YEJF - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YEJF - Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein YejF

UniProt:	P33916	Sequences: MTQTLLAIENLSVGFRHQQTVRTVVNDVSLQIEAGETLALVGESGSGKSVTALSILRLLPSPPVEYLSGDIRFHGESLLHASDQTLRGVRGNKIAMIFQEPMVSLNPLHTLEKQLYEVLSLHRGMRREAARGEILNCLDRVGIRQAAKRLTDYPHQLSGGERQRVMIAMALLTRPELLIADEPTTALDVSVQAQILQLLRELQGELNMGMLFITHNLSIVRKLAHRVAVMQNGRCVEQNYAATLFASPTHPYTQKLLNSEPSGDPVPLPEPASTLLDVEQLQVAFPIRKGILKRIVDHNVVVKNISFTLRAGETLGLVGESGSGKSTTGLALLRLINSQGSIIFDGQPLQNLNRRQLLPIRHRIQVVFQDPNSSLNPRLNVLQIIEEGLRVHQPTLSAAQREQQVIAVMHEVGLDPETRHRYPAEFSGGQRQRIAIARALILKPSLIILDEPTSSLDKTVQAQILTLLKSLQQKHQLAYLFISHDLHVVRALCHQVIILRQGEVVEQGPCARVFATPQQEYTRQLLALS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG12041
Length:	529 (455)
Sequences:	181 (151)
Seq/√Len:	7.1

ECOLI - YEJF XYLG ALSA
BACSU - YKOD YKPA YUFO YFMM
SULSO - Y2030 Y1893

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
483_S	489_V	7.856	1.00
36_E	226_R	5.260	0.99
316_G	483_S	5.239	0.99
250_H	253_T	5.094	0.99
39_A	212_F	4.892	0.99
316_G	489_V	4.348	0.98
44_S	330_L	3.936	0.96
448_I	482_I	3.748	0.94
196_L	219_I	3.729	0.94
387_E	392_H	3.434	0.91
9_E	70_D	3.155	0.87
381_V	387_E	2.983	0.83
111_L	165_V	2.925	0.82
52_A	179_I	2.905	0.82
375_L	387_E	2.877	0.81
25_V	51_T	2.801	0.79
316_G	326_S	2.736	0.77
46_S	230_M	2.635	0.75
186_A	431_R	2.584	0.73
329_G	448_I	2.483	0.70
8_I	30_L	2.480	0.70
316_G	493_C	2.469	0.69
411_E	470_S	2.446	0.69
376_N	387_E	2.417	0.68
227_V	439_A	2.398	0.67
227_V	241_A	2.243	0.62
25_V	230_M	2.238	0.61
388_G	392_H	2.236	0.61
25_V	43_E	2.211	0.60
283_V	286_P	2.211	0.60
26_N	234_R	2.164	0.59
141_V	167_I	2.158	0.58
170_A	180_A	2.136	0.58
229_V	237_E	2.129	0.57
115_L	169_M	2.089	0.56
259_S	342_I	2.040	0.54
289_K	292_L	1.984	0.52
372_N	447_I	1.939	0.50
44_S	316_G	1.928	0.50
52_A	213_I	1.925	0.50
313_E	495_Q	1.918	0.49
191_V	452_P	1.872	0.48
237_E	248_P	1.819	0.46
437_A	483_S	1.794	0.45
108_L	257_L	1.759	0.43
200_R	254_Q	1.759	0.43
25_V	40_L	1.756	0.43
106_N	169_M	1.755	0.43
465_L	488_V	1.742	0.43
171_L	436_I	1.740	0.43
25_V	46_S	1.723	0.42
169_M	198_L	1.718	0.42
214_T	220_V	1.716	0.42
44_S	437_A	1.715	0.42
199_L	441_I	1.713	0.41
309_L	315_L	1.696	0.41
327_T	331_A	1.692	0.41
306_S	489_V	1.680	0.40
229_V	253_T	1.671	0.40
56_L	96_M	1.668	0.40
52_A	214_T	1.655	0.39
331_A	342_I	1.653	0.39
287_I	290_G	1.640	0.39
27_D	326_S	1.633	0.39
330_L	483_S	1.624	0.38
342_I	473_Q	1.624	0.38
326_S	405_V	1.621	0.38
218_S	436_I	1.614	0.38
71_I	287_I	1.610	0.38
152_D	191_V	1.580	0.37
229_V	311_A	1.578	0.37
7_A	12_S	1.558	0.36
64_V	299_N	1.555	0.36
285_F	289_K	1.541	0.35
143_I	447_I	1.538	0.35
90_R	455_S	1.530	0.35
258_N	403_Q	1.513	0.34
60_P	180_A	1.509	0.34
382_L	387_E	1.502	0.34
98_F	186_A	1.501	0.34
482_I	488_V	1.496	0.34
385_I	388_G	1.494	0.34
191_V	483_S	1.489	0.33
17_H	177_L	1.480	0.33
366_V	370_D	1.480	0.33
257_L	481_F	1.480	0.33
367_V	488_V	1.475	0.33
46_S	64_V	1.475	0.33
171_L	202_L	1.471	0.33
26_N	327_T	1.460	0.32
192_Q	478_A	1.455	0.32
294_R	338_S	1.439	0.32
367_V	370_D	1.429	0.31
445_S	482_I	1.426	0.31
326_S	483_S	1.426	0.31
449_L	452_P	1.421	0.31
27_D	437_A	1.419	0.31
167_I	464_I	1.410	0.31
226_R	238_Q	1.402	0.31
90_R	430_Q	1.391	0.30
316_G	437_A	1.388	0.30
192_Q	430_Q	1.385	0.30
296_V	437_A	1.382	0.30
175_P	329_G	1.376	0.30
404_Q	443_K	1.369	0.29
155_H	452_P	1.364	0.29
316_G	330_L	1.363	0.29
106_N	472_Q	1.357	0.29
178_L	377_P	1.355	0.29
185_T	455_S	1.342	0.29
323_S	367_V	1.341	0.29
230_M	467_L	1.341	0.29
8_I	445_S	1.339	0.28
219_I	462_A	1.336	0.28
89_V	293_K	1.336	0.28
366_V	371_P	1.336	0.28
75_G	495_Q	1.335	0.28
384_I	387_E	1.326	0.28
253_T	260_E	1.320	0.28
363_R	445_S	1.318	0.28
165_V	381_V	1.318	0.28
178_L	339_Q	1.315	0.28
383_Q	387_E	1.310	0.28
100_E	114_Q	1.308	0.28
50_V	214_T	1.307	0.27
129_A	473_Q	1.306	0.27
409_M	446_L	1.305	0.27
327_T	336_I	1.297	0.27
40_L	305_I	1.287	0.27
381_V	472_Q	1.279	0.27
296_V	330_L	1.279	0.27
207_N	375_L	1.278	0.27
241_A	257_L	1.275	0.27
100_E	185_T	1.274	0.26
367_V	426_F	1.273	0.26
166_M	333_L	1.272	0.26
90_R	185_T	1.267	0.26
175_P	412_V	1.255	0.26
280_Q	291_I	1.247	0.26
156_Q	436_I	1.240	0.25
327_T	385_I	1.236	0.25
375_L	392_H	1.233	0.25
193_A	323_S	1.232	0.25
23_T	494_H	1.226	0.25
54_S	453_T	1.220	0.25
50_V	220_V	1.213	0.25
10_N	317_L	1.208	0.25
227_V	257_L	1.205	0.24
445_S	448_I	1.205	0.24
97_I	301_V	1.193	0.24
159_G	215_H	1.188	0.24
66_Y	380_N	1.186	0.24
489_V	493_C	1.181	0.24
39_A	90_R	1.174	0.24
236_V	253_T	1.170	0.23
72_R	197_Q	1.169	0.23
387_E	390_R	1.167	0.23
72_R	79_L	1.166	0.23
46_S	473_Q	1.164	0.23
6_L	11_L	1.163	0.23
228_A	235_C	1.160	0.23
161_E	449_L	1.160	0.23
291_I	332_L	1.160	0.23
467_L	499_L	1.160	0.23
171_L	230_M	1.158	0.23
208_M	483_S	1.157	0.23
405_V	459_T	1.154	0.23
381_V	426_F	1.152	0.23
162_R	220_V	1.145	0.23
240_Y	337_N	1.140	0.23
376_N	385_I	1.138	0.23
116_Y	134_I	1.137	0.23
141_V	436_I	1.135	0.23
285_F	292_L	1.130	0.22
411_E	467_L	1.128	0.22
50_V	185_T	1.126	0.22
483_S	493_C	1.123	0.22
320_E	364_I	1.121	0.22
170_A	453_T	1.117	0.22
302_V	426_F	1.112	0.22
217_L	491_A	1.107	0.22
96_M	426_F	1.105	0.22
178_L	194_Q	1.104	0.22
8_I	11_L	1.098	0.22
381_V	388_G	1.096	0.21
171_L	439_A	1.094	0.21
383_Q	390_R	1.087	0.21
301_V	482_I	1.087	0.21
376_N	388_G	1.085	0.21
285_F	308_T	1.081	0.21
381_V	385_I	1.076	0.21
461_Q	488_V	1.076	0.21
30_L	425_E	1.074	0.21
368_F	371_P	1.070	0.21
30_L	133_E	1.070	0.21
98_F	431_R	1.067	0.21
375_L	388_G	1.066	0.21
209_G	489_V	1.066	0.21
71_I	251_P	1.062	0.21
143_I	412_V	1.061	0.21
142_G	482_I	1.061	0.21
90_R	175_P	1.061	0.21
179_I	465_L	1.059	0.21
58_L	96_M	1.048	0.20
230_M	413_G	1.046	0.20
154_P	211_L	1.045	0.20
90_R	100_E	1.043	0.20
376_N	390_R	1.038	0.20
141_V	461_Q	1.036	0.20
205_E	494_H	1.034	0.20
114_Q	252_Y	1.025	0.20
201_E	411_E	1.023	0.20
53_L	366_V	1.017	0.20
317_L	422_Y	1.015	0.19
413_G	463_Q	1.012	0.19
99_Q	182_E	1.008	0.19
25_V	155_H	1.008	0.19
93_K	176_E	1.007	0.19
285_F	293_K	1.003	0.19
385_I	392_H	1.003	0.19
309_L	426_F	1.001	0.19
105_L	428_G	1.000	0.19
412_V	431_R	1.000	0.19
375_L	383_Q	0.994	0.19
384_I	388_G	0.991	0.19
185_T	225_H	0.987	0.19
174_R	412_V	0.985	0.19
234_R	279_E	0.985	0.19
56_L	424_A	0.984	0.19
10_N	29_S	0.977	0.19
339_Q	342_I	0.976	0.19
242_A	342_I	0.975	0.19
333_L	364_I	0.971	0.18
56_L	179_I	0.968	0.18
197_Q	343_I	0.965	0.18
15_F	25_V	0.963	0.18
162_R	452_P	0.959	0.18
144_R	381_V	0.959	0.18
169_M	472_Q	0.957	0.18
114_Q	387_E	0.957	0.18
92_N	344_F	0.956	0.18
292_L	295_I	0.955	0.18
90_R	224_A	0.954	0.18
422_Y	425_E	0.949	0.18
71_I	443_K	0.949	0.18
54_S	161_E	0.948	0.18
31_Q	498_I	0.942	0.18
380_N	388_G	0.941	0.18
82_S	85_T	0.939	0.18
376_N	381_V	0.938	0.18
28_V	295_I	0.936	0.18
157_L	296_V	0.936	0.18
385_I	389_L	0.935	0.18
175_P	431_R	0.935	0.18
294_R	331_A	0.933	0.18
32_I	173_T	0.930	0.17
102_M	191_V	0.930	0.17
41_V	372_N	0.929	0.17
434_I	446_L	0.926	0.17
53_L	172_L	0.926	0.17
315_L	479_Y	0.921	0.17
366_V	448_I	0.921	0.17
405_V	497_I	0.919	0.17
137_C	178_L	0.915	0.17
134_I	412_V	0.912	0.17
304_N	389_L	0.911	0.17
51_T	477_L	0.911	0.17
87_R	482_I	0.910	0.17
241_A	467_L	0.909	0.17
321_S	340_G	0.908	0.17
448_I	488_V	0.908	0.17
439_A	447_I	0.908	0.17
249_T	406_I	0.907	0.17
126_R	436_I	0.907	0.17
328_T	493_C	0.907	0.17
13_V	28_V	0.901	0.17
367_V	371_P	0.894	0.17
99_Q	181_D	0.893	0.17
31_Q	280_Q	0.892	0.17
106_N	198_L	0.891	0.17
36_E	64_V	0.887	0.17
235_C	439_A	0.886	0.17
54_S	229_V	0.885	0.17
236_V	466_T	0.885	0.17
160_G	182_E	0.884	0.16
182_E	433_R	0.884	0.16
50_V	455_S	0.883	0.16
431_R	441_I	0.882	0.16
99_Q	160_G	0.880	0.16
99_Q	433_R	0.880	0.16
97_I	166_M	0.880	0.16
417_E	480_L	0.879	0.16
152_D	452_P	0.879	0.16
212_F	442_L	0.876	0.16
181_D	433_R	0.876	0.16
160_G	181_D	0.876	0.16
232_N	236_V	0.876	0.16
135_L	417_E	0.876	0.16
289_K	307_F	0.875	0.16
302_V	499_L	0.872	0.16
199_L	431_R	0.871	0.16
287_I	292_L	0.870	0.16
30_L	72_R	0.868	0.16
117_E	446_L	0.867	0.16
160_G	433_R	0.867	0.16
320_E	423_P	0.864	0.16
53_L	482_I	0.863	0.16
32_I	214_T	0.862	0.16
376_N	392_H	0.860	0.16
65_E	97_I	0.858	0.16
239_N	245_F	0.857	0.16
44_S	483_S	0.857	0.16
154_P	435_A	0.857	0.16
257_L	260_E	0.857	0.16
50_V	100_E	0.855	0.16
185_T	449_L	0.855	0.16
454_S	481_F	0.852	0.16
30_L	485_D	0.851	0.16
50_V	161_E	0.851	0.16
50_V	330_L	0.850	0.16
199_L	408_V	0.850	0.16
290_G	294_R	0.849	0.16
483_S	494_H	0.848	0.16
84_Q	478_A	0.847	0.16
162_R	185_T	0.845	0.16
177_L	425_E	0.845	0.16
318_V	489_V	0.845	0.16
66_Y	410_H	0.841	0.16
309_L	434_I	0.841	0.16
161_E	455_S	0.840	0.16
41_V	458_K	0.840	0.16
311_A	415_D	0.838	0.16
381_V	392_H	0.838	0.16
210_M	494_H	0.838	0.16
281_L	291_I	0.835	0.15
133_E	236_V	0.833	0.15
28_V	94_I	0.830	0.15
10_N	244_L	0.830	0.15
104_S	331_A	0.826	0.15
437_A	467_L	0.822	0.15
99_Q	215_H	0.821	0.15
40_L	51_T	0.820	0.15
159_G	163_Q	0.819	0.15
244_L	248_P	0.818	0.15
163_Q	215_H	0.817	0.15
40_L	483_S	0.817	0.15
248_P	454_S	0.817	0.15
213_I	220_V	0.814	0.15
185_T	329_G	0.811	0.15
168_A	461_Q	0.810	0.15
90_R	186_A	0.809	0.15
142_G	254_Q	0.807	0.15
44_S	196_L	0.806	0.15
111_L	178_L	0.804	0.15
291_I	306_S	0.804	0.15
91_G	180_A	0.804	0.15
53_L	329_G	0.803	0.15
409_M	443_K	0.802	0.15
345_D	405_V	0.802	0.15
318_V	486_L	0.801	0.15
88_G	136_N	0.799	0.15
118_V	152_D	0.799	0.15
228_A	309_L	0.799	0.15
479_Y	497_I	0.795	0.15
100_E	186_A	0.795	0.15
41_V	437_A	0.792	0.15
50_V	114_Q	0.789	0.15
300_V	311_A	0.789	0.15
165_V	460_V	0.787	0.15
186_A	430_Q	0.786	0.15
209_G	465_L	0.784	0.14
44_S	296_V	0.783	0.14
94_I	177_L	0.781	0.14
153_Y	465_L	0.780	0.14
50_V	90_R	0.779	0.14
96_M	111_L	0.778	0.14
144_R	460_V	0.773	0.14
109_H	166_M	0.773	0.14
331_A	462_A	0.772	0.14
392_H	434_I	0.772	0.14
99_Q	159_G	0.772	0.14
221_R	260_E	0.770	0.14
365_Q	370_D	0.769	0.14
288_R	467_L	0.769	0.14
440_L	446_L	0.768	0.14
169_M	452_P	0.766	0.14
92_N	304_N	0.763	0.14
73_F	95_A	0.762	0.14
53_L	185_T	0.758	0.14
162_R	330_L	0.757	0.14
117_E	478_A	0.753	0.14
301_V	367_V	0.752	0.14
90_R	431_R	0.752	0.14
51_T	162_R	0.751	0.14
208_M	316_G	0.751	0.14
401_R	459_T	0.749	0.14
71_I	459_T	0.748	0.14
472_Q	479_Y	0.744	0.14
100_E	213_I	0.743	0.14
257_L	462_A	0.741	0.14
248_P	261_P	0.741	0.14
90_R	225_H	0.741	0.14
107_P	321_S	0.740	0.14
173_T	244_L	0.739	0.14
331_A	338_S	0.739	0.14
165_V	483_S	0.738	0.14
162_R	191_V	0.737	0.14
379_L	384_I	0.737	0.14
114_Q	185_T	0.736	0.14
367_V	449_L	0.735	0.14
64_V	327_T	0.732	0.14
191_V	489_V	0.732	0.14
32_I	208_M	0.731	0.13
449_L	455_S	0.727	0.13
239_N	244_L	0.727	0.13
152_D	168_A	0.726	0.13
40_L	44_S	0.725	0.13
58_L	222_K	0.723	0.13
88_G	380_N	0.723	0.13
37_T	203_Q	0.723	0.13
280_Q	415_D	0.723	0.13
71_I	81_A	0.721	0.13
159_G	164_R	0.720	0.13
473_Q	494_H	0.717	0.13
211_L	317_L	0.716	0.13
9_E	145_Q	0.715	0.13
250_H	417_E	0.711	0.13
100_E	109_H	0.711	0.13
294_R	327_T	0.710	0.13
86_L	257_L	0.710	0.13
199_L	261_P	0.710	0.13
37_T	78_L	0.709	0.13
24_V	315_L	0.708	0.13
367_V	372_N	0.708	0.13
213_I	449_L	0.707	0.13
129_A	282_Q	0.703	0.13
193_A	298_H	0.701	0.13
285_F	290_G	0.700	0.13
161_E	259_S	0.697	0.13
179_I	461_Q	0.697	0.13
50_V	162_R	0.697	0.13
72_R	305_I	0.697	0.13
100_E	431_R	0.692	0.13
282_Q	317_L	0.691	0.13
65_E	90_R	0.690	0.13
217_L	477_L	0.690	0.13
188_D	432_Q	0.690	0.13
141_V	210_M	0.690	0.13
67_L	149_R	0.686	0.13
50_V	449_L	0.685	0.13
164_R	215_H	0.684	0.13
196_L	200_R	0.682	0.13
208_M	289_K	0.680	0.13
41_V	245_F	0.680	0.13
175_P	430_Q	0.680	0.13
37_T	202_L	0.679	0.13
212_F	477_L	0.677	0.13
218_S	380_N	0.676	0.13
100_E	455_S	0.672	0.12
300_V	497_I	0.672	0.12
301_V	464_I	0.670	0.12
182_E	215_H	0.669	0.12
124_G	480_L	0.668	0.12
6_L	178_L	0.668	0.12
236_V	309_L	0.665	0.12
127_R	478_A	0.664	0.12
61_S	222_K	0.663	0.12
134_I	478_A	0.663	0.12
330_L	449_L	0.662	0.12
161_E	213_I	0.661	0.12
128_E	403_Q	0.661	0.12
138_L	210_M	0.656	0.12
86_L	327_T	0.655	0.12
36_E	71_I	0.654	0.12
326_S	404_Q	0.652	0.12
225_H	455_S	0.648	0.12
25_V	36_E	0.648	0.12
12_S	15_F	0.648	0.12
134_I	455_S	0.646	0.12
50_V	213_I	0.646	0.12
24_V	403_Q	0.645	0.12
124_G	326_S	0.644	0.12
192_Q	219_I	0.644	0.12
12_S	28_V	0.644	0.12
344_F	364_I	0.643	0.12
403_Q	410_H	0.643	0.12
410_H	470_S	0.643	0.12
377_P	462_A	0.642	0.12
434_I	474_K	0.640	0.12
233_G	256_L	0.640	0.12
75_G	94_I	0.639	0.12
162_R	455_S	0.639	0.12
346_G	405_V	0.638	0.12
249_T	474_K	0.636	0.12
364_I	446_L	0.632	0.12
278_V	281_L	0.631	0.12
6_L	259_S	0.631	0.12
50_V	65_E	0.631	0.12
330_L	367_V	0.627	0.12
254_Q	487_H	0.626	0.12
274_T	277_D	0.626	0.12
7_A	308_T	0.625	0.12
181_D	215_H	0.623	0.12
128_E	132_G	0.623	0.12
50_V	225_H	0.623	0.12
33_E	402_E	0.622	0.12
161_E	185_T	0.621	0.12
215_H	433_R	0.621	0.12
160_G	215_H	0.621	0.12
169_M	478_A	0.621	0.12
78_L	81_A	0.618	0.12
36_E	108_L	0.618	0.12
221_R	434_I	0.618	0.12
159_G	181_D	0.616	0.12
105_L	321_S	0.616	0.12
194_Q	465_L	0.614	0.12
27_D	44_S	0.613	0.12
200_R	209_G	0.612	0.11
30_L	424_A	0.611	0.11
73_F	492_L	0.610	0.11
91_G	313_E	0.608	0.11
159_G	182_E	0.608	0.11
278_V	405_V	0.608	0.11
177_L	480_L	0.607	0.11
300_V	341_S	0.607	0.11
191_V	316_G	0.607	0.11
314_T	381_V	0.607	0.11
296_V	316_G	0.606	0.11
205_E	476_Q	0.606	0.11
42_G	48_K	0.606	0.11
45_G	48_K	0.606	0.11
42_G	47_G	0.606	0.11
42_G	45_G	0.606	0.11
49_S	461_Q	0.604	0.11
39_A	50_V	0.603	0.11
58_L	425_E	0.602	0.11
186_A	329_G	0.602	0.11
153_Y	461_Q	0.600	0.11
70_D	116_Y	0.599	0.11
166_M	187_L	0.598	0.11
229_V	248_P	0.598	0.11
121_L	219_I	0.598	0.11
104_S	192_Q	0.596	0.11
58_L	141_V	0.595	0.11
175_P	244_L	0.591	0.11
255_K	497_I	0.591	0.11
366_V	426_F	0.590	0.11
171_L	449_L	0.587	0.11
327_T	489_V	0.587	0.11
198_L	326_S	0.586	0.11
90_R	130_A	0.586	0.11
52_A	228_A	0.586	0.11
103_V	320_E	0.585	0.11
103_V	171_L	0.584	0.11
97_I	431_R	0.584	0.11
159_G	433_R	0.583	0.11
143_I	186_A	0.582	0.11
262_S	411_E	0.581	0.11
289_K	293_K	0.579	0.11
65_E	225_H	0.579	0.11
244_L	341_S	0.578	0.11
185_T	430_Q	0.578	0.11
479_Y	493_C	0.577	0.11
283_V	287_I	0.574	0.11
109_H	185_T	0.573	0.11
114_Q	162_R	0.571	0.11
115_L	189_V	0.570	0.11
326_S	493_C	0.570	0.11
177_L	346_G	0.569	0.11
362_H	434_I	0.568	0.11
33_E	238_Q	0.567	0.11
243_T	471_L	0.566	0.11
106_N	482_I	0.566	0.11
219_I	313_E	0.566	0.11
100_E	225_H	0.565	0.11
382_L	420_H	0.565	0.11
51_T	452_P	0.565	0.11
79_L	82_S	0.565	0.11
177_L	290_G	0.564	0.11
329_G	431_R	0.564	0.11
258_N	478_A	0.563	0.11
203_Q	471_L	0.563	0.11
442_L	488_V	0.563	0.11
114_Q	418_T	0.563	0.11
8_I	86_L	0.563	0.11
39_A	224_A	0.563	0.11
250_H	255_K	0.561	0.11
65_E	114_Q	0.561	0.11
185_T	301_V	0.560	0.11
295_I	307_F	0.559	0.11
230_M	249_T	0.558	0.11
469_K	489_V	0.558	0.11
275_L	287_I	0.558	0.11
83_D	304_N	0.556	0.11
187_L	220_V	0.554	0.11
107_P	229_V	0.553	0.11
13_V	60_P	0.552	0.11
236_V	440_L	0.551	0.11
279_E	285_F	0.551	0.11
191_V	208_M	0.551	0.11
97_I	186_A	0.550	0.11
201_E	439_A	0.550	0.11
49_S	261_P	0.550	0.11
421_R	453_T	0.550	0.11
219_I	327_T	0.550	0.11
379_L	387_E	0.549	0.11
210_M	437_A	0.548	0.11
111_L	311_A	0.547	0.11
136_N	341_S	0.546	0.10
29_S	319_G	0.546	0.10
111_L	434_I	0.543	0.10
375_L	390_R	0.543	0.10
169_M	482_I	0.542	0.10
333_L	426_F	0.541	0.10
49_S	161_E	0.541	0.10
142_G	198_L	0.541	0.10
101_P	186_A	0.541	0.10
115_L	168_A	0.541	0.10
486_L	493_C	0.541	0.10
250_H	422_Y	0.540	0.10
78_L	94_I	0.539	0.10
250_H	294_R	0.537	0.10
27_D	257_L	0.536	0.10
218_S	315_L	0.536	0.10
66_Y	132_G	0.536	0.10
231_Q	413_G	0.535	0.10
386_E	424_A	0.535	0.10
190_S	493_C	0.534	0.10
69_G	143_I	0.534	0.10
155_H	464_I	0.533	0.10
462_A	488_V	0.532	0.10
250_H	260_E	0.532	0.10
70_D	497_I	0.531	0.10
330_L	455_S	0.531	0.10
136_N	255_K	0.531	0.10
186_A	455_S	0.530	0.10
165_V	464_I	0.529	0.10
13_V	228_A	0.528	0.10
141_V	169_M	0.527	0.10
102_M	385_I	0.526	0.10
118_V	141_V	0.526	0.10
314_T	331_A	0.524	0.10
437_A	477_L	0.524	0.10
27_D	296_V	0.523	0.10
412_V	418_T	0.523	0.10
43_E	299_N	0.522	0.10
97_I	455_S	0.522	0.10
118_V	482_I	0.521	0.10
16_R	246_A	0.521	0.10
176_E	281_L	0.520	0.10
111_L	494_H	0.520	0.10
364_I	479_Y	0.518	0.10
296_V	483_S	0.517	0.10
230_M	497_I	0.517	0.10
260_E	310_R	0.516	0.10
255_K	462_A	0.516	0.10
153_Y	435_A	0.515	0.10
34_A	372_N	0.515	0.10
157_L	428_G	0.514	0.10
431_R	454_S	0.513	0.10
262_S	327_T	0.512	0.10
9_E	305_I	0.512	0.10
129_A	305_I	0.512	0.10
169_M	175_P	0.512	0.10
286_P	298_H	0.510	0.10
293_K	306_S	0.509	0.10
381_V	384_I	0.508	0.10
90_R	330_L	0.507	0.10
173_T	285_F	0.506	0.10
230_M	414_L	0.506	0.10
7_A	416_P	0.505	0.10
116_Y	333_L	0.505	0.10
133_E	243_T	0.504	0.10
46_S	307_F	0.503	0.10
37_T	464_I	0.502	0.10
375_L	431_R	0.502	0.10
84_Q	300_V	0.502	0.10
114_Q	455_S	0.501	0.10
8_I	140_R	0.501	0.10
157_L	168_A	0.501	0.10
6_L	294_R	0.500	0.10
242_A	441_I	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4finA	2	0.8885	100	0.495	Contact Map
4q9hA	1	0.9206	100	0.497	Contact Map
4f4cA	1	0.8922	100	0.508	Contact Map
1yqtA	1	0.8847	100	0.524	Contact Map
3ux8A	2	0.8091	100	0.527	Contact Map
2iw3A	2	0.8412	100	0.528	Contact Map
3bk7A	1	0.8828	100	0.529	Contact Map
3ozxA	1	0.8677	100	0.534	Contact Map
3j16B	1	0.8866	100	0.535	Contact Map
2vf7A	2	0.9112	100	0.593	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0134 seconds.