ADIA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

ADIA - Biodegradative arginine decarboxylase

UniProt:	P28629	Sequences: MKVLIVESEFLHQDTWVGNAVERLADALSQQNVTVIKSTSFDDGFAILSSNEAIDCLMFSYQMEHPDEHQNVRQLIGKLHERQQNVPVFLLGDREKALAAMDRDLLELVDEFAWILEDTADFIAGRAVAAMTRYRQQLLPPLFSALMKYSDIHEYSWAAPGHQGGVGFTKTPAGRFYHDYYGENLFRTDMGIERTSLGSLLDHTGAFGESEKYAARVFGADRSWSVVVGTSGSNRTIMQACMTDNDVVVVDRNCHKSIEQGLMLTGAKPVYMVPSRNRYGIIGPIYPQEMQPETLQKKISESPLTKDKAGQKPSYCVVTNCTYDGVCYNAKEAQDLLEKTSDRLHFDEAWYGYARFNPIYADHYAMRGEPGDHNGPTVFATHSTHKLLNALSQASYIHVREGRGAINFSRFNQAYMMHATTSPLYAICASNDVAVSMMDGNSGLSLTQEVIDEAVDFRQAMARLYKEFTADGSWFFKPWNKEVVTDPQTGKTYDFADAPTKLLTTVQDCWVMHPGESWHGFKDIPDNWSMLDPIKVSILAPGMGEDGELEETGVPAALVTAWLGRHGIVPTRTTDFQIMFLFSMGVTRGKWGTLVNTLCSFKRHYDANTPLAQVMPELVEQYPDTYANMGIHDLGDTMFAWLKENNPGARLNEAYSGLPVAEVTPREAYNAIVDNNVELVSIENLPGRIAANSVIPYPPGIPMLLSGENFGDKNSPQVSYLRSLQSWDHHFPGFEHETEGTEIIDGIYHVMCVKA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11501
Length:	755 (700)
Sequences:	649 (277)
Seq/√Len:	10.5

ECOLI - ADIA LDCI DCLZ DCOS DCOR

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
678_E	688_R	7.520	1.00
671_A	676_N	7.057	1.00
604_H	609_T	6.221	1.00
223_S	398_H	5.904	1.00
242_M	267_A	5.885	1.00
513_H	516_E	5.544	1.00
159_A	191_G	5.438	1.00
394_A	430_S	5.026	1.00
608_N	633_D	4.918	1.00
143_F	432_D	4.781	1.00
181_Y	188_T	4.725	1.00
89_F	130_A	4.379	0.99
215_A	220_A	4.377	0.99
159_A	193_E	4.345	0.99
365_A	380_A	4.163	0.99
562_W	600_S	4.131	0.99
660_V	709_N	3.895	0.99
610_P	613_Q	3.814	0.99
76_I	88_V	3.766	0.98
230_T	381_T	3.729	0.98
608_N	630_G	3.639	0.98
454_A	582_F	3.534	0.98
236_T	419_A	3.525	0.97
536_V	582_F	2.926	0.93
237_I	379_F	2.876	0.92
630_G	633_D	2.832	0.91
197_L	411_F	2.831	0.91
672_I	701_I	2.799	0.91
244_D	670_N	2.717	0.90
681_S	684_N	2.713	0.89
158_A	417_M	2.686	0.89
177_Y	430_S	2.667	0.89
625_T	637_T	2.646	0.88
677_V	691_A	2.621	0.88
474_W	606_D	2.593	0.87
191_G	572_R	2.573	0.87
167_G	438_M	2.539	0.86
224_W	408_F	2.449	0.84
260_Q	418_H	2.408	0.83
379_F	411_F	2.403	0.83
554_V	605_Y	2.402	0.83
206_A	242_M	2.393	0.82
159_A	192_I	2.384	0.82
202_D	737_E	2.367	0.82
213_Y	216_R	2.366	0.82
683_E	722_R	2.366	0.82
213_Y	217_V	2.351	0.81
576_F	639_F	2.340	0.81
127_A	295_L	2.324	0.80
120_A	124_A	2.308	0.80
210_S	225_S	2.294	0.79
566_H	600_S	2.273	0.79
207_F	428_C	2.255	0.78
227_V	427_I	2.226	0.77
225_S	431_N	2.211	0.77
457_F	582_F	2.204	0.77
475_F	606_D	2.178	0.76
214_A	225_S	2.167	0.75
395_S	697_Y	2.146	0.75
649_A	653_E	2.128	0.74
217_V	439_D	2.121	0.74
163_Q	191_G	2.112	0.73
185_L	426_A	2.110	0.73
193_E	571_T	2.052	0.71
235_R	260_Q	2.033	0.70
236_T	595_V	2.027	0.70
247_V	313_P	1.990	0.69
113_A	127_A	1.955	0.67
259_E	705_L	1.941	0.67
511_V	527_N	1.915	0.65
157_W	284_P	1.910	0.65
183_E	187_R	1.907	0.65
420_T	737_E	1.901	0.65
516_E	551_E	1.894	0.65
143_F	147_M	1.877	0.64
206_A	554_V	1.843	0.62
158_A	191_G	1.841	0.62
216_R	439_D	1.830	0.62
233_S	701_I	1.826	0.62
430_S	719_S	1.826	0.62
646_N	649_A	1.806	0.61
297_K	301_E	1.785	0.60
201_L	228_V	1.769	0.59
392_S	423_P	1.765	0.59
257_S	696_P	1.740	0.58
502_L	506_V	1.736	0.58
262_L	344_L	1.728	0.57
332_E	335_D	1.728	0.57
197_L	437_M	1.727	0.57
237_I	267_A	1.723	0.57
248_V	262_L	1.721	0.57
74_Q	689_I	1.718	0.57
175_R	179_D	1.716	0.57
611_L	625_T	1.711	0.56
230_T	235_R	1.699	0.56
140_P	353_Y	1.697	0.56
149_Y	159_A	1.681	0.55
185_L	391_L	1.677	0.55
125_G	153_H	1.671	0.55
197_L	207_F	1.669	0.54
27_A	30_Q	1.668	0.54
181_Y	216_R	1.665	0.54
180_Y	184_N	1.662	0.54
161_G	395_S	1.655	0.54
476_F	598_L	1.654	0.54
159_A	321_C	1.648	0.53
251_D	322_T	1.645	0.53
167_G	389_N	1.635	0.53
213_Y	439_D	1.615	0.52
420_T	571_T	1.612	0.52
457_F	536_V	1.611	0.52
228_V	232_G	1.610	0.52
390_A	396_Y	1.609	0.52
285_I	318_V	1.607	0.52
457_F	585_G	1.591	0.51
562_W	566_H	1.570	0.50
228_V	393_Q	1.568	0.50
186_F	261_G	1.553	0.49
83_Q	167_G	1.548	0.49
247_V	299_I	1.545	0.49
159_A	163_Q	1.541	0.48
663_V	671_A	1.538	0.48
397_I	634_L	1.536	0.48
181_Y	382_H	1.533	0.48
434_A	580_F	1.531	0.48
76_I	411_F	1.525	0.48
321_C	739_E	1.513	0.47
158_A	190_M	1.494	0.46
619_V	623_P	1.490	0.46
284_P	348_E	1.489	0.46
208_G	212_K	1.489	0.46
662_E	709_N	1.478	0.46
158_A	163_Q	1.478	0.46
348_E	351_Y	1.475	0.45
180_Y	188_T	1.472	0.45
644_E	730_H	1.470	0.45
330_A	669_Y	1.462	0.45
244_D	666_R	1.459	0.45
415_Y	617_E	1.459	0.45
357_N	447_T	1.456	0.44
26_D	30_Q	1.451	0.44
510_W	520_G	1.449	0.44
461_M	598_L	1.447	0.44
562_W	604_H	1.445	0.44
177_Y	181_Y	1.437	0.44
163_Q	193_E	1.427	0.43
514_P	526_D	1.419	0.43
329_N	527_N	1.418	0.43
382_H	564_G	1.410	0.42
236_T	248_V	1.402	0.42
159_A	572_R	1.401	0.42
537_S	577_Q	1.398	0.42
216_R	566_H	1.390	0.41
719_S	722_R	1.388	0.41
146_L	429_A	1.386	0.41
214_A	223_S	1.386	0.41
153_H	243_T	1.383	0.41
558_L	635_G	1.373	0.41
23_R	36_I	1.361	0.40
194_R	572_R	1.354	0.40
260_Q	417_M	1.351	0.40
167_G	454_A	1.348	0.40
111_E	122_F	1.347	0.40
167_G	536_V	1.347	0.40
181_Y	379_F	1.338	0.39
392_S	590_K	1.337	0.39
149_Y	290_M	1.337	0.39
250_V	302_S	1.331	0.39
573_T	605_Y	1.322	0.38
159_A	194_R	1.316	0.38
173_A	220_A	1.312	0.38
148_K	683_E	1.309	0.38
231_S	260_Q	1.309	0.38
395_S	696_P	1.301	0.37
142_L	318_V	1.292	0.37
188_T	673_V	1.291	0.37
544_G	550_E	1.287	0.37
612_A	628_N	1.282	0.37
331_K	362_D	1.279	0.37
233_S	598_L	1.272	0.36
277_N	542_G	1.270	0.36
387_L	534_I	1.270	0.36
161_G	697_Y	1.269	0.36
568_I	719_S	1.269	0.36
201_L	226_V	1.264	0.36
542_G	626_Y	1.257	0.36
250_V	259_E	1.256	0.36
391_L	424_L	1.253	0.35
236_T	397_I	1.249	0.35
184_N	295_L	1.243	0.35
271_Y	416_M	1.231	0.34
337_L	531_L	1.230	0.34
281_I	479_W	1.230	0.34
235_R	418_H	1.228	0.34
453_E	591_W	1.228	0.34
265_T	685_L	1.228	0.34
227_V	261_G	1.227	0.34
264_L	295_L	1.225	0.34
159_A	326_V	1.222	0.34
635_G	639_F	1.219	0.34
234_N	697_Y	1.217	0.34
89_F	318_V	1.215	0.34
279_Y	589_G	1.215	0.34
286_Y	531_L	1.215	0.34
186_F	449_E	1.213	0.34
231_S	423_P	1.207	0.33
620_E	746_G	1.207	0.33
149_Y	201_L	1.205	0.33
573_T	705_L	1.205	0.33
680_V	718_V	1.203	0.33
590_K	659_P	1.195	0.33
363_H	507_Q	1.190	0.33
343_R	377_T	1.189	0.33
233_S	516_E	1.185	0.33
235_R	259_E	1.184	0.32
241_C	379_F	1.181	0.32
237_I	248_V	1.179	0.32
30_Q	77_G	1.178	0.32
633_D	719_S	1.176	0.32
181_Y	410_R	1.176	0.32
159_A	199_S	1.168	0.32
34_T	63_M	1.168	0.32
56_C	89_F	1.167	0.32
166_V	411_F	1.166	0.32
295_L	299_I	1.159	0.31
686_P	712_D	1.154	0.31
298_K	301_E	1.151	0.31
72_V	568_I	1.148	0.31
230_T	263_M	1.148	0.31
340_T	377_T	1.147	0.31
589_G	598_L	1.145	0.31
320_N	390_A	1.144	0.31
111_E	654_A	1.142	0.31
568_I	689_I	1.142	0.31
191_G	195_T	1.142	0.31
455_V	504_T	1.142	0.31
440_G	523_D	1.140	0.31
396_Y	431_N	1.138	0.31
73_R	92_G	1.138	0.31
185_L	554_V	1.135	0.31
320_N	396_Y	1.135	0.31
101_M	516_E	1.135	0.31
366_M	394_A	1.132	0.30
241_C	406_I	1.130	0.30
669_Y	673_V	1.127	0.30
476_F	537_S	1.127	0.30
191_G	579_M	1.122	0.30
171_T	413_Q	1.118	0.30
709_N	713_K	1.117	0.30
102_D	105_L	1.117	0.30
232_G	379_F	1.117	0.30
641_W	703_M	1.114	0.30
711_G	717_Q	1.113	0.30
158_A	193_E	1.109	0.29
188_T	264_L	1.109	0.29
190_M	528_W	1.109	0.29
50_S	54_I	1.107	0.29
267_A	723_S	1.103	0.29
327_C	641_W	1.103	0.29
191_G	194_R	1.102	0.29
80_H	108_L	1.101	0.29
499_P	502_L	1.098	0.29
88_V	233_S	1.098	0.29
149_Y	230_T	1.085	0.29
452_D	667_E	1.085	0.29
192_I	272_M	1.083	0.28
485_T	508_D	1.083	0.28
393_Q	556_A	1.082	0.28
286_Y	705_L	1.081	0.28
423_P	443_G	1.080	0.28
235_R	290_M	1.079	0.28
250_V	537_S	1.075	0.28
287_P	525_P	1.072	0.28
314_S	583_S	1.071	0.28
142_L	210_S	1.066	0.28
21_V	682_I	1.064	0.28
313_P	454_A	1.062	0.28
338_E	376_P	1.061	0.28
222_R	408_F	1.060	0.28
391_L	564_G	1.058	0.28
272_M	290_M	1.057	0.28
454_A	588_R	1.056	0.27
289_E	298_K	1.056	0.27
143_F	727_W	1.052	0.27
588_R	592_G	1.050	0.27
199_S	320_N	1.048	0.27
210_S	431_N	1.046	0.27
30_Q	73_R	1.045	0.27
712_D	719_S	1.043	0.27
161_G	282_I	1.042	0.27
201_L	421_T	1.041	0.27
171_T	228_V	1.037	0.27
185_L	424_L	1.035	0.27
270_V	704_L	1.033	0.27
636_D	640_A	1.027	0.26
81_E	86_V	1.027	0.26
160_P	535_K	1.023	0.26
397_I	411_F	1.020	0.26
89_F	691_A	1.020	0.26
211_E	241_C	1.019	0.26
559_V	578_I	1.019	0.26
170_K	605_Y	1.019	0.26
232_G	672_I	1.017	0.26
188_T	315_Y	1.013	0.26
513_H	526_D	1.012	0.26
214_A	266_G	1.008	0.26
191_G	396_Y	1.008	0.26
228_V	413_Q	1.008	0.26
414_A	696_P	1.007	0.26
257_S	697_Y	1.006	0.26
641_W	645_N	1.004	0.26
149_Y	415_Y	1.003	0.26
151_D	513_H	1.002	0.25
234_N	257_S	0.998	0.25
348_E	363_H	0.997	0.25
398_H	556_A	0.997	0.25
111_E	225_S	0.997	0.25
544_G	631_I	0.997	0.25
677_V	713_K	0.994	0.25
348_E	354_A	0.994	0.25
219_G	348_E	0.985	0.25
145_A	388_L	0.981	0.25
147_M	562_W	0.979	0.25
348_E	530_M	0.979	0.25
381_T	393_Q	0.979	0.25
119_T	122_F	0.978	0.25
217_V	233_S	0.978	0.25
260_Q	702_P	0.977	0.25
236_T	680_V	0.973	0.24
98_L	604_H	0.971	0.24
158_A	327_C	0.969	0.24
326_V	479_W	0.969	0.24
370_P	455_V	0.969	0.24
78_K	86_V	0.968	0.24
193_E	528_W	0.966	0.24
711_G	719_S	0.963	0.24
231_S	417_M	0.962	0.24
288_Q	294_T	0.962	0.24
257_S	414_A	0.961	0.24
281_I	373_H	0.960	0.24
199_S	390_A	0.958	0.24
300_S	644_E	0.957	0.24
218_F	388_L	0.957	0.24
561_A	574_T	0.954	0.24
660_V	719_S	0.954	0.24
567_G	604_H	0.954	0.24
292_P	296_Q	0.954	0.24
145_A	658_L	0.951	0.24
434_A	680_V	0.951	0.24
231_S	418_H	0.949	0.24
210_S	233_S	0.949	0.24
197_L	361_A	0.949	0.24
358_P	532_D	0.949	0.24
300_S	308_K	0.948	0.24
243_T	674_D	0.947	0.24
382_H	398_H	0.946	0.24
186_F	570_P	0.946	0.24
579_M	706_S	0.945	0.24
499_P	503_L	0.943	0.23
384_T	396_Y	0.942	0.23
342_D	401_E	0.940	0.23
219_G	355_R	0.940	0.23
200_L	733_G	0.937	0.23
475_F	577_Q	0.935	0.23
238_M	406_I	0.935	0.23
159_A	739_E	0.932	0.23
272_M	615_M	0.931	0.23
208_G	598_L	0.929	0.23
313_P	479_W	0.928	0.23
306_K	638_M	0.927	0.23
551_E	730_H	0.922	0.23
551_E	643_K	0.922	0.23
607_A	687_G	0.919	0.23
519_H	542_G	0.916	0.23
186_F	571_T	0.915	0.23
218_F	675_N	0.913	0.22
576_F	580_F	0.912	0.22
157_W	701_I	0.910	0.22
175_R	641_W	0.909	0.22
281_I	597_T	0.909	0.22
378_V	682_I	0.909	0.22
247_V	286_Y	0.908	0.22
329_N	414_A	0.907	0.22
329_N	677_V	0.907	0.22
291_Q	336_L	0.906	0.22
358_P	576_F	0.906	0.22
248_V	374_N	0.906	0.22
295_L	719_S	0.904	0.22
464_L	725_Q	0.902	0.22
290_M	391_L	0.900	0.22
192_I	705_L	0.898	0.22
212_K	270_V	0.897	0.22
449_E	452_D	0.897	0.22
71_N	675_N	0.896	0.22
88_V	672_I	0.896	0.22
453_E	582_F	0.894	0.22
275_S	650_R	0.893	0.22
308_K	641_W	0.893	0.22
101_M	147_M	0.891	0.22
202_D	319_T	0.891	0.22
235_R	702_P	0.890	0.22
478_P	570_P	0.889	0.22
534_I	702_P	0.887	0.22
329_N	507_Q	0.886	0.22
585_G	605_Y	0.885	0.22
629_M	637_T	0.884	0.22
581_L	590_K	0.883	0.21
77_G	108_L	0.881	0.21
200_L	571_T	0.879	0.21
253_N	390_A	0.879	0.21
127_A	738_T	0.879	0.21
234_N	696_P	0.878	0.21
108_L	644_E	0.878	0.21
510_W	718_V	0.876	0.21
321_C	413_Q	0.876	0.21
132_T	548_E	0.875	0.21
501_K	680_V	0.874	0.21
156_S	691_A	0.873	0.21
125_G	158_A	0.873	0.21
44_G	47_I	0.872	0.21
338_E	352_G	0.870	0.21
425_Y	518_W	0.869	0.21
537_S	709_N	0.868	0.21
301_E	411_F	0.867	0.21
30_Q	36_I	0.866	0.21
607_A	719_S	0.865	0.21
443_G	446_L	0.865	0.21
451_I	534_I	0.864	0.21
23_R	89_F	0.863	0.21
420_T	572_R	0.863	0.21
193_E	572_R	0.862	0.21
223_S	427_I	0.862	0.21
142_L	214_A	0.862	0.21
262_L	330_A	0.862	0.21
260_Q	285_I	0.860	0.21
157_W	348_E	0.859	0.21
475_F	670_N	0.859	0.21
63_M	75_L	0.857	0.21
141_P	443_G	0.856	0.21
180_Y	696_P	0.856	0.21
431_N	574_T	0.856	0.21
396_Y	480_N	0.855	0.21
474_W	602_K	0.851	0.20
724_L	728_D	0.851	0.20
634_L	734_F	0.849	0.20
390_A	434_A	0.847	0.20
268_K	701_I	0.846	0.20
537_S	639_F	0.846	0.20
291_Q	689_I	0.846	0.20
254_C	319_T	0.845	0.20
22_E	26_D	0.844	0.20
79_L	113_A	0.843	0.20
340_T	376_P	0.843	0.20
451_I	530_M	0.839	0.20
154_E	391_L	0.839	0.20
210_S	572_R	0.839	0.20
150_S	416_M	0.837	0.20
620_E	653_E	0.836	0.20
243_T	685_L	0.833	0.20
522_K	527_N	0.833	0.20
50_S	53_A	0.832	0.20
35_V	538_I	0.832	0.20
396_Y	478_P	0.832	0.20
54_I	75_L	0.831	0.20
93_D	105_L	0.831	0.20
359_I	530_M	0.831	0.20
413_Q	420_T	0.830	0.20
122_F	177_Y	0.830	0.20
411_F	589_G	0.830	0.20
142_L	230_T	0.829	0.20
21_V	59_F	0.828	0.20
297_K	300_S	0.828	0.20
104_D	136_Q	0.828	0.20
326_V	648_G	0.828	0.20
231_S	392_S	0.827	0.20
158_A	168_F	0.827	0.20
261_G	570_P	0.825	0.20
326_V	577_Q	0.825	0.20
186_F	357_N	0.822	0.20
190_M	238_M	0.822	0.20
340_T	343_R	0.820	0.20
246_D	314_S	0.819	0.20
416_M	425_Y	0.819	0.20
215_A	734_F	0.819	0.20
185_L	378_V	0.817	0.19
216_R	662_E	0.816	0.19
394_A	427_I	0.815	0.19
596_N	599_C	0.815	0.19
181_Y	186_F	0.814	0.19
239_Q	264_L	0.813	0.19
196_S	258_I	0.811	0.19
217_V	435_V	0.808	0.19
352_G	566_H	0.807	0.19
232_G	420_T	0.805	0.19
574_T	639_F	0.805	0.19
287_P	527_N	0.803	0.19
92_G	101_M	0.803	0.19
177_Y	326_V	0.802	0.19
702_P	723_S	0.802	0.19
557_A	718_V	0.801	0.19
487_P	502_L	0.801	0.19
263_M	415_Y	0.801	0.19
191_G	320_N	0.800	0.19
93_D	113_A	0.800	0.19
107_E	151_D	0.799	0.19
250_V	254_C	0.798	0.19
76_I	379_F	0.798	0.19
319_T	702_P	0.798	0.19
476_F	510_W	0.798	0.19
293_E	297_K	0.797	0.19
409_S	742_E	0.797	0.19
457_F	531_L	0.797	0.19
317_V	737_E	0.797	0.19
432_D	547_G	0.795	0.19
501_K	667_E	0.795	0.19
443_G	532_D	0.794	0.19
421_T	443_G	0.793	0.19
50_S	337_L	0.792	0.19
579_M	733_G	0.792	0.19
704_L	721_L	0.792	0.19
709_N	738_T	0.790	0.19
397_I	668_A	0.790	0.19
531_L	648_G	0.789	0.19
388_L	585_G	0.788	0.19
158_A	570_P	0.783	0.18
138_L	173_A	0.783	0.18
241_C	655_Y	0.783	0.18
551_E	620_E	0.783	0.18
743_I	746_G	0.782	0.18
282_I	395_S	0.781	0.18
393_Q	572_R	0.780	0.18
228_V	572_R	0.779	0.18
237_I	598_L	0.779	0.18
738_T	743_I	0.777	0.18
316_C	655_Y	0.776	0.18
211_E	605_Y	0.776	0.18
44_G	54_I	0.776	0.18
184_N	230_T	0.776	0.18
192_I	195_T	0.776	0.18
382_H	558_L	0.775	0.18
256_K	476_F	0.774	0.18
571_T	739_E	0.773	0.18
374_N	607_A	0.769	0.18
314_S	343_R	0.766	0.18
181_Y	599_C	0.765	0.18
611_L	619_V	0.764	0.18
326_V	391_L	0.762	0.18
326_V	529_S	0.761	0.18
569_V	694_V	0.759	0.18
34_T	38_S	0.759	0.18
155_Y	411_F	0.758	0.18
461_M	599_C	0.758	0.18
149_Y	163_Q	0.756	0.18
180_Y	429_A	0.756	0.18
297_K	621_Q	0.754	0.18
482_E	691_A	0.753	0.18
450_V	737_E	0.753	0.18
206_A	738_T	0.753	0.18
185_L	449_E	0.751	0.18
334_Q	378_V	0.748	0.18
53_A	62_Q	0.748	0.18
459_Q	500_T	0.748	0.18
124_A	460_A	0.747	0.17
352_G	396_Y	0.747	0.17
44_G	50_S	0.747	0.17
319_T	354_A	0.747	0.17
230_T	697_Y	0.746	0.17
38_S	221_D	0.745	0.17
143_F	225_S	0.745	0.17
438_M	474_W	0.744	0.17
572_R	739_E	0.743	0.17
577_Q	723_S	0.741	0.17
90_L	105_L	0.741	0.17
226_V	419_A	0.740	0.17
460_A	595_V	0.738	0.17
190_M	417_M	0.737	0.17
423_P	432_D	0.737	0.17
223_S	690_A	0.737	0.17
435_V	655_Y	0.734	0.17
281_I	531_L	0.733	0.17
61_Y	72_V	0.732	0.17
621_Q	745_D	0.732	0.17
188_T	528_W	0.731	0.17
158_A	572_R	0.731	0.17
527_N	557_A	0.729	0.17
479_W	531_L	0.728	0.17
542_G	553_G	0.728	0.17
184_N	668_A	0.728	0.17
418_H	702_P	0.726	0.17
258_I	717_Q	0.725	0.17
190_M	193_E	0.725	0.17
457_F	591_W	0.725	0.17
536_V	591_W	0.724	0.17
223_S	432_D	0.723	0.17
525_P	718_V	0.721	0.17
171_T	706_S	0.718	0.17
365_A	704_L	0.718	0.17
208_G	527_N	0.717	0.17
173_A	433_V	0.717	0.17
164_G	392_S	0.716	0.17
259_E	702_P	0.715	0.17
417_M	669_Y	0.715	0.17
240_A	397_I	0.714	0.17
415_Y	695_I	0.712	0.17
336_L	439_D	0.710	0.17
126_R	219_G	0.710	0.17
290_M	503_L	0.709	0.16
500_T	504_T	0.706	0.16
482_E	507_Q	0.705	0.16
231_S	443_G	0.704	0.16
306_K	632_H	0.702	0.16
213_Y	432_D	0.701	0.16
363_H	529_S	0.701	0.16
382_H	425_Y	0.700	0.16
204_T	420_T	0.700	0.16
77_G	81_E	0.699	0.16
158_A	739_E	0.699	0.16
148_K	216_R	0.698	0.16
220_A	662_E	0.698	0.16
209_E	615_M	0.696	0.16
263_M	684_N	0.696	0.16
200_L	328_Y	0.695	0.16
148_K	433_V	0.694	0.16
212_K	610_P	0.694	0.16
149_Y	191_G	0.693	0.16
584_M	642_L	0.692	0.16
427_I	683_E	0.691	0.16
142_L	225_S	0.690	0.16
192_I	320_N	0.690	0.16
254_C	354_A	0.689	0.16
345_H	454_A	0.687	0.16
164_G	437_M	0.684	0.16
194_R	321_C	0.683	0.16
200_L	432_D	0.683	0.16
168_F	567_G	0.681	0.16
315_Y	572_R	0.681	0.16
357_N	693_S	0.680	0.16
88_V	209_E	0.680	0.16
461_M	546_D	0.680	0.16
391_L	398_H	0.678	0.16
261_G	321_C	0.678	0.16
184_N	696_P	0.678	0.16
297_K	444_L	0.678	0.16
197_L	725_Q	0.676	0.16
91_L	607_A	0.676	0.16
250_V	289_E	0.675	0.16
111_E	572_R	0.674	0.16
284_P	529_S	0.674	0.16
563_L	708_E	0.673	0.16
272_M	285_I	0.672	0.16
190_M	695_I	0.672	0.16
453_E	536_V	0.672	0.16
19_N	34_T	0.671	0.16
238_M	259_E	0.671	0.16
554_V	661_A	0.671	0.16
149_Y	391_L	0.670	0.16
418_H	443_G	0.669	0.15
274_P	388_L	0.669	0.15
619_V	631_I	0.669	0.15
208_G	689_I	0.668	0.15
40_S	382_H	0.668	0.15
264_L	411_F	0.667	0.15
235_R	420_T	0.666	0.15
234_N	395_S	0.666	0.15
170_K	669_Y	0.665	0.15
507_Q	677_V	0.665	0.15
617_E	646_N	0.665	0.15
209_E	439_D	0.664	0.15
27_A	271_Y	0.664	0.15
91_L	433_V	0.664	0.15
502_L	509_C	0.662	0.15
190_M	590_K	0.660	0.15
455_V	688_R	0.660	0.15
279_Y	520_G	0.660	0.15
461_M	479_W	0.659	0.15
440_G	444_L	0.659	0.15
77_G	293_E	0.659	0.15
158_A	207_F	0.658	0.15
258_I	317_V	0.658	0.15
40_S	221_D	0.658	0.15
201_L	443_G	0.658	0.15
333_A	577_Q	0.658	0.15
616_P	626_Y	0.658	0.15
235_R	248_V	0.657	0.15
293_E	689_I	0.656	0.15
225_S	315_Y	0.656	0.15
171_T	290_M	0.655	0.15
30_Q	40_S	0.655	0.15
270_V	434_A	0.654	0.15
553_G	626_Y	0.654	0.15
79_L	407_N	0.653	0.15
47_I	62_Q	0.652	0.15
320_N	693_S	0.652	0.15
449_E	678_E	0.652	0.15
19_N	45_F	0.652	0.15
200_L	556_A	0.652	0.15
50_S	57_L	0.650	0.15
482_E	649_A	0.650	0.15
157_W	364_Y	0.649	0.15
277_N	389_N	0.648	0.15
207_F	413_Q	0.647	0.15
603_R	646_N	0.647	0.15
193_E	739_E	0.647	0.15
129_A	599_C	0.646	0.15
516_E	524_I	0.646	0.15
206_A	265_T	0.644	0.15
39_T	59_F	0.644	0.15
245_N	268_K	0.644	0.15
452_D	456_D	0.643	0.15
345_H	605_Y	0.643	0.15
296_Q	401_E	0.642	0.15
158_A	202_D	0.642	0.15
384_T	398_H	0.641	0.15
25_A	29_S	0.641	0.15
228_V	706_S	0.640	0.15
261_G	538_I	0.640	0.15
274_P	480_N	0.640	0.15
575_D	642_L	0.639	0.15
596_N	603_R	0.638	0.15
321_C	417_M	0.637	0.15
19_N	36_I	0.637	0.15
191_G	199_S	0.637	0.15
228_V	342_D	0.637	0.15
323_Y	392_S	0.636	0.15
211_E	582_F	0.636	0.15
379_F	406_I	0.636	0.15
262_L	651_L	0.636	0.15
181_Y	260_Q	0.636	0.15
88_V	546_D	0.634	0.15
398_H	723_S	0.634	0.15
193_E	392_S	0.633	0.15
295_L	648_G	0.633	0.15
104_D	689_I	0.632	0.15
394_A	567_G	0.632	0.15
278_R	520_G	0.631	0.15
476_F	539_L	0.630	0.15
250_V	577_Q	0.630	0.15
51_N	72_V	0.630	0.15
231_S	446_L	0.630	0.15
125_G	208_G	0.629	0.15
317_V	353_Y	0.629	0.15
415_Y	455_V	0.627	0.14
126_R	649_A	0.626	0.14
163_Q	194_R	0.626	0.14
625_T	713_K	0.626	0.14
228_V	235_R	0.625	0.14
93_D	682_I	0.624	0.14
208_G	211_E	0.623	0.14
271_Y	536_V	0.623	0.14
238_M	475_F	0.622	0.14
342_D	693_S	0.622	0.14
191_G	571_T	0.621	0.14
448_Q	689_I	0.621	0.14
559_V	584_M	0.621	0.14
164_G	417_M	0.621	0.14
250_V	705_L	0.620	0.14
321_C	351_Y	0.618	0.14
321_C	348_E	0.617	0.14
231_S	388_L	0.617	0.14
231_S	702_P	0.615	0.14
162_H	581_L	0.614	0.14
35_V	74_Q	0.614	0.14
26_D	29_S	0.613	0.14
56_C	62_Q	0.613	0.14
117_E	589_G	0.613	0.14
224_W	587_T	0.613	0.14
107_E	121_D	0.612	0.14
158_A	194_R	0.612	0.14
23_R	35_V	0.612	0.14
280_G	626_Y	0.611	0.14
93_D	607_A	0.610	0.14
196_S	295_L	0.610	0.14
158_A	428_C	0.610	0.14
313_P	387_L	0.609	0.14
41_F	65_H	0.609	0.14
278_R	704_L	0.608	0.14
260_Q	441_N	0.608	0.14
22_E	62_Q	0.607	0.14
285_I	328_Y	0.606	0.14
403_R	645_N	0.606	0.14
458_R	510_W	0.606	0.14
333_A	638_M	0.605	0.14
143_F	223_S	0.605	0.14
269_P	389_N	0.605	0.14
231_S	235_R	0.605	0.14
202_D	274_P	0.604	0.14
191_G	210_S	0.604	0.14
423_P	590_K	0.604	0.14
111_E	593_T	0.603	0.14
193_E	480_N	0.602	0.14
701_I	704_L	0.601	0.14
211_E	259_E	0.600	0.14
226_V	408_F	0.600	0.14
33_V	465_Y	0.599	0.14
250_V	313_P	0.599	0.14
426_A	672_I	0.598	0.14
298_K	411_F	0.598	0.14
320_N	583_S	0.598	0.14
267_A	720_Y	0.598	0.14
414_A	516_E	0.597	0.14
126_R	573_T	0.597	0.14
187_R	586_V	0.597	0.14
233_S	244_D	0.596	0.14
36_I	217_V	0.596	0.14
19_N	77_G	0.595	0.14
357_N	380_A	0.595	0.14
147_M	432_D	0.595	0.14
391_L	411_F	0.594	0.14
241_C	315_Y	0.594	0.14
551_E	557_A	0.594	0.14
189_D	280_G	0.594	0.14
361_A	520_G	0.594	0.14
541_P	626_Y	0.593	0.14
503_L	537_S	0.593	0.14
541_P	553_G	0.593	0.14
92_G	431_N	0.592	0.14
300_S	374_N	0.592	0.14
181_Y	718_V	0.592	0.14
668_A	697_Y	0.592	0.14
54_I	149_Y	0.592	0.14
327_C	439_D	0.591	0.14
264_L	513_H	0.591	0.14
290_M	547_G	0.590	0.14
200_L	393_Q	0.590	0.14
414_A	724_L	0.590	0.14
393_Q	577_Q	0.590	0.14
503_L	509_C	0.590	0.14
22_E	39_T	0.590	0.14
164_G	327_C	0.589	0.14
598_L	704_L	0.589	0.14
219_G	360_Y	0.589	0.14
361_A	646_N	0.588	0.14
381_T	556_A	0.587	0.14
510_W	605_Y	0.586	0.14
398_H	590_K	0.586	0.14
390_A	583_S	0.586	0.14
223_S	396_Y	0.585	0.14
163_Q	695_I	0.584	0.14
177_Y	562_W	0.584	0.14
297_K	625_T	0.584	0.14
85_N	88_V	0.583	0.13
282_I	697_Y	0.583	0.13
293_E	501_K	0.583	0.13
144_S	190_M	0.582	0.13
144_S	683_E	0.582	0.13
194_R	571_T	0.582	0.13
320_N	353_Y	0.582	0.13
88_V	113_A	0.582	0.13
254_C	702_P	0.582	0.13
387_L	434_A	0.581	0.13
444_L	663_V	0.580	0.13
37_K	48_L	0.579	0.13
42_D	47_I	0.578	0.13
159_A	571_T	0.578	0.13
181_Y	693_S	0.577	0.13
321_C	572_R	0.577	0.13
60_S	221_D	0.576	0.13
600_S	603_R	0.576	0.13
109_V	299_I	0.575	0.13
156_S	641_W	0.575	0.13
185_L	526_D	0.575	0.13
88_V	185_L	0.575	0.13
198_G	203_H	0.574	0.13
226_V	232_G	0.572	0.13
172_P	541_P	0.571	0.13
60_S	414_A	0.571	0.13
93_D	184_N	0.570	0.13
515_G	522_K	0.570	0.13
126_R	452_D	0.567	0.13
21_V	559_V	0.567	0.13
102_D	111_E	0.565	0.13
281_I	313_P	0.565	0.13
125_G	190_M	0.565	0.13
390_A	447_T	0.564	0.13
517_S	546_D	0.564	0.13
392_S	443_G	0.564	0.13
223_S	391_L	0.563	0.13
323_Y	590_K	0.563	0.13
146_L	272_M	0.562	0.13
258_I	407_N	0.562	0.13
303_P	308_K	0.562	0.13
157_W	530_M	0.562	0.13
219_G	701_I	0.561	0.13
249_V	734_F	0.561	0.13
285_I	421_T	0.560	0.13
462_A	586_V	0.560	0.13
186_F	729_H	0.560	0.13
20_A	52_E	0.560	0.13
117_E	598_L	0.559	0.13
520_G	746_G	0.559	0.13
376_P	419_A	0.559	0.13
204_T	655_Y	0.559	0.13
127_A	417_M	0.558	0.13
39_T	65_H	0.558	0.13
431_N	736_H	0.558	0.13
398_H	416_M	0.557	0.13
113_A	242_M	0.557	0.13
39_T	42_D	0.556	0.13
474_W	520_G	0.556	0.13
19_N	23_R	0.556	0.13
230_T	736_H	0.556	0.13
173_A	300_S	0.556	0.13
428_C	478_P	0.556	0.13
540_A	571_T	0.555	0.13
702_P	731_F	0.555	0.13
227_V	536_V	0.555	0.13
75_L	85_N	0.555	0.13
290_M	351_Y	0.554	0.13
547_G	550_E	0.554	0.13
508_D	511_V	0.554	0.13
398_H	659_P	0.553	0.13
158_A	186_F	0.552	0.13
310_G	374_N	0.552	0.13
139_L	316_C	0.552	0.13
196_S	544_G	0.552	0.13
38_S	60_S	0.551	0.13
38_S	49_S	0.551	0.13
233_S	435_V	0.551	0.13
432_D	443_G	0.550	0.13
149_Y	154_E	0.550	0.13
449_E	460_A	0.550	0.13
305_T	308_K	0.550	0.13
46_A	59_F	0.549	0.13
107_E	603_R	0.548	0.13
188_T	257_S	0.548	0.13
294_T	559_V	0.547	0.13
519_H	665_P	0.547	0.13
201_L	235_R	0.546	0.13
262_L	557_A	0.546	0.13
265_T	666_R	0.546	0.13
701_I	725_Q	0.545	0.13
653_E	656_S	0.545	0.13
201_L	230_T	0.544	0.13
24_L	27_A	0.544	0.13
233_S	658_L	0.543	0.13
400_R	459_Q	0.541	0.13
183_E	216_R	0.541	0.13
277_N	425_Y	0.541	0.13
481_K	540_A	0.540	0.13
357_N	367_R	0.540	0.13
145_A	394_A	0.540	0.13
333_A	717_Q	0.540	0.13
371_G	374_N	0.539	0.13
279_Y	554_V	0.539	0.13
19_N	40_S	0.538	0.13
42_D	50_S	0.538	0.13
177_Y	260_Q	0.537	0.13
562_W	717_Q	0.537	0.13
360_Y	728_D	0.536	0.12
161_G	668_A	0.536	0.12
179_D	460_A	0.535	0.12
351_Y	354_A	0.535	0.12
412_N	720_Y	0.535	0.12
209_E	621_Q	0.534	0.12
227_V	650_R	0.534	0.12
284_P	530_M	0.534	0.12
137_Q	562_W	0.533	0.12
170_K	513_H	0.533	0.12
301_E	686_P	0.533	0.12
195_T	578_I	0.533	0.12
536_V	586_V	0.533	0.12
418_H	691_A	0.531	0.12
192_I	583_S	0.531	0.12
251_D	345_H	0.531	0.12
438_M	602_K	0.531	0.12
520_G	555_P	0.530	0.12
122_F	157_W	0.530	0.12
156_S	218_F	0.529	0.12
41_F	50_S	0.528	0.12
228_V	668_A	0.528	0.12
227_V	264_L	0.528	0.12
142_L	250_V	0.528	0.12
277_N	518_W	0.527	0.12
27_A	53_A	0.527	0.12
186_F	284_P	0.526	0.12
523_D	597_T	0.526	0.12
326_V	585_G	0.526	0.12
35_V	370_P	0.526	0.12
415_Y	520_G	0.526	0.12
45_F	52_E	0.525	0.12
219_G	556_A	0.525	0.12
261_G	315_Y	0.525	0.12
277_N	519_H	0.525	0.12
572_R	579_M	0.524	0.12
91_L	499_P	0.523	0.12
223_S	352_G	0.522	0.12
394_A	414_A	0.522	0.12
360_Y	457_F	0.521	0.12
463_R	628_N	0.520	0.12
370_P	526_D	0.520	0.12
288_Q	559_V	0.520	0.12
538_I	599_C	0.520	0.12
209_E	258_I	0.519	0.12
476_F	585_G	0.519	0.12
348_E	380_A	0.518	0.12
334_Q	367_R	0.518	0.12
526_D	712_D	0.518	0.12
93_D	649_A	0.518	0.12
194_R	413_Q	0.518	0.12
19_N	48_L	0.518	0.12
418_H	433_V	0.517	0.12
313_P	577_Q	0.517	0.12
427_I	479_W	0.517	0.12
430_S	522_K	0.517	0.12
511_V	531_L	0.517	0.12
225_S	435_V	0.517	0.12
200_L	420_T	0.517	0.12
299_I	624_D	0.515	0.12
100_A	108_L	0.514	0.12
573_T	647_P	0.513	0.12
664_T	684_N	0.513	0.12
35_V	610_P	0.513	0.12
235_R	419_A	0.513	0.12
162_H	519_H	0.512	0.12
352_G	675_N	0.512	0.12
454_A	479_W	0.512	0.12
453_E	476_F	0.512	0.12
101_M	452_D	0.510	0.12
190_M	398_H	0.510	0.12
480_N	727_W	0.510	0.12
162_H	189_D	0.510	0.12
142_L	571_T	0.510	0.12
191_G	705_L	0.509	0.12
218_F	688_R	0.509	0.12
23_R	103_R	0.509	0.12
448_Q	452_D	0.509	0.12
340_T	742_E	0.508	0.12
671_A	689_I	0.508	0.12
112_F	120_A	0.508	0.12
576_F	693_S	0.507	0.12
86_V	620_E	0.506	0.12
194_R	739_E	0.506	0.12
665_P	687_G	0.506	0.12
444_L	680_V	0.506	0.12
233_S	631_I	0.505	0.12
247_V	295_L	0.505	0.12
117_E	411_F	0.505	0.12
572_R	577_Q	0.505	0.12
186_F	679_L	0.505	0.12
391_L	590_K	0.504	0.12
234_N	668_A	0.504	0.12
156_S	582_F	0.503	0.12
476_F	702_P	0.502	0.12
257_S	395_S	0.502	0.12
538_I	649_A	0.502	0.12
225_S	572_R	0.501	0.12
336_L	345_H	0.501	0.12
171_T	207_F	0.500	0.12
381_T	568_I	0.500	0.12
177_Y	687_G	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2vycA	5	1	100	0.499	Contact Map
1c4kA	2	0.9311	100	0.559	Contact Map
3n75A	4	0.9391	100	0.561	Contact Map
2x3lA	2	0.5563	100	0.753	Contact Map
4q6rA	2	0.5391	100	0.889	Contact Map
3mc6A	2	0.5166	100	0.898	Contact Map
4w8iA	2	0.4636	99.9	0.924	Contact Map
1js3A	2	0.5417	99.8	0.937	Contact Map
3bc8A	3	0.5536	99.8	0.939	Contact Map
3k40A	2	0.5285	99.7	0.941	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0196 seconds.