PGAB - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PGAB - Poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine N-deacetylase

UniProt:	P75906	Sequences: MLRNGNKYLLMLVSIIMLTACISQSRTSFIPPQDRESLLAEQPWPHNGFVAISWHNVEDEAADQRFMSVRTSALREQFAWLRENGYQPVSIAQIREAHRGGKPLPEKAVVLTFDDGYQSFYTRVFPILQAFQWPAVWAPVGSWVDTPADKQVKFGDELVDREYFATWQQVREVARSRLVELASHTWNSHYGIQANATGSLLPVYVNRAYFTDHARYETAAEYRERIRLDAVKMTEYLRTKVEVNPHVFVWPYGEANGIAIEELKKLGYDMFFTLESGLANASQLDSIPRVLIANNPSLKEFAQQIITVQEKSPQRIMHIDLDYVYDENLQQMDRNIDVLIQRVKDMQISTVYLQAFADPDGDGLVKEVWFPNRLLPMKADIFSRVAWQLRTRSGVNIYAWMPVLSWDLDPTLTRVKYLPTGEKKAQIHPEQYHRLSPFDDRVRAQVGMLYEDLAGHAAFDGILFHDDALLSDYEDASAPAITAYQQAGFSGSLSEIRQNPEQFKQWARFKSRALTDFTLELSARVKAIRGPHIKTARNIFALPVIQPESEAWFAQNYADFLKSYDWTAIMAMPYLEGVAEKSADQWLIQLTNQIKNIPQAKDKSILELQAQNWQKNGQHQAISSQQLAHWMSLLQLNGVKNYGYYPDNFLHNQPEIDLIRPEFSTAWYPKND	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13864
Length:	672 (619)
Sequences:	168 (108)
Seq/√Len:	4.3

ECOLI - PGAB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
92_A	96_E	6.050	0.99
368_V	449_L	5.143	0.96
374_L	448_M	4.335	0.90
125_F	173_V	3.671	0.80
141_G	186_W	3.412	0.75
215_R	221_E	3.326	0.73
317_M	343_V	3.291	0.72
89_V	94_I	3.182	0.69
52_I	485_Q	3.169	0.69
49_F	287_I	3.068	0.66
609_Q	613_W	3.063	0.66
153_K	156_D	3.051	0.66
403_V	518_T	2.947	0.63
360_D	366_K	2.945	0.63
359_P	378_K	2.922	0.62
601_K	639_V	2.855	0.60
210_F	221_E	2.837	0.60
576_E	609_Q	2.789	0.58
187_N	223_R	2.752	0.57
320_D	466_D	2.748	0.57
53_S	112_T	2.729	0.57
192_I	208_A	2.725	0.57
91_I	247_V	2.722	0.56
199_S	384_R	2.679	0.55
652_N	655_E	2.621	0.53
483_A	487_A	2.604	0.53
57_V	124_V	2.603	0.53
624_S	658_L	2.592	0.53
552_W	576_E	2.576	0.52
373_R	448_M	2.567	0.52
74_L	78_F	2.561	0.52
218_T	539_I	2.539	0.51
552_W	575_L	2.512	0.50
89_V	520_E	2.506	0.50
128_L	135_A	2.402	0.47
57_V	457_A	2.321	0.44
316_I	643_G	2.283	0.43
128_L	361_G	2.202	0.41
576_E	613_W	2.167	0.40
129_Q	222_Y	2.149	0.39
155_G	648_N	2.142	0.39
118_Q	169_Q	2.130	0.39
550_E	556_N	2.125	0.39
558_A	597_I	2.121	0.39
187_N	190_Y	2.113	0.38
570_M	613_W	2.096	0.38
496_I	499_N	2.090	0.38
49_F	533_I	2.080	0.37
592_N	637_N	2.053	0.37
538_N	613_W	2.024	0.36
329_L	381_I	2.009	0.35
187_N	585_Q	2.005	0.35
447_G	524_R	2.004	0.35
182_A	511_S	1.989	0.35
368_V	406_W	1.971	0.34
415_V	419_P	1.963	0.34
235_E	622_I	1.946	0.34
374_L	445_Q	1.942	0.34
52_I	534_K	1.941	0.34
226_I	259_A	1.933	0.33
90_S	540_F	1.912	0.33
444_A	448_M	1.904	0.33
222_Y	259_A	1.903	0.33
570_M	609_Q	1.898	0.32
77_Q	154_F	1.894	0.32
317_M	346_M	1.859	0.31
336_I	384_R	1.851	0.31
482_T	485_Q	1.851	0.31
567_T	659_I	1.841	0.31
490_S	502_Q	1.825	0.30
323_Y	465_H	1.800	0.30
144_V	247_V	1.798	0.30
562_K	612_N	1.787	0.30
120_F	137_W	1.779	0.29
469_L	540_F	1.778	0.29
57_V	82_R	1.776	0.29
320_D	335_N	1.775	0.29
185_T	204_Y	1.770	0.29
389_L	586_W	1.744	0.28
385_V	652_N	1.735	0.28
464_F	522_S	1.730	0.28
222_Y	522_S	1.706	0.28
279_A	487_A	1.705	0.28
373_R	451_E	1.695	0.27
69_V	207_R	1.693	0.27
129_Q	603_K	1.692	0.27
317_M	531_P	1.691	0.27
179_V	398_Y	1.683	0.27
406_W	449_L	1.677	0.27
56_N	88_P	1.674	0.27
295_N	439_D	1.664	0.27
79_A	131_F	1.664	0.27
481_I	489_F	1.663	0.27
593_Q	648_N	1.657	0.26
194_A	206_N	1.648	0.26
478_A	526_K	1.641	0.26
314_Q	352_Y	1.639	0.26
255_A	360_D	1.629	0.26
93_Q	102_K	1.627	0.26
476_A	497_R	1.626	0.26
56_N	586_W	1.626	0.26
210_F	213_H	1.622	0.26
54_W	552_W	1.613	0.25
570_M	576_E	1.613	0.25
318_H	401_M	1.610	0.25
201_L	383_S	1.608	0.25
78_F	496_I	1.602	0.25
74_L	389_L	1.600	0.25
315_R	586_W	1.597	0.25
262_E	643_G	1.584	0.25
377_M	446_V	1.583	0.25
360_D	365_V	1.580	0.25
142_S	226_I	1.574	0.24
182_A	281_A	1.566	0.24
527_A	567_T	1.565	0.24
100_G	246_H	1.557	0.24
222_Y	528_I	1.542	0.24
57_V	662_E	1.540	0.24
386_A	460_D	1.538	0.24
468_A	514_L	1.538	0.24
89_V	462_I	1.536	0.24
68_S	409_D	1.534	0.24
631_M	641_N	1.532	0.24
451_E	524_R	1.518	0.23
226_I	230_A	1.513	0.23
54_W	569_I	1.511	0.23
248_F	268_Y	1.511	0.23
59_D	404_L	1.504	0.23
78_F	88_P	1.494	0.23
475_D	506_W	1.493	0.23
264_K	603_K	1.490	0.23
167_W	240_K	1.480	0.22
550_E	610_A	1.480	0.22
449_L	650_L	1.479	0.22
54_W	77_Q	1.471	0.22
557_Y	594_I	1.469	0.22
613_W	645_Y	1.467	0.22
280_N	288_P	1.460	0.22
107_K	226_I	1.460	0.22
542_L	546_Q	1.455	0.22
315_R	389_L	1.449	0.22
354_Q	538_N	1.448	0.22
343_V	350_T	1.443	0.22
320_D	465_H	1.442	0.22
286_S	512_R	1.442	0.22
317_M	663_F	1.432	0.21
588_I	633_L	1.428	0.21
511_S	559_D	1.428	0.21
210_F	215_R	1.426	0.21
432_Y	465_H	1.421	0.21
88_P	112_T	1.414	0.21
179_V	457_A	1.412	0.21
248_F	271_F	1.411	0.21
320_D	645_Y	1.410	0.21
472_D	552_W	1.408	0.21
609_Q	645_Y	1.402	0.21
133_W	233_M	1.399	0.21
439_D	479_P	1.385	0.20
86_Y	218_T	1.381	0.20
616_N	652_N	1.380	0.20
108_A	194_A	1.377	0.20
277_G	284_L	1.377	0.20
403_V	556_N	1.371	0.20
548_E	551_A	1.362	0.20
139_P	566_W	1.361	0.20
390_R	460_D	1.358	0.20
403_V	468_A	1.346	0.20
90_S	138_A	1.346	0.20
171_R	390_R	1.345	0.20
408_L	446_V	1.342	0.20
478_A	540_F	1.339	0.20
170_V	659_I	1.336	0.20
383_S	557_Y	1.334	0.20
150_K	539_I	1.332	0.19
129_Q	173_V	1.329	0.19
154_F	569_I	1.327	0.19
223_R	261_E	1.326	0.19
648_N	651_H	1.324	0.19
291_L	384_R	1.324	0.19
446_V	484_Y	1.323	0.19
552_W	570_M	1.314	0.19
324_V	649_F	1.314	0.19
574_Y	626_Q	1.310	0.19
204_Y	481_I	1.304	0.19
377_M	386_A	1.304	0.19
130_A	279_A	1.299	0.19
254_E	563_S	1.298	0.19
188_S	204_Y	1.295	0.19
335_N	466_D	1.289	0.19
230_A	440_D	1.285	0.19
442_V	639_V	1.283	0.19
447_G	520_E	1.282	0.19
484_Y	489_F	1.282	0.19
279_A	288_P	1.279	0.18
201_L	357_A	1.265	0.18
374_L	449_L	1.261	0.18
483_A	509_F	1.258	0.18
89_V	228_L	1.254	0.18
536_A	607_E	1.254	0.18
464_F	521_L	1.253	0.18
480_A	484_Y	1.250	0.18
268_Y	454_A	1.250	0.18
165_A	605_I	1.246	0.18
612_N	615_K	1.245	0.18
262_E	610_A	1.244	0.18
92_A	247_V	1.238	0.18
58_E	65_R	1.236	0.18
133_W	154_F	1.236	0.18
404_L	437_P	1.234	0.18
330_Q	426_Q	1.233	0.18
234_T	244_N	1.228	0.18
441_R	444_A	1.226	0.18
490_S	496_I	1.222	0.17
127_I	389_L	1.221	0.17
333_D	337_D	1.217	0.17
247_V	272_F	1.215	0.17
247_V	350_T	1.213	0.17
320_D	613_W	1.210	0.17
335_N	538_N	1.202	0.17
89_V	171_R	1.200	0.17
82_R	334_R	1.197	0.17
552_W	613_W	1.188	0.17
67_M	347_Q	1.182	0.17
481_I	490_S	1.180	0.17
336_I	343_V	1.179	0.17
112_T	149_D	1.177	0.17
117_Y	149_D	1.174	0.17
336_I	440_D	1.173	0.17
301_F	549_S	1.166	0.17
52_I	214_A	1.165	0.16
160_D	334_R	1.155	0.16
220_A	603_K	1.151	0.16
318_H	465_H	1.151	0.16
388_Q	647_D	1.149	0.16
78_F	127_I	1.146	0.16
139_P	181_L	1.142	0.16
395_V	436_S	1.140	0.16
541_A	607_E	1.138	0.16
263_L	439_D	1.135	0.16
141_G	549_S	1.133	0.16
57_V	74_L	1.133	0.16
186_W	248_F	1.123	0.16
316_I	386_A	1.122	0.16
313_P	601_K	1.121	0.16
59_D	164_F	1.120	0.16
318_H	432_Y	1.120	0.16
201_L	385_V	1.119	0.16
518_T	643_G	1.112	0.16
125_F	182_A	1.112	0.16
45_P	77_Q	1.112	0.16
518_T	586_W	1.110	0.16
315_R	649_F	1.109	0.16
51_A	368_V	1.109	0.16
93_Q	108_A	1.101	0.15
247_V	292_I	1.095	0.15
347_Q	648_N	1.093	0.15
340_I	556_N	1.093	0.15
125_F	137_W	1.091	0.15
356_F	490_S	1.090	0.15
129_Q	368_V	1.090	0.15
291_L	392_R	1.086	0.15
531_P	567_T	1.085	0.15
277_G	506_W	1.081	0.15
139_P	236_Y	1.079	0.15
466_D	645_Y	1.078	0.15
148_A	261_E	1.074	0.15
207_R	219_A	1.072	0.15
51_A	112_T	1.067	0.15
481_I	506_W	1.066	0.15
175_R	641_N	1.066	0.15
214_A	486_Q	1.065	0.15
219_A	648_N	1.064	0.15
219_A	455_G	1.064	0.15
519_L	563_S	1.064	0.15
400_W	645_Y	1.060	0.15
332_M	438_F	1.059	0.15
57_V	602_D	1.059	0.15
85_G	206_N	1.058	0.15
137_W	177_R	1.056	0.15
290_V	368_V	1.055	0.15
69_V	277_G	1.050	0.15
446_V	482_T	1.048	0.15
538_N	576_E	1.048	0.15
462_I	533_I	1.045	0.15
327_E	337_D	1.043	0.15
660_R	665_T	1.042	0.15
552_W	609_Q	1.041	0.15
319_I	337_D	1.041	0.15
120_F	271_F	1.041	0.15
478_A	652_N	1.038	0.14
575_L	609_Q	1.037	0.14
202_P	205_V	1.036	0.14
94_I	164_F	1.036	0.14
191_G	202_P	1.031	0.14
93_Q	295_N	1.029	0.14
472_D	575_L	1.029	0.14
539_I	548_E	1.027	0.14
373_R	449_L	1.026	0.14
389_L	560_F	1.022	0.14
604_S	634_L	1.021	0.14
444_A	449_L	1.019	0.14
408_L	465_H	1.018	0.14
192_I	396_N	1.016	0.14
574_Y	583_A	1.015	0.14
320_D	432_Y	1.011	0.14
171_R	460_D	1.005	0.14
439_D	540_F	1.005	0.14
199_S	291_L	1.002	0.14
311_K	377_M	1.002	0.14
484_Y	497_R	1.000	0.14
106_E	554_A	0.999	0.14
356_F	524_R	0.996	0.14
226_I	603_K	0.995	0.14
533_I	631_M	0.987	0.14
152_V	210_F	0.986	0.14
276_S	469_L	0.986	0.14
343_V	436_S	0.984	0.14
188_S	365_V	0.984	0.14
211_T	347_Q	0.983	0.14
165_A	489_F	0.981	0.14
469_L	605_I	0.979	0.14
78_F	389_L	0.977	0.14
214_A	546_Q	0.977	0.14
93_Q	476_A	0.976	0.14
168_Q	523_A	0.972	0.14
199_S	336_I	0.972	0.14
110_V	180_E	0.971	0.14
168_Q	549_S	0.970	0.13
118_Q	182_A	0.969	0.13
51_A	337_D	0.967	0.13
49_F	78_F	0.967	0.13
432_Y	466_D	0.964	0.13
334_R	596_N	0.962	0.13
80_W	209_Y	0.962	0.13
631_M	642_Y	0.961	0.13
66_F	159_V	0.955	0.13
438_F	513_A	0.955	0.13
512_R	584_D	0.954	0.13
586_W	664_S	0.951	0.13
450_Y	647_D	0.951	0.13
469_L	652_N	0.951	0.13
473_Y	492_S	0.949	0.13
139_P	556_N	0.945	0.13
431_Q	471_S	0.944	0.13
73_A	295_N	0.942	0.13
451_E	554_A	0.940	0.13
220_A	520_E	0.939	0.13
164_F	664_S	0.939	0.13
269_D	533_I	0.938	0.13
194_A	259_A	0.936	0.13
522_S	641_N	0.935	0.13
237_L	406_W	0.934	0.13
242_E	547_P	0.934	0.13
69_V	531_P	0.932	0.13
549_S	552_W	0.932	0.13
177_R	209_Y	0.930	0.13
145_D	185_T	0.929	0.13
330_Q	546_Q	0.929	0.13
268_Y	301_F	0.926	0.13
335_N	613_W	0.924	0.13
561_L	598_P	0.923	0.13
419_P	583_A	0.922	0.13
470_L	544_V	0.922	0.13
259_A	605_I	0.918	0.13
205_V	268_Y	0.918	0.13
194_A	362_D	0.918	0.13
68_S	298_L	0.917	0.13
156_D	557_Y	0.917	0.13
465_H	572_M	0.916	0.13
379_A	648_N	0.914	0.13
139_P	630_W	0.913	0.13
51_A	642_Y	0.912	0.13
401_M	460_D	0.912	0.13
165_A	318_H	0.910	0.13
169_Q	622_I	0.910	0.13
159_V	182_A	0.907	0.13
86_Y	89_V	0.906	0.13
239_T	533_I	0.905	0.13
350_T	587_L	0.905	0.13
544_V	558_A	0.904	0.13
244_N	485_Q	0.897	0.13
329_L	443_R	0.897	0.13
244_N	454_A	0.896	0.12
387_W	514_L	0.892	0.12
405_S	540_F	0.891	0.12
160_D	459_F	0.888	0.12
342_R	450_Y	0.887	0.12
49_F	65_R	0.887	0.12
165_A	272_F	0.884	0.12
465_H	609_Q	0.884	0.12
170_V	247_V	0.883	0.12
559_D	643_G	0.883	0.12
78_F	133_W	0.883	0.12
125_F	183_S	0.878	0.12
48_G	496_I	0.878	0.12
494_S	623_S	0.877	0.12
357_A	540_F	0.875	0.12
177_R	657_D	0.875	0.12
607_E	647_D	0.874	0.12
187_N	352_Y	0.874	0.12
69_V	296_P	0.873	0.12
583_A	659_I	0.872	0.12
255_A	278_L	0.871	0.12
594_I	606_L	0.871	0.12
222_Y	464_F	0.869	0.12
135_A	361_G	0.869	0.12
480_A	506_W	0.868	0.12
518_T	521_L	0.868	0.12
237_L	294_N	0.863	0.12
393_S	427_I	0.863	0.12
454_A	666_A	0.861	0.12
49_F	284_L	0.859	0.12
81_L	531_P	0.857	0.12
119_S	349_S	0.856	0.12
243_V	349_S	0.856	0.12
246_H	351_V	0.854	0.12
141_G	509_F	0.854	0.12
287_I	349_S	0.853	0.12
556_N	642_Y	0.850	0.12
320_D	538_N	0.849	0.12
177_R	349_S	0.848	0.12
218_T	221_E	0.847	0.12
352_Y	574_Y	0.845	0.12
381_I	492_S	0.844	0.12
125_F	375_L	0.842	0.12
294_N	391_T	0.842	0.12
273_T	345_D	0.841	0.12
487_A	509_F	0.841	0.12
182_A	438_F	0.839	0.12
340_I	539_I	0.839	0.12
466_D	613_W	0.837	0.12
284_L	413_T	0.837	0.12
154_F	273_T	0.835	0.12
185_T	306_I	0.835	0.12
192_I	584_D	0.833	0.12
295_N	442_V	0.832	0.12
169_Q	177_R	0.831	0.12
226_I	540_F	0.831	0.12
136_V	343_V	0.830	0.12
375_L	499_N	0.830	0.12
149_D	162_E	0.830	0.12
320_D	609_Q	0.827	0.12
145_D	218_T	0.827	0.12
400_W	472_D	0.826	0.12
485_Q	501_E	0.826	0.12
336_I	438_F	0.824	0.12
318_H	569_I	0.823	0.12
68_S	106_E	0.820	0.12
453_L	459_F	0.820	0.12
481_I	546_Q	0.820	0.12
113_F	242_E	0.819	0.12
539_I	641_N	0.815	0.11
125_F	385_V	0.814	0.11
253_G	644_Y	0.814	0.11
241_V	377_M	0.812	0.11
610_A	629_H	0.811	0.11
136_V	350_T	0.810	0.11
512_R	516_D	0.810	0.11
496_I	521_L	0.809	0.11
450_Y	607_E	0.808	0.11
192_I	261_E	0.807	0.11
574_Y	578_V	0.806	0.11
493_L	566_W	0.804	0.11
52_I	149_D	0.803	0.11
138_A	350_T	0.801	0.11
381_I	411_T	0.801	0.11
88_P	586_W	0.801	0.11
307_T	639_V	0.797	0.11
413_T	507_A	0.797	0.11
400_W	552_W	0.797	0.11
128_L	242_E	0.796	0.11
315_R	664_S	0.796	0.11
462_I	640_K	0.795	0.11
74_L	586_W	0.794	0.11
354_Q	613_W	0.793	0.11
283_Q	288_P	0.793	0.11
391_T	524_R	0.793	0.11
199_S	206_N	0.791	0.11
320_D	570_M	0.790	0.11
99_R	622_I	0.788	0.11
85_G	569_I	0.787	0.11
76_E	318_H	0.787	0.11
201_L	390_R	0.787	0.11
208_A	348_I	0.787	0.11
220_A	503_F	0.786	0.11
76_E	148_A	0.786	0.11
159_V	188_S	0.784	0.11
247_V	471_S	0.784	0.11
56_N	127_I	0.784	0.11
464_F	518_T	0.784	0.11
258_I	303_Q	0.784	0.11
103_P	592_N	0.783	0.11
610_A	631_M	0.783	0.11
61_A	238_R	0.781	0.11
495_E	499_N	0.781	0.11
164_F	514_L	0.779	0.11
131_F	632_S	0.779	0.11
443_R	623_S	0.778	0.11
544_V	569_I	0.778	0.11
85_G	567_T	0.777	0.11
161_R	556_N	0.776	0.11
258_I	262_E	0.776	0.11
219_A	604_S	0.776	0.11
89_V	185_T	0.775	0.11
149_D	265_K	0.774	0.11
75_R	637_N	0.773	0.11
152_V	155_G	0.773	0.11
74_L	397_I	0.772	0.11
201_L	603_K	0.772	0.11
48_G	214_A	0.771	0.11
600_A	604_S	0.769	0.11
160_D	237_L	0.769	0.11
136_V	188_S	0.767	0.11
101_G	173_V	0.767	0.11
498_Q	502_Q	0.766	0.11
201_L	206_N	0.766	0.11
603_K	650_L	0.766	0.11
120_F	260_I	0.765	0.11
124_V	563_S	0.765	0.11
320_D	576_E	0.765	0.11
357_A	623_S	0.764	0.11
147_P	185_T	0.764	0.11
78_F	186_W	0.762	0.11
185_T	206_N	0.762	0.11
354_Q	400_W	0.762	0.11
131_F	389_L	0.760	0.11
364_L	433_H	0.760	0.11
152_V	408_L	0.757	0.11
414_R	529_R	0.756	0.11
518_T	560_F	0.756	0.11
295_N	337_D	0.756	0.11
133_W	586_W	0.755	0.11
112_T	639_V	0.754	0.11
168_Q	539_I	0.754	0.11
313_P	346_M	0.753	0.11
238_R	301_F	0.751	0.11
149_D	334_R	0.750	0.11
78_F	187_N	0.749	0.11
356_F	451_E	0.749	0.11
139_P	257_G	0.749	0.11
575_L	613_W	0.749	0.11
118_Q	622_I	0.748	0.11
498_Q	546_Q	0.748	0.11
179_V	346_M	0.747	0.11
315_R	397_I	0.747	0.11
508_R	642_Y	0.746	0.11
136_V	247_V	0.745	0.11
52_I	156_D	0.745	0.11
348_I	377_M	0.744	0.11
476_A	484_Y	0.744	0.11
168_Q	615_K	0.742	0.11
446_V	552_W	0.742	0.11
221_E	577_G	0.741	0.11
76_E	658_L	0.741	0.11
476_A	481_I	0.741	0.11
401_M	405_S	0.741	0.11
317_M	332_M	0.737	0.11
168_Q	447_G	0.736	0.11
185_T	260_I	0.735	0.11
49_F	305_I	0.734	0.10
296_P	543_P	0.733	0.10
221_E	346_M	0.733	0.10
54_W	245_P	0.733	0.10
287_I	603_K	0.732	0.10
321_L	339_L	0.732	0.10
98_H	346_M	0.730	0.10
377_M	381_I	0.730	0.10
170_V	346_M	0.728	0.10
594_I	604_S	0.728	0.10
230_A	643_G	0.728	0.10
233_M	630_W	0.725	0.10
568_A	607_E	0.725	0.10
430_E	546_Q	0.724	0.10
215_R	218_T	0.723	0.10
287_I	300_E	0.723	0.10
337_D	384_R	0.723	0.10
383_S	605_I	0.722	0.10
346_M	652_N	0.722	0.10
419_P	529_R	0.722	0.10
78_F	224_E	0.721	0.10
150_K	386_A	0.721	0.10
333_D	336_I	0.721	0.10
624_S	653_Q	0.720	0.10
194_A	377_M	0.720	0.10
70_R	308_V	0.719	0.10
547_P	606_L	0.718	0.10
113_F	272_F	0.717	0.10
409_D	600_A	0.717	0.10
172_E	385_V	0.716	0.10
442_V	529_R	0.716	0.10
88_P	133_W	0.714	0.10
148_A	386_A	0.713	0.10
103_P	112_T	0.713	0.10
389_L	664_S	0.712	0.10
174_A	381_I	0.712	0.10
330_Q	482_T	0.711	0.10
301_F	542_L	0.710	0.10
160_D	581_K	0.708	0.10
224_E	567_T	0.708	0.10
540_F	605_I	0.708	0.10
529_R	543_P	0.706	0.10
144_V	186_W	0.706	0.10
591_T	601_K	0.705	0.10
543_P	553_F	0.704	0.10
78_F	128_L	0.703	0.10
58_E	68_S	0.703	0.10
56_N	389_L	0.702	0.10
92_A	272_F	0.702	0.10
222_Y	567_T	0.701	0.10
208_A	652_N	0.701	0.10
207_R	294_N	0.699	0.10
515_T	518_T	0.699	0.10
72_S	188_S	0.698	0.10
405_S	442_V	0.697	0.10
68_S	374_L	0.696	0.10
291_L	339_L	0.696	0.10
345_D	365_V	0.696	0.10
201_L	374_L	0.695	0.10
361_G	609_Q	0.695	0.10
320_D	575_L	0.694	0.10
75_R	106_E	0.694	0.10
158_L	188_S	0.694	0.10
567_T	602_D	0.691	0.10
476_A	493_L	0.690	0.10
464_F	663_F	0.690	0.10
538_N	609_Q	0.690	0.10
593_Q	651_H	0.689	0.10
272_F	346_M	0.688	0.10
319_I	503_F	0.688	0.10
403_V	643_G	0.687	0.10
486_Q	490_S	0.686	0.10
465_H	576_E	0.686	0.10
74_L	560_F	0.686	0.10
118_Q	157_E	0.685	0.10
48_G	204_Y	0.684	0.10
439_D	477_S	0.684	0.10
71_T	295_N	0.684	0.10
108_A	470_L	0.684	0.10
127_I	397_I	0.684	0.10
244_N	652_N	0.683	0.10
145_D	278_L	0.682	0.10
162_E	254_E	0.681	0.10
489_F	496_I	0.679	0.10
165_A	206_N	0.678	0.10
318_H	575_L	0.677	0.10
560_F	626_Q	0.677	0.10
120_F	415_V	0.676	0.10
163_Y	194_A	0.676	0.10
152_V	620_Q	0.675	0.10
526_K	540_F	0.675	0.10
340_I	381_I	0.675	0.10
122_T	211_T	0.674	0.10
367_E	504_K	0.673	0.10
499_N	651_H	0.673	0.10
388_Q	517_F	0.673	0.10
414_R	419_P	0.671	0.10
57_V	237_L	0.670	0.10
77_Q	174_A	0.670	0.10
129_Q	243_V	0.669	0.10
51_A	203_V	0.668	0.10
56_N	560_F	0.667	0.10
141_G	350_T	0.667	0.10
439_D	603_K	0.666	0.10
186_W	247_V	0.665	0.10
150_K	188_S	0.665	0.10
493_L	597_I	0.665	0.10
569_I	595_K	0.663	0.10
560_F	586_W	0.663	0.10
63_D	296_P	0.662	0.10
47_N	492_S	0.661	0.10
256_N	648_N	0.660	0.10
451_E	456_H	0.660	0.10
515_T	560_F	0.660	0.10
398_Y	442_V	0.656	0.10
67_M	292_I	0.655	0.10
301_F	385_V	0.654	0.10
633_L	639_V	0.654	0.10
165_A	239_T	0.652	0.10
397_I	612_N	0.652	0.10
478_A	481_I	0.651	0.10
98_H	462_I	0.646	0.10
389_L	649_F	0.645	0.10
150_K	327_E	0.645	0.10
244_N	577_G	0.645	0.10
495_E	562_K	0.644	0.10
404_L	457_A	0.643	0.10
69_V	438_F	0.642	0.09
638_G	646_P	0.641	0.09
98_H	520_E	0.640	0.09
357_A	613_W	0.640	0.09
84_N	170_V	0.640	0.09
268_Y	366_K	0.639	0.09
233_M	248_F	0.639	0.09
226_I	605_I	0.638	0.09
465_H	645_Y	0.637	0.09
572_M	576_E	0.636	0.09
356_F	385_V	0.635	0.09
56_N	518_T	0.634	0.09
197_T	440_D	0.634	0.09
108_A	204_Y	0.630	0.09
396_N	421_G	0.630	0.09
655_E	666_A	0.629	0.09
168_Q	293_A	0.628	0.09
194_A	302_A	0.627	0.09
133_W	630_W	0.627	0.09
159_V	549_S	0.626	0.09
365_V	623_S	0.626	0.09
191_G	199_S	0.626	0.09
398_Y	405_S	0.625	0.09
401_M	533_I	0.625	0.09
647_D	654_P	0.624	0.09
330_Q	404_L	0.624	0.09
56_N	315_R	0.624	0.09
89_V	328_N	0.623	0.09
642_Y	663_F	0.622	0.09
109_V	505_Q	0.622	0.09
166_T	237_L	0.620	0.09
404_L	468_A	0.619	0.09
116_G	372_N	0.618	0.09
111_L	182_A	0.618	0.09
186_W	350_T	0.618	0.09
438_F	525_V	0.618	0.09
388_Q	450_Y	0.615	0.09
426_Q	554_A	0.615	0.09
372_N	435_L	0.615	0.09
56_N	71_T	0.614	0.09
352_Y	529_R	0.613	0.09
649_F	664_S	0.613	0.09
222_Y	269_D	0.613	0.09
535_T	571_A	0.612	0.09
205_V	578_V	0.611	0.09
173_V	540_F	0.611	0.09
159_V	590_L	0.610	0.09
92_A	177_R	0.609	0.09
384_R	388_Q	0.609	0.09
526_K	605_I	0.607	0.09
51_A	96_E	0.607	0.09
52_I	589_Q	0.607	0.09
431_Q	469_L	0.607	0.09
348_I	642_Y	0.606	0.09
298_L	451_E	0.605	0.09
113_F	128_L	0.604	0.09
173_V	536_A	0.603	0.09
331_Q	538_N	0.603	0.09
636_L	642_Y	0.602	0.09
572_M	607_E	0.602	0.09
44_W	341_Q	0.601	0.09
592_N	612_N	0.601	0.09
553_F	630_W	0.601	0.09
235_E	244_N	0.601	0.09
248_F	341_Q	0.600	0.09
472_D	576_E	0.599	0.09
446_V	473_Y	0.598	0.09
238_R	330_Q	0.598	0.09
150_K	610_A	0.596	0.09
549_S	667_W	0.595	0.09
272_F	310_E	0.594	0.09
205_V	248_F	0.594	0.09
496_I	502_Q	0.594	0.09
44_W	415_V	0.592	0.09
295_N	665_T	0.591	0.09
131_F	153_K	0.591	0.09
77_Q	552_W	0.590	0.09
194_A	262_E	0.590	0.09
371_P	435_L	0.589	0.09
442_V	588_I	0.589	0.09
90_S	185_T	0.589	0.09
58_E	64_Q	0.587	0.09
235_E	653_Q	0.586	0.09
164_F	649_F	0.585	0.09
264_K	272_F	0.585	0.09
484_Y	522_S	0.584	0.09
49_F	449_L	0.584	0.09
80_W	391_T	0.584	0.09
516_D	616_N	0.582	0.09
127_I	150_K	0.582	0.09
340_I	344_K	0.581	0.09
352_Y	549_S	0.581	0.09
152_V	628_A	0.581	0.09
490_S	498_Q	0.580	0.09
70_R	610_A	0.579	0.09
254_E	463_L	0.579	0.09
145_D	643_G	0.579	0.09
156_D	383_S	0.579	0.09
57_V	583_A	0.579	0.09
100_G	643_G	0.579	0.09
97_A	155_G	0.579	0.09
317_M	649_F	0.579	0.09
394_G	540_F	0.579	0.09
48_G	108_A	0.578	0.09
570_M	645_Y	0.577	0.09
457_A	525_V	0.576	0.09
465_H	607_E	0.575	0.09
85_G	544_V	0.575	0.09
612_N	620_Q	0.575	0.09
146_T	639_V	0.574	0.09
459_F	464_F	0.574	0.09
261_E	394_G	0.574	0.09
128_L	315_R	0.574	0.09
257_G	566_W	0.573	0.09
130_A	635_Q	0.572	0.09
212_D	523_A	0.571	0.09
77_Q	569_I	0.571	0.09
117_Y	275_E	0.570	0.09
259_A	383_S	0.570	0.09
227_R	265_K	0.570	0.09
122_T	554_A	0.569	0.09
170_V	593_Q	0.568	0.09
79_A	440_D	0.567	0.09
518_T	664_S	0.566	0.09
86_Y	139_P	0.566	0.09
113_F	131_F	0.565	0.09
249_V	646_P	0.565	0.09
131_F	181_L	0.565	0.09
205_V	316_I	0.564	0.09
372_N	572_M	0.563	0.09
327_E	540_F	0.562	0.09
187_N	298_L	0.560	0.09
466_D	576_E	0.559	0.09
540_F	613_W	0.559	0.09
208_A	347_Q	0.559	0.09
578_V	583_A	0.559	0.09
79_A	347_Q	0.558	0.09
349_S	648_N	0.557	0.09
465_H	568_A	0.557	0.09
313_P	356_F	0.555	0.09
323_Y	388_Q	0.555	0.09
166_T	224_E	0.555	0.09
65_R	141_G	0.554	0.09
241_V	346_M	0.554	0.09
156_D	161_R	0.554	0.09
219_A	442_V	0.550	0.09
144_V	343_V	0.548	0.09
58_E	77_Q	0.547	0.09
400_W	575_L	0.546	0.09
400_W	538_N	0.545	0.09
70_R	268_Y	0.544	0.09
318_H	613_W	0.544	0.09
352_Y	528_I	0.544	0.09
135_A	406_W	0.543	0.09
319_I	339_L	0.542	0.09
554_A	603_K	0.541	0.09
448_M	513_A	0.541	0.09
167_W	237_L	0.540	0.08
116_G	400_W	0.538	0.08
400_W	572_M	0.536	0.08
529_R	635_Q	0.535	0.08
134_P	464_F	0.535	0.08
386_A	610_A	0.534	0.08
193_Q	499_N	0.533	0.08
69_V	78_F	0.533	0.08
238_R	592_N	0.532	0.08
356_F	585_Q	0.532	0.08
157_E	218_T	0.532	0.08
231_V	367_E	0.532	0.08
53_S	179_V	0.532	0.08
94_I	110_V	0.532	0.08
256_N	425_A	0.531	0.08
249_V	638_G	0.531	0.08
606_L	643_G	0.530	0.08
320_D	357_A	0.529	0.08
89_V	101_G	0.529	0.08
137_W	169_Q	0.529	0.08
212_D	596_N	0.529	0.08
354_Q	540_F	0.528	0.08
379_A	454_A	0.527	0.08
190_Y	298_L	0.526	0.08
238_R	558_A	0.526	0.08
290_V	484_Y	0.526	0.08
203_V	449_L	0.526	0.08
504_K	650_L	0.526	0.08
107_K	471_S	0.526	0.08
139_P	255_A	0.525	0.08
292_I	338_V	0.525	0.08
475_D	480_A	0.524	0.08
244_N	398_Y	0.523	0.08
318_H	609_Q	0.523	0.08
219_A	378_K	0.523	0.08
201_L	557_Y	0.521	0.08
389_L	393_S	0.521	0.08
561_L	634_L	0.520	0.08
291_L	403_V	0.520	0.08
74_L	257_G	0.520	0.08
417_Y	440_D	0.519	0.08
323_Y	575_L	0.519	0.08
54_W	85_G	0.518	0.08
159_V	169_Q	0.517	0.08
409_D	419_P	0.517	0.08
201_L	210_F	0.516	0.08
406_W	514_L	0.516	0.08
109_V	655_E	0.515	0.08
279_A	506_W	0.514	0.08
260_I	306_I	0.514	0.08
197_T	207_R	0.514	0.08
177_R	663_F	0.514	0.08
166_T	292_I	0.513	0.08
296_P	305_I	0.513	0.08
605_I	608_L	0.513	0.08
193_Q	211_T	0.512	0.08
245_P	557_Y	0.512	0.08
163_Y	661_P	0.511	0.08
362_D	656_I	0.511	0.08
288_P	532_H	0.510	0.08
385_V	625_Q	0.510	0.08
375_L	606_L	0.510	0.08
59_D	547_P	0.508	0.08
292_I	603_K	0.508	0.08
158_L	544_V	0.508	0.08
318_H	576_E	0.508	0.08
49_F	422_E	0.507	0.08
441_R	655_E	0.507	0.08
117_Y	121_Y	0.507	0.08
52_I	64_Q	0.505	0.08
482_T	491_G	0.505	0.08
166_T	482_T	0.504	0.08
292_I	583_A	0.504	0.08
471_S	513_A	0.504	0.08
155_G	221_E	0.504	0.08
169_Q	384_R	0.504	0.08
337_D	496_I	0.503	0.08
54_W	243_V	0.503	0.08
60_E	652_N	0.502	0.08
123_R	630_W	0.501	0.08
608_L	627_L	0.501	0.08
145_D	529_R	0.500	0.08
223_R	524_R	0.500	0.08
237_L	604_S	0.500	0.08
248_F	659_I	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4f9dA	1	0.881	100	0.58	Contact Map
4p7oA	1	0.5149	100	0.753	Contact Map
3vusA	1	0.3914	100	0.796	Contact Map
5bu6A	2	0.3824	100	0.798	Contact Map
4u10A	1	0.3824	100	0.806	Contact Map
4wcjA	1	0.3467	100	0.843	Contact Map
4v33A	1	0.378	100	0.854	Contact Map
4l1gA	1	0.314	100	0.867	Contact Map
2w3zA	1	0.3348	100	0.904	Contact Map
2c1iA	1	0.3929	100	0.911	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0163 seconds.