DOSP - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

DOSP - Oxygen sensor protein DosP

UniProt:	P76129	Sequences: MKLTDADNAADGIFFPALEQNMMGAVLINENDEVMFFNPAAEKLWGYKREEVIGNNIDMLIPRDLRPAHPEYIRHNREGGKARVEGMSRELQLEKKDGSKIWTRFALSKVSAEGKVYYLALVRDASVEMAQKEQTRQLIIAVDHLDRPVIVLDPERHIVQCNRAFTEMFGYCISEASGMQPDTLLNIPEFPADNRIRLQQLLWKTARDQDEFLLLTRTGEKIWIKASISPVYDVLAHLQNLVMTFSDITEERQIRQLEGNILAAMCSSPPFHEMGEIICRNIESVLNESHVSLFALRNGMPIHWASSSHGAEIQNAQSWSATIRQRDGAPAGILQIKTSSGAETSAFIERVADISQHMAALALEQEKSRQHIEQLIQFDPMTGLPNRNNLHNYLDDLVDKAVSPVVYLIGVDHIQDVIDSLGYAWADQALLEVVNRFREKLKPDQYLCRIEGTQFVLVSLENDVSNITQIADELRNVVSKPIMIDDKPFPLTLSIGISYDLGKNRDYLLSTAHNAMDYIRKNGGNGWQFFSPAMNEMVKERLVLGAALKEAISNNQLKLVYQPQIFAETGELYGIEALARWHDPLHGHVPPSRFIPLAEEIGEIENIGRWVIAEACRQLAEWRSQNIHIPALSVNLSALHFRSNQLPNQVSDAMHAWGIDGHQLTVEITESMMMEHDTEIFKRIQILRDMGVGLSVDDFGTGFSGLSRLVSLPVTEIKIDKSFVDRCLTEKRILALLEAITSIGQSLNLTVVAEGVETKEQFEMLRKIHCRVIQGYFFSRPLPAEEIPGWMSSVLPLKI	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13792
Length:	799 (662)
Sequences:	167 (144)
Seq/√Len:	5.6

ECOLI - DOSP YEGE GMR YFGF YLIE YFEA
BACSU - YKOW

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
636_L	646_L	4.275	0.95
442_K	445_Q	4.024	0.93
423_Y	513_H	4.007	0.92
608_G	640_H	3.996	0.92
423_Y	454_Q	3.284	0.82
423_Y	494_S	3.084	0.77
607_I	773_I	2.992	0.75
567_A	607_I	2.985	0.75
411_V	415_Q	2.955	0.74
423_Y	517_D	2.938	0.74
721_K	725_D	2.895	0.72
575_I	787_I	2.736	0.68
452_G	513_H	2.735	0.68
779_S	782_L	2.693	0.67
704_S	723_F	2.632	0.65
410_G	415_Q	2.589	0.63
415_Q	453_T	2.578	0.63
580_R	635_N	2.531	0.62
205_T	230_P	2.517	0.61
415_Q	423_Y	2.507	0.61
595_I	704_S	2.448	0.59
454_Q	513_H	2.416	0.58
494_S	517_D	2.408	0.57
412_D	494_S	2.342	0.55
513_H	517_D	2.320	0.54
410_G	423_Y	2.315	0.54
423_Y	452_G	2.310	0.54
418_I	453_T	2.307	0.54
702_G	709_L	2.266	0.53
581_W	587_G	2.237	0.52
595_I	723_F	2.234	0.52
454_Q	517_D	2.197	0.50
364_E	641_F	2.177	0.50
578_L	670_E	2.165	0.49
410_G	419_D	2.118	0.48
718_K	754_E	2.107	0.47
618_Q	641_F	2.103	0.47
433_V	749_L	2.100	0.47
561_Y	615_A	2.095	0.47
674_M	771_R	2.088	0.47
653_A	657_W	2.084	0.46
600_E	721_K	2.070	0.46
415_Q	517_D	2.035	0.45
138_L	146_D	2.022	0.44
541_R	557_L	2.009	0.44
381_M	453_T	2.007	0.44
248_I	252_R	1.996	0.43
581_W	702_G	1.995	0.43
440_K	472_D	1.987	0.43
604_I	699_F	1.986	0.43
745_Q	771_R	1.984	0.43
736_L	743_I	1.983	0.43
635_N	667_E	1.981	0.43
423_Y	516_M	1.980	0.43
669_T	699_F	1.972	0.43
699_F	723_F	1.949	0.42
580_R	667_E	1.924	0.41
720_D	754_E	1.919	0.41
410_G	517_D	1.883	0.40
667_E	718_K	1.877	0.39
698_D	754_E	1.874	0.39
608_G	739_A	1.862	0.39
599_E	637_S	1.852	0.39
670_E	718_K	1.836	0.38
409_I	569_T	1.827	0.38
594_F	670_E	1.824	0.38
410_G	520_R	1.822	0.38
164_A	451_E	1.809	0.37
578_L	594_F	1.807	0.37
162_N	228_I	1.805	0.37
587_G	610_W	1.793	0.37
640_H	719_I	1.790	0.37
332_G	335_Q	1.790	0.37
494_S	598_A	1.776	0.36
249_T	646_L	1.775	0.36
604_I	704_S	1.771	0.36
390_L	595_I	1.769	0.36
252_R	255_R	1.767	0.36
147_R	246_S	1.756	0.36
381_M	513_H	1.755	0.36
578_L	718_K	1.737	0.35
633_S	745_Q	1.733	0.35
640_H	790_W	1.730	0.35
589_V	607_I	1.721	0.34
557_L	790_W	1.703	0.34
453_T	520_R	1.701	0.34
670_E	698_D	1.699	0.34
510_S	616_C	1.689	0.33
667_E	754_E	1.679	0.33
578_L	698_D	1.679	0.33
591_P	594_F	1.679	0.33
542_L	740_I	1.677	0.33
599_E	699_F	1.674	0.33
580_R	718_K	1.674	0.33
248_I	622_W	1.670	0.33
583_D	659_I	1.670	0.33
162_N	190_F	1.669	0.33
670_E	754_E	1.666	0.33
578_L	754_E	1.666	0.33
576_E	635_N	1.659	0.33
635_N	718_K	1.658	0.33
638_A	674_M	1.656	0.32
415_Q	512_A	1.650	0.32
540_E	593_R	1.646	0.32
570_G	650_V	1.645	0.32
618_Q	694_L	1.636	0.32
667_E	720_D	1.630	0.32
704_S	709_L	1.627	0.32
597_L	643_S	1.618	0.31
699_F	718_K	1.604	0.31
146_D	676_H	1.602	0.31
576_E	697_D	1.602	0.31
381_M	452_G	1.594	0.31
592_S	695_S	1.594	0.31
528_Q	607_I	1.587	0.30
412_D	452_G	1.581	0.30
493_L	644_N	1.580	0.30
389_N	717_I	1.578	0.30
219_G	383_G	1.576	0.30
670_E	720_D	1.574	0.30
449_R	453_T	1.556	0.30
669_T	723_F	1.555	0.29
530_F	581_W	1.547	0.29
150_I	243_M	1.541	0.29
608_G	704_S	1.539	0.29
581_W	610_W	1.533	0.29
410_G	453_T	1.532	0.29
584_P	587_G	1.531	0.29
449_R	520_R	1.531	0.29
494_S	513_H	1.530	0.29
214_L	744_G	1.529	0.29
630_P	665_T	1.528	0.29
580_R	720_D	1.528	0.29
410_G	451_E	1.524	0.29
171_Y	217_R	1.520	0.29
410_G	418_I	1.517	0.28
407_Y	530_F	1.514	0.28
710_V	733_I	1.507	0.28
576_E	580_R	1.505	0.28
578_L	720_D	1.500	0.28
560_V	744_G	1.500	0.28
143_D	163_R	1.499	0.28
712_L	743_I	1.493	0.28
211_E	248_I	1.489	0.28
516_M	633_S	1.488	0.28
635_N	720_D	1.480	0.27
523_G	530_F	1.476	0.27
756_V	773_I	1.469	0.27
360_A	572_L	1.468	0.27
580_R	754_E	1.467	0.27
519_I	581_W	1.463	0.27
412_D	598_A	1.462	0.27
418_I	520_R	1.458	0.27
390_L	570_G	1.452	0.27
150_I	158_I	1.448	0.27
597_L	780_R	1.442	0.26
247_D	753_A	1.441	0.26
561_Y	631_A	1.438	0.26
755_G	774_Q	1.431	0.26
432_E	752_V	1.430	0.26
286_L	294_F	1.425	0.26
719_I	770_C	1.423	0.26
635_N	754_E	1.418	0.26
712_L	736_L	1.415	0.26
640_H	740_I	1.408	0.25
415_Q	454_Q	1.406	0.25
467_I	638_A	1.403	0.25
378_F	632_L	1.401	0.25
699_F	720_D	1.400	0.25
596_P	696_V	1.400	0.25
333_I	344_T	1.399	0.25
699_F	754_E	1.397	0.25
387_R	423_Y	1.396	0.25
538_V	696_V	1.393	0.25
160_Q	435_N	1.392	0.25
594_F	718_K	1.388	0.25
594_F	754_E	1.386	0.25
594_F	698_D	1.385	0.25
495_I	516_M	1.385	0.25
559_L	610_W	1.377	0.25
699_F	706_L	1.377	0.25
578_L	667_E	1.375	0.25
231_V	363_L	1.372	0.25
710_V	776_Y	1.370	0.25
604_I	669_T	1.366	0.24
501_L	529_F	1.362	0.24
227_S	457_L	1.359	0.24
329_A	332_G	1.359	0.24
406_V	529_F	1.353	0.24
412_D	423_Y	1.352	0.24
387_R	451_E	1.351	0.24
587_G	701_T	1.351	0.24
667_E	670_E	1.349	0.24
409_I	781_P	1.337	0.24
381_M	418_I	1.337	0.24
333_I	358_M	1.336	0.24
622_W	724_V	1.334	0.24
595_I	608_G	1.333	0.24
693_G	715_T	1.328	0.23
756_V	770_C	1.328	0.23
408_L	442_K	1.325	0.23
282_I	287_N	1.324	0.23
654_M	692_V	1.322	0.23
581_W	599_E	1.318	0.23
452_G	494_S	1.314	0.23
375_L	706_L	1.313	0.23
661_G	783_P	1.311	0.23
405_V	467_I	1.308	0.23
408_L	618_Q	1.307	0.23
515_A	581_W	1.305	0.23
411_V	414_I	1.301	0.23
610_W	701_T	1.298	0.23
758_T	761_Q	1.295	0.23
667_E	781_P	1.294	0.23
515_A	702_G	1.293	0.23
694_L	784_A	1.283	0.22
756_V	765_L	1.279	0.22
453_T	513_H	1.279	0.22
494_S	561_Y	1.279	0.22
638_A	770_C	1.279	0.22
597_L	611_V	1.274	0.22
608_G	740_I	1.270	0.22
297_R	776_Y	1.261	0.22
270_P	293_L	1.256	0.22
248_I	756_V	1.255	0.22
387_R	512_A	1.254	0.22
475_R	516_M	1.253	0.22
698_D	718_K	1.251	0.22
545_G	643_S	1.249	0.22
421_L	610_W	1.246	0.21
518_Y	636_L	1.245	0.21
454_Q	494_S	1.240	0.21
714_V	727_C	1.238	0.21
654_M	690_M	1.230	0.21
358_M	516_M	1.227	0.21
415_Q	513_H	1.227	0.21
599_E	669_T	1.226	0.21
581_W	598_A	1.221	0.21
594_F	720_D	1.221	0.21
451_E	517_D	1.220	0.21
418_I	449_R	1.218	0.21
616_C	739_A	1.217	0.21
372_I	707_S	1.216	0.21
477_V	493_L	1.215	0.21
390_L	750_T	1.215	0.21
510_S	633_S	1.208	0.21
415_Q	426_A	1.207	0.21
278_I	758_T	1.207	0.21
278_I	286_L	1.206	0.21
599_E	604_I	1.205	0.21
419_D	513_H	1.204	0.21
137_Q	377_Q	1.202	0.20
600_E	608_G	1.198	0.20
618_Q	778_F	1.198	0.20
776_Y	781_P	1.195	0.20
667_E	700_G	1.194	0.20
741_T	771_R	1.194	0.20
365_Q	408_L	1.191	0.20
608_G	723_F	1.189	0.20
698_D	704_S	1.188	0.20
478_V	653_A	1.186	0.20
567_A	773_I	1.186	0.20
402_V	658_G	1.184	0.20
604_I	723_F	1.178	0.20
457_L	624_S	1.178	0.20
580_R	670_E	1.177	0.20
447_L	671_S	1.163	0.20
581_W	584_P	1.160	0.20
667_E	757_E	1.158	0.20
297_R	787_I	1.157	0.19
485_D	767_K	1.157	0.19
372_I	564_Q	1.157	0.19
530_F	784_A	1.154	0.19
595_I	699_F	1.151	0.19
248_I	457_L	1.151	0.19
578_L	700_G	1.149	0.19
295_A	473_E	1.147	0.19
403_S	444_D	1.144	0.19
219_G	328_G	1.142	0.19
667_E	706_L	1.140	0.19
618_Q	646_L	1.140	0.19
429_A	482_I	1.136	0.19
583_D	587_G	1.136	0.19
598_A	709_L	1.135	0.19
572_L	623_R	1.131	0.19
581_W	637_S	1.128	0.19
471_A	583_D	1.127	0.19
614_E	618_Q	1.125	0.19
137_Q	148_P	1.124	0.19
667_E	697_D	1.123	0.19
516_M	573_Y	1.119	0.19
578_L	635_N	1.118	0.19
558_K	582_H	1.115	0.19
579_A	611_V	1.114	0.19
560_V	763_E	1.113	0.19
613_A	657_W	1.110	0.19
669_T	718_K	1.110	0.19
153_D	198_L	1.107	0.18
412_D	564_Q	1.101	0.18
372_I	557_L	1.101	0.18
418_I	426_A	1.099	0.18
701_T	723_F	1.096	0.18
491_L	684_I	1.095	0.18
410_G	717_I	1.095	0.18
674_M	696_V	1.090	0.18
635_N	670_E	1.089	0.18
501_L	714_V	1.087	0.18
419_D	449_R	1.087	0.18
429_A	508_L	1.082	0.18
698_D	720_D	1.082	0.18
398_V	687_L	1.076	0.18
351_V	761_Q	1.075	0.18
492_T	642_R	1.074	0.18
369_R	378_F	1.070	0.18
669_T	709_L	1.068	0.18
601_I	719_I	1.065	0.18
727_C	737_L	1.064	0.18
417_V	425_W	1.064	0.18
223_W	252_R	1.063	0.18
134_Q	137_Q	1.060	0.17
670_E	700_G	1.059	0.17
381_M	412_D	1.058	0.17
418_I	454_Q	1.051	0.17
570_G	671_S	1.049	0.17
381_M	454_Q	1.048	0.17
578_L	591_P	1.048	0.17
134_Q	456_V	1.048	0.17
456_V	736_L	1.046	0.17
699_F	753_A	1.045	0.17
378_F	556_Q	1.041	0.17
252_R	723_F	1.038	0.17
594_F	667_E	1.035	0.17
667_E	774_Q	1.034	0.17
365_Q	423_Y	1.033	0.17
383_G	739_A	1.033	0.17
580_R	781_P	1.032	0.17
621_E	658_G	1.032	0.17
561_Y	618_Q	1.029	0.17
667_E	699_F	1.029	0.17
263_A	557_L	1.028	0.17
635_N	781_P	1.028	0.17
447_L	459_S	1.026	0.17
157_H	232_Y	1.023	0.17
376_I	705_G	1.021	0.17
718_K	781_P	1.020	0.17
138_L	153_D	1.019	0.17
203_W	727_C	1.016	0.17
316_A	484_I	1.013	0.17
759_K	777_F	1.010	0.17
478_V	507_Y	1.007	0.16
320_S	459_S	1.007	0.16
298_N	566_F	1.007	0.16
669_T	698_D	1.005	0.16
445_Q	473_E	1.002	0.16
633_S	737_L	1.001	0.16
669_T	720_D	1.001	0.16
583_D	598_A	1.001	0.16
635_N	757_E	0.998	0.16
231_V	483_M	0.998	0.16
397_L	411_V	0.997	0.16
403_S	442_K	0.996	0.16
542_L	665_T	0.996	0.16
635_N	697_D	0.996	0.16
149_V	492_T	0.995	0.16
578_L	699_F	0.995	0.16
471_A	780_R	0.995	0.16
348_I	437_F	0.993	0.16
200_Q	266_C	0.989	0.16
231_V	474_L	0.988	0.16
595_I	698_D	0.984	0.16
248_I	706_L	0.983	0.16
641_F	694_L	0.981	0.16
389_N	393_Y	0.980	0.16
386_N	563_P	0.980	0.16
591_P	670_E	0.979	0.16
578_L	669_T	0.978	0.16
223_W	602_G	0.978	0.16
637_S	770_C	0.978	0.16
614_E	741_T	0.978	0.16
392_N	470_I	0.975	0.16
162_N	178_G	0.975	0.16
511_T	557_L	0.972	0.16
407_Y	495_I	0.972	0.16
164_A	246_S	0.969	0.16
452_G	517_D	0.966	0.16
687_L	764_M	0.966	0.16
595_I	776_Y	0.965	0.16
597_L	696_V	0.965	0.16
704_S	718_K	0.963	0.16
783_P	786_E	0.962	0.16
516_M	714_V	0.959	0.16
323_I	340_S	0.959	0.16
670_E	699_F	0.959	0.16
557_L	579_A	0.957	0.16
372_I	641_F	0.957	0.16
190_F	213_L	0.957	0.16
570_G	783_P	0.957	0.16
646_L	744_G	0.956	0.16
249_T	375_L	0.955	0.16
697_D	720_D	0.955	0.16
599_E	757_E	0.955	0.16
328_G	332_G	0.953	0.15
443_P	473_E	0.950	0.15
415_Q	451_E	0.950	0.15
407_Y	471_A	0.948	0.15
456_V	509_L	0.947	0.15
488_P	554_N	0.946	0.15
635_N	700_G	0.946	0.15
504_N	507_Y	0.945	0.15
291_V	294_F	0.944	0.15
599_E	667_E	0.944	0.15
432_E	634_V	0.943	0.15
454_Q	520_R	0.935	0.15
412_D	513_H	0.934	0.15
448_C	719_I	0.934	0.15
164_A	719_I	0.933	0.15
621_E	625_Q	0.932	0.15
222_I	434_V	0.931	0.15
561_Y	608_G	0.929	0.15
562_Q	700_G	0.926	0.15
587_G	654_M	0.925	0.15
385_P	550_E	0.924	0.15
436_R	713_P	0.922	0.15
410_G	512_A	0.922	0.15
630_P	743_I	0.920	0.15
580_R	706_L	0.916	0.15
563_P	747_L	0.914	0.15
389_N	632_L	0.913	0.15
390_L	458_V	0.912	0.15
414_I	520_R	0.912	0.15
669_T	777_F	0.911	0.15
258_E	261_I	0.910	0.15
421_L	723_F	0.909	0.15
654_M	739_A	0.908	0.15
385_P	436_R	0.907	0.15
719_I	740_I	0.907	0.15
394_L	533_A	0.907	0.15
415_Q	452_G	0.905	0.15
252_R	583_D	0.904	0.15
148_P	166_T	0.904	0.15
632_L	721_K	0.904	0.15
319_W	661_G	0.902	0.15
250_E	447_L	0.901	0.15
650_V	784_A	0.901	0.15
757_E	781_P	0.899	0.15
297_R	328_G	0.898	0.15
270_P	292_S	0.897	0.14
706_L	718_K	0.896	0.14
377_Q	530_F	0.895	0.14
414_I	654_M	0.895	0.14
595_I	641_F	0.895	0.14
450_I	665_T	0.894	0.14
698_D	781_P	0.894	0.14
257_L	684_I	0.894	0.14
633_S	661_G	0.893	0.14
697_D	718_K	0.890	0.14
343_E	465_S	0.889	0.14
372_I	716_E	0.886	0.14
411_V	545_G	0.884	0.14
288_E	294_F	0.883	0.14
576_E	667_E	0.883	0.14
378_F	517_D	0.882	0.14
344_T	358_M	0.882	0.14
427_D	449_R	0.882	0.14
628_H	676_H	0.881	0.14
179_M	737_L	0.878	0.14
667_E	698_D	0.877	0.14
635_N	706_L	0.876	0.14
719_I	736_L	0.875	0.14
423_Y	453_T	0.873	0.14
607_I	727_C	0.872	0.14
408_L	516_M	0.872	0.14
254_I	617_R	0.871	0.14
669_T	754_E	0.871	0.14
472_D	619_L	0.869	0.14
248_I	574_G	0.868	0.14
412_D	739_A	0.868	0.14
741_T	777_F	0.866	0.14
667_E	755_G	0.866	0.14
188_P	771_R	0.865	0.14
408_L	717_I	0.864	0.14
613_A	656_A	0.862	0.14
616_C	659_I	0.861	0.14
616_C	761_Q	0.859	0.14
700_G	757_E	0.859	0.14
674_M	727_C	0.857	0.14
623_R	660_D	0.856	0.14
376_I	712_L	0.854	0.14
332_G	341_G	0.853	0.14
551_A	756_V	0.850	0.14
719_I	743_I	0.849	0.14
698_D	722_S	0.848	0.14
667_E	705_G	0.847	0.14
335_Q	341_G	0.844	0.14
547_A	736_L	0.844	0.14
635_N	705_G	0.841	0.14
530_F	780_R	0.840	0.14
365_Q	415_Q	0.840	0.14
147_R	164_A	0.839	0.14
580_R	594_F	0.836	0.13
660_D	750_T	0.835	0.13
704_S	754_E	0.832	0.13
364_E	749_L	0.830	0.13
485_D	597_L	0.830	0.13
138_L	694_L	0.829	0.13
665_T	743_I	0.829	0.13
133_E	417_V	0.827	0.13
336_I	434_V	0.827	0.13
606_N	687_L	0.824	0.13
580_R	774_Q	0.823	0.13
608_G	637_S	0.821	0.13
387_R	517_D	0.820	0.13
447_L	474_L	0.819	0.13
668_I	724_V	0.819	0.13
608_G	761_Q	0.817	0.13
176_A	681_F	0.816	0.13
559_L	701_T	0.816	0.13
699_F	765_L	0.814	0.13
427_D	520_R	0.814	0.13
406_V	446_Y	0.813	0.13
556_Q	584_P	0.811	0.13
486_D	721_K	0.810	0.13
372_I	743_I	0.810	0.13
646_L	694_L	0.810	0.13
254_I	676_H	0.807	0.13
410_G	449_R	0.806	0.13
580_R	697_D	0.802	0.13
419_D	453_T	0.802	0.13
448_C	671_S	0.801	0.13
591_P	718_K	0.801	0.13
491_L	788_P	0.800	0.13
461_E	632_L	0.798	0.13
580_R	700_G	0.798	0.13
580_R	699_F	0.797	0.13
587_G	702_G	0.796	0.13
387_R	410_G	0.795	0.13
250_E	575_I	0.795	0.13
580_R	757_E	0.794	0.13
194_N	406_V	0.794	0.13
572_L	628_H	0.794	0.13
463_D	477_V	0.793	0.13
165_F	217_R	0.792	0.13
408_L	414_I	0.792	0.13
227_S	246_S	0.791	0.13
192_A	786_E	0.787	0.13
722_S	744_G	0.787	0.13
230_P	766_R	0.786	0.13
139_I	165_F	0.784	0.13
379_D	496_G	0.783	0.13
379_D	775_G	0.783	0.13
496_G	775_G	0.783	0.13
288_E	298_N	0.782	0.13
724_V	744_G	0.781	0.13
604_I	720_D	0.780	0.13
544_L	702_G	0.780	0.13
594_F	700_G	0.780	0.13
169_F	185_L	0.779	0.13
555_N	634_V	0.779	0.13
733_I	744_G	0.779	0.13
564_Q	631_A	0.778	0.13
398_V	529_F	0.778	0.13
132_K	467_I	0.777	0.13
635_N	699_F	0.776	0.13
637_S	699_F	0.776	0.13
580_R	705_G	0.776	0.13
489_F	626_N	0.775	0.13
739_A	744_G	0.774	0.13
700_G	718_K	0.774	0.13
333_I	337_K	0.771	0.12
622_W	720_D	0.771	0.12
638_A	771_R	0.770	0.12
447_L	498_S	0.770	0.12
754_E	781_P	0.770	0.12
592_S	785_E	0.768	0.12
398_V	477_V	0.768	0.12
205_T	597_L	0.767	0.12
246_S	451_E	0.767	0.12
376_I	459_S	0.765	0.12
415_Q	418_I	0.764	0.12
635_N	774_Q	0.764	0.12
707_S	758_T	0.763	0.12
594_F	635_N	0.762	0.12
677_D	680_I	0.761	0.12
365_Q	494_S	0.761	0.12
704_S	720_D	0.758	0.12
176_A	668_I	0.758	0.12
540_E	690_M	0.756	0.12
374_Q	752_V	0.755	0.12
697_D	774_Q	0.755	0.12
270_P	274_M	0.754	0.12
286_L	680_I	0.753	0.12
320_S	332_G	0.753	0.12
720_D	781_P	0.751	0.12
324_R	505_R	0.750	0.12
407_Y	708_R	0.750	0.12
223_W	703_F	0.750	0.12
402_V	724_V	0.750	0.12
170_G	414_I	0.749	0.12
390_L	532_P	0.746	0.12
137_Q	589_V	0.746	0.12
412_D	744_G	0.746	0.12
502_G	559_L	0.746	0.12
748_N	753_A	0.746	0.12
419_D	520_R	0.744	0.12
600_E	740_I	0.744	0.12
382_T	426_A	0.744	0.12
615_A	631_A	0.744	0.12
584_P	654_M	0.743	0.12
549_K	692_V	0.743	0.12
398_V	612_I	0.741	0.12
336_I	390_L	0.740	0.12
375_L	688_R	0.738	0.12
701_T	709_L	0.738	0.12
495_I	633_S	0.736	0.12
718_K	757_E	0.736	0.12
398_V	593_R	0.733	0.12
552_I	579_A	0.733	0.12
248_I	753_A	0.731	0.12
587_G	723_F	0.731	0.12
581_W	602_G	0.731	0.12
309_H	482_I	0.731	0.12
378_F	657_W	0.730	0.12
607_I	663_Q	0.728	0.12
420_S	495_I	0.727	0.12
584_P	596_P	0.724	0.12
326_R	332_G	0.723	0.12
384_L	702_G	0.722	0.12
574_G	699_F	0.721	0.12
597_L	785_E	0.720	0.12
757_E	774_Q	0.720	0.12
230_P	523_G	0.720	0.12
263_A	589_V	0.719	0.12
411_V	471_A	0.719	0.12
385_P	519_I	0.718	0.12
667_E	709_L	0.718	0.12
528_Q	596_P	0.716	0.12
171_Y	200_Q	0.716	0.12
670_E	781_P	0.716	0.12
641_F	723_F	0.713	0.12
700_G	754_E	0.712	0.12
449_R	454_Q	0.711	0.12
368_S	372_I	0.711	0.12
405_V	497_I	0.711	0.12
650_V	656_A	0.708	0.12
418_I	452_G	0.707	0.12
135_T	139_I	0.707	0.12
403_S	459_S	0.707	0.12
757_E	776_Y	0.704	0.12
423_Y	512_A	0.704	0.12
641_F	736_L	0.703	0.11
436_R	515_A	0.703	0.11
391_H	611_V	0.702	0.11
412_D	524_G	0.700	0.11
508_L	696_V	0.699	0.11
382_T	591_P	0.699	0.11
591_P	754_E	0.698	0.11
420_S	749_L	0.697	0.11
265_M	665_T	0.697	0.11
231_V	485_D	0.694	0.11
479_S	498_S	0.693	0.11
382_T	670_E	0.693	0.11
410_G	414_I	0.692	0.11
352_A	428_Q	0.690	0.11
354_I	358_M	0.690	0.11
291_V	491_L	0.689	0.11
498_S	603_E	0.689	0.11
641_F	747_L	0.688	0.11
448_C	573_Y	0.688	0.11
583_D	654_M	0.688	0.11
508_L	587_G	0.687	0.11
600_E	761_Q	0.686	0.11
580_R	698_D	0.686	0.11
606_N	658_G	0.686	0.11
513_H	528_Q	0.686	0.11
148_P	158_I	0.685	0.11
255_R	707_S	0.685	0.11
448_C	603_E	0.684	0.11
556_Q	719_I	0.684	0.11
646_L	722_S	0.682	0.11
543_V	668_I	0.681	0.11
595_I	754_E	0.680	0.11
664_L	692_V	0.680	0.11
564_Q	618_Q	0.679	0.11
698_D	776_Y	0.679	0.11
745_Q	770_C	0.678	0.11
581_W	723_F	0.677	0.11
578_L	704_S	0.676	0.11
706_L	720_D	0.676	0.11
599_E	635_N	0.676	0.11
604_I	637_S	0.674	0.11
595_I	604_I	0.674	0.11
611_V	753_A	0.674	0.11
387_R	494_S	0.672	0.11
408_L	616_C	0.672	0.11
372_I	646_L	0.672	0.11
723_F	753_A	0.671	0.11
559_L	705_G	0.670	0.11
691_G	697_D	0.668	0.11
489_F	748_N	0.668	0.11
376_I	436_R	0.665	0.11
670_E	704_S	0.663	0.11
515_A	705_G	0.662	0.11
482_I	719_I	0.662	0.11
158_I	243_M	0.661	0.11
667_E	776_Y	0.661	0.11
452_G	520_R	0.659	0.11
337_K	344_T	0.658	0.11
754_E	776_Y	0.656	0.11
432_E	633_S	0.656	0.11
706_L	754_E	0.656	0.11
247_D	569_T	0.656	0.11
616_C	664_L	0.655	0.11
497_I	527_W	0.655	0.11
157_H	742_S	0.654	0.11
257_L	530_F	0.654	0.11
429_A	498_S	0.654	0.11
205_T	242_V	0.654	0.11
378_F	671_S	0.654	0.11
580_R	755_G	0.652	0.11
399_D	505_R	0.652	0.11
403_S	429_A	0.651	0.11
644_N	658_G	0.650	0.11
505_R	653_A	0.650	0.11
382_T	718_K	0.650	0.11
456_V	739_A	0.649	0.11
542_L	604_I	0.649	0.11
150_I	162_N	0.649	0.11
594_F	669_T	0.648	0.11
405_V	459_S	0.648	0.11
269_P	282_I	0.647	0.11
735_A	761_Q	0.645	0.11
504_N	535_N	0.644	0.11
557_L	688_R	0.644	0.11
718_K	774_Q	0.643	0.11
331_A	337_K	0.642	0.11
697_D	754_E	0.642	0.11
231_V	373_E	0.641	0.11
735_A	776_Y	0.640	0.11
594_F	699_F	0.640	0.11
589_V	740_I	0.640	0.11
758_T	776_Y	0.639	0.11
474_L	510_S	0.638	0.11
401_A	589_V	0.638	0.11
461_E	771_R	0.638	0.11
697_D	781_P	0.637	0.11
646_L	650_V	0.637	0.11
604_I	698_D	0.635	0.11
156_R	556_Q	0.635	0.11
635_N	776_Y	0.635	0.11
578_L	781_P	0.635	0.11
360_A	686_I	0.632	0.11
525_N	620_A	0.631	0.11
517_D	520_R	0.631	0.11
709_L	723_F	0.630	0.11
301_P	305_A	0.630	0.11
583_D	606_N	0.630	0.11
579_A	752_V	0.629	0.10
136_R	495_I	0.629	0.10
456_V	680_I	0.629	0.10
611_V	781_P	0.628	0.10
596_P	782_L	0.627	0.10
591_P	698_D	0.627	0.10
201_L	211_E	0.626	0.10
376_I	414_I	0.626	0.10
778_F	782_L	0.625	0.10
591_P	720_D	0.625	0.10
559_L	615_A	0.625	0.10
474_L	744_G	0.624	0.10
716_E	768_I	0.624	0.10
169_F	179_M	0.624	0.10
441_L	636_L	0.623	0.10
512_A	761_Q	0.623	0.10
599_E	700_G	0.623	0.10
412_D	454_Q	0.622	0.10
143_D	537_M	0.621	0.10
485_D	589_V	0.621	0.10
447_L	492_T	0.621	0.10
564_Q	665_T	0.620	0.10
641_F	764_M	0.620	0.10
467_I	471_A	0.617	0.10
747_L	770_C	0.616	0.10
451_E	718_K	0.614	0.10
635_N	698_D	0.614	0.10
749_L	784_A	0.613	0.10
295_A	550_E	0.613	0.10
163_R	417_V	0.613	0.10
616_C	634_V	0.612	0.10
452_G	516_M	0.612	0.10
559_L	731_K	0.611	0.10
557_L	665_T	0.611	0.10
379_D	422_G	0.611	0.10
422_G	496_G	0.611	0.10
422_G	775_G	0.611	0.10
697_D	755_G	0.610	0.10
365_Q	641_F	0.610	0.10
188_P	638_A	0.609	0.10
309_H	317_Q	0.608	0.10
640_H	723_F	0.608	0.10
572_L	734_L	0.606	0.10
667_E	704_S	0.606	0.10
556_Q	770_C	0.606	0.10
512_A	664_L	0.606	0.10
405_V	636_L	0.606	0.10
275_G	385_P	0.604	0.10
636_L	790_W	0.604	0.10
343_E	744_G	0.604	0.10
298_N	477_V	0.604	0.10
504_N	530_F	0.602	0.10
671_S	719_I	0.601	0.10
727_C	740_I	0.600	0.10
437_F	643_S	0.599	0.10
711_S	721_K	0.599	0.10
242_V	257_L	0.597	0.10
669_T	707_S	0.597	0.10
381_M	405_V	0.596	0.10
331_A	344_T	0.596	0.10
410_G	426_A	0.595	0.10
722_S	754_E	0.595	0.10
713_P	743_I	0.594	0.10
635_N	755_G	0.593	0.10
293_L	500_D	0.593	0.10
591_P	697_D	0.592	0.10
382_T	578_L	0.592	0.10
408_L	423_Y	0.591	0.10
499_Y	545_G	0.591	0.10
138_L	545_G	0.589	0.10
401_A	509_L	0.588	0.10
447_L	568_E	0.588	0.10
562_Q	667_E	0.588	0.10
289_S	296_L	0.588	0.10
420_S	511_T	0.586	0.10
523_G	581_W	0.586	0.10
706_L	776_Y	0.585	0.10
411_V	453_T	0.585	0.10
720_D	757_E	0.585	0.10
175_E	480_K	0.585	0.10
598_A	607_I	0.585	0.10
233_D	597_L	0.583	0.10
468_T	529_F	0.583	0.10
669_T	765_L	0.583	0.10
410_G	513_H	0.583	0.10
342_A	642_R	0.582	0.10
411_V	423_Y	0.581	0.10
541_R	650_V	0.581	0.10
160_Q	682_K	0.580	0.10
426_A	513_H	0.580	0.10
494_S	581_W	0.578	0.10
384_L	523_G	0.576	0.10
379_D	386_N	0.576	0.10
386_N	496_G	0.576	0.10
386_N	775_G	0.576	0.10
148_P	416_D	0.575	0.10
272_H	789_G	0.574	0.10
219_G	320_S	0.574	0.10
580_R	599_E	0.573	0.10
603_E	606_N	0.572	0.10
365_Q	517_D	0.572	0.10
576_E	720_D	0.572	0.10
415_Q	520_R	0.571	0.10
724_V	753_A	0.570	0.10
162_N	668_I	0.570	0.10
162_N	670_E	0.570	0.10
165_F	246_S	0.570	0.10
687_L	753_A	0.570	0.10
360_A	727_C	0.569	0.10
223_W	372_I	0.569	0.10
186_N	212_F	0.569	0.10
427_D	453_T	0.569	0.10
666_V	705_G	0.568	0.10
699_F	704_S	0.568	0.10
521_K	692_V	0.567	0.10
183_T	752_V	0.566	0.10
320_S	323_I	0.566	0.10
414_I	756_V	0.566	0.10
426_A	453_T	0.566	0.10
583_D	586_H	0.566	0.10
515_A	587_G	0.565	0.10
664_L	761_Q	0.564	0.10
754_E	757_E	0.564	0.10
600_E	647_P	0.564	0.10
564_Q	659_I	0.563	0.10
426_A	520_R	0.562	0.10
706_L	757_E	0.561	0.10
147_R	152_L	0.560	0.10
410_G	552_I	0.560	0.10
456_V	531_S	0.560	0.10
417_V	791_M	0.559	0.10
395_D	491_L	0.557	0.10
257_L	641_F	0.557	0.10
618_Q	621_E	0.557	0.10
398_V	458_V	0.556	0.10
471_A	787_I	0.555	0.10
412_D	727_C	0.554	0.10
218_T	783_P	0.553	0.10
390_L	413_H	0.553	0.10
332_G	344_T	0.553	0.10
181_P	228_I	0.552	0.10
229_S	429_A	0.552	0.10
597_L	654_M	0.552	0.10
236_A	247_D	0.551	0.10
481_P	575_I	0.551	0.10
375_L	482_I	0.550	0.10
324_R	634_V	0.549	0.10
405_V	492_T	0.549	0.10
700_G	781_P	0.549	0.10
618_Q	659_I	0.548	0.09
451_E	454_Q	0.547	0.09
597_L	756_V	0.547	0.09
557_L	604_I	0.546	0.09
258_E	517_D	0.546	0.09
387_R	415_Q	0.545	0.09
576_E	774_Q	0.545	0.09
139_I	633_S	0.544	0.09
320_S	756_V	0.543	0.09
551_A	770_C	0.542	0.09
720_D	774_Q	0.542	0.09
178_G	213_L	0.541	0.09
608_G	633_S	0.541	0.09
599_E	765_L	0.541	0.09
509_L	768_I	0.540	0.09
182_D	228_I	0.539	0.09
688_R	715_T	0.539	0.09
576_E	718_K	0.539	0.09
142_V	264_A	0.537	0.09
248_I	557_L	0.536	0.09
519_I	587_G	0.536	0.09
721_K	759_K	0.534	0.09
132_K	224_I	0.533	0.09
580_R	776_Y	0.533	0.09
436_R	581_W	0.532	0.09
641_F	740_I	0.532	0.09
175_E	428_Q	0.531	0.09
581_W	770_C	0.531	0.09
601_I	673_M	0.530	0.09
423_Y	451_E	0.530	0.09
303_H	661_G	0.529	0.09
530_F	598_A	0.529	0.09
133_E	136_R	0.528	0.09
294_F	783_P	0.528	0.09
379_D	774_Q	0.528	0.09
496_G	774_Q	0.528	0.09
332_G	337_K	0.527	0.09
387_R	577_A	0.527	0.09
411_V	752_V	0.527	0.09
459_S	492_T	0.525	0.09
700_G	720_D	0.524	0.09
599_E	709_L	0.524	0.09
355_S	719_I	0.524	0.09
467_I	475_R	0.523	0.09
382_T	418_I	0.523	0.09
599_E	702_G	0.523	0.09
172_C	534_M	0.523	0.09
619_L	724_V	0.523	0.09
706_L	723_F	0.522	0.09
159_V	780_R	0.522	0.09
754_E	774_Q	0.521	0.09
163_R	613_A	0.520	0.09
252_R	776_Y	0.520	0.09
167_E	624_S	0.519	0.09
415_Q	494_S	0.519	0.09
479_S	590_P	0.518	0.09
394_L	429_A	0.518	0.09
610_W	638_A	0.517	0.09
273_E	668_I	0.517	0.09
752_V	781_P	0.516	0.09
396_D	571_E	0.515	0.09
213_L	223_W	0.515	0.09
598_A	618_Q	0.515	0.09
414_I	561_Y	0.514	0.09
471_A	584_P	0.513	0.09
752_V	758_T	0.512	0.09
414_I	744_G	0.512	0.09
449_R	513_H	0.512	0.09
498_S	671_S	0.511	0.09
740_I	761_Q	0.511	0.09
139_I	144_H	0.510	0.09
564_Q	710_V	0.510	0.09
249_T	518_Y	0.509	0.09
211_E	238_L	0.509	0.09
774_Q	781_P	0.508	0.09
185_L	202_L	0.507	0.09
546_A	745_Q	0.505	0.09
637_S	669_T	0.505	0.09
244_T	682_K	0.503	0.09
162_N	718_K	0.503	0.09
368_S	375_L	0.501	0.09
160_Q	244_T	0.501	0.09
737_L	782_L	0.501	0.09
502_G	509_L	0.501	0.09
379_D	562_Q	0.500	0.09
496_G	562_Q	0.500	0.09
562_Q	775_G	0.500	0.09
578_L	595_I	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4rnhA	2	0.5156	100	0.526	Contact Map
4j40A	2	0.3141	100	0.531	Contact Map
3pjxA	1	0.5181	100	0.543	Contact Map
3gfzA	2	0.4693	100	0.596	Contact Map
4hjfA	1	0.3267	100	0.628	Contact Map
4hu4A	1	0.3091	100	0.681	Contact Map
4kieA	1	0.3267	100	0.685	Contact Map
3sy8A	6	0.4844	100	0.689	Contact Map
2r6oA	2	0.3217	100	0.691	Contact Map
4rniA	2	0.3179	100	0.693	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0169 seconds.