PITB - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PITB - Probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2

UniProt:	P43676	Sequences: MLNLFVGLDIYTGLLLLLALAFVLFYEAINGFHDTANAVAAVIYTRAMQPQLAVVMAAFFNFFGVLLGGLSVAYAIVHMLPTDLLLNMGSTHGLAMVFSMLLAAIIWNLGTWFFGLPASSSHTLIGAIIGIGLTNALLTGSSVMDALNLREVTKIFSSLIVSPIVGLVIAGGLIFLLRRYWSGTKKRDRIHRIPEDRKKKKGKRKPPFWTRIALIVSAAGVAFSHGANDGQKGIGLVMLVLVGIAPAGFVVNMNASGYEITRTRDAVTNFEHYLQQHPELPQKLIAMEPPLPAASTDGTQVTEFHCHPANTFDAIARVKTMLPGNMESYEPLSVSQRSQLRRIMLCISDTSAKLAKLPGVSKEDQNLLKKLRSDMLSTIEYAPVWIIMAVALALGIGTMIGWRRVAMTIGEKIGKRGMTYAQGMAAQMTAAVSIGLASYIGMPVSTTHVLSSAVAGTMVVDGGGLQRKTVTSILMAWVFTLPAAIFLSGGLYWIALQLI	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG12883
Length:	499 (468)
Sequences:	366 (175)
Seq/√Len:	8.1

ECOLI - PITB PITA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
151_E	154_K	6.313	1.00
267_V	371_L	5.311	1.00
118_A	484_A	5.304	1.00
177_L	181_W	5.234	1.00
48_M	60_F	4.910	0.99
329_Y	332_L	4.502	0.99
178_R	461_D	4.318	0.98
329_Y	333_S	4.170	0.98
164_I	168_V	3.612	0.95
56_M	219_A	3.423	0.94
348_S	372_R	3.187	0.91
74_Y	381_Y	3.108	0.90
417_G	427_Q	3.033	0.88
193_I	201_K	2.929	0.86
227_A	438_S	2.875	0.85
129_I	348_S	2.759	0.83
110_G	116_L	2.717	0.82
192_R	201_K	2.658	0.80
161_V	165_V	2.623	0.79
354_L	428_M	2.447	0.74
71_S	441_G	2.442	0.74
220_G	431_A	2.437	0.74
399_M	403_R	2.396	0.73
330_E	333_S	2.375	0.72
133_L	141_S	2.371	0.72
134_T	486_F	2.206	0.66
183_G	189_R	2.202	0.66
88_M	103_A	2.198	0.66
156_F	224_S	2.162	0.64
113_F	116_L	2.155	0.64
134_T	493_W	2.130	0.63
484_A	488_S	2.119	0.63
118_A	488_S	2.103	0.62
193_I	475_M	2.044	0.60
118_A	136_A	2.033	0.59
354_L	360_V	2.028	0.59
137_L	489_G	2.024	0.59
123_T	449_V	1.967	0.57
442_M	453_A	1.965	0.57
167_L	459_V	1.965	0.57
89_G	124_L	1.952	0.56
60_F	381_Y	1.905	0.54
87_N	496_L	1.889	0.53
151_E	242_V	1.886	0.53
106_I	483_A	1.882	0.53
422_Q	458_M	1.873	0.53
88_M	356_K	1.864	0.52
157_S	161_V	1.863	0.52
434_I	481_L	1.857	0.52
60_F	63_F	1.854	0.52
149_L	453_A	1.848	0.52
106_I	116_L	1.840	0.51
149_L	152_V	1.830	0.51
57_A	152_V	1.827	0.51
438_S	449_V	1.825	0.51
48_M	424_M	1.797	0.50
68_G	382_A	1.790	0.49
75_A	156_F	1.765	0.48
59_F	62_F	1.760	0.48
382_A	387_I	1.759	0.48
106_I	202_G	1.748	0.48
63_F	492_Y	1.738	0.47
74_Y	473_I	1.730	0.47
191_H	217_S	1.710	0.46
215_I	311_T	1.701	0.46
22_F	263_T	1.696	0.46
59_F	425_A	1.692	0.45
201_K	332_L	1.690	0.45
217_S	427_Q	1.687	0.45
311_T	314_A	1.680	0.45
203_K	354_L	1.678	0.45
82_T	379_I	1.676	0.45
177_L	425_A	1.658	0.44
425_A	428_M	1.651	0.44
165_V	224_S	1.646	0.44
295_S	299_T	1.646	0.44
50_P	496_L	1.646	0.44
88_M	93_G	1.632	0.43
70_L	382_A	1.611	0.42
301_V	313_D	1.594	0.41
242_V	247_A	1.578	0.41
77_V	428_M	1.577	0.41
220_G	224_S	1.574	0.41
202_G	205_K	1.572	0.41
425_A	472_S	1.568	0.40
406_A	460_V	1.567	0.40
242_V	270_F	1.560	0.40
97_V	297_D	1.547	0.40
92_H	242_V	1.536	0.39
395_G	465_L	1.536	0.39
375_M	379_I	1.533	0.39
110_G	114_F	1.519	0.38
294_A	301_V	1.518	0.38
299_T	302_T	1.508	0.38
297_D	311_T	1.497	0.38
327_E	403_R	1.489	0.37
273_Y	367_L	1.487	0.37
189_R	462_G	1.481	0.37
155_I	412_K	1.478	0.37
138_L	412_K	1.472	0.37
42_V	223_F	1.471	0.37
463_G	478_V	1.459	0.36
374_D	495_A	1.429	0.35
319_K	492_Y	1.427	0.35
20_L	135_N	1.413	0.34
74_Y	349_D	1.389	0.34
326_M	329_Y	1.374	0.33
416_R	468_K	1.373	0.33
361_S	364_D	1.373	0.33
154_K	347_I	1.371	0.33
328_S	333_S	1.371	0.33
69_G	382_A	1.362	0.33
220_G	457_T	1.329	0.31
55_V	138_L	1.327	0.31
20_L	390_V	1.327	0.31
421_A	425_A	1.324	0.31
172_G	191_H	1.322	0.31
318_V	326_M	1.320	0.31
89_G	338_S	1.320	0.31
133_L	442_M	1.318	0.31
113_F	297_D	1.318	0.31
139_T	496_L	1.316	0.31
136_A	496_L	1.313	0.31
19_A	47_A	1.310	0.31
86_L	90_S	1.305	0.31
402_W	420_Y	1.303	0.30
174_I	384_V	1.301	0.30
127_A	396_I	1.299	0.30
124_L	152_V	1.298	0.30
24_L	90_S	1.297	0.30
295_S	302_T	1.295	0.30
133_L	136_A	1.293	0.30
156_F	164_I	1.285	0.30
49_Q	253_M	1.284	0.30
74_Y	332_L	1.271	0.29
147_L	386_I	1.269	0.29
60_F	136_A	1.268	0.29
164_I	176_L	1.261	0.29
133_L	139_T	1.260	0.29
105_I	458_M	1.259	0.29
209_W	212_I	1.254	0.29
388_M	484_A	1.251	0.29
274_L	312_F	1.247	0.29
486_F	489_G	1.247	0.29
368_L	435_G	1.245	0.28
318_V	329_Y	1.245	0.28
164_I	310_N	1.245	0.28
210_T	453_A	1.234	0.28
70_L	234_I	1.233	0.28
88_M	242_V	1.229	0.28
75_A	247_A	1.203	0.27
136_A	141_S	1.198	0.27
155_I	215_I	1.198	0.27
102_L	392_L	1.198	0.27
116_L	349_D	1.197	0.27
369_K	372_R	1.195	0.27
114_F	283_K	1.181	0.26
322_L	325_N	1.177	0.26
344_M	348_S	1.174	0.26
371_L	392_L	1.167	0.26
350_T	493_W	1.163	0.26
97_V	118_A	1.162	0.26
23_V	433_S	1.146	0.25
301_V	304_F	1.146	0.25
147_L	379_I	1.145	0.25
472_S	479_F	1.144	0.25
340_L	485_I	1.141	0.25
91_T	171_G	1.134	0.25
83_D	463_G	1.133	0.25
85_L	234_I	1.132	0.25
177_L	416_R	1.131	0.25
244_I	459_V	1.129	0.25
315_I	365_Q	1.127	0.25
440_I	484_A	1.124	0.25
68_G	387_I	1.120	0.24
255_A	337_R	1.118	0.24
18_L	201_K	1.115	0.24
106_I	205_K	1.113	0.24
295_S	298_G	1.110	0.24
70_L	387_I	1.108	0.24
60_F	412_K	1.103	0.24
29_I	344_M	1.102	0.24
350_T	467_R	1.099	0.24
477_W	480_T	1.092	0.24
191_H	347_I	1.090	0.24
315_I	322_L	1.088	0.23
218_A	427_Q	1.087	0.23
172_G	176_L	1.082	0.23
378_T	473_I	1.079	0.23
334_V	486_F	1.078	0.23
436_L	440_I	1.064	0.23
47_A	78_H	1.063	0.23
77_V	355_A	1.063	0.23
368_L	421_A	1.062	0.23
56_M	218_A	1.061	0.23
271_E	275_Q	1.060	0.23
124_L	209_W	1.058	0.23
277_H	364_D	1.057	0.23
242_V	279_E	1.057	0.23
113_F	133_L	1.057	0.23
336_Q	492_Y	1.053	0.22
66_L	388_M	1.052	0.22
339_Q	484_A	1.051	0.22
218_A	417_G	1.046	0.22
294_A	302_T	1.046	0.22
24_L	393_A	1.044	0.22
327_E	333_S	1.044	0.22
340_L	371_L	1.042	0.22
21_A	192_R	1.040	0.22
49_Q	483_A	1.037	0.22
85_L	144_M	1.036	0.22
212_I	368_L	1.033	0.22
58_A	79_M	1.023	0.22
115_G	423_G	1.023	0.22
18_L	267_V	1.018	0.21
245_A	274_L	1.014	0.21
220_G	454_V	1.011	0.21
22_F	495_A	1.010	0.21
217_S	417_G	1.008	0.21
177_L	208_F	1.006	0.21
265_D	269_N	1.002	0.21
59_F	67_L	1.002	0.21
359_G	369_K	0.996	0.21
60_F	354_L	0.996	0.21
106_I	484_A	0.996	0.21
92_H	179_R	0.988	0.21
57_A	453_A	0.988	0.21
25_F	69_G	0.986	0.21
316_A	336_Q	0.984	0.21
156_F	449_V	0.982	0.20
445_S	456_G	0.982	0.20
443_P	456_G	0.982	0.20
270_F	492_Y	0.981	0.20
129_I	479_F	0.981	0.20
328_S	432_V	0.980	0.20
490_G	494_I	0.979	0.20
46_R	116_L	0.978	0.20
28_A	167_L	0.977	0.20
188_D	192_R	0.977	0.20
88_M	98_F	0.977	0.20
364_D	367_L	0.977	0.20
437_A	444_V	0.975	0.20
227_A	449_V	0.975	0.20
47_A	493_W	0.973	0.20
95_A	415_K	0.972	0.20
278_P	340_L	0.969	0.20
116_L	358_P	0.968	0.20
177_L	421_A	0.959	0.20
154_K	474_L	0.959	0.20
295_S	301_V	0.959	0.20
29_I	427_Q	0.959	0.20
161_V	492_Y	0.958	0.20
86_L	136_A	0.956	0.20
97_V	123_T	0.954	0.20
80_L	476_A	0.954	0.20
76_I	215_I	0.952	0.20
220_G	422_Q	0.950	0.20
470_V	474_L	0.947	0.20
157_S	473_I	0.944	0.19
135_N	390_V	0.943	0.19
400_I	457_T	0.942	0.19
318_V	375_M	0.940	0.19
326_M	344_M	0.939	0.19
77_V	215_I	0.939	0.19
250_V	424_M	0.936	0.19
118_A	123_T	0.934	0.19
142_S	192_R	0.932	0.19
298_G	304_F	0.931	0.19
133_L	496_L	0.931	0.19
156_F	313_D	0.929	0.19
114_F	479_F	0.925	0.19
86_L	314_A	0.924	0.19
116_L	353_K	0.924	0.19
331_P	369_K	0.924	0.19
67_L	189_R	0.923	0.19
165_V	441_G	0.922	0.19
145_D	495_A	0.920	0.19
94_L	234_I	0.919	0.19
264_R	267_V	0.916	0.19
69_G	387_I	0.915	0.19
205_K	248_G	0.905	0.19
20_L	396_I	0.905	0.19
47_A	87_N	0.903	0.18
171_G	459_V	0.903	0.18
234_I	427_Q	0.903	0.18
240_V	495_A	0.898	0.18
216_V	484_A	0.896	0.18
136_A	142_S	0.896	0.18
70_L	210_T	0.892	0.18
263_T	326_M	0.891	0.18
269_N	367_L	0.891	0.18
178_R	284_L	0.888	0.18
133_L	332_L	0.884	0.18
223_F	453_A	0.883	0.18
324_G	327_E	0.882	0.18
77_V	496_L	0.882	0.18
303_E	472_S	0.881	0.18
261_T	389_A	0.880	0.18
470_V	484_A	0.880	0.18
242_V	276_Q	0.874	0.18
337_R	370_K	0.874	0.18
479_F	485_I	0.871	0.18
146_A	409_I	0.868	0.18
253_M	256_S	0.867	0.18
105_I	422_Q	0.867	0.18
133_L	467_R	0.867	0.18
150_R	192_R	0.864	0.18
152_V	158_S	0.863	0.17
476_A	481_L	0.862	0.17
174_I	460_V	0.855	0.17
125_I	425_A	0.852	0.17
100_M	103_A	0.851	0.17
47_A	149_L	0.850	0.17
102_L	358_P	0.849	0.17
116_L	179_R	0.849	0.17
468_K	486_F	0.848	0.17
415_K	472_S	0.847	0.17
85_L	344_M	0.846	0.17
134_T	364_D	0.846	0.17
386_I	460_V	0.846	0.17
278_P	317_R	0.844	0.17
189_R	497_Q	0.841	0.17
118_A	462_G	0.841	0.17
94_L	249_F	0.841	0.17
154_K	484_A	0.837	0.17
29_I	234_I	0.836	0.17
140_G	303_E	0.833	0.17
424_M	453_A	0.832	0.17
158_S	321_M	0.830	0.17
307_H	354_L	0.830	0.17
103_A	462_G	0.829	0.17
188_D	435_G	0.827	0.17
82_T	243_G	0.827	0.17
271_E	320_T	0.826	0.17
247_A	263_T	0.826	0.17
155_I	353_K	0.826	0.17
431_A	459_V	0.826	0.17
459_V	467_R	0.825	0.17
56_M	427_Q	0.824	0.17
63_F	103_A	0.824	0.17
78_H	349_D	0.823	0.17
316_A	354_L	0.822	0.17
162_S	422_Q	0.818	0.16
272_H	320_T	0.817	0.16
138_L	475_M	0.816	0.16
142_S	355_A	0.814	0.16
352_A	484_A	0.814	0.16
350_T	354_L	0.813	0.16
435_G	439_Y	0.813	0.16
123_T	438_S	0.812	0.16
165_V	169_I	0.811	0.16
48_M	285_I	0.811	0.16
436_L	449_V	0.810	0.16
40_A	115_G	0.808	0.16
307_H	311_T	0.807	0.16
310_N	492_Y	0.805	0.16
282_Q	388_M	0.801	0.16
68_G	234_I	0.799	0.16
18_L	366_N	0.797	0.16
49_Q	60_F	0.797	0.16
146_A	386_I	0.796	0.16
70_L	438_S	0.794	0.16
50_P	395_G	0.793	0.16
179_R	277_H	0.792	0.16
113_F	244_I	0.789	0.16
260_I	304_F	0.789	0.16
34_D	37_N	0.788	0.16
148_N	337_R	0.787	0.16
245_A	442_M	0.783	0.16
300_Q	312_F	0.783	0.16
142_S	317_R	0.783	0.16
233_G	241_L	0.782	0.16
294_A	305_H	0.781	0.16
327_E	498_L	0.778	0.16
89_G	473_I	0.777	0.16
151_E	309_A	0.777	0.16
116_L	331_P	0.777	0.16
21_A	431_A	0.777	0.16
152_V	168_V	0.774	0.15
16_L	42_V	0.773	0.15
301_V	306_C	0.771	0.15
165_V	244_I	0.769	0.15
129_I	409_I	0.764	0.15
312_F	373_S	0.763	0.15
52_L	329_Y	0.763	0.15
388_M	494_I	0.761	0.15
139_T	473_I	0.759	0.15
138_L	331_P	0.759	0.15
50_P	99_S	0.759	0.15
274_L	354_L	0.759	0.15
205_K	219_A	0.758	0.15
363_E	448_H	0.757	0.15
155_I	266_A	0.756	0.15
103_A	263_T	0.754	0.15
14_L	161_V	0.754	0.15
123_T	227_A	0.753	0.15
125_I	375_M	0.751	0.15
50_P	374_D	0.750	0.15
299_T	486_F	0.746	0.15
106_I	212_I	0.744	0.15
242_V	311_T	0.742	0.15
68_G	345_L	0.742	0.15
141_S	496_L	0.741	0.15
17_L	158_S	0.740	0.15
165_V	340_L	0.739	0.15
307_H	363_E	0.738	0.15
94_L	140_G	0.736	0.15
220_G	389_A	0.736	0.15
433_S	438_S	0.736	0.15
234_I	382_A	0.734	0.15
204_R	468_K	0.734	0.15
462_G	498_L	0.731	0.15
113_F	157_S	0.731	0.15
113_F	399_M	0.729	0.15
256_S	475_M	0.729	0.15
91_T	486_F	0.727	0.14
432_V	435_G	0.726	0.14
315_I	344_M	0.725	0.14
88_M	430_A	0.725	0.14
253_M	261_T	0.724	0.14
28_A	386_I	0.722	0.14
362_K	373_S	0.722	0.14
137_L	486_F	0.719	0.14
165_V	367_L	0.719	0.14
430_A	476_A	0.718	0.14
220_G	388_M	0.717	0.14
47_A	322_L	0.717	0.14
458_M	463_G	0.716	0.14
151_E	467_R	0.716	0.14
75_A	349_D	0.716	0.14
129_I	459_V	0.714	0.14
165_V	475_M	0.714	0.14
224_S	460_V	0.713	0.14
374_D	473_I	0.713	0.14
279_E	478_V	0.713	0.14
275_Q	278_P	0.712	0.14
357_L	360_V	0.712	0.14
108_N	446_T	0.710	0.14
201_K	204_R	0.709	0.14
106_I	348_S	0.709	0.14
190_I	205_K	0.708	0.14
253_M	380_E	0.708	0.14
69_G	151_E	0.705	0.14
158_S	164_I	0.704	0.14
189_R	201_K	0.704	0.14
54_V	406_A	0.702	0.14
209_W	451_S	0.699	0.14
345_L	387_I	0.699	0.14
420_Y	450_L	0.698	0.14
274_L	277_H	0.697	0.14
145_D	342_R	0.696	0.14
295_S	313_D	0.695	0.14
250_V	352_A	0.695	0.14
99_S	259_E	0.693	0.14
345_L	382_A	0.693	0.14
38_A	481_L	0.693	0.14
129_I	351_S	0.692	0.14
74_Y	449_V	0.690	0.14
402_W	414_G	0.689	0.14
405_V	427_Q	0.689	0.14
14_L	189_R	0.688	0.14
297_D	400_I	0.687	0.14
155_I	161_V	0.684	0.14
70_L	441_G	0.681	0.14
113_F	123_T	0.679	0.14
295_S	347_I	0.679	0.14
180_Y	442_M	0.678	0.14
60_F	254_N	0.677	0.13
48_M	67_L	0.674	0.13
188_D	492_Y	0.674	0.13
421_A	435_G	0.673	0.13
176_L	359_G	0.671	0.13
136_A	151_E	0.669	0.13
354_L	362_K	0.668	0.13
274_L	349_D	0.668	0.13
103_A	336_Q	0.668	0.13
275_Q	324_G	0.668	0.13
143_V	487_L	0.668	0.13
315_I	331_P	0.666	0.13
48_M	275_Q	0.665	0.13
77_V	488_S	0.664	0.13
26_Y	50_P	0.662	0.13
104_A	448_H	0.661	0.13
165_V	364_D	0.661	0.13
366_N	403_R	0.659	0.13
374_D	498_L	0.659	0.13
362_K	475_M	0.658	0.13
17_L	484_A	0.657	0.13
179_R	360_V	0.657	0.13
259_E	276_Q	0.654	0.13
68_G	381_Y	0.653	0.13
349_D	364_D	0.652	0.13
233_G	420_Y	0.650	0.13
338_S	492_Y	0.647	0.13
105_I	402_W	0.646	0.13
59_F	259_E	0.645	0.13
270_F	364_D	0.644	0.13
156_F	369_K	0.643	0.13
67_L	320_T	0.643	0.13
270_F	273_Y	0.643	0.13
18_L	338_S	0.642	0.13
69_G	177_L	0.642	0.13
443_P	480_T	0.641	0.13
456_G	480_T	0.641	0.13
445_S	480_T	0.641	0.13
456_G	477_W	0.641	0.13
445_S	477_W	0.641	0.13
443_P	477_W	0.641	0.13
479_F	483_A	0.641	0.13
174_I	498_L	0.640	0.13
373_S	498_L	0.640	0.13
67_L	432_V	0.639	0.13
272_H	416_R	0.639	0.13
282_Q	494_I	0.638	0.13
204_R	296_T	0.638	0.13
116_L	479_F	0.635	0.13
116_L	418_M	0.635	0.13
346_C	427_Q	0.635	0.13
372_R	400_I	0.635	0.13
169_I	242_V	0.631	0.13
353_K	470_V	0.631	0.13
189_R	488_S	0.629	0.13
87_N	244_I	0.628	0.13
60_F	67_L	0.628	0.13
265_D	403_R	0.626	0.13
84_L	128_I	0.620	0.12
169_I	172_G	0.619	0.12
19_A	315_I	0.619	0.12
324_G	392_L	0.618	0.12
422_Q	457_T	0.616	0.12
77_V	125_I	0.614	0.12
268_T	462_G	0.612	0.12
100_M	430_A	0.611	0.12
232_K	235_G	0.608	0.12
307_H	312_F	0.606	0.12
55_V	436_L	0.606	0.12
114_F	156_F	0.604	0.12
83_D	462_G	0.604	0.12
260_I	439_Y	0.603	0.12
150_R	360_V	0.602	0.12
137_L	365_Q	0.600	0.12
58_A	151_E	0.600	0.12
244_I	442_M	0.599	0.12
84_L	491_L	0.599	0.12
97_V	399_M	0.599	0.12
180_Y	425_A	0.599	0.12
442_M	460_V	0.598	0.12
45_T	111_T	0.598	0.12
167_L	240_V	0.598	0.12
270_F	318_V	0.597	0.12
294_A	378_T	0.597	0.12
127_A	461_D	0.595	0.12
362_K	366_N	0.595	0.12
438_S	441_G	0.595	0.12
123_T	294_A	0.594	0.12
214_L	419_T	0.593	0.12
172_G	310_N	0.592	0.12
25_F	28_A	0.592	0.12
362_K	432_V	0.591	0.12
218_A	346_C	0.590	0.12
106_I	315_I	0.590	0.12
269_N	468_K	0.590	0.12
138_L	317_R	0.590	0.12
84_L	207_P	0.590	0.12
78_H	382_A	0.589	0.12
259_E	498_L	0.589	0.12
474_L	489_G	0.588	0.12
106_I	374_D	0.588	0.12
95_A	221_V	0.586	0.12
294_A	299_T	0.585	0.12
102_L	492_Y	0.584	0.12
298_G	436_L	0.584	0.12
51_Q	85_L	0.584	0.12
106_I	183_G	0.583	0.12
103_A	489_G	0.583	0.12
329_Y	492_Y	0.583	0.12
160_I	354_L	0.583	0.12
209_W	458_M	0.582	0.12
68_G	380_E	0.580	0.12
416_R	488_S	0.579	0.12
60_F	496_L	0.579	0.12
55_V	424_M	0.578	0.12
247_A	320_T	0.577	0.12
25_F	94_L	0.577	0.12
88_M	393_A	0.577	0.12
51_Q	91_T	0.577	0.12
267_V	367_L	0.576	0.12
111_T	121_S	0.576	0.12
264_R	488_S	0.576	0.12
71_S	224_S	0.575	0.12
457_T	463_G	0.574	0.12
454_V	457_T	0.574	0.12
87_N	322_L	0.573	0.12
204_R	347_I	0.573	0.12
344_M	416_R	0.572	0.12
88_M	271_E	0.572	0.12
157_S	364_D	0.571	0.12
365_Q	369_K	0.571	0.12
311_T	318_V	0.571	0.12
298_G	421_A	0.568	0.12
408_T	447_T	0.567	0.12
87_N	325_N	0.565	0.11
85_L	251_V	0.564	0.11
295_S	311_T	0.563	0.11
16_L	40_A	0.563	0.11
332_L	490_G	0.562	0.11
48_M	219_A	0.560	0.11
133_L	484_A	0.559	0.11
314_A	344_M	0.559	0.11
247_A	339_Q	0.559	0.11
131_I	406_A	0.559	0.11
263_T	344_M	0.557	0.11
103_A	390_V	0.556	0.11
178_R	271_E	0.555	0.11
146_A	251_V	0.555	0.11
327_E	377_S	0.555	0.11
18_L	183_G	0.553	0.11
75_A	451_S	0.553	0.11
178_R	224_S	0.552	0.11
55_V	168_V	0.552	0.11
302_T	307_H	0.552	0.11
82_T	409_I	0.551	0.11
17_L	136_A	0.549	0.11
215_I	351_S	0.548	0.11
77_V	303_E	0.548	0.11
365_Q	419_T	0.547	0.11
140_G	282_Q	0.547	0.11
275_Q	311_T	0.545	0.11
24_L	86_L	0.544	0.11
457_T	468_K	0.544	0.11
436_L	442_M	0.543	0.11
26_Y	149_L	0.542	0.11
56_M	217_S	0.542	0.11
83_D	478_V	0.542	0.11
368_L	451_S	0.541	0.11
17_L	339_Q	0.541	0.11
272_H	276_Q	0.541	0.11
160_I	371_L	0.541	0.11
233_G	402_W	0.540	0.11
176_L	247_A	0.539	0.11
352_A	462_G	0.539	0.11
247_A	270_F	0.537	0.11
209_W	422_Q	0.536	0.11
132_G	430_A	0.536	0.11
425_A	474_L	0.536	0.11
188_D	259_E	0.536	0.11
131_I	455_A	0.536	0.11
116_L	484_A	0.535	0.11
164_I	282_Q	0.535	0.11
161_V	361_S	0.535	0.11
116_L	154_K	0.534	0.11
149_L	156_F	0.533	0.11
95_A	105_I	0.532	0.11
17_L	388_M	0.532	0.11
310_N	350_T	0.530	0.11
296_T	340_L	0.530	0.11
224_S	436_L	0.528	0.11
270_F	367_L	0.526	0.11
180_Y	188_D	0.526	0.11
296_T	338_S	0.525	0.11
260_I	378_T	0.525	0.11
269_N	490_G	0.525	0.11
51_Q	305_H	0.525	0.11
14_L	17_L	0.525	0.11
152_V	479_F	0.524	0.11
358_P	492_Y	0.524	0.11
225_H	232_K	0.524	0.11
176_L	496_L	0.522	0.11
214_L	341_R	0.522	0.11
113_F	364_D	0.522	0.11
243_G	399_M	0.521	0.11
420_Y	469_T	0.519	0.11
87_N	181_W	0.519	0.11
357_L	416_R	0.516	0.11
142_S	189_R	0.515	0.11
271_E	368_L	0.515	0.11
15_L	105_I	0.512	0.11
490_G	497_Q	0.512	0.11
89_G	174_I	0.512	0.11
457_T	464_G	0.511	0.11
42_V	123_T	0.511	0.11
78_H	87_N	0.511	0.11
129_I	133_L	0.510	0.11
202_G	440_I	0.510	0.11
50_P	405_V	0.508	0.11
253_M	337_R	0.508	0.11
300_Q	303_E	0.508	0.11
421_A	429_T	0.508	0.11
330_E	392_L	0.506	0.11
162_S	458_M	0.505	0.11
116_L	165_V	0.505	0.11
242_V	496_L	0.505	0.11
183_G	416_R	0.505	0.11
474_L	488_S	0.504	0.10
46_R	490_G	0.503	0.10
193_I	472_S	0.502	0.10
48_M	439_Y	0.502	0.10
46_R	178_R	0.502	0.10
339_Q	378_T	0.502	0.10
333_S	403_R	0.501	0.10
148_N	263_T	0.500	0.10
262_R	370_K	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2jlnA	1	0.3527	91	0.973	Contact Map
4m5bA	1	0.2305	31.1	0.984	Contact Map
3qe7A	2	0.3427	29.7	0.984	Contact Map
3zbhA	2	0.1944	29.4	0.984	Contact Map
4i0xB	1	0.1703	27.7	0.984	Contact Map
3ogiB	1	0.1784	25.5	0.984	Contact Map
3gwkC	2	0.1904	17.9	0.985	Contact Map
2wscI	1	0.0601	15.4	0.986	Contact Map
4oj2X	3	0.3788	13.4	0.986	Contact Map
4dx5A	3	0.3186	12	0.986	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0128 seconds.