YJIY - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YJIY - Inner membrane protein YjiY

UniProt:	P39396	Sequences: MDTKKIFKHIPWVILGIIGAFCLAVVALRRGEHISALWIVVASVSVYLVAYRYYSLYIAQKVMKLDPTRATPAVINNDGLNYVPTNRYVLFGHHFAAIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGTLWLLAGVVLAGAVQDFMVLFISSRRNGASLGEMIKEEMGPVPGTIALFGCFLIMIIILAVLALIVVKALAESPWGVFTVCSTVPIALFMGIYMRFIRPGRVGEVSVIGIVLLVASIYFGGVIAHDPYWGPALTFKDTTITFALIGYAFVSALLPVWLILAPRDYLATFLKIGVIVGLALGIVVLNPELKMPAMTQYIDGTGPLWKGALFPFLFITIACGAVSGFHALISSGTTPKLLANETDARFIGYGAMLMESFVAIMALVAASIIEPGLYFAMNTPPAGLGITMPNLHEMGGENAPIIMAQLKDVTAHAAATVSSWGFVISPEQILQTAKDIGEPSVLNRAGGAPTLAVGIAHVFHKVLPMADMGFWYHFGILFEALFILTALDAGTRSGRFMLQDLLGNFIPFLKKTDSLVAGIIGTAGCVGLWGYLLYQGVVDPLGGVKSLWPLFGISNQMLAAVALVLGTVVLIKMKRTQYIWVTVVPAVWLLICTTWALGLKLFSTNPQMEGFFYMASQYKEKIANGTDLTAQQIANMNHIVVNNYTNAGLSILFLIVVYSIIFYGFKTWLAVRNSDKRTDKETPYVPIPEGGVKISSHH	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG12586
Length:	716 (675)
Sequences:	512 (218)
Seq/√Len:	8.4

ECOLI - YJIY CSTA
BACSU - CSTA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
632_M	661_N	5.934	1.00
449_Q	453_D	5.303	1.00
228_I	232_V	4.921	0.99
176_I	504_A	4.347	0.99
653_N	656_H	4.308	0.99
47_Y	374_S	4.277	0.99
520_L	527_L	4.078	0.98
475_H	486_M	3.982	0.98
430_H	434_T	3.923	0.97
55_S	363_R	3.722	0.96
153_I	583_L	3.593	0.96
135_F	362_A	3.546	0.95
253_F	261_A	3.525	0.95
290_I	372_M	3.444	0.94
137_V	584_G	3.375	0.94
122_L	377_A	3.207	0.92
67_P	358_N	3.147	0.91
512_G	543_C	3.139	0.91
120_L	124_A	3.122	0.91
24_A	34_I	2.930	0.88
254_K	257_T	2.913	0.87
78_D	531_D	2.895	0.87
142_S	356_L	2.893	0.87
67_P	360_T	2.838	0.86
210_I	276_L	2.816	0.85
270_A	540_T	2.811	0.85
68_T	702_Y	2.796	0.85
659_V	663_T	2.795	0.85
640_I	658_V	2.771	0.84
206_L	210_I	2.751	0.84
585_T	600_T	2.734	0.83
309_M	313_T	2.730	0.83
126_V	131_A	2.711	0.83
613_W	617_L	2.628	0.81
395_M	471_V	2.620	0.81
188_L	194_G	2.611	0.80
19_G	45_S	2.605	0.80
648_A	654_M	2.605	0.80
578_A	608_L	2.597	0.80
402_L	461_N	2.591	0.80
347_I	504_A	2.588	0.80
46_V	127_V	2.522	0.78
630_F	665_A	2.508	0.78
63_M	136_M	2.498	0.77
636_Y	654_M	2.463	0.76
26_V	29_R	2.451	0.76
394_A	447_I	2.401	0.74
619_L	668_S	2.394	0.74
170_F	516_L	2.389	0.74
527_L	538_I	2.373	0.73
195_V	258_I	2.368	0.73
594_T	690_R	2.365	0.73
608_L	679_I	2.357	0.73
639_K	648_A	2.332	0.72
49_V	123_L	2.326	0.72
15_L	49_V	2.312	0.71
640_I	655_N	2.311	0.71
435_V	438_W	2.299	0.71
646_L	654_M	2.262	0.70
357_A	361_D	2.261	0.70
176_I	505_L	2.245	0.69
46_V	123_L	2.234	0.69
204_I	230_L	2.191	0.67
260_F	264_G	2.165	0.66
9_H	53_Y	2.162	0.66
64_K	593_R	2.158	0.66
434_T	438_W	2.156	0.66
174_I	546_L	2.144	0.65
402_L	460_L	2.142	0.65
586_V	686_W	2.138	0.65
579_V	625_Q	2.097	0.63
261_A	264_G	2.093	0.63
45_S	127_V	2.092	0.63
55_S	65_L	2.079	0.63
77_N	84_P	2.077	0.63
504_A	511_S	2.071	0.62
247_W	250_A	2.064	0.62
244_D	249_P	2.024	0.61
87_R	361_D	2.013	0.60
176_I	511_S	1.986	0.59
12_W	390_G	1.984	0.59
198_V	525_P	1.983	0.59
169_C	504_A	1.951	0.58
190_E	252_T	1.929	0.57
525_P	528_K	1.919	0.56
441_V	444_P	1.908	0.56
639_K	654_M	1.893	0.55
345_A	504_A	1.889	0.55
532_S	535_A	1.863	0.54
260_F	545_G	1.854	0.54
612_T	672_L	1.853	0.53
168_G	674_V	1.840	0.53
640_I	651_I	1.830	0.53
140_I	587_V	1.827	0.52
16_G	20_A	1.817	0.52
170_F	543_C	1.814	0.52
636_Y	648_A	1.809	0.52
589_I	597_I	1.802	0.51
582_V	682_G	1.792	0.51
621_S	626_M	1.787	0.51
395_M	469_L	1.776	0.50
24_A	28_L	1.774	0.50
62_V	588_L	1.771	0.50
542_G	671_F	1.768	0.50
137_V	504_A	1.761	0.50
340_V	607_L	1.758	0.50
589_I	686_W	1.756	0.49
128_L	142_S	1.755	0.49
267_F	271_L	1.736	0.49
286_T	347_I	1.736	0.49
638_E	641_A	1.714	0.48
402_L	438_W	1.707	0.47
687_L	691_N	1.707	0.47
108_V	675_V	1.700	0.47
108_V	468_T	1.696	0.47
307_L	385_S	1.695	0.47
630_F	662_Y	1.673	0.46
495_L	575_M	1.671	0.46
66_D	702_Y	1.663	0.46
40_V	382_V	1.652	0.45
9_H	48_L	1.652	0.45
288_L	495_L	1.645	0.45
24_A	652_A	1.636	0.44
645_D	651_I	1.630	0.44
453_D	483_M	1.622	0.44
356_L	362_A	1.608	0.43
44_V	48_L	1.606	0.43
237_F	240_V	1.605	0.43
75_I	145_N	1.598	0.43
65_L	135_F	1.570	0.42
108_V	177_L	1.569	0.42
244_D	247_W	1.560	0.41
527_L	535_A	1.555	0.41
402_L	434_T	1.549	0.41
176_I	347_I	1.534	0.40
395_M	658_V	1.531	0.40
153_I	539_G	1.520	0.40
62_V	599_V	1.516	0.40
243_H	458_S	1.511	0.39
151_E	522_N	1.502	0.39
128_L	602_V	1.499	0.39
286_T	544_V	1.498	0.39
645_D	657_I	1.497	0.39
395_M	468_T	1.492	0.39
167_F	183_I	1.483	0.38
612_T	676_Y	1.482	0.38
135_F	553_Q	1.474	0.38
250_A	253_F	1.474	0.38
41_V	128_L	1.473	0.38
377_A	610_C	1.454	0.37
401_G	646_L	1.452	0.37
348_S	369_A	1.446	0.37
101_A	113_M	1.441	0.37
244_D	641_A	1.441	0.37
14_I	18_I	1.440	0.37
147_A	198_V	1.425	0.36
369_A	469_L	1.425	0.36
87_R	154_K	1.422	0.36
119_T	381_L	1.421	0.36
256_T	260_F	1.402	0.35
59_A	65_L	1.400	0.35
636_Y	639_K	1.399	0.35
634_S	638_E	1.395	0.35
41_V	45_S	1.390	0.35
123_L	258_I	1.387	0.34
229_V	232_V	1.375	0.34
179_V	565_L	1.374	0.34
431_A	435_V	1.374	0.34
264_G	268_V	1.362	0.34
298_L	302_V	1.353	0.33
198_V	610_C	1.352	0.33
11_P	17_I	1.351	0.33
526_F	529_K	1.350	0.33
681_Y	684_K	1.347	0.33
145_N	700_T	1.346	0.33
63_M	593_R	1.342	0.33
179_V	473_I	1.341	0.33
18_I	312_M	1.341	0.33
152_M	323_W	1.340	0.33
90_L	355_L	1.338	0.33
66_D	595_Q	1.334	0.32
44_V	372_M	1.330	0.32
588_L	600_T	1.330	0.32
189_A	255_D	1.325	0.32
22_C	45_S	1.323	0.32
182_L	648_A	1.318	0.32
512_G	516_L	1.317	0.32
312_M	357_A	1.313	0.32
680_F	683_F	1.303	0.31
167_F	670_L	1.302	0.31
76_N	145_N	1.300	0.31
113_M	488_F	1.288	0.31
207_F	226_I	1.278	0.30
406_M	674_V	1.277	0.30
692_S	697_D	1.262	0.30
176_I	179_V	1.257	0.30
216_R	222_E	1.246	0.29
233_A	595_Q	1.245	0.29
288_L	575_M	1.244	0.29
119_T	511_S	1.243	0.29
271_L	572_S	1.242	0.29
176_I	292_V	1.241	0.29
19_G	505_L	1.240	0.29
198_V	323_W	1.231	0.29
11_P	15_L	1.221	0.28
24_A	39_I	1.217	0.28
189_A	252_T	1.215	0.28
645_D	654_M	1.215	0.28
391_L	450_T	1.213	0.28
246_Y	249_P	1.213	0.28
164_I	677_S	1.212	0.28
630_F	661_N	1.211	0.28
168_G	575_M	1.210	0.28
215_I	397_T	1.202	0.28
177_L	435_V	1.200	0.28
23_L	610_C	1.199	0.28
182_L	563_K	1.195	0.28
391_L	442_I	1.193	0.28
235_I	689_V	1.193	0.28
512_G	562_V	1.192	0.27
43_S	47_Y	1.192	0.27
137_V	176_I	1.191	0.27
21_F	25_V	1.190	0.27
88_Y	364_F	1.190	0.27
12_W	66_D	1.185	0.27
621_S	628_G	1.183	0.27
63_M	584_G	1.181	0.27
179_V	675_V	1.171	0.27
50_A	302_V	1.157	0.26
65_L	664_N	1.151	0.26
226_I	348_S	1.150	0.26
517_Q	530_T	1.150	0.26
477_F	516_L	1.149	0.26
633_A	662_Y	1.148	0.26
75_I	362_A	1.148	0.26
15_L	243_H	1.147	0.26
637_K	641_A	1.147	0.26
604_A	616_G	1.147	0.26
267_F	541_A	1.141	0.26
477_F	686_W	1.141	0.26
655_N	658_V	1.141	0.26
59_A	135_F	1.136	0.26
433_A	437_S	1.136	0.26
207_F	215_I	1.127	0.25
235_I	540_T	1.126	0.25
664_N	686_W	1.123	0.25
630_F	666_G	1.118	0.25
234_S	237_F	1.118	0.25
66_D	390_G	1.113	0.25
650_Q	653_N	1.112	0.25
142_S	477_F	1.109	0.25
166_L	516_L	1.107	0.25
516_L	543_C	1.106	0.25
347_I	505_L	1.105	0.25
236_Y	527_L	1.104	0.25
639_K	657_I	1.102	0.25
301_V	606_W	1.101	0.25
639_K	649_Q	1.100	0.25
48_L	382_V	1.099	0.24
579_V	642_N	1.098	0.24
206_L	253_F	1.095	0.24
223_V	260_F	1.095	0.24
234_S	505_L	1.094	0.24
75_I	135_F	1.093	0.24
23_L	495_L	1.092	0.24
189_A	565_L	1.091	0.24
651_I	655_N	1.085	0.24
323_W	516_L	1.082	0.24
49_V	119_T	1.081	0.24
584_G	593_R	1.077	0.24
260_F	263_I	1.076	0.24
511_S	610_C	1.074	0.24
666_G	670_L	1.073	0.24
445_E	680_F	1.073	0.24
66_D	139_F	1.070	0.24
169_C	176_I	1.069	0.24
431_A	440_F	1.068	0.24
643_G	651_I	1.066	0.23
635_Q	646_L	1.065	0.23
181_A	505_L	1.064	0.23
477_F	512_G	1.064	0.23
18_I	369_A	1.063	0.23
35_S	260_F	1.063	0.23
39_I	307_L	1.060	0.23
459_V	540_T	1.060	0.23
644_T	654_M	1.059	0.23
199_C	253_F	1.058	0.23
244_D	248_G	1.058	0.23
619_L	665_A	1.054	0.23
639_K	650_Q	1.049	0.23
259_T	511_S	1.048	0.23
389_P	629_F	1.048	0.23
637_K	697_D	1.047	0.23
90_L	101_A	1.046	0.23
643_G	648_A	1.034	0.23
52_R	109_L	1.028	0.22
499_L	540_T	1.028	0.22
151_E	495_L	1.024	0.22
257_T	631_Y	1.021	0.22
599_V	605_V	1.021	0.22
527_L	672_L	1.019	0.22
46_V	128_L	1.018	0.22
120_L	309_M	1.016	0.22
550_L	629_F	1.016	0.22
432_A	436_S	1.015	0.22
86_N	212_M	1.010	0.22
255_D	365_I	1.010	0.22
633_A	661_N	1.008	0.22
259_T	262_L	1.001	0.22
635_Q	648_A	1.000	0.22
181_A	322_L	0.996	0.21
438_W	460_L	0.996	0.21
174_I	311_A	0.995	0.21
226_I	230_L	0.993	0.21
267_F	562_V	0.992	0.21
302_V	680_F	0.992	0.21
182_L	324_K	0.991	0.21
257_T	307_L	0.986	0.21
161_P	532_S	0.982	0.21
399_P	403_G	0.980	0.21
477_F	586_V	0.979	0.21
86_N	450_T	0.978	0.21
169_C	511_S	0.975	0.21
688_A	692_S	0.973	0.21
268_V	523_F	0.970	0.21
575_M	619_L	0.967	0.21
300_I	379_M	0.967	0.21
63_M	139_F	0.966	0.21
44_V	599_V	0.962	0.20
17_I	663_T	0.958	0.20
395_M	450_T	0.956	0.20
629_F	633_A	0.956	0.20
53_Y	323_W	0.955	0.20
43_S	378_I	0.949	0.20
542_G	676_Y	0.949	0.20
153_I	161_P	0.946	0.20
228_I	504_A	0.945	0.20
179_V	292_V	0.945	0.20
215_I	680_F	0.944	0.20
18_I	45_S	0.943	0.20
22_C	365_I	0.943	0.20
173_M	515_M	0.941	0.20
406_M	460_L	0.941	0.20
17_I	446_Q	0.940	0.20
372_M	504_A	0.940	0.20
69_R	173_M	0.939	0.20
214_F	301_V	0.939	0.20
87_R	246_Y	0.939	0.20
435_V	659_V	0.938	0.20
11_P	16_G	0.937	0.20
18_I	306_E	0.936	0.20
197_T	566_W	0.936	0.20
300_I	520_L	0.935	0.20
473_I	504_A	0.934	0.20
480_V	539_G	0.934	0.20
68_T	207_F	0.933	0.20
56_L	504_A	0.931	0.20
67_P	142_S	0.930	0.20
239_G	631_Y	0.928	0.20
636_Y	650_Q	0.926	0.20
164_I	674_V	0.925	0.19
595_Q	652_A	0.925	0.19
635_Q	645_D	0.925	0.19
433_A	637_K	0.925	0.19
647_T	654_M	0.925	0.19
153_I	608_L	0.919	0.19
517_Q	549_Y	0.918	0.19
17_I	642_N	0.914	0.19
248_G	252_T	0.913	0.19
199_C	387_I	0.912	0.19
18_I	294_V	0.911	0.19
235_I	262_L	0.911	0.19
559_L	653_N	0.909	0.19
39_I	262_L	0.908	0.19
120_L	675_V	0.907	0.19
15_L	526_F	0.907	0.19
10_I	527_L	0.904	0.19
64_K	235_I	0.904	0.19
101_A	447_I	0.902	0.19
151_E	447_I	0.900	0.19
267_F	486_M	0.900	0.19
157_M	669_I	0.898	0.19
316_I	319_T	0.897	0.19
255_D	555_V	0.896	0.19
308_K	388_E	0.895	0.19
237_F	529_K	0.891	0.19
292_V	345_A	0.890	0.19
55_S	535_A	0.889	0.19
331_L	459_V	0.889	0.19
47_Y	492_F	0.888	0.19
450_T	612_T	0.888	0.19
57_Y	61_K	0.887	0.19
44_V	455_G	0.886	0.18
122_L	610_C	0.886	0.18
33_H	306_E	0.886	0.18
195_V	529_K	0.880	0.18
374_S	492_F	0.879	0.18
302_V	475_H	0.879	0.18
35_S	310_P	0.878	0.18
680_F	684_K	0.878	0.18
241_I	461_N	0.877	0.18
53_Y	152_M	0.874	0.18
50_A	253_F	0.873	0.18
101_A	488_F	0.873	0.18
119_T	152_M	0.867	0.18
294_V	546_L	0.866	0.18
270_A	312_M	0.864	0.18
252_T	615_L	0.863	0.18
524_I	528_K	0.863	0.18
347_I	546_L	0.862	0.18
499_L	583_L	0.862	0.18
172_I	346_L	0.861	0.18
136_M	584_G	0.860	0.18
90_L	488_F	0.858	0.18
133_Q	628_G	0.857	0.18
389_P	600_T	0.856	0.18
646_L	651_I	0.856	0.18
369_A	669_I	0.850	0.18
236_Y	454_I	0.850	0.18
654_M	689_V	0.849	0.18
10_I	294_V	0.846	0.17
445_E	448_L	0.846	0.17
26_V	34_I	0.845	0.17
78_D	678_I	0.845	0.17
196_F	200_S	0.843	0.17
259_T	516_L	0.842	0.17
15_L	50_A	0.842	0.17
17_I	698_K	0.841	0.17
18_I	26_V	0.841	0.17
318_G	398_P	0.841	0.17
118_G	469_L	0.841	0.17
435_V	460_L	0.840	0.17
23_L	566_W	0.836	0.17
166_L	170_F	0.833	0.17
355_L	602_V	0.832	0.17
362_A	553_Q	0.832	0.17
49_V	258_I	0.832	0.17
87_R	358_N	0.830	0.17
13_V	471_V	0.830	0.17
239_G	243_H	0.830	0.17
153_I	347_I	0.829	0.17
596_Y	599_V	0.829	0.17
595_Q	637_K	0.829	0.17
119_T	123_L	0.825	0.17
57_Y	596_Y	0.825	0.17
340_V	604_A	0.824	0.17
216_R	251_L	0.824	0.17
662_Y	666_G	0.823	0.17
18_I	233_A	0.821	0.17
356_L	369_A	0.821	0.17
348_S	356_L	0.821	0.17
212_M	223_V	0.821	0.17
185_V	494_I	0.821	0.17
566_W	633_A	0.820	0.17
119_T	460_L	0.820	0.17
161_P	681_Y	0.820	0.17
634_S	641_A	0.819	0.17
646_L	657_I	0.818	0.17
58_I	249_P	0.817	0.17
40_V	137_V	0.817	0.17
348_S	452_K	0.816	0.17
684_K	688_A	0.816	0.17
345_A	683_F	0.814	0.17
166_L	215_I	0.813	0.17
190_E	664_N	0.812	0.17
77_N	372_M	0.812	0.17
540_T	583_L	0.808	0.17
361_D	663_T	0.807	0.17
356_L	476_V	0.807	0.17
661_N	666_G	0.806	0.17
133_Q	571_I	0.806	0.17
525_P	640_I	0.805	0.17
215_I	406_M	0.805	0.17
609_I	641_A	0.804	0.17
170_F	183_I	0.804	0.17
608_L	612_T	0.803	0.16
495_L	532_S	0.803	0.16
23_L	197_T	0.802	0.16
621_S	630_F	0.801	0.16
37_L	301_V	0.800	0.16
170_F	323_W	0.798	0.16
177_L	654_M	0.796	0.16
616_G	672_L	0.796	0.16
86_N	658_V	0.795	0.16
279_A	379_M	0.795	0.16
34_I	306_E	0.794	0.16
271_L	666_G	0.794	0.16
139_F	390_G	0.793	0.16
113_M	327_L	0.792	0.16
157_M	407_P	0.792	0.16
181_A	199_C	0.791	0.16
25_V	34_I	0.789	0.16
362_A	632_M	0.789	0.16
176_I	343_F	0.787	0.16
82_Y	225_V	0.785	0.16
268_V	372_M	0.783	0.16
148_S	175_I	0.783	0.16
474_A	486_M	0.782	0.16
313_T	684_K	0.781	0.16
237_F	261_A	0.780	0.16
686_W	690_R	0.780	0.16
236_Y	348_S	0.779	0.16
142_S	147_A	0.778	0.16
61_K	87_R	0.778	0.16
309_M	385_S	0.775	0.16
512_G	579_V	0.774	0.16
9_H	142_S	0.773	0.16
78_D	400_A	0.773	0.16
459_V	487_G	0.772	0.16
154_K	469_L	0.770	0.16
70_A	522_N	0.767	0.16
170_F	686_W	0.767	0.16
383_A	386_I	0.766	0.16
527_L	532_S	0.766	0.16
74_V	161_P	0.763	0.16
248_G	298_L	0.763	0.16
25_V	602_V	0.763	0.16
646_L	653_N	0.762	0.16
78_D	229_V	0.762	0.16
186_K	255_D	0.762	0.16
46_V	519_L	0.762	0.16
217_P	488_F	0.762	0.16
16_G	49_V	0.761	0.16
152_M	169_C	0.760	0.16
53_Y	259_T	0.760	0.16
153_I	157_M	0.760	0.16
44_V	50_A	0.760	0.16
152_M	587_V	0.759	0.15
20_A	590_K	0.758	0.15
192_P	239_G	0.758	0.15
235_I	697_D	0.758	0.15
225_V	452_K	0.758	0.15
82_Y	700_T	0.758	0.15
74_V	610_C	0.757	0.15
118_G	154_K	0.757	0.15
683_F	687_L	0.755	0.15
137_V	369_A	0.755	0.15
214_F	234_S	0.754	0.15
153_I	681_Y	0.754	0.15
654_M	657_I	0.751	0.15
256_T	355_L	0.748	0.15
457_P	701_P	0.748	0.15
99_A	568_L	0.747	0.15
588_L	646_L	0.746	0.15
292_V	523_F	0.746	0.15
91_F	584_G	0.744	0.15
233_A	680_F	0.744	0.15
559_L	616_G	0.742	0.15
622_T	645_D	0.742	0.15
434_T	437_S	0.740	0.15
16_G	602_V	0.739	0.15
97_A	514_F	0.738	0.15
18_I	542_G	0.737	0.15
174_I	343_F	0.737	0.15
402_L	435_V	0.737	0.15
664_N	668_S	0.736	0.15
331_L	540_T	0.736	0.15
195_V	629_F	0.736	0.15
236_Y	482_P	0.735	0.15
137_V	664_N	0.734	0.15
553_Q	591_M	0.734	0.15
638_E	642_N	0.734	0.15
651_I	654_M	0.733	0.15
186_K	245_P	0.732	0.15
37_L	304_N	0.732	0.15
389_P	550_L	0.731	0.15
431_A	664_N	0.731	0.15
48_L	347_I	0.730	0.15
30_R	311_A	0.730	0.15
692_S	702_Y	0.729	0.15
211_Y	216_R	0.729	0.15
687_L	693_D	0.729	0.15
381_L	656_H	0.728	0.15
656_H	659_V	0.728	0.15
450_T	672_L	0.727	0.15
159_P	684_K	0.727	0.15
9_H	13_V	0.726	0.15
400_A	540_T	0.724	0.15
503_T	576_L	0.724	0.15
198_V	391_L	0.723	0.15
85_T	143_R	0.719	0.15
314_Q	317_D	0.718	0.15
485_D	654_M	0.717	0.15
12_W	15_L	0.716	0.15
630_F	633_A	0.713	0.15
453_D	486_M	0.712	0.14
578_A	653_N	0.711	0.14
34_I	223_V	0.711	0.14
632_M	635_Q	0.711	0.14
147_A	528_K	0.710	0.14
526_F	691_N	0.709	0.14
450_T	486_M	0.709	0.14
659_V	666_G	0.709	0.14
632_M	668_S	0.707	0.14
166_L	198_V	0.707	0.14
16_G	663_T	0.704	0.14
172_I	343_F	0.700	0.14
22_C	623_N	0.699	0.14
46_V	49_V	0.699	0.14
395_M	463_A	0.699	0.14
159_P	586_V	0.698	0.14
170_F	504_A	0.698	0.14
545_G	680_F	0.698	0.14
172_I	176_I	0.698	0.14
145_N	480_V	0.697	0.14
24_A	206_L	0.697	0.14
624_P	628_G	0.695	0.14
207_F	401_G	0.695	0.14
80_L	592_K	0.693	0.14
119_T	170_F	0.693	0.14
139_F	355_L	0.693	0.14
595_Q	666_G	0.692	0.14
35_S	304_N	0.692	0.14
302_V	638_E	0.692	0.14
101_A	505_L	0.691	0.14
326_A	617_L	0.691	0.14
169_C	323_W	0.690	0.14
395_M	624_P	0.689	0.14
559_L	563_K	0.689	0.14
147_A	155_E	0.688	0.14
533_L	537_I	0.688	0.14
78_D	83_V	0.685	0.14
62_V	583_L	0.685	0.14
152_M	511_S	0.685	0.14
454_I	555_V	0.684	0.14
437_S	635_Q	0.683	0.14
65_L	340_V	0.681	0.14
389_P	431_A	0.681	0.14
552_Y	593_R	0.680	0.14
312_M	316_I	0.679	0.14
17_I	655_N	0.679	0.14
13_V	693_D	0.679	0.14
298_L	453_D	0.678	0.14
25_V	214_F	0.677	0.14
635_Q	639_K	0.677	0.14
202_V	261_A	0.677	0.14
452_K	457_P	0.677	0.14
512_G	684_K	0.677	0.14
563_K	643_G	0.677	0.14
128_L	652_A	0.676	0.14
87_R	672_L	0.675	0.14
601_V	605_V	0.674	0.14
139_F	476_V	0.673	0.14
28_L	433_A	0.671	0.14
293_I	372_M	0.670	0.14
243_H	264_G	0.670	0.14
402_L	436_S	0.669	0.14
575_M	674_V	0.669	0.14
639_K	643_G	0.668	0.14
147_A	667_L	0.667	0.14
435_V	633_A	0.666	0.14
388_E	395_M	0.666	0.14
101_A	331_L	0.664	0.14
431_A	517_Q	0.662	0.13
159_P	225_V	0.661	0.13
488_F	505_L	0.660	0.13
133_Q	626_M	0.659	0.13
62_V	234_S	0.658	0.13
270_A	478_H	0.657	0.13
340_V	566_W	0.657	0.13
629_F	659_V	0.656	0.13
383_A	675_V	0.656	0.13
28_L	441_V	0.655	0.13
355_L	476_V	0.655	0.13
241_I	324_K	0.655	0.13
540_T	543_C	0.655	0.13
167_F	698_K	0.654	0.13
347_I	687_L	0.654	0.13
582_V	679_I	0.652	0.13
631_Y	638_E	0.651	0.13
431_A	434_T	0.651	0.13
263_I	564_S	0.650	0.13
139_F	588_L	0.650	0.13
44_V	261_A	0.649	0.13
26_V	463_A	0.649	0.13
532_S	604_A	0.648	0.13
20_A	24_A	0.646	0.13
13_V	298_L	0.646	0.13
39_I	539_G	0.646	0.13
244_D	534_V	0.645	0.13
37_L	525_P	0.645	0.13
166_L	323_W	0.645	0.13
339_A	345_A	0.643	0.13
600_T	629_F	0.643	0.13
400_A	657_I	0.643	0.13
692_S	696_T	0.642	0.13
7_F	45_S	0.642	0.13
372_M	476_V	0.641	0.13
436_S	441_V	0.640	0.13
176_I	583_L	0.640	0.13
629_F	664_N	0.639	0.13
152_M	519_L	0.638	0.13
250_A	659_V	0.638	0.13
169_C	505_L	0.636	0.13
595_Q	677_S	0.636	0.13
26_V	634_S	0.635	0.13
200_S	391_L	0.634	0.13
235_I	527_L	0.634	0.13
28_L	619_L	0.633	0.13
25_V	29_R	0.633	0.13
536_G	621_S	0.632	0.13
173_M	222_E	0.629	0.13
633_A	637_K	0.629	0.13
207_F	662_Y	0.629	0.13
74_V	122_L	0.629	0.13
123_L	195_V	0.627	0.13
176_I	478_H	0.627	0.13
22_C	695_R	0.627	0.13
608_L	676_Y	0.627	0.13
145_N	195_V	0.626	0.13
633_A	659_V	0.626	0.13
347_I	593_R	0.626	0.13
262_L	378_I	0.624	0.13
34_I	313_T	0.624	0.13
431_A	629_F	0.623	0.13
9_H	16_G	0.623	0.13
486_M	540_T	0.623	0.13
247_W	659_V	0.623	0.13
49_V	405_T	0.622	0.13
242_A	488_F	0.621	0.13
118_G	315_Y	0.620	0.13
634_S	637_K	0.620	0.13
17_I	207_F	0.618	0.13
638_E	644_T	0.618	0.13
386_I	667_L	0.618	0.13
478_H	482_P	0.618	0.13
222_E	515_M	0.618	0.13
139_F	286_T	0.618	0.13
22_C	704_P	0.617	0.13
99_A	304_N	0.617	0.13
63_M	68_T	0.616	0.13
512_G	584_G	0.616	0.13
172_I	611_T	0.615	0.13
459_V	488_F	0.615	0.13
127_V	665_A	0.615	0.13
450_T	475_H	0.615	0.13
33_H	602_V	0.615	0.13
39_I	170_F	0.613	0.13
225_V	605_V	0.613	0.13
440_F	664_N	0.613	0.13
190_E	457_P	0.612	0.13
231_L	611_T	0.612	0.13
139_F	517_Q	0.611	0.13
126_V	447_I	0.610	0.12
589_I	600_T	0.610	0.12
331_L	681_Y	0.609	0.12
74_V	463_A	0.609	0.12
22_C	36_A	0.607	0.12
442_I	459_V	0.605	0.12
101_A	196_F	0.605	0.12
122_L	262_L	0.604	0.12
115_Y	458_S	0.604	0.12
388_E	452_K	0.604	0.12
589_I	594_T	0.603	0.12
313_T	318_G	0.601	0.12
198_V	592_K	0.600	0.12
77_N	575_M	0.600	0.12
13_V	658_V	0.600	0.12
188_L	468_T	0.599	0.12
176_I	626_M	0.599	0.12
430_H	435_V	0.599	0.12
197_T	340_V	0.599	0.12
157_M	174_I	0.599	0.12
259_T	356_L	0.597	0.12
70_A	295_G	0.597	0.12
19_G	22_C	0.596	0.12
49_V	253_F	0.596	0.12
189_A	663_T	0.595	0.12
140_I	584_G	0.595	0.12
647_T	652_A	0.594	0.12
453_D	677_S	0.594	0.12
63_M	165_A	0.593	0.12
57_Y	599_V	0.593	0.12
99_A	505_L	0.593	0.12
29_R	537_I	0.591	0.12
458_S	461_N	0.591	0.12
157_M	264_G	0.589	0.12
157_M	186_K	0.588	0.12
151_E	186_K	0.587	0.12
474_A	607_L	0.587	0.12
167_F	170_F	0.587	0.12
164_I	604_A	0.587	0.12
452_K	625_Q	0.587	0.12
120_L	433_A	0.586	0.12
249_P	596_Y	0.586	0.12
572_S	599_V	0.586	0.12
75_I	80_L	0.586	0.12
90_L	365_I	0.585	0.12
157_M	512_G	0.585	0.12
504_A	572_S	0.585	0.12
61_K	82_Y	0.585	0.12
645_D	650_Q	0.585	0.12
248_G	550_L	0.584	0.12
77_N	355_L	0.583	0.12
261_A	357_A	0.583	0.12
258_I	695_R	0.583	0.12
30_R	119_T	0.582	0.12
194_G	468_T	0.582	0.12
198_V	347_I	0.582	0.12
530_T	536_G	0.582	0.12
171_L	358_N	0.580	0.12
383_A	539_G	0.580	0.12
128_L	477_F	0.580	0.12
431_A	552_Y	0.580	0.12
566_W	607_L	0.579	0.12
171_L	542_G	0.579	0.12
583_L	681_Y	0.579	0.12
226_I	248_G	0.577	0.12
74_V	532_S	0.577	0.12
263_I	308_K	0.577	0.12
7_F	642_N	0.576	0.12
588_L	593_R	0.575	0.12
137_V	619_L	0.574	0.12
208_M	488_F	0.574	0.12
226_I	267_F	0.574	0.12
55_S	523_F	0.574	0.12
214_F	381_L	0.573	0.12
46_V	670_L	0.573	0.12
23_L	235_I	0.572	0.12
528_K	673_I	0.571	0.12
25_V	430_H	0.571	0.12
65_L	362_A	0.571	0.12
20_A	386_I	0.570	0.12
171_L	671_F	0.570	0.12
263_I	545_G	0.570	0.12
35_S	587_V	0.569	0.12
41_V	657_I	0.569	0.12
23_L	26_V	0.568	0.12
269_S	278_L	0.568	0.12
230_L	233_A	0.568	0.12
434_T	550_L	0.567	0.12
157_M	583_L	0.567	0.12
198_V	361_D	0.567	0.12
247_W	256_T	0.566	0.12
450_T	463_A	0.566	0.12
154_K	533_L	0.565	0.12
43_S	174_I	0.565	0.12
101_A	667_L	0.565	0.12
99_A	514_F	0.563	0.12
179_V	504_A	0.563	0.12
559_L	624_P	0.563	0.12
357_A	678_I	0.563	0.12
437_S	683_F	0.562	0.12
64_K	268_V	0.562	0.12
47_Y	84_P	0.562	0.12
163_T	484_A	0.562	0.12
177_L	681_Y	0.561	0.12
257_T	261_A	0.561	0.12
383_A	530_T	0.560	0.12
563_K	631_Y	0.560	0.12
76_N	542_G	0.560	0.12
46_V	74_V	0.559	0.12
153_I	640_I	0.558	0.12
185_V	439_G	0.557	0.12
42_A	69_R	0.556	0.12
641_A	652_A	0.556	0.12
26_V	401_G	0.556	0.12
124_A	184_V	0.555	0.12
177_L	299_G	0.555	0.12
271_L	537_I	0.555	0.12
279_A	355_L	0.555	0.12
443_S	446_Q	0.555	0.12
589_I	668_S	0.555	0.12
387_I	430_H	0.555	0.12
75_I	258_I	0.554	0.11
66_D	517_Q	0.553	0.11
446_Q	623_N	0.552	0.11
492_F	520_L	0.552	0.11
88_Y	566_W	0.552	0.11
176_I	301_V	0.552	0.11
343_F	576_L	0.551	0.11
161_P	235_I	0.551	0.11
167_F	523_F	0.551	0.11
686_W	689_V	0.550	0.11
666_G	669_I	0.550	0.11
60_Q	142_S	0.548	0.11
473_I	675_V	0.548	0.11
145_N	234_S	0.547	0.11
247_W	644_T	0.547	0.11
109_L	544_V	0.547	0.11
239_G	388_E	0.547	0.11
174_I	237_F	0.546	0.11
206_L	243_H	0.546	0.11
87_R	135_F	0.545	0.11
34_I	572_S	0.545	0.11
402_L	430_H	0.545	0.11
225_V	480_V	0.545	0.11
181_A	586_V	0.545	0.11
532_S	539_G	0.545	0.11
685_T	696_T	0.544	0.11
649_Q	654_M	0.543	0.11
245_P	641_A	0.543	0.11
168_G	331_L	0.542	0.11
210_I	244_D	0.542	0.11
378_I	391_L	0.542	0.11
540_T	681_Y	0.542	0.11
659_V	664_N	0.542	0.11
152_M	166_L	0.542	0.11
225_V	292_V	0.542	0.11
129_A	528_K	0.541	0.11
70_A	703_V	0.541	0.11
360_T	442_I	0.541	0.11
232_V	702_Y	0.541	0.11
39_I	608_L	0.540	0.11
668_S	672_L	0.540	0.11
233_A	299_G	0.540	0.11
225_V	293_I	0.539	0.11
369_A	661_N	0.537	0.11
204_I	562_V	0.537	0.11
270_A	486_M	0.536	0.11
395_M	631_Y	0.536	0.11
358_N	592_K	0.536	0.11
206_L	407_P	0.536	0.11
35_S	135_F	0.535	0.11
622_T	641_A	0.535	0.11
67_P	592_K	0.534	0.11
197_T	607_L	0.534	0.11
234_S	546_L	0.534	0.11
219_R	674_V	0.533	0.11
113_M	331_L	0.533	0.11
390_G	517_Q	0.531	0.11
263_I	677_S	0.531	0.11
615_L	661_N	0.531	0.11
292_V	504_A	0.531	0.11
516_L	539_G	0.529	0.11
308_K	446_Q	0.529	0.11
46_V	369_A	0.529	0.11
248_G	664_N	0.528	0.11
70_A	151_E	0.528	0.11
19_G	171_L	0.527	0.11
244_D	704_P	0.525	0.11
296_L	628_G	0.524	0.11
636_Y	643_G	0.524	0.11
14_I	207_F	0.524	0.11
197_T	316_I	0.524	0.11
123_L	625_Q	0.523	0.11
237_F	592_K	0.523	0.11
17_I	20_A	0.522	0.11
390_G	440_F	0.522	0.11
153_I	295_G	0.521	0.11
435_V	440_F	0.521	0.11
356_L	437_S	0.521	0.11
219_R	229_V	0.519	0.11
18_I	67_P	0.518	0.11
234_S	356_L	0.518	0.11
446_Q	450_T	0.518	0.11
495_L	543_C	0.518	0.11
11_P	61_K	0.518	0.11
153_I	542_G	0.517	0.11
186_K	468_T	0.517	0.11
188_L	224_S	0.517	0.11
151_E	621_S	0.517	0.11
486_M	672_L	0.516	0.11
74_V	604_A	0.516	0.11
182_L	250_A	0.515	0.11
15_L	609_I	0.515	0.11
13_V	16_G	0.515	0.11
169_C	540_T	0.515	0.11
346_L	576_L	0.514	0.11
495_L	604_A	0.514	0.11
189_A	468_T	0.514	0.11
431_A	438_W	0.513	0.11
152_M	499_L	0.513	0.11
25_V	653_N	0.513	0.11
53_Y	183_I	0.513	0.11
69_R	222_E	0.513	0.11
169_C	690_R	0.513	0.11
323_W	528_K	0.513	0.11
453_D	457_P	0.513	0.11
269_S	285_A	0.512	0.11
640_I	692_S	0.512	0.11
70_A	186_K	0.512	0.11
543_C	583_L	0.511	0.11
505_L	511_S	0.510	0.11
226_I	612_T	0.510	0.11
654_M	658_V	0.510	0.11
198_V	528_K	0.510	0.11
253_F	562_V	0.510	0.11
270_A	653_N	0.510	0.11
78_D	292_V	0.509	0.11
585_T	597_I	0.509	0.11
292_V	662_Y	0.508	0.11
395_M	654_M	0.508	0.11
468_T	654_M	0.507	0.11
123_L	639_K	0.507	0.11
635_Q	654_M	0.507	0.11
168_G	516_L	0.506	0.11
177_L	307_L	0.506	0.11
50_A	295_G	0.506	0.11
659_V	662_Y	0.506	0.11
101_A	288_L	0.505	0.11
579_V	640_I	0.505	0.11
259_T	323_W	0.504	0.11
17_I	602_V	0.504	0.11
540_T	642_N	0.504	0.11
625_Q	676_Y	0.504	0.11
303_L	518_D	0.503	0.11
131_A	371_L	0.503	0.11
369_A	382_V	0.503	0.11
375_F	667_L	0.503	0.11
59_A	588_L	0.502	0.11
154_K	531_D	0.502	0.11
566_W	661_N	0.502	0.11
234_S	608_L	0.502	0.11
258_I	473_I	0.502	0.11
564_S	663_T	0.502	0.11
172_I	347_I	0.501	0.11
650_Q	657_I	0.501	0.11
55_S	59_A	0.501	0.11
638_E	656_H	0.500	0.11
389_P	440_F	0.500	0.11
139_F	142_S	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2cfqA	1	0.183	44.8	0.989	Contact Map
2xq2A	2	0.0782	33.4	0.99	Contact Map
2dw3A	1	0.0782	28.4	0.99	Contact Map
4px7A	1	0.1131	26.7	0.99	Contact Map
1pw4A	1	0.1858	18.6	0.991	Contact Map
4pypA	1	0.4539	17.7	0.991	Contact Map
4wgvA	2	0.4497	14.5	0.991	Contact Map
4q65A	1	0.1453	13.3	0.992	Contact Map
4wfeA	2	0.1285	10.5	0.992	Contact Map
3giaA	1	0.0936	10.4	0.992	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0169 seconds.