GSIA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

GSIA - Glutathione import ATP-binding protein GsiA

UniProt:	P75796	Sequences: MPHSDELDAGNVLAVENLNIAFMQDQQKIAAVRNLSFSLQRGETLAIVGESGSGKSVTALALMRLLEQAGGLVQCDKMLLQRRSREVIELSEQNAAQMRHVRGADMAMIFQEPMTSLNPVFTVGEQIAESIRLHQNASREEAMVEAKRMLDQVRIPEAQTILSRYPHQLSGGMRQRVMIAMALSCRPAVLIADEPTTALDVTIQAQILQLIKVLQKEMSMGVIFITHDMGVVAEIADRVLVMYQGEAVETGTVEQIFHAPQHPYTRALLAAVPQLGAMKGLDYPRRFPLISLEHPAKQAPPIEQKTVVDGEPVLRVRNLVTRFPLRSGLLNRVTREVHAVEKVSFDLWPGETLSLVGESGSGKSTTGRALLRLVESQGGEIIFNGQRIDTLSPGKLQALRRDIQFIFQDPYASLDPRQTIGDSIIEPLRVHGLLPGKDAAARVAWLLERVGLLPEHAWRYPHEFSGGQRQRICIARALALNPKVIIADEAVSALDVSIRGQIINLLLDLQRDFGIAYLFISHDMAVVERISHRVAVMYLGQIVEIGPRRAVFENPQHPYTRKLLAAVPVAEPSRQRPQRVLLSDDLPSNIHLRGEEVAAVSLQCVGPGHYVAQPQSEYAFMRR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13472
Length:	623 (468)
Sequences:	123 (115)
Seq/√Len:	5.3

ECOLI - GSIA YHES UUP ETTA
BACSU - YDIF YFMR YKPA YFMM YKOD EXPZ
SULSO - Q97UG5 Y1893

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
601_S	609_H	2.981	0.73
236_A	239_V	2.930	0.71
598_A	604_C	2.878	0.70
233_A	254_E	2.836	0.69
134_H	139_R	2.711	0.65
602_L	609_H	2.646	0.63
241_V	256_I	2.610	0.62
583_S	598_A	2.606	0.62
579_R	587_P	2.606	0.62
285_R	291_S	2.561	0.60
583_S	596_E	2.464	0.57
582_L	587_P	2.401	0.55
569_V	603_Q	2.362	0.54
604_C	608_G	2.287	0.51
584_D	587_P	2.270	0.51
226_T	454_P	2.258	0.50
288_P	294_H	2.237	0.50
592_L	598_A	2.221	0.49
589_N	602_L	2.189	0.48
587_P	595_E	2.162	0.47
573_S	584_D	2.140	0.46
461_P	472_I	2.128	0.46
355_L	410_P	2.105	0.45
583_S	587_P	2.099	0.45
253_V	452_L	2.095	0.45
580_V	583_S	2.093	0.45
583_S	590_I	2.088	0.45
359_S	492_S	2.086	0.45
590_I	598_A	2.085	0.44
584_D	595_E	2.079	0.44
583_S	604_C	2.050	0.43
597_V	603_Q	2.027	0.43
285_R	288_P	2.007	0.42
601_S	605_V	1.999	0.42
600_V	604_C	1.978	0.41
154_R	191_I	1.974	0.41
576_R	590_I	1.953	0.40
198_A	490_A	1.909	0.39
588_S	596_E	1.901	0.39
317_R	370_L	1.895	0.38
581_L	592_L	1.888	0.38
349_P	354_S	1.852	0.37
604_C	607_P	1.850	0.37
588_S	601_S	1.845	0.37
285_R	292_L	1.818	0.36
573_S	582_L	1.803	0.35
600_V	608_G	1.790	0.35
581_L	587_P	1.789	0.35
579_R	584_D	1.781	0.35
585_D	598_A	1.779	0.35
286_R	299_A	1.774	0.35
592_L	595_E	1.767	0.34
580_V	604_C	1.765	0.34
577_P	581_L	1.744	0.34
600_V	603_Q	1.736	0.33
586_L	594_G	1.735	0.33
242_M	245_G	1.709	0.33
211_I	520_I	1.699	0.32
586_L	601_S	1.698	0.32
173_M	291_S	1.693	0.32
587_P	590_I	1.688	0.32
194_E	471_R	1.674	0.32
590_I	606_G	1.667	0.31
173_M	285_R	1.662	0.31
135_Q	239_V	1.656	0.31
424_I	443_V	1.625	0.30
339_A	455_E	1.602	0.30
457_A	516_A	1.602	0.30
574_R	607_P	1.598	0.29
583_S	599_A	1.593	0.29
347_L	372_R	1.593	0.29
354_S	498_I	1.593	0.29
104_A	108_M	1.586	0.29
288_P	291_S	1.582	0.29
354_S	532_H	1.577	0.29
214_L	220_M	1.574	0.29
577_P	590_I	1.553	0.28
194_E	197_T	1.547	0.28
197_T	492_S	1.543	0.28
579_R	603_Q	1.540	0.28
569_V	575_Q	1.538	0.28
567_V	602_L	1.532	0.28
572_P	588_S	1.527	0.28
244_Q	560_T	1.524	0.27
418_Q	426_E	1.524	0.27
405_F	471_R	1.521	0.27
289_L	296_A	1.518	0.27
588_S	594_G	1.495	0.27
587_P	602_L	1.489	0.27
576_R	579_R	1.488	0.26
579_R	583_S	1.484	0.26
580_V	590_I	1.466	0.26
589_N	605_V	1.466	0.26
288_P	527_V	1.462	0.26
590_I	594_G	1.461	0.26
287_F	291_S	1.459	0.26
582_L	597_V	1.455	0.26
207_I	466_G	1.450	0.26
420_I	472_I	1.445	0.25
579_R	588_S	1.425	0.25
473_C	481_N	1.422	0.25
580_V	596_E	1.415	0.25
590_I	595_E	1.411	0.25
169_L	291_S	1.408	0.24
228_D	515_I	1.405	0.24
577_P	587_P	1.404	0.24
596_E	604_C	1.400	0.24
605_V	609_H	1.400	0.24
579_R	601_S	1.391	0.24
585_D	609_H	1.391	0.24
567_V	570_A	1.390	0.24
583_S	588_S	1.381	0.24
577_P	582_L	1.380	0.24
589_N	595_E	1.363	0.23
598_A	605_V	1.359	0.23
559_Y	597_V	1.359	0.23
586_L	592_L	1.359	0.23
166_P	177_V	1.354	0.23
572_P	587_P	1.352	0.23
127_I	140_E	1.349	0.23
197_T	515_I	1.346	0.23
562_K	581_L	1.344	0.23
593_R	599_A	1.341	0.23
192_A	467_G	1.335	0.23
161_I	164_R	1.332	0.23
206_Q	231_V	1.330	0.23
198_A	492_S	1.325	0.22
582_L	590_I	1.323	0.22
597_V	606_G	1.322	0.22
590_I	593_R	1.311	0.22
578_Q	598_A	1.311	0.22
410_P	473_C	1.309	0.22
585_D	594_G	1.307	0.22
589_N	603_Q	1.279	0.21
227_H	467_G	1.277	0.21
583_S	586_L	1.264	0.21
572_P	583_S	1.254	0.21
585_D	590_I	1.250	0.21
297_K	300_P	1.249	0.21
117_L	120_V	1.249	0.21
580_V	600_V	1.245	0.21
587_P	596_E	1.229	0.20
171_G	408_Q	1.229	0.20
587_P	594_G	1.223	0.20
581_L	585_D	1.220	0.20
198_A	502_I	1.213	0.20
198_A	493_A	1.211	0.20
588_S	595_E	1.209	0.20
239_V	347_L	1.208	0.20
199_L	405_F	1.204	0.20
580_V	588_S	1.203	0.20
210_L	260_P	1.200	0.20
356_V	534_V	1.199	0.20
572_P	586_L	1.199	0.20
266_R	461_P	1.194	0.20
598_A	607_P	1.193	0.20
169_L	173_M	1.193	0.20
580_V	598_A	1.193	0.20
155_I	493_A	1.188	0.19
285_R	527_V	1.187	0.19
173_M	288_P	1.182	0.19
595_E	599_A	1.174	0.19
581_L	584_D	1.173	0.19
585_D	601_S	1.172	0.19
230_G	313_V	1.172	0.19
127_I	134_H	1.167	0.19
405_F	546_G	1.166	0.19
597_V	601_S	1.160	0.19
562_K	609_H	1.156	0.19
589_N	599_A	1.155	0.19
447_L	466_G	1.151	0.19
113_P	487_A	1.151	0.19
580_V	594_G	1.150	0.19
602_L	605_V	1.149	0.19
288_P	292_L	1.145	0.19
592_L	605_V	1.141	0.18
577_P	595_E	1.139	0.18
206_Q	450_V	1.135	0.18
127_I	139_R	1.135	0.18
589_N	597_V	1.135	0.18
587_P	598_A	1.134	0.18
565_A	601_S	1.132	0.18
568_P	580_V	1.131	0.18
225_I	241_V	1.128	0.18
591_H	601_S	1.127	0.18
105_D	112_E	1.127	0.18
573_S	607_P	1.116	0.18
175_Q	288_P	1.116	0.18
104_A	112_E	1.113	0.18
567_V	575_Q	1.108	0.18
231_V	515_I	1.100	0.18
448_E	493_A	1.099	0.18
602_L	606_G	1.099	0.18
575_Q	597_V	1.098	0.18
580_V	587_P	1.096	0.18
228_D	523_D	1.094	0.18
579_R	589_N	1.090	0.17
228_D	359_S	1.082	0.17
562_K	589_N	1.080	0.17
384_N	471_R	1.076	0.17
452_L	546_G	1.076	0.17
228_D	466_G	1.074	0.17
579_R	591_H	1.074	0.17
603_Q	607_P	1.070	0.17
598_A	609_H	1.069	0.17
197_T	228_D	1.069	0.17
450_V	468_Q	1.068	0.17
579_R	592_L	1.065	0.17
283_Y	364_S	1.064	0.17
590_I	596_E	1.063	0.17
108_M	112_E	1.062	0.17
577_P	584_D	1.060	0.17
204_Q	369_A	1.059	0.17
591_H	604_C	1.057	0.17
223_I	335_R	1.056	0.17
585_D	599_A	1.055	0.17
584_D	598_A	1.051	0.17
194_E	494_L	1.047	0.17
584_D	602_L	1.046	0.17
585_D	589_N	1.046	0.17
181_M	354_S	1.044	0.17
599_A	603_Q	1.044	0.17
568_P	600_V	1.043	0.17
589_N	593_R	1.040	0.17
584_D	594_G	1.039	0.17
370_L	475_A	1.039	0.17
240_L	299_A	1.036	0.16
562_K	583_S	1.033	0.16
591_H	609_H	1.032	0.16
182_A	354_S	1.031	0.16
595_E	604_C	1.030	0.16
581_L	602_L	1.028	0.16
289_L	292_L	1.024	0.16
163_S	580_V	1.024	0.16
568_P	573_S	1.023	0.16
584_D	605_V	1.017	0.16
584_D	588_S	1.017	0.16
183_L	194_E	1.017	0.16
592_L	600_V	1.015	0.16
282_D	287_F	1.012	0.16
194_E	228_D	1.011	0.16
568_P	599_A	1.009	0.16
573_S	609_H	1.006	0.16
575_Q	590_I	1.004	0.16
575_Q	585_D	1.003	0.16
226_T	448_E	1.001	0.16
197_T	207_I	1.001	0.16
580_V	597_V	0.998	0.16
597_V	602_L	0.994	0.16
170_S	200_D	0.991	0.16
357_G	362_G	0.991	0.16
357_G	363_K	0.991	0.16
357_G	488_D	0.991	0.16
357_G	489_E	0.991	0.16
357_G	495_D	0.991	0.16
357_G	522_H	0.991	0.16
495_D	522_H	0.991	0.16
170_S	193_D	0.991	0.16
172_G	522_H	0.991	0.16
172_G	200_D	0.991	0.16
170_S	522_H	0.991	0.16
170_S	495_D	0.991	0.16
193_D	362_G	0.991	0.16
193_D	357_G	0.991	0.16
193_D	489_E	0.991	0.16
193_D	495_D	0.991	0.16
193_D	522_H	0.991	0.16
170_S	357_G	0.991	0.16
170_S	362_G	0.991	0.16
193_D	200_D	0.991	0.16
193_D	363_K	0.991	0.16
170_S	363_K	0.991	0.16
170_S	488_D	0.991	0.16
193_D	488_D	0.991	0.16
170_S	489_E	0.991	0.16
362_G	488_D	0.991	0.16
200_D	357_G	0.991	0.16
488_D	522_H	0.991	0.16
200_D	488_D	0.991	0.16
489_E	522_H	0.991	0.16
172_G	488_D	0.991	0.16
200_D	489_E	0.991	0.16
172_G	489_E	0.991	0.16
363_K	522_H	0.991	0.16
363_K	495_D	0.991	0.16
363_K	489_E	0.991	0.16
489_E	495_D	0.991	0.16
363_K	488_D	0.991	0.16
362_G	522_H	0.991	0.16
488_D	495_D	0.991	0.16
200_D	495_D	0.991	0.16
200_D	362_G	0.991	0.16
172_G	193_D	0.991	0.16
362_G	489_E	0.991	0.16
200_D	363_K	0.991	0.16
172_G	357_G	0.991	0.16
172_G	362_G	0.991	0.16
172_G	495_D	0.991	0.16
362_G	495_D	0.991	0.16
172_G	363_K	0.991	0.16
200_D	522_H	0.991	0.16
206_Q	466_G	0.991	0.16
564_L	567_V	0.990	0.16
197_T	471_R	0.989	0.16
594_G	599_A	0.989	0.16
226_T	493_A	0.984	0.16
380_E	578_Q	0.982	0.15
592_L	601_S	0.981	0.15
178_M	503_I	0.980	0.15
106_M	109_I	0.980	0.15
347_L	403_I	0.980	0.15
183_L	211_I	0.979	0.15
567_V	596_E	0.979	0.15
194_E	466_G	0.978	0.15
579_R	608_G	0.978	0.15
483_K	524_M	0.975	0.15
595_E	607_P	0.971	0.15
462_H	601_S	0.966	0.15
587_P	591_H	0.965	0.15
571_E	578_Q	0.964	0.15
591_H	599_A	0.962	0.15
578_Q	581_L	0.959	0.15
581_L	591_H	0.958	0.15
562_K	578_Q	0.957	0.15
596_E	608_G	0.955	0.15
590_I	609_H	0.954	0.15
142_A	184_S	0.952	0.15
578_Q	582_L	0.950	0.15
197_T	523_D	0.946	0.15
132_R	139_R	0.944	0.15
599_A	608_G	0.943	0.15
593_R	605_V	0.940	0.15
309_D	459_R	0.940	0.15
593_R	596_E	0.937	0.15
575_Q	580_V	0.936	0.15
271_A	347_L	0.932	0.15
573_S	601_S	0.931	0.15
570_A	596_E	0.928	0.15
176_R	379_G	0.926	0.15
593_R	598_A	0.925	0.15
152_Q	493_A	0.925	0.15
242_M	367_G	0.925	0.15
196_T	227_H	0.924	0.14
371_L	486_I	0.924	0.14
285_R	296_A	0.923	0.14
197_T	466_G	0.920	0.14
525_A	548_R	0.915	0.14
582_L	596_E	0.913	0.14
589_N	592_L	0.912	0.14
352_T	479_A	0.911	0.14
290_I	296_A	0.910	0.14
592_L	596_E	0.909	0.14
586_L	590_I	0.908	0.14
231_V	523_D	0.905	0.14
206_Q	359_S	0.904	0.14
199_L	546_G	0.904	0.14
577_P	589_N	0.902	0.14
226_T	366_T	0.900	0.14
569_V	584_D	0.900	0.14
581_L	599_A	0.899	0.14
197_T	359_S	0.897	0.14
596_E	601_S	0.896	0.14
587_P	604_C	0.896	0.14
562_K	582_L	0.895	0.14
584_D	592_L	0.895	0.14
573_S	581_L	0.893	0.14
231_V	405_F	0.891	0.14
173_M	409_D	0.890	0.14
492_S	515_I	0.890	0.14
152_Q	155_I	0.889	0.14
570_A	600_V	0.888	0.14
571_E	599_A	0.883	0.14
588_S	593_R	0.883	0.14
582_L	593_R	0.882	0.14
229_M	524_M	0.879	0.14
570_A	574_R	0.877	0.14
291_S	448_E	0.876	0.14
198_A	515_I	0.875	0.14
359_S	515_I	0.868	0.14
569_V	594_G	0.866	0.14
286_R	311_E	0.865	0.14
581_L	586_L	0.865	0.14
174_R	409_D	0.864	0.14
588_S	602_L	0.863	0.14
152_Q	297_K	0.862	0.13
195_P	466_G	0.859	0.13
149_M	354_S	0.858	0.13
593_R	607_P	0.858	0.13
413_S	517_Y	0.854	0.13
584_D	590_I	0.853	0.13
190_L	194_E	0.852	0.13
584_D	607_P	0.850	0.13
575_Q	595_E	0.850	0.13
583_S	595_E	0.849	0.13
569_V	579_R	0.848	0.13
383_F	401_R	0.845	0.13
203_I	256_I	0.845	0.13
584_D	589_N	0.845	0.13
581_L	598_A	0.845	0.13
594_G	609_H	0.844	0.13
574_R	585_D	0.843	0.13
577_P	600_V	0.843	0.13
582_L	607_P	0.842	0.13
595_E	602_L	0.838	0.13
571_E	579_R	0.838	0.13
569_V	580_V	0.837	0.13
444_A	493_A	0.835	0.13
539_L	588_S	0.829	0.13
197_T	206_Q	0.827	0.13
589_N	596_E	0.825	0.13
592_L	602_L	0.824	0.13
569_V	600_V	0.822	0.13
242_M	250_T	0.821	0.13
228_D	231_V	0.816	0.13
223_I	298_Q	0.814	0.13
587_P	603_Q	0.814	0.13
573_S	591_H	0.814	0.13
570_A	577_P	0.814	0.13
579_R	597_V	0.812	0.13
561_R	564_L	0.811	0.13
567_V	600_V	0.810	0.13
565_A	607_P	0.808	0.13
287_F	290_I	0.805	0.13
588_S	597_V	0.805	0.13
590_I	597_V	0.804	0.13
461_P	485_I	0.803	0.13
275_L	302_I	0.800	0.13
586_L	600_V	0.797	0.13
196_T	368_R	0.795	0.12
570_A	603_Q	0.793	0.12
237_D	559_Y	0.791	0.12
573_S	598_A	0.789	0.12
589_N	609_H	0.788	0.12
579_R	599_A	0.788	0.12
583_S	605_V	0.787	0.12
285_R	289_L	0.778	0.12
600_V	607_P	0.777	0.12
579_R	607_P	0.773	0.12
581_L	608_G	0.773	0.12
567_V	607_P	0.772	0.12
581_L	589_N	0.770	0.12
595_E	598_A	0.770	0.12
197_T	231_V	0.767	0.12
585_D	603_Q	0.764	0.12
288_P	296_A	0.761	0.12
574_R	596_E	0.759	0.12
569_V	599_A	0.757	0.12
282_D	291_S	0.756	0.12
582_L	598_A	0.754	0.12
582_L	595_E	0.753	0.12
578_Q	600_V	0.751	0.12
574_R	604_C	0.750	0.12
586_L	602_L	0.748	0.12
292_L	406_I	0.748	0.12
190_L	466_G	0.746	0.12
581_L	609_H	0.746	0.12
569_V	576_R	0.746	0.12
359_S	466_G	0.744	0.12
562_K	594_G	0.742	0.12
310_G	459_R	0.741	0.12
375_E	596_E	0.740	0.12
194_E	365_T	0.739	0.12
586_L	603_Q	0.738	0.12
227_H	466_G	0.737	0.12
570_A	595_E	0.737	0.12
568_P	596_E	0.736	0.12
310_G	321_T	0.735	0.12
581_L	588_S	0.733	0.12
287_F	292_L	0.731	0.12
195_P	467_G	0.731	0.12
571_E	598_A	0.731	0.12
572_P	606_G	0.731	0.12
169_L	294_H	0.730	0.12
570_A	599_A	0.728	0.12
576_R	606_G	0.727	0.12
579_R	602_L	0.725	0.11
227_H	447_L	0.725	0.11
579_R	595_E	0.724	0.11
583_S	594_G	0.724	0.11
583_S	589_N	0.721	0.11
568_P	598_A	0.721	0.11
586_L	606_G	0.720	0.11
235_I	562_K	0.720	0.11
585_D	595_E	0.719	0.11
601_S	608_G	0.719	0.11
572_P	605_V	0.716	0.11
152_Q	300_P	0.716	0.11
195_P	502_I	0.714	0.11
590_I	607_P	0.712	0.11
581_L	597_V	0.709	0.11
206_Q	471_R	0.709	0.11
576_R	584_D	0.706	0.11
297_K	304_Q	0.706	0.11
476_R	536_V	0.706	0.11
231_V	471_R	0.704	0.11
575_Q	604_C	0.704	0.11
293_E	568_P	0.702	0.11
593_R	602_L	0.702	0.11
295_P	474_I	0.701	0.11
502_I	505_L	0.698	0.11
593_R	597_V	0.697	0.11
596_E	600_V	0.696	0.11
562_K	575_Q	0.694	0.11
223_I	518_L	0.693	0.11
560_T	590_I	0.692	0.11
569_V	589_N	0.691	0.11
187_P	487_A	0.689	0.11
584_D	591_H	0.688	0.11
575_Q	602_L	0.688	0.11
282_D	289_L	0.687	0.11
575_Q	583_S	0.686	0.11
135_Q	140_E	0.686	0.11
194_E	490_A	0.684	0.11
379_G	408_Q	0.684	0.11
575_Q	586_L	0.683	0.11
207_I	515_I	0.681	0.11
104_A	111_Q	0.679	0.11
300_P	304_Q	0.678	0.11
105_D	109_I	0.678	0.11
575_Q	588_S	0.677	0.11
149_M	187_P	0.677	0.11
466_G	515_I	0.676	0.11
149_M	455_E	0.676	0.11
585_D	596_E	0.675	0.11
580_V	586_L	0.672	0.11
199_L	490_A	0.669	0.11
583_S	609_H	0.669	0.11
206_Q	515_I	0.668	0.11
183_L	195_P	0.665	0.11
492_S	502_I	0.664	0.11
175_Q	470_Q	0.663	0.11
597_V	609_H	0.662	0.11
582_L	606_G	0.661	0.11
465_S	522_H	0.659	0.11
200_D	465_S	0.659	0.11
193_D	465_S	0.659	0.11
362_G	465_S	0.659	0.11
172_G	465_S	0.659	0.11
170_S	465_S	0.659	0.11
465_S	495_D	0.659	0.11
363_K	465_S	0.659	0.11
357_G	465_S	0.659	0.11
465_S	489_E	0.659	0.11
465_S	488_D	0.659	0.11
577_P	597_V	0.659	0.11
188_A	509_L	0.658	0.11
317_R	600_V	0.658	0.11
572_P	580_V	0.655	0.11
585_D	608_G	0.652	0.11
207_I	227_H	0.652	0.11
588_S	609_H	0.651	0.11
594_G	602_L	0.648	0.10
343_V	567_V	0.646	0.10
581_L	593_R	0.646	0.10
588_S	592_L	0.646	0.10
107_A	158_A	0.645	0.10
241_V	526_V	0.644	0.10
564_L	570_A	0.643	0.10
598_A	603_Q	0.641	0.10
292_L	299_A	0.640	0.10
367_G	482_P	0.639	0.10
288_P	407_F	0.639	0.10
573_S	608_G	0.636	0.10
457_A	500_G	0.635	0.10
506_L	517_Y	0.634	0.10
199_L	485_I	0.634	0.10
581_L	595_E	0.632	0.10
575_Q	584_D	0.630	0.10
572_P	579_R	0.628	0.10
583_S	602_L	0.628	0.10
226_T	444_A	0.628	0.10
177_V	281_L	0.627	0.10
360_G	488_D	0.626	0.10
360_G	489_E	0.626	0.10
360_G	363_K	0.626	0.10
357_G	360_G	0.626	0.10
200_D	360_G	0.626	0.10
360_G	495_D	0.626	0.10
291_S	294_H	0.626	0.10
193_D	360_G	0.626	0.10
170_S	360_G	0.626	0.10
360_G	522_H	0.626	0.10
172_G	360_G	0.626	0.10
573_S	580_V	0.625	0.10
573_S	579_R	0.625	0.10
603_Q	609_H	0.624	0.10
571_E	575_Q	0.624	0.10
196_T	228_D	0.622	0.10
572_P	598_A	0.621	0.10
145_E	526_V	0.616	0.10
596_E	605_V	0.613	0.10
177_V	266_R	0.613	0.10
574_R	595_E	0.611	0.10
567_V	572_P	0.611	0.10
586_L	598_A	0.611	0.10
600_V	605_V	0.605	0.10
493_A	505_L	0.604	0.10
170_S	408_Q	0.603	0.10
408_Q	522_H	0.603	0.10
408_Q	489_E	0.603	0.10
408_Q	488_D	0.603	0.10
193_D	408_Q	0.603	0.10
408_Q	495_D	0.603	0.10
357_G	408_Q	0.603	0.10
172_G	408_Q	0.603	0.10
363_K	408_Q	0.603	0.10
200_D	408_Q	0.603	0.10
362_G	408_Q	0.603	0.10
383_F	402_D	0.601	0.10
158_A	598_A	0.599	0.10
169_L	285_R	0.599	0.10
581_L	596_E	0.598	0.10
155_I	300_P	0.598	0.10
581_L	604_C	0.597	0.10
573_S	594_G	0.590	0.10
578_Q	605_V	0.590	0.10
579_R	590_I	0.589	0.10
498_I	516_A	0.588	0.10
221_G	461_P	0.588	0.10
179_I	227_H	0.585	0.10
567_V	591_H	0.585	0.10
599_A	607_P	0.584	0.10
579_R	598_A	0.583	0.10
580_V	601_S	0.582	0.10
591_H	598_A	0.580	0.10
410_P	517_Y	0.580	0.10
587_P	609_H	0.578	0.10
581_L	594_G	0.577	0.10
135_Q	139_R	0.575	0.10
194_E	523_D	0.575	0.10
578_Q	590_I	0.575	0.10
599_A	605_V	0.573	0.10
576_R	600_V	0.572	0.10
575_Q	589_N	0.572	0.10
572_P	578_Q	0.572	0.10
578_Q	591_H	0.569	0.10
285_R	290_I	0.569	0.10
149_M	177_V	0.567	0.10
574_R	606_G	0.567	0.10
230_G	361_S	0.566	0.09
198_A	359_S	0.564	0.09
232_V	443_V	0.564	0.09
584_D	599_A	0.562	0.09
589_N	600_V	0.561	0.09
576_R	603_Q	0.560	0.09
313_V	516_A	0.560	0.09
592_L	597_V	0.559	0.09
109_I	112_E	0.559	0.09
150_L	464_F	0.559	0.09
586_L	589_N	0.557	0.09
577_P	596_E	0.556	0.09
287_F	296_A	0.556	0.09
127_I	132_R	0.554	0.09
596_E	603_Q	0.554	0.09
365_T	490_A	0.553	0.09
178_M	355_L	0.553	0.09
317_R	380_E	0.551	0.09
169_L	175_Q	0.551	0.09
575_Q	601_S	0.550	0.09
149_M	308_V	0.550	0.09
270_A	315_R	0.549	0.09
282_D	296_A	0.548	0.09
597_V	605_V	0.546	0.09
356_V	478_L	0.544	0.09
577_P	599_A	0.544	0.09
590_I	600_V	0.543	0.09
345_F	517_Y	0.539	0.09
304_Q	356_V	0.535	0.09
593_R	604_C	0.531	0.09
569_V	592_L	0.531	0.09
335_R	469_R	0.531	0.09
483_K	520_I	0.530	0.09
100_H	104_A	0.530	0.09
582_L	594_G	0.529	0.09
572_P	576_R	0.528	0.09
321_T	369_A	0.528	0.09
474_I	520_I	0.526	0.09
405_F	491_V	0.526	0.09
406_I	527_V	0.526	0.09
263_P	418_Q	0.526	0.09
224_F	236_A	0.524	0.09
123_V	134_H	0.522	0.09
577_P	605_V	0.521	0.09
272_V	403_I	0.521	0.09
589_N	598_A	0.521	0.09
588_S	603_Q	0.519	0.09
573_S	604_C	0.517	0.09
568_P	604_C	0.516	0.09
585_D	588_S	0.515	0.09
569_V	586_L	0.514	0.09
198_A	228_D	0.513	0.09
598_A	606_G	0.511	0.09
212_K	592_L	0.508	0.09
582_L	586_L	0.507	0.09
588_S	608_G	0.507	0.09
359_S	523_D	0.507	0.09
178_M	464_F	0.504	0.09
364_S	537_M	0.504	0.09
508_D	592_L	0.503	0.09
572_P	595_E	0.502	0.09
578_Q	586_L	0.500	0.09
355_L	481_N	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4finA	2	0.8058	100	0.491	Contact Map
4q9hA	1	0.8299	100	0.499	Contact Map
4f4cA	1	0.8058	100	0.504	Contact Map
2iw3A	2	0.7368	100	0.519	Contact Map
1yqtA	1	0.8202	100	0.551	Contact Map
3bk7A	1	0.8427	100	0.552	Contact Map
3ozxA	1	0.8186	100	0.558	Contact Map
3j16B	1	0.8636	100	0.57	Contact Map
3ux8A	2	0.7175	100	0.58	Contact Map
2vf7A	2	0.7897	100	0.603	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0131 seconds.