YNBC - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YNBC - Uncharacterized protein YnbC

UniProt:	P76092	Sequences: MENSRIPGEHFFTTSDNTALFYRHWPALQPGAKKVIVLFHRGHEHSGRLQHLVDELAMPDTAFYAWDARGHGKSSGPRGYSPSLARSVRDVDEFVRFAASDSQVGLEEVVVIAQSVGAVLVATWIHDYAPAIRGLVLASPAFKVKLYVPLARPALALWHRLRGLFFINSYVKGRYLTHDRQRGASFNNDPLITRAIAVNILLDLYKTSERIIRDAAAITLPTQLLISGDDYVVHRQPQIDFYQRLRSPLKELHLLPGFYHDTLGEENRALAFEKMQSFISRLYANKSQKFDYQHEDCTGPSADRWRLLSGGPVPLSPVDLAYRFMRKAMKLFGTHSSGLHLGMSTGFDSGSSLDYVYQNQPQGSNAFGRLVDKIYLNSVGWRGIRQRKTHLQILIKQAVADLHAKGLAVRVVDIAAGHGRYVLDALANEPAVSDILLRDYSELNVAQGQEMIAQRGMSGRVRFEQGDAFNPEELSALTPRPTLAIVSGLYELFPENEQVKNSLAGLANAIEPGGILIYTGQPWHPQLEMIAGVLTSHKDGKPWVMRVRSQGEMDSLVRDAGFDKCTQRIDEWGIFTVSMAVRRDN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13750
Length:	585 (574)
Sequences:	144 (92)
Seq/√Len:	3.9

ECOLI - YNBC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
361_P	373_K	6.337	0.98
301_S	549_S	6.123	0.98
39_F	91_V	5.825	0.97
81_S	87_S	5.749	0.97
302_A	306_R	4.037	0.83
424_D	455_R	3.801	0.78
80_Y	197_A	3.702	0.76
53_V	63_F	3.670	0.76
71_H	81_S	3.342	0.68
92_D	96_R	3.342	0.68
373_K	377_N	3.300	0.67
235_R	239_I	3.245	0.66
164_L	197_A	3.234	0.66
304_R	547_V	3.115	0.62
64_Y	102_S	2.984	0.59
394_L	568_R	2.939	0.58
490_Y	502_S	2.937	0.58
361_P	377_N	2.839	0.55
64_Y	104_V	2.773	0.53
88_V	123_T	2.726	0.52
36_I	499_V	2.677	0.50
399_V	409_V	2.632	0.49
412_V	477_L	2.599	0.48
143_K	234_H	2.586	0.48
80_Y	199_N	2.584	0.48
484_A	510_I	2.580	0.47
121_V	135_L	2.516	0.46
80_Y	164_L	2.482	0.45
422_V	485_I	2.441	0.44
125_I	220_L	2.439	0.43
91_V	121_V	2.352	0.41
134_G	282_L	2.333	0.41
507_A	582_R	2.326	0.40
563_D	581_V	2.306	0.40
365_N	369_R	2.293	0.39
296_D	412_V	2.286	0.39
64_Y	186_F	2.274	0.39
131_A	558_R	2.241	0.38
318_V	528_E	2.239	0.38
14_T	71_H	2.223	0.38
71_H	87_S	2.216	0.37
435_I	461_V	2.204	0.37
474_L	506_L	2.148	0.36
125_I	135_L	2.131	0.35
520_G	576_T	2.116	0.35
113_A	540_G	2.094	0.34
197_A	203_D	2.072	0.34
123_T	535_T	2.062	0.33
395_I	485_I	2.048	0.33
95_V	120_L	2.036	0.33
471_P	508_N	2.017	0.32
14_T	81_S	2.007	0.32
319_D	323_R	2.004	0.32
395_I	455_R	2.004	0.32
155_L	438_R	2.002	0.32
173_G	187_N	1.969	0.31
410_R	433_S	1.968	0.31
386_Q	572_W	1.957	0.31
164_L	207_T	1.948	0.31
110_V	134_G	1.937	0.30
114_Q	182_R	1.929	0.30
144_V	152_R	1.895	0.29
96_R	485_I	1.884	0.29
527_L	547_V	1.883	0.29
34_K	549_S	1.861	0.28
208_S	211_I	1.832	0.28
121_V	220_L	1.831	0.28
355_Y	527_L	1.826	0.28
81_S	226_I	1.819	0.28
82_P	145_K	1.819	0.28
424_D	447_Q	1.806	0.27
275_M	279_I	1.806	0.27
236_Q	240_D	1.805	0.27
300_P	549_S	1.804	0.27
186_F	343_M	1.782	0.27
112_I	427_A	1.766	0.26
322_Y	332_F	1.728	0.25
35_V	64_Y	1.724	0.25
125_I	132_I	1.718	0.25
122_A	207_T	1.715	0.25
80_Y	203_D	1.689	0.25
227_S	262_T	1.686	0.25
438_R	515_I	1.681	0.24
510_I	562_F	1.681	0.24
256_P	339_L	1.674	0.24
227_S	261_D	1.646	0.24
155_L	514_G	1.633	0.23
339_L	343_M	1.628	0.23
295_E	299_G	1.618	0.23
269_A	371_V	1.603	0.23
113_A	341_L	1.586	0.23
161_L	467_D	1.586	0.23
114_Q	264_G	1.570	0.22
333_G	432_V	1.564	0.22
425_A	567_Q	1.564	0.22
120_L	473_E	1.557	0.22
528_E	532_G	1.547	0.22
269_A	273_E	1.545	0.22
422_V	453_A	1.544	0.22
80_Y	216_A	1.542	0.22
242_Y	451_M	1.533	0.22
39_F	436_L	1.511	0.21
39_F	296_D	1.510	0.21
14_T	53_V	1.508	0.21
91_V	120_L	1.508	0.21
301_S	547_V	1.507	0.21
32_A	108_E	1.507	0.21
557_V	560_A	1.506	0.21
442_E	465_Q	1.498	0.21
339_L	388_K	1.498	0.21
37_V	95_V	1.483	0.21
259_Y	292_Y	1.482	0.21
323_R	390_H	1.480	0.21
134_G	283_Y	1.462	0.20
103_Q	579_M	1.460	0.20
35_V	470_N	1.459	0.20
393_I	568_R	1.457	0.20
367_F	461_V	1.449	0.20
239_I	252_L	1.448	0.20
467_D	484_A	1.443	0.20
187_N	269_A	1.438	0.20
84_L	432_V	1.438	0.20
52_L	64_Y	1.427	0.20
509_A	567_Q	1.424	0.19
386_Q	389_T	1.415	0.19
49_L	322_Y	1.412	0.19
138_A	263_L	1.412	0.19
98_A	360_Q	1.412	0.19
164_L	199_N	1.409	0.19
474_L	490_Y	1.406	0.19
300_P	312_P	1.405	0.19
410_R	482_T	1.403	0.19
145_K	168_N	1.398	0.19
100_S	472_E	1.395	0.19
153_P	156_A	1.390	0.19
473_E	476_A	1.385	0.19
173_G	329_M	1.381	0.19
113_A	508_N	1.378	0.19
58_M	61_T	1.375	0.19
153_P	467_D	1.375	0.19
83_S	132_I	1.370	0.19
81_S	175_Y	1.369	0.19
448_G	463_F	1.366	0.18
153_P	424_D	1.364	0.18
143_K	152_R	1.362	0.18
431_A	459_G	1.355	0.18
197_A	216_A	1.351	0.18
62_A	361_P	1.350	0.18
153_P	514_G	1.341	0.18
152_R	339_L	1.333	0.18
112_I	395_I	1.332	0.18
425_A	483_L	1.329	0.18
167_I	327_K	1.307	0.17
64_Y	303_D	1.307	0.17
181_Q	320_L	1.301	0.17
515_I	551_G	1.298	0.17
24_H	122_A	1.293	0.17
395_I	460_R	1.293	0.17
352_S	388_K	1.289	0.17
320_L	400_A	1.285	0.17
464_E	581_V	1.279	0.17
168_N	393_I	1.275	0.17
182_R	264_G	1.272	0.17
200_I	306_R	1.256	0.17
292_Y	555_S	1.254	0.17
104_V	367_F	1.251	0.17
125_I	517_I	1.251	0.17
501_N	576_T	1.249	0.17
365_N	477_L	1.248	0.17
114_Q	227_S	1.246	0.16
378_S	436_L	1.242	0.16
263_L	275_M	1.239	0.16
296_D	313_V	1.234	0.16
365_N	582_R	1.231	0.16
82_P	255_L	1.229	0.16
121_V	475_S	1.226	0.16
291_D	390_H	1.225	0.16
503_L	557_V	1.221	0.16
155_L	198_V	1.220	0.16
135_L	220_L	1.216	0.16
388_K	499_V	1.214	0.16
445_V	560_A	1.212	0.16
322_Y	533_V	1.208	0.16
83_S	291_D	1.199	0.16
114_Q	165_F	1.199	0.16
320_L	582_R	1.191	0.16
301_S	304_R	1.187	0.16
37_V	477_L	1.180	0.15
377_N	495_E	1.178	0.15
28_L	373_K	1.176	0.15
10_H	284_A	1.175	0.15
155_L	375_Y	1.174	0.15
92_D	485_I	1.172	0.15
59_P	436_L	1.168	0.15
433_S	482_T	1.167	0.15
195_A	582_R	1.162	0.15
313_V	318_V	1.158	0.15
85_A	579_M	1.156	0.15
39_F	139_S	1.155	0.15
108_E	286_K	1.153	0.15
332_F	378_S	1.153	0.15
95_V	259_Y	1.147	0.15
191_L	522_P	1.147	0.15
322_Y	329_M	1.146	0.15
186_F	378_S	1.132	0.15
186_F	515_I	1.130	0.15
50_Q	332_F	1.129	0.15
50_Q	322_Y	1.127	0.15
150_L	389_T	1.124	0.15
37_V	480_R	1.123	0.15
150_L	352_S	1.120	0.15
378_S	412_V	1.120	0.15
296_D	576_T	1.113	0.15
53_V	474_L	1.109	0.14
82_P	165_F	1.107	0.14
61_T	283_Y	1.107	0.14
112_I	272_F	1.107	0.14
51_H	474_L	1.106	0.14
254_L	352_S	1.106	0.14
111_V	237_P	1.103	0.14
167_I	195_A	1.101	0.14
82_P	142_F	1.094	0.14
183_G	192_I	1.094	0.14
426_L	435_I	1.093	0.14
374_I	477_L	1.091	0.14
255_L	271_A	1.087	0.14
329_M	520_G	1.086	0.14
270_L	274_K	1.085	0.14
234_H	244_R	1.082	0.14
182_R	227_S	1.081	0.14
313_V	576_T	1.080	0.14
95_V	329_M	1.073	0.14
450_E	520_G	1.072	0.14
379_V	382_R	1.072	0.14
23_R	522_P	1.066	0.14
81_S	318_V	1.066	0.14
427_A	576_T	1.065	0.14
369_R	509_A	1.062	0.14
299_G	484_A	1.061	0.14
39_F	330_K	1.060	0.14
302_A	432_V	1.059	0.14
363_G	522_P	1.058	0.14
156_A	539_D	1.056	0.14
390_H	539_D	1.054	0.14
84_L	120_L	1.051	0.14
341_L	436_L	1.051	0.14
104_V	283_Y	1.049	0.14
203_D	207_T	1.046	0.14
81_S	481_P	1.046	0.14
122_A	566_T	1.046	0.14
425_A	445_V	1.045	0.14
20_L	240_D	1.044	0.14
52_L	544_V	1.043	0.14
173_G	312_P	1.043	0.14
335_H	367_F	1.038	0.13
14_T	226_I	1.038	0.13
35_V	104_V	1.037	0.13
217_A	355_Y	1.034	0.13
223_Q	253_H	1.033	0.13
183_G	499_V	1.028	0.13
14_T	134_G	1.024	0.13
484_A	563_D	1.021	0.13
466_G	490_Y	1.017	0.13
164_L	203_D	1.016	0.13
194_R	219_T	1.015	0.13
37_V	266_E	1.015	0.13
396_K	428_N	1.014	0.13
39_F	54_D	1.013	0.13
57_A	229_D	1.012	0.13
195_A	390_H	1.011	0.13
39_F	59_P	1.011	0.13
52_L	568_R	1.008	0.13
163_G	264_G	1.008	0.13
449_Q	464_E	1.007	0.13
436_L	473_E	1.006	0.13
515_I	528_E	1.002	0.13
50_Q	283_Y	1.001	0.13
51_H	165_F	1.000	0.13
78_R	489_L	0.998	0.13
291_D	455_R	0.998	0.13
256_P	504_A	0.997	0.13
168_N	194_R	0.997	0.13
223_Q	264_G	0.997	0.13
219_T	422_V	0.996	0.13
144_V	205_Y	0.995	0.13
295_E	551_G	0.993	0.13
49_L	332_F	0.990	0.13
21_F	276_Q	0.984	0.13
61_T	109_V	0.984	0.13
259_Y	266_E	0.983	0.13
34_K	343_M	0.982	0.13
95_V	576_T	0.981	0.13
329_M	375_Y	0.980	0.13
152_R	175_Y	0.979	0.13
165_F	182_R	0.978	0.13
33_K	455_R	0.977	0.13
399_V	411_V	0.976	0.13
457_M	473_E	0.973	0.13
160_R	424_D	0.972	0.13
422_V	576_T	0.971	0.13
283_Y	341_L	0.971	0.13
91_V	329_M	0.970	0.13
87_S	388_K	0.968	0.13
412_V	465_Q	0.968	0.13
23_R	191_L	0.967	0.13
200_I	239_I	0.966	0.13
313_V	528_E	0.965	0.13
23_R	363_G	0.964	0.13
308_L	503_L	0.962	0.13
549_S	571_E	0.962	0.13
259_Y	504_A	0.961	0.12
197_A	395_I	0.960	0.12
153_P	409_V	0.959	0.12
344_S	566_T	0.957	0.12
91_V	240_D	0.957	0.12
49_L	91_V	0.954	0.12
52_L	270_L	0.952	0.12
528_E	565_C	0.951	0.12
158_W	162_R	0.948	0.12
474_L	502_S	0.948	0.12
329_M	485_I	0.947	0.12
244_R	286_K	0.942	0.12
304_R	532_G	0.941	0.12
464_E	558_R	0.940	0.12
453_A	460_R	0.939	0.12
292_Y	295_E	0.939	0.12
51_H	55_E	0.938	0.12
305_W	333_G	0.936	0.12
22_Y	128_Y	0.936	0.12
292_Y	322_Y	0.934	0.12
296_D	436_L	0.929	0.12
328_A	367_F	0.926	0.12
35_V	86_R	0.923	0.12
361_P	430_P	0.923	0.12
362_Q	373_K	0.921	0.12
269_A	484_A	0.919	0.12
465_Q	529_M	0.918	0.12
66_W	76_G	0.917	0.12
59_P	566_T	0.917	0.12
396_K	411_V	0.916	0.12
63_F	474_L	0.913	0.12
15_S	93_E	0.912	0.12
37_V	485_I	0.909	0.12
109_V	472_E	0.908	0.12
177_T	215_A	0.908	0.12
114_Q	262_T	0.908	0.12
416_A	490_Y	0.907	0.12
325_M	461_V	0.906	0.12
207_T	211_I	0.906	0.12
11_F	19_A	0.905	0.12
96_R	106_L	0.905	0.12
173_G	466_G	0.905	0.12
293_Q	581_V	0.903	0.12
18_T	405_K	0.899	0.12
135_L	190_P	0.898	0.12
248_P	404_A	0.896	0.12
59_P	367_F	0.896	0.12
27_A	352_S	0.896	0.12
82_P	268_R	0.893	0.12
466_G	474_L	0.888	0.12
279_I	485_I	0.887	0.12
227_S	445_V	0.885	0.12
89_R	568_R	0.885	0.12
391_L	473_E	0.884	0.12
73_K	361_P	0.883	0.12
30_P	428_N	0.880	0.12
175_Y	226_I	0.878	0.11
152_R	256_P	0.878	0.11
53_V	122_A	0.877	0.11
407_L	511_E	0.876	0.11
71_H	226_I	0.876	0.11
95_V	125_I	0.876	0.11
73_K	188_N	0.874	0.11
329_M	395_I	0.874	0.11
114_Q	261_D	0.874	0.11
207_T	432_V	0.873	0.11
55_E	223_Q	0.872	0.11
512_P	539_D	0.872	0.11
339_L	447_Q	0.869	0.11
15_S	175_Y	0.867	0.11
539_D	542_P	0.865	0.11
347_F	363_G	0.864	0.11
95_V	371_V	0.863	0.11
164_L	216_A	0.861	0.11
88_V	470_N	0.860	0.11
84_L	306_R	0.859	0.11
455_R	498_Q	0.855	0.11
80_Y	207_T	0.854	0.11
305_W	309_S	0.853	0.11
180_R	416_A	0.853	0.11
404_A	501_N	0.853	0.11
29_Q	364_S	0.852	0.11
182_R	351_S	0.852	0.11
183_G	208_S	0.852	0.11
236_Q	422_V	0.850	0.11
555_S	558_R	0.850	0.11
231_Y	551_G	0.849	0.11
195_A	571_E	0.848	0.11
435_I	452_I	0.848	0.11
35_V	532_G	0.848	0.11
92_D	391_L	0.847	0.11
81_S	85_A	0.847	0.11
207_T	312_P	0.845	0.11
139_S	195_A	0.842	0.11
279_I	576_T	0.840	0.11
426_L	430_P	0.840	0.11
200_I	203_D	0.839	0.11
516_L	561_G	0.838	0.11
515_I	581_V	0.838	0.11
182_R	223_Q	0.837	0.11
242_Y	248_P	0.836	0.11
15_S	432_V	0.834	0.11
202_L	441_S	0.830	0.11
53_V	412_V	0.829	0.11
329_M	541_K	0.827	0.11
333_G	340_H	0.826	0.11
200_I	494_P	0.826	0.11
25_W	135_L	0.824	0.11
382_R	559_D	0.824	0.11
175_Y	395_I	0.823	0.11
114_Q	223_Q	0.821	0.11
395_I	453_A	0.820	0.11
98_A	329_M	0.820	0.11
250_K	414_I	0.819	0.11
316_S	535_T	0.813	0.11
412_V	495_E	0.812	0.11
405_K	495_E	0.810	0.11
165_F	255_L	0.809	0.11
89_R	326_R	0.808	0.11
158_W	436_L	0.805	0.11
242_Y	504_A	0.802	0.11
28_L	367_F	0.802	0.11
138_A	142_F	0.801	0.11
261_D	418_H	0.801	0.11
296_D	411_V	0.800	0.11
173_G	183_G	0.798	0.11
470_N	480_R	0.798	0.11
133_R	503_L	0.798	0.11
86_R	93_E	0.795	0.11
182_R	262_T	0.794	0.11
205_Y	443_L	0.793	0.11
424_D	485_I	0.792	0.11
227_S	264_G	0.791	0.11
144_V	186_F	0.789	0.11
182_R	261_D	0.788	0.10
333_G	339_L	0.788	0.10
355_Y	463_F	0.787	0.10
108_E	131_A	0.786	0.10
153_P	438_R	0.785	0.10
317_P	411_V	0.784	0.10
166_F	535_T	0.783	0.10
322_Y	567_Q	0.780	0.10
150_L	188_N	0.780	0.10
97_F	295_E	0.779	0.10
76_G	133_R	0.778	0.10
250_K	336_S	0.777	0.10
142_F	255_L	0.777	0.10
183_G	474_L	0.776	0.10
153_P	244_R	0.775	0.10
438_R	464_E	0.775	0.10
188_N	275_M	0.775	0.10
114_Q	351_S	0.775	0.10
33_K	424_D	0.773	0.10
193_T	291_D	0.772	0.10
259_Y	404_A	0.772	0.10
341_L	367_F	0.771	0.10
352_S	392_Q	0.771	0.10
175_Y	411_V	0.771	0.10
107_E	207_T	0.770	0.10
242_Y	266_E	0.770	0.10
407_L	455_R	0.769	0.10
87_S	322_Y	0.769	0.10
397_Q	401_D	0.769	0.10
14_T	87_S	0.768	0.10
341_L	579_M	0.765	0.10
511_E	520_G	0.763	0.10
111_V	249_L	0.763	0.10
277_S	333_G	0.763	0.10
299_G	538_K	0.763	0.10
420_R	468_A	0.762	0.10
57_A	109_V	0.760	0.10
378_S	473_E	0.760	0.10
183_G	426_L	0.760	0.10
156_A	424_D	0.759	0.10
343_M	347_F	0.756	0.10
222_T	568_R	0.756	0.10
114_Q	163_G	0.755	0.10
527_L	574_I	0.755	0.10
155_L	515_I	0.754	0.10
391_L	480_R	0.753	0.10
262_T	441_S	0.752	0.10
463_F	536_S	0.751	0.10
362_Q	371_V	0.749	0.10
175_Y	187_N	0.749	0.10
235_R	508_N	0.747	0.10
121_V	162_R	0.746	0.10
51_H	82_P	0.745	0.10
333_G	422_V	0.742	0.10
334_T	364_S	0.742	0.10
9_E	197_A	0.741	0.10
343_M	391_L	0.741	0.10
85_A	226_I	0.741	0.10
64_Y	399_V	0.741	0.10
441_S	452_I	0.740	0.10
152_R	482_T	0.739	0.10
261_D	452_I	0.738	0.10
334_T	403_H	0.735	0.10
113_A	471_P	0.735	0.10
125_I	134_G	0.735	0.10
133_R	557_V	0.734	0.10
147_Y	178_H	0.734	0.10
145_K	435_I	0.733	0.10
447_Q	455_R	0.732	0.10
87_S	120_L	0.731	0.10
61_T	280_S	0.730	0.10
98_A	501_N	0.730	0.10
333_G	343_M	0.730	0.10
38_L	122_A	0.729	0.10
91_V	446_A	0.729	0.10
347_F	522_P	0.729	0.10
81_S	395_I	0.728	0.10
139_S	391_L	0.727	0.10
246_R	304_R	0.727	0.10
175_Y	326_R	0.726	0.10
336_S	368_G	0.726	0.10
337_S	405_K	0.726	0.10
10_H	369_R	0.724	0.10
261_D	264_G	0.724	0.10
109_V	242_Y	0.724	0.10
358_Q	466_G	0.723	0.10
315_L	371_V	0.722	0.10
75_S	123_T	0.721	0.10
227_S	441_S	0.721	0.10
18_T	167_I	0.720	0.10
295_E	306_R	0.720	0.10
307_L	390_H	0.720	0.10
104_V	242_Y	0.718	0.10
162_R	435_I	0.717	0.10
419_G	463_F	0.716	0.10
158_W	517_I	0.715	0.10
377_N	582_R	0.715	0.10
395_I	581_V	0.715	0.10
256_P	447_Q	0.714	0.10
345_T	423_L	0.713	0.10
261_D	445_V	0.709	0.10
572_W	582_R	0.709	0.10
453_A	458_S	0.709	0.10
304_R	555_S	0.709	0.10
35_V	286_K	0.708	0.10
452_I	463_F	0.707	0.10
453_A	485_I	0.704	0.10
323_R	341_L	0.704	0.10
59_P	296_D	0.703	0.10
55_E	165_F	0.703	0.10
428_N	449_Q	0.703	0.10
239_I	318_V	0.702	0.10
190_P	215_A	0.702	0.10
193_T	582_R	0.701	0.10
407_L	472_E	0.699	0.10
112_I	382_R	0.698	0.10
446_A	541_K	0.698	0.10
91_V	211_I	0.697	0.10
261_D	441_S	0.696	0.10
52_L	540_G	0.695	0.10
333_G	347_F	0.694	0.10
277_S	544_V	0.693	0.10
377_N	407_L	0.690	0.09
134_G	364_S	0.690	0.09
219_T	303_D	0.687	0.09
56_L	116_V	0.687	0.09
173_G	324_F	0.685	0.09
355_Y	363_G	0.685	0.09
145_K	259_Y	0.685	0.09
135_L	235_R	0.684	0.09
113_A	527_L	0.684	0.09
121_V	240_D	0.684	0.09
14_T	373_K	0.682	0.09
553_M	576_T	0.681	0.09
154_A	513_G	0.680	0.09
390_H	484_A	0.680	0.09
243_Q	337_S	0.680	0.09
165_F	264_G	0.679	0.09
290_F	472_E	0.679	0.09
145_K	255_L	0.678	0.09
118_A	264_G	0.678	0.09
54_D	91_V	0.677	0.09
81_S	295_E	0.675	0.09
390_H	393_I	0.672	0.09
289_K	320_L	0.671	0.09
217_A	363_G	0.670	0.09
211_I	326_R	0.670	0.09
36_I	544_V	0.669	0.09
477_L	566_T	0.667	0.09
467_D	538_K	0.667	0.09
464_E	563_D	0.666	0.09
193_T	197_A	0.666	0.09
306_R	520_G	0.665	0.09
142_F	263_L	0.663	0.09
150_L	211_I	0.661	0.09
390_H	404_A	0.660	0.09
145_K	441_S	0.660	0.09
272_F	373_K	0.659	0.09
364_S	454_Q	0.658	0.09
120_L	576_T	0.658	0.09
55_E	253_H	0.658	0.09
114_Q	445_V	0.657	0.09
264_G	452_I	0.657	0.09
361_P	405_K	0.657	0.09
107_E	236_Q	0.657	0.09
138_A	567_Q	0.657	0.09
406_G	462_R	0.655	0.09
358_Q	362_Q	0.655	0.09
223_Q	251_E	0.655	0.09
29_Q	549_S	0.654	0.09
173_G	325_M	0.654	0.09
123_T	293_Q	0.649	0.09
275_M	301_S	0.648	0.09
361_P	401_D	0.648	0.09
86_R	386_Q	0.647	0.09
502_S	535_T	0.647	0.09
392_Q	436_L	0.644	0.09
295_E	515_I	0.644	0.09
49_L	61_T	0.643	0.09
302_A	333_G	0.643	0.09
76_G	503_L	0.643	0.09
375_Y	438_R	0.642	0.09
167_I	219_T	0.642	0.09
123_T	431_A	0.641	0.09
423_L	463_F	0.641	0.09
333_G	410_R	0.640	0.09
121_V	449_Q	0.639	0.09
85_A	569_I	0.637	0.09
99_A	582_R	0.636	0.09
398_A	579_M	0.636	0.09
247_S	318_V	0.635	0.09
306_R	395_I	0.635	0.09
239_I	312_P	0.634	0.09
318_V	431_A	0.634	0.09
290_F	581_V	0.634	0.09
283_Y	459_G	0.634	0.09
193_T	507_A	0.634	0.09
92_D	302_A	0.633	0.09
61_T	102_S	0.633	0.09
16_D	45_H	0.628	0.09
25_W	125_I	0.628	0.09
28_L	36_I	0.626	0.09
138_A	553_M	0.626	0.09
105_G	446_A	0.626	0.09
206_K	533_V	0.625	0.09
66_W	133_R	0.625	0.09
203_D	216_A	0.624	0.09
227_S	418_H	0.623	0.09
186_F	447_Q	0.623	0.09
121_V	134_G	0.622	0.09
85_A	183_G	0.621	0.09
195_A	365_N	0.619	0.09
264_G	351_S	0.618	0.09
345_T	418_H	0.618	0.09
280_S	456_G	0.618	0.09
16_D	23_R	0.618	0.09
156_A	206_K	0.618	0.09
118_A	142_F	0.616	0.09
114_Q	237_P	0.614	0.09
404_A	571_E	0.613	0.09
110_V	299_G	0.613	0.09
155_L	244_R	0.613	0.09
116_V	486_V	0.613	0.09
375_Y	520_G	0.612	0.09
281_R	462_R	0.612	0.09
322_Y	327_K	0.610	0.09
9_E	193_T	0.609	0.09
345_T	443_L	0.609	0.09
229_D	424_D	0.609	0.09
391_L	434_D	0.608	0.09
274_K	327_K	0.608	0.09
313_V	457_M	0.607	0.09
57_A	373_K	0.606	0.09
134_G	302_A	0.605	0.09
98_A	101_D	0.605	0.09
173_G	283_Y	0.604	0.09
14_T	284_A	0.603	0.09
154_A	163_G	0.603	0.09
52_L	322_Y	0.602	0.09
103_Q	269_A	0.602	0.09
315_L	370_L	0.601	0.09
98_A	327_K	0.601	0.09
161_L	195_A	0.599	0.09
464_E	508_N	0.599	0.09
88_V	520_G	0.598	0.09
58_M	207_T	0.598	0.09
329_M	517_I	0.597	0.09
49_L	571_E	0.597	0.09
486_V	489_L	0.597	0.09
475_S	508_N	0.595	0.09
34_K	290_F	0.594	0.09
29_Q	109_V	0.594	0.09
160_R	273_E	0.593	0.09
343_M	467_D	0.593	0.09
108_E	377_N	0.593	0.09
39_F	352_S	0.592	0.09
323_R	403_H	0.591	0.09
104_V	186_F	0.591	0.09
479_P	502_S	0.591	0.09
120_L	485_I	0.590	0.09
153_P	515_I	0.589	0.09
442_E	466_G	0.589	0.09
96_R	200_I	0.588	0.09
77_P	358_Q	0.588	0.09
365_N	373_K	0.588	0.09
52_L	173_G	0.586	0.09
145_K	237_P	0.586	0.09
36_I	109_V	0.584	0.09
296_D	422_V	0.584	0.09
50_Q	53_V	0.583	0.08
84_L	161_L	0.582	0.08
27_A	322_Y	0.582	0.08
276_Q	486_V	0.582	0.08
10_H	317_P	0.581	0.08
446_A	477_L	0.580	0.08
190_P	275_M	0.578	0.08
18_T	207_T	0.578	0.08
131_A	377_N	0.578	0.08
154_A	212_I	0.578	0.08
305_W	332_F	0.577	0.08
324_F	403_H	0.577	0.08
313_V	392_Q	0.577	0.08
145_K	271_A	0.576	0.08
163_G	261_D	0.576	0.08
23_R	347_F	0.576	0.08
284_A	369_R	0.575	0.08
430_P	459_G	0.572	0.08
198_V	341_L	0.572	0.08
373_K	450_E	0.570	0.08
234_H	237_P	0.570	0.08
23_R	217_A	0.570	0.08
17_N	121_V	0.569	0.08
142_F	211_I	0.567	0.08
374_I	520_G	0.567	0.08
105_G	154_A	0.567	0.08
112_I	576_T	0.567	0.08
167_I	309_S	0.566	0.08
438_R	468_A	0.565	0.08
108_E	132_I	0.564	0.08
255_L	520_G	0.563	0.08
107_E	511_E	0.562	0.08
113_A	345_T	0.562	0.08
306_R	322_Y	0.559	0.08
76_G	557_V	0.559	0.08
109_V	409_V	0.558	0.08
343_M	471_P	0.558	0.08
75_S	88_V	0.557	0.08
320_L	324_F	0.557	0.08
51_H	163_G	0.557	0.08
345_T	535_T	0.556	0.08
80_Y	200_I	0.555	0.08
71_H	377_N	0.555	0.08
311_G	532_G	0.555	0.08
303_D	306_R	0.553	0.08
26_P	59_P	0.552	0.08
285_N	408_A	0.552	0.08
77_P	369_R	0.551	0.08
510_I	582_R	0.551	0.08
92_D	249_L	0.550	0.08
312_P	318_V	0.550	0.08
133_R	489_L	0.550	0.08
262_T	352_S	0.549	0.08
319_D	533_V	0.548	0.08
16_D	22_Y	0.548	0.08
64_Y	515_I	0.547	0.08
19_A	272_F	0.547	0.08
299_G	532_G	0.545	0.08
319_D	334_T	0.545	0.08
223_Q	226_I	0.545	0.08
23_R	355_Y	0.543	0.08
200_I	302_A	0.542	0.08
142_F	165_F	0.542	0.08
163_G	479_P	0.542	0.08
15_S	321_A	0.542	0.08
144_V	200_I	0.542	0.08
249_L	472_E	0.541	0.08
397_Q	404_A	0.541	0.08
52_L	393_I	0.540	0.08
253_H	316_S	0.540	0.08
108_E	446_A	0.539	0.08
282_L	302_A	0.538	0.08
55_E	351_S	0.538	0.08
436_L	464_E	0.538	0.08
61_T	312_P	0.536	0.08
60_D	159_H	0.536	0.08
108_E	180_R	0.535	0.08
66_W	503_L	0.535	0.08
92_D	277_S	0.535	0.08
132_I	250_K	0.535	0.08
187_N	356_V	0.534	0.08
422_V	581_V	0.532	0.08
273_E	337_S	0.532	0.08
302_A	440_Y	0.532	0.08
355_Y	522_P	0.530	0.08
55_E	114_Q	0.530	0.08
211_I	411_V	0.529	0.08
46_S	132_I	0.529	0.08
392_Q	572_W	0.529	0.08
237_P	567_Q	0.529	0.08
144_V	282_L	0.528	0.08
198_V	375_Y	0.528	0.08
207_T	533_V	0.528	0.08
125_I	480_R	0.527	0.08
78_R	117_G	0.527	0.08
29_Q	110_V	0.527	0.08
17_N	30_P	0.527	0.08
15_S	386_Q	0.527	0.08
220_L	229_D	0.527	0.08
64_Y	203_D	0.526	0.08
406_G	427_A	0.526	0.08
377_N	538_K	0.524	0.08
51_H	114_Q	0.524	0.08
22_Y	97_F	0.524	0.08
329_M	332_F	0.523	0.08
399_V	426_L	0.521	0.08
200_I	235_R	0.520	0.08
144_V	185_S	0.519	0.08
46_S	49_L	0.518	0.08
51_H	211_I	0.517	0.08
20_L	154_A	0.516	0.08
121_V	206_K	0.516	0.08
360_Q	453_A	0.514	0.08
397_Q	477_L	0.513	0.08
355_Y	547_V	0.513	0.08
418_H	535_T	0.512	0.08
37_V	414_I	0.512	0.08
280_S	485_I	0.512	0.08
116_V	420_R	0.511	0.08
526_Q	531_A	0.511	0.08
181_Q	400_A	0.511	0.08
96_R	173_G	0.509	0.08
38_L	121_V	0.509	0.08
423_L	437_L	0.509	0.08
25_W	89_R	0.509	0.08
279_I	470_N	0.508	0.08
164_L	302_A	0.507	0.08
164_L	378_S	0.507	0.08
128_Y	538_K	0.506	0.08
175_Y	499_V	0.506	0.08
51_H	182_R	0.506	0.08
19_A	88_V	0.505	0.08
273_E	393_I	0.505	0.08
564_K	573_G	0.504	0.08
163_G	437_L	0.504	0.08
36_I	269_A	0.503	0.08
113_A	366_A	0.503	0.08
199_N	392_Q	0.503	0.08
358_Q	520_G	0.503	0.08
408_A	427_A	0.502	0.08
78_R	486_V	0.502	0.08
296_D	506_L	0.502	0.08
234_H	341_L	0.502	0.08
547_V	559_D	0.502	0.08
92_D	200_I	0.502	0.08
334_T	344_S	0.502	0.08
30_P	109_V	0.501	0.08
71_H	174_R	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3pe6A	1	0.4752	100	0.893	Contact Map
2y6uA	2	0.5197	100	0.896	Contact Map
3hjuA	2	0.4821	100	0.91	Contact Map
1k8qA	1	0.4718	100	0.912	Contact Map
1thtA	2	0.4872	99.9	0.916	Contact Map
2wtmA	2	0.4239	99.9	0.916	Contact Map
4fblA	2	0.4154	99.9	0.917	Contact Map
1mtzA	1	0.4513	99.9	0.918	Contact Map
4oseA	1	0.441	99.9	0.919	Contact Map
2hdwA	2	0.4701	99.9	0.919	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0146 seconds.