THIC - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

THIC - Phosphomethylpyrimidine synthase

UniProt:	P30136	Sequences: MSATKLTRREQRARAQHFIDTLEGTAFPNSKRIYITGTHPGVRVPMREIQLSPTLIGGSKEQPQYEENEAIPVYDTSGPYGDPQIAINVQQGLAKLRQPWIDARGDTEELTVRSSDYTKARLADDGLDELRFSGVLTPKRAKAGRRVTQLHYARQGIITPEMEFIAIRENMGRERIRSEVLRHQHPGMSFGAHLPENITAEFVRDEVAAGRAIIPANINHPESEPMIIGRNFLVKVNANIGNSAVTSSIEEEVEKLVWSTRWGADTVMDLSTGRYIHETREWILRNSPVPIGTVPIYQALEKVNGIAEDLTWEAFRDTLLEQAEQGVDYFTIHAGVLLRYVPMTAKRLTGIVSRGGSIMAKWCLSHHQENFLYQHFREICEICAAYDVSLSLGDGLRPGSIQDANDEAQFAELHTLGELTKIAWEYDVQVMIEGPGHVPMQMIRRNMTEELEHCHEAPFYTLGPLTTDIAPGYDHFTSGIGAAMIGWFGCAMLCYVTPKEHLGLPNKEDVKQGLITYKIAAHAADLAKGHPGAQIRDNAMSKARFEFRWEDQFNLALDPFTARAYHDETLPQESGKVAHFCSMCGPKFCSMKISQEVRDYAATQTIEMGMADMSENFRARGGEIYLRKEEA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11585
Length:	631 (596)
Sequences:	625 (156)
Seq/√Len:	6.4

ECOLI - THIC
BACSU - THIC
HALSA - THIC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
613_M	616_N	5.731	1.00
165_I	207_V	5.618	0.99
267_V	291_I	5.092	0.99
414_H	449_E	5.078	0.99
49_I	73_V	4.942	0.99
383_C	390_L	4.557	0.98
511_K	561_T	4.480	0.97
512_Q	561_T	4.439	0.97
213_I	389_S	4.374	0.97
207_V	214_I	4.090	0.95
32_R	81_G	4.031	0.95
377_R	425_E	3.755	0.92
39_H	103_A	3.519	0.90
377_R	422_I	3.493	0.89
449_E	453_H	3.395	0.88
146_R	384_A	3.205	0.85
506_N	568_E	3.148	0.83
31_K	48_E	3.135	0.83
45_P	164_F	3.047	0.81
107_T	139_K	3.041	0.81
381_E	426_Y	3.000	0.80
151_H	427_D	2.920	0.78
440_M	484_M	2.891	0.78
236_V	514_L	2.849	0.76
117_Y	121_R	2.844	0.76
238_A	267_V	2.781	0.75
550_E	563_R	2.779	0.75
479_G	490_C	2.704	0.72
534_Q	538_N	2.676	0.72
370_N	374_Q	2.662	0.71
337_L	370_N	2.658	0.71
121_R	278_E	2.650	0.71
377_R	426_Y	2.554	0.68
572_Q	575_G	2.529	0.67
95_K	136_L	2.504	0.66
384_A	426_Y	2.393	0.62
306_I	587_K	2.378	0.62
213_I	431_M	2.345	0.61
597_V	600_Y	2.315	0.60
38_T	103_A	2.315	0.60
368_Q	374_Q	2.295	0.59
540_M	556_A	2.281	0.59
121_R	124_D	2.276	0.58
115_S	121_R	2.267	0.58
407_E	414_H	2.252	0.57
238_A	259_S	2.230	0.57
348_L	402_Q	2.227	0.57
113_R	119_K	2.217	0.56
110_L	121_R	2.209	0.56
470_A	477_T	2.206	0.56
444_R	448_T	2.205	0.56
121_R	131_R	2.194	0.55
233_L	518_K	2.193	0.55
68_N	542_K	2.189	0.55
512_Q	516_T	2.181	0.55
205_D	209_A	2.180	0.55
110_L	115_S	2.143	0.54
306_I	309_D	2.128	0.53
216_A	223_S	2.098	0.52
516_T	519_I	2.065	0.51
449_E	452_E	2.063	0.51
110_L	114_S	2.038	0.50
343_M	407_E	1.991	0.48
184_Q	532_G	1.986	0.48
110_L	117_Y	1.963	0.47
414_H	453_H	1.957	0.47
337_L	411_A	1.954	0.47
233_L	530_H	1.945	0.46
113_R	121_R	1.942	0.46
95_K	98_Q	1.921	0.45
124_D	131_R	1.915	0.45
187_G	192_A	1.894	0.44
37_G	167_I	1.879	0.44
118_T	121_R	1.871	0.44
440_M	443_I	1.864	0.43
110_L	119_K	1.853	0.43
181_L	184_Q	1.849	0.43
450_E	530_H	1.839	0.42
259_S	264_A	1.825	0.42
338_L	367_H	1.824	0.42
54_T	68_N	1.820	0.42
32_R	164_F	1.817	0.42
115_S	119_K	1.807	0.41
311_T	314_A	1.795	0.41
511_K	560_F	1.791	0.41
146_R	151_H	1.779	0.40
450_E	455_H	1.766	0.40
121_R	127_L	1.761	0.40
267_V	287_S	1.756	0.40
296_I	594_S	1.744	0.39
26_A	261_R	1.729	0.39
151_H	384_A	1.728	0.39
106_D	152_Y	1.715	0.38
41_G	103_A	1.714	0.38
35_I	46_M	1.706	0.38
187_G	190_F	1.705	0.38
146_R	426_Y	1.665	0.36
173_R	233_L	1.664	0.36
238_A	287_S	1.659	0.36
115_S	131_R	1.655	0.36
238_A	264_A	1.647	0.36
113_R	120_A	1.644	0.36
132_F	281_E	1.642	0.36
610_M	614_S	1.636	0.35
151_H	155_Q	1.635	0.35
365_S	374_Q	1.617	0.35
165_I	227_I	1.616	0.35
38_T	42_V	1.609	0.35
37_G	163_E	1.606	0.34
187_G	191_G	1.600	0.34
48_E	72_P	1.595	0.34
359_M	370_N	1.579	0.34
150_L	484_M	1.567	0.33
131_R	278_E	1.566	0.33
511_K	515_I	1.563	0.33
479_G	516_T	1.560	0.33
249_I	279_T	1.559	0.33
416_L	432_I	1.543	0.32
115_S	120_A	1.534	0.32
554_N	563_R	1.529	0.32
484_M	488_F	1.527	0.32
150_L	384_A	1.515	0.31
117_Y	120_A	1.512	0.31
223_S	389_S	1.510	0.31
181_L	185_H	1.502	0.31
33_I	46_M	1.498	0.31
108_E	140_R	1.495	0.31
185_H	442_M	1.495	0.31
117_Y	131_R	1.494	0.31
185_H	538_N	1.494	0.31
51_L	71_I	1.462	0.30
163_E	167_I	1.460	0.30
401_I	534_Q	1.455	0.30
66_E	542_K	1.455	0.30
542_K	546_E	1.451	0.30
508_E	512_Q	1.441	0.29
38_T	41_G	1.432	0.29
53_P	67_E	1.426	0.29
118_T	124_D	1.421	0.29
181_L	538_N	1.400	0.28
441_Q	450_E	1.397	0.28
185_H	534_Q	1.394	0.28
614_S	618_R	1.391	0.28
22_L	514_L	1.390	0.28
101_I	223_S	1.389	0.28
184_Q	538_N	1.386	0.28
101_I	106_D	1.368	0.27
127_L	131_R	1.361	0.27
515_I	568_E	1.356	0.27
22_L	25_T	1.352	0.27
26_A	81_G	1.349	0.26
173_R	511_K	1.333	0.26
116_D	119_K	1.328	0.26
593_I	597_V	1.327	0.26
357_S	593_I	1.326	0.26
72_P	171_M	1.324	0.26
567_D	576_K	1.322	0.26
587_K	596_E	1.312	0.25
113_R	117_Y	1.308	0.25
233_L	441_Q	1.305	0.25
512_Q	560_F	1.303	0.25
30_S	47_R	1.300	0.25
121_R	130_L	1.299	0.25
482_A	517_Y	1.298	0.25
42_V	79_P	1.294	0.25
113_R	118_T	1.292	0.25
110_L	113_R	1.288	0.25
51_L	70_A	1.283	0.25
330_F	379_I	1.281	0.25
339_R	411_A	1.281	0.25
561_T	565_Y	1.279	0.25
392_L	416_L	1.279	0.25
308_E	361_K	1.275	0.24
595_Q	599_D	1.273	0.24
566_H	582_S	1.267	0.24
115_S	278_E	1.263	0.24
141_A	160_P	1.260	0.24
390_L	426_Y	1.254	0.24
337_L	340_Y	1.253	0.24
185_H	507_K	1.231	0.23
213_I	430_V	1.230	0.23
567_D	582_S	1.229	0.23
110_L	118_T	1.222	0.23
114_S	121_R	1.218	0.23
115_S	124_D	1.216	0.23
146_R	427_D	1.215	0.23
117_Y	278_E	1.212	0.23
117_Y	124_D	1.203	0.23
141_A	428_V	1.200	0.22
115_S	118_T	1.198	0.22
376_F	416_L	1.197	0.22
476_F	512_Q	1.193	0.22
307_A	361_K	1.190	0.22
291_I	594_S	1.189	0.22
615_E	619_A	1.188	0.22
110_L	278_E	1.188	0.22
400_S	466_T	1.181	0.22
110_L	120_A	1.177	0.22
540_M	555_L	1.174	0.22
148_T	425_E	1.172	0.22
556_A	564_A	1.171	0.22
39_H	42_V	1.170	0.22
51_L	69_E	1.169	0.22
287_S	291_I	1.167	0.22
345_A	595_Q	1.167	0.22
216_A	389_S	1.167	0.22
80_Y	87_I	1.164	0.22
339_R	370_N	1.163	0.22
68_N	278_E	1.163	0.22
151_H	428_V	1.163	0.22
336_V	390_L	1.157	0.21
284_L	401_I	1.149	0.21
256_L	514_L	1.147	0.21
514_L	556_A	1.144	0.21
376_F	392_L	1.144	0.21
319_L	379_I	1.141	0.21
414_H	455_H	1.140	0.21
101_I	221_P	1.137	0.21
194_L	209_A	1.136	0.21
440_M	447_M	1.135	0.21
36_T	43_R	1.134	0.21
227_I	248_S	1.132	0.21
45_P	574_S	1.130	0.21
33_I	173_R	1.130	0.21
117_Y	127_L	1.124	0.21
315_F	450_E	1.122	0.21
593_I	601_A	1.121	0.21
438_V	450_E	1.119	0.20
336_V	383_C	1.110	0.20
449_E	455_H	1.109	0.20
567_D	571_P	1.109	0.20
384_A	390_L	1.107	0.20
443_I	466_T	1.105	0.20
511_K	564_A	1.105	0.20
112_V	138_P	1.101	0.20
512_Q	565_Y	1.101	0.20
155_Q	384_A	1.100	0.20
147_V	151_H	1.100	0.20
127_L	130_L	1.097	0.20
37_G	160_P	1.097	0.20
45_P	122_L	1.089	0.20
236_V	256_L	1.088	0.20
158_I	375_H	1.079	0.20
567_D	578_A	1.078	0.20
441_Q	484_M	1.070	0.19
155_Q	381_E	1.068	0.19
147_V	427_D	1.065	0.19
477_T	516_T	1.061	0.19
190_F	444_R	1.060	0.19
550_E	554_N	1.060	0.19
248_S	251_E	1.060	0.19
114_S	117_Y	1.058	0.19
207_V	320_L	1.050	0.19
165_I	214_I	1.049	0.19
150_L	476_F	1.039	0.19
80_Y	376_F	1.037	0.19
110_L	131_R	1.034	0.19
150_L	490_C	1.034	0.19
118_T	490_C	1.034	0.19
561_T	587_K	1.032	0.18
72_P	172_G	1.030	0.18
234_V	516_T	1.029	0.18
561_T	564_A	1.028	0.18
117_Y	130_L	1.024	0.18
68_N	534_Q	1.023	0.18
414_H	452_E	1.023	0.18
165_I	484_M	1.012	0.18
259_S	442_M	1.011	0.18
447_M	472_G	1.009	0.18
37_G	42_V	1.009	0.18
234_V	524_A	1.008	0.18
193_H	209_A	1.008	0.18
43_R	140_R	1.005	0.18
198_I	207_V	0.999	0.18
296_I	337_L	0.995	0.18
612_D	624_I	0.990	0.18
384_A	427_D	0.990	0.18
119_K	124_D	0.988	0.18
338_L	593_I	0.988	0.18
516_T	565_Y	0.987	0.18
213_I	284_L	0.987	0.18
214_I	469_I	0.982	0.17
124_D	127_L	0.981	0.17
22_L	236_V	0.974	0.17
377_R	384_A	0.974	0.17
68_N	538_N	0.973	0.17
306_I	511_K	0.972	0.17
209_A	508_E	0.972	0.17
514_L	572_Q	0.966	0.17
383_C	426_Y	0.965	0.17
198_I	519_I	0.963	0.17
171_M	479_G	0.963	0.17
174_E	197_N	0.960	0.17
53_P	315_F	0.960	0.17
118_T	278_E	0.959	0.17
349_T	400_S	0.957	0.17
54_T	66_E	0.957	0.17
407_E	455_H	0.956	0.17
23_E	507_K	0.955	0.17
599_D	610_M	0.955	0.17
287_S	377_R	0.952	0.17
114_S	119_K	0.952	0.17
31_K	50_Q	0.949	0.17
608_M	611_A	0.948	0.17
574_S	577_V	0.947	0.17
120_A	278_E	0.946	0.17
115_S	127_L	0.945	0.17
442_M	490_C	0.943	0.17
594_S	614_S	0.943	0.17
77_S	430_V	0.940	0.17
378_E	381_E	0.940	0.17
450_E	453_H	0.939	0.17
367_H	617_F	0.937	0.16
26_A	32_R	0.936	0.16
576_K	582_S	0.935	0.16
256_L	516_T	0.935	0.16
160_P	163_E	0.935	0.16
165_I	511_K	0.934	0.16
150_L	214_I	0.934	0.16
89_V	250_E	0.932	0.16
89_V	173_R	0.931	0.16
71_I	535_I	0.930	0.16
165_I	234_V	0.930	0.16
188_M	442_M	0.929	0.16
124_D	130_L	0.929	0.16
118_T	131_R	0.926	0.16
151_H	426_Y	0.926	0.16
275_Y	511_K	0.925	0.16
184_Q	534_Q	0.925	0.16
213_I	557_L	0.925	0.16
209_A	456_E	0.925	0.16
101_I	104_R	0.922	0.16
34_Y	45_P	0.919	0.16
175_R	213_I	0.919	0.16
146_R	390_L	0.915	0.16
389_S	479_G	0.914	0.16
466_T	612_D	0.911	0.16
453_H	490_C	0.909	0.16
174_E	519_I	0.908	0.16
101_I	152_Y	0.907	0.16
376_F	432_I	0.905	0.16
51_L	540_M	0.901	0.16
130_L	279_T	0.900	0.16
512_Q	515_I	0.898	0.16
456_E	568_E	0.897	0.16
130_L	278_E	0.897	0.16
209_A	450_E	0.896	0.16
110_L	138_P	0.895	0.16
338_L	364_L	0.895	0.16
118_T	125_D	0.894	0.16
110_L	124_D	0.893	0.16
142_K	381_E	0.892	0.16
89_V	490_C	0.888	0.16
256_L	490_C	0.886	0.15
163_E	309_D	0.884	0.15
311_T	316_R	0.883	0.15
571_P	582_S	0.882	0.15
617_F	624_I	0.882	0.15
400_S	594_S	0.881	0.15
106_D	427_D	0.879	0.15
614_S	620_R	0.878	0.15
184_Q	442_M	0.876	0.15
102_D	107_T	0.874	0.15
22_L	257_V	0.872	0.15
112_V	119_K	0.869	0.15
141_A	427_D	0.868	0.15
194_L	619_A	0.867	0.15
146_R	428_V	0.867	0.15
284_L	389_S	0.867	0.15
346_K	599_D	0.866	0.15
511_K	587_K	0.865	0.15
29_N	620_R	0.865	0.15
420_T	424_W	0.864	0.15
601_A	605_T	0.863	0.15
370_N	411_A	0.860	0.15
617_F	623_E	0.859	0.15
114_S	131_R	0.857	0.15
344_T	582_S	0.856	0.15
426_Y	514_L	0.856	0.15
264_A	267_V	0.855	0.15
46_M	389_S	0.850	0.15
116_D	120_A	0.849	0.15
616_N	620_R	0.848	0.15
23_E	257_V	0.846	0.15
119_K	278_E	0.846	0.15
571_P	576_K	0.845	0.15
621_G	625_Y	0.844	0.15
348_L	542_K	0.844	0.15
451_L	456_E	0.843	0.15
381_E	384_A	0.841	0.15
116_D	121_R	0.840	0.15
600_Y	605_T	0.840	0.15
32_R	66_E	0.833	0.14
441_Q	448_T	0.832	0.14
164_F	546_E	0.830	0.14
71_I	151_H	0.830	0.14
145_R	155_Q	0.828	0.14
81_G	164_F	0.828	0.14
27_F	508_E	0.826	0.14
154_R	563_R	0.825	0.14
610_M	613_M	0.824	0.14
89_V	167_I	0.824	0.14
87_I	378_E	0.820	0.14
27_F	261_R	0.816	0.14
364_L	367_H	0.816	0.14
106_D	223_S	0.812	0.14
576_K	579_H	0.810	0.14
124_D	278_E	0.810	0.14
223_S	378_E	0.810	0.14
146_R	383_C	0.809	0.14
308_E	385_A	0.809	0.14
139_K	514_L	0.808	0.14
124_D	249_I	0.807	0.14
160_P	427_D	0.801	0.14
340_Y	411_A	0.797	0.14
443_I	447_M	0.793	0.14
22_L	27_F	0.790	0.14
256_L	390_L	0.790	0.14
43_R	441_Q	0.790	0.14
68_N	115_S	0.790	0.14
256_L	260_T	0.789	0.14
420_T	431_M	0.789	0.14
402_Q	449_E	0.789	0.14
186_P	442_M	0.787	0.14
238_A	484_M	0.787	0.14
54_T	70_A	0.786	0.14
19_I	274_R	0.786	0.14
209_A	455_H	0.785	0.14
506_N	556_A	0.783	0.14
43_R	85_I	0.782	0.14
45_P	81_G	0.780	0.14
587_K	605_T	0.779	0.14
32_R	80_Y	0.777	0.13
248_S	279_T	0.776	0.13
35_I	383_C	0.774	0.13
80_Y	85_I	0.773	0.13
101_I	107_T	0.773	0.13
51_L	556_A	0.773	0.13
336_V	340_Y	0.769	0.13
359_M	594_S	0.768	0.13
254_E	507_K	0.768	0.13
425_E	624_I	0.767	0.13
611_A	614_S	0.767	0.13
35_I	167_I	0.767	0.13
550_E	572_Q	0.767	0.13
233_L	511_K	0.766	0.13
340_Y	370_N	0.766	0.13
421_K	425_E	0.764	0.13
213_I	260_T	0.759	0.13
81_G	426_Y	0.759	0.13
518_K	599_D	0.757	0.13
260_T	425_E	0.757	0.13
187_G	195_P	0.757	0.13
71_I	359_M	0.757	0.13
146_R	425_E	0.756	0.13
392_L	432_I	0.755	0.13
367_H	593_I	0.752	0.13
250_E	561_T	0.752	0.13
377_R	390_L	0.750	0.13
42_V	164_F	0.749	0.13
68_N	110_L	0.749	0.13
191_G	451_L	0.748	0.13
323_A	385_A	0.747	0.13
368_Q	452_E	0.746	0.13
567_D	579_H	0.745	0.13
128_D	278_E	0.744	0.13
594_S	600_Y	0.743	0.13
213_I	449_E	0.743	0.13
96_L	556_A	0.739	0.13
383_C	479_G	0.738	0.13
80_Y	416_L	0.738	0.13
476_F	490_C	0.737	0.13
518_K	610_M	0.737	0.13
158_I	469_I	0.735	0.13
246_T	256_L	0.735	0.13
613_M	617_F	0.734	0.13
73_V	536_R	0.733	0.13
486_G	569_T	0.732	0.13
154_R	556_A	0.731	0.13
120_A	124_D	0.731	0.13
340_Y	430_V	0.730	0.13
304_N	309_D	0.730	0.13
88_N	91_Q	0.729	0.13
261_R	416_L	0.729	0.13
251_E	259_S	0.728	0.13
570_L	574_S	0.724	0.13
570_L	582_S	0.723	0.13
119_K	507_K	0.723	0.13
172_G	511_K	0.723	0.13
274_R	575_G	0.722	0.13
315_F	374_Q	0.721	0.13
608_M	612_D	0.721	0.13
37_G	41_G	0.720	0.13
566_H	578_A	0.720	0.13
118_T	260_T	0.717	0.13
22_L	89_V	0.714	0.12
259_S	565_Y	0.714	0.12
130_L	134_G	0.713	0.12
597_V	601_A	0.712	0.12
367_H	625_Y	0.711	0.12
22_L	256_L	0.711	0.12
122_L	128_D	0.709	0.12
150_L	274_R	0.709	0.12
209_A	441_Q	0.708	0.12
188_M	192_A	0.707	0.12
278_E	542_K	0.707	0.12
466_T	470_A	0.706	0.12
144_G	160_P	0.706	0.12
605_T	612_D	0.704	0.12
146_R	377_R	0.702	0.12
374_Q	426_Y	0.702	0.12
46_M	163_E	0.700	0.12
348_L	484_M	0.700	0.12
125_D	128_D	0.700	0.12
374_Q	383_C	0.700	0.12
194_L	236_V	0.700	0.12
80_Y	392_L	0.699	0.12
29_N	188_M	0.699	0.12
571_P	578_A	0.699	0.12
158_I	346_K	0.699	0.12
422_I	425_E	0.698	0.12
115_S	130_L	0.696	0.12
257_V	407_E	0.696	0.12
148_T	155_Q	0.693	0.12
567_D	580_F	0.693	0.12
384_A	425_E	0.693	0.12
158_I	248_S	0.690	0.12
35_I	313_E	0.690	0.12
130_L	538_N	0.686	0.12
320_L	445_R	0.686	0.12
430_V	450_E	0.686	0.12
77_S	465_L	0.684	0.12
506_N	601_A	0.683	0.12
566_H	570_L	0.683	0.12
151_H	160_P	0.682	0.12
117_Y	122_L	0.679	0.12
111_T	378_E	0.679	0.12
374_Q	384_A	0.679	0.12
344_T	567_D	0.678	0.12
560_F	563_R	0.678	0.12
18_F	514_L	0.677	0.12
374_Q	532_G	0.675	0.12
389_S	594_S	0.675	0.12
95_K	323_A	0.674	0.12
566_H	576_K	0.674	0.12
569_T	582_S	0.673	0.12
106_D	160_P	0.673	0.12
586_P	593_I	0.673	0.12
599_D	614_S	0.673	0.12
608_M	619_A	0.671	0.12
564_A	568_E	0.671	0.12
29_N	207_V	0.671	0.12
184_Q	187_G	0.670	0.12
113_R	124_D	0.668	0.12
410_F	449_E	0.666	0.12
348_L	444_R	0.666	0.12
407_E	452_E	0.666	0.12
315_F	378_E	0.665	0.12
296_I	340_Y	0.665	0.12
187_G	487_W	0.664	0.12
309_D	343_M	0.664	0.12
18_F	575_G	0.664	0.12
395_G	548_R	0.664	0.12
374_Q	390_L	0.663	0.12
40_P	43_R	0.663	0.12
105_G	112_V	0.663	0.12
506_N	511_K	0.663	0.12
102_D	223_S	0.662	0.12
49_I	536_R	0.662	0.12
167_I	448_T	0.662	0.12
114_S	278_E	0.661	0.12
455_H	530_H	0.661	0.12
486_G	515_I	0.660	0.12
42_V	421_K	0.660	0.12
27_F	90_Q	0.658	0.12
51_L	76_T	0.658	0.12
622_G	626_L	0.657	0.12
307_A	338_L	0.657	0.12
71_I	425_E	0.656	0.12
337_L	490_C	0.656	0.12
160_P	167_I	0.656	0.12
43_R	421_K	0.655	0.12
259_S	267_V	0.655	0.12
39_H	43_R	0.652	0.11
337_L	466_T	0.652	0.11
367_H	621_G	0.652	0.11
209_A	234_V	0.651	0.11
309_D	518_K	0.651	0.11
296_I	336_V	0.651	0.11
606_I	624_I	0.650	0.11
110_L	127_L	0.650	0.11
142_K	346_K	0.649	0.11
231_N	456_E	0.649	0.11
450_E	538_N	0.648	0.11
440_M	480_I	0.646	0.11
114_S	120_A	0.646	0.11
164_F	444_R	0.644	0.11
338_L	361_K	0.644	0.11
566_H	569_T	0.643	0.11
279_T	546_E	0.640	0.11
71_I	594_S	0.640	0.11
314_A	611_A	0.639	0.11
246_T	385_A	0.639	0.11
452_E	455_H	0.639	0.11
274_R	466_T	0.636	0.11
257_V	376_F	0.636	0.11
278_E	428_V	0.633	0.11
39_H	107_T	0.633	0.11
66_E	278_E	0.633	0.11
617_F	625_Y	0.632	0.11
167_I	507_K	0.631	0.11
48_E	390_L	0.631	0.11
337_L	415_T	0.631	0.11
306_I	596_E	0.631	0.11
155_Q	427_D	0.630	0.11
164_F	368_Q	0.630	0.11
38_T	120_A	0.629	0.11
337_L	442_M	0.628	0.11
152_Y	163_E	0.627	0.11
275_Y	450_E	0.625	0.11
606_I	613_M	0.624	0.11
361_K	596_E	0.624	0.11
114_S	118_T	0.623	0.11
160_P	428_V	0.622	0.11
307_A	365_S	0.622	0.11
396_L	431_M	0.621	0.11
37_G	106_D	0.621	0.11
35_I	142_K	0.619	0.11
579_H	582_S	0.619	0.11
411_A	452_E	0.619	0.11
422_I	426_Y	0.619	0.11
343_M	411_A	0.617	0.11
444_R	455_H	0.617	0.11
155_Q	488_F	0.617	0.11
592_K	596_E	0.616	0.11
43_R	84_Q	0.615	0.11
165_I	560_F	0.614	0.11
34_Y	515_I	0.614	0.11
118_T	130_L	0.614	0.11
151_H	278_E	0.613	0.11
338_L	579_H	0.612	0.11
207_V	309_D	0.612	0.11
152_Y	427_D	0.611	0.11
52_S	515_I	0.611	0.11
569_T	579_H	0.611	0.11
316_R	375_H	0.610	0.11
23_E	441_Q	0.607	0.11
519_I	568_E	0.607	0.11
396_L	465_L	0.606	0.11
163_E	308_E	0.605	0.11
99_P	103_A	0.604	0.11
207_V	244_A	0.604	0.11
466_T	477_T	0.604	0.11
31_K	568_E	0.604	0.11
68_N	546_E	0.604	0.11
450_E	484_M	0.604	0.11
79_P	103_A	0.603	0.11
43_R	103_A	0.601	0.11
341_V	469_I	0.601	0.11
71_I	532_G	0.600	0.11
296_I	519_I	0.600	0.11
416_L	426_Y	0.600	0.11
137_T	164_F	0.600	0.11
476_F	479_G	0.600	0.11
33_I	540_M	0.599	0.11
445_R	449_E	0.599	0.11
231_N	472_G	0.598	0.11
128_D	431_M	0.598	0.11
124_D	129_E	0.598	0.11
45_P	96_L	0.598	0.11
438_V	447_M	0.598	0.11
304_N	384_A	0.597	0.11
616_N	619_A	0.597	0.11
278_E	281_E	0.596	0.11
407_E	449_E	0.596	0.11
384_A	428_V	0.596	0.11
32_R	384_A	0.595	0.11
238_A	260_T	0.595	0.11
514_L	574_S	0.594	0.11
113_R	275_Y	0.593	0.11
332_I	379_I	0.592	0.11
73_V	384_A	0.592	0.11
178_S	309_D	0.592	0.11
127_L	278_E	0.591	0.11
620_R	626_L	0.591	0.11
479_G	512_Q	0.591	0.11
233_L	614_S	0.590	0.11
614_S	617_F	0.590	0.11
364_L	579_H	0.590	0.11
68_N	185_H	0.589	0.11
192_A	213_I	0.588	0.11
248_S	308_E	0.588	0.11
171_M	304_N	0.588	0.11
319_L	330_F	0.587	0.11
96_L	223_S	0.587	0.11
185_H	196_E	0.587	0.11
132_F	152_Y	0.586	0.11
68_N	121_R	0.586	0.11
385_A	514_L	0.586	0.11
36_T	72_P	0.586	0.11
566_H	579_H	0.584	0.11
163_E	306_I	0.584	0.11
338_L	617_F	0.584	0.11
173_R	177_R	0.582	0.10
383_C	449_E	0.582	0.10
315_F	514_L	0.582	0.10
248_S	447_M	0.582	0.10
19_I	514_L	0.581	0.10
81_G	261_R	0.581	0.10
80_Y	257_V	0.580	0.10
539_A	548_R	0.580	0.10
370_N	476_F	0.580	0.10
77_S	396_L	0.579	0.10
46_M	167_I	0.578	0.10
538_N	614_S	0.578	0.10
238_A	442_M	0.577	0.10
73_V	136_L	0.577	0.10
348_L	359_M	0.577	0.10
128_D	133_S	0.577	0.10
31_K	54_T	0.576	0.10
85_I	94_A	0.575	0.10
194_L	574_S	0.574	0.10
173_R	260_T	0.574	0.10
512_Q	587_K	0.574	0.10
19_I	22_L	0.574	0.10
33_I	72_P	0.573	0.10
35_I	314_A	0.573	0.10
607_E	611_A	0.573	0.10
420_T	592_K	0.572	0.10
360_A	590_S	0.571	0.10
37_G	46_M	0.571	0.10
507_K	538_N	0.569	0.10
440_M	466_T	0.567	0.10
45_P	223_S	0.567	0.10
120_A	250_E	0.566	0.10
37_G	152_Y	0.565	0.10
388_V	414_H	0.565	0.10
32_R	426_Y	0.565	0.10
395_G	477_T	0.565	0.10
68_N	249_I	0.563	0.10
264_A	590_S	0.562	0.10
25_T	249_I	0.562	0.10
158_I	320_L	0.562	0.10
128_D	131_R	0.561	0.10
279_T	542_K	0.560	0.10
447_M	450_E	0.560	0.10
123_A	574_S	0.560	0.10
139_K	314_A	0.560	0.10
68_N	119_K	0.559	0.10
515_I	519_I	0.559	0.10
27_F	610_M	0.559	0.10
150_L	154_R	0.557	0.10
184_Q	526_L	0.557	0.10
309_D	385_A	0.557	0.10
262_W	357_S	0.556	0.10
207_V	486_G	0.556	0.10
173_R	538_N	0.556	0.10
110_L	534_Q	0.555	0.10
115_S	538_N	0.555	0.10
42_V	442_M	0.554	0.10
148_T	274_R	0.554	0.10
189_S	192_A	0.554	0.10
428_V	532_G	0.554	0.10
181_L	507_K	0.553	0.10
447_M	466_T	0.552	0.10
313_E	445_R	0.552	0.10
338_L	357_S	0.552	0.10
36_T	41_G	0.551	0.10
466_T	515_I	0.551	0.10
33_I	85_I	0.551	0.10
379_I	448_T	0.550	0.10
390_L	438_V	0.550	0.10
323_A	560_F	0.550	0.10
264_A	442_M	0.550	0.10
54_T	542_K	0.550	0.10
198_I	233_L	0.549	0.10
587_K	590_S	0.548	0.10
150_L	383_C	0.547	0.10
150_L	486_G	0.546	0.10
309_D	370_N	0.545	0.10
450_E	466_T	0.545	0.10
506_N	515_I	0.544	0.10
150_L	250_E	0.544	0.10
79_P	84_Q	0.542	0.10
539_A	546_E	0.542	0.10
400_S	443_I	0.542	0.10
514_L	565_Y	0.542	0.10
138_P	279_T	0.541	0.10
565_Y	569_T	0.540	0.10
118_T	127_L	0.540	0.10
39_H	514_L	0.539	0.10
106_D	163_E	0.538	0.10
364_L	586_P	0.538	0.10
236_V	264_A	0.538	0.10
19_I	23_E	0.536	0.10
377_R	383_C	0.536	0.10
173_R	267_V	0.535	0.10
578_A	582_S	0.535	0.10
133_S	619_A	0.535	0.10
95_K	197_N	0.534	0.10
383_C	514_L	0.534	0.10
343_M	479_G	0.533	0.10
367_H	609_G	0.532	0.10
442_M	614_S	0.531	0.10
315_F	530_H	0.531	0.10
344_T	576_K	0.530	0.10
118_T	249_I	0.530	0.10
374_Q	594_S	0.530	0.10
569_T	576_K	0.530	0.10
606_I	616_N	0.530	0.10
615_E	618_R	0.529	0.10
68_N	279_T	0.529	0.10
95_K	314_A	0.529	0.10
110_L	130_L	0.528	0.10
205_D	615_E	0.527	0.10
19_I	572_Q	0.527	0.10
365_S	592_K	0.527	0.10
498_P	586_P	0.527	0.10
73_V	284_L	0.527	0.10
27_F	112_V	0.526	0.10
254_E	411_A	0.525	0.10
370_N	577_V	0.525	0.10
207_V	484_M	0.525	0.10
181_L	542_K	0.525	0.10
158_I	260_T	0.525	0.10
342_P	590_S	0.524	0.10
340_Y	592_K	0.524	0.10
71_I	555_L	0.523	0.10
25_T	514_L	0.523	0.10
22_L	250_E	0.522	0.10
374_Q	575_G	0.522	0.10
401_I	532_G	0.522	0.10
307_A	427_D	0.522	0.10
617_F	622_G	0.521	0.10
115_S	532_G	0.521	0.10
81_G	560_F	0.520	0.10
617_F	621_G	0.520	0.10
25_T	207_V	0.520	0.10
71_I	198_I	0.519	0.10
264_A	360_A	0.519	0.10
185_H	542_K	0.518	0.10
602_A	622_G	0.518	0.10
246_T	516_T	0.518	0.10
582_S	598_R	0.518	0.10
24_G	384_A	0.518	0.10
213_I	555_L	0.518	0.10
308_E	592_K	0.517	0.10
261_R	376_F	0.517	0.10
606_I	614_S	0.516	0.10
240_I	267_V	0.516	0.10
51_L	381_E	0.516	0.10
364_L	593_I	0.516	0.10
141_A	146_R	0.515	0.10
213_I	424_W	0.514	0.10
91_Q	98_Q	0.514	0.10
36_T	39_H	0.513	0.10
113_R	116_D	0.513	0.10
35_I	48_E	0.513	0.10
119_K	127_L	0.512	0.10
443_I	530_H	0.512	0.10
515_I	561_T	0.512	0.10
233_L	484_M	0.512	0.10
115_S	122_L	0.512	0.10
38_T	174_E	0.512	0.10
119_K	122_L	0.512	0.10
390_L	479_G	0.511	0.10
171_M	377_R	0.511	0.10
337_L	516_T	0.511	0.10
96_L	101_I	0.509	0.10
341_V	486_G	0.509	0.10
89_V	479_G	0.508	0.10
367_H	579_H	0.507	0.10
244_A	593_I	0.507	0.10
163_E	185_H	0.507	0.10
68_N	613_M	0.506	0.09
311_T	407_E	0.506	0.09
117_Y	425_E	0.506	0.09
344_T	566_H	0.506	0.09
368_Q	507_K	0.505	0.09
29_N	550_E	0.505	0.09
336_V	595_Q	0.504	0.09
415_T	571_P	0.504	0.09
296_I	575_G	0.503	0.09
119_K	131_R	0.503	0.09
103_A	160_P	0.502	0.09
195_P	506_N	0.502	0.09
146_R	150_L	0.502	0.09
148_T	407_E	0.502	0.09
484_M	561_T	0.501	0.09
304_N	508_E	0.501	0.09
304_N	624_I	0.501	0.09
258_W	262_W	0.500	0.09
160_P	575_G	0.500	0.09
171_M	197_N	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3epoA	2	0.832	100	0.21	Contact Map
4s28A	2	0.8067	100	0.289	Contact Map
3fysA	1	0.065	23.5	0.992	Contact Map
4k0mC	1	0.1426	20.3	0.992	Contact Map
3s4oA	1	0.2425	18.1	0.992	Contact Map
3hxiC	1	0.019	15.8	0.992	Contact Map
1qtwA	1	0.3724	14.2	0.992	Contact Map
1zr9A	1	0.0919	11.7	0.993	Contact Map
2l8eA	1	0.0602	11.4	0.993	Contact Map
4h3dA	2	0.3391	11	0.993	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0141 seconds.