RLMKL - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

RLMKL - Ribosomal RNA large subunit methyltransferase K/L

UniProt:	P75864	Sequences: MNSLFASTARGLEELLKTELENLGAVECQVVQGGVHFKGDTRLVYQSLMWSRLASRIMLPLGECKVYSDLDLYLGVQAINWTEMFNPGATFAVHFSGLNDTIRNSQYGAMKVKDAIVDAFTRKNLPRPNVDRDAPDIRVNVWLHKETASIALDLSGDGLHLRGYRDRAGIAPIKETLAAAIVMRSGWQPGTPLLDPMCGSGTLLIEAAMLATDRAPGLHRGRWGFSGWAQHDEAIWQEVKAEAQTRARKGLAEYSSHFYGSDSDARVIQRARTNARLAGIGELITFEVKDVAQLTNPLPKGPYGTVLSNPPYGERLDSEPALIALHSLLGRIMKNQFGGWNLSLFSASPDLLSCLQLRADKQYKAKNGPLDCVQKNYHVAESTPDSKPAMVAEDYTNRLRKNLKKFEKWARQEGIECYRLYDADLPEYNVAVDRYADWVVVQEYAPPKTIDAHKARQRLFDIIAATISVLGIAPNKLVLKTRERQKGKNQYQKLGEKGEFLEVTEYNAHLWVNLTDYLDTGLFLDHRIARRMLGQMSKGKDFLNLFSYTGSATVHAGLGGARSTTTVDMSRTYLEWAERNLRLNGLTGRAHRLIQADCLAWLREANEQFDLIFIDPPTFSNSKRMEDAFDVQRDHLALMKDLKRLLRAGGTIMFSNNKRGFRMDLDGLAKLGLKAQEITQKTLSQDFARNRQIHNCWLITAA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13717
Length:	702 (694)
Sequences:	489 (308)
Seq/√Len:	11.7

ECOLI - RLMKL

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
213_D	246_R	6.749	1.00
595_Q	624_R	6.363	1.00
430_V	462_I	6.351	1.00
275_A	286_F	5.684	1.00
547_S	566_T	5.548	1.00
6_A	37_F	5.039	1.00
508_A	558_L	4.771	1.00
6_A	57_I	4.607	1.00
275_A	280_I	4.224	1.00
541_D	647_R	4.121	0.99
82_T	119_A	4.079	0.99
5_F	34_G	3.980	0.99
181_I	307_L	3.922	0.99
141_V	148_A	3.723	0.99
529_A	653_M	3.700	0.99
46_Q	242_E	3.547	0.98
542_F	564_T	3.543	0.98
550_G	566_T	3.293	0.97
503_V	522_L	3.290	0.97
246_R	250_G	3.222	0.97
439_V	470_L	3.175	0.97
559_G	611_L	3.168	0.97
137_I	152_L	3.154	0.96
213_D	250_G	3.130	0.96
333_M	342_L	3.104	0.96
507_N	534_G	3.071	0.96
439_V	466_T	3.062	0.96
85_F	137_I	3.051	0.96
95_F	108_G	3.048	0.96
537_S	611_L	2.971	0.95
58_M	151_A	2.963	0.95
678_I	682_T	2.963	0.95
204_L	260_G	2.953	0.95
20_L	25_A	2.917	0.94
550_G	577_A	2.912	0.94
116_I	139_V	2.884	0.94
47_S	57_I	2.860	0.94
9_A	176_T	2.860	0.94
565_T	609_F	2.855	0.94
64_C	75_G	2.817	0.93
228_W	231_H	2.808	0.93
636_L	667_G	2.793	0.93
102_I	108_G	2.756	0.93
42_R	238_E	2.733	0.92
536_M	653_M	2.730	0.92
532_M	536_M	2.716	0.92
564_T	591_H	2.715	0.92
25_A	43_L	2.712	0.92
45_Y	231_H	2.705	0.92
280_I	286_F	2.658	0.91
676_Q	698_L	2.603	0.90
20_L	47_S	2.568	0.90
185_S	343_S	2.517	0.89
352_L	375_K	2.513	0.88
618_T	658_K	2.466	0.87
155_S	224_G	2.433	0.87
80_N	83_E	2.431	0.87
84_M	228_W	2.403	0.86
40_D	43_L	2.371	0.85
501_L	514_L	2.346	0.85
508_A	555_H	2.333	0.84
553_T	581_L	2.305	0.84
511_W	579_R	2.287	0.83
663_M	695_N	2.273	0.83
677_E	695_N	2.247	0.82
643_K	673_L	2.243	0.82
73_Y	115_A	2.235	0.82
112_V	141_V	2.217	0.81
639_M	699_I	2.217	0.81
506_Y	531_R	2.210	0.81
41_T	231_H	2.195	0.80
204_L	286_F	2.194	0.80
49_M	239_V	2.137	0.78
635_H	664_D	2.107	0.77
366_K	371_D	2.103	0.77
459_L	479_L	2.057	0.76
395_Y	430_V	2.056	0.76
529_A	684_S	2.047	0.75
466_T	477_L	2.021	0.74
94_H	138_R	2.002	0.74
605_A	645_L	2.001	0.74
42_R	46_Q	1.981	0.73
194_L	594_I	1.961	0.72
547_S	550_G	1.957	0.72
95_F	141_V	1.940	0.71
541_D	563_S	1.917	0.70
569_M	625_M	1.907	0.70
33_G	369_P	1.902	0.70
534_G	559_G	1.884	0.69
155_S	225_F	1.884	0.69
55_S	158_G	1.865	0.68
343_S	376_N	1.860	0.68
486_K	566_T	1.853	0.67
558_L	586_L	1.843	0.67
6_A	20_L	1.841	0.67
608_Q	647_R	1.831	0.67
510_L	555_H	1.817	0.66
564_T	581_L	1.815	0.66
85_F	120_F	1.809	0.66
76_V	150_I	1.785	0.64
76_V	112_V	1.768	0.64
534_G	555_H	1.763	0.63
70_L	111_K	1.763	0.63
407_E	410_A	1.751	0.63
157_D	161_L	1.729	0.62
181_I	345_F	1.729	0.62
532_M	653_M	1.719	0.61
500_F	579_R	1.719	0.61
508_A	534_G	1.702	0.61
571_R	595_Q	1.683	0.60
68_S	71_D	1.676	0.59
581_L	586_L	1.672	0.59
652_I	699_I	1.661	0.59
614_I	652_I	1.661	0.59
667_G	673_L	1.654	0.58
410_A	685_Q	1.650	0.58
169_G	267_V	1.647	0.58
438_W	478_V	1.644	0.58
115_A	430_V	1.640	0.58
37_F	57_I	1.631	0.57
64_C	148_A	1.627	0.57
542_F	591_H	1.623	0.57
72_L	148_A	1.615	0.56
345_F	349_P	1.612	0.56
80_N	119_A	1.605	0.56
141_V	150_I	1.593	0.55
674_K	700_T	1.591	0.55
258_F	286_F	1.591	0.55
550_G	593_L	1.588	0.55
507_N	558_L	1.571	0.54
508_A	586_L	1.565	0.54
513_N	516_D	1.563	0.54
550_G	581_L	1.563	0.54
536_M	698_L	1.559	0.54
10_R	33_G	1.548	0.53
502_E	511_W	1.543	0.53
6_A	47_S	1.535	0.53
653_M	698_L	1.514	0.51
94_H	140_N	1.508	0.51
659_R	690_N	1.499	0.51
345_F	348_S	1.490	0.50
425_L	566_T	1.477	0.50
553_T	564_T	1.477	0.50
547_S	684_S	1.476	0.50
10_R	366_K	1.475	0.50
8_T	673_L	1.467	0.49
581_L	593_L	1.458	0.49
137_I	228_W	1.458	0.49
91_F	110_M	1.449	0.48
268_I	288_V	1.430	0.47
553_T	591_H	1.427	0.47
507_N	531_R	1.426	0.47
4_L	44_V	1.421	0.47
529_A	629_F	1.420	0.47
280_I	590_A	1.413	0.46
403_L	410_A	1.409	0.46
304_G	340_W	1.404	0.46
95_F	143_L	1.404	0.46
267_V	270_R	1.396	0.46
116_I	472_I	1.396	0.46
658_K	695_N	1.386	0.45
89_A	229_A	1.377	0.45
247_A	370_L	1.376	0.45
651_T	698_L	1.366	0.44
60_P	151_A	1.363	0.44
134_A	222_R	1.359	0.44
566_T	577_A	1.356	0.44
416_E	436_A	1.352	0.43
533_L	559_G	1.339	0.43
566_T	684_S	1.337	0.43
500_F	511_W	1.331	0.42
104_N	110_M	1.330	0.42
108_G	141_V	1.327	0.42
605_A	609_F	1.323	0.42
99_N	103_R	1.319	0.42
394_D	425_L	1.316	0.42
651_T	700_T	1.315	0.42
425_L	547_S	1.301	0.41
639_M	643_K	1.293	0.41
676_Q	681_K	1.287	0.40
390_M	393_E	1.287	0.40
529_A	566_T	1.285	0.40
394_D	429_N	1.283	0.40
618_T	621_N	1.283	0.40
640_K	670_K	1.280	0.40
91_F	137_I	1.275	0.40
441_V	466_T	1.272	0.40
106_Q	110_M	1.264	0.39
137_I	389_A	1.261	0.39
129_N	558_L	1.251	0.39
77_Q	122_R	1.248	0.39
679_T	691_R	1.243	0.38
690_N	693_I	1.241	0.38
614_I	639_M	1.233	0.38
355_L	385_D	1.233	0.38
614_I	642_L	1.225	0.37
168_A	267_V	1.224	0.37
677_E	697_W	1.221	0.37
625_M	645_L	1.221	0.37
322_L	514_L	1.220	0.37
307_L	450_I	1.219	0.37
685_Q	688_A	1.196	0.36
4_L	37_F	1.192	0.36
268_I	286_F	1.187	0.36
280_I	631_V	1.185	0.36
158_G	174_K	1.177	0.35
8_T	697_W	1.175	0.35
614_I	629_F	1.171	0.35
434_R	439_V	1.171	0.35
15_L	180_A	1.169	0.35
285_T	289_K	1.167	0.35
563_S	647_R	1.166	0.35
667_G	670_K	1.165	0.35
68_S	439_V	1.165	0.35
529_A	536_M	1.164	0.35
420_L	470_L	1.163	0.35
365_A	374_Q	1.160	0.34
312_Y	367_N	1.157	0.34
504_T	509_H	1.155	0.34
47_S	586_L	1.154	0.34
184_R	361_K	1.153	0.34
399_L	425_L	1.150	0.34
536_M	651_T	1.148	0.34
50_W	215_A	1.147	0.34
346_S	375_K	1.146	0.34
20_L	37_F	1.145	0.34
6_A	25_A	1.140	0.34
213_D	242_E	1.138	0.33
345_F	375_K	1.136	0.33
533_L	653_M	1.129	0.33
67_Y	71_D	1.117	0.33
459_L	467_I	1.116	0.33
629_F	697_W	1.114	0.32
510_L	553_T	1.113	0.32
610_D	647_R	1.112	0.32
260_G	271_A	1.110	0.32
285_T	288_V	1.108	0.32
37_F	47_S	1.106	0.32
504_T	534_G	1.106	0.32
643_K	667_G	1.100	0.32
115_A	148_A	1.098	0.32
478_V	515_T	1.098	0.32
492_Q	569_M	1.097	0.32
41_T	84_M	1.094	0.32
571_R	624_R	1.092	0.31
542_F	611_L	1.090	0.31
510_L	532_M	1.088	0.31
211_A	250_G	1.087	0.31
532_M	682_T	1.079	0.31
679_T	683_L	1.075	0.31
502_E	583_L	1.073	0.31
407_E	446_P	1.072	0.31
504_T	507_N	1.072	0.31
358_R	375_K	1.068	0.30
210_L	582_R	1.066	0.30
9_A	429_N	1.066	0.30
653_M	682_T	1.065	0.30
394_D	427_E	1.064	0.30
592_R	679_T	1.061	0.30
182_V	185_S	1.061	0.30
653_M	678_I	1.061	0.30
363_Y	514_L	1.060	0.30
442_Q	613_F	1.056	0.30
432_V	609_F	1.055	0.30
409_W	685_Q	1.055	0.30
395_Y	462_I	1.053	0.30
442_Q	598_C	1.052	0.30
397_N	402_N	1.052	0.30
425_L	469_V	1.052	0.30
308_S	344_L	1.049	0.30
510_L	547_S	1.045	0.30
50_W	213_D	1.045	0.30
106_Q	373_V	1.045	0.30
63_E	147_T	1.043	0.29
79_I	112_V	1.042	0.29
377_Y	437_D	1.039	0.29
75_G	148_A	1.038	0.29
15_L	53_L	1.036	0.29
640_K	673_L	1.035	0.29
573_Y	616_P	1.035	0.29
77_Q	119_A	1.029	0.29
79_I	150_I	1.026	0.29
261_S	289_K	1.025	0.29
410_A	434_R	1.024	0.29
8_T	13_E	1.019	0.28
275_A	697_W	1.019	0.28
55_S	618_T	1.017	0.28
142_W	149_S	1.013	0.28
508_A	554_V	1.011	0.28
79_I	450_I	1.007	0.28
184_R	363_Y	1.005	0.28
291_V	329_L	1.005	0.28
389_A	394_D	1.003	0.28
8_T	363_Y	1.003	0.28
532_M	678_I	1.001	0.28
91_F	117_V	0.996	0.28
434_R	470_L	0.991	0.27
571_R	609_F	0.990	0.27
533_L	631_V	0.986	0.27
69_D	107_Y	0.986	0.27
261_S	294_L	0.984	0.27
107_Y	209_M	0.980	0.27
28_C	116_I	0.979	0.27
326_H	566_T	0.978	0.27
577_A	642_L	0.978	0.27
169_G	274_N	0.977	0.27
639_M	652_I	0.977	0.27
165_R	198_C	0.977	0.27
117_V	138_R	0.975	0.27
399_L	469_V	0.973	0.27
498_G	677_E	0.973	0.27
86_N	89_A	0.972	0.27
9_A	55_S	0.970	0.27
158_G	628_A	0.969	0.26
297_P	337_F	0.967	0.26
55_S	95_F	0.966	0.26
603_R	641_D	0.964	0.26
97_G	108_G	0.963	0.26
79_I	115_A	0.963	0.26
286_F	588_G	0.961	0.26
603_R	637_A	0.954	0.26
362_Q	683_L	0.951	0.26
177_L	196_P	0.950	0.26
363_Y	376_N	0.946	0.26
10_R	361_K	0.943	0.25
39_G	43_L	0.937	0.25
154_L	228_W	0.937	0.25
506_Y	534_G	0.936	0.25
200_S	262_D	0.936	0.25
44_V	399_L	0.936	0.25
291_V	675_A	0.936	0.25
533_L	611_L	0.934	0.25
462_I	479_L	0.934	0.25
50_W	243_A	0.934	0.25
138_R	351_L	0.934	0.25
542_F	552_A	0.934	0.25
91_F	139_V	0.933	0.25
55_S	394_D	0.929	0.25
656_N	695_N	0.927	0.25
450_I	455_A	0.926	0.25
204_L	284_I	0.926	0.25
96_S	142_W	0.921	0.25
392_A	465_A	0.919	0.25
61_L	152_L	0.919	0.25
528_I	547_S	0.916	0.24
528_I	684_S	0.916	0.24
423_A	622_S	0.914	0.24
507_N	551_S	0.912	0.24
622_S	625_M	0.911	0.24
352_L	377_Y	0.910	0.24
658_K	692_Q	0.908	0.24
63_E	400_R	0.907	0.24
628_A	633_R	0.907	0.24
467_I	470_L	0.907	0.24
629_F	658_K	0.906	0.24
8_T	643_K	0.905	0.24
42_R	235_I	0.902	0.24
369_P	406_F	0.900	0.24
76_V	89_A	0.899	0.24
247_A	628_A	0.898	0.24
53_L	183_M	0.896	0.24
175_E	311_P	0.895	0.24
223_W	308_S	0.894	0.24
278_A	372_C	0.892	0.24
77_Q	80_N	0.889	0.24
396_T	469_V	0.888	0.23
494_L	609_F	0.886	0.23
286_F	308_S	0.885	0.23
115_A	141_V	0.883	0.23
64_C	542_F	0.883	0.23
437_D	471_G	0.881	0.23
437_D	450_I	0.880	0.23
439_V	472_I	0.880	0.23
571_R	678_I	0.878	0.23
41_T	228_W	0.875	0.23
174_K	312_Y	0.874	0.23
526_H	655_S	0.874	0.23
508_A	581_L	0.873	0.23
232_D	235_I	0.871	0.23
154_L	197_M	0.868	0.23
127_R	135_P	0.867	0.23
555_H	642_L	0.866	0.23
70_L	74_L	0.866	0.23
258_F	506_Y	0.866	0.23
502_E	509_H	0.862	0.23
223_W	652_I	0.862	0.23
160_H	310_P	0.861	0.23
13_E	618_T	0.861	0.23
172_P	309_N	0.859	0.22
97_G	103_R	0.859	0.22
446_P	455_A	0.858	0.22
55_S	629_F	0.857	0.22
93_V	450_I	0.857	0.22
542_F	682_T	0.856	0.22
177_L	618_T	0.856	0.22
93_V	562_R	0.856	0.22
355_L	377_Y	0.856	0.22
93_V	112_V	0.856	0.22
564_T	588_G	0.855	0.22
542_F	581_L	0.854	0.22
97_G	105_S	0.853	0.22
59_L	230_Q	0.852	0.22
33_G	223_W	0.851	0.22
668_L	699_I	0.851	0.22
322_L	346_S	0.850	0.22
280_I	283_L	0.849	0.22
529_A	696_C	0.849	0.22
376_N	425_L	0.848	0.22
164_Y	485_Q	0.846	0.22
471_G	476_K	0.844	0.22
565_T	594_I	0.843	0.22
157_D	224_G	0.842	0.22
555_H	696_C	0.841	0.22
57_I	155_S	0.840	0.22
441_V	467_I	0.839	0.22
261_S	291_V	0.838	0.22
64_C	697_W	0.836	0.22
428_Y	461_D	0.833	0.22
185_S	429_N	0.831	0.22
289_K	699_I	0.830	0.21
31_V	140_N	0.830	0.21
305_T	629_F	0.830	0.21
4_L	623_K	0.829	0.21
116_I	281_G	0.829	0.21
184_R	427_E	0.827	0.21
103_R	609_F	0.825	0.21
276_R	486_K	0.825	0.21
76_V	454_K	0.824	0.21
165_R	195_D	0.824	0.21
229_A	594_I	0.823	0.21
366_K	369_P	0.822	0.21
485_Q	492_Q	0.821	0.21
242_E	246_R	0.819	0.21
284_I	377_Y	0.818	0.21
536_M	611_L	0.818	0.21
139_V	152_L	0.816	0.21
517_Y	573_Y	0.815	0.21
185_S	448_K	0.815	0.21
677_E	684_S	0.814	0.21
263_S	291_V	0.813	0.21
239_V	675_A	0.812	0.21
4_L	154_L	0.812	0.21
175_E	367_N	0.811	0.21
39_G	484_R	0.811	0.21
265_A	268_I	0.809	0.21
30_V	553_T	0.809	0.21
73_Y	118_D	0.808	0.21
175_E	202_T	0.808	0.21
310_P	315_R	0.807	0.21
10_R	363_Y	0.807	0.21
485_Q	490_Q	0.807	0.21
394_D	461_D	0.807	0.21
66_V	150_I	0.806	0.21
314_E	317_D	0.805	0.21
6_A	566_T	0.802	0.21
261_S	268_I	0.802	0.21
459_L	466_T	0.801	0.21
485_Q	516_D	0.801	0.21
130_V	342_L	0.801	0.21
510_L	652_I	0.799	0.20
86_N	234_A	0.799	0.20
149_S	676_Q	0.798	0.20
8_T	372_C	0.798	0.20
33_G	660_G	0.796	0.20
395_Y	683_L	0.795	0.20
347_A	420_L	0.793	0.20
511_W	586_L	0.786	0.20
566_T	696_C	0.786	0.20
370_L	498_G	0.784	0.20
438_W	476_K	0.784	0.20
14_E	33_G	0.782	0.20
510_L	554_V	0.781	0.20
542_F	678_I	0.781	0.20
173_I	472_I	0.781	0.20
510_L	551_S	0.780	0.20
112_V	148_A	0.779	0.20
92_A	135_P	0.779	0.20
85_F	89_A	0.778	0.20
290_D	355_L	0.778	0.20
58_M	140_N	0.777	0.20
451_D	454_K	0.777	0.20
141_V	579_R	0.773	0.20
667_G	675_A	0.773	0.20
130_V	137_I	0.772	0.20
25_A	37_F	0.770	0.20
264_D	553_T	0.770	0.20
7_S	153_D	0.769	0.20
520_T	573_Y	0.768	0.19
553_T	641_D	0.768	0.19
214_R	247_A	0.766	0.19
683_L	691_R	0.766	0.19
683_L	695_N	0.765	0.19
411_R	418_Y	0.764	0.19
116_I	255_S	0.762	0.19
120_F	528_I	0.762	0.19
8_T	142_W	0.760	0.19
72_L	81_W	0.760	0.19
6_A	547_S	0.760	0.19
262_D	337_F	0.759	0.19
612_I	646_L	0.758	0.19
9_A	104_N	0.757	0.19
566_T	629_F	0.757	0.19
590_A	677_E	0.755	0.19
203_L	275_A	0.755	0.19
4_L	40_D	0.754	0.19
529_A	547_S	0.752	0.19
182_V	305_T	0.752	0.19
53_L	182_V	0.752	0.19
104_N	430_V	0.750	0.19
444_Y	630_D	0.750	0.19
83_E	446_P	0.750	0.19
485_Q	488_K	0.750	0.19
286_F	359_A	0.750	0.19
261_S	287_E	0.750	0.19
164_Y	490_Q	0.744	0.19
158_G	164_Y	0.744	0.19
425_L	684_S	0.743	0.19
174_K	309_N	0.743	0.19
85_F	91_F	0.742	0.19
261_S	345_F	0.742	0.19
586_L	591_H	0.742	0.19
338_G	384_P	0.741	0.19
154_L	470_L	0.740	0.19
388_P	394_D	0.739	0.19
164_Y	313_G	0.738	0.19
364_K	373_V	0.738	0.19
20_L	137_I	0.738	0.19
152_L	459_L	0.736	0.18
332_I	336_Q	0.736	0.18
91_F	120_F	0.735	0.18
441_V	463_I	0.734	0.18
194_L	486_K	0.734	0.18
331_R	691_R	0.733	0.18
213_D	247_A	0.733	0.18
118_D	127_R	0.732	0.18
581_L	591_H	0.732	0.18
17_K	28_C	0.732	0.18
597_D	600_A	0.730	0.18
163_G	187_W	0.730	0.18
142_W	339_G	0.729	0.18
643_K	675_A	0.729	0.18
692_Q	695_N	0.728	0.18
5_F	57_I	0.727	0.18
84_M	231_H	0.727	0.18
569_M	695_N	0.726	0.18
174_K	340_W	0.725	0.18
76_V	140_N	0.724	0.18
202_T	367_N	0.723	0.18
119_A	535_Q	0.723	0.18
342_L	609_F	0.722	0.18
321_A	432_V	0.721	0.18
265_A	280_I	0.721	0.18
354_C	618_T	0.721	0.18
174_K	197_M	0.721	0.18
18_T	21_E	0.719	0.18
4_L	405_K	0.719	0.18
237_Q	450_I	0.719	0.18
60_P	111_K	0.717	0.18
517_Y	616_P	0.717	0.18
143_L	271_A	0.717	0.18
310_P	313_G	0.717	0.18
108_G	143_L	0.716	0.18
572_T	616_P	0.716	0.18
50_W	236_W	0.715	0.18
41_T	44_V	0.714	0.18
105_S	169_G	0.714	0.18
73_Y	111_K	0.713	0.18
395_Y	631_V	0.712	0.18
663_M	690_N	0.712	0.18
405_K	656_N	0.711	0.18
222_R	256_S	0.711	0.18
190_G	306_V	0.708	0.18
356_Q	564_T	0.708	0.18
160_H	209_M	0.708	0.18
564_T	593_L	0.708	0.18
97_G	104_N	0.708	0.18
199_G	313_G	0.707	0.18
261_S	285_T	0.707	0.18
493_K	542_F	0.706	0.18
169_G	376_N	0.706	0.18
108_G	480_K	0.706	0.18
335_N	432_V	0.705	0.18
595_Q	690_N	0.705	0.18
297_P	510_L	0.704	0.18
463_I	579_R	0.704	0.18
149_S	415_I	0.703	0.18
195_D	198_C	0.703	0.18
188_Q	305_T	0.703	0.18
41_T	235_I	0.703	0.18
209_M	224_G	0.701	0.17
585_G	677_E	0.700	0.17
99_N	146_E	0.699	0.17
446_P	643_K	0.699	0.17
105_S	209_M	0.698	0.17
130_V	306_V	0.697	0.17
247_A	362_Q	0.697	0.17
93_V	629_F	0.697	0.17
254_Y	258_F	0.697	0.17
161_L	372_C	0.696	0.17
457_Q	472_I	0.695	0.17
48_L	225_F	0.695	0.17
344_L	355_L	0.695	0.17
42_R	86_N	0.695	0.17
445_A	574_L	0.694	0.17
246_R	249_K	0.693	0.17
14_E	30_V	0.692	0.17
145_K	656_N	0.692	0.17
241_A	420_L	0.691	0.17
639_M	667_G	0.691	0.17
439_V	684_S	0.690	0.17
330_G	397_N	0.690	0.17
199_G	310_P	0.690	0.17
541_D	652_I	0.690	0.17
318_S	326_H	0.689	0.17
348_S	467_I	0.689	0.17
636_L	665_L	0.689	0.17
141_V	430_V	0.688	0.17
472_I	645_L	0.688	0.17
51_S	239_V	0.688	0.17
352_L	440_V	0.688	0.17
618_T	695_N	0.687	0.17
522_L	551_S	0.687	0.17
450_I	664_D	0.686	0.17
537_S	653_M	0.684	0.17
362_Q	461_D	0.684	0.17
625_M	628_A	0.683	0.17
4_L	319_E	0.683	0.17
551_S	577_A	0.683	0.17
23_L	564_T	0.682	0.17
17_K	537_S	0.682	0.17
309_N	315_R	0.682	0.17
542_F	553_T	0.682	0.17
223_W	226_S	0.682	0.17
517_Y	572_T	0.681	0.17
399_L	420_L	0.681	0.17
268_I	602_L	0.681	0.17
37_F	418_Y	0.680	0.17
636_L	670_K	0.679	0.17
31_V	34_G	0.678	0.17
507_N	668_L	0.678	0.17
258_F	618_T	0.678	0.17
204_L	275_A	0.676	0.17
175_E	315_R	0.675	0.17
117_V	452_A	0.674	0.17
486_K	628_A	0.674	0.17
175_E	310_P	0.672	0.17
35_V	210_L	0.671	0.17
310_P	367_N	0.671	0.17
196_P	427_E	0.671	0.17
625_M	629_F	0.671	0.17
569_M	577_A	0.670	0.17
520_T	616_P	0.669	0.17
257_H	285_T	0.669	0.17
415_I	693_I	0.668	0.17
182_V	691_R	0.668	0.17
94_H	104_N	0.668	0.17
534_G	642_L	0.667	0.17
87_P	582_R	0.667	0.17
177_L	311_P	0.667	0.17
506_Y	528_I	0.667	0.17
198_C	311_P	0.665	0.16
7_S	553_T	0.665	0.16
69_D	104_N	0.665	0.16
425_L	432_V	0.665	0.16
537_S	559_G	0.664	0.16
16_L	53_L	0.663	0.16
140_N	342_L	0.663	0.16
180_A	512_V	0.661	0.16
528_I	652_I	0.660	0.16
334_K	459_L	0.659	0.16
187_W	193_L	0.658	0.16
260_G	539_G	0.658	0.16
311_P	315_R	0.658	0.16
413_E	595_Q	0.658	0.16
308_S	342_L	0.658	0.16
677_E	682_T	0.657	0.16
432_V	471_G	0.657	0.16
180_A	553_T	0.656	0.16
292_A	432_V	0.656	0.16
180_A	205_I	0.654	0.16
70_L	107_Y	0.654	0.16
82_T	481_T	0.654	0.16
182_V	307_L	0.654	0.16
536_M	625_M	0.653	0.16
528_I	642_L	0.653	0.16
78_A	329_L	0.652	0.16
50_W	246_R	0.651	0.16
181_I	371_D	0.651	0.16
92_A	267_V	0.650	0.16
322_L	446_P	0.650	0.16
602_L	687_F	0.650	0.16
57_I	349_P	0.649	0.16
39_G	67_Y	0.648	0.16
410_A	425_L	0.647	0.16
105_S	481_T	0.647	0.16
296_N	336_Q	0.647	0.16
348_S	373_V	0.646	0.16
209_M	403_L	0.645	0.16
439_V	569_M	0.645	0.16
533_L	536_M	0.645	0.16
160_H	175_E	0.645	0.16
39_G	609_F	0.645	0.16
174_K	348_S	0.644	0.16
203_L	306_V	0.643	0.16
181_I	365_A	0.643	0.16
483_E	489_N	0.642	0.16
68_S	209_M	0.642	0.16
5_F	142_W	0.640	0.16
12_L	370_L	0.640	0.16
663_M	677_E	0.640	0.16
142_W	417_C	0.640	0.16
311_P	367_N	0.639	0.16
57_I	239_V	0.638	0.16
105_S	673_L	0.637	0.16
242_E	250_G	0.637	0.16
659_R	693_I	0.637	0.16
76_V	93_V	0.637	0.16
629_F	639_M	0.637	0.16
63_E	332_I	0.636	0.16
537_S	691_R	0.636	0.16
25_A	450_I	0.635	0.16
400_R	466_T	0.633	0.16
440_V	480_K	0.633	0.16
140_N	151_A	0.630	0.16
215_A	236_W	0.630	0.16
412_Q	683_L	0.630	0.16
271_A	340_W	0.629	0.16
613_F	690_N	0.628	0.15
55_S	353_S	0.628	0.15
557_G	679_T	0.628	0.15
197_M	697_W	0.628	0.15
566_T	642_L	0.626	0.15
345_F	451_D	0.626	0.15
579_R	593_L	0.626	0.15
503_V	602_L	0.626	0.15
42_R	129_N	0.626	0.15
441_V	627_D	0.625	0.15
85_F	139_V	0.625	0.15
100_D	149_S	0.625	0.15
143_L	204_L	0.625	0.15
104_N	143_L	0.624	0.15
643_K	684_S	0.624	0.15
231_H	467_I	0.623	0.15
84_M	229_A	0.622	0.15
93_V	99_N	0.622	0.15
534_G	611_L	0.621	0.15
564_T	586_L	0.621	0.15
114_D	128_P	0.619	0.15
460_F	483_E	0.618	0.15
388_P	465_A	0.618	0.15
175_E	312_Y	0.618	0.15
618_T	629_F	0.618	0.15
14_E	104_N	0.617	0.15
92_A	241_A	0.617	0.15
432_V	631_V	0.616	0.15
161_L	416_E	0.616	0.15
129_N	461_D	0.615	0.15
210_L	592_R	0.614	0.15
536_M	678_I	0.614	0.15
484_R	670_K	0.614	0.15
68_S	609_F	0.614	0.15
510_L	581_L	0.613	0.15
397_N	485_Q	0.613	0.15
258_F	539_G	0.613	0.15
209_M	448_K	0.612	0.15
370_L	514_L	0.612	0.15
413_E	579_R	0.611	0.15
437_D	514_L	0.611	0.15
438_W	688_A	0.609	0.15
352_L	356_Q	0.609	0.15
58_M	280_I	0.609	0.15
177_L	522_L	0.609	0.15
641_D	645_L	0.609	0.15
108_G	478_V	0.608	0.15
406_F	699_I	0.608	0.15
192_P	675_A	0.607	0.15
117_V	417_C	0.607	0.15
102_I	143_L	0.607	0.15
658_K	675_A	0.606	0.15
353_S	375_K	0.605	0.15
325_L	480_K	0.604	0.15
102_I	351_L	0.603	0.15
306_V	600_A	0.603	0.15
352_L	394_D	0.602	0.15
75_G	190_G	0.602	0.15
202_T	311_P	0.602	0.15
34_G	250_G	0.601	0.15
169_G	514_L	0.601	0.15
533_L	629_F	0.601	0.15
272_R	288_V	0.601	0.15
18_T	302_P	0.601	0.15
18_T	341_N	0.599	0.15
39_G	669_A	0.599	0.15
31_V	598_C	0.599	0.15
463_I	466_T	0.598	0.15
9_A	108_G	0.596	0.15
175_E	313_G	0.595	0.15
208_A	258_F	0.594	0.15
437_D	476_K	0.594	0.15
532_M	571_R	0.594	0.15
555_H	611_L	0.593	0.15
264_D	550_G	0.593	0.15
410_A	493_K	0.591	0.15
74_L	141_V	0.589	0.14
104_N	256_S	0.589	0.14
185_S	305_T	0.589	0.14
467_I	477_L	0.588	0.14
40_D	335_N	0.588	0.14
636_L	668_L	0.588	0.14
190_G	542_F	0.587	0.14
105_S	207_A	0.587	0.14
5_F	20_L	0.587	0.14
474_P	534_G	0.587	0.14
150_I	300_K	0.586	0.14
533_L	542_F	0.586	0.14
62_G	341_N	0.586	0.14
352_L	658_K	0.585	0.14
333_M	624_R	0.585	0.14
130_V	499_E	0.584	0.14
151_A	428_Y	0.583	0.14
165_R	340_W	0.582	0.14
631_V	656_N	0.581	0.14
478_V	501_L	0.581	0.14
151_A	183_M	0.581	0.14
32_Q	363_Y	0.579	0.14
109_A	154_L	0.578	0.14
151_A	450_I	0.578	0.14
48_L	365_A	0.578	0.14
517_Y	520_T	0.577	0.14
230_Q	603_R	0.577	0.14
566_T	673_L	0.577	0.14
66_V	152_L	0.577	0.14
202_T	522_L	0.577	0.14
578_E	677_E	0.577	0.14
57_I	371_D	0.577	0.14
264_D	294_L	0.576	0.14
5_F	9_A	0.576	0.14
39_G	140_N	0.576	0.14
528_I	531_R	0.575	0.14
130_V	492_Q	0.574	0.14
223_W	586_L	0.573	0.14
241_A	245_T	0.573	0.14
104_N	115_A	0.571	0.14
328_L	493_K	0.571	0.14
403_L	501_L	0.571	0.14
78_A	119_A	0.571	0.14
260_G	369_P	0.571	0.14
78_A	223_W	0.571	0.14
320_P	323_I	0.571	0.14
258_F	275_A	0.570	0.14
104_N	132_R	0.570	0.14
140_N	280_I	0.570	0.14
474_P	559_G	0.569	0.14
5_F	13_E	0.569	0.14
308_S	673_L	0.569	0.14
418_Y	467_I	0.569	0.14
520_T	572_T	0.568	0.14
562_R	578_E	0.568	0.14
9_A	232_D	0.568	0.14
33_G	392_A	0.567	0.14
202_T	310_P	0.567	0.14
643_K	668_L	0.566	0.14
65_K	147_T	0.565	0.14
208_A	271_A	0.564	0.14
581_L	585_G	0.563	0.14
40_D	466_T	0.563	0.14
102_I	314_E	0.563	0.14
186_G	438_W	0.563	0.14
87_P	107_Y	0.561	0.14
380_A	384_P	0.561	0.14
12_L	417_C	0.558	0.14
642_L	645_L	0.558	0.14
639_M	642_L	0.558	0.14
653_M	696_C	0.557	0.14
57_I	321_A	0.557	0.14
13_E	55_S	0.557	0.14
479_L	618_T	0.557	0.14
107_Y	231_H	0.557	0.14
395_Y	399_L	0.556	0.14
103_R	143_L	0.556	0.14
111_K	503_V	0.555	0.14
216_P	572_T	0.555	0.14
200_S	310_P	0.554	0.14
33_G	169_G	0.554	0.14
510_L	534_G	0.554	0.14
134_A	157_D	0.554	0.14
39_G	459_L	0.554	0.14
63_E	70_L	0.554	0.14
138_R	151_A	0.554	0.14
152_L	207_A	0.554	0.14
550_G	690_N	0.552	0.14
361_K	621_N	0.552	0.14
194_L	332_I	0.551	0.14
529_A	569_M	0.551	0.14
307_L	415_I	0.550	0.14
244_Q	504_T	0.550	0.14
472_I	550_G	0.550	0.14
111_K	498_G	0.550	0.14
353_S	377_Y	0.550	0.14
500_F	571_R	0.549	0.14
89_A	227_G	0.549	0.14
363_Y	374_Q	0.549	0.14
110_M	347_A	0.548	0.14
529_A	593_L	0.548	0.14
93_V	148_A	0.548	0.14
41_T	318_S	0.548	0.14
550_G	553_T	0.548	0.14
141_V	535_Q	0.548	0.14
322_L	409_W	0.547	0.13
205_I	474_P	0.545	0.13
16_L	19_E	0.545	0.13
450_I	613_F	0.545	0.13
452_A	697_W	0.544	0.13
326_H	344_L	0.543	0.13
596_A	649_G	0.543	0.13
57_I	651_T	0.543	0.13
175_E	309_N	0.542	0.13
199_G	315_R	0.541	0.13
8_T	376_N	0.541	0.13
122_R	477_L	0.540	0.13
360_D	378_H	0.539	0.13
107_Y	133_D	0.539	0.13
182_V	467_I	0.539	0.13
116_I	214_R	0.538	0.13
116_I	457_Q	0.538	0.13
403_L	470_L	0.538	0.13
346_S	351_L	0.538	0.13
199_G	202_T	0.537	0.13
405_K	425_L	0.537	0.13
97_G	100_D	0.536	0.13
281_G	446_P	0.536	0.13
18_T	539_G	0.535	0.13
85_F	429_N	0.535	0.13
192_P	307_L	0.534	0.13
645_L	673_L	0.534	0.13
86_N	152_L	0.533	0.13
129_N	508_A	0.533	0.13
98_L	104_N	0.532	0.13
52_R	56_R	0.532	0.13
111_K	323_I	0.532	0.13
99_N	143_L	0.532	0.13
532_M	651_T	0.532	0.13
146_E	332_I	0.531	0.13
200_S	309_N	0.531	0.13
265_A	446_P	0.531	0.13
163_G	202_T	0.530	0.13
15_L	363_Y	0.530	0.13
182_V	429_N	0.530	0.13
394_D	684_S	0.529	0.13
559_G	579_R	0.529	0.13
529_A	532_M	0.529	0.13
119_A	123_K	0.529	0.13
476_K	627_D	0.528	0.13
175_E	196_P	0.528	0.13
124_N	579_R	0.527	0.13
71_D	74_L	0.527	0.13
169_G	363_Y	0.526	0.13
404_K	492_Q	0.526	0.13
9_A	95_F	0.525	0.13
57_I	692_Q	0.525	0.13
10_R	184_R	0.525	0.13
146_E	441_V	0.524	0.13
102_I	480_K	0.524	0.13
12_L	569_M	0.524	0.13
132_R	692_Q	0.524	0.13
69_D	111_K	0.524	0.13
537_S	553_T	0.523	0.13
423_A	625_M	0.522	0.13
114_D	118_D	0.522	0.13
223_W	559_G	0.522	0.13
489_N	599_L	0.522	0.13
577_A	586_L	0.521	0.13
158_G	348_S	0.521	0.13
35_V	109_A	0.521	0.13
7_S	55_S	0.520	0.13
615_D	657_N	0.520	0.13
344_L	639_M	0.520	0.13
160_H	316_L	0.520	0.13
90_T	232_D	0.520	0.13
189_P	465_A	0.520	0.13
194_L	413_E	0.519	0.13
13_E	552_A	0.518	0.13
33_G	563_S	0.518	0.13
220_R	417_C	0.518	0.13
93_V	499_E	0.517	0.13
195_D	311_P	0.517	0.13
212_T	381_E	0.517	0.13
315_R	340_W	0.517	0.13
13_E	177_L	0.516	0.13
29_Q	68_S	0.516	0.13
64_C	181_I	0.516	0.13
431_A	520_T	0.516	0.13
129_N	496_E	0.515	0.13
33_G	110_M	0.514	0.13
86_N	486_K	0.514	0.13
127_R	136_D	0.514	0.13
495_G	498_G	0.514	0.13
125_L	457_Q	0.513	0.13
290_D	344_L	0.513	0.13
186_G	678_I	0.513	0.13
97_G	222_R	0.513	0.13
532_M	681_K	0.513	0.13
280_I	596_A	0.512	0.13
286_F	477_L	0.512	0.13
389_A	649_G	0.512	0.13
306_V	609_F	0.511	0.13
207_A	258_F	0.511	0.13
362_Q	439_V	0.511	0.13
236_W	243_A	0.510	0.13
184_R	428_Y	0.510	0.13
182_V	236_W	0.509	0.13
97_G	658_K	0.509	0.13
160_H	311_P	0.508	0.13
174_K	346_S	0.507	0.13
120_F	137_I	0.507	0.13
222_R	679_T	0.507	0.13
20_L	392_A	0.506	0.13
307_L	675_A	0.506	0.13
196_P	311_P	0.505	0.13
18_T	123_K	0.505	0.13
65_K	662_R	0.505	0.13
272_R	386_S	0.505	0.13
60_P	581_L	0.505	0.13
44_V	321_A	0.505	0.13
150_I	649_G	0.505	0.13
399_L	466_T	0.504	0.13
245_T	249_K	0.504	0.13
122_R	207_A	0.503	0.13
175_E	326_H	0.503	0.13
198_C	315_R	0.503	0.13
550_G	611_L	0.502	0.12
205_I	679_T	0.502	0.12
115_A	462_I	0.502	0.12
48_L	57_I	0.501	0.12
152_L	473_A	0.501	0.12
481_T	566_T	0.501	0.12
21_E	116_I	0.500	0.12
46_Q	239_V	0.500	0.12
498_G	592_R	0.500	0.12
609_F	697_W	0.500	0.12
247_A	322_L	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3v97A	1	0.9501	100	0.461	Contact Map
3lduA	1	0.5342	100	0.701	Contact Map
3ldgA	1	0.5285	100	0.703	Contact Map
3k0bA	1	0.5228	100	0.708	Contact Map
3tm4A	1	0.4672	100	0.793	Contact Map
3tmaA	2	0.4587	100	0.825	Contact Map
2b78A	1	0.5014	100	0.853	Contact Map
3vseA	1	0.5242	100	0.857	Contact Map
3c0kA	2	0.5128	100	0.873	Contact Map
1wxxA	2	0.5071	100	0.873	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0168 seconds.