YEGQ - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YEGQ - Uncharacterized protease YegQ

UniProt:	P76403	Sequences: MFKPELLSPAGTLKNMRYAFAYGADAVYAGQPRYSLRVRNNEFNHENLQLGINEAHALGKKFYVVVNIAPHNAKLKTFIRDLKPVVEMGPDALIMSDPGLIMLVREHFPEMPIHLSVQANAVNWATVKFWQQMGLTRVILSRELSLEEIEEIRNQVPDMEIEIFVHGALCMAYSGRCLLSGYINKRDPNQGTCTNACRWEYNVQEGKEDDVGNIVHKYEPIPVQNVEPTLGIGAPTDKVFMIEEAQRPGEYMTAFEDEHGTYIMNSKDLRAIAHVERLTKMGVHSLKIEGRTKSFYYCARTAQVYRKAIDDAAAGKPFDTSLLETLEGLAHRGYTEGFLRRHTHDDYQNYEYGYSVSDRQQFVGEFTGERKGDLAAVAVKNKFSVGDSLELMTPQGNINFTLEHMENAKGEAMPIAPGDGYTVWLPVPQDLELNYALLMRNFSGETTRNPHGK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG14060
Length:	453 (420)
Sequences:	402 (169)
Seq/√Len:	8.2

ECOLI - YEGQ
BACSU - YRRO

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
66_V	78_F	7.906	1.00
17_R	54_E	5.995	1.00
272_I	304_V	5.984	1.00
65_V	339_L	4.724	0.99
276_E	280_K	4.684	0.99
8_S	302_A	3.795	0.97
391_L	400_F	3.604	0.95
364_G	377_V	3.360	0.93
75_L	124_W	3.349	0.93
243_E	249_G	3.302	0.93
49_Q	53_N	3.163	0.91
131_Q	158_D	3.075	0.90
407_N	411_E	3.049	0.89
20_F	55_A	3.036	0.89
150_E	277_R	2.990	0.88
368_G	376_A	2.748	0.83
336_E	340_R	2.681	0.82
127_V	159_M	2.670	0.81
112_P	136_T	2.625	0.80
244_E	247_R	2.600	0.79
156_V	284_H	2.548	0.78
382_K	415_I	2.532	0.78
68_I	96_S	2.447	0.75
69_A	96_S	2.428	0.74
14_K	365_E	2.427	0.74
127_V	138_V	2.357	0.72
243_E	251_Y	2.321	0.71
65_V	171_M	2.308	0.70
405_M	425_L	2.295	0.70
121_A	126_T	2.294	0.70
233_G	236_T	2.243	0.68
307_K	319_D	2.239	0.68
12_T	15_N	2.236	0.68
228_P	233_G	2.178	0.66
15_N	38_V	2.165	0.65
362_F	365_E	2.161	0.65
273_A	323_L	2.156	0.65
124_W	155_Q	2.114	0.63
336_E	343_T	2.086	0.62
8_S	15_N	2.071	0.62
72_N	124_W	2.068	0.62
306_R	310_D	2.065	0.61
150_E	154_N	2.061	0.61
339_L	346_D	2.033	0.60
15_N	18_Y	1.993	0.59
16_M	20_F	1.968	0.58
69_A	122_V	1.960	0.57
230_L	233_G	1.950	0.57
16_M	62_F	1.944	0.57
7_L	10_A	1.898	0.55
389_L	402_L	1.878	0.54
5_E	9_P	1.878	0.54
330_A	373_D	1.877	0.54
121_A	138_V	1.839	0.52
14_K	295_F	1.773	0.49
87_E	368_G	1.765	0.49
42_E	46_E	1.749	0.48
64_V	85_V	1.738	0.48
183_I	254_A	1.698	0.46
12_T	413_M	1.652	0.44
38_V	65_V	1.651	0.44
202_N	243_E	1.642	0.44
138_V	171_M	1.635	0.44
351_E	362_F	1.629	0.44
18_Y	362_F	1.625	0.43
50_L	54_E	1.624	0.43
5_E	10_A	1.594	0.42
150_E	280_K	1.590	0.42
171_M	339_L	1.588	0.42
320_T	323_L	1.576	0.41
18_Y	295_F	1.570	0.41
108_F	185_K	1.557	0.41
232_I	236_T	1.549	0.40
7_L	11_G	1.543	0.40
95_M	100_L	1.519	0.39
192_T	344_H	1.518	0.39
6_L	9_P	1.516	0.39
65_V	358_D	1.515	0.39
8_S	288_I	1.511	0.39
21_A	360_Q	1.487	0.38
295_F	362_F	1.483	0.38
89_G	132_Q	1.479	0.38
4_P	313_A	1.472	0.37
31_Q	66_V	1.469	0.37
379_V	383_F	1.468	0.37
21_A	58_L	1.462	0.37
200_E	245_A	1.457	0.37
31_Q	78_F	1.456	0.37
203_V	243_E	1.456	0.37
240_F	254_A	1.454	0.37
311_D	316_K	1.454	0.37
107_H	171_M	1.442	0.36
378_A	419_D	1.441	0.36
324_E	345_D	1.438	0.36
205_E	238_K	1.433	0.36
31_Q	86_V	1.431	0.36
16_M	54_E	1.416	0.35
236_T	240_F	1.411	0.35
70_P	113_I	1.405	0.35
376_A	424_W	1.400	0.34
388_S	399_N	1.396	0.34
106_E	132_Q	1.386	0.34
131_Q	159_M	1.379	0.34
82_L	105_R	1.374	0.34
229_T	233_G	1.368	0.33
16_M	55_A	1.334	0.32
65_V	295_F	1.324	0.32
15_N	47_N	1.319	0.31
283_V	339_L	1.311	0.31
413_M	421_Y	1.308	0.31
228_P	231_G	1.305	0.31
183_I	284_H	1.298	0.31
415_I	421_Y	1.292	0.31
17_R	50_L	1.288	0.30
45_H	82_L	1.279	0.30
72_N	151_E	1.251	0.29
151_E	155_Q	1.250	0.29
5_E	11_G	1.243	0.29
233_G	237_D	1.240	0.29
6_L	10_A	1.239	0.29
3_K	228_P	1.225	0.28
300_R	303_Q	1.222	0.28
12_T	42_E	1.222	0.28
66_V	253_T	1.217	0.28
18_Y	22_Y	1.215	0.28
16_M	88_M	1.213	0.28
31_Q	85_V	1.208	0.28
203_V	254_A	1.202	0.27
281_M	340_R	1.202	0.27
75_L	272_I	1.201	0.27
78_F	86_V	1.200	0.27
8_S	14_K	1.199	0.27
75_L	108_F	1.194	0.27
214_I	239_V	1.192	0.27
42_E	339_L	1.189	0.27
15_N	295_F	1.188	0.27
273_A	336_E	1.188	0.27
368_G	374_L	1.172	0.26
213_N	216_H	1.165	0.26
202_N	389_L	1.164	0.26
184_N	311_D	1.163	0.26
72_N	188_P	1.154	0.26
6_L	11_G	1.153	0.26
234_A	237_D	1.153	0.26
340_R	343_T	1.149	0.26
233_G	344_H	1.146	0.26
128_K	131_Q	1.146	0.26
13_L	51_G	1.146	0.26
38_V	295_F	1.132	0.25
54_E	208_E	1.126	0.25
82_L	251_Y	1.118	0.25
236_T	255_F	1.118	0.25
154_N	277_R	1.117	0.25
408_A	422_T	1.116	0.25
18_Y	393_T	1.115	0.25
328_G	359_R	1.111	0.25
8_S	38_V	1.111	0.25
273_A	343_T	1.107	0.24
336_E	344_H	1.107	0.24
14_K	18_Y	1.103	0.24
45_H	68_I	1.097	0.24
132_Q	384_S	1.094	0.24
79_I	83_K	1.092	0.24
273_A	281_M	1.084	0.24
279_T	407_N	1.077	0.24
76_K	151_E	1.066	0.23
171_M	252_M	1.064	0.23
65_V	346_D	1.053	0.23
304_V	325_T	1.053	0.23
18_Y	360_Q	1.053	0.23
65_V	185_K	1.050	0.23
228_P	236_T	1.041	0.22
75_L	80_R	1.040	0.22
73_A	77_T	1.035	0.22
204_Q	241_M	1.034	0.22
96_S	344_H	1.033	0.22
216_H	378_A	1.030	0.22
110_E	361_Q	1.027	0.22
79_I	108_F	1.026	0.22
53_N	371_K	1.025	0.22
22_Y	133_M	1.024	0.22
216_H	392_M	1.023	0.22
75_L	107_H	1.020	0.22
169_L	342_H	1.019	0.22
204_Q	405_M	1.019	0.22
82_L	365_E	1.018	0.22
349_N	355_S	1.012	0.22
69_A	121_A	1.011	0.22
18_Y	21_A	1.010	0.22
77_T	81_D	1.009	0.22
159_M	284_H	1.006	0.21
133_M	154_N	1.005	0.21
50_L	138_V	1.004	0.21
352_Y	357_S	1.003	0.21
367_T	378_A	1.002	0.21
12_T	417_P	1.001	0.21
242_I	429_Q	1.001	0.21
324_E	351_E	1.000	0.21
63_Y	284_H	0.998	0.21
375_A	427_V	0.987	0.21
255_F	376_A	0.986	0.21
402_L	425_L	0.976	0.21
95_M	113_I	0.974	0.21
200_E	323_L	0.972	0.21
369_E	374_L	0.964	0.20
72_N	267_K	0.963	0.20
63_Y	242_I	0.963	0.20
13_L	54_E	0.962	0.20
95_M	353_G	0.959	0.20
8_S	18_Y	0.948	0.20
254_A	284_H	0.946	0.20
243_E	247_R	0.943	0.20
112_P	251_Y	0.941	0.20
12_T	65_V	0.936	0.20
167_G	191_G	0.936	0.20
167_G	290_G	0.936	0.20
191_G	290_G	0.936	0.20
32_P	98_P	0.935	0.20
60_K	72_N	0.932	0.19
65_V	108_F	0.932	0.19
283_V	346_D	0.929	0.19
124_W	188_P	0.929	0.19
46_E	89_G	0.926	0.19
257_D	262_Y	0.925	0.19
237_D	255_F	0.924	0.19
280_K	422_T	0.920	0.19
232_I	240_F	0.918	0.19
371_K	402_L	0.916	0.19
69_A	126_T	0.916	0.19
274_H	336_E	0.914	0.19
320_T	324_E	0.914	0.19
295_F	365_E	0.912	0.19
108_F	171_M	0.908	0.19
82_L	192_T	0.905	0.19
44_N	63_Y	0.903	0.19
244_E	296_Y	0.902	0.19
135_L	188_P	0.901	0.19
57_A	229_T	0.899	0.19
385_V	414_P	0.899	0.19
192_T	345_D	0.898	0.19
369_E	377_V	0.896	0.19
325_T	331_H	0.894	0.18
283_V	399_N	0.893	0.18
154_N	284_H	0.891	0.18
78_F	377_V	0.887	0.18
80_R	132_Q	0.884	0.18
14_K	38_V	0.883	0.18
228_P	344_H	0.882	0.18
373_D	413_M	0.882	0.18
126_T	339_L	0.880	0.18
51_G	296_Y	0.880	0.18
183_I	203_V	0.878	0.18
183_I	192_T	0.872	0.18
108_F	298_C	0.871	0.18
63_Y	133_M	0.870	0.18
15_N	358_D	0.870	0.18
106_E	128_K	0.866	0.18
82_L	89_G	0.863	0.18
215_V	283_V	0.862	0.18
96_S	108_F	0.860	0.18
55_A	62_F	0.859	0.18
69_A	229_T	0.858	0.18
89_G	307_K	0.855	0.18
239_V	255_F	0.855	0.18
128_K	207_K	0.854	0.17
18_Y	365_E	0.846	0.17
325_T	328_G	0.845	0.17
244_E	251_Y	0.845	0.17
183_I	236_T	0.843	0.17
44_N	361_Q	0.842	0.17
51_G	311_D	0.842	0.17
288_I	301_T	0.842	0.17
374_L	378_A	0.839	0.17
38_V	428_P	0.836	0.17
236_T	254_A	0.830	0.17
369_E	399_N	0.830	0.17
42_E	54_E	0.829	0.17
65_V	298_C	0.828	0.17
96_S	232_I	0.826	0.17
266_S	309_I	0.824	0.17
255_F	344_H	0.822	0.17
54_E	57_A	0.822	0.17
124_W	171_M	0.822	0.17
251_Y	255_F	0.822	0.17
136_T	188_P	0.822	0.17
48_L	319_D	0.820	0.17
95_M	101_I	0.820	0.17
171_M	358_D	0.820	0.17
209_D	238_K	0.818	0.17
233_G	240_F	0.817	0.17
108_F	339_L	0.815	0.17
150_E	276_E	0.813	0.17
83_K	401_T	0.812	0.17
138_V	377_V	0.811	0.16
121_A	133_M	0.811	0.16
156_V	159_M	0.808	0.16
230_L	236_T	0.807	0.16
230_L	235_P	0.805	0.16
264_M	401_T	0.803	0.16
32_P	379_V	0.802	0.16
82_L	417_P	0.802	0.16
45_H	352_Y	0.801	0.16
279_T	313_A	0.797	0.16
32_P	262_Y	0.794	0.16
89_G	111_M	0.793	0.16
32_P	257_D	0.791	0.16
211_V	325_T	0.791	0.16
65_V	417_P	0.791	0.16
408_A	424_W	0.790	0.16
246_Q	344_H	0.789	0.16
152_I	333_G	0.787	0.16
75_L	131_Q	0.786	0.16
185_K	339_L	0.786	0.16
367_T	419_D	0.786	0.16
281_M	336_E	0.784	0.16
149_I	339_L	0.783	0.16
103_L	111_M	0.782	0.16
171_M	392_M	0.779	0.16
331_H	405_M	0.778	0.16
22_Y	360_Q	0.777	0.16
373_D	402_L	0.777	0.16
66_V	86_V	0.776	0.16
53_N	77_T	0.774	0.16
135_L	159_M	0.773	0.16
105_R	251_Y	0.769	0.16
23_G	167_G	0.769	0.16
23_G	191_G	0.769	0.16
23_G	290_G	0.769	0.16
232_I	235_P	0.768	0.16
4_P	279_T	0.765	0.15
196_A	324_E	0.765	0.15
3_K	229_T	0.762	0.15
3_K	313_A	0.761	0.15
78_F	419_D	0.760	0.15
153_R	284_H	0.759	0.15
115_L	135_L	0.759	0.15
366_F	395_Q	0.759	0.15
150_E	211_V	0.759	0.15
196_A	252_M	0.759	0.15
409_K	412_A	0.756	0.15
378_A	422_T	0.752	0.15
236_T	344_H	0.749	0.15
343_T	347_Y	0.748	0.15
156_V	254_A	0.747	0.15
128_K	285_S	0.745	0.15
158_D	284_H	0.743	0.15
52_I	56_H	0.743	0.15
117_V	141_S	0.742	0.15
33_R	341_R	0.742	0.15
45_H	135_L	0.740	0.15
328_G	358_D	0.740	0.15
377_V	402_L	0.740	0.15
377_V	425_L	0.739	0.15
21_A	393_T	0.737	0.15
216_H	377_V	0.735	0.15
53_N	57_A	0.734	0.15
323_L	343_T	0.733	0.15
14_K	362_F	0.732	0.15
203_V	235_P	0.730	0.15
247_R	251_Y	0.730	0.15
214_I	367_T	0.729	0.15
61_K	264_M	0.729	0.15
124_W	132_Q	0.729	0.15
54_E	58_L	0.727	0.15
216_H	249_G	0.726	0.15
231_G	345_D	0.724	0.15
215_V	243_E	0.724	0.15
82_L	427_V	0.723	0.15
340_R	344_H	0.723	0.15
42_E	302_A	0.720	0.15
16_M	226_V	0.719	0.14
3_K	354_Y	0.716	0.14
22_Y	393_T	0.713	0.14
379_V	382_K	0.713	0.14
200_E	362_F	0.710	0.14
340_R	347_Y	0.709	0.14
369_E	373_D	0.707	0.14
188_P	302_A	0.706	0.14
408_A	413_M	0.706	0.14
74_K	141_S	0.706	0.14
204_Q	239_V	0.706	0.14
63_Y	135_L	0.705	0.14
131_Q	407_N	0.704	0.14
357_S	388_S	0.704	0.14
22_Y	391_L	0.703	0.14
378_A	411_E	0.703	0.14
8_S	393_T	0.702	0.14
267_K	298_C	0.702	0.14
245_A	414_P	0.702	0.14
409_K	424_W	0.700	0.14
61_K	267_K	0.699	0.14
203_V	240_F	0.699	0.14
90_P	120_N	0.698	0.14
196_A	245_A	0.697	0.14
110_E	283_V	0.694	0.14
3_K	395_Q	0.693	0.14
20_F	428_P	0.692	0.14
123_N	137_R	0.691	0.14
123_N	172_A	0.691	0.14
63_Y	236_T	0.690	0.14
138_V	155_Q	0.690	0.14
200_E	211_V	0.688	0.14
382_K	417_P	0.688	0.14
57_A	408_A	0.688	0.14
154_N	158_D	0.687	0.14
35_S	152_I	0.685	0.14
47_N	50_L	0.684	0.14
20_F	54_E	0.684	0.14
136_T	367_T	0.682	0.14
203_V	215_V	0.682	0.14
242_I	254_A	0.681	0.14
227_E	231_G	0.677	0.14
207_K	280_K	0.677	0.14
47_N	88_M	0.675	0.14
382_K	389_L	0.674	0.14
61_K	375_A	0.674	0.14
231_G	325_T	0.671	0.14
60_K	188_P	0.671	0.14
183_I	331_H	0.670	0.14
73_A	245_A	0.670	0.14
200_E	351_E	0.666	0.13
358_D	424_W	0.666	0.13
80_R	113_I	0.665	0.13
233_G	255_F	0.665	0.13
288_I	365_E	0.664	0.13
165_V	311_D	0.663	0.13
117_V	139_I	0.663	0.13
123_N	160_E	0.661	0.13
75_L	339_L	0.660	0.13
147_E	279_T	0.660	0.13
202_N	209_D	0.656	0.13
211_V	214_I	0.655	0.13
320_T	410_G	0.655	0.13
149_I	405_M	0.653	0.13
231_G	236_T	0.653	0.13
379_V	389_L	0.652	0.13
128_K	208_E	0.652	0.13
311_D	318_F	0.649	0.13
252_M	313_A	0.649	0.13
366_F	428_P	0.648	0.13
260_G	265_N	0.646	0.13
108_F	417_P	0.646	0.13
204_Q	251_Y	0.646	0.13
98_P	129_F	0.644	0.13
121_A	159_M	0.643	0.13
245_A	371_K	0.642	0.13
71_H	199_W	0.641	0.13
357_S	374_L	0.640	0.13
13_L	17_R	0.640	0.13
352_Y	356_V	0.638	0.13
231_G	407_N	0.637	0.13
169_L	181_G	0.637	0.13
137_R	160_E	0.637	0.13
87_E	328_G	0.637	0.13
147_E	153_R	0.634	0.13
51_G	396_G	0.633	0.13
283_V	388_S	0.630	0.13
80_R	83_K	0.630	0.13
113_I	388_S	0.628	0.13
18_Y	391_L	0.628	0.13
53_N	235_P	0.628	0.13
206_G	241_M	0.626	0.13
244_E	263_I	0.625	0.13
15_N	65_V	0.624	0.13
95_M	104_V	0.623	0.13
62_F	295_F	0.622	0.13
354_Y	357_S	0.621	0.13
96_S	229_T	0.621	0.13
183_I	233_G	0.620	0.13
96_S	358_D	0.619	0.13
98_P	130_W	0.619	0.13
389_L	400_F	0.619	0.13
17_R	208_E	0.617	0.13
405_M	413_M	0.616	0.12
126_T	132_Q	0.616	0.12
231_G	235_P	0.616	0.12
188_P	361_Q	0.615	0.12
18_Y	48_L	0.614	0.12
228_P	235_P	0.613	0.12
367_T	414_P	0.612	0.12
61_K	159_M	0.612	0.12
66_V	108_F	0.611	0.12
126_T	368_G	0.611	0.12
274_H	288_I	0.609	0.12
210_D	404_H	0.608	0.12
190_Q	257_D	0.607	0.12
273_A	391_L	0.607	0.12
103_L	301_T	0.606	0.12
231_G	240_F	0.605	0.12
63_Y	336_E	0.604	0.12
36_L	308_A	0.603	0.12
150_E	401_T	0.599	0.12
383_F	423_V	0.599	0.12
276_E	358_D	0.598	0.12
48_L	209_D	0.598	0.12
274_H	277_R	0.597	0.12
55_A	58_L	0.597	0.12
121_A	127_V	0.595	0.12
205_E	209_D	0.594	0.12
4_P	248_P	0.593	0.12
211_V	351_E	0.593	0.12
247_R	250_E	0.593	0.12
367_T	377_V	0.592	0.12
74_K	187_D	0.591	0.12
135_L	138_V	0.589	0.12
55_A	380_K	0.588	0.12
262_Y	333_G	0.587	0.12
38_V	111_M	0.585	0.12
243_E	394_P	0.584	0.12
108_F	183_I	0.583	0.12
276_E	428_P	0.583	0.12
23_G	30_G	0.583	0.12
141_S	182_Y	0.581	0.12
401_T	429_Q	0.580	0.12
117_V	187_D	0.580	0.12
69_A	285_S	0.580	0.12
79_I	86_V	0.578	0.12
16_M	124_W	0.577	0.12
229_T	388_S	0.576	0.12
321_S	388_S	0.575	0.12
45_H	64_V	0.575	0.12
356_V	427_V	0.573	0.12
79_I	366_F	0.573	0.12
229_T	345_D	0.573	0.12
152_I	256_E	0.573	0.12
384_S	415_I	0.571	0.12
74_K	117_V	0.570	0.12
53_N	406_E	0.570	0.12
242_I	362_F	0.570	0.12
89_G	414_P	0.568	0.12
80_R	107_H	0.568	0.12
185_K	344_H	0.567	0.12
88_M	321_S	0.567	0.12
3_K	276_E	0.566	0.12
45_H	133_M	0.565	0.12
78_F	108_F	0.564	0.12
126_T	414_P	0.563	0.12
369_E	389_L	0.562	0.12
24_A	28_Y	0.562	0.12
33_R	271_A	0.562	0.12
178_L	263_I	0.562	0.12
215_V	323_L	0.561	0.12
343_T	351_E	0.559	0.11
276_E	321_S	0.559	0.11
31_Q	72_N	0.558	0.11
391_L	399_N	0.557	0.11
82_L	246_Q	0.557	0.11
83_K	87_E	0.557	0.11
241_M	244_E	0.555	0.11
367_T	376_A	0.555	0.11
374_L	424_W	0.555	0.11
294_S	335_T	0.554	0.11
104_V	113_I	0.554	0.11
138_V	328_G	0.552	0.11
331_H	382_K	0.550	0.11
65_V	357_S	0.548	0.11
18_Y	65_V	0.547	0.11
38_V	42_E	0.547	0.11
134_G	167_G	0.547	0.11
134_G	290_G	0.547	0.11
134_G	191_G	0.547	0.11
415_I	419_D	0.546	0.11
209_D	214_I	0.546	0.11
53_N	376_A	0.544	0.11
124_W	138_V	0.543	0.11
214_I	412_A	0.543	0.11
324_E	343_T	0.541	0.11
96_S	233_G	0.541	0.11
85_V	110_E	0.540	0.11
42_E	47_N	0.540	0.11
18_Y	38_V	0.540	0.11
331_H	352_Y	0.540	0.11
141_S	179_L	0.539	0.11
366_F	371_K	0.538	0.11
102_M	302_A	0.536	0.11
205_E	414_P	0.535	0.11
361_Q	365_E	0.534	0.11
15_N	362_F	0.534	0.11
376_A	414_P	0.533	0.11
202_N	284_H	0.533	0.11
60_K	302_A	0.533	0.11
61_K	136_T	0.532	0.11
63_Y	285_S	0.532	0.11
126_T	358_D	0.532	0.11
85_V	89_G	0.531	0.11
234_A	323_L	0.531	0.11
171_M	183_I	0.530	0.11
8_S	60_K	0.530	0.11
188_P	192_T	0.530	0.11
124_W	227_E	0.529	0.11
271_A	292_T	0.529	0.11
133_M	336_E	0.529	0.11
368_G	371_K	0.529	0.11
354_Y	382_K	0.528	0.11
75_L	122_V	0.528	0.11
17_R	376_A	0.527	0.11
401_T	413_M	0.526	0.11
257_D	265_N	0.525	0.11
251_Y	263_I	0.525	0.11
328_G	385_V	0.522	0.11
272_I	307_K	0.521	0.11
328_G	391_L	0.521	0.11
366_F	378_A	0.521	0.11
22_Y	365_E	0.519	0.11
331_H	392_M	0.518	0.11
211_V	304_V	0.515	0.11
43_F	168_A	0.515	0.11
276_E	279_T	0.515	0.11
260_G	333_G	0.514	0.11
65_V	374_L	0.513	0.11
225_N	228_P	0.512	0.11
244_E	249_G	0.511	0.11
104_V	244_E	0.509	0.11
16_M	239_V	0.508	0.11
320_T	408_A	0.508	0.11
101_I	334_Y	0.507	0.11
106_E	153_R	0.506	0.11
244_E	253_T	0.506	0.11
340_R	392_M	0.506	0.11
195_N	292_T	0.506	0.11
75_L	110_E	0.505	0.11
311_D	386_G	0.505	0.11
395_Q	414_P	0.504	0.11
307_K	325_T	0.504	0.11
8_S	250_E	0.502	0.11
378_A	402_L	0.502	0.11
74_K	190_Q	0.502	0.11
68_I	121_A	0.501	0.11
360_Q	391_L	0.501	0.11
204_Q	378_A	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4he6A	1	0.1921	99.7	0.917	Contact Map
2bdqA	2	0.3885	97.5	0.963	Contact Map
1h5yA	1	0.4172	96.1	0.969	Contact Map
3f4wA	2	0.3113	95.5	0.971	Contact Map
3tsmA	2	0.2958	94.8	0.972	Contact Map
3qjaA	1	0.3267	94.6	0.972	Contact Map
3q58A	2	0.3024	94.4	0.973	Contact Map
1q6oA	3	0.3046	93.9	0.973	Contact Map
3igsA	1	0.3024	93.8	0.973	Contact Map
3jr2A	3	0.298	93.4	0.974	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0123 seconds.