PTFX2 - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTFX2 - Multiphosphoryl transfer protein 2

UniProt:	P32670	Sequences: MALIVEFICELPNGVHARPASHVETLCNTFSSQIEWHNLRTDRKGNAKSALALIGTDTLAGDNCQLLISGADEQEAHQRLSQWLRDEFPHCDAPLAEVKSDELEPLPVSLTNLNPQIIRARTVCSGSAGGILTPISSLDLNALGNLPAAKGVDAEQSALENGLTLVLKNIEFRLLDSDGATSAILEAHRSLAGDTSLREHLLAGVSAGLSCAEAIVASANHFCEEFSRSSSSYLQERALDVRDVCFQLLQQIYGEQRFPAPGKLTQPAICMADELTPSQFLELDKNHLKGLLLKSGGTTSHTVILARSFNIPTLVGVDIDALTPWQQQTIYIDGNAGAIVVEPGEAVARYYQQEARVQDALREQQRVWLTQQARTADGIRIEIAANIAHSVEAQAAFGNGAEGVGLFRTEMLYMDRTSAPGESELYNIFCQALESANGRSIIVRTMDIGGDKPVDYLNIPAEANPFLGYRAVRIYEEYASLFTTQLRSILRASAHGSLKIMIPMISSMEEILWVKEKLAEAKQQLRNEHIPFDEKIQLGIMLEVPSVMFIIDQCCEEIDFFSIGSNDLTQYLLAVDRDNAKVTRHYNSLNPAFLRALDYAVQAVHRQGKWIGLCGELGAKGSVLPLLVGLGLDELSMSAPSIPAAKARMAQLDSRECRKLLNQAMACRTSLEVEHLLAQFRMTQQDAPLVTAECITLESDWRSKEEVLKGMTDNLLLAGRCRYPRKLEADLWAREAVFSTGLGFSFAIPHSKSEHIEQSTISVARLQAPVRWGDDEAQFIIMLTLNKHAAGDQHMRIFSRLARRIMHEEFRNALVNAASADAIASLLQHELEL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11906
Length:	833 (662)
Sequences:	910 (606)
Seq/√Len:	23.5

ECOLI - PTFX2 PTFX1 PT1P PT1
BACSU - PT1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
605_H	633_D	7.080	1.00
290_G	332_I	6.682	1.00
512_L	557_E	5.946	1.00
598_D	602_Q	5.158	1.00
483_T	520_E	4.784	1.00
486_L	518_L	4.720	1.00
629_G	661_L	4.611	1.00
436_A	441_I	4.597	1.00
132_L	330_I	4.218	1.00
664_A	676_L	4.020	1.00
587_N	674_E	3.883	1.00
158_A	212_A	3.838	1.00
422_E	491_R	3.786	1.00
600_A	611_I	3.687	1.00
511_I	558_I	3.610	1.00
625_P	657_C	3.582	1.00
472_V	514_V	3.572	1.00
506_S	546_S	3.543	1.00
572_L	596_A	3.258	1.00
314_L	339_I	3.180	1.00
628_V	649_M	3.156	1.00
269_I	332_I	3.140	1.00
376_A	653_D	3.131	1.00
612_G	634_E	3.099	1.00
379_I	633_D	3.065	1.00
548_M	596_A	3.044	1.00
613_L	632_L	3.041	1.00
227_S	242_R	2.984	1.00
579_N	582_V	2.910	1.00
450_G	466_F	2.895	0.99
314_L	334_G	2.888	0.99
159_L	201_L	2.785	0.99
483_T	521_A	2.782	0.99
422_E	484_T	2.764	0.99
329_T	348_A	2.732	0.99
379_I	654_S	2.728	0.99
619_A	637_M	2.716	0.99
499_K	537_Q	2.658	0.99
331_Y	351_Y	2.650	0.99
542_L	547_V	2.641	0.99
563_I	600_A	2.603	0.99
669_T	672_E	2.597	0.99
454_V	458_N	2.493	0.98
151_G	154_A	2.481	0.98
469_Y	477_E	2.454	0.98
83_W	88_F	2.434	0.98
209_L	213_E	2.373	0.98
422_E	487_R	2.336	0.98
9_C	58_T	2.332	0.98
380_R	402_E	2.326	0.98
668_R	672_E	2.262	0.97
281_L	313_T	2.255	0.97
9_C	64_C	2.253	0.97
652_L	657_C	2.245	0.97
519_A	535_K	2.223	0.97
448_I	454_V	2.195	0.96
58_T	64_C	2.185	0.96
131_I	266_Q	2.163	0.96
426_Y	491_R	2.135	0.96
271_M	330_I	2.129	0.96
31_S	72_D	2.127	0.96
430_C	434_E	2.125	0.96
269_I	290_G	2.090	0.95
32_S	72_D	2.058	0.95
166_V	169_N	2.051	0.95
654_S	658_R	2.046	0.95
233_Y	579_N	2.045	0.95
521_A	524_Q	2.038	0.95
630_L	664_A	2.034	0.95
490_L	518_L	2.033	0.94
348_A	352_Q	2.031	0.94
542_L	554_C	1.971	0.94
463_A	578_D	1.962	0.93
118_I	317_V	1.961	0.93
155_E	158_A	1.954	0.93
129_G	348_A	1.941	0.93
502_I	514_V	1.913	0.92
548_M	551_I	1.909	0.92
601_V	605_H	1.906	0.92
392_E	547_V	1.903	0.92
155_E	166_V	1.879	0.92
448_I	458_N	1.873	0.92
167_L	193_G	1.856	0.91
66_L	84_L	1.844	0.91
508_M	557_E	1.842	0.91
664_A	667_C	1.839	0.91
547_V	554_C	1.835	0.91
476_E	513_W	1.834	0.91
30_F	76_A	1.828	0.91
291_L	306_A	1.826	0.91
619_A	645_A	1.815	0.90
472_V	505_I	1.815	0.90
552_D	606_R	1.809	0.90
122_T	334_G	1.807	0.90
489_I	498_L	1.806	0.90
74_Q	78_Q	1.796	0.90
264_L	268_A	1.784	0.89
423_S	491_R	1.783	0.89
23_V	47_A	1.776	0.89
162_G	166_V	1.766	0.89
515_K	557_E	1.755	0.89
549_F	596_A	1.753	0.89
629_G	664_A	1.736	0.88
367_V	542_L	1.731	0.88
414_M	423_S	1.711	0.87
133_T	264_L	1.710	0.87
448_I	496_G	1.703	0.87
151_G	155_E	1.693	0.87
273_D	295_S	1.685	0.87
212_A	253_Y	1.685	0.87
625_P	652_L	1.683	0.86
630_L	661_L	1.680	0.86
156_Q	202_L	1.665	0.86
162_G	169_N	1.665	0.86
442_I	612_G	1.648	0.85
160_E	202_L	1.636	0.85
551_I	603_A	1.634	0.85
384_A	403_G	1.629	0.85
15_V	23_V	1.621	0.84
588_S	617_L	1.617	0.84
223_C	227_S	1.616	0.84
653_D	656_E	1.606	0.84
215_I	248_L	1.589	0.83
233_Y	236_E	1.580	0.83
155_E	162_G	1.577	0.83
8_I	63_N	1.577	0.83
170_I	189_R	1.559	0.82
399_N	643_P	1.552	0.82
551_I	604_V	1.550	0.81
626_L	677_L	1.542	0.81
416_R	424_E	1.532	0.81
502_I	538_L	1.527	0.80
267_P	289_K	1.519	0.80
599_Y	603_A	1.513	0.80
233_Y	582_V	1.506	0.80
307_R	404_V	1.505	0.79
166_V	170_I	1.504	0.79
575_V	585_H	1.496	0.79
330_I	339_I	1.491	0.79
81_S	85_R	1.486	0.79
219_A	245_C	1.483	0.78
151_G	158_A	1.480	0.78
40_R	62_D	1.462	0.77
339_I	509_E	1.462	0.77
334_G	484_T	1.458	0.77
383_I	646_K	1.444	0.77
352_Q	355_A	1.443	0.77
443_V	489_I	1.435	0.76
508_M	554_C	1.431	0.76
166_V	173_R	1.431	0.76
667_C	676_L	1.424	0.76
393_A	397_F	1.415	0.75
277_P	402_E	1.411	0.75
244_V	466_F	1.408	0.75
133_T	268_A	1.405	0.75
374_R	380_R	1.404	0.74
198_R	201_L	1.394	0.74
71_A	75_E	1.383	0.73
7_F	89_P	1.383	0.73
518_L	538_L	1.374	0.73
34_I	47_A	1.370	0.73
156_Q	206_S	1.367	0.72
553_Q	595_R	1.365	0.72
373_A	402_E	1.363	0.72
423_S	427_N	1.360	0.72
404_V	619_A	1.356	0.72
76_A	79_R	1.353	0.72
618_G	635_L	1.348	0.71
316_G	492_A	1.343	0.71
158_A	162_G	1.341	0.71
129_G	349_R	1.329	0.70
152_V	155_E	1.327	0.70
334_G	491_R	1.325	0.70
475_Y	482_F	1.315	0.69
551_I	561_F	1.313	0.69
279_Q	334_G	1.312	0.69
626_L	630_L	1.309	0.69
502_I	518_L	1.304	0.69
610_W	634_E	1.303	0.69
598_D	662_N	1.299	0.68
303_V	313_T	1.296	0.68
243_D	278_S	1.291	0.68
233_Y	616_E	1.291	0.68
500_I	617_L	1.288	0.68
294_K	318_D	1.286	0.68
236_E	469_Y	1.285	0.68
477_E	581_K	1.282	0.67
382_E	610_W	1.280	0.67
171_E	175_L	1.277	0.67
409_T	486_L	1.274	0.67
159_L	162_G	1.271	0.67
469_Y	582_V	1.268	0.67
663_Q	676_L	1.259	0.66
9_C	24_E	1.254	0.66
373_A	650_A	1.250	0.65
30_F	48_K	1.247	0.65
382_E	442_I	1.244	0.65
27_C	34_I	1.233	0.64
149_A	210_S	1.230	0.64
438_G	497_S	1.228	0.64
233_Y	585_H	1.218	0.63
52_A	226_F	1.211	0.63
656_E	659_K	1.208	0.63
594_L	673_V	1.207	0.63
540_I	626_L	1.205	0.62
130_G	267_P	1.202	0.62
169_N	251_Q	1.199	0.62
132_L	324_P	1.198	0.62
520_E	524_Q	1.196	0.62
84_L	87_E	1.184	0.61
423_S	426_Y	1.182	0.61
403_G	440_S	1.181	0.61
558_I	609_K	1.179	0.61
239_L	276_T	1.177	0.61
266_Q	287_H	1.173	0.60
381_I	628_V	1.172	0.60
284_D	288_L	1.170	0.60
280_F	284_D	1.168	0.60
271_M	642_I	1.163	0.60
573_L	590_N	1.163	0.60
344_G	347_V	1.162	0.60
328_Q	342_E	1.161	0.60
31_S	71_A	1.153	0.59
563_I	611_I	1.143	0.58
205_V	211_C	1.142	0.58
565_S	613_L	1.139	0.58
220_N	224_E	1.136	0.58
601_V	611_I	1.135	0.58
407_F	432_A	1.129	0.57
317_V	421_G	1.129	0.57
549_F	572_L	1.126	0.57
82_Q	86_D	1.123	0.57
509_E	669_T	1.122	0.57
443_V	498_L	1.121	0.57
166_V	251_Q	1.120	0.57
548_M	572_L	1.112	0.56
245_C	492_A	1.103	0.56
52_A	331_Y	1.102	0.56
210_S	213_E	1.102	0.56
466_F	501_M	1.100	0.55
624_L	645_A	1.099	0.55
576_D	600_A	1.097	0.55
471_A	593_F	1.096	0.55
390_S	428_I	1.095	0.55
648_R	652_L	1.094	0.55
292_L	339_I	1.092	0.55
84_L	88_F	1.085	0.54
329_T	505_I	1.084	0.54
151_G	162_G	1.082	0.54
373_A	400_G	1.078	0.54
270_C	366_R	1.078	0.54
52_A	269_I	1.077	0.54
317_V	330_I	1.076	0.54
124_C	150_K	1.076	0.54
162_G	170_I	1.074	0.54
384_A	634_E	1.068	0.53
551_I	600_A	1.067	0.53
228_R	260_A	1.064	0.53
540_I	554_C	1.064	0.53
442_I	610_W	1.063	0.53
660_L	676_L	1.063	0.53
163_L	176_D	1.058	0.52
446_M	476_E	1.055	0.52
241_V	404_V	1.055	0.52
152_V	158_A	1.052	0.52
173_R	247_Q	1.046	0.52
371_Q	650_A	1.044	0.51
212_A	252_I	1.043	0.51
264_L	267_P	1.041	0.51
11_L	280_F	1.039	0.51
191_L	350_Y	1.038	0.51
201_L	248_L	1.038	0.51
33_Q	46_N	1.038	0.51
347_V	351_Y	1.037	0.51
335_N	358_Q	1.036	0.51
510_E	563_I	1.033	0.51
11_L	89_P	1.026	0.50
26_L	29_T	1.025	0.50
65_Q	274_E	1.024	0.50
103_L	271_M	1.021	0.50
493_S	496_G	1.021	0.50
368_W	371_Q	1.021	0.50
379_I	658_R	1.020	0.50
243_D	277_P	1.018	0.50
288_L	311_I	1.017	0.50
308_S	311_I	1.016	0.49
603_A	612_G	1.013	0.49
11_L	53_L	1.012	0.49
419_A	456_Y	1.012	0.49
244_V	280_F	1.010	0.49
233_Y	575_V	1.006	0.49
30_F	72_D	1.006	0.49
280_F	309_F	1.005	0.49
389_H	392_E	1.004	0.49
307_R	616_E	1.003	0.49
308_S	536_I	1.001	0.48
515_K	519_A	1.001	0.48
601_V	633_D	1.001	0.48
265_T	268_A	1.000	0.48
280_F	302_T	0.997	0.48
624_L	649_M	0.995	0.48
108_V	111_T	0.991	0.48
483_T	517_K	0.989	0.48
167_L	170_I	0.988	0.48
407_F	637_M	0.988	0.48
166_V	247_Q	0.988	0.48
265_T	287_H	0.987	0.47
97_E	546_S	0.986	0.47
292_L	332_I	0.985	0.47
187_A	275_L	0.984	0.47
158_A	169_N	0.983	0.47
482_F	548_M	0.979	0.47
453_P	578_D	0.978	0.47
558_I	579_N	0.977	0.47
95_L	546_S	0.977	0.47
563_I	601_V	0.975	0.47
27_C	48_K	0.974	0.47
542_L	558_I	0.973	0.46
487_R	524_Q	0.971	0.46
155_E	169_N	0.971	0.46
547_V	611_I	0.969	0.46
482_F	514_V	0.969	0.46
167_L	189_R	0.968	0.46
134_P	326_Q	0.967	0.46
661_L	664_A	0.966	0.46
366_R	369_L	0.966	0.46
54_I	88_F	0.964	0.46
597_L	632_L	0.964	0.46
404_V	492_A	0.961	0.46
314_L	332_I	0.959	0.45
11_L	90_H	0.959	0.45
383_I	637_M	0.956	0.45
516_E	520_E	0.955	0.45
413_Y	489_I	0.955	0.45
135_I	191_L	0.953	0.45
159_L	674_E	0.953	0.45
29_T	497_S	0.952	0.45
336_A	341_V	0.950	0.45
241_V	585_H	0.949	0.45
511_I	546_S	0.948	0.45
619_A	641_S	0.947	0.45
172_F	176_D	0.946	0.45
70_G	76_A	0.945	0.44
522_K	526_R	0.942	0.44
645_A	649_M	0.941	0.44
667_C	672_E	0.938	0.44
617_L	638_S	0.937	0.44
302_T	340_V	0.935	0.44
359_D	363_E	0.934	0.44
269_I	330_I	0.933	0.44
385_A	396_A	0.932	0.44
433_L	497_S	0.925	0.43
637_M	645_A	0.925	0.43
95_L	187_A	0.921	0.43
116_Q	270_C	0.921	0.43
667_C	673_V	0.921	0.43
345_E	349_R	0.920	0.43
92_D	96_A	0.919	0.43
317_V	321_A	0.919	0.43
120_A	555_C	0.919	0.43
587_N	665_M	0.918	0.43
440_S	676_L	0.917	0.43
166_V	281_L	0.911	0.42
149_A	155_E	0.910	0.42
655_R	658_R	0.908	0.42
430_C	505_I	0.907	0.42
418_S	431_Q	0.907	0.42
653_D	675_H	0.906	0.42
492_A	637_M	0.906	0.42
327_Q	363_E	0.906	0.42
350_Y	354_E	0.905	0.42
185_L	192_A	0.904	0.42
92_D	95_L	0.903	0.42
169_N	173_R	0.900	0.41
563_I	632_L	0.899	0.41
83_W	87_E	0.898	0.41
30_F	80_L	0.897	0.41
612_G	633_D	0.897	0.41
170_I	173_R	0.897	0.41
327_Q	630_L	0.896	0.41
618_G	624_L	0.892	0.41
76_A	416_R	0.892	0.41
245_C	316_G	0.890	0.41
280_F	288_L	0.888	0.41
213_E	216_V	0.887	0.41
442_I	634_E	0.886	0.40
175_L	285_K	0.886	0.40
203_A	546_S	0.884	0.40
380_R	649_M	0.882	0.40
147_P	244_V	0.881	0.40
46_N	365_Q	0.879	0.40
506_S	511_I	0.878	0.40
589_L	601_V	0.875	0.40
84_L	575_V	0.875	0.40
155_E	211_C	0.873	0.40
27_C	30_F	0.872	0.39
30_F	79_R	0.871	0.39
7_F	87_E	0.871	0.39
238_A	466_F	0.869	0.39
175_L	178_D	0.868	0.39
289_K	475_Y	0.866	0.39
171_E	189_R	0.865	0.39
50_A	57_D	0.864	0.39
425_L	488_S	0.863	0.39
174_L	305_L	0.863	0.39
204_G	209_L	0.862	0.39
623_V	657_C	0.860	0.39
239_L	544_V	0.859	0.39
344_G	384_A	0.855	0.38
197_L	219_A	0.854	0.38
579_N	638_S	0.854	0.38
334_G	337_G	0.851	0.38
83_W	433_L	0.849	0.38
387_I	393_A	0.848	0.38
45_G	196_S	0.847	0.38
131_I	327_Q	0.847	0.38
432_A	441_I	0.845	0.38
163_L	317_V	0.844	0.38
101_D	104_E	0.844	0.38
275_L	291_L	0.842	0.38
384_A	610_W	0.842	0.38
381_I	635_L	0.842	0.38
224_E	227_S	0.841	0.37
382_E	612_G	0.841	0.37
416_R	583_T	0.841	0.37
129_G	331_Y	0.838	0.37
414_M	638_S	0.836	0.37
290_G	309_F	0.835	0.37
375_T	379_I	0.835	0.37
303_V	446_M	0.834	0.37
328_Q	656_E	0.834	0.37
190_S	579_N	0.832	0.37
299_T	478_Y	0.826	0.36
54_I	575_V	0.825	0.36
675_H	679_Q	0.825	0.36
155_E	159_L	0.824	0.36
54_I	616_E	0.822	0.36
484_T	487_R	0.821	0.36
74_Q	161_N	0.821	0.36
617_L	623_V	0.819	0.36
293_L	550_I	0.819	0.36
66_L	573_L	0.818	0.36
381_I	633_D	0.817	0.36
245_C	466_F	0.817	0.36
582_V	585_H	0.817	0.36
292_L	616_E	0.816	0.36
45_G	191_L	0.815	0.36
425_L	504_M	0.813	0.36
548_M	603_A	0.812	0.36
11_L	23_V	0.810	0.35
130_G	212_A	0.809	0.35
243_D	290_G	0.807	0.35
407_F	441_I	0.805	0.35
14_G	18_R	0.802	0.35
506_S	575_V	0.802	0.35
540_I	588_S	0.801	0.35
653_D	657_C	0.798	0.35
243_D	402_E	0.796	0.35
356_R	359_D	0.796	0.35
517_K	542_L	0.794	0.34
404_V	544_V	0.792	0.34
162_G	252_I	0.792	0.34
373_A	646_K	0.789	0.34
340_V	347_V	0.789	0.34
16_H	19_P	0.788	0.34
440_S	499_K	0.788	0.34
433_L	498_L	0.787	0.34
57_D	315_V	0.787	0.34
392_E	620_K	0.785	0.34
307_R	544_V	0.785	0.34
549_F	582_V	0.783	0.34
540_I	664_A	0.781	0.34
546_S	550_I	0.781	0.34
407_F	616_E	0.781	0.34
482_F	491_R	0.777	0.33
514_V	518_L	0.773	0.33
671_L	675_H	0.773	0.33
380_R	439_R	0.773	0.33
317_V	474_I	0.771	0.33
363_E	367_V	0.771	0.33
363_E	366_R	0.770	0.33
194_D	647_A	0.769	0.33
457_L	617_L	0.766	0.33
606_R	628_V	0.765	0.33
276_T	478_Y	0.765	0.33
28_N	190_S	0.765	0.33
205_V	649_M	0.763	0.32
292_L	317_V	0.763	0.32
561_F	603_A	0.761	0.32
353_Q	659_K	0.760	0.32
392_E	401_A	0.760	0.32
11_L	87_E	0.760	0.32
185_L	544_V	0.759	0.32
364_Q	608_G	0.758	0.32
339_I	606_R	0.757	0.32
525_L	535_K	0.755	0.32
481_L	518_L	0.755	0.32
548_M	609_K	0.754	0.32
159_L	163_L	0.754	0.32
184_I	272_A	0.753	0.32
8_I	97_E	0.749	0.32
9_C	549_F	0.748	0.32
393_A	640_P	0.748	0.32
11_L	185_L	0.747	0.31
169_N	247_Q	0.746	0.31
445_T	475_Y	0.746	0.31
201_L	326_Q	0.741	0.31
400_G	646_K	0.741	0.31
628_V	635_L	0.740	0.31
663_Q	667_C	0.740	0.31
276_T	493_S	0.740	0.31
483_T	524_Q	0.739	0.31
166_V	448_I	0.739	0.31
580_A	601_V	0.734	0.31
463_A	466_F	0.733	0.31
34_I	48_K	0.733	0.31
188_H	297_G	0.732	0.31
233_Y	351_Y	0.731	0.31
36_W	84_L	0.729	0.30
205_V	354_E	0.729	0.30
359_D	376_A	0.728	0.30
157_S	161_N	0.727	0.30
24_E	244_V	0.727	0.30
149_A	152_V	0.724	0.30
281_L	314_L	0.721	0.30
579_N	585_H	0.720	0.30
155_E	453_P	0.718	0.30
11_L	88_F	0.717	0.30
331_Y	448_I	0.716	0.30
474_I	481_L	0.715	0.30
325_W	328_Q	0.714	0.30
511_I	603_A	0.714	0.30
72_D	76_A	0.711	0.29
124_C	207_A	0.711	0.29
237_R	240_D	0.709	0.29
270_C	281_L	0.709	0.29
422_E	492_A	0.708	0.29
45_G	52_A	0.707	0.29
160_E	164_T	0.707	0.29
36_W	66_L	0.706	0.29
544_V	626_L	0.706	0.29
25_T	54_I	0.706	0.29
398_G	643_P	0.705	0.29
554_C	609_K	0.705	0.29
279_Q	293_L	0.704	0.29
23_V	36_W	0.704	0.29
459_I	507_S	0.704	0.29
185_L	650_A	0.704	0.29
402_E	436_A	0.703	0.29
303_V	555_C	0.702	0.29
547_V	600_A	0.702	0.29
373_A	378_G	0.701	0.29
32_S	508_M	0.699	0.29
62_D	416_R	0.699	0.29
206_S	542_L	0.699	0.29
244_V	281_L	0.698	0.29
227_S	346_A	0.697	0.29
128_A	355_A	0.697	0.29
283_L	288_L	0.696	0.28
190_S	617_L	0.696	0.28
459_I	474_I	0.694	0.28
221_H	345_E	0.693	0.28
119_R	599_Y	0.693	0.28
299_T	593_F	0.692	0.28
455_D	563_I	0.691	0.28
623_V	632_L	0.691	0.28
202_L	205_V	0.691	0.28
187_A	302_T	0.689	0.28
85_R	441_I	0.688	0.28
182_S	587_N	0.687	0.28
201_L	218_S	0.687	0.28
115_P	191_L	0.686	0.28
269_I	394_Q	0.686	0.28
277_P	501_M	0.685	0.28
213_E	616_E	0.685	0.28
383_I	642_I	0.684	0.28
356_R	360_A	0.684	0.28
426_Y	430_C	0.684	0.28
80_L	363_E	0.683	0.28
414_M	511_I	0.683	0.28
411_M	554_C	0.682	0.28
27_C	76_A	0.682	0.28
363_E	602_Q	0.682	0.28
397_F	407_F	0.681	0.28
502_I	536_I	0.680	0.28
122_T	638_S	0.679	0.27
226_F	575_V	0.679	0.27
241_V	450_G	0.678	0.27
170_I	508_M	0.677	0.27
309_F	334_G	0.675	0.27
575_V	582_V	0.675	0.27
49_S	453_P	0.674	0.27
547_V	551_I	0.674	0.27
265_T	416_R	0.672	0.27
373_A	384_A	0.672	0.27
248_L	448_I	0.672	0.27
278_S	283_L	0.672	0.27
166_V	171_E	0.671	0.27
539_G	560_F	0.671	0.27
51_L	226_F	0.670	0.27
231_S	642_I	0.669	0.27
279_Q	313_T	0.669	0.27
278_S	382_E	0.669	0.27
148_A	175_L	0.669	0.27
589_L	623_V	0.668	0.27
366_R	643_P	0.667	0.27
36_W	586_Y	0.667	0.27
439_R	674_E	0.667	0.27
272_A	416_R	0.667	0.27
602_Q	659_K	0.665	0.27
504_M	571_Y	0.665	0.27
163_L	515_K	0.664	0.27
247_Q	480_S	0.664	0.27
78_Q	271_M	0.663	0.27
260_A	342_E	0.661	0.26
156_Q	160_E	0.661	0.26
519_A	522_K	0.659	0.26
214_A	494_A	0.657	0.26
313_T	334_G	0.656	0.26
388_A	414_M	0.655	0.26
235_Q	242_R	0.654	0.26
87_E	90_H	0.654	0.26
247_Q	621_G	0.654	0.26
32_S	638_S	0.654	0.26
99_K	271_M	0.653	0.26
231_S	521_A	0.653	0.26
575_V	616_E	0.653	0.26
659_K	663_Q	0.653	0.26
169_N	178_D	0.653	0.26
279_Q	589_L	0.652	0.26
271_M	630_L	0.652	0.26
161_N	199_E	0.651	0.26
269_I	363_E	0.651	0.26
430_C	495_H	0.651	0.26
575_V	579_N	0.651	0.26
166_V	182_S	0.651	0.26
123_V	600_A	0.651	0.26
51_L	215_I	0.650	0.26
205_V	540_I	0.650	0.26
237_R	574_A	0.647	0.26
519_A	538_L	0.647	0.26
450_G	579_N	0.647	0.26
276_T	279_Q	0.647	0.26
184_I	565_S	0.647	0.26
432_A	649_M	0.646	0.26
159_L	205_V	0.645	0.26
277_P	327_Q	0.645	0.26
390_S	432_A	0.644	0.26
46_N	52_A	0.643	0.26
273_D	353_Q	0.642	0.25
372_Q	650_A	0.642	0.25
226_F	498_L	0.641	0.25
197_L	236_E	0.641	0.25
277_P	415_D	0.641	0.25
338_A	592_A	0.640	0.25
426_Y	505_I	0.640	0.25
68_I	77_H	0.639	0.25
540_I	561_F	0.639	0.25
293_L	443_V	0.639	0.25
8_I	495_H	0.638	0.25
334_G	513_W	0.637	0.25
219_A	501_M	0.637	0.25
82_Q	431_Q	0.636	0.25
165_L	251_Q	0.634	0.25
246_F	276_T	0.634	0.25
369_L	398_G	0.634	0.25
665_M	669_T	0.633	0.25
352_Q	356_R	0.632	0.25
161_N	207_A	0.630	0.25
424_E	583_T	0.630	0.25
508_M	670_S	0.630	0.25
29_T	203_A	0.630	0.25
502_I	569_T	0.629	0.25
93_A	97_E	0.629	0.25
23_V	506_S	0.629	0.25
77_H	433_L	0.627	0.25
178_D	186_E	0.627	0.25
382_E	579_N	0.627	0.25
79_R	299_T	0.626	0.25
212_A	365_Q	0.625	0.25
484_T	490_L	0.624	0.25
231_S	455_D	0.624	0.25
658_R	662_N	0.624	0.25
554_C	592_A	0.623	0.24
193_G	511_I	0.623	0.24
68_I	73_E	0.622	0.24
191_L	499_K	0.622	0.24
214_A	500_I	0.622	0.24
244_V	313_T	0.621	0.24
391_V	427_N	0.621	0.24
37_H	67_L	0.621	0.24
478_Y	592_A	0.621	0.24
276_T	416_R	0.620	0.24
277_P	294_K	0.620	0.24
565_S	659_K	0.620	0.24
25_T	28_N	0.619	0.24
191_L	520_E	0.619	0.24
482_F	517_K	0.619	0.24
304_I	307_R	0.619	0.24
129_G	423_S	0.618	0.24
458_N	578_D	0.618	0.24
508_M	512_L	0.618	0.24
65_Q	91_C	0.617	0.24
112_N	223_C	0.616	0.24
156_Q	159_L	0.616	0.24
396_A	400_G	0.614	0.24
291_L	639_A	0.613	0.24
159_L	166_V	0.612	0.24
184_I	281_L	0.612	0.24
17_A	70_G	0.612	0.24
382_E	601_V	0.612	0.24
249_L	424_E	0.611	0.24
50_A	302_T	0.611	0.24
118_I	341_V	0.610	0.24
9_C	233_Y	0.610	0.24
52_A	292_L	0.610	0.24
316_G	466_F	0.608	0.24
40_R	43_R	0.607	0.24
152_V	169_N	0.607	0.24
603_A	609_K	0.606	0.24
106_L	109_S	0.606	0.24
370_T	392_E	0.605	0.24
147_P	156_Q	0.604	0.23
274_E	558_I	0.604	0.23
370_T	653_D	0.603	0.23
600_A	603_A	0.602	0.23
451_D	504_M	0.602	0.23
100_S	480_S	0.602	0.23
216_V	220_N	0.601	0.23
293_L	297_G	0.601	0.23
381_I	606_R	0.599	0.23
32_S	70_G	0.599	0.23
326_Q	330_I	0.599	0.23
204_G	217_A	0.598	0.23
118_I	292_L	0.598	0.23
48_K	540_I	0.598	0.23
364_Q	367_V	0.597	0.23
401_A	547_V	0.597	0.23
64_C	272_A	0.596	0.23
75_E	199_E	0.596	0.23
142_A	216_V	0.596	0.23
336_A	509_E	0.596	0.23
52_A	387_I	0.595	0.23
173_R	177_S	0.594	0.23
277_P	315_V	0.593	0.23
388_A	463_A	0.593	0.23
121_R	668_R	0.592	0.23
173_R	603_A	0.592	0.23
45_G	209_L	0.591	0.23
7_F	12_P	0.590	0.23
172_F	266_Q	0.590	0.23
634_E	673_V	0.590	0.23
272_A	515_K	0.589	0.23
511_I	540_I	0.589	0.23
419_A	482_F	0.588	0.23
438_G	633_D	0.588	0.23
222_F	241_V	0.587	0.23
269_I	285_K	0.587	0.23
662_N	665_M	0.587	0.23
10_E	24_E	0.586	0.23
235_Q	575_V	0.586	0.23
373_A	649_M	0.585	0.23
561_F	604_V	0.582	0.22
186_E	189_R	0.582	0.22
11_L	453_P	0.582	0.22
473_R	539_G	0.580	0.22
30_F	592_A	0.580	0.22
308_S	454_V	0.580	0.22
656_E	672_E	0.580	0.22
247_Q	576_D	0.579	0.22
197_L	208_G	0.579	0.22
161_N	345_E	0.578	0.22
263_K	266_Q	0.578	0.22
548_M	613_L	0.578	0.22
407_F	454_V	0.578	0.22
248_L	544_V	0.577	0.22
112_N	207_A	0.576	0.22
123_V	126_G	0.576	0.22
11_L	624_L	0.576	0.22
130_G	268_A	0.575	0.22
512_L	515_K	0.575	0.22
554_C	561_F	0.575	0.22
250_Q	463_A	0.575	0.22
361_L	505_I	0.575	0.22
637_M	641_S	0.575	0.22
338_A	341_V	0.575	0.22
402_E	551_I	0.573	0.22
279_Q	300_S	0.573	0.22
170_I	463_A	0.573	0.22
431_Q	659_K	0.573	0.22
500_I	559_D	0.572	0.22
170_I	306_A	0.571	0.22
173_R	502_I	0.571	0.22
357_V	517_K	0.571	0.22
672_E	675_H	0.570	0.22
442_I	501_M	0.570	0.22
187_A	274_E	0.569	0.22
538_L	656_E	0.569	0.22
71_A	82_Q	0.569	0.22
395_A	399_N	0.569	0.22
331_Y	536_I	0.568	0.22
403_G	425_L	0.568	0.22
643_P	650_A	0.567	0.22
493_S	534_E	0.567	0.22
165_L	169_N	0.567	0.22
388_A	578_D	0.567	0.22
342_E	486_L	0.566	0.22
482_F	596_A	0.566	0.22
142_A	364_Q	0.566	0.22
223_C	593_F	0.565	0.22
196_S	520_E	0.565	0.22
267_P	287_H	0.565	0.22
379_I	505_I	0.565	0.22
237_R	449_G	0.563	0.21
283_L	610_W	0.563	0.21
409_T	521_A	0.563	0.21
339_I	608_G	0.563	0.21
297_G	382_E	0.563	0.21
393_A	436_A	0.562	0.21
598_D	619_A	0.562	0.21
248_L	582_V	0.562	0.21
304_I	569_T	0.561	0.21
371_Q	432_A	0.561	0.21
303_V	334_G	0.561	0.21
411_M	551_I	0.561	0.21
448_I	623_V	0.561	0.21
428_I	431_Q	0.560	0.21
542_L	608_G	0.560	0.21
131_I	267_P	0.559	0.21
433_L	441_I	0.559	0.21
99_K	103_L	0.559	0.21
14_G	70_G	0.559	0.21
409_T	619_A	0.558	0.21
23_V	578_D	0.557	0.21
276_T	307_R	0.557	0.21
243_D	247_Q	0.557	0.21
276_T	291_L	0.557	0.21
324_P	427_N	0.556	0.21
25_T	448_I	0.556	0.21
11_L	514_V	0.555	0.21
203_A	329_T	0.555	0.21
446_M	479_A	0.554	0.21
626_L	664_A	0.554	0.21
215_I	219_A	0.553	0.21
203_A	206_S	0.552	0.21
500_I	662_N	0.552	0.21
14_G	17_A	0.551	0.21
322_L	547_V	0.551	0.21
441_I	489_I	0.551	0.21
504_M	591_P	0.550	0.21
153_D	493_S	0.550	0.21
171_E	349_R	0.550	0.21
388_A	648_R	0.550	0.21
226_F	443_V	0.549	0.21
556_E	668_R	0.548	0.21
343_P	563_I	0.546	0.21
55_G	518_L	0.545	0.21
426_Y	495_H	0.545	0.21
305_L	411_M	0.545	0.21
474_I	549_F	0.545	0.21
383_I	565_S	0.544	0.21
432_A	442_I	0.544	0.21
250_Q	475_Y	0.544	0.21
245_C	476_E	0.544	0.21
156_Q	649_M	0.544	0.21
53_L	190_S	0.544	0.21
433_L	492_A	0.543	0.21
23_V	80_L	0.542	0.21
321_A	409_T	0.542	0.21
66_L	366_R	0.541	0.20
340_V	351_Y	0.541	0.20
219_A	241_V	0.541	0.20
200_H	482_F	0.540	0.20
240_D	451_D	0.540	0.20
442_I	448_I	0.540	0.20
128_A	654_S	0.540	0.20
315_V	318_D	0.538	0.20
235_Q	241_V	0.538	0.20
493_S	660_L	0.538	0.20
663_Q	666_A	0.538	0.20
270_C	293_L	0.537	0.20
230_S	463_A	0.537	0.20
403_G	488_S	0.536	0.20
11_L	288_L	0.535	0.20
160_E	168_K	0.535	0.20
172_F	655_R	0.534	0.20
127_S	355_A	0.534	0.20
589_L	674_E	0.534	0.20
181_T	579_N	0.534	0.20
109_S	606_R	0.533	0.20
549_F	669_T	0.533	0.20
460_P	648_R	0.533	0.20
380_R	398_G	0.533	0.20
68_I	632_L	0.533	0.20
508_M	558_I	0.532	0.20
168_K	427_N	0.532	0.20
308_S	445_T	0.532	0.20
309_F	661_L	0.531	0.20
235_Q	582_V	0.531	0.20
421_G	486_L	0.531	0.20
32_S	477_E	0.531	0.20
198_R	360_A	0.531	0.20
302_T	426_Y	0.529	0.20
9_C	113_L	0.529	0.20
240_D	452_K	0.529	0.20
185_L	229_S	0.529	0.20
272_A	423_S	0.528	0.20
15_V	448_I	0.528	0.20
378_G	635_L	0.528	0.20
132_L	326_Q	0.528	0.20
257_R	332_I	0.527	0.20
31_S	509_E	0.527	0.20
129_G	352_Q	0.527	0.20
200_H	231_S	0.527	0.20
13_N	578_D	0.526	0.20
108_V	668_R	0.526	0.20
482_F	582_V	0.526	0.20
244_V	383_I	0.526	0.20
123_V	618_G	0.526	0.20
554_C	604_V	0.526	0.20
124_C	492_A	0.526	0.20
496_G	569_T	0.524	0.20
607_Q	610_W	0.524	0.20
281_L	316_G	0.524	0.20
563_I	597_L	0.524	0.20
442_I	599_Y	0.523	0.20
522_K	535_K	0.523	0.20
210_S	557_E	0.523	0.20
389_H	421_G	0.523	0.20
13_N	233_Y	0.523	0.20
365_Q	644_A	0.523	0.20
279_Q	644_A	0.522	0.20
512_L	619_A	0.521	0.20
369_L	565_S	0.520	0.20
416_R	594_L	0.520	0.20
201_L	215_I	0.520	0.20
427_N	601_V	0.520	0.20
340_V	616_E	0.520	0.20
160_E	163_L	0.519	0.19
84_L	459_I	0.519	0.19
99_K	161_N	0.519	0.19
164_T	345_E	0.519	0.19
390_S	626_L	0.518	0.19
401_A	501_M	0.518	0.19
300_S	446_M	0.518	0.19
427_N	431_Q	0.518	0.19
37_H	65_Q	0.517	0.19
434_E	658_R	0.516	0.19
339_I	544_V	0.516	0.19
53_L	57_D	0.516	0.19
432_A	637_M	0.515	0.19
345_E	394_Q	0.514	0.19
537_Q	656_E	0.514	0.19
168_K	207_A	0.513	0.19
12_P	231_S	0.513	0.19
237_R	451_D	0.511	0.19
244_V	316_G	0.511	0.19
512_L	668_R	0.511	0.19
150_K	371_Q	0.511	0.19
21_S	581_K	0.511	0.19
604_V	611_I	0.510	0.19
16_H	70_G	0.510	0.19
70_G	73_E	0.510	0.19
422_E	443_V	0.510	0.19
183_A	356_R	0.509	0.19
13_N	409_T	0.509	0.19
269_I	555_C	0.509	0.19
226_F	235_Q	0.508	0.19
281_L	334_G	0.508	0.19
307_R	569_T	0.507	0.19
170_I	193_G	0.507	0.19
64_C	84_L	0.507	0.19
429_F	485_Q	0.507	0.19
184_I	613_L	0.506	0.19
205_V	493_S	0.505	0.19
547_V	561_F	0.505	0.19
443_V	550_I	0.504	0.19
234_L	605_H	0.504	0.19
288_L	482_F	0.504	0.19
385_A	632_L	0.504	0.19
307_R	638_S	0.504	0.19
433_L	455_D	0.503	0.19
669_T	673_V	0.503	0.19
358_Q	361_L	0.502	0.19
154_A	158_A	0.502	0.19
617_L	627_L	0.502	0.19
15_V	505_I	0.502	0.19
165_L	352_Q	0.502	0.19
23_V	308_S	0.501	0.19
436_A	471_A	0.501	0.19
660_L	663_Q	0.501	0.19
339_I	613_L	0.500	0.19
552_D	595_R	0.500	0.19

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2hwgA	2	0.6807	100	0.511	Contact Map
2wqdA	2	0.6783	100	0.512	Contact Map
1vbgA	2	0.7515	100	0.591	Contact Map
1kblA	2	0.7539	100	0.592	Contact Map
2x0sA	2	0.7635	100	0.601	Contact Map
2olsA	2	0.6363	100	0.653	Contact Map
2xz9A	2	0.3806	100	0.723	Contact Map
1zymA	2	0.2917	100	0.818	Contact Map
4l9zA	5	0.3541	100	0.865	Contact Map
3qqwA	3	0.3469	100	0.865	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0151 seconds.