YGAQ - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YGAQ - Putative uncharacterized protein YgaQ

UniProt:	P76616	Sequences: MFSIKPGPRNLPIDNPTLLSWNITDGDLNSKLNTLEYLNCITNIINSCGVYPQGLKDREIISTFHAEKVINDLLKNDYKISLSPDTTYRELNKAAQRSITAPDRIGERKTWVYQRDTMIERGDNSGVYQYGRAEHFTHIISDKPSPKDKYVAYAINIPDYELAADVYNINVTSPSGQQETFKILINLEHLRQTLERKSLTAVQKSQCEIITPKKPGEAILHAFNATYQQIRENMSEFARCHYGYIQIPPVTTFRADGPETPEEEKGYWFHAYQPEDLCTIHNPMGDLQDFIALVKDAKKFGIDIIPDYTFNFMGIGGSGKNDLDYPSADIRAKISKDIEGGIPGYWQGQVLIPFIKDPVTKERKQIHPEDIHLTAKDFEASKDNISKDEWENLHALKEKRLNGMPKTTPKSDQVIMLQNQYVREMRKYGVRGLRYDAAKHSKHEQIERSITPPLKNYNERLHNTNLFNPKYHKKAVMNYMEYLVTCQLDEQQMSSLLYERDDLSAIDFSLLMKTIKAFSFGGDLQTLASKPGSTISSIPSERRILININHDFPNNGNLFNDFLFNHQQDEQLAMAYIAALPFSRPLVYWDGQVLKSTTEIKNYDGSTRVGGEAWLNKGCSTYQQLYNEFHALYIDKAGIWSAFEGVSATKNVLAFSRGDSVNINHSPHDGLVIINKGNEEVEGTWPNKLQPGIYKNMGSNSVNIIINNTRKIIPPGKVFTLRGGTLNINIPGRSALLLGKTGEPPNYLYL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13520
Length:	750 (559)
Sequences:	215 (186)
Seq/√Len:	7.9

ECOLI - YGAQ GLGB
BACSU - PULA
SULSO - Q7LX99

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
150_Y	153_Y	5.081	0.99
290_F	294_V	5.064	0.99
296_D	299_K	4.169	0.98
328_A	331_R	4.134	0.98
124_N	127_V	4.075	0.97
328_A	333_K	3.670	0.95
120_E	123_D	3.249	0.91
291_I	427_K	3.196	0.90
123_D	127_V	3.043	0.88
164_A	169_I	2.962	0.86
579_A	672_V	2.882	0.85
120_E	124_N	2.837	0.84
120_E	125_S	2.816	0.83
183_I	186_N	2.808	0.83
122_G	125_S	2.778	0.82
118_M	125_S	2.627	0.78
436_D	550_H	2.626	0.78
255_A	267_Y	2.566	0.77
327_S	331_R	2.553	0.76
298_K	431_R	2.527	0.76
103_D	120_E	2.513	0.75
125_S	132_R	2.495	0.75
183_I	190_L	2.458	0.73
575_A	718_V	2.414	0.72
330_I	333_K	2.392	0.71
272_Y	434_R	2.390	0.71
312_F	550_H	2.357	0.70
124_N	130_Y	2.349	0.70
151_V	154_A	2.314	0.69
313_M	330_I	2.304	0.68
309_T	312_F	2.289	0.68
151_V	155_I	2.279	0.67
458_N	464_T	2.278	0.67
118_M	123_D	2.256	0.67
272_Y	550_H	2.255	0.67
625_L	705_I	2.252	0.66
312_F	436_D	2.251	0.66
103_D	118_M	2.245	0.66
434_R	550_H	2.239	0.66
272_Y	469_P	2.234	0.66
434_R	469_P	2.219	0.65
125_S	130_Y	2.197	0.64
401_L	440_H	2.194	0.64
307_D	550_H	2.194	0.64
326_P	331_R	2.183	0.64
325_Y	328_A	2.167	0.63
312_F	469_P	2.149	0.63
454_L	464_T	2.143	0.62
223_F	248_P	2.141	0.62
469_P	550_H	2.085	0.60
601_K	604_D	2.082	0.60
116_D	120_E	2.073	0.60
307_D	436_D	2.061	0.59
166_V	169_I	2.032	0.58
103_D	125_S	2.024	0.58
272_Y	436_D	2.009	0.57
593_V	607_T	1.989	0.56
152_A	156_N	1.984	0.56
651_N	677_G	1.968	0.56
113_Y	118_M	1.962	0.55
165_D	169_I	1.960	0.55
162_L	165_D	1.942	0.54
116_D	125_S	1.942	0.54
629_F	635_D	1.931	0.54
164_A	171_V	1.930	0.54
250_V	290_F	1.922	0.54
162_L	169_I	1.913	0.53
245_I	297_A	1.895	0.53
115_R	118_M	1.891	0.52
272_Y	551_D	1.870	0.52
307_D	312_F	1.856	0.51
434_R	551_D	1.855	0.51
152_A	155_I	1.836	0.50
113_Y	116_D	1.834	0.50
436_D	469_P	1.829	0.50
429_G	566_H	1.823	0.50
95_A	99_I	1.813	0.49
102_P	120_E	1.807	0.49
628_E	632_L	1.798	0.49
677_G	681_V	1.795	0.49
272_Y	312_F	1.793	0.48
103_D	116_D	1.790	0.48
102_P	123_D	1.786	0.48
151_V	157_I	1.783	0.48
120_E	127_V	1.774	0.48
278_C	421_Y	1.774	0.48
312_F	434_R	1.772	0.48
468_N	630_H	1.768	0.47
127_V	130_Y	1.764	0.47
184_L	190_L	1.764	0.47
327_S	333_K	1.758	0.47
406_K	474_K	1.740	0.46
102_P	106_G	1.731	0.46
103_D	123_D	1.716	0.45
309_T	436_D	1.716	0.45
309_T	550_H	1.716	0.45
247_I	304_I	1.711	0.45
239_R	624_Q	1.707	0.45
469_P	551_D	1.688	0.44
116_D	123_D	1.684	0.44
147_K	150_Y	1.684	0.44
162_L	166_V	1.677	0.44
97_R	103_D	1.670	0.43
406_K	473_K	1.669	0.43
436_D	551_D	1.664	0.43
272_Y	309_T	1.650	0.43
309_T	469_P	1.627	0.42
113_Y	123_D	1.621	0.42
587_V	635_D	1.616	0.41
118_M	124_N	1.615	0.41
242_Y	302_I	1.611	0.41
548_I	591_G	1.605	0.41
508_F	511_L	1.598	0.41
326_P	329_D	1.591	0.40
147_K	152_A	1.590	0.40
272_Y	307_D	1.582	0.40
168_N	171_V	1.577	0.40
329_D	333_K	1.575	0.40
117_T	120_E	1.558	0.39
307_D	434_R	1.557	0.39
113_Y	120_E	1.550	0.39
219_I	248_P	1.546	0.39
298_K	304_I	1.543	0.38
216_G	637_A	1.539	0.38
153_Y	157_I	1.517	0.37
127_V	132_R	1.516	0.37
600_I	605_G	1.505	0.37
407_T	414_V	1.496	0.37
228_Q	232_E	1.495	0.37
123_D	130_Y	1.486	0.36
500_R	505_A	1.485	0.36
246_Q	276_D	1.476	0.36
423_R	452_P	1.469	0.36
113_Y	125_S	1.469	0.36
415_I	448_R	1.464	0.35
327_S	330_I	1.458	0.35
218_A	588_Y	1.456	0.35
117_T	123_D	1.454	0.35
587_V	644_E	1.451	0.35
102_P	113_Y	1.447	0.35
125_S	128_Y	1.430	0.34
296_D	300_F	1.410	0.34
307_D	469_P	1.405	0.33
439_K	552_F	1.397	0.33
312_F	551_D	1.392	0.33
153_Y	156_N	1.387	0.33
113_Y	126_G	1.375	0.32
116_D	124_N	1.374	0.32
102_P	118_M	1.374	0.32
294_V	634_I	1.372	0.32
310_F	421_Y	1.358	0.32
165_D	168_N	1.354	0.32
244_Y	303_D	1.351	0.31
331_R	408_T	1.344	0.31
147_K	151_V	1.343	0.31
97_R	101_A	1.342	0.31
326_P	333_K	1.338	0.31
123_D	128_Y	1.326	0.31
625_L	698_G	1.317	0.30
151_V	156_N	1.315	0.30
97_R	102_P	1.312	0.30
571_Q	618_G	1.311	0.30
221_H	269_F	1.310	0.30
252_T	283_P	1.300	0.30
110_T	113_Y	1.296	0.30
106_G	120_E	1.295	0.29
115_R	120_E	1.290	0.29
508_F	552_F	1.289	0.29
151_V	171_V	1.279	0.29
184_L	191_R	1.278	0.29
104_R	117_T	1.277	0.29
680_E	715_P	1.277	0.29
103_D	106_G	1.274	0.29
271_A	312_F	1.272	0.29
600_I	606_S	1.270	0.29
642_A	645_G	1.270	0.29
207_C	429_G	1.267	0.29
255_A	290_F	1.265	0.28
91_L	94_A	1.257	0.28
506_I	552_F	1.254	0.28
450_I	455_K	1.253	0.28
226_T	709_T	1.253	0.28
125_S	137_T	1.246	0.28
466_L	587_V	1.246	0.28
150_Y	156_N	1.240	0.28
286_D	587_V	1.235	0.27
469_P	609_V	1.234	0.27
626_Y	635_D	1.232	0.27
311_N	406_K	1.223	0.27
241_H	309_T	1.220	0.27
269_F	508_F	1.215	0.27
123_D	132_R	1.215	0.27
185_I	192_Q	1.212	0.27
469_P	590_D	1.211	0.27
107_E	111_W	1.210	0.27
102_P	116_D	1.202	0.26
452_P	669_D	1.201	0.26
455_K	503_L	1.197	0.26
309_T	434_R	1.190	0.26
80_I	129_Q	1.187	0.26
103_D	113_Y	1.186	0.26
88_Y	95_A	1.185	0.26
124_N	132_R	1.182	0.26
600_I	604_D	1.182	0.26
188_E	192_Q	1.182	0.26
448_R	465_N	1.173	0.26
304_I	431_R	1.173	0.26
313_M	473_K	1.170	0.25
220_L	414_V	1.168	0.25
455_K	655_F	1.167	0.25
118_M	122_G	1.166	0.25
525_Q	529_S	1.166	0.25
412_D	697_M	1.163	0.25
148_D	151_V	1.159	0.25
527_L	654_A	1.157	0.25
471_Y	630_H	1.156	0.25
97_R	118_M	1.154	0.25
622_Y	625_L	1.150	0.25
99_I	102_P	1.146	0.25
196_R	199_L	1.145	0.25
158_P	165_D	1.141	0.25
248_P	589_W	1.141	0.25
506_I	511_L	1.137	0.24
160_Y	165_D	1.133	0.24
150_Y	154_A	1.131	0.24
478_N	482_Y	1.130	0.24
552_F	557_N	1.121	0.24
74_L	80_I	1.112	0.24
172_T	668_H	1.112	0.24
237_F	297_A	1.105	0.23
150_Y	155_I	1.100	0.23
271_A	431_R	1.100	0.23
307_D	551_D	1.099	0.23
152_A	157_I	1.094	0.23
150_Y	157_I	1.091	0.23
241_H	469_P	1.088	0.23
115_R	123_D	1.088	0.23
281_H	403_G	1.086	0.23
320_K	323_L	1.081	0.23
319_G	323_L	1.079	0.23
128_Y	132_R	1.078	0.23
230_I	234_M	1.077	0.23
241_H	312_F	1.075	0.23
186_N	190_L	1.075	0.23
274_P	405_P	1.070	0.22
309_T	590_D	1.066	0.22
237_F	290_F	1.066	0.22
103_D	122_G	1.065	0.22
310_F	552_F	1.065	0.22
518_F	624_Q	1.065	0.22
83_S	198_S	1.062	0.22
188_E	191_R	1.060	0.22
80_I	683_G	1.058	0.22
184_L	188_E	1.056	0.22
88_Y	94_A	1.055	0.22
328_A	334_I	1.054	0.22
116_D	128_Y	1.053	0.22
268_W	549_N	1.053	0.22
187_L	191_R	1.051	0.22
215_P	539_P	1.051	0.22
116_D	122_G	1.045	0.22
313_M	505_A	1.042	0.22
406_K	475_A	1.041	0.22
74_L	78_Y	1.040	0.22
599_E	604_D	1.034	0.21
97_R	100_T	1.033	0.21
326_P	330_I	1.033	0.21
111_W	118_M	1.028	0.21
88_Y	91_L	1.027	0.21
708_N	712_I	1.023	0.21
73_L	76_N	1.022	0.21
469_P	592_Q	1.019	0.21
312_F	609_V	1.015	0.21
249_P	307_D	1.015	0.21
506_I	557_N	1.010	0.21
116_D	130_Y	1.007	0.21
579_A	655_F	1.007	0.21
470_K	554_N	1.003	0.21
99_I	103_D	1.002	0.21
196_R	665_H	1.000	0.21
103_D	124_N	0.999	0.21
148_D	152_A	0.996	0.20
122_G	130_Y	0.993	0.20
111_W	121_R	0.992	0.20
226_T	293_L	0.990	0.20
559_F	571_Q	0.988	0.20
310_F	437_A	0.988	0.20
234_M	649_T	0.986	0.20
245_I	602_N	0.986	0.20
308_Y	437_A	0.984	0.20
302_I	619_C	0.982	0.20
431_R	583_S	0.981	0.20
228_Q	231_R	0.977	0.20
546_I	557_N	0.976	0.20
147_K	153_Y	0.976	0.20
282_N	413_Q	0.976	0.20
467_F	549_N	0.973	0.20
269_F	552_F	0.972	0.20
111_W	116_D	0.962	0.20
102_P	115_R	0.959	0.19
120_E	130_Y	0.957	0.19
592_Q	671_L	0.952	0.19
313_M	406_K	0.951	0.19
75_K	653_L	0.951	0.19
303_D	458_N	0.950	0.19
277_L	640_W	0.949	0.19
123_D	126_G	0.948	0.19
267_Y	588_Y	0.947	0.19
268_W	285_G	0.947	0.19
226_T	232_E	0.944	0.19
106_G	123_D	0.943	0.19
399_K	402_N	0.942	0.19
83_S	197_K	0.942	0.19
103_D	114_Q	0.939	0.19
246_Q	546_I	0.939	0.19
615_L	683_G	0.938	0.19
417_L	424_E	0.932	0.19
591_G	623_Q	0.930	0.19
249_P	550_H	0.930	0.19
413_Q	435_Y	0.929	0.19
238_A	349_Q	0.929	0.19
305_I	684_T	0.926	0.19
271_A	309_T	0.925	0.19
516_K	519_S	0.924	0.19
325_Y	331_R	0.921	0.19
224_N	697_M	0.918	0.18
278_C	283_P	0.917	0.18
241_H	272_Y	0.915	0.18
160_Y	512_M	0.915	0.18
560_N	564_F	0.914	0.18
290_F	417_L	0.913	0.18
312_F	583_S	0.909	0.18
309_T	551_D	0.905	0.18
446_I	612_E	0.905	0.18
254_R	314_G	0.905	0.18
97_R	106_G	0.903	0.18
136_F	139_I	0.901	0.18
223_F	253_F	0.900	0.18
307_D	583_S	0.899	0.18
634_I	669_D	0.897	0.18
159_D	305_I	0.896	0.18
72_D	75_K	0.895	0.18
146_P	151_V	0.894	0.18
99_I	114_Q	0.893	0.18
104_R	115_R	0.892	0.18
98_S	301_G	0.891	0.18
232_E	239_R	0.891	0.18
468_N	590_D	0.891	0.18
665_H	669_D	0.889	0.18
507_D	692_G	0.884	0.18
280_I	428_Y	0.883	0.18
249_P	583_S	0.880	0.18
311_N	404_M	0.880	0.18
448_R	587_V	0.877	0.17
514_T	547_N	0.877	0.17
272_Y	609_V	0.875	0.17
231_R	292_A	0.872	0.17
99_I	113_Y	0.872	0.17
183_I	192_Q	0.871	0.17
551_D	592_Q	0.870	0.17
230_I	656_S	0.867	0.17
327_S	332_A	0.867	0.17
448_R	585_P	0.866	0.17
524_L	534_T	0.865	0.17
99_I	117_T	0.864	0.17
644_E	699_S	0.863	0.17
298_K	428_Y	0.863	0.17
111_W	120_E	0.862	0.17
99_I	120_E	0.861	0.17
134_E	137_T	0.857	0.17
110_T	123_D	0.857	0.17
179_E	190_L	0.856	0.17
92_N	97_R	0.854	0.17
161_E	169_I	0.853	0.17
507_D	517_A	0.852	0.17
221_H	271_A	0.850	0.17
597_T	604_D	0.849	0.17
100_T	108_R	0.848	0.17
455_K	466_L	0.848	0.17
103_D	107_E	0.844	0.17
92_N	95_A	0.843	0.17
535_I	544_I	0.841	0.17
118_M	128_Y	0.840	0.17
621_T	712_I	0.839	0.17
99_I	123_D	0.835	0.17
446_I	503_L	0.835	0.17
290_F	300_F	0.834	0.17
142_D	145_S	0.830	0.16
114_Q	465_N	0.830	0.16
597_T	602_N	0.830	0.16
83_S	86_T	0.828	0.16
550_H	583_S	0.827	0.16
161_E	164_A	0.827	0.16
160_Y	163_A	0.826	0.16
410_K	603_Y	0.826	0.16
236_E	609_V	0.825	0.16
469_P	583_S	0.824	0.16
153_Y	171_V	0.822	0.16
434_R	609_V	0.820	0.16
310_F	508_F	0.816	0.16
280_I	293_L	0.815	0.16
546_I	549_N	0.815	0.16
438_A	446_I	0.814	0.16
149_K	152_A	0.814	0.16
110_T	125_S	0.811	0.16
644_E	658_G	0.811	0.16
153_Y	169_I	0.810	0.16
305_I	587_V	0.810	0.16
120_E	132_R	0.809	0.16
295_K	299_K	0.809	0.16
78_Y	83_S	0.808	0.16
290_F	481_E	0.807	0.16
91_L	286_D	0.807	0.16
407_T	413_Q	0.806	0.16
182_K	192_Q	0.806	0.16
277_L	622_Y	0.806	0.16
280_I	284_M	0.804	0.16
81_S	239_R	0.804	0.16
551_D	590_D	0.801	0.16
151_V	169_I	0.800	0.16
268_W	438_A	0.798	0.16
199_L	222_A	0.796	0.16
302_I	313_M	0.796	0.16
558_L	593_V	0.791	0.16
468_N	471_Y	0.790	0.16
122_G	444_E	0.789	0.16
97_R	113_Y	0.787	0.15
305_I	638_G	0.787	0.15
228_Q	634_I	0.786	0.15
106_G	118_M	0.785	0.15
325_Y	333_K	0.784	0.15
665_H	697_M	0.784	0.15
308_Y	421_Y	0.780	0.15
86_T	193_T	0.779	0.15
222_A	247_I	0.778	0.15
708_N	720_T	0.777	0.15
235_S	300_F	0.777	0.15
251_T	587_V	0.776	0.15
409_P	439_K	0.774	0.15
71_N	78_Y	0.770	0.15
143_K	456_N	0.770	0.15
116_D	127_V	0.767	0.15
146_P	715_P	0.766	0.15
307_D	311_N	0.765	0.15
552_F	555_N	0.763	0.15
302_I	699_S	0.762	0.15
235_S	417_L	0.760	0.15
294_V	502_D	0.759	0.15
249_P	436_D	0.757	0.15
167_Y	249_P	0.755	0.15
442_K	468_N	0.755	0.15
271_A	469_P	0.754	0.15
644_E	722_R	0.753	0.15
269_F	546_I	0.752	0.15
713_I	722_R	0.752	0.15
254_R	275_E	0.752	0.15
522_G	642_A	0.752	0.15
511_L	552_F	0.751	0.15
435_Y	557_N	0.749	0.15
311_N	437_A	0.747	0.15
549_N	553_P	0.747	0.15
300_F	479_Y	0.745	0.15
554_N	557_N	0.743	0.15
290_F	293_L	0.742	0.15
234_M	249_P	0.742	0.15
506_I	586_L	0.742	0.15
91_L	95_A	0.741	0.15
405_P	408_T	0.740	0.15
308_Y	557_N	0.739	0.14
97_R	120_E	0.738	0.14
225_A	268_W	0.738	0.14
189_H	192_Q	0.737	0.14
633_Y	637_A	0.734	0.14
243_G	303_D	0.733	0.14
228_Q	293_L	0.732	0.14
112_V	235_S	0.732	0.14
268_W	511_L	0.732	0.14
414_V	472_H	0.731	0.14
164_A	679_E	0.731	0.14
102_P	117_T	0.730	0.14
284_M	295_K	0.729	0.14
222_A	284_M	0.729	0.14
71_N	74_L	0.728	0.14
478_N	481_E	0.727	0.14
164_A	168_N	0.723	0.14
307_D	432_G	0.722	0.14
135_H	302_I	0.722	0.14
269_F	557_N	0.720	0.14
652_V	668_H	0.720	0.14
164_A	481_E	0.720	0.14
75_K	79_K	0.720	0.14
107_E	158_P	0.719	0.14
273_Q	506_I	0.719	0.14
102_P	114_Q	0.718	0.14
550_H	609_V	0.714	0.14
97_R	116_D	0.714	0.14
650_K	668_H	0.714	0.14
279_T	602_N	0.713	0.14
481_E	673_I	0.712	0.14
193_T	621_T	0.709	0.14
115_R	128_Y	0.709	0.14
96_Q	105_I	0.708	0.14
104_R	123_D	0.707	0.14
111_W	125_S	0.705	0.14
95_A	103_D	0.704	0.14
75_K	712_I	0.704	0.14
71_N	77_D	0.704	0.14
470_K	506_I	0.703	0.14
83_S	684_T	0.702	0.14
174_P	306_P	0.702	0.14
253_F	607_T	0.701	0.14
305_I	652_V	0.700	0.14
281_H	584_R	0.700	0.14
273_Q	511_L	0.700	0.14
114_Q	118_M	0.700	0.14
272_Y	432_G	0.699	0.14
249_P	311_N	0.698	0.14
107_E	113_Y	0.697	0.14
482_Y	628_E	0.694	0.14
504_S	508_F	0.694	0.14
467_F	548_I	0.694	0.14
167_Y	284_M	0.694	0.14
271_A	551_D	0.694	0.14
118_M	127_V	0.693	0.14
302_I	505_A	0.693	0.14
614_W	718_V	0.693	0.14
280_I	405_P	0.692	0.14
431_R	609_V	0.690	0.14
110_T	116_D	0.689	0.14
103_D	115_R	0.687	0.13
282_N	595_K	0.687	0.13
313_M	470_K	0.685	0.13
90_E	147_K	0.684	0.13
312_F	425_M	0.684	0.13
528_A	658_G	0.682	0.13
172_T	444_E	0.680	0.13
106_G	125_S	0.680	0.13
184_L	192_Q	0.678	0.13
326_P	334_I	0.676	0.13
87_T	93_K	0.675	0.13
152_A	173_S	0.674	0.13
265_K	683_G	0.673	0.13
118_M	130_Y	0.672	0.13
301_G	624_Q	0.671	0.13
680_E	702_V	0.671	0.13
538_I	544_I	0.670	0.13
248_P	669_D	0.670	0.13
573_A	591_G	0.670	0.13
124_N	128_Y	0.669	0.13
102_P	125_S	0.669	0.13
578_A	631_A	0.668	0.13
464_T	498_Y	0.668	0.13
213_K	653_L	0.667	0.13
93_K	299_K	0.666	0.13
479_Y	482_Y	0.666	0.13
111_W	115_R	0.666	0.13
268_W	470_K	0.666	0.13
186_N	189_H	0.665	0.13
302_I	414_V	0.663	0.13
277_L	424_E	0.663	0.13
287_L	671_L	0.662	0.13
436_D	583_S	0.661	0.13
400_R	437_A	0.661	0.13
79_K	138_H	0.661	0.13
162_L	171_V	0.660	0.13
329_D	623_Q	0.660	0.13
508_F	557_N	0.658	0.13
221_H	291_I	0.657	0.13
709_T	718_V	0.657	0.13
107_E	114_Q	0.657	0.13
646_V	696_N	0.656	0.13
425_M	551_D	0.656	0.13
313_M	401_L	0.655	0.13
86_T	94_A	0.654	0.13
579_A	698_G	0.652	0.13
480_M	592_Q	0.649	0.13
285_G	408_T	0.649	0.13
310_F	471_Y	0.649	0.13
628_E	684_T	0.648	0.13
286_D	533_S	0.647	0.13
216_G	284_M	0.647	0.13
636_K	707_N	0.646	0.13
90_E	198_S	0.645	0.13
127_V	137_T	0.645	0.13
268_W	282_N	0.645	0.13
399_K	589_W	0.645	0.13
103_D	117_T	0.645	0.13
279_T	293_L	0.644	0.13
691_P	714_P	0.644	0.13
113_Y	122_G	0.643	0.13
308_Y	546_I	0.643	0.13
241_H	307_D	0.641	0.13
154_A	615_L	0.641	0.13
231_R	286_D	0.639	0.13
271_A	550_H	0.638	0.13
652_V	683_G	0.636	0.13
629_F	636_K	0.633	0.12
278_C	310_F	0.633	0.12
407_T	441_S	0.633	0.12
282_N	508_F	0.632	0.12
446_I	556_G	0.632	0.12
542_R	559_F	0.632	0.12
551_D	609_V	0.631	0.12
598_T	636_K	0.631	0.12
437_A	508_F	0.631	0.12
183_I	191_R	0.629	0.12
406_K	409_P	0.628	0.12
185_I	193_T	0.627	0.12
427_K	558_L	0.626	0.12
642_A	646_V	0.624	0.12
471_Y	511_L	0.624	0.12
451_T	456_N	0.624	0.12
127_V	138_H	0.623	0.12
224_N	533_S	0.621	0.12
97_R	117_T	0.621	0.12
313_M	409_P	0.620	0.12
413_Q	557_N	0.616	0.12
612_E	653_L	0.615	0.12
182_K	191_R	0.615	0.12
273_Q	471_Y	0.614	0.12
274_P	282_N	0.611	0.12
679_E	712_I	0.611	0.12
237_F	301_G	0.610	0.12
146_P	153_Y	0.610	0.12
425_M	469_P	0.609	0.12
234_M	623_Q	0.608	0.12
245_I	612_E	0.608	0.12
331_R	406_K	0.606	0.12
308_Y	506_I	0.606	0.12
117_T	125_S	0.605	0.12
409_P	440_H	0.605	0.12
667_P	697_M	0.604	0.12
467_F	545_L	0.603	0.12
274_P	421_Y	0.603	0.12
99_I	110_T	0.603	0.12
522_G	710_R	0.602	0.12
423_R	465_N	0.602	0.12
286_D	621_T	0.602	0.12
409_P	421_Y	0.602	0.12
99_I	105_I	0.601	0.12
573_A	685_W	0.601	0.12
572_L	575_A	0.600	0.12
652_V	684_T	0.599	0.12
403_G	407_T	0.599	0.12
314_G	409_P	0.599	0.12
74_L	77_D	0.598	0.12
409_P	422_V	0.598	0.12
594_L	619_C	0.598	0.12
72_D	78_Y	0.597	0.12
188_E	639_I	0.596	0.12
416_M	420_Q	0.596	0.12
449_S	466_L	0.596	0.12
271_A	436_D	0.595	0.12
194_L	415_I	0.594	0.12
456_N	628_E	0.594	0.12
427_K	579_A	0.594	0.12
149_K	691_P	0.593	0.12
578_A	711_K	0.591	0.12
106_G	109_K	0.591	0.12
306_P	462_H	0.591	0.12
497_L	560_N	0.591	0.12
95_A	102_P	0.590	0.12
248_P	588_Y	0.589	0.12
311_N	721_L	0.589	0.12
104_R	114_Q	0.589	0.12
231_R	296_D	0.589	0.12
447_E	515_I	0.589	0.12
269_F	439_K	0.588	0.12
526_T	529_S	0.588	0.12
544_I	548_I	0.587	0.12
269_F	554_N	0.587	0.12
77_D	80_I	0.587	0.12
247_I	587_V	0.585	0.12
325_Y	329_D	0.585	0.12
83_S	628_E	0.583	0.12
413_Q	420_Q	0.582	0.12
86_T	632_L	0.580	0.12
82_L	86_T	0.580	0.12
100_T	110_T	0.579	0.12
552_F	580_L	0.577	0.12
544_I	557_N	0.577	0.12
102_P	105_I	0.577	0.12
124_N	134_E	0.577	0.12
214_K	230_I	0.575	0.11
273_Q	586_L	0.575	0.11
98_S	331_R	0.574	0.11
179_E	192_Q	0.574	0.11
431_R	469_P	0.574	0.11
424_E	427_K	0.574	0.11
221_H	557_N	0.573	0.11
218_A	597_T	0.572	0.11
78_Y	82_L	0.572	0.11
587_V	666_S	0.572	0.11
272_Y	590_D	0.572	0.11
72_D	77_D	0.572	0.11
92_N	96_Q	0.571	0.11
450_I	609_V	0.571	0.11
100_T	103_D	0.570	0.11
295_K	426_R	0.570	0.11
76_N	84_P	0.570	0.11
105_I	121_R	0.570	0.11
90_E	230_I	0.569	0.11
683_G	713_I	0.569	0.11
186_N	577_I	0.568	0.11
273_Q	555_N	0.567	0.11
179_E	670_G	0.567	0.11
310_F	470_K	0.567	0.11
223_F	271_A	0.566	0.11
225_A	569_D	0.565	0.11
113_Y	127_V	0.564	0.11
86_T	239_R	0.564	0.11
552_F	595_K	0.564	0.11
239_R	667_P	0.563	0.11
403_G	440_H	0.562	0.11
533_S	538_I	0.561	0.11
134_E	139_I	0.561	0.11
225_A	470_K	0.561	0.11
308_Y	552_F	0.561	0.11
154_A	157_I	0.561	0.11
212_P	430_V	0.561	0.11
308_Y	470_K	0.560	0.11
312_F	590_D	0.560	0.11
108_R	117_T	0.560	0.11
501_D	505_A	0.560	0.11
245_I	424_E	0.560	0.11
180_T	185_I	0.559	0.11
439_K	555_N	0.558	0.11
703_N	719_F	0.558	0.11
80_I	149_K	0.557	0.11
411_S	542_R	0.556	0.11
525_Q	571_Q	0.556	0.11
252_T	506_I	0.555	0.11
89_R	226_T	0.555	0.11
677_G	685_W	0.555	0.11
576_Y	622_Y	0.554	0.11
636_K	665_H	0.554	0.11
450_I	500_R	0.553	0.11
583_S	590_D	0.552	0.11
696_N	715_P	0.551	0.11
298_K	583_S	0.550	0.11
239_R	620_S	0.549	0.11
110_T	127_V	0.547	0.11
105_I	124_N	0.546	0.11
317_G	682_E	0.546	0.11
348_G	653_L	0.544	0.11
597_T	608_R	0.544	0.11
96_Q	99_I	0.542	0.11
241_H	434_R	0.542	0.11
152_A	165_D	0.541	0.11
109_K	123_D	0.541	0.11
245_I	622_Y	0.541	0.11
434_R	590_D	0.541	0.11
230_I	615_L	0.540	0.11
291_I	622_Y	0.540	0.11
447_E	501_D	0.540	0.11
548_I	629_F	0.540	0.11
81_S	84_P	0.539	0.11
462_H	712_I	0.539	0.11
91_L	539_P	0.539	0.11
84_P	673_I	0.539	0.11
75_K	294_V	0.538	0.11
161_E	285_G	0.538	0.11
306_P	322_D	0.537	0.11
135_H	692_G	0.537	0.11
221_H	508_F	0.537	0.11
617_K	620_S	0.536	0.11
107_E	118_M	0.536	0.11
629_F	668_H	0.536	0.11
102_P	124_N	0.535	0.11
214_K	672_V	0.535	0.11
594_L	699_S	0.535	0.11
273_Q	557_N	0.535	0.11
117_T	127_V	0.534	0.11
305_I	572_L	0.534	0.11
249_P	551_D	0.533	0.11
438_A	450_I	0.533	0.11
310_F	595_K	0.531	0.11
659_D	671_L	0.531	0.11
73_L	78_Y	0.531	0.11
633_Y	670_G	0.531	0.11
76_N	83_S	0.531	0.11
435_Y	595_K	0.529	0.11
656_S	669_D	0.529	0.11
449_S	507_D	0.529	0.11
227_Y	232_E	0.529	0.11
269_F	436_D	0.528	0.11
288_Q	295_K	0.528	0.11
421_Y	437_A	0.527	0.11
95_A	117_T	0.527	0.11
471_Y	540_S	0.527	0.11
432_G	550_H	0.526	0.11
629_F	715_P	0.524	0.11
125_S	134_E	0.523	0.11
313_M	328_A	0.523	0.11
182_K	633_Y	0.522	0.11
252_T	281_H	0.522	0.11
223_F	589_W	0.520	0.11
268_W	508_F	0.520	0.11
122_G	132_R	0.520	0.11
99_I	106_G	0.519	0.11
285_G	588_Y	0.518	0.11
408_T	421_Y	0.516	0.11
566_H	692_G	0.516	0.11
551_D	675_N	0.515	0.11
458_N	671_L	0.515	0.11
74_L	85_D	0.515	0.11
607_T	610_G	0.514	0.11
305_I	644_E	0.514	0.11
432_G	469_P	0.514	0.11
103_D	128_Y	0.513	0.10
421_Y	470_K	0.513	0.10
246_Q	313_M	0.512	0.10
325_Y	330_I	0.511	0.10
597_T	600_I	0.511	0.10
464_T	631_A	0.510	0.10
77_D	82_L	0.510	0.10
306_P	510_L	0.509	0.10
269_F	586_L	0.509	0.10
149_K	301_G	0.508	0.10
241_H	432_G	0.508	0.10
695_K	704_I	0.508	0.10
181_F	518_F	0.508	0.10
284_M	631_A	0.508	0.10
124_N	137_T	0.507	0.10
470_K	557_N	0.507	0.10
471_Y	552_F	0.506	0.10
271_A	298_K	0.506	0.10
450_I	458_N	0.506	0.10
470_K	552_F	0.505	0.10
454_L	463_N	0.505	0.10
249_P	272_Y	0.505	0.10
284_M	591_G	0.502	0.10
277_L	575_A	0.502	0.10
243_G	271_A	0.501	0.10
228_Q	292_A	0.500	0.10
643_F	657_R	0.500	0.10
293_L	426_R	0.500	0.10
196_R	656_S	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2wanA	1	0.8427	100	0.511	Contact Map
3wdhA	1	0.816	100	0.514	Contact Map
2e8yA	1	0.8347	100	0.514	Contact Map
3fawA	1	0.8293	100	0.539	Contact Map
2ya1A	1	0.8213	100	0.539	Contact Map
1wzlA	2	0.7093	100	0.551	Contact Map
1ea9C	2	0.7093	100	0.551	Contact Map
3k1dA	1	0.8373	100	0.552	Contact Map
3amlA	1	0.7787	100	0.552	Contact Map
2ya0A	1	0.748	100	0.554	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0147 seconds.