PGAA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PGAA - Poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine export protein

UniProt:	P69434	Sequences: MYSSSRKRCPKTKWALKLLTAAFLAASPAAKSAVNNAYDALIIEARKGNTQPALSWFALKSALSNNQIADWLQIALWAGQDKQVITVYNRYRHQQLPARGYAAVAVAYRNLQQWQNSLTLWQKALSLEPQNKDYQRGQILTLADAGHYDTALVKLKQLNSGAPDKANLLAEAYIYKLAGRHQDELRAMTESLPENASTQQYPTEYVQALRNNQLAAAIDDANLTPDIRADIHAELVRLSFMPTRSESERYAIADRALAQYAALEILWHDNPDRTAQYQRIQVDHLGALLTRDRYKDVISHYQRLKKTGQIIPPWGQYWVASAYLKDHQPKKAQSIMTELFYHKETIAPDLSDEELADLFYSHLESENYPGALTVTQHTINTSPPFLRLMGTPTSIPNDTWLQGHSFLSTVAKYSNDLPQAEMTARELAYNAPGNQGLRIDYASVLQARGWPRAAENELKKAEVIEPRNINLEVEQAWTALTLQEWQQAAVLTHDVVEREPQDPGVVRLKRAVDVHNLAELRIAGSTGIDAEGPDSGKHDVDLTTIVYSPPLKDNWRGFAGFGYADGQFSEGKGIVRDWLAGVEWRSRNIWLEAEYAERVFNHEHKPGARLSGWYDFNDNWRIGSQLERLSHRVPLRAMKNGVTGNSAQAYVRWYQNERRKYGVSWAFTDFSDSNQRHEVSLEGQERIWSSPYLIVDFLPSLYYEQNTEHDTPYYNPIKTFDIVPAFEASHLLWRSYENSWEQIFSAGVGASWQKHYGTDVVTQLGYGQRISWNDVIDAGATLRWEKRPYDGDREHNLYVEFDMTFRF	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13865
Length:	807 (664)
Sequences:	295 (246)
Seq/√Len:	9.6

ECOLI - PGAA BCSC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
674_N	713_Y	4.838	1.00
105_A	120_L	3.792	0.98
328_Q	331_K	3.767	0.98
180_R	183_D	3.619	0.97
469_I	495_V	3.572	0.97
319_V	323_Y	3.563	0.97
458_L	474_E	3.556	0.97
713_Y	716_P	3.508	0.97
424_A	440_D	3.476	0.96
558_F	562_G	3.471	0.96
660_K	684_Q	3.259	0.95
562_G	567_Q	2.973	0.91
188_M	204_E	2.947	0.91
293_R	296_D	2.872	0.90
562_G	566_G	2.792	0.89
674_N	716_P	2.703	0.87
591_L	714_Y	2.698	0.87
627_E	668_T	2.681	0.86
560_G	567_Q	2.589	0.84
138_Q	198_T	2.552	0.83
151_A	420_A	2.464	0.81
201_Y	204_E	2.427	0.80
256_A	261_A	2.406	0.79
437_L	440_D	2.400	0.79
203_T	224_T	2.306	0.76
139_I	155_L	2.303	0.76
133_D	140_L	2.287	0.76
155_L	170_A	2.283	0.76
175_Y	180_R	2.265	0.75
560_G	566_G	2.249	0.75
129_P	134_Y	2.243	0.74
642_V	672_D	2.242	0.74
640_N	672_D	2.233	0.74
137_G	140_L	2.225	0.74
791_G	794_E	2.170	0.72
560_G	569_S	2.150	0.71
727_E	755_H	2.145	0.71
471_L	474_E	2.145	0.71
179_G	204_E	2.128	0.70
558_F	567_Q	2.127	0.70
281_Q	284_H	2.123	0.70
121_W	155_L	2.123	0.70
118_L	138_Q	2.110	0.70
484_E	487_Q	2.093	0.69
320_A	339_L	2.091	0.69
424_A	427_L	2.074	0.68
206_V	221_A	2.072	0.68
520_L	747_G	2.052	0.67
562_G	569_S	2.049	0.67
108_Y	116_N	2.001	0.65
558_F	569_S	2.000	0.65
406_F	458_L	1.986	0.65
133_D	155_L	1.976	0.64
205_Y	209_L	1.964	0.64
221_A	225_P	1.960	0.64
407_L	411_A	1.938	0.63
634_P	672_D	1.935	0.62
121_W	136_R	1.928	0.62
479_A	484_E	1.927	0.62
131_N	136_R	1.917	0.62
488_A	628_R	1.906	0.61
143_A	155_L	1.890	0.61
411_A	414_S	1.890	0.61
566_G	569_S	1.875	0.60
234_E	237_R	1.871	0.60
442_A	479_A	1.870	0.60
494_D	498_R	1.869	0.60
474_E	495_V	1.865	0.60
770_I	780_A	1.842	0.59
118_L	122_Q	1.836	0.58
441_Y	445_L	1.827	0.58
719_T	751_S	1.826	0.58
768_Q	780_A	1.824	0.58
320_A	370_G	1.821	0.58
759_D	779_G	1.809	0.57
698_L	725_A	1.807	0.57
662_G	749_G	1.798	0.57
605_K	643_T	1.789	0.56
254_D	259_Q	1.773	0.55
209_L	214_L	1.773	0.55
172_A	188_M	1.763	0.55
209_L	216_A	1.762	0.55
638_M	726_F	1.756	0.55
424_A	473_V	1.755	0.55
308_G	312_P	1.751	0.54
105_A	117_S	1.748	0.54
314_W	336_M	1.747	0.54
558_F	566_G	1.745	0.54
640_N	712_P	1.721	0.53
556_R	637_A	1.713	0.53
105_A	128_E	1.710	0.53
627_E	679_V	1.703	0.52
781_T	797_L	1.700	0.52
121_W	133_D	1.697	0.52
301_Y	319_V	1.689	0.52
105_A	112_Q	1.681	0.51
556_R	562_G	1.669	0.51
714_Y	749_G	1.662	0.51
133_D	138_Q	1.660	0.50
697_F	726_F	1.660	0.50
744_F	764_L	1.659	0.50
139_I	163_P	1.652	0.50
458_L	482_L	1.647	0.50
169_L	172_A	1.646	0.50
105_A	145_A	1.636	0.49
136_R	140_L	1.635	0.49
704_E	719_T	1.620	0.49
301_Y	304_L	1.617	0.49
113_Q	123_K	1.612	0.48
662_G	682_E	1.604	0.48
170_A	209_L	1.602	0.48
640_N	715_N	1.571	0.46
672_D	725_A	1.569	0.46
742_Q	749_G	1.568	0.46
341_Y	381_T	1.556	0.46
171_E	212_N	1.551	0.46
783_R	794_E	1.548	0.45
640_N	711_T	1.547	0.45
472_E	475_Q	1.540	0.45
298_I	322_A	1.534	0.45
140_L	155_L	1.530	0.45
461_A	464_I	1.523	0.44
336_M	340_F	1.520	0.44
288_L	366_E	1.512	0.44
458_L	462_E	1.508	0.44
155_L	203_T	1.503	0.43
135_Q	154_K	1.503	0.43
416_D	419_Q	1.502	0.43
633_V	747_G	1.501	0.43
339_L	351_S	1.497	0.43
155_L	167_N	1.492	0.43
412_K	424_A	1.490	0.43
255_R	258_A	1.489	0.43
627_E	649_A	1.471	0.42
676_R	713_Y	1.469	0.42
309_Q	671_S	1.468	0.42
213_Q	216_A	1.457	0.41
185_L	213_Q	1.456	0.41
559_A	562_G	1.448	0.41
602_H	629_L	1.444	0.41
320_A	799_V	1.441	0.41
739_S	745_S	1.441	0.41
108_Y	114_W	1.437	0.41
687_I	695_V	1.431	0.40
206_V	301_Y	1.431	0.40
504_G	508_L	1.430	0.40
212_N	224_T	1.429	0.40
166_A	171_E	1.428	0.40
133_D	136_R	1.426	0.40
490_V	570_E	1.423	0.40
420_A	520_L	1.423	0.40
438_R	484_E	1.422	0.40
331_K	419_Q	1.417	0.40
654_Y	725_A	1.413	0.40
359_F	772_W	1.412	0.39
133_D	167_N	1.405	0.39
315_G	772_W	1.405	0.39
559_A	582_V	1.404	0.39
146_G	163_P	1.404	0.39
313_P	320_A	1.402	0.39
614_Y	622_I	1.396	0.39
556_R	560_G	1.390	0.39
622_I	651_V	1.389	0.38
358_L	362_H	1.388	0.38
336_M	357_D	1.383	0.38
559_A	568_F	1.382	0.38
303_R	321_S	1.379	0.38
314_W	361_S	1.375	0.38
121_W	137_G	1.374	0.38
642_V	713_Y	1.374	0.38
638_M	728_A	1.373	0.38
481_T	508_L	1.373	0.38
585_R	779_G	1.358	0.37
617_N	620_W	1.351	0.37
410_V	437_L	1.351	0.37
684_Q	700_S	1.351	0.37
122_Q	415_N	1.340	0.36
640_N	725_A	1.340	0.36
121_W	138_Q	1.339	0.36
427_L	437_L	1.335	0.36
207_Q	221_A	1.333	0.36
425_R	441_Y	1.333	0.36
132_K	140_L	1.317	0.35
136_R	167_N	1.316	0.35
225_P	229_A	1.313	0.35
158_L	217_A	1.309	0.35
709_H	712_P	1.302	0.35
367_N	557_G	1.301	0.35
622_I	657_E	1.297	0.35
160_S	557_G	1.296	0.35
138_Q	225_P	1.292	0.34
788_P	791_G	1.290	0.34
171_E	203_T	1.288	0.34
421_E	445_L	1.287	0.34
112_Q	117_S	1.284	0.34
314_W	360_Y	1.283	0.34
593_A	754_K	1.281	0.34
596_A	607_G	1.280	0.34
629_L	711_T	1.276	0.34
406_F	410_V	1.275	0.34
419_Q	459_K	1.274	0.34
146_G	663_V	1.272	0.34
214_L	224_T	1.268	0.33
709_H	725_A	1.264	0.33
167_N	209_L	1.262	0.33
285_L	297_V	1.262	0.33
357_D	361_S	1.261	0.33
458_L	471_L	1.252	0.33
474_E	477_W	1.248	0.33
426_E	444_V	1.246	0.33
333_Q	361_S	1.243	0.33
237_R	240_F	1.241	0.32
291_R	329_P	1.241	0.32
492_T	496_V	1.238	0.32
138_Q	159_N	1.238	0.32
662_G	684_Q	1.230	0.32
636_R	762_T	1.226	0.32
744_F	794_E	1.223	0.32
436_G	475_Q	1.217	0.31
231_I	234_E	1.216	0.31
410_V	414_S	1.215	0.31
465_E	495_V	1.215	0.31
424_A	437_L	1.211	0.31
583_E	618_D	1.211	0.31
654_Y	660_K	1.211	0.31
131_N	212_N	1.210	0.31
738_N	770_I	1.209	0.31
132_K	167_N	1.206	0.31
288_L	363_L	1.198	0.31
366_E	666_A	1.196	0.31
470_N	474_E	1.194	0.31
686_R	734_R	1.194	0.31
427_L	500_P	1.193	0.31
604_H	610_L	1.192	0.31
320_A	458_L	1.189	0.30
660_K	698_L	1.185	0.30
546_V	774_D	1.182	0.30
662_G	714_Y	1.181	0.30
629_L	715_N	1.181	0.30
594_E	629_L	1.177	0.30
742_Q	790_D	1.174	0.30
777_D	798_Y	1.171	0.30
152_L	174_I	1.168	0.30
672_D	711_T	1.168	0.30
145_A	192_L	1.167	0.30
624_S	764_L	1.161	0.29
129_P	148_Y	1.161	0.29
469_I	481_T	1.161	0.29
435_Q	711_T	1.160	0.29
639_K	711_T	1.160	0.29
288_L	293_R	1.156	0.29
594_E	609_R	1.156	0.29
168_L	206_V	1.154	0.29
668_T	722_I	1.147	0.29
629_L	779_G	1.145	0.29
662_G	792_D	1.144	0.29
715_N	742_Q	1.142	0.29
441_Y	446_Q	1.138	0.29
543_T	547_Y	1.136	0.28
366_E	734_R	1.135	0.28
298_I	590_W	1.135	0.28
177_L	209_L	1.131	0.28
106_V	121_W	1.128	0.28
163_P	176_K	1.127	0.28
421_E	425_R	1.126	0.28
360_Y	363_L	1.126	0.28
627_E	773_N	1.126	0.28
468_N	494_D	1.124	0.28
106_V	134_Y	1.122	0.28
458_L	472_E	1.121	0.28
738_N	742_Q	1.120	0.28
132_K	135_Q	1.119	0.28
638_M	672_D	1.118	0.28
407_L	799_V	1.117	0.28
518_A	529_D	1.115	0.28
297_V	660_K	1.112	0.28
138_Q	144_D	1.110	0.28
552_K	555_W	1.108	0.27
293_R	339_L	1.108	0.27
133_D	137_G	1.106	0.27
457_E	461_A	1.106	0.27
236_V	241_M	1.106	0.27
684_Q	698_L	1.106	0.27
672_D	749_G	1.103	0.27
136_R	142_L	1.102	0.27
105_A	109_R	1.102	0.27
458_L	473_V	1.101	0.27
132_K	138_Q	1.101	0.27
333_Q	336_M	1.100	0.27
599_V	682_E	1.099	0.27
176_K	757_G	1.098	0.27
644_G	676_R	1.098	0.27
110_N	133_D	1.097	0.27
503_P	511_A	1.097	0.27
596_A	640_N	1.096	0.27
559_A	719_T	1.090	0.27
738_N	749_G	1.090	0.27
105_A	115_Q	1.088	0.27
410_V	458_L	1.087	0.27
749_G	794_E	1.086	0.27
476_A	488_A	1.083	0.27
764_L	784_W	1.082	0.27
122_Q	138_Q	1.080	0.26
639_K	672_D	1.079	0.26
599_V	602_H	1.078	0.26
312_P	616_F	1.077	0.26
766_Y	794_E	1.077	0.26
365_S	370_G	1.077	0.26
105_A	121_W	1.074	0.26
136_R	155_L	1.074	0.26
682_E	711_T	1.072	0.26
367_N	422_M	1.070	0.26
686_R	689_S	1.064	0.26
105_A	141_T	1.063	0.26
110_N	118_L	1.063	0.26
608_A	649_A	1.062	0.26
605_K	633_V	1.061	0.26
105_A	108_Y	1.061	0.26
715_N	719_T	1.060	0.26
232_H	236_V	1.059	0.26
361_S	364_E	1.059	0.26
332_A	432_P	1.058	0.26
718_K	752_W	1.056	0.26
324_L	336_M	1.054	0.26
747_G	786_K	1.053	0.26
432_P	484_E	1.049	0.25
196_A	221_A	1.048	0.25
358_L	383_P	1.046	0.25
599_V	711_T	1.046	0.25
465_E	468_N	1.044	0.25
485_W	489_A	1.040	0.25
559_A	671_S	1.039	0.25
675_Q	764_L	1.038	0.25
257_L	510_R	1.036	0.25
358_L	378_T	1.035	0.25
202_P	632_R	1.034	0.25
146_G	230_D	1.028	0.25
138_Q	142_L	1.028	0.25
601_N	759_D	1.028	0.25
129_P	145_A	1.026	0.25
637_A	706_N	1.026	0.25
672_D	761_V	1.023	0.25
203_T	225_P	1.022	0.24
747_G	776_I	1.019	0.24
634_P	706_N	1.019	0.24
746_A	764_L	1.019	0.24
113_Q	116_N	1.017	0.24
120_L	123_K	1.017	0.24
693_L	733_W	1.017	0.24
375_T	687_I	1.017	0.24
660_K	715_N	1.015	0.24
236_V	240_F	1.012	0.24
424_A	714_Y	1.009	0.24
715_N	725_A	1.008	0.24
549_P	641_G	1.005	0.24
538_H	610_L	1.004	0.24
757_G	760_V	1.002	0.24
581_G	618_D	1.002	0.24
508_L	622_I	1.000	0.24
306_K	647_A	0.997	0.24
582_V	644_G	0.996	0.24
459_K	486_Q	0.995	0.24
443_S	458_L	0.993	0.24
629_L	656_N	0.993	0.24
124_A	129_P	0.993	0.24
112_Q	121_W	0.992	0.23
686_R	729_S	0.992	0.23
284_H	288_L	0.992	0.23
472_E	477_W	0.992	0.23
172_A	497_E	0.991	0.23
140_L	171_E	0.991	0.23
672_D	713_Y	0.988	0.23
453_A	468_N	0.988	0.23
543_T	758_T	0.986	0.23
140_L	209_L	0.984	0.23
225_P	616_F	0.980	0.23
285_L	762_T	0.980	0.23
654_Y	712_P	0.979	0.23
374_V	726_F	0.977	0.23
204_E	207_Q	0.976	0.23
544_T	559_A	0.976	0.23
357_D	721_D	0.971	0.23
472_E	495_V	0.969	0.23
608_A	628_R	0.968	0.23
552_K	650_Y	0.968	0.23
158_L	162_A	0.965	0.23
212_N	449_G	0.965	0.23
146_G	170_A	0.964	0.23
115_Q	595_Y	0.961	0.23
371_A	674_N	0.961	0.23
154_K	449_G	0.961	0.23
124_A	130_Q	0.958	0.22
479_A	487_Q	0.958	0.22
198_T	221_A	0.957	0.22
107_A	110_N	0.955	0.22
766_Y	790_D	0.949	0.22
155_L	188_M	0.948	0.22
629_L	682_E	0.947	0.22
704_E	753_Q	0.947	0.22
147_H	150_T	0.947	0.22
209_L	213_Q	0.947	0.22
298_I	302_Q	0.947	0.22
321_S	336_M	0.945	0.22
207_Q	211_N	0.941	0.22
132_K	155_L	0.941	0.22
612_G	670_F	0.940	0.22
682_E	698_L	0.939	0.22
620_W	653_W	0.937	0.22
113_Q	128_E	0.936	0.22
427_L	472_E	0.935	0.22
579_L	585_R	0.932	0.22
594_E	656_N	0.925	0.21
122_Q	126_S	0.925	0.21
616_F	799_V	0.925	0.21
654_Y	769_R	0.924	0.21
380_N	423_T	0.924	0.21
304_L	315_G	0.923	0.21
138_Q	209_L	0.922	0.21
571_G	583_E	0.920	0.21
369_P	442_A	0.918	0.21
718_K	727_E	0.918	0.21
131_N	137_G	0.916	0.21
653_W	736_Y	0.916	0.21
288_L	322_A	0.916	0.21
596_A	660_K	0.916	0.21
219_D	293_R	0.915	0.21
742_Q	766_Y	0.914	0.21
311_I	314_W	0.914	0.21
502_D	531_E	0.911	0.21
357_D	443_S	0.910	0.21
445_L	457_E	0.910	0.21
698_L	715_N	0.910	0.21
474_E	714_Y	0.910	0.21
153_V	160_S	0.906	0.21
117_S	121_W	0.905	0.21
178_A	181_H	0.904	0.21
706_N	715_N	0.904	0.21
186_R	557_G	0.903	0.21
356_A	360_Y	0.902	0.21
304_L	764_L	0.902	0.21
726_F	779_G	0.900	0.21
749_G	790_D	0.899	0.21
645_N	695_V	0.895	0.21
207_Q	213_Q	0.895	0.21
367_N	370_G	0.893	0.20
676_R	715_N	0.893	0.20
715_N	790_D	0.892	0.20
700_S	757_G	0.888	0.20
108_Y	209_L	0.887	0.20
537_K	679_V	0.887	0.20
711_T	725_A	0.887	0.20
614_Y	666_A	0.886	0.20
660_K	700_S	0.886	0.20
437_L	443_S	0.884	0.20
229_A	236_V	0.883	0.20
125_L	155_L	0.882	0.20
556_R	566_G	0.882	0.20
420_A	437_L	0.881	0.20
162_A	165_K	0.881	0.20
500_P	691_P	0.881	0.20
782_L	797_L	0.881	0.20
136_R	168_L	0.878	0.20
133_D	143_A	0.878	0.20
131_N	144_D	0.877	0.20
335_I	423_T	0.877	0.20
378_T	469_I	0.877	0.20
320_A	481_T	0.875	0.20
786_K	791_G	0.875	0.20
171_E	175_Y	0.875	0.20
755_H	799_V	0.872	0.20
445_L	461_A	0.871	0.20
654_Y	682_E	0.870	0.20
216_A	520_L	0.869	0.20
172_A	187_A	0.869	0.20
227_I	380_N	0.868	0.20
554_N	567_Q	0.866	0.20
320_A	714_Y	0.865	0.20
556_R	569_S	0.864	0.20
642_V	674_N	0.863	0.20
220_D	224_T	0.862	0.20
789_Y	794_E	0.861	0.20
438_R	442_A	0.859	0.19
634_P	642_V	0.859	0.19
581_G	772_W	0.858	0.19
714_Y	785_E	0.858	0.19
594_E	599_V	0.857	0.19
604_H	607_G	0.857	0.19
400_W	418_P	0.856	0.19
735_S	798_Y	0.854	0.19
442_A	462_E	0.852	0.19
754_K	772_W	0.852	0.19
491_L	645_N	0.851	0.19
743_I	782_L	0.851	0.19
413_Y	444_V	0.850	0.19
636_R	672_D	0.850	0.19
599_V	709_H	0.848	0.19
608_A	627_E	0.848	0.19
411_A	443_S	0.848	0.19
749_G	788_P	0.842	0.19
312_P	766_Y	0.841	0.19
662_G	680_S	0.841	0.19
305_K	500_P	0.838	0.19
638_M	722_I	0.835	0.19
410_V	424_A	0.835	0.19
461_A	508_L	0.833	0.19
511_A	803_M	0.833	0.19
334_S	341_Y	0.832	0.19
646_S	698_L	0.832	0.19
369_P	467_R	0.830	0.19
339_L	343_K	0.829	0.19
489_A	495_V	0.829	0.19
774_D	783_R	0.827	0.19
380_N	687_I	0.825	0.19
140_L	144_D	0.825	0.19
682_E	725_A	0.825	0.19
594_E	672_D	0.824	0.19
339_L	414_S	0.824	0.19
557_G	750_A	0.824	0.19
515_H	524_G	0.823	0.18
203_T	234_E	0.822	0.18
156_K	164_D	0.822	0.18
353_E	456_N	0.822	0.18
362_H	367_N	0.821	0.18
642_V	711_T	0.817	0.18
630_S	670_F	0.816	0.18
437_L	778_A	0.814	0.18
151_A	171_E	0.814	0.18
125_L	129_P	0.813	0.18
404_H	427_L	0.813	0.18
336_M	361_S	0.811	0.18
624_S	720_F	0.811	0.18
709_H	779_G	0.811	0.18
148_Y	225_P	0.811	0.18
729_S	776_I	0.808	0.18
180_R	227_I	0.805	0.18
175_Y	205_Y	0.805	0.18
203_T	207_Q	0.804	0.18
279_R	318_W	0.803	0.18
339_L	380_N	0.801	0.18
786_K	792_D	0.800	0.18
629_L	769_R	0.796	0.18
348_P	560_G	0.796	0.18
476_A	681_L	0.795	0.18
185_L	209_L	0.795	0.18
234_E	240_F	0.795	0.18
371_A	676_R	0.794	0.18
124_A	128_E	0.791	0.18
293_R	444_V	0.791	0.18
133_D	166_A	0.791	0.18
711_T	715_N	0.790	0.18
129_P	508_L	0.787	0.18
314_W	318_W	0.787	0.18
410_V	434_N	0.786	0.18
172_A	307_T	0.786	0.18
371_A	713_Y	0.785	0.17
773_N	777_D	0.783	0.17
221_A	234_E	0.782	0.17
169_L	206_V	0.781	0.17
582_V	593_A	0.781	0.17
594_E	779_G	0.781	0.17
231_I	240_F	0.780	0.17
502_D	510_R	0.780	0.17
634_P	640_N	0.778	0.17
118_L	354_E	0.772	0.17
190_E	699_P	0.771	0.17
543_T	569_S	0.770	0.17
489_A	496_V	0.770	0.17
601_N	717_I	0.769	0.17
407_L	412_K	0.768	0.17
106_V	109_R	0.768	0.17
373_T	376_Q	0.768	0.17
767_G	773_N	0.768	0.17
440_D	445_L	0.767	0.17
142_L	165_K	0.767	0.17
628_R	715_N	0.767	0.17
633_V	643_T	0.767	0.17
121_W	613_W	0.766	0.17
337_T	366_E	0.765	0.17
118_L	129_P	0.765	0.17
718_K	782_L	0.764	0.17
581_G	676_R	0.764	0.17
640_N	654_Y	0.762	0.17
360_Y	383_P	0.762	0.17
510_R	524_G	0.760	0.17
650_Y	703_Y	0.758	0.17
140_L	177_L	0.757	0.17
138_Q	167_N	0.757	0.17
669_D	780_A	0.756	0.17
479_A	491_L	0.756	0.17
545_I	560_G	0.756	0.17
598_R	607_G	0.756	0.17
745_S	749_G	0.756	0.17
604_H	643_T	0.756	0.17
136_R	139_I	0.755	0.17
321_S	324_L	0.755	0.17
336_M	549_P	0.754	0.17
561_F	566_G	0.753	0.17
618_D	670_F	0.753	0.17
688_W	719_T	0.751	0.17
634_P	638_M	0.751	0.17
239_S	242_P	0.748	0.17
594_E	715_N	0.748	0.17
464_I	609_R	0.748	0.17
128_E	131_N	0.747	0.17
740_W	746_A	0.747	0.17
298_I	335_I	0.746	0.16
149_D	299_S	0.746	0.16
298_I	419_Q	0.746	0.16
110_N	114_W	0.746	0.16
799_V	803_M	0.746	0.16
427_L	440_D	0.744	0.16
596_A	684_Q	0.744	0.16
788_P	794_E	0.742	0.16
642_V	771_S	0.742	0.16
327_H	507_R	0.741	0.16
596_A	599_V	0.741	0.16
132_K	136_R	0.740	0.16
478_T	610_L	0.740	0.16
747_G	751_S	0.739	0.16
108_Y	124_A	0.739	0.16
150_T	463_V	0.739	0.16
599_V	662_G	0.739	0.16
176_K	208_A	0.739	0.16
200_Q	221_A	0.738	0.16
620_W	651_V	0.738	0.16
155_L	212_N	0.738	0.16
639_K	709_H	0.738	0.16
629_L	654_Y	0.736	0.16
660_K	682_E	0.736	0.16
138_Q	148_Y	0.735	0.16
338_E	416_D	0.734	0.16
326_D	334_S	0.733	0.16
193_P	727_E	0.732	0.16
172_A	295_K	0.731	0.16
654_Y	709_H	0.731	0.16
607_G	742_Q	0.730	0.16
441_Y	484_E	0.729	0.16
440_D	473_V	0.729	0.16
275_A	279_R	0.729	0.16
404_H	460_K	0.728	0.16
216_A	353_E	0.727	0.16
123_K	127_L	0.726	0.16
334_S	373_T	0.726	0.16
288_L	297_V	0.726	0.16
719_T	759_D	0.725	0.16
560_G	564_A	0.725	0.16
679_V	701_L	0.724	0.16
143_A	170_A	0.724	0.16
672_D	684_Q	0.723	0.16
682_E	709_H	0.723	0.16
667_F	675_Q	0.720	0.16
190_E	718_K	0.720	0.16
557_G	647_A	0.719	0.16
610_L	645_N	0.719	0.16
140_L	143_A	0.718	0.16
424_A	474_E	0.718	0.16
167_N	170_A	0.717	0.16
196_A	466_P	0.717	0.16
238_L	242_P	0.716	0.16
215_A	241_M	0.716	0.16
672_D	682_E	0.716	0.16
562_G	565_D	0.715	0.16
178_A	697_F	0.714	0.16
624_S	675_Q	0.714	0.16
654_Y	759_D	0.714	0.16
306_K	377_H	0.713	0.16
629_L	759_D	0.713	0.16
151_A	716_P	0.712	0.16
314_W	676_R	0.711	0.16
349_D	376_Q	0.711	0.16
186_R	320_A	0.710	0.16
714_Y	753_Q	0.709	0.16
639_K	712_P	0.709	0.16
546_V	557_G	0.708	0.16
380_N	595_Y	0.708	0.16
502_D	508_L	0.707	0.16
642_V	709_H	0.703	0.15
164_D	338_E	0.702	0.15
159_N	213_Q	0.701	0.15
510_R	514_V	0.701	0.15
479_A	593_A	0.701	0.15
542_L	724_P	0.701	0.15
355_L	359_F	0.699	0.15
447_A	492_T	0.698	0.15
379_I	383_P	0.697	0.15
594_E	762_T	0.697	0.15
188_M	201_Y	0.696	0.15
217_A	713_Y	0.695	0.15
177_L	225_P	0.694	0.15
447_A	454_A	0.694	0.15
621_R	714_Y	0.694	0.15
501_Q	673_S	0.693	0.15
533_P	537_K	0.693	0.15
656_N	682_E	0.693	0.15
761_V	794_E	0.693	0.15
279_R	321_S	0.691	0.15
436_G	595_Y	0.689	0.15
636_R	753_Q	0.689	0.15
729_S	785_E	0.688	0.15
636_R	766_Y	0.687	0.15
627_E	676_R	0.684	0.15
654_Y	779_G	0.684	0.15
537_K	715_N	0.683	0.15
142_L	150_T	0.682	0.15
425_R	578_W	0.682	0.15
601_N	642_V	0.682	0.15
180_R	207_Q	0.682	0.15
740_W	749_G	0.681	0.15
684_Q	800_E	0.680	0.15
442_A	446_Q	0.680	0.15
288_L	378_T	0.679	0.15
117_S	172_A	0.678	0.15
639_K	654_Y	0.677	0.15
154_K	746_A	0.675	0.15
163_P	207_Q	0.675	0.15
201_Y	557_G	0.674	0.15
453_A	600_F	0.674	0.15
749_G	768_Q	0.673	0.15
318_W	356_A	0.673	0.15
360_Y	364_E	0.673	0.15
343_K	722_I	0.672	0.15
786_K	793_R	0.671	0.15
198_T	201_Y	0.670	0.15
121_W	171_E	0.670	0.15
155_L	159_N	0.670	0.15
654_Y	711_T	0.669	0.15
515_H	520_L	0.669	0.15
557_G	721_D	0.666	0.15
410_V	440_D	0.662	0.15
108_Y	126_S	0.661	0.15
659_R	685_E	0.660	0.14
401_L	468_N	0.659	0.14
439_I	491_L	0.658	0.14
470_N	495_V	0.658	0.14
559_A	565_D	0.655	0.14
598_R	684_Q	0.655	0.14
144_D	152_L	0.654	0.14
672_D	790_D	0.653	0.14
140_L	167_N	0.651	0.14
172_A	507_R	0.651	0.14
753_Q	791_G	0.650	0.14
213_Q	229_A	0.650	0.14
303_R	470_N	0.649	0.14
609_R	627_E	0.648	0.14
337_T	349_D	0.648	0.14
702_Y	714_Y	0.646	0.14
522_I	529_D	0.646	0.14
146_G	209_L	0.645	0.14
442_A	458_L	0.645	0.14
594_E	639_K	0.644	0.14
291_R	327_H	0.642	0.14
358_L	375_T	0.641	0.14
738_N	741_E	0.640	0.14
166_A	546_V	0.639	0.14
323_Y	490_V	0.639	0.14
443_S	447_A	0.639	0.14
766_Y	789_Y	0.639	0.14
439_I	446_Q	0.638	0.14
488_A	647_A	0.638	0.14
152_L	179_G	0.638	0.14
438_R	671_S	0.637	0.14
636_R	759_D	0.636	0.14
171_E	225_P	0.635	0.14
693_L	728_A	0.634	0.14
408_S	424_A	0.634	0.14
131_N	143_A	0.634	0.14
322_A	618_D	0.634	0.14
449_G	530_A	0.632	0.14
231_I	237_R	0.632	0.14
234_E	239_S	0.631	0.14
412_K	447_A	0.630	0.14
645_N	772_W	0.630	0.14
656_N	709_H	0.627	0.14
581_G	644_G	0.627	0.14
654_Y	672_D	0.626	0.14
169_L	255_R	0.626	0.14
357_D	615_D	0.625	0.14
151_A	217_A	0.624	0.14
204_E	208_A	0.624	0.14
287_A	484_E	0.623	0.14
591_L	621_R	0.623	0.14
601_N	784_W	0.622	0.14
146_G	782_L	0.622	0.14
578_W	761_V	0.621	0.14
475_Q	479_A	0.621	0.14
275_A	301_Y	0.621	0.14
378_T	611_S	0.621	0.14
149_D	746_A	0.620	0.14
322_A	340_F	0.620	0.14
334_S	338_E	0.619	0.14
639_K	725_A	0.618	0.14
692_Y	787_R	0.618	0.14
176_K	221_A	0.617	0.14
412_K	772_W	0.617	0.14
525_S	747_G	0.616	0.14
633_V	685_E	0.615	0.14
152_L	299_S	0.615	0.14
661_Y	685_E	0.614	0.13
222_N	372_L	0.613	0.13
213_Q	221_A	0.613	0.13
177_L	212_N	0.613	0.13
234_E	238_L	0.612	0.13
314_W	317_Y	0.612	0.13
720_F	759_D	0.610	0.13
223_L	227_I	0.610	0.13
411_A	424_A	0.610	0.13
670_F	676_R	0.609	0.13
654_Y	715_N	0.608	0.13
609_R	725_A	0.607	0.13
656_N	715_N	0.604	0.13
108_Y	133_D	0.603	0.13
433_G	484_E	0.603	0.13
581_G	757_G	0.602	0.13
137_G	141_T	0.602	0.13
322_A	339_L	0.602	0.13
224_T	227_I	0.601	0.13
165_K	221_A	0.600	0.13
634_P	742_Q	0.600	0.13
283_D	301_Y	0.600	0.13
442_A	610_L	0.600	0.13
107_A	122_Q	0.599	0.13
630_S	721_D	0.599	0.13
336_M	798_Y	0.599	0.13
371_A	531_E	0.597	0.13
359_F	634_P	0.597	0.13
596_A	682_E	0.596	0.13
567_Q	645_N	0.595	0.13
314_W	333_Q	0.594	0.13
263_L	424_A	0.593	0.13
634_P	637_A	0.593	0.13
735_S	761_V	0.593	0.13
151_A	642_V	0.591	0.13
336_M	537_K	0.591	0.13
634_P	715_N	0.590	0.13
349_D	496_V	0.590	0.13
205_Y	224_T	0.590	0.13
598_R	660_K	0.588	0.13
582_V	744_F	0.587	0.13
772_W	778_A	0.587	0.13
615_D	779_G	0.587	0.13
171_E	178_A	0.587	0.13
121_W	125_L	0.586	0.13
203_T	214_L	0.585	0.13
599_V	725_A	0.585	0.13
119_T	337_T	0.584	0.13
234_E	242_P	0.584	0.13
237_R	255_R	0.583	0.13
559_A	569_S	0.583	0.13
544_T	695_V	0.581	0.13
316_Q	376_Q	0.580	0.13
314_W	356_A	0.579	0.13
660_K	719_T	0.578	0.13
646_S	769_R	0.576	0.13
292_D	408_S	0.576	0.13
369_P	620_W	0.575	0.13
316_Q	342_H	0.574	0.13
213_Q	225_P	0.574	0.13
439_I	473_V	0.574	0.13
667_F	757_G	0.572	0.13
713_Y	790_D	0.572	0.13
680_S	792_D	0.571	0.13
547_Y	581_G	0.570	0.13
516_N	554_N	0.569	0.13
159_N	193_P	0.569	0.13
373_T	419_Q	0.568	0.13
594_E	709_H	0.567	0.13
142_L	170_A	0.567	0.13
512_V	520_L	0.567	0.13
740_W	751_S	0.567	0.13
398_D	624_S	0.566	0.13
434_N	529_D	0.564	0.12
690_S	693_L	0.564	0.12
611_S	664_S	0.563	0.12
160_S	353_E	0.562	0.12
107_A	118_L	0.562	0.12
602_H	610_L	0.562	0.12
105_A	124_A	0.561	0.12
353_E	468_N	0.560	0.12
153_V	707_T	0.560	0.12
196_A	627_E	0.560	0.12
147_H	444_V	0.558	0.12
151_A	371_A	0.558	0.12
195_N	726_F	0.558	0.12
123_K	153_V	0.556	0.12
640_N	706_N	0.556	0.12
672_D	708_E	0.555	0.12
133_D	152_L	0.555	0.12
198_T	228_R	0.555	0.12
634_P	670_F	0.555	0.12
714_Y	737_E	0.555	0.12
650_Y	668_T	0.554	0.12
181_H	208_A	0.554	0.12
255_R	261_A	0.553	0.12
648_Q	666_A	0.553	0.12
443_S	474_E	0.553	0.12
281_Q	315_G	0.552	0.12
646_S	660_K	0.552	0.12
442_A	457_E	0.551	0.12
374_V	399_T	0.551	0.12
668_T	676_R	0.551	0.12
296_D	302_Q	0.550	0.12
436_G	458_L	0.550	0.12
153_V	299_S	0.547	0.12
690_S	733_W	0.547	0.12
208_A	282_V	0.547	0.12
717_I	723_V	0.545	0.12
753_Q	790_D	0.545	0.12
337_T	370_G	0.545	0.12
113_Q	653_W	0.544	0.12
642_V	682_E	0.544	0.12
734_R	769_R	0.543	0.12
139_I	297_V	0.543	0.12
192_L	234_E	0.543	0.12
196_A	209_L	0.542	0.12
701_L	755_H	0.541	0.12
729_S	743_I	0.541	0.12
117_S	698_L	0.541	0.12
169_L	207_Q	0.540	0.12
533_P	567_Q	0.540	0.12
226_D	306_K	0.540	0.12
302_Q	323_Y	0.540	0.12
537_K	553_D	0.539	0.12
479_A	513_D	0.538	0.12
418_P	582_V	0.537	0.12
175_Y	187_A	0.536	0.12
123_K	136_R	0.534	0.12
362_H	437_L	0.534	0.12
165_K	174_I	0.533	0.12
596_A	698_L	0.533	0.12
662_G	698_L	0.532	0.12
238_L	687_I	0.531	0.12
446_Q	478_T	0.530	0.12
207_Q	214_L	0.530	0.12
116_N	122_Q	0.528	0.12
197_S	225_P	0.528	0.12
556_R	567_Q	0.527	0.12
173_Y	188_M	0.527	0.12
411_A	439_I	0.527	0.12
427_L	431_A	0.526	0.12
627_E	638_M	0.525	0.12
786_K	796_N	0.525	0.12
319_V	506_V	0.525	0.12
625_Q	668_T	0.525	0.12
558_F	740_W	0.524	0.12
226_D	295_K	0.523	0.12
196_A	430_N	0.523	0.12
358_L	607_G	0.523	0.12
680_S	702_Y	0.523	0.12
172_A	746_A	0.522	0.12
309_Q	546_V	0.521	0.12
304_L	318_W	0.520	0.12
287_A	464_I	0.519	0.12
134_Y	147_H	0.519	0.12
409_T	445_L	0.519	0.12
743_I	774_D	0.519	0.12
438_R	457_E	0.519	0.12
112_Q	116_N	0.518	0.12
510_R	515_H	0.516	0.12
438_R	724_P	0.516	0.12
646_S	711_T	0.515	0.12
111_L	150_T	0.515	0.12
365_S	419_Q	0.515	0.12
319_V	719_T	0.514	0.12
570_E	626_L	0.514	0.12
206_V	224_T	0.514	0.12
610_L	724_P	0.511	0.11
116_N	123_K	0.510	0.11
517_L	522_I	0.510	0.11
637_A	672_D	0.510	0.11
274_T	280_I	0.510	0.11
510_R	517_L	0.509	0.11
647_A	728_A	0.509	0.11
366_E	383_P	0.508	0.11
371_A	420_A	0.508	0.11
138_Q	226_D	0.508	0.11
217_A	716_P	0.508	0.11
699_P	786_K	0.507	0.11
320_A	803_M	0.506	0.11
367_N	500_P	0.506	0.11
325_K	424_A	0.504	0.11
594_E	636_R	0.504	0.11
521_R	527_G	0.504	0.11
114_W	120_L	0.504	0.11
442_A	474_E	0.504	0.11
579_L	584_W	0.503	0.11
333_Q	362_H	0.503	0.11
470_N	477_W	0.503	0.11
640_N	682_E	0.503	0.11
171_E	642_V	0.502	0.11
361_S	581_G	0.502	0.11
218_I	307_T	0.502	0.11
577_D	645_N	0.502	0.11
594_E	801_F	0.502	0.11
644_G	728_A	0.501	0.11
148_Y	160_S	0.501	0.11
444_V	489_A	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1w3bA	2	0.4734	100	0.764	Contact Map
4ui9J	2	0.5316	100	0.767	Contact Map
2xpiA	2	0.5663	100	0.768	Contact Map
4rg9A	2	0.5155	100	0.771	Contact Map
4kvmA	3	0.6022	100	0.773	Contact Map
4ui9X	2	0.5886	100	0.774	Contact Map
4ui9C	2	0.5812	100	0.778	Contact Map
4uzyA	1	0.6109	100	0.798	Contact Map
3fp2A	1	0.5143	100	0.799	Contact Map
4bujB	1	0.7249	100	0.808	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0153 seconds.