NUOG - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

NUOG - NADH-quinone oxidoreductase subunit G

UniProt:	P33602	Sequences: MATIHVDGKEYEVNGADNLLEACLSLGLDIPYFCWHPALGSVGACRQCAVKQYQNAEDTRGRLVMSCMTPASDGTFISIDDEEAKQFRESVVEWLMTNHPHDCPVCEEGGNCHLQDMTVMTGHSFRRYRFTKRTHRNQDLGPFISHEMNRCIACYRCVRYYKDYADGTDLGVYGAHDNVYFGRPEDGTLESEFSGNLVEICPTGVFTDKTHSERYNRKWDMQFAPSICQQCSIGCNISPGERYGELRRIENRYNGTVNHYFLCDRGRFGYGYVNLKDRPRQPVQRRGDDFITLNAEQAMQGAADILRQSKKVIGIGSPRASVESNFALRELVGEENFYTGIAHGEQERLQLALKVLREGGIYTPALREIESYDAVLVLGEDVTQTGARVALAVRQAVKGKAREMAAAQKVADWQIAAILNIGQRAKHPLFVTNVDDTRLDDIAAWTYRAPVEDQARLGFAIAHALDNSAPAVDGIEPELQSKIDVIVQALAGAKKPLIISGTNAGSLEVIQAAANVAKALKGRGADVGITMIARSVNSMGLGIMGGGSLEEALTELETGRADAVVVLENDLHRHASAIRVNAALAKAPLVMVVDHQRTAIMENAHLVLSAASFAESDGTVINNEGRAQRFFQVYDPAYYDSKTVMLESWRWLHSLHSTLLSREVDWTQLDHVIDAVVAKIPELAGIKDAAPDATFRIRGQKLAREPHRYSGRTAMRANISVHEPRQPQDIDTMFTFSMEGNNQPTAHRSQVPFAWAPGWNSPQAWNKFQDEVGGKLRFGDPGVRLFETSENGLDYFTSVPARFQPQDGKWRIAPYYHLFGSDELSQRAPVFQSRMPQPYIKLNPADAAKLGVNAGTRVSFSYDGNTVTLPVEIAEGLTAGQVGLPMGMSGIAPVLAGAHLEDLKEAQQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG12087
Length:	908 (690)
Sequences:	1070 (523)
Seq/√Len:	19.9

ECOLI - NUOG
BACSU - YJGC FDHL
SULSO - Q97V13

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
338_Y	342_A	4.612	1.00
300_Q	658_T	4.574	1.00
281_Q	292_T	4.492	1.00
333_G	342_A	4.434	1.00
333_G	338_Y	4.328	1.00
333_G	340_G	4.319	1.00
627_A	686_I	4.310	1.00
286_R	291_I	4.274	1.00
333_G	336_N	4.131	1.00
335_E	338_Y	3.985	1.00
335_E	342_A	3.919	1.00
333_G	337_F	3.874	1.00
337_F	342_A	3.850	1.00
306_L	591_M	3.848	1.00
587_A	590_V	3.784	1.00
336_N	340_G	3.513	1.00
336_N	342_A	3.506	1.00
337_F	340_G	3.468	1.00
342_A	345_E	3.459	1.00
335_E	340_G	3.356	1.00
299_M	658_T	3.305	1.00
224_A	241_E	3.295	1.00
305_I	308_Q	3.182	1.00
340_G	345_E	3.158	0.99
333_G	343_H	3.118	0.99
333_G	341_I	3.107	0.99
342_A	346_Q	3.071	0.99
17_D	25_S	3.059	0.99
285_R	290_F	3.023	0.99
431_V	483_I	2.903	0.99
340_G	343_H	2.895	0.99
293_L	301_G	2.864	0.99
338_Y	341_I	2.838	0.99
51_K	81_D	2.814	0.99
331_L	659_L	2.773	0.99
445_W	448_R	2.743	0.99
650_R	654_S	2.719	0.98
301_G	305_I	2.692	0.98
597_R	607_V	2.684	0.98
333_G	345_E	2.670	0.98
341_I	345_E	2.550	0.98
338_Y	343_H	2.544	0.98
198_V	206_F	2.514	0.97
321_S	630_F	2.496	0.97
338_Y	345_E	2.476	0.97
646_L	654_S	2.463	0.97
5_H	76_F	2.462	0.97
335_E	341_I	2.429	0.97
103_C	112_C	2.410	0.97
340_G	346_Q	2.409	0.97
337_F	341_I	2.402	0.97
336_N	341_I	2.400	0.96
454_Q	457_L	2.388	0.96
103_C	106_C	2.386	0.96
562_D	588_P	2.372	0.96
3_T	12_E	2.332	0.96
24_L	32_Y	2.323	0.96
377_V	413_W	2.295	0.95
365_A	698_R	2.279	0.95
702_L	706_P	2.233	0.95
446_T	449_A	2.227	0.95
373_D	495_K	2.209	0.94
435_D	519_A	2.207	0.94
482_K	485_V	2.206	0.94
106_C	112_C	2.190	0.94
338_Y	346_Q	2.164	0.94
336_N	343_H	2.156	0.94
13_V	17_D	2.141	0.93
180_Y	186_D	2.134	0.93
337_F	345_E	2.133	0.93
172_V	181_F	2.131	0.93
566_V	590_V	2.130	0.93
304_D	308_Q	2.118	0.93
284_Q	293_L	2.100	0.93
333_G	346_Q	2.057	0.92
657_S	663_E	2.046	0.92
334_E	338_Y	2.044	0.92
443_A	447_Y	2.017	0.91
336_N	345_E	1.998	0.91
421_I	486_I	1.998	0.91
406_A	431_V	1.985	0.90
459_F	462_A	1.977	0.90
343_H	346_Q	1.970	0.90
51_K	83_E	1.968	0.90
673_I	676_V	1.966	0.90
337_F	343_H	1.958	0.90
341_I	346_Q	1.957	0.90
447_Y	454_Q	1.949	0.90
638_Y	644_V	1.947	0.89
453_D	456_R	1.915	0.89
467_N	480_Q	1.910	0.89
470_P	476_E	1.902	0.88
335_E	343_H	1.898	0.88
377_V	380_E	1.892	0.88
18_N	21_E	1.883	0.88
335_E	346_Q	1.879	0.88
334_E	337_F	1.867	0.87
182_G	186_D	1.867	0.87
132_K	135_H	1.867	0.87
7_D	80_D	1.863	0.87
324_S	327_A	1.846	0.87
544_M	676_V	1.840	0.87
454_Q	458_G	1.840	0.87
649_W	672_V	1.822	0.86
393_V	499_I	1.820	0.86
334_E	342_A	1.819	0.86
113_H	156_R	1.816	0.86
439_L	454_Q	1.798	0.85
504_A	509_V	1.781	0.85
443_A	454_Q	1.755	0.84
493_A	496_P	1.735	0.83
316_G	325_N	1.729	0.83
99_H	103_C	1.726	0.83
552_A	561_A	1.722	0.83
22_A	26_L	1.722	0.83
306_L	563_A	1.719	0.83
337_F	346_Q	1.715	0.82
375_V	401_A	1.708	0.82
6_V	23_C	1.705	0.82
93_E	127_R	1.701	0.82
514_A	523_R	1.680	0.81
78_S	81_D	1.653	0.80
335_E	345_E	1.642	0.79
30_I	66_S	1.639	0.79
564_V	587_A	1.626	0.79
431_V	475_I	1.624	0.79
4_I	11_Y	1.607	0.78
475_I	483_I	1.603	0.78
99_H	112_C	1.599	0.78
99_H	106_C	1.596	0.77
638_Y	645_M	1.595	0.77
309_S	563_A	1.595	0.77
450_P	524_G	1.594	0.77
656_H	664_V	1.592	0.77
141_G	193_F	1.591	0.77
480_Q	484_D	1.587	0.77
470_P	473_D	1.587	0.77
442_I	491_A	1.585	0.77
222_Q	241_E	1.584	0.77
369_I	499_I	1.583	0.77
283_V	607_V	1.578	0.77
457_L	460_A	1.577	0.77
673_I	677_V	1.555	0.76
92_V	118_T	1.548	0.75
290_F	607_V	1.546	0.75
336_N	346_Q	1.538	0.75
106_C	115_Q	1.538	0.75
369_I	393_V	1.534	0.75
617_D	632_Q	1.522	0.74
439_L	458_G	1.509	0.73
617_D	629_R	1.496	0.73
439_L	443_A	1.493	0.72
632_Q	635_D	1.491	0.72
697_I	701_K	1.487	0.72
29_D	120_M	1.486	0.72
345_E	348_R	1.485	0.72
376_L	406_A	1.485	0.72
196_N	261_F	1.484	0.72
334_E	340_G	1.470	0.71
3_T	10_E	1.466	0.71
432_T	513_A	1.458	0.71
565_V	593_V	1.442	0.70
308_Q	312_V	1.439	0.70
365_A	368_E	1.436	0.69
7_D	88_R	1.434	0.69
313_I	562_D	1.431	0.69
19_L	30_I	1.428	0.69
146_H	180_Y	1.427	0.69
165_A	391_L	1.412	0.68
14_N	17_D	1.406	0.68
571_L	581_N	1.405	0.68
103_C	115_Q	1.400	0.67
281_Q	644_V	1.399	0.67
6_V	28_L	1.398	0.67
281_Q	293_L	1.387	0.67
637_A	645_M	1.368	0.66
647_E	650_R	1.366	0.65
490_L	517_A	1.362	0.65
131_T	134_T	1.359	0.65
7_D	78_S	1.358	0.65
199_E	251_N	1.356	0.65
465_L	470_P	1.348	0.64
394_R	412_D	1.345	0.64
428_P	509_V	1.344	0.64
701_K	708_R	1.340	0.64
470_P	481_S	1.333	0.63
112_C	115_Q	1.332	0.63
632_Q	636_P	1.331	0.63
104_P	150_R	1.330	0.63
316_G	385_T	1.324	0.63
343_H	347_E	1.318	0.63
481_S	485_V	1.317	0.63
238_S	252_R	1.316	0.62
13_V	22_A	1.316	0.62
567_L	652_L	1.315	0.62
374_A	404_M	1.315	0.62
429_L	433_N	1.311	0.62
176_H	186_D	1.310	0.62
457_L	461_I	1.307	0.62
7_D	22_A	1.305	0.62
556_L	587_A	1.303	0.62
259_H	392_A	1.300	0.61
436_D	465_L	1.298	0.61
557_E	586_K	1.298	0.61
371_S	526_D	1.292	0.61
63_L	84_A	1.288	0.61
436_D	466_D	1.287	0.61
334_E	341_I	1.286	0.61
257_V	325_N	1.280	0.60
162_K	168_T	1.279	0.60
470_P	480_Q	1.276	0.60
673_I	686_I	1.272	0.60
131_T	135_H	1.270	0.60
431_V	473_D	1.266	0.59
11_Y	26_L	1.266	0.59
92_V	121_T	1.264	0.59
319_R	502_T	1.263	0.59
238_S	694_T	1.262	0.59
674_D	687_K	1.256	0.59
284_Q	301_G	1.255	0.59
402_R	489_A	1.255	0.59
160_Y	196_N	1.255	0.59
246_L	273_V	1.254	0.59
455_A	458_G	1.252	0.59
23_C	30_I	1.249	0.58
667_T	671_H	1.247	0.58
63_L	87_F	1.242	0.58
15_G	71_A	1.237	0.58
378_L	432_T	1.232	0.57
327_A	331_L	1.228	0.57
476_E	480_Q	1.223	0.57
242_R	246_L	1.222	0.57
366_L	389_V	1.218	0.56
113_H	117_M	1.216	0.56
117_M	121_T	1.215	0.56
374_A	489_A	1.213	0.56
39_L	159_R	1.212	0.56
495_K	527_V	1.212	0.56
442_I	488_Q	1.207	0.56
339_T	345_E	1.201	0.55
328_L	567_L	1.199	0.55
565_V	652_L	1.196	0.55
476_E	482_K	1.189	0.55
208_D	268_F	1.185	0.54
677_V	704_R	1.182	0.54
225_P	252_R	1.182	0.54
105_V	116_D	1.181	0.54
4_I	71_A	1.176	0.54
47_Q	117_M	1.175	0.54
221_M	242_R	1.174	0.54
82_E	86_Q	1.174	0.54
217_R	220_D	1.170	0.53
259_H	367_R	1.170	0.53
110_G	115_Q	1.169	0.53
299_M	654_S	1.166	0.53
46_R	94_W	1.164	0.53
502_T	570_D	1.159	0.53
301_G	591_M	1.157	0.52
302_A	591_M	1.151	0.52
571_L	603_N	1.147	0.52
569_N	574_H	1.145	0.52
102_D	150_R	1.144	0.52
330_E	675_A	1.139	0.51
404_M	486_I	1.131	0.51
299_M	646_L	1.130	0.51
690_A	700_Q	1.129	0.51
627_A	673_I	1.122	0.50
46_R	65_M	1.115	0.50
565_V	648_S	1.114	0.50
239_P	249_I	1.108	0.49
239_P	614_A	1.106	0.49
584_L	590_V	1.101	0.49
410_V	415_I	1.099	0.49
284_Q	606_L	1.090	0.48
19_L	52_Q	1.086	0.48
670_D	677_V	1.085	0.48
24_L	37_P	1.084	0.48
47_Q	84_A	1.077	0.47
339_T	346_Q	1.077	0.47
556_L	586_K	1.075	0.47
654_S	658_T	1.072	0.47
498_I	517_A	1.071	0.47
414_Q	420_N	1.067	0.47
240_G	250_E	1.066	0.47
325_N	567_L	1.062	0.46
19_L	66_S	1.061	0.46
102_D	106_C	1.060	0.46
357_R	518_K	1.059	0.46
397_V	403_E	1.056	0.46
502_T	623_N	1.055	0.46
653_H	664_V	1.054	0.46
373_D	493_A	1.051	0.46
99_H	102_D	1.050	0.46
306_L	589_L	1.048	0.45
51_K	78_S	1.047	0.45
6_V	15_G	1.047	0.45
325_N	331_L	1.045	0.45
327_A	652_L	1.044	0.45
270_Y	292_T	1.044	0.45
585_A	603_N	1.043	0.45
581_N	603_N	1.042	0.45
668_Q	671_H	1.041	0.45
281_Q	654_S	1.041	0.45
419_L	482_K	1.040	0.45
13_V	25_S	1.036	0.45
68_M	77_I	1.035	0.45
130_F	133_R	1.035	0.45
357_R	529_I	1.035	0.45
339_T	343_H	1.034	0.45
463_H	468_S	1.028	0.44
17_D	21_E	1.028	0.44
544_M	683_L	1.028	0.44
36_H	39_L	1.027	0.44
653_H	665_D	1.027	0.44
46_R	175_A	1.022	0.44
279_P	607_V	1.018	0.43
332_V	336_N	1.011	0.43
199_E	267_R	1.010	0.43
49_A	84_A	1.008	0.43
327_A	669_L	1.006	0.43
502_T	548_S	1.006	0.43
14_N	25_S	1.006	0.43
94_W	176_H	1.005	0.43
60_R	175_A	1.005	0.43
145_S	212_S	1.003	0.43
102_D	112_C	1.001	0.42
110_G	217_R	0.998	0.42
522_G	527_V	0.998	0.42
98_N	391_L	0.994	0.42
23_C	77_I	0.991	0.42
305_I	588_P	0.988	0.42
104_P	115_Q	0.987	0.42
103_C	110_G	0.982	0.41
533_A	539_M	0.981	0.41
582_A	586_K	0.978	0.41
454_Q	460_A	0.977	0.41
303_A	655_L	0.976	0.41
90_S	128_Y	0.976	0.41
339_T	342_A	0.975	0.41
182_G	185_E	0.966	0.40
71_A	617_D	0.965	0.40
92_V	117_M	0.964	0.40
227_I	630_F	0.964	0.40
302_A	305_I	0.963	0.40
676_V	680_I	0.963	0.40
320_A	567_L	0.959	0.40
373_D	494_K	0.950	0.39
36_H	156_R	0.950	0.39
476_E	481_S	0.948	0.39
421_I	475_I	0.943	0.39
11_Y	27_G	0.942	0.39
306_L	655_L	0.938	0.38
638_Y	648_S	0.933	0.38
106_C	110_G	0.932	0.38
43_G	93_E	0.931	0.38
17_D	22_A	0.931	0.38
2_A	71_A	0.928	0.38
130_F	135_H	0.927	0.38
351_L	507_L	0.923	0.38
102_D	115_Q	0.921	0.37
101_H	106_C	0.921	0.37
46_R	176_H	0.913	0.37
236_N	252_R	0.910	0.37
669_L	688_D	0.909	0.37
555_E	558_T	0.908	0.37
109_G	115_Q	0.906	0.37
65_M	68_M	0.905	0.36
343_H	570_D	0.904	0.36
560_R	588_P	0.903	0.36
370_E	395_Q	0.901	0.36
273_V	614_A	0.899	0.36
225_P	238_S	0.896	0.36
357_R	523_R	0.896	0.36
4_I	19_L	0.892	0.36
322_V	621_I	0.892	0.36
285_R	605_H	0.891	0.36
14_N	22_A	0.888	0.35
553_L	584_L	0.887	0.35
4_I	17_D	0.886	0.35
20_L	32_Y	0.886	0.35
555_E	561_A	0.885	0.35
18_N	131_T	0.885	0.35
128_Y	175_A	0.884	0.35
342_A	348_R	0.884	0.35
482_K	486_I	0.883	0.35
536_V	620_V	0.881	0.35
385_T	573_R	0.877	0.35
222_Q	244_G	0.877	0.35
597_R	601_M	0.877	0.35
293_L	297_Q	0.876	0.35
432_T	509_V	0.875	0.35
343_H	348_R	0.873	0.35
84_A	87_F	0.869	0.34
446_T	560_R	0.869	0.34
7_D	499_I	0.867	0.34
341_I	348_R	0.867	0.34
52_Q	64_V	0.867	0.34
223_F	240_G	0.866	0.34
43_G	46_R	0.865	0.34
670_D	674_D	0.865	0.34
239_P	246_L	0.864	0.34
96_M	101_H	0.864	0.34
159_R	163_D	0.863	0.34
298_A	608_L	0.862	0.34
96_M	118_T	0.862	0.34
341_I	347_E	0.862	0.34
307_R	310_K	0.860	0.34
100_P	159_R	0.856	0.34
377_V	393_V	0.854	0.33
22_A	77_I	0.854	0.33
380_E	501_G	0.854	0.33
301_G	304_D	0.852	0.33
591_M	659_L	0.851	0.33
419_L	485_V	0.846	0.33
117_M	120_M	0.845	0.33
460_A	463_H	0.843	0.33
465_L	468_S	0.842	0.33
656_H	663_E	0.841	0.33
304_D	576_S	0.841	0.33
223_F	238_S	0.839	0.33
77_I	467_N	0.839	0.33
356_L	515_N	0.838	0.33
307_R	659_L	0.838	0.33
5_H	10_E	0.837	0.33
29_D	566_V	0.837	0.33
466_D	470_P	0.837	0.33
342_A	347_E	0.836	0.32
392_A	626_R	0.836	0.32
443_A	458_G	0.836	0.32
9_K	26_L	0.834	0.32
166_D	416_A	0.833	0.32
4_I	12_E	0.832	0.32
470_P	483_I	0.832	0.32
32_Y	84_A	0.830	0.32
10_E	476_E	0.828	0.32
613_F	620_V	0.827	0.32
68_M	93_E	0.825	0.32
374_A	493_A	0.825	0.32
96_M	112_C	0.821	0.32
573_R	594_D	0.821	0.32
559_G	562_D	0.820	0.32
114_L	203_T	0.819	0.32
106_C	109_G	0.817	0.31
139_D	209_K	0.817	0.31
43_G	159_R	0.816	0.31
616_S	648_S	0.816	0.31
343_H	509_V	0.814	0.31
214_R	245_E	0.811	0.31
304_D	654_S	0.810	0.31
223_F	249_I	0.810	0.31
484_D	491_A	0.809	0.31
466_D	469_A	0.807	0.31
325_N	328_L	0.806	0.31
144_I	198_V	0.805	0.31
366_L	623_N	0.805	0.31
382_V	393_V	0.801	0.31
410_V	485_V	0.798	0.30
333_G	348_R	0.797	0.30
369_I	389_V	0.795	0.30
669_L	673_I	0.794	0.30
586_K	590_V	0.791	0.30
456_R	459_F	0.790	0.30
652_L	655_L	0.789	0.30
101_H	150_R	0.788	0.30
318_P	343_H	0.788	0.30
4_I	13_V	0.788	0.30
301_G	308_Q	0.788	0.30
101_H	115_Q	0.788	0.30
336_N	563_A	0.787	0.30
328_L	332_V	0.785	0.30
437_T	440_D	0.785	0.30
146_H	193_F	0.785	0.30
458_G	461_I	0.782	0.29
91_V	95_L	0.782	0.29
101_H	105_V	0.780	0.29
94_W	175_A	0.778	0.29
674_D	689_A	0.778	0.29
588_P	608_L	0.777	0.29
11_Y	23_C	0.775	0.29
309_S	314_G	0.774	0.29
378_L	504_A	0.772	0.29
364_P	685_G	0.769	0.29
312_V	588_P	0.769	0.29
138_Q	209_K	0.768	0.29
592_V	601_M	0.768	0.29
454_Q	459_F	0.767	0.29
451_V	518_K	0.766	0.29
99_H	115_Q	0.766	0.29
106_C	116_D	0.765	0.29
369_I	647_E	0.764	0.29
103_C	116_D	0.763	0.28
335_E	348_R	0.762	0.28
156_R	368_E	0.759	0.28
293_L	606_L	0.758	0.28
304_D	307_R	0.757	0.28
107_E	207_T	0.757	0.28
237_I	251_N	0.756	0.28
428_P	504_A	0.755	0.28
118_T	277_D	0.754	0.28
331_L	336_N	0.753	0.28
450_P	685_G	0.751	0.28
93_E	159_R	0.751	0.28
566_V	632_Q	0.751	0.28
189_L	192_E	0.749	0.28
155_Y	268_F	0.748	0.28
386_G	539_M	0.748	0.28
15_G	186_D	0.748	0.28
118_T	579_R	0.747	0.28
500_S	542_G	0.746	0.28
334_E	343_H	0.746	0.28
441_D	602_E	0.746	0.28
437_T	483_I	0.745	0.28
211_H	250_E	0.745	0.28
444_A	476_E	0.745	0.28
138_Q	193_F	0.745	0.28
91_V	94_W	0.745	0.28
293_L	654_S	0.744	0.27
114_L	118_T	0.744	0.27
76_F	470_P	0.743	0.27
348_R	502_T	0.743	0.27
191_S	194_S	0.740	0.27
348_R	570_D	0.740	0.27
281_Q	294_N	0.739	0.27
285_R	597_R	0.738	0.27
284_Q	297_Q	0.738	0.27
594_D	633_V	0.736	0.27
254_N	671_H	0.736	0.27
690_A	697_I	0.735	0.27
325_N	648_S	0.733	0.27
439_L	463_H	0.732	0.27
244_G	635_D	0.731	0.27
410_V	414_Q	0.731	0.27
331_L	611_A	0.731	0.27
555_E	560_R	0.731	0.27
339_T	347_E	0.730	0.27
454_Q	461_I	0.730	0.27
490_L	520_L	0.730	0.27
283_V	604_A	0.729	0.27
634_Y	637_A	0.726	0.27
471_A	558_T	0.725	0.27
361_I	524_G	0.725	0.27
654_S	657_S	0.724	0.26
132_K	137_N	0.722	0.26
22_A	71_A	0.722	0.26
19_L	60_R	0.721	0.26
96_M	103_C	0.721	0.26
286_R	305_I	0.719	0.26
112_C	624_E	0.719	0.26
92_V	123_H	0.718	0.26
115_Q	150_R	0.717	0.26
653_H	662_R	0.717	0.26
601_M	648_S	0.716	0.26
66_S	91_V	0.715	0.26
240_G	248_R	0.715	0.26
130_F	134_T	0.714	0.26
404_M	421_I	0.714	0.26
102_D	124_S	0.714	0.26
101_H	110_G	0.714	0.26
384_Q	412_D	0.714	0.26
598_T	607_V	0.711	0.26
233_I	388_R	0.711	0.26
655_L	659_L	0.710	0.26
490_L	496_P	0.710	0.26
301_G	589_L	0.710	0.26
603_N	607_V	0.706	0.26
137_N	145_S	0.703	0.25
33_F	114_L	0.703	0.25
279_P	598_T	0.702	0.25
289_D	597_R	0.702	0.25
144_I	148_M	0.701	0.25
684_A	701_K	0.701	0.25
46_R	91_V	0.701	0.25
239_P	374_A	0.699	0.25
375_V	393_V	0.699	0.25
464_A	469_A	0.699	0.25
199_E	262_L	0.698	0.25
44_A	294_N	0.698	0.25
554_T	557_E	0.697	0.25
338_Y	347_E	0.697	0.25
40_G	163_D	0.696	0.25
392_A	395_Q	0.693	0.25
564_V	588_P	0.693	0.25
452_E	686_I	0.691	0.25
383_T	401_A	0.691	0.25
13_V	71_A	0.690	0.25
76_F	476_E	0.689	0.25
583_A	603_N	0.687	0.25
99_H	110_G	0.686	0.25
33_F	95_L	0.686	0.25
435_D	512_A	0.686	0.25
19_L	40_G	0.686	0.25
373_D	527_V	0.685	0.25
321_S	613_F	0.684	0.24
13_V	66_S	0.684	0.24
93_E	97_T	0.683	0.24
583_A	607_V	0.683	0.24
648_S	669_L	0.682	0.24
271_G	277_D	0.682	0.24
385_T	502_T	0.682	0.24
657_S	665_D	0.682	0.24
101_H	109_G	0.681	0.24
90_S	94_W	0.681	0.24
4_I	14_N	0.680	0.24
52_Q	654_S	0.680	0.24
122_G	657_S	0.679	0.24
662_R	665_D	0.678	0.24
33_F	196_N	0.678	0.24
78_S	85_K	0.677	0.24
653_H	657_S	0.677	0.24
468_S	471_A	0.676	0.24
13_V	110_G	0.675	0.24
362_Y	530_T	0.674	0.24
140_L	193_F	0.673	0.24
378_L	509_V	0.673	0.24
73_D	311_K	0.672	0.24
553_L	557_E	0.671	0.24
10_E	73_D	0.671	0.24
58_D	81_D	0.670	0.24
629_R	688_D	0.670	0.24
173_Y	182_G	0.669	0.24
7_D	79_I	0.669	0.24
43_G	68_M	0.667	0.24
291_I	297_Q	0.667	0.24
20_L	273_V	0.666	0.24
70_P	471_A	0.665	0.24
309_S	313_I	0.665	0.24
169_D	260_Y	0.665	0.24
30_I	92_V	0.665	0.24
117_M	156_R	0.664	0.24
301_G	306_L	0.664	0.24
20_L	156_R	0.664	0.24
96_M	115_Q	0.663	0.24
304_D	448_R	0.662	0.23
411_A	420_N	0.661	0.23
373_D	583_A	0.660	0.23
631_F	692_D	0.660	0.23
650_R	653_H	0.659	0.23
38_A	118_T	0.659	0.23
230_Q	387_A	0.659	0.23
317_S	321_S	0.659	0.23
307_R	671_H	0.657	0.23
47_Q	68_M	0.656	0.23
328_L	378_L	0.656	0.23
582_A	585_A	0.656	0.23
184_P	190_E	0.656	0.23
85_K	588_P	0.654	0.23
557_E	583_A	0.654	0.23
423_Q	428_P	0.653	0.23
23_C	118_T	0.652	0.23
317_S	320_A	0.652	0.23
455_A	463_H	0.652	0.23
181_F	460_A	0.651	0.23
319_R	500_S	0.650	0.23
161_Y	197_L	0.649	0.23
138_Q	189_L	0.649	0.23
429_L	584_L	0.648	0.23
277_D	476_E	0.647	0.23
82_E	275_L	0.647	0.23
196_N	391_L	0.647	0.23
657_S	662_R	0.645	0.23
357_R	514_A	0.645	0.23
697_I	700_Q	0.645	0.23
25_S	655_L	0.643	0.23
38_A	113_H	0.642	0.23
96_M	205_V	0.642	0.23
103_C	624_E	0.642	0.23
103_C	109_G	0.641	0.22
71_A	75_T	0.641	0.22
167_G	394_R	0.641	0.22
174_G	178_N	0.640	0.22
96_M	104_P	0.639	0.22
315_I	564_V	0.639	0.22
4_I	77_I	0.637	0.22
160_Y	208_D	0.637	0.22
155_Y	181_F	0.636	0.22
118_T	121_T	0.636	0.22
5_H	8_G	0.636	0.22
318_P	535_S	0.635	0.22
455_A	461_I	0.635	0.22
11_Y	22_A	0.634	0.22
316_G	321_S	0.633	0.22
685_G	690_A	0.633	0.22
163_D	171_G	0.632	0.22
107_E	212_S	0.632	0.22
377_V	406_A	0.631	0.22
349_L	513_A	0.630	0.22
350_Q	359_G	0.629	0.22
51_K	63_L	0.628	0.22
21_E	86_Q	0.628	0.22
226_S	699_G	0.628	0.22
93_E	163_D	0.628	0.22
183_R	390_A	0.626	0.22
75_T	454_Q	0.625	0.22
689_A	693_A	0.625	0.22
356_L	511_Q	0.624	0.22
104_P	119_V	0.624	0.22
381_D	384_Q	0.623	0.22
381_D	577_A	0.622	0.22
669_L	672_V	0.622	0.22
150_R	204_G	0.621	0.22
19_L	23_C	0.620	0.22
702_L	707_H	0.619	0.22
475_I	486_I	0.618	0.21
18_N	41_S	0.617	0.21
96_M	106_C	0.617	0.21
440_D	488_Q	0.616	0.21
444_A	470_P	0.616	0.21
153_A	172_V	0.616	0.21
686_I	701_K	0.616	0.21
93_E	175_A	0.614	0.21
141_G	501_G	0.614	0.21
70_P	558_T	0.614	0.21
30_I	245_E	0.614	0.21
293_L	308_Q	0.613	0.21
44_A	172_V	0.613	0.21
360_G	623_N	0.611	0.21
265_R	407_A	0.611	0.21
319_R	570_D	0.610	0.21
172_V	179_V	0.610	0.21
331_L	655_L	0.610	0.21
318_P	538_S	0.609	0.21
334_E	662_R	0.609	0.21
633_V	672_V	0.609	0.21
502_T	511_Q	0.607	0.21
346_Q	349_L	0.607	0.21
331_L	584_L	0.606	0.21
143_F	149_N	0.606	0.21
95_L	299_M	0.605	0.21
9_K	83_E	0.604	0.21
500_S	529_I	0.604	0.21
534_R	538_S	0.604	0.21
502_T	533_A	0.604	0.21
105_V	150_R	0.603	0.21
680_I	683_L	0.603	0.21
440_D	619_T	0.603	0.21
621_I	683_L	0.602	0.21
344_G	506_S	0.601	0.21
327_A	666_W	0.600	0.21
63_L	66_S	0.600	0.21
427_H	587_A	0.600	0.21
65_M	164_Y	0.599	0.21
486_I	490_L	0.598	0.21
281_Q	560_R	0.598	0.21
101_H	112_C	0.598	0.21
352_A	355_V	0.597	0.21
390_A	394_R	0.597	0.21
308_Q	591_M	0.597	0.21
547_G	555_E	0.597	0.21
340_G	348_R	0.597	0.21
84_A	119_V	0.597	0.21
234_G	387_A	0.596	0.21
251_N	356_L	0.596	0.21
400_K	580_V	0.596	0.21
37_P	391_L	0.595	0.20
236_N	257_V	0.595	0.20
617_D	633_V	0.595	0.20
46_R	115_Q	0.594	0.20
6_V	575_A	0.594	0.20
336_N	339_T	0.594	0.20
670_D	688_D	0.593	0.20
19_L	424_R	0.592	0.20
302_A	655_L	0.592	0.20
484_D	655_L	0.591	0.20
251_N	267_R	0.591	0.20
16_A	73_D	0.590	0.20
438_R	666_W	0.589	0.20
160_Y	199_E	0.589	0.20
144_I	441_D	0.588	0.20
461_I	519_A	0.587	0.20
387_A	596_Q	0.587	0.20
418_I	426_K	0.586	0.20
46_R	159_R	0.586	0.20
128_Y	395_Q	0.586	0.20
423_Q	570_D	0.585	0.20
338_Y	348_R	0.585	0.20
80_D	85_K	0.584	0.20
94_W	128_Y	0.584	0.20
4_I	16_A	0.584	0.20
537_N	540_G	0.584	0.20
20_L	364_P	0.582	0.20
335_E	662_R	0.582	0.20
326_F	650_R	0.581	0.20
303_A	684_A	0.579	0.20
19_L	68_M	0.578	0.20
316_G	341_I	0.578	0.20
234_G	618_G	0.577	0.20
337_F	347_E	0.577	0.20
441_D	566_V	0.577	0.20
207_T	212_S	0.577	0.20
9_K	311_K	0.577	0.20
339_T	539_M	0.577	0.20
348_R	552_A	0.577	0.20
349_L	352_A	0.576	0.20
143_F	512_A	0.576	0.20
100_P	149_N	0.576	0.20
436_D	461_I	0.576	0.20
431_V	516_V	0.574	0.20
103_C	217_R	0.574	0.20
681_P	684_A	0.574	0.20
7_D	305_I	0.574	0.20
19_L	73_D	0.574	0.20
255_G	391_L	0.573	0.20
71_A	556_L	0.573	0.20
644_V	647_E	0.573	0.20
112_C	116_D	0.572	0.20
453_D	566_V	0.572	0.20
210_T	255_G	0.572	0.20
10_E	66_S	0.571	0.19
456_R	460_A	0.571	0.19
488_Q	492_G	0.571	0.19
160_Y	495_K	0.571	0.19
73_D	132_K	0.570	0.19
631_F	701_K	0.570	0.19
370_E	390_A	0.569	0.19
2_A	14_N	0.569	0.19
368_E	649_W	0.569	0.19
285_R	288_D	0.568	0.19
18_N	179_V	0.568	0.19
498_I	611_A	0.568	0.19
71_A	77_I	0.568	0.19
26_L	29_D	0.567	0.19
523_R	659_L	0.567	0.19
281_Q	284_Q	0.566	0.19
276_K	671_H	0.566	0.19
208_D	237_I	0.566	0.19
35_W	695_F	0.566	0.19
138_Q	187_G	0.565	0.19
285_R	560_R	0.565	0.19
146_H	155_Y	0.564	0.19
308_Q	663_E	0.564	0.19
360_G	396_A	0.564	0.19
265_R	344_G	0.564	0.19
245_E	304_D	0.563	0.19
401_A	607_V	0.563	0.19
376_L	547_G	0.563	0.19
96_M	150_R	0.563	0.19
93_E	100_P	0.563	0.19
172_V	666_W	0.562	0.19
380_E	406_A	0.561	0.19
16_A	186_D	0.561	0.19
13_V	23_C	0.561	0.19
257_V	291_I	0.561	0.19
393_V	403_E	0.560	0.19
71_A	80_D	0.558	0.19
102_D	119_V	0.558	0.19
307_R	655_L	0.558	0.19
166_D	196_N	0.557	0.19
148_M	193_F	0.557	0.19
32_Y	176_H	0.557	0.19
265_R	330_E	0.556	0.19
333_G	339_T	0.556	0.19
408_Q	599_A	0.556	0.19
155_Y	203_T	0.556	0.19
439_L	519_A	0.555	0.19
225_P	254_N	0.555	0.19
535_S	538_S	0.555	0.19
9_K	72_S	0.555	0.19
22_A	70_P	0.555	0.19
108_E	210_T	0.554	0.19
315_I	549_L	0.554	0.19
128_Y	250_E	0.553	0.19
390_A	502_T	0.552	0.19
237_I	381_D	0.552	0.19
301_G	590_V	0.551	0.19
674_D	677_V	0.551	0.19
373_D	652_L	0.551	0.19
564_V	590_V	0.551	0.19
336_N	348_R	0.550	0.19
570_D	683_L	0.550	0.19
269_G	396_A	0.550	0.19
43_G	94_W	0.550	0.19
362_Y	501_G	0.550	0.19
353_L	500_S	0.550	0.19
196_N	200_I	0.549	0.19
439_L	447_Y	0.549	0.19
382_V	385_T	0.549	0.19
52_Q	63_L	0.549	0.19
232_S	532_I	0.548	0.19
560_R	667_T	0.548	0.19
344_G	534_R	0.547	0.19
344_G	533_A	0.547	0.19
3_T	73_D	0.546	0.19
612_S	637_A	0.544	0.18
593_V	651_W	0.544	0.18
269_G	598_T	0.544	0.18
447_Y	566_V	0.544	0.18
349_L	408_Q	0.544	0.18
432_T	512_A	0.544	0.18
544_M	680_I	0.543	0.18
198_V	243_Y	0.543	0.18
222_Q	312_V	0.543	0.18
140_L	209_K	0.543	0.18
106_C	624_E	0.543	0.18
382_V	502_T	0.542	0.18
6_V	584_L	0.542	0.18
7_D	128_Y	0.542	0.18
259_H	632_Q	0.541	0.18
249_I	404_M	0.541	0.18
69_T	498_I	0.540	0.18
40_G	130_F	0.540	0.18
111_N	250_E	0.540	0.18
209_K	247_R	0.539	0.18
296_E	671_H	0.539	0.18
21_E	37_P	0.539	0.18
113_H	139_D	0.538	0.18
592_V	604_A	0.538	0.18
138_Q	165_A	0.538	0.18
471_A	654_S	0.537	0.18
564_V	680_I	0.537	0.18
677_V	684_A	0.536	0.18
446_T	667_T	0.536	0.18
50_V	64_V	0.536	0.18
196_N	392_A	0.536	0.18
166_D	398_K	0.536	0.18
315_I	552_A	0.536	0.18
66_S	171_G	0.535	0.18
318_P	509_V	0.535	0.18
175_A	178_N	0.535	0.18
317_S	567_L	0.535	0.18
11_Y	77_I	0.535	0.18
109_G	112_C	0.534	0.18
16_A	77_I	0.534	0.18
281_Q	448_R	0.534	0.18
114_L	497_L	0.534	0.18
106_C	150_R	0.534	0.18
513_A	516_V	0.534	0.18
12_E	27_G	0.533	0.18
610_A	651_W	0.533	0.18
22_A	303_A	0.533	0.18
240_G	251_N	0.533	0.18
394_R	594_D	0.532	0.18
41_S	244_G	0.532	0.18
251_N	570_D	0.531	0.18
68_M	144_I	0.531	0.18
632_Q	648_S	0.531	0.18
281_Q	491_A	0.531	0.18
27_G	78_S	0.531	0.18
170_L	268_F	0.531	0.18
513_A	520_L	0.530	0.18
50_V	508_E	0.530	0.18
470_P	475_I	0.530	0.18
469_A	476_E	0.530	0.18
488_Q	491_A	0.529	0.18
485_V	489_A	0.529	0.18
459_F	471_A	0.528	0.18
20_L	24_L	0.528	0.18
321_S	520_L	0.528	0.18
324_S	573_R	0.527	0.18
702_L	705_E	0.527	0.18
30_I	120_M	0.526	0.18
72_S	585_A	0.526	0.18
604_A	607_V	0.526	0.18
28_L	668_Q	0.525	0.18
357_R	500_S	0.525	0.18
118_T	370_E	0.525	0.18
323_E	618_G	0.525	0.18
28_L	453_D	0.524	0.18
191_S	197_L	0.524	0.18
86_Q	488_Q	0.524	0.18
374_A	496_P	0.524	0.18
145_S	203_T	0.524	0.18
512_A	594_D	0.523	0.18
66_S	467_N	0.523	0.18
150_R	205_V	0.522	0.18
97_T	177_D	0.522	0.18
443_A	519_A	0.522	0.18
339_T	545_G	0.522	0.18
104_P	181_F	0.521	0.18
375_V	497_L	0.521	0.18
270_Y	274_N	0.520	0.18
319_R	572_H	0.520	0.18
10_E	81_D	0.520	0.18
632_Q	647_E	0.520	0.18
476_E	659_L	0.519	0.17
80_D	655_L	0.518	0.17
434_V	438_R	0.517	0.17
358_E	528_G	0.517	0.17
230_Q	275_L	0.517	0.17
290_F	605_H	0.516	0.17
701_K	707_H	0.515	0.17
331_L	608_L	0.515	0.17
385_T	553_L	0.515	0.17
333_G	347_E	0.515	0.17
533_A	538_S	0.514	0.17
129_R	456_R	0.514	0.17
441_D	488_Q	0.514	0.17
610_A	683_L	0.514	0.17
360_G	622_N	0.514	0.17
98_N	117_M	0.513	0.17
21_E	60_R	0.513	0.17
230_Q	237_I	0.512	0.17
80_D	560_R	0.512	0.17
16_A	70_P	0.511	0.17
553_L	562_D	0.511	0.17
399_G	421_I	0.511	0.17
451_V	454_Q	0.510	0.17
553_L	632_Q	0.509	0.17
230_Q	324_S	0.509	0.17
581_N	590_V	0.509	0.17
76_F	87_F	0.509	0.17
566_V	647_E	0.508	0.17
265_R	360_G	0.508	0.17
453_D	489_A	0.508	0.17
254_N	493_A	0.508	0.17
80_D	120_M	0.508	0.17
670_D	673_I	0.507	0.17
24_L	130_F	0.507	0.17
94_W	227_I	0.506	0.17
382_V	499_I	0.506	0.17
557_E	582_A	0.506	0.17
5_H	12_E	0.505	0.17
225_P	237_I	0.505	0.17
14_N	136_R	0.504	0.17
143_F	268_F	0.504	0.17
509_V	513_A	0.504	0.17
66_S	697_I	0.503	0.17
80_D	617_D	0.503	0.17
319_R	623_N	0.503	0.17
443_A	674_D	0.503	0.17
247_R	431_V	0.503	0.17
92_V	315_I	0.502	0.17
344_G	503_N	0.502	0.17
304_D	404_M	0.502	0.17
448_R	591_M	0.502	0.17
509_V	512_A	0.501	0.17
580_V	604_A	0.501	0.17
303_A	524_G	0.501	0.17
364_P	411_A	0.501	0.17
71_A	89_E	0.501	0.17
60_R	76_F	0.501	0.17
41_S	434_V	0.501	0.17
234_G	323_E	0.500	0.17
30_I	246_L	0.500	0.17
7_D	455_A	0.500	0.17
438_R	447_Y	0.500	0.17

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3i9v3	1	0.7819	100	0.548	Contact Map
1h0hA	1	0.7434	100	0.625	Contact Map
2iv2X	1	0.6531	100	0.634	Contact Map
1kqfA	3	0.7434	100	0.634	Contact Map
2napA	1	0.6872	100	0.642	Contact Map
3ml1A	1	0.707	100	0.658	Contact Map
4aayA	6	0.6905	100	0.661	Contact Map
2e7zA	1	0.6663	100	0.662	Contact Map
1g8kA	3	0.6861	100	0.667	Contact Map
2vpzA	1	0.6762	100	0.669	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0179 seconds.