.63
627_L	661_A	1.325	0.63
331_A	481_T	1.324	0.63
555_V	576_N	1.321	0.63
497_L	614_L	1.318	0.63
387_A	425_A	1.311	0.62
499_I	515_I	1.310	0.62
277_F	306_S	1.310	0.62
155_L	197_I	1.309	0.62
539_V	555_V	1.303	0.62
576_N	635_S	1.301	0.61
596_Q	600_T	1.300	0.61
152_S	198_R	1.300	0.61
230_Y	582_L	1.292	0.61
387_A	429_V	1.286	0.61
277_F	299_T	1.276	0.60
304_R	613_E	1.268	0.59
555_V	606_K	1.266	0.59
507_Q	560_I	1.254	0.59
657_L	673_L	1.248	0.58
429_V	666_S	1.247	0.58
26_C	47_K	1.244	0.58
23_K	120_N	1.244	0.58
345_S	349_Q	1.241	0.58
130_T	263_K	1.229	0.57
159_L	163_A	1.221	0.56
626_G	661_A	1.220	0.56
291_E	315_P	1.219	0.56
598_V	630_D	1.217	0.56
29_W	47_K	1.215	0.56
165_Q	244_Q	1.212	0.56
353_T	357_K	1.209	0.56
499_I	535_L	1.206	0.56
651_S	655_R	1.201	0.55
360_K	364_Q	1.196	0.55
615_G	632_L	1.194	0.55
166_L	294_G	1.194	0.55
242_S	463_F	1.191	0.55
62_S	553_D	1.190	0.54
142_Y	266_I	1.186	0.54
278_L	311_L	1.182	0.54
370_A	647_R	1.182	0.54
430_L	494_N	1.181	0.54
516_Q	520_V	1.181	0.54
241_I	380_I	1.180	0.54
350_V	353_T	1.180	0.54
243_E	273_T	1.179	0.54
356_D	360_K	1.179	0.54
509_L	616_G	1.170	0.53
369_L	372_S	1.168	0.53
629_L	632_L	1.153	0.52
82_Y	430_L	1.152	0.52
209_G	250_W	1.146	0.52
136_S	345_S	1.143	0.51
82_Y	86_R	1.139	0.51
261_L	264_P	1.138	0.51
289_I	613_E	1.137	0.51
81_E	85_V	1.136	0.51
549_D	600_T	1.134	0.51
300_L	310_V	1.132	0.51
416_A	453_Y	1.131	0.51
261_L	265_T	1.130	0.51
427_Q	502_V	1.128	0.50
270_E	292_K	1.120	0.50
439_I	631_E	1.120	0.50
592_R	600_T	1.117	0.50
439_I	445_I	1.114	0.50
579_V	582_L	1.113	0.50
487_L	622_P	1.105	0.49
535_L	653_A	1.098	0.49
291_E	312_S	1.096	0.48
616_G	638_R	1.094	0.48
498_M	558_F	1.084	0.48
131_L	321_R	1.082	0.48
49_S	56_G	1.080	0.47
376_K	655_R	1.079	0.47
161_T	248_I	1.075	0.47
378_I	625_L	1.074	0.47
281_D	285_L	1.073	0.47
186_S	576_N	1.069	0.47
539_V	601_A	1.068	0.47
419_E	423_F	1.067	0.47
194_A	197_I	1.064	0.46
141_S	213_I	1.062	0.46
327_A	336_L	1.058	0.46
322_Y	325_Q	1.053	0.46
349_Q	359_Q	1.050	0.45
505_L	615_G	1.046	0.45
365_A	368_Q	1.044	0.45
51_A	223_L	1.043	0.45
379_D	609_G	1.040	0.45
516_Q	519_I	1.039	0.45
289_I	336_L	1.039	0.45
197_I	323_A	1.038	0.45
210_A	613_E	1.034	0.44
471_I	546_Y	1.031	0.44
420_Q	423_F	1.027	0.44
64_S	271_D	1.025	0.44
299_T	337_A	1.024	0.44
236_S	541_V	1.022	0.44
555_V	599_T	1.021	0.44
508_I	543_S	1.021	0.44
94_Q	543_S	1.016	0.43
33_I	46_A	1.013	0.43
560_I	608_V	1.012	0.43
508_I	539_V	1.010	0.43
546_Y	603_Q	1.010	0.43
419_E	489_A	1.007	0.43
356_D	359_Q	1.002	0.42
145_I	148_S	1.001	0.42
184_H	390_A	1.000	0.42
505_L	555_V	1.000	0.42
230_Y	579_V	0.997	0.42
406_T	422_Q	0.997	0.42
479_F	511_V	0.996	0.42
560_I	598_V	0.990	0.42
445_I	455_N	0.988	0.42
314_L	418_D	0.986	0.41
660_Q	664_C	0.985	0.41
290_L	547_I	0.983	0.41
95_P	99_E	0.983	0.41
10_L	89_D	0.982	0.41
29_W	79_L	0.981	0.41
445_I	620_Y	0.980	0.41
183_A	272_L	0.980	0.41
60_N	69_G	0.979	0.41
548_I	600_T	0.978	0.41
104_P	333_C	0.978	0.41
622_P	649_L	0.976	0.41
305_A	636_S	0.975	0.41
51_A	266_I	0.974	0.41
634_M	642_V	0.974	0.41
363_A	366_A	0.971	0.40
162_L	245_L	0.967	0.40
15_H	18_P	0.965	0.40
22_L	35_F	0.965	0.40
169_Q	278_L	0.958	0.40
463_F	490_A	0.957	0.40
143_R	206_Q	0.956	0.40
230_Y	613_E	0.956	0.40
364_Q	539_V	0.956	0.40
223_L	600_T	0.953	0.39
216_M	242_S	0.953	0.39
127_G	156_E	0.953	0.39
165_Q	642_V	0.953	0.39
10_L	88_I	0.951	0.39
596_Q	599_T	0.950	0.39
489_A	634_M	0.950	0.39
10_L	52_L	0.947	0.39
192_E	195_G	0.947	0.39
157_H	203_E	0.945	0.39
516_Q	535_L	0.944	0.39
238_I	545_C	0.943	0.39
10_L	450_S	0.941	0.39
428_Q	656_E	0.941	0.39
131_L	323_A	0.936	0.38
372_S	376_K	0.935	0.38
379_D	598_V	0.934	0.38
46_A	79_L	0.934	0.38
151_D	207_G	0.933	0.38
331_A	489_A	0.933	0.38
268_V	327_A	0.933	0.38
363_A	640_P	0.932	0.38
372_S	624_L	0.932	0.38
266_I	327_A	0.932	0.38
69_G	413_R	0.929	0.38
212_I	245_L	0.929	0.38
238_I	315_P	0.928	0.38
181_L	541_V	0.927	0.38
312_S	362_Q	0.926	0.38
331_A	558_F	0.925	0.38
336_L	506_D	0.925	0.38
588_P	626_G	0.924	0.38
431_L	492_F	0.922	0.37
266_I	533_I	0.921	0.37
201_M	537_I	0.921	0.37
242_S	489_A	0.917	0.37
413_R	580_S	0.917	0.37
168_Q	257_N	0.916	0.37
660_Q	673_L	0.915	0.37
305_A	442_T	0.915	0.37
25_Q	28_Q	0.913	0.37
394_F	404_F	0.910	0.37
570_Y	587_T	0.909	0.37
18_P	417_P	0.909	0.37
61_D	69_G	0.909	0.37
37_N	61_D	0.908	0.37
23_K	241_I	0.907	0.37
321_R	424_E	0.907	0.37
223_L	440_F	0.906	0.36
127_G	476_A	0.905	0.36
83_I	86_R	0.904	0.36
264_P	286_A	0.901	0.36
242_S	313_G	0.901	0.36
294_G	609_G	0.896	0.36
181_L	197_I	0.894	0.36
75_A	535_L	0.894	0.36
645_Q	649_L	0.894	0.36
133_L	323_A	0.893	0.36
51_A	328_V	0.892	0.36
171_R	361_Q	0.889	0.35
200_L	206_Q	0.887	0.35
341_N	381_A	0.887	0.35
202_T	539_V	0.885	0.35
77_R	229_D	0.884	0.35
252_E	477_G	0.882	0.35
422_Q	485_A	0.879	0.35
425_A	543_S	0.879	0.35
381_A	631_E	0.878	0.35
234_R	417_P	0.877	0.35
479_F	593_M	0.877	0.35
536_G	557_F	0.875	0.35
129_G	227_A	0.875	0.35
115_D	267_L	0.871	0.34
370_A	399_E	0.870	0.34
56_G	312_S	0.867	0.34
416_A	479_F	0.866	0.34
193_F	610_I	0.860	0.34
378_I	486_I	0.858	0.34
119_G	580_S	0.857	0.34
585_P	614_L	0.857	0.34
463_F	558_F	0.856	0.34
50_L	223_L	0.856	0.34
399_E	433_A	0.854	0.33
409_L	615_G	0.853	0.33
413_R	453_Y	0.851	0.33
347_Y	351_A	0.850	0.33
8_C	546_Y	0.850	0.33
285_L	479_F	0.848	0.33
371_Y	377_R	0.847	0.33
526_G	608_V	0.846	0.33
317_D	336_L	0.846	0.33
18_P	309_P	0.844	0.33
290_L	294_G	0.844	0.33
91_D	94_Q	0.843	0.33
423_F	492_F	0.843	0.33
58_L	127_G	0.842	0.33
8_C	23_K	0.842	0.33
349_Q	352_Q	0.842	0.33
404_F	438_I	0.841	0.33
136_S	349_Q	0.839	0.33
67_I	72_E	0.837	0.32
324_G	360_K	0.837	0.32
597_I	600_T	0.836	0.32
27_S	186_S	0.836	0.32
650_D	653_A	0.834	0.32
417_P	588_P	0.834	0.32
196_N	228_S	0.834	0.32
244_Q	477_G	0.833	0.32
277_F	281_D	0.830	0.32
217_E	520_V	0.829	0.32
404_F	634_M	0.829	0.32
410_Y	486_I	0.829	0.32
364_Q	380_I	0.828	0.32
546_Y	596_Q	0.822	0.32
302_L	408_M	0.821	0.32
9_P	23_K	0.819	0.31
78_V	81_E	0.819	0.31
230_Y	572_V	0.819	0.31
45_D	362_Q	0.818	0.31
53_I	87_F	0.814	0.31
13_G	16_A	0.812	0.31
305_A	389_E	0.808	0.31
200_L	215_N	0.808	0.31
162_L	244_Q	0.807	0.31
241_I	277_F	0.806	0.31
312_S	510_W	0.806	0.31
395_A	640_P	0.805	0.31
183_A	299_T	0.804	0.31
155_L	159_L	0.804	0.31
134_L	323_A	0.803	0.31
277_F	285_L	0.803	0.31
35_F	83_I	0.802	0.31
169_Q	313_G	0.801	0.30
195_G	202_T	0.800	0.30
374_D	588_P	0.799	0.30
537_I	551_F	0.798	0.30
263_K	284_N	0.798	0.30
658_A	661_A	0.797	0.30
29_W	33_I	0.797	0.30
541_V	623_L	0.796	0.30
497_L	533_I	0.793	0.30
653_A	656_E	0.791	0.30
86_R	89_D	0.789	0.30
385_G	575_N	0.789	0.30
610_I	632_L	0.788	0.30
126_V	560_I	0.787	0.30
642_V	646_L	0.786	0.30
468_A	590_F	0.782	0.29
305_A	533_I	0.781	0.29
267_L	363_A	0.781	0.29
392_G	396_N	0.780	0.29
442_T	486_I	0.780	0.29
422_Q	451_I	0.780	0.29
314_L	471_I	0.778	0.29
234_R	571_A	0.777	0.29
591_L	626_G	0.776	0.29
63_C	67_I	0.776	0.29
381_A	607_W	0.775	0.29
158_S	249_T	0.774	0.29
163_A	497_L	0.774	0.29
406_T	616_G	0.774	0.29
128_V	328_V	0.773	0.29
162_L	248_I	0.773	0.29
300_L	443_M	0.771	0.29
562_S	616_G	0.771	0.29
410_Y	425_A	0.771	0.29
10_L	277_F	0.770	0.29
49_S	295_R	0.770	0.29
192_E	224_S	0.770	0.29
244_Q	290_L	0.768	0.29
212_I	242_S	0.768	0.29
545_C	629_L	0.767	0.29
234_R	374_D	0.766	0.29
121_V	614_L	0.763	0.28
333_C	532_T	0.763	0.28
544_V	597_I	0.763	0.28
551_F	606_K	0.763	0.28
89_D	318_A	0.762	0.28
208_L	305_A	0.761	0.28
379_D	439_I	0.761	0.28
300_L	552_C	0.756	0.28
306_S	331_A	0.755	0.28
56_G	315_P	0.754	0.28
36_I	66_N	0.754	0.28
569_L	617_E	0.753	0.28
466_Y	579_V	0.753	0.28
389_E	392_G	0.753	0.28
221_A	623_L	0.753	0.28
295_R	312_S	0.753	0.28
421_E	580_S	0.752	0.28
660_Q	663_E	0.752	0.28
240_D	624_L	0.750	0.28
119_G	194_A	0.749	0.28
304_R	635_S	0.749	0.28
241_I	271_D	0.746	0.28
70_S	361_Q	0.746	0.28
190_D	556_D	0.746	0.28
149_A	650_D	0.745	0.27
378_I	630_D	0.744	0.27
547_I	550_H	0.744	0.27
621_L	642_V	0.743	0.27
44_A	192_E	0.741	0.27
37_N	230_Y	0.740	0.27
361_Q	364_Q	0.740	0.27
452_P	560_I	0.739	0.27
447_G	576_N	0.738	0.27
56_G	291_E	0.737	0.27
85_V	221_A	0.736	0.27
289_I	314_L	0.736	0.27
50_L	53_I	0.735	0.27
153_T	342_D	0.733	0.27
408_M	411_M	0.733	0.27
426_Y	501_M	0.731	0.27
171_R	174_D	0.731	0.27
52_L	672_A	0.731	0.27
288_M	303_A	0.730	0.27
95_P	229_D	0.729	0.27
657_L	660_Q	0.728	0.27
225_A	228_S	0.728	0.27
586_I	620_Y	0.728	0.27
138_S	359_Q	0.728	0.27
181_L	245_L	0.727	0.27
213_I	380_I	0.727	0.27
122_L	125_G	0.727	0.27
469_V	634_M	0.726	0.27
78_V	296_T	0.725	0.26
133_L	136_S	0.724	0.26
510_W	562_S	0.724	0.26
41_N	635_S	0.723	0.26
266_I	391_P	0.723	0.26
44_A	440_F	0.721	0.26
462_P	567_Q	0.721	0.26
65_L	69_G	0.720	0.26
305_A	308_I	0.720	0.26
325_Q	653_A	0.719	0.26
201_M	351_A	0.718	0.26
117_L	126_V	0.718	0.26
613_E	616_G	0.717	0.26
13_G	17_R	0.717	0.26
376_K	380_I	0.717	0.26
151_D	154_R	0.717	0.26
23_K	510_W	0.716	0.26
198_R	202_T	0.716	0.26
288_M	299_T	0.716	0.26
476_A	479_F	0.716	0.26
51_A	562_S	0.715	0.26
481_T	484_R	0.715	0.26
537_I	558_F	0.715	0.26
443_M	473_P	0.714	0.26
240_D	399_E	0.714	0.26
41_N	135_Q	0.714	0.26
71_D	74_Q	0.713	0.26
151_D	162_L	0.712	0.26
304_R	310_V	0.709	0.26
343_A	502_V	0.708	0.26
79_L	663_E	0.707	0.26
129_G	264_P	0.706	0.26
168_Q	172_E	0.705	0.25
327_A	373_R	0.705	0.25
470_R	536_G	0.704	0.25
541_V	647_R	0.703	0.25
594_L	624_L	0.701	0.25
425_A	428_Q	0.701	0.25
632_L	647_R	0.700	0.25
313_G	386_T	0.700	0.25
178_K	241_I	0.699	0.25
90_S	94_Q	0.699	0.25
437_P	673_L	0.699	0.25
10_L	511_V	0.698	0.25
588_P	591_L	0.698	0.25
75_A	78_V	0.697	0.25
408_M	548_I	0.697	0.25
360_K	478_L	0.696	0.25
179_T	214_S	0.694	0.25
267_L	438_I	0.694	0.25
197_I	535_L	0.693	0.25
512_K	556_D	0.690	0.25
276_Q	297_S	0.689	0.25
167_N	263_K	0.689	0.25
151_D	158_S	0.689	0.25
634_M	639_I	0.687	0.25
321_R	394_F	0.687	0.25
18_P	568_Y	0.686	0.25
439_I	534_T	0.686	0.25
26_C	29_W	0.685	0.25
276_Q	290_L	0.685	0.25
11_P	566_T	0.685	0.25
308_I	479_F	0.684	0.24
522_L	527_L	0.684	0.24
123_A	427_Q	0.683	0.24
30_Q	521_E	0.682	0.24
79_L	486_I	0.682	0.24
15_H	19_A	0.682	0.24
293_T	565_M	0.681	0.24
501_M	568_Y	0.681	0.24
213_I	217_E	0.680	0.24
475_F	589_S	0.680	0.24
242_S	473_P	0.680	0.24
331_A	613_E	0.680	0.24
534_T	607_W	0.680	0.24
94_Q	201_M	0.679	0.24
241_I	463_F	0.678	0.24
87_F	230_Y	0.678	0.24
111_R	114_P	0.678	0.24
221_A	224_S	0.678	0.24
53_I	231_L	0.678	0.24
79_L	360_K	0.677	0.24
498_M	637_P	0.676	0.24
58_L	61_D	0.676	0.24
327_A	654_C	0.675	0.24
51_A	440_F	0.675	0.24
23_K	440_F	0.674	0.24
548_I	558_F	0.673	0.24
219_V	539_V	0.672	0.24
281_D	607_W	0.672	0.24
469_V	502_V	0.671	0.24
422_Q	426_Y	0.671	0.24
665_R	668_Q	0.670	0.24
634_M	638_R	0.670	0.24
118_Y	663_E	0.670	0.24
74_Q	81_E	0.668	0.24
448_D	501_M	0.667	0.24
152_S	162_L	0.666	0.24
262_E	265_T	0.665	0.24
153_T	368_Q	0.663	0.23
269_A	580_S	0.663	0.23
228_S	639_I	0.662	0.23
479_F	545_C	0.661	0.23
558_F	609_G	0.661	0.23
537_I	661_A	0.660	0.23
160_A	164_E	0.660	0.23
26_C	30_Q	0.659	0.23
194_A	354_L	0.659	0.23
621_L	646_L	0.659	0.23
153_T	157_H	0.658	0.23
505_L	509_L	0.658	0.23
8_C	433_A	0.657	0.23
153_T	156_E	0.656	0.23
47_K	435_D	0.655	0.23
483_L	531_E	0.654	0.23
159_L	162_L	0.652	0.23
230_Y	238_I	0.652	0.23
282_L	292_K	0.651	0.23
516_Q	525_D	0.651	0.23
136_S	353_T	0.650	0.23
189_Q	339_N	0.649	0.23
539_V	545_C	0.649	0.23
667_A	675_T	0.649	0.23
164_E	502_V	0.647	0.23
155_L	627_L	0.647	0.23
265_T	642_V	0.646	0.23
111_R	640_P	0.646	0.23
197_I	363_A	0.645	0.23
114_P	640_P	0.644	0.23
484_R	589_S	0.642	0.23
41_N	666_S	0.641	0.22
63_C	69_G	0.639	0.22
336_L	603_Q	0.639	0.22
266_I	653_A	0.639	0.22
86_R	576_N	0.638	0.22
236_S	273_T	0.638	0.22
180_I	295_R	0.638	0.22
34_T	499_I	0.636	0.22
27_S	189_Q	0.636	0.22
180_I	483_L	0.635	0.22
153_T	343_A	0.635	0.22
295_R	315_P	0.635	0.22
330_D	364_Q	0.634	0.22
406_T	509_L	0.634	0.22
18_P	588_P	0.632	0.22
207_G	210_A	0.631	0.22
199_R	202_T	0.630	0.22
413_R	417_P	0.629	0.22
60_N	72_E	0.629	0.22
103_H	160_A	0.629	0.22
498_M	507_Q	0.629	0.22
457_P	669_E	0.629	0.22
10_L	22_L	0.628	0.22
443_M	590_F	0.626	0.22
278_L	473_P	0.626	0.22
404_F	451_I	0.625	0.22
266_I	529_H	0.624	0.22
166_L	319_I	0.624	0.22
7_L	330_D	0.623	0.22
585_P	666_S	0.623	0.22
197_I	264_P	0.622	0.22
281_D	324_G	0.622	0.22
50_L	299_T	0.622	0.22
224_S	343_A	0.621	0.22
508_I	590_F	0.621	0.22
585_P	634_M	0.620	0.22
479_F	514_E	0.619	0.21
21_E	248_I	0.619	0.21
182_S	185_L	0.619	0.21
41_N	185_L	0.618	0.21
267_L	290_L	0.618	0.21
23_K	271_D	0.617	0.21
413_R	416_A	0.617	0.21
415_S	428_Q	0.616	0.21
504_S	582_L	0.616	0.21
107_R	111_R	0.615	0.21
71_D	660_Q	0.613	0.21
539_V	562_S	0.613	0.21
35_F	146_P	0.613	0.21
218_Q	294_G	0.612	0.21
122_L	300_L	0.611	0.21
511_V	514_E	0.611	0.21
88_I	91_D	0.610	0.21
168_Q	517_K	0.609	0.21
490_A	657_L	0.609	0.21
503_H	532_T	0.608	0.21
419_E	551_F	0.608	0.21
228_S	302_L	0.608	0.21
45_D	51_A	0.607	0.21
629_L	658_A	0.607	0.21
296_T	382_A	0.607	0.21
126_V	353_T	0.606	0.21
366_A	515_I	0.605	0.21
327_A	353_T	0.605	0.21
195_G	623_L	0.604	0.21
234_R	568_Y	0.604	0.21
32_E	144_A	0.602	0.21
74_Q	195_G	0.602	0.21
194_A	314_L	0.602	0.21
379_D	576_N	0.602	0.21
543_S	576_N	0.602	0.21
499_I	533_I	0.602	0.21
390_A	393_A	0.601	0.21
439_I	496_Q	0.600	0.21
20_W	366_A	0.600	0.21
548_I	597_I	0.599	0.21
237_D	417_P	0.599	0.21
440_F	550_H	0.599	0.21
173_R	585_P	0.598	0.21
203_E	327_A	0.597	0.21
618_S	642_V	0.596	0.21
237_D	309_P	0.596	0.21
173_R	215_N	0.596	0.21
429_V	438_I	0.595	0.20
125_G	637_P	0.595	0.20
54_G	515_I	0.595	0.20
61_D	299_T	0.594	0.20
276_Q	304_R	0.593	0.20
300_L	408_M	0.593	0.20
166_L	189_Q	0.591	0.20
576_N	582_L	0.590	0.20
161_T	165_Q	0.590	0.20
136_S	669_E	0.590	0.20
160_A	378_I	0.589	0.20
423_F	430_L	0.589	0.20
126_V	233_E	0.589	0.20
198_R	201_M	0.589	0.20
145_I	201_M	0.589	0.20
18_P	237_D	0.589	0.20
572_V	579_V	0.588	0.20
164_E	169_Q	0.587	0.20
380_I	643_K	0.587	0.20
438_I	582_L	0.587	0.20
35_F	497_L	0.587	0.20
49_S	52_L	0.586	0.20
246_L	328_V	0.586	0.20
131_L	512_K	0.586	0.20
346_G	349_Q	0.585	0.20
102_A	263_K	0.584	0.20
132_T	139_L	0.584	0.20
339_N	425_A	0.583	0.20
32_E	52_L	0.583	0.20
207_G	570_Y	0.582	0.20
231_L	643_K	0.582	0.20
117_L	289_I	0.581	0.20
508_I	537_I	0.580	0.20
385_G	437_P	0.580	0.20
586_I	670_I	0.579	0.20
603_Q	625_L	0.579	0.20
214_S	323_A	0.578	0.20
288_M	430_L	0.577	0.20
374_D	417_P	0.576	0.20
456_I	478_L	0.576	0.20
223_L	454_L	0.575	0.20
378_I	439_I	0.574	0.20
335_V	589_S	0.574	0.20
25_Q	29_W	0.573	0.20
546_Y	579_V	0.573	0.20
192_E	273_T	0.572	0.20
453_Y	624_L	0.571	0.19
196_N	551_F	0.570	0.19
52_L	291_E	0.570	0.19
84_Q	89_D	0.570	0.19
135_Q	323_A	0.569	0.19
188_I	245_L	0.568	0.19
10_L	621_L	0.568	0.19
24_E	27_S	0.567	0.19
67_I	76_R	0.567	0.19
662_C	666_S	0.567	0.19
639_I	667_A	0.566	0.19
68_S	642_V	0.566	0.19
417_P	568_Y	0.566	0.19
33_I	326_P	0.566	0.19
271_D	555_V	0.566	0.19
201_M	490_A	0.565	0.19
423_F	445_I	0.565	0.19
391_P	395_A	0.565	0.19
117_L	134_L	0.565	0.19
273_T	469_V	0.565	0.19
149_A	368_Q	0.565	0.19
301_I	304_R	0.564	0.19
572_V	613_E	0.563	0.19
491_S	616_G	0.562	0.19
44_A	206_Q	0.561	0.19
99_E	360_K	0.561	0.19
537_I	585_P	0.561	0.19
470_R	482_Q	0.560	0.19
357_K	360_K	0.560	0.19
31_S	505_L	0.560	0.19
608_V	634_M	0.560	0.19
246_L	539_V	0.559	0.19
482_Q	536_G	0.558	0.19
268_V	289_I	0.558	0.19
649_L	654_C	0.557	0.19
576_N	636_S	0.557	0.19
342_D	651_S	0.557	0.19
211_A	497_L	0.556	0.19
44_A	269_A	0.555	0.19
155_L	484_R	0.555	0.19
484_R	488_R	0.555	0.19
29_W	71_D	0.555	0.19
201_M	208_L	0.554	0.19
33_I	47_K	0.554	0.19
107_R	148_S	0.554	0.19
370_A	646_L	0.553	0.19
511_V	515_I	0.553	0.19
41_N	350_V	0.553	0.19
215_N	388_L	0.552	0.19
513_G	604_R	0.552	0.19
360_K	435_D	0.552	0.19
123_A	439_I	0.552	0.19
10_L	184_H	0.552	0.19
530_A	663_E	0.551	0.19
100_L	668_Q	0.551	0.19
302_L	623_L	0.550	0.19
340_P	417_P	0.550	0.19
120_N	311_L	0.548	0.19
128_V	594_L	0.548	0.19
130_T	264_P	0.548	0.19
181_L	188_I	0.547	0.19
240_D	274_P	0.547	0.19
22_L	503_H	0.546	0.18
60_N	88_I	0.546	0.18
411_M	420_Q	0.546	0.18
267_L	666_S	0.545	0.18
375_N	417_P	0.545	0.18
223_L	495_A	0.545	0.18
515_I	575_N	0.545	0.18
541_V	568_Y	0.545	0.18
181_L	616_G	0.544	0.18
380_I	621_L	0.544	0.18
387_A	663_E	0.544	0.18
14_L	502_V	0.544	0.18
429_V	634_M	0.543	0.18
309_P	568_Y	0.541	0.18
63_C	71_D	0.541	0.18
45_D	646_L	0.540	0.18
244_Q	618_S	0.540	0.18
144_A	656_E	0.540	0.18
304_R	463_F	0.540	0.18
180_I	331_A	0.539	0.18
215_N	264_P	0.539	0.18
331_A	334_G	0.539	0.18
450_S	579_V	0.539	0.18
10_L	181_L	0.538	0.18
479_F	488_R	0.537	0.18
490_A	530_A	0.537	0.18
361_Q	420_Q	0.537	0.18
344_V	348_Y	0.537	0.18
26_C	486_I	0.537	0.18
586_I	661_A	0.537	0.18
323_A	327_A	0.536	0.18
279_S	623_L	0.535	0.18
32_E	129_G	0.535	0.18
549_D	601_A	0.535	0.18
53_I	613_E	0.534	0.18
161_T	225_A	0.534	0.18
49_S	304_R	0.533	0.18
126_V	143_R	0.533	0.18
353_T	478_L	0.533	0.18
394_F	433_A	0.533	0.18
203_E	451_I	0.532	0.18
70_S	257_N	0.532	0.18
372_S	625_L	0.532	0.18
364_Q	648_Q	0.532	0.18
232_R	238_I	0.531	0.18
67_I	75_A	0.531	0.18
399_E	502_V	0.530	0.18
155_L	671_E	0.530	0.18
112_L	669_E	0.530	0.18
73_E	100_L	0.530	0.18
150_Q	346_G	0.530	0.18
169_Q	244_Q	0.530	0.18
6_F	11_P	0.530	0.18
457_P	578_R	0.530	0.18
14_L	445_I	0.529	0.18
272_L	302_L	0.528	0.18
470_R	557_F	0.527	0.18
120_N	476_A	0.527	0.18
241_I	634_M	0.527	0.18
299_T	572_V	0.526	0.18
200_L	652_E	0.526	0.18
636_S	674_L	0.525	0.18
478_L	592_R	0.525	0.18
167_N	483_L	0.525	0.18
389_E	640_P	0.524	0.18
150_Q	655_R	0.524	0.18
234_R	245_L	0.524	0.18
290_L	490_A	0.524	0.18
439_I	491_S	0.523	0.18
190_D	245_L	0.523	0.18
184_H	384_I	0.523	0.18
180_I	278_L	0.522	0.18
263_K	549_D	0.521	0.18
624_L	627_L	0.521	0.18
502_V	519_I	0.521	0.18
374_D	627_L	0.520	0.17
400_G	422_Q	0.520	0.17
137_D	160_A	0.520	0.17
478_L	515_I	0.520	0.17
28_Q	229_D	0.519	0.17
8_C	230_Y	0.519	0.17
427_Q	491_S	0.519	0.17
149_A	167_N	0.518	0.17
95_P	98_A	0.518	0.17
285_L	535_L	0.517	0.17
264_P	299_T	0.517	0.17
37_N	53_I	0.517	0.17
29_W	78_V	0.517	0.17
268_V	291_E	0.517	0.17
366_A	429_V	0.516	0.17
373_R	378_I	0.515	0.17
49_S	276_Q	0.515	0.17
230_Y	635_S	0.515	0.17
196_N	200_L	0.514	0.17
28_Q	31_S	0.513	0.17
599_T	656_E	0.512	0.17
579_V	642_V	0.512	0.17
618_S	668_Q	0.512	0.17
7_L	200_L	0.511	0.17
551_F	668_Q	0.511	0.17
44_A	223_L	0.511	0.17
657_L	664_C	0.511	0.17
64_S	197_I	0.511	0.17
350_V	357_K	0.510	0.17
11_P	339_N	0.510	0.17
311_L	659_R	0.510	0.17
449_K	568_Y	0.510	0.17
410_Y	418_D	0.509	0.17
337_A	344_V	0.509	0.17
12_N	192_E	0.509	0.17
450_S	616_G	0.509	0.17
267_L	593_M	0.509	0.17
132_T	288_M	0.508	0.17
140_D	514_E	0.508	0.17
234_R	588_P	0.508	0.17
505_L	667_A	0.507	0.17
342_D	345_S	0.507	0.17
562_S	594_L	0.507	0.17
82_Y	89_D	0.506	0.17
160_A	258_K	0.506	0.17
389_E	617_E	0.506	0.17
223_L	572_V	0.506	0.17
161_T	342_D	0.506	0.17
240_D	244_Q	0.506	0.17
182_S	669_E	0.506	0.17
495_A	533_I	0.506	0.17
71_D	75_A	0.505	0.17
288_M	337_A	0.505	0.17
266_I	505_L	0.505	0.17
313_G	630_D	0.505	0.17
35_F	391_P	0.505	0.17
358_R	362_Q	0.505	0.17
609_G	630_D	0.504	0.17
221_A	307_A	0.503	0.17
237_D	501_M	0.502	0.17
223_L	493_G	0.502	0.17
53_I	572_V	0.502	0.17
184_H	631_E	0.501	0.17
392_G	653_A	0.500	0.17

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2wqdA	2	0.6787	100	0.52	Contact Map
2hwgA	2	0.6787	100	0.522	Contact Map
1vbgA	2	0.7545	100	0.572	Contact Map
1kblA	2	0.7569	100	0.573	Contact Map
2x0sA	2	0.7557	100	0.58	Contact Map
2olsA	2	0.6402	100	0.641	Contact Map
2xz9A	2	0.3815	100	0.725	Contact Map
1zymA	2	0.29	100	0.826	Contact Map
4l9zA	5	0.355	100	0.866	Contact Map
3qqwA	3	0.3478	100	0.867	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0169 seconds.