YQIK - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YQIK - Inner membrane protein YqiK

UniProt:	P77306	Sequences: MDDIVNSVPSWMFTAIIAVCILFIIGIIFARLYRRASAEQAFVRTGLGGQKVVMSGGAIVMPIFHEIIPINMNTLKLEVSRSTIDSLITKDRMRVDVVVAFFVRVKPSVEGIATAAQTLGQRTLSPEDLRMLVEDKFVDALRATAAQMTMHELQDTRENFVQGVQNTVAEDLSKNGLELESVSLTNFNQTSKEHFNPNNAFDAEGLTKLTQETERRRRERNEVEQDVEVAVREKNRDALSRKLEIEQQEAFMTLEQEQQVKTRTAEQNARIAAFEAERRREAEQTRILAERQIQETEIDREQAVRSRKVEAEREVRIKEIEQQQVTEIANQTKSIAIAAKSEQQSQAEARANLALAEAVSAQQNVETTRQTAEADRAKQVALIAAAQDAETKAVELTVRAKAEKEAAEMQAAAIVELAEATRKKGLAEAEAQRALNDAINVLSDEQTSLKFKLALLQALPAVIEKSVEPMKSIDGIKIIQVDGLNRGGAAGDANTGNVGGGNLAEQALSAALSYRTQAPLIDSLLNEIGVSGGSLAALTSPLTSTTPVEEKAE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG14232
Length:	553 (481)
Sequences:	586 (305)
Seq/√Len:	13.9

ECOLI - YQIK
BACSU - YUAG

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
425_G	431_A	7.325	1.00
426_L	430_E	5.624	1.00
393_A	398_V	3.984	1.00
468_E	471_K	3.322	0.99
408_E	412_A	3.246	0.98
356_A	361_A	3.200	0.98
464_E	468_E	3.130	0.98
375_D	379_Q	3.051	0.98
386_A	390_E	3.041	0.97
353_L	357_E	2.739	0.95
357_E	360_S	2.679	0.95
384_A	387_Q	2.672	0.95
367_T	371_T	2.632	0.94
283_E	286_R	2.622	0.94
404_K	409_M	2.583	0.93
421_T	427_A	2.496	0.92
398_V	406_A	2.437	0.91
422_R	427_A	2.422	0.91
147_Q	163_G	2.394	0.90
239_L	253_T	2.371	0.90
317_I	321_E	2.324	0.89
163_G	166_N	2.323	0.89
308_K	312_E	2.314	0.89
356_A	367_T	2.314	0.89
152_E	330_N	2.282	0.88
16_I	20_C	2.276	0.88
356_A	360_S	2.251	0.87
373_E	377_A	2.226	0.87
261_K	275_E	2.203	0.86
339_A	343_Q	2.177	0.86
272_A	275_E	2.176	0.86
461_A	464_E	2.175	0.86
393_A	396_L	2.164	0.85
354_A	365_V	2.150	0.85
344_Q	347_A	2.144	0.85
472_S	476_I	2.111	0.84
336_A	339_A	2.095	0.83
337_I	340_K	2.094	0.83
361_A	364_N	2.074	0.83
406_A	410_Q	2.070	0.82
432_Q	435_L	2.066	0.82
233_E	237_D	2.001	0.80
311_A	333_K	1.987	0.80
403_E	406_A	1.979	0.79
393_A	397_T	1.978	0.79
433_R	437_D	1.969	0.79
398_V	418_A	1.910	0.77
403_E	409_M	1.894	0.76
422_R	426_L	1.876	0.76
404_K	410_Q	1.874	0.75
136_K	175_N	1.871	0.75
207_T	211_Q	1.857	0.75
394_V	400_A	1.823	0.73
34_R	67_I	1.806	0.73
346_Q	350_R	1.805	0.73
393_A	403_E	1.798	0.72
400_A	404_K	1.793	0.72
30_A	343_Q	1.786	0.72
405_E	409_M	1.785	0.72
398_V	403_E	1.773	0.71
370_Q	373_E	1.771	0.71
250_A	253_T	1.771	0.71
48_G	65_H	1.771	0.71
153_L	187_F	1.771	0.71
398_V	404_K	1.753	0.70
300_R	304_V	1.749	0.70
388_D	392_K	1.744	0.70
75_L	129_L	1.740	0.70
477_K	482_D	1.735	0.70
476_I	480_Q	1.719	0.69
53_V	58_A	1.704	0.68
396_L	406_A	1.704	0.68
107_P	117_Q	1.694	0.68
404_K	408_E	1.694	0.68
314_E	324_Q	1.686	0.67
375_D	378_K	1.683	0.67
371_T	379_Q	1.680	0.67
403_E	410_Q	1.677	0.67
40_Q	69_P	1.661	0.66
21_I	28_I	1.659	0.66
390_E	393_A	1.657	0.66
18_A	24_I	1.652	0.66
335_I	339_A	1.648	0.65
484_L	487_G	1.636	0.65
361_A	368_T	1.626	0.64
522_D	525_L	1.612	0.64
347_A	350_R	1.607	0.63
18_A	21_I	1.605	0.63
384_A	388_D	1.589	0.62
102_F	154_Q	1.583	0.62
277_E	280_R	1.555	0.61
423_K	427_A	1.554	0.61
465_K	468_E	1.543	0.60
17_I	26_G	1.537	0.60
25_I	59_I	1.534	0.60
39_E	72_M	1.533	0.60
86_S	154_Q	1.529	0.59
19_V	373_E	1.520	0.59
34_R	64_F	1.514	0.59
354_A	361_A	1.509	0.58
380_V	387_Q	1.498	0.58
411_A	417_L	1.494	0.58
46_G	438_A	1.486	0.57
389_A	402_A	1.475	0.57
393_A	401_K	1.473	0.56
279_R	283_E	1.473	0.56
327_E	337_I	1.472	0.56
13_F	17_I	1.471	0.56
324_Q	332_T	1.427	0.54
106_K	111_G	1.425	0.54
320_I	328_I	1.416	0.53
228_E	232_R	1.414	0.53
28_I	59_I	1.408	0.53
475_G	480_Q	1.405	0.53
478_I	486_R	1.397	0.52
463_I	466_S	1.395	0.52
397_T	406_A	1.393	0.52
409_M	413_A	1.386	0.52
344_Q	348_E	1.380	0.51
107_P	112_I	1.378	0.51
463_I	467_V	1.377	0.51
409_M	412_A	1.366	0.51
361_A	365_V	1.366	0.51
428_E	442_L	1.355	0.50
410_Q	417_L	1.355	0.50
488_G	491_G	1.354	0.50
288_L	291_R	1.353	0.50
440_N	443_S	1.347	0.50
342_E	348_E	1.343	0.49
426_L	434_A	1.340	0.49
15_A	26_G	1.340	0.49
385_A	391_T	1.337	0.49
317_I	320_I	1.333	0.49
53_V	117_Q	1.325	0.48
456_L	507_A	1.316	0.48
477_K	480_Q	1.316	0.48
427_A	433_R	1.313	0.48
362_Q	366_E	1.310	0.48
392_K	395_E	1.307	0.47
433_R	441_V	1.301	0.47
172_L	177_L	1.297	0.47
431_A	434_A	1.296	0.47
354_A	374_A	1.293	0.47
487_G	490_A	1.293	0.47
478_I	491_G	1.291	0.47
396_L	403_E	1.291	0.47
406_A	409_M	1.289	0.47
398_V	401_K	1.288	0.46
43_V	119_L	1.288	0.46
44_R	58_A	1.282	0.46
198_N	333_K	1.279	0.46
453_L	457_Q	1.273	0.46
175_N	180_E	1.268	0.45
394_V	398_V	1.266	0.45
332_T	339_A	1.266	0.45
74_T	102_F	1.264	0.45
133_V	148_M	1.262	0.45
409_M	415_V	1.256	0.45
163_G	167_T	1.256	0.45
503_L	507_A	1.255	0.45
356_A	369_R	1.253	0.45
149_T	200_A	1.239	0.44
15_A	23_F	1.238	0.44
44_R	65_H	1.231	0.43
356_A	363_Q	1.231	0.43
486_R	490_A	1.226	0.43
483_G	490_A	1.222	0.43
148_M	165_Q	1.220	0.43
452_K	456_L	1.219	0.43
397_T	401_K	1.219	0.43
108_S	111_G	1.214	0.42
37_S	40_Q	1.213	0.42
221_N	234_K	1.209	0.42
156_T	159_N	1.208	0.42
278_R	281_E	1.207	0.42
79_V	175_N	1.201	0.42
61_M	64_F	1.200	0.42
220_R	223_V	1.194	0.41
474_D	477_K	1.192	0.41
414_I	421_T	1.191	0.41
101_F	182_V	1.186	0.41
66_E	213_T	1.178	0.41
477_K	518_A	1.174	0.40
367_T	372_A	1.172	0.40
33_Y	116_A	1.170	0.40
226_D	375_D	1.169	0.40
501_G	505_E	1.169	0.40
398_V	409_M	1.167	0.40
154_Q	182_V	1.167	0.40
100_A	184_L	1.161	0.40
70_I	365_V	1.156	0.39
479_I	504_A	1.153	0.39
321_E	345_S	1.153	0.39
101_F	187_F	1.147	0.39
308_K	311_A	1.146	0.39
102_F	182_V	1.142	0.39
520_L	523_S	1.141	0.39
235_N	238_A	1.141	0.39
312_E	322_Q	1.140	0.39
279_R	289_A	1.137	0.38
51_K	257_E	1.137	0.38
117_Q	154_Q	1.136	0.38
376_R	380_V	1.133	0.38
396_L	409_M	1.133	0.38
326_T	337_I	1.133	0.38
376_R	379_Q	1.132	0.38
343_Q	346_Q	1.130	0.38
368_T	372_A	1.125	0.38
396_L	401_K	1.124	0.38
505_E	524_L	1.121	0.38
475_G	482_D	1.121	0.38
104_R	117_Q	1.108	0.37
389_A	393_A	1.096	0.36
478_I	507_A	1.095	0.36
353_L	361_A	1.086	0.36
357_E	363_Q	1.084	0.36
340_K	347_A	1.073	0.35
12_M	19_V	1.072	0.35
485_N	488_G	1.071	0.35
151_H	222_E	1.065	0.35
20_C	23_F	1.061	0.35
387_Q	391_T	1.050	0.34
158_E	166_N	1.049	0.34
400_A	405_E	1.049	0.34
456_L	478_I	1.048	0.34
57_G	141_L	1.047	0.34
336_A	340_K	1.042	0.34
387_Q	390_E	1.040	0.34
305_R	308_K	1.040	0.34
483_G	488_G	1.038	0.34
309_V	312_E	1.036	0.33
241_R	244_E	1.034	0.33
479_I	482_D	1.033	0.33
249_E	253_T	1.032	0.33
462_V	524_L	1.030	0.33
472_S	525_L	1.026	0.33
518_A	523_S	1.026	0.33
341_S	345_S	1.026	0.33
392_K	405_E	1.025	0.33
77_L	155_D	1.024	0.33
330_N	333_K	1.024	0.33
13_F	18_A	1.019	0.33
368_T	371_T	1.017	0.33
419_E	423_K	1.014	0.32
386_A	389_A	1.014	0.32
340_K	350_R	1.014	0.32
380_V	384_A	1.010	0.32
359_V	369_R	1.010	0.32
327_E	331_Q	1.009	0.32
362_Q	369_R	1.005	0.32
381_A	387_Q	1.004	0.32
27_I	357_E	1.003	0.32
401_K	405_E	1.002	0.32
405_E	435_L	1.001	0.32
364_N	372_A	0.999	0.32
86_S	102_F	0.996	0.32
478_I	483_G	0.996	0.32
135_D	145_A	0.995	0.32
135_D	150_M	0.993	0.31
202_D	210_T	0.993	0.31
357_E	361_A	0.991	0.31
156_T	292_Q	0.990	0.31
234_K	238_A	0.988	0.31
421_T	428_E	0.986	0.31
335_I	340_K	0.983	0.31
104_R	182_V	0.981	0.31
256_Q	269_A	0.979	0.31
399_R	403_E	0.976	0.31
306_S	310_E	0.972	0.30
79_V	182_V	0.970	0.30
413_A	417_L	0.969	0.30
314_E	521_I	0.968	0.30
226_D	308_K	0.966	0.30
97_V	253_T	0.963	0.30
434_A	438_A	0.959	0.30
394_V	401_K	0.957	0.30
46_G	229_V	0.957	0.30
357_E	362_Q	0.955	0.30
361_A	370_Q	0.954	0.30
222_E	226_D	0.953	0.30
16_I	23_F	0.952	0.30
521_I	525_L	0.946	0.29
489_A	492_D	0.945	0.29
138_V	175_N	0.945	0.29
150_M	201_F	0.943	0.29
355_L	358_A	0.943	0.29
486_R	491_G	0.938	0.29
248_Q	319_E	0.937	0.29
225_Q	228_E	0.937	0.29
301_E	312_E	0.937	0.29
72_M	184_L	0.933	0.29
112_I	231_V	0.931	0.29
133_V	177_L	0.926	0.28
135_D	154_Q	0.924	0.28
346_Q	349_A	0.924	0.28
379_Q	383_I	0.919	0.28
478_I	490_A	0.917	0.28
280_R	289_A	0.917	0.28
465_K	504_A	0.916	0.28
139_D	216_R	0.912	0.28
479_I	506_Q	0.911	0.28
424_K	431_A	0.911	0.28
334_S	338_A	0.908	0.28
430_E	433_R	0.908	0.28
374_A	385_A	0.907	0.28
456_L	476_I	0.907	0.28
211_Q	215_R	0.906	0.28
154_Q	201_F	0.905	0.27
335_I	338_A	0.904	0.27
352_N	365_V	0.901	0.27
502_N	505_E	0.900	0.27
233_E	248_Q	0.900	0.27
358_A	365_V	0.896	0.27
91_D	150_M	0.892	0.27
29_F	247_Q	0.892	0.27
438_A	441_V	0.891	0.27
474_D	480_Q	0.889	0.27
244_E	247_Q	0.889	0.27
46_G	55_S	0.884	0.27
308_K	314_E	0.884	0.27
401_K	408_E	0.884	0.27
487_G	491_G	0.881	0.26
472_S	475_G	0.880	0.26
286_R	290_E	0.879	0.26
86_S	135_D	0.878	0.26
458_A	507_A	0.877	0.26
179_L	243_L	0.874	0.26
77_L	103_V	0.872	0.26
281_E	337_I	0.871	0.26
381_A	430_E	0.870	0.26
42_F	394_V	0.868	0.26
175_N	182_V	0.864	0.26
150_M	200_A	0.863	0.26
17_I	24_I	0.861	0.26
23_F	27_I	0.861	0.26
204_E	221_N	0.860	0.26
138_V	185_T	0.857	0.25
406_A	412_A	0.855	0.25
414_I	417_L	0.852	0.25
321_E	324_Q	0.852	0.25
142_R	216_R	0.851	0.25
483_G	487_G	0.849	0.25
159_N	163_G	0.847	0.25
167_T	203_A	0.845	0.25
152_E	259_Q	0.845	0.25
319_E	323_Q	0.842	0.25
341_S	347_A	0.842	0.25
238_A	271_I	0.842	0.25
140_A	143_A	0.840	0.25
167_T	184_L	0.837	0.25
152_E	331_Q	0.833	0.24
405_E	408_E	0.829	0.24
504_A	507_A	0.826	0.24
46_G	51_K	0.819	0.24
478_I	481_V	0.819	0.24
364_N	368_T	0.816	0.24
485_N	489_A	0.815	0.24
23_F	248_Q	0.814	0.24
369_R	373_E	0.813	0.24
473_I	478_I	0.811	0.24
154_Q	158_E	0.809	0.24
331_Q	338_A	0.809	0.24
327_E	333_K	0.806	0.23
233_E	478_I	0.805	0.23
46_G	49_G	0.805	0.23
87_L	137_F	0.803	0.23
274_F	280_R	0.801	0.23
427_A	431_A	0.800	0.23
281_E	284_Q	0.800	0.23
326_T	330_N	0.800	0.23
272_A	276_A	0.797	0.23
356_A	368_T	0.795	0.23
457_Q	461_A	0.795	0.23
88_I	187_F	0.794	0.23
74_T	175_N	0.794	0.23
338_A	342_E	0.794	0.23
98_V	212_E	0.793	0.23
422_R	425_G	0.792	0.23
184_L	269_A	0.791	0.23
43_V	46_G	0.789	0.23
306_S	314_E	0.788	0.23
456_L	490_A	0.788	0.23
92_R	150_M	0.788	0.23
18_A	435_L	0.787	0.23
246_E	250_A	0.787	0.23
424_K	427_A	0.787	0.23
517_Q	520_L	0.785	0.23
390_E	401_K	0.785	0.23
363_Q	376_R	0.784	0.23
145_A	201_F	0.781	0.22
421_T	424_K	0.780	0.22
395_E	404_K	0.780	0.22
305_R	309_V	0.779	0.22
163_G	178_E	0.779	0.22
95_V	135_D	0.778	0.22
386_A	435_L	0.777	0.22
371_T	374_A	0.773	0.22
430_E	434_A	0.773	0.22
155_D	161_V	0.768	0.22
199_N	203_A	0.767	0.22
45_T	201_F	0.766	0.22
48_G	162_Q	0.764	0.22
503_L	506_Q	0.762	0.22
18_A	110_E	0.762	0.22
133_V	196_N	0.761	0.22
364_N	387_Q	0.760	0.22
354_A	363_Q	0.759	0.22
465_K	501_G	0.758	0.22
81_R	94_R	0.758	0.22
357_E	365_V	0.756	0.22
334_S	387_Q	0.753	0.21
452_K	505_E	0.750	0.21
517_Q	523_S	0.748	0.21
20_C	24_I	0.748	0.21
308_K	322_Q	0.747	0.21
102_F	135_D	0.747	0.21
154_Q	209_L	0.746	0.21
107_P	154_Q	0.744	0.21
399_R	444_D	0.743	0.21
329_A	335_I	0.743	0.21
388_D	395_E	0.743	0.21
436_N	442_L	0.738	0.21
458_A	465_K	0.738	0.21
303_A	311_A	0.737	0.21
278_R	304_V	0.735	0.21
33_Y	51_K	0.734	0.21
86_S	95_V	0.731	0.21
341_S	344_Q	0.729	0.21
200_A	206_L	0.727	0.21
204_E	216_R	0.725	0.20
301_E	317_I	0.724	0.20
286_R	301_E	0.723	0.20
52_V	318_K	0.723	0.20
110_E	125_S	0.720	0.20
353_L	358_A	0.718	0.20
288_L	292_Q	0.715	0.20
459_L	479_I	0.713	0.20
459_L	466_S	0.713	0.20
65_H	214_E	0.713	0.20
137_F	470_M	0.711	0.20
462_V	504_A	0.710	0.20
334_S	337_I	0.709	0.20
64_F	301_E	0.706	0.20
25_I	431_A	0.705	0.20
356_A	387_Q	0.704	0.20
386_A	392_K	0.703	0.20
311_A	315_V	0.701	0.20
416_E	427_A	0.700	0.20
22_L	444_D	0.700	0.20
133_V	141_L	0.700	0.20
514_Y	517_Q	0.699	0.20
207_T	220_R	0.698	0.20
472_S	477_K	0.697	0.19
51_K	55_S	0.697	0.19
95_V	102_F	0.696	0.19
417_L	421_T	0.696	0.19
148_M	251_F	0.695	0.19
93_M	150_M	0.694	0.19
321_E	390_E	0.694	0.19
284_Q	293_I	0.692	0.19
314_E	327_E	0.691	0.19
310_E	314_E	0.690	0.19
282_A	289_A	0.689	0.19
311_A	329_A	0.688	0.19
414_I	424_K	0.687	0.19
54_M	112_I	0.686	0.19
404_K	412_A	0.686	0.19
502_N	521_I	0.685	0.19
151_H	289_A	0.685	0.19
136_K	171_D	0.685	0.19
264_T	275_E	0.683	0.19
407_A	413_A	0.682	0.19
237_D	269_A	0.682	0.19
41_A	57_G	0.682	0.19
133_V	165_Q	0.681	0.19
502_N	506_Q	0.679	0.19
342_E	346_Q	0.678	0.19
437_D	441_V	0.677	0.19
131_M	173_S	0.675	0.19
454_A	463_I	0.674	0.19
378_K	391_T	0.674	0.19
34_R	152_E	0.670	0.19
268_N	275_E	0.669	0.19
311_A	317_I	0.668	0.19
22_L	63_I	0.668	0.19
88_I	92_R	0.665	0.18
320_I	524_L	0.663	0.18
454_A	458_A	0.663	0.18
361_A	367_T	0.663	0.18
456_L	503_L	0.663	0.18
22_L	169_A	0.661	0.18
64_F	425_G	0.661	0.18
94_R	203_A	0.661	0.18
504_A	522_D	0.660	0.18
479_I	503_L	0.660	0.18
479_I	507_A	0.659	0.18
132_L	203_A	0.659	0.18
483_G	491_G	0.659	0.18
13_F	27_I	0.657	0.18
273_A	280_R	0.657	0.18
76_K	129_L	0.657	0.18
331_Q	341_S	0.655	0.18
207_T	214_E	0.654	0.18
152_E	159_N	0.653	0.18
354_A	358_A	0.653	0.18
102_F	155_D	0.651	0.18
328_I	340_K	0.650	0.18
92_R	151_H	0.648	0.18
481_V	491_G	0.646	0.18
71_N	117_Q	0.646	0.18
11_W	26_G	0.646	0.18
35_R	168_V	0.645	0.18
27_I	31_R	0.645	0.18
39_E	473_I	0.645	0.18
331_Q	345_S	0.643	0.18
340_K	343_Q	0.643	0.18
436_N	441_V	0.642	0.18
32_L	59_I	0.642	0.18
282_A	382_L	0.638	0.18
394_V	412_A	0.637	0.18
360_S	363_Q	0.636	0.17
17_I	21_I	0.635	0.17
53_V	64_F	0.635	0.17
481_V	484_L	0.633	0.17
216_R	356_A	0.632	0.17
308_K	412_A	0.632	0.17
518_A	525_L	0.629	0.17
432_Q	439_I	0.629	0.17
102_F	107_P	0.628	0.17
478_I	484_L	0.627	0.17
74_T	92_R	0.627	0.17
91_D	256_Q	0.626	0.17
374_A	401_K	0.624	0.17
37_S	67_I	0.623	0.17
283_E	290_E	0.623	0.17
363_Q	369_R	0.623	0.17
504_A	515_R	0.622	0.17
479_I	518_A	0.621	0.17
15_A	19_V	0.619	0.17
88_I	185_T	0.617	0.17
97_V	186_N	0.616	0.17
257_E	261_K	0.616	0.17
166_N	271_I	0.615	0.17
303_A	307_R	0.614	0.17
101_F	172_L	0.614	0.17
202_D	206_L	0.614	0.17
86_S	145_A	0.612	0.17
466_S	475_G	0.612	0.17
429_A	438_A	0.612	0.17
71_N	129_L	0.611	0.17
367_T	380_V	0.610	0.17
252_M	363_Q	0.610	0.17
396_L	400_A	0.609	0.17
46_G	223_V	0.608	0.17
34_R	37_S	0.607	0.17
302_Q	324_Q	0.607	0.17
92_R	138_V	0.607	0.17
349_A	354_A	0.605	0.17
408_E	413_A	0.604	0.17
187_F	465_K	0.603	0.16
507_A	522_D	0.603	0.16
432_Q	443_S	0.603	0.16
18_A	355_L	0.601	0.16
457_Q	486_R	0.601	0.16
426_L	433_R	0.599	0.16
371_T	444_D	0.598	0.16
455_L	524_L	0.598	0.16
154_Q	186_N	0.597	0.16
210_T	227_V	0.597	0.16
45_T	93_M	0.597	0.16
20_C	377_A	0.596	0.16
473_I	523_S	0.596	0.16
372_A	376_R	0.595	0.16
353_L	365_V	0.594	0.16
138_V	182_V	0.594	0.16
477_K	481_V	0.593	0.16
360_S	364_N	0.592	0.16
103_V	411_A	0.592	0.16
318_K	342_E	0.590	0.16
184_L	187_F	0.590	0.16
72_M	425_G	0.589	0.16
484_L	501_G	0.589	0.16
161_V	182_V	0.589	0.16
234_K	251_F	0.588	0.16
197_P	210_T	0.588	0.16
472_S	478_I	0.587	0.16
19_V	110_E	0.587	0.16
42_F	412_A	0.586	0.16
345_S	354_A	0.586	0.16
21_I	131_M	0.585	0.16
397_T	420_A	0.585	0.16
91_D	420_A	0.585	0.16
356_A	371_T	0.585	0.16
136_K	180_E	0.584	0.16
127_E	237_D	0.584	0.16
20_C	27_I	0.583	0.16
251_F	263_R	0.581	0.16
46_G	329_A	0.580	0.16
354_A	357_E	0.580	0.16
384_A	417_L	0.579	0.16
378_K	385_A	0.577	0.16
169_A	472_S	0.577	0.16
45_T	359_V	0.576	0.16
37_S	156_T	0.576	0.16
308_K	334_S	0.575	0.16
200_A	209_L	0.575	0.16
312_E	316_R	0.574	0.16
152_E	261_K	0.573	0.16
397_T	403_E	0.573	0.16
260_V	385_A	0.572	0.16
44_R	359_V	0.569	0.15
313_R	327_E	0.569	0.15
57_G	112_I	0.569	0.15
214_E	479_I	0.568	0.15
507_A	523_S	0.567	0.15
129_L	238_A	0.567	0.15
161_V	227_V	0.567	0.15
324_Q	327_E	0.566	0.15
455_L	507_A	0.563	0.15
13_F	22_L	0.563	0.15
478_I	522_D	0.562	0.15
371_T	376_R	0.562	0.15
385_A	388_D	0.562	0.15
472_S	479_I	0.562	0.15
397_T	402_A	0.561	0.15
390_E	394_V	0.561	0.15
363_Q	367_T	0.561	0.15
172_L	209_L	0.560	0.15
452_K	520_L	0.560	0.15
412_A	428_E	0.557	0.15
53_V	293_I	0.557	0.15
14_T	27_I	0.557	0.15
43_V	177_L	0.556	0.15
267_Q	271_I	0.556	0.15
16_I	421_T	0.556	0.15
478_I	521_I	0.554	0.15
137_F	204_E	0.554	0.15
46_G	130_R	0.552	0.15
470_M	475_G	0.552	0.15
172_L	187_F	0.552	0.15
421_T	425_G	0.552	0.15
277_E	282_A	0.552	0.15
28_I	377_A	0.552	0.15
118_T	175_N	0.551	0.15
292_Q	379_Q	0.551	0.15
358_A	361_A	0.551	0.15
329_A	334_S	0.550	0.15
216_R	221_N	0.549	0.15
419_E	422_R	0.548	0.15
457_Q	465_K	0.547	0.15
106_K	178_E	0.546	0.15
516_T	522_D	0.545	0.15
21_I	26_G	0.545	0.15
146_A	263_R	0.545	0.15
322_Q	327_E	0.544	0.15
369_R	378_K	0.541	0.15
114_T	152_E	0.541	0.15
334_S	339_A	0.540	0.15
345_S	356_A	0.540	0.15
396_L	402_A	0.539	0.15
518_A	522_D	0.539	0.15
253_T	257_E	0.538	0.15
26_G	30_A	0.538	0.15
28_I	173_S	0.537	0.15
21_I	27_I	0.537	0.15
517_Q	521_I	0.536	0.15
115_A	177_L	0.536	0.15
89_T	331_Q	0.536	0.15
505_E	517_Q	0.535	0.15
308_K	316_R	0.534	0.15
368_T	380_V	0.532	0.14
424_K	428_E	0.530	0.14
439_I	478_I	0.530	0.14
416_E	421_T	0.530	0.14
306_S	337_I	0.530	0.14
352_N	356_A	0.526	0.14
434_A	437_D	0.525	0.14
137_F	221_N	0.525	0.14
309_V	317_I	0.524	0.14
463_I	522_D	0.524	0.14
60_V	265_A	0.523	0.14
148_M	225_Q	0.522	0.14
104_R	137_F	0.522	0.14
88_I	94_R	0.521	0.14
363_Q	380_V	0.521	0.14
18_A	109_V	0.520	0.14
104_R	145_A	0.518	0.14
360_S	365_V	0.518	0.14
314_E	317_I	0.517	0.14
79_V	317_I	0.516	0.14
88_I	146_A	0.516	0.14
24_I	430_E	0.515	0.14
352_N	360_S	0.514	0.14
46_G	53_V	0.513	0.14
366_E	419_E	0.513	0.14
369_R	375_D	0.513	0.14
365_V	376_R	0.513	0.14
224_E	227_V	0.513	0.14
86_S	155_D	0.511	0.14
12_M	29_F	0.511	0.14
102_F	140_A	0.510	0.14
486_R	492_D	0.510	0.14
261_K	314_E	0.510	0.14
93_M	201_F	0.510	0.14
100_A	155_D	0.509	0.14
109_V	113_A	0.506	0.14
147_Q	520_L	0.506	0.14
314_E	463_I	0.505	0.14
398_V	410_Q	0.504	0.14
342_E	347_A	0.504	0.14
480_Q	505_E	0.504	0.14
428_E	435_L	0.504	0.14
344_Q	349_A	0.503	0.14
212_E	227_V	0.503	0.14
360_S	381_A	0.503	0.14
71_N	75_L	0.502	0.14
217_R	288_L	0.502	0.14
371_T	383_I	0.502	0.14
417_L	423_K	0.501	0.14
96_D	124_L	0.501	0.14
316_R	319_E	0.500	0.14
61_M	304_V	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1winA	1	0.2586	99.9	0.844	Contact Map
4fvgA	2	0.1971	99.8	0.864	Contact Map
3bk6A	3	0.2984	99.8	0.866	Contact Map
2rpbA	1	0.2043	99.5	0.892	Contact Map
2zuoA	7	0.66	88.5	0.964	Contact Map
3v6iB	1	0.1754	51.2	0.974	Contact Map
5a2fA	1	0	38.2	0.976	Contact Map
2e0zA	8	0.2007	31.7	0.977	Contact Map
4um9B	2	0	27.2	0.978	Contact Map
2jwaA	2	0.0687	23.4	0.978	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.