SCPA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SCPA - Methylmalonyl-CoA mutase

UniProt:	P27253	Sequences: MSNVQEWQQLANKELSRREKTVDSLVHQTAEGIAIKPLYTEADLDNLEVTGTLPGLPPYVRGPRATMYTAQPWTIRQYAGFSTAKESNAFYRRNLAAGQKGLSVAFDLATHRGYDSDNPRVAGDVGKAGVAIDTVEDMKVLFDQIPLDKMSVSMTMNGAVLPVLAFYIVAAEEQGVTPDKLTGTIQNDILKEYLCRNTYIYPPKPSMRIIADIIAWCSGNMPRFNTISISGYHMGEAGANCVQQVAFTLADGIEYIKAAISAGLKIDDFAPRLSFFFGIGMDLFMNVAMLRAARYLWSEAVSGFGAQDPKSLALRTHCQTSGWSLTEQDPYNNVIRTTIEALAATLGGTQSLHTNAFDEALGLPTDFSARIARNTQIIIQEESELCRTVDPLAGSYYIESLTDQIVKQARAIIQQIDEAGGMAKAIEAGLPKRMIEEASAREQSLIDQGKRVIVGVNKYKLDHEDETDVLEIDNVMVRNEQIASLERIRATRDDAAVTAALNALTHAAQHNENLLAAAVNAARVRATLGEISDALEVAFDRYLVPSQCVTGVIAQSYHQSEKSASEFDAIVAQTEQFLADNGRRPRILIAKMGQDGHDRGAKVIASAYSDLGFDVDLSPMFSTPEEIARLAVENDVHVVGASSLAAGHKTLIPELVEALKKWGREDICVVAGGVIPPQDYAFLQERGVAAIYGPGTPMLDSVRDVLNLISQHHD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11444
Length:	714 (677)
Sequences:	1424 (425)
Seq/√Len:	16.3

ECOLI - SCPA
HALSA - Q9HRZ1 Q9HRK7
SULSO - Q97W21

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
256_I	301_V	6.547	1.00
134_T	488_I	4.728	1.00
299_E	410_R	4.704	1.00
681_A	685_E	4.354	1.00
494_D	498_T	4.337	1.00
172_E	523_R	4.183	1.00
505_T	537_V	3.988	1.00
265_K	268_D	3.789	1.00
169_V	523_R	3.753	1.00
177_T	180_K	3.517	1.00
245_V	405_I	3.479	0.99
516_A	520_N	3.462	0.99
257_K	417_D	3.362	0.99
652_I	671_A	3.333	0.99
284_F	398_I	3.318	0.99
629_R	633_E	3.315	0.99
139_K	173_E	3.314	0.99
410_R	414_Q	3.304	0.99
36_K	43_D	3.188	0.99
408_Q	411_A	3.149	0.99
334_V	357_F	3.132	0.99
167_Y	171_A	3.121	0.99
148_D	180_K	3.092	0.99
277_F	290_L	3.062	0.99
116_S	133_D	3.048	0.99
161_L	535_L	2.987	0.98
284_F	397_Y	2.959	0.98
493_D	496_A	2.956	0.98
217_C	226_T	2.925	0.98
658_A	661_K	2.921	0.98
166_F	528_L	2.917	0.98
295_Y	406_V	2.916	0.98
116_S	131_A	2.886	0.98
229_I	273_L	2.857	0.98
240_N	438_A	2.847	0.98
479_N	483_A	2.822	0.98
148_D	176_V	2.807	0.98
573_Q	707_N	2.787	0.97
487_R	491_T	2.782	0.97
504_L	535_L	2.749	0.97
604_I	701_S	2.744	0.97
442_E	451_R	2.732	0.97
461_L	464_E	2.710	0.97
445_L	451_R	2.690	0.97
625_E	658_A	2.657	0.96
247_F	430_L	2.656	0.96
87_S	91_Y	2.637	0.96
535_L	539_F	2.589	0.96
85_K	480_E	2.582	0.96
331_Y	357_F	2.562	0.96
178_P	216_W	2.556	0.96
201_Y	532_S	2.555	0.96
604_I	608_Y	2.466	0.95
277_F	318_C	2.395	0.94
506_H	509_Q	2.394	0.94
452_V	458_K	2.369	0.93
140_V	484_S	2.291	0.92
422_M	431_P	2.271	0.92
302_S	312_L	2.265	0.92
403_D	407_K	2.260	0.92
260_I	266_I	2.258	0.92
267_D	311_S	2.222	0.91
27_H	35_I	2.212	0.91
178_P	220_N	2.208	0.91
586_R	635_D	2.199	0.90
215_A	262_A	2.157	0.89
265_K	307_Q	2.154	0.89
139_K	525_R	2.153	0.89
548_C	617_L	2.129	0.89
136_E	139_K	2.120	0.89
303_G	417_D	2.112	0.88
361_L	677_P	2.108	0.88
93_R	366_D	2.108	0.88
104_V	132_I	2.101	0.88
497_V	526_A	2.101	0.88
151_S	182_T	2.093	0.88
495_A	499_A	2.069	0.87
482_I	486_E	2.068	0.87
400_S	404_Q	2.060	0.87
346_L	392_L	2.049	0.87
508_A	535_L	2.009	0.86
483_A	487_R	1.979	0.85
656_V	688_V	1.971	0.85
214_I	259_A	1.961	0.84
204_K	427_E	1.961	0.84
370_R	374_N	1.958	0.84
30_A	445_L	1.950	0.84
335_I	338_T	1.947	0.84
211_A	258_A	1.940	0.84
341_A	352_L	1.930	0.83
498_T	502_N	1.911	0.83
60_V	295_Y	1.902	0.82
166_F	522_A	1.901	0.82
414_Q	418_E	1.898	0.82
649_K	682_F	1.887	0.82
639_V	655_L	1.884	0.82
36_K	39_Y	1.878	0.82
638_V	670_V	1.870	0.81
135_V	139_K	1.860	0.81
575_E	584_R	1.855	0.81
345_T	385_L	1.849	0.81
424_K	427_E	1.847	0.80
656_V	669_V	1.845	0.80
172_E	178_P	1.798	0.79
391_P	398_I	1.792	0.78
298_S	302_S	1.779	0.78
522_A	531_I	1.777	0.78
31_E	285_M	1.775	0.78
503_A	520_N	1.773	0.78
604_I	670_V	1.765	0.77
507_A	517_A	1.735	0.76
656_V	686_R	1.731	0.76
301_V	306_A	1.729	0.76
307_Q	311_S	1.720	0.75
684_Q	691_I	1.716	0.75
365_T	368_S	1.694	0.74
404_Q	408_Q	1.688	0.74
40_T	43_D	1.680	0.74
671_A	688_V	1.678	0.73
489_R	497_V	1.674	0.73
210_I	214_I	1.668	0.73
173_E	525_R	1.667	0.73
161_L	518_A	1.657	0.73
277_F	293_A	1.651	0.72
584_R	616_D	1.650	0.72
616_D	635_D	1.636	0.72
658_A	662_W	1.632	0.71
381_E	459_Y	1.628	0.71
178_P	519_V	1.620	0.71
616_D	634_N	1.618	0.71
496_A	520_N	1.617	0.71
584_R	637_H	1.615	0.71
168_I	519_V	1.596	0.70
632_V	662_W	1.595	0.70
257_K	304_F	1.592	0.69
136_E	525_R	1.590	0.69
502_N	506_H	1.588	0.69
471_E	649_K	1.572	0.68
116_S	481_Q	1.564	0.68
78_Y	196_R	1.552	0.67
586_R	616_D	1.550	0.67
135_V	525_R	1.544	0.67
254_E	257_K	1.537	0.67
168_I	216_W	1.536	0.67
249_L	300_A	1.531	0.66
503_A	517_A	1.529	0.66
489_R	527_T	1.528	0.66
199_Y	544_V	1.508	0.65
92_R	144_Q	1.501	0.65
242_V	405_I	1.494	0.64
507_A	510_H	1.481	0.64
89_A	93_R	1.480	0.64
244_Q	289_M	1.464	0.63
243_Q	412_I	1.461	0.62
570_I	699_L	1.456	0.62
669_V	688_V	1.446	0.62
253_I	300_A	1.442	0.61
39_Y	400_S	1.435	0.61
682_F	686_R	1.435	0.61
625_E	654_E	1.434	0.61
136_E	488_I	1.434	0.61
489_R	504_L	1.427	0.61
254_E	258_A	1.422	0.60
26_V	34_A	1.421	0.60
496_A	500_A	1.411	0.60
505_T	509_Q	1.410	0.60
100_K	149_K	1.410	0.60
629_R	658_A	1.408	0.60
589_I	604_I	1.407	0.59
507_A	512_E	1.397	0.59
692_Y	704_D	1.395	0.59
240_N	243_Q	1.387	0.58
253_I	305_G	1.375	0.58
570_I	703_R	1.374	0.58
111_H	196_R	1.370	0.57
349_T	352_L	1.369	0.57
327_E	649_K	1.367	0.57
214_I	262_A	1.365	0.57
210_I	262_A	1.362	0.57
641_A	652_I	1.359	0.57
331_Y	335_I	1.342	0.56
479_N	486_E	1.341	0.56
616_D	630_L	1.334	0.55
249_L	252_G	1.331	0.55
338_T	348_G	1.319	0.54
416_I	578_L	1.312	0.54
339_I	343_A	1.311	0.54
500_A	524_V	1.308	0.54
608_Y	701_S	1.298	0.53
507_A	539_F	1.294	0.53
572_A	576_Q	1.293	0.53
52_T	60_V	1.290	0.53
437_E	441_R	1.281	0.52
298_S	312_L	1.281	0.52
330_P	601_A	1.276	0.52
629_R	662_W	1.272	0.52
678_Q	691_I	1.271	0.52
33_I	285_M	1.270	0.52
588_L	639_V	1.265	0.51
331_Y	371_I	1.263	0.51
53_L	56_L	1.260	0.51
412_I	430_L	1.259	0.51
346_L	385_L	1.258	0.51
179_D	220_N	1.257	0.51
185_I	226_T	1.257	0.51
270_A	311_S	1.254	0.51
504_L	517_A	1.251	0.50
518_A	531_I	1.248	0.50
54_P	283_L	1.244	0.50
331_Y	367_F	1.244	0.50
433_R	549_V	1.243	0.50
28_Q	34_A	1.232	0.49
660_K	665_E	1.229	0.49
590_A	627_I	1.227	0.49
318_C	349_T	1.225	0.49
78_Y	111_H	1.222	0.49
241_C	278_G	1.220	0.49
628_A	658_A	1.219	0.49
38_L	389_V	1.216	0.48
504_L	521_A	1.216	0.48
327_E	601_A	1.215	0.48
592_M	655_L	1.213	0.48
392_L	398_I	1.211	0.48
680_Y	693_G	1.209	0.48
178_P	523_R	1.206	0.48
606_S	609_S	1.202	0.48
521_A	526_A	1.199	0.47
614_D	634_N	1.193	0.47
244_Q	286_N	1.182	0.46
494_D	497_V	1.169	0.46
409_A	413_I	1.168	0.46
533_D	537_V	1.167	0.46
267_D	270_A	1.166	0.46
657_E	661_K	1.166	0.46
64_R	259_A	1.155	0.45
215_A	219_G	1.153	0.45
573_Q	703_R	1.151	0.45
496_A	524_V	1.150	0.45
469_V	678_Q	1.147	0.44
128_A	197_N	1.134	0.44
283_L	287_V	1.130	0.43
229_I	256_I	1.127	0.43
250_A	413_I	1.122	0.43
604_I	638_V	1.121	0.43
241_C	405_I	1.120	0.43
338_T	383_S	1.119	0.43
446_I	453_I	1.116	0.43
111_H	197_N	1.115	0.43
356_A	369_A	1.113	0.42
42_A	45_D	1.107	0.42
253_I	306_A	1.105	0.42
483_A	490_A	1.103	0.42
345_T	379_I	1.102	0.42
35_I	397_Y	1.095	0.41
486_E	579_A	1.094	0.41
341_A	379_I	1.094	0.41
486_E	489_R	1.092	0.41
243_Q	392_L	1.092	0.41
282_D	387_R	1.091	0.41
99_Q	102_L	1.088	0.41
568_D	689_A	1.088	0.41
485_L	488_I	1.080	0.41
25_L	37_P	1.078	0.40
357_F	367_F	1.077	0.40
584_R	630_L	1.071	0.40
135_V	268_D	1.067	0.40
490_A	495_A	1.067	0.40
242_V	412_I	1.058	0.39
93_R	96_A	1.054	0.39
85_K	89_A	1.053	0.39
567_F	570_I	1.053	0.39
168_I	221_M	1.052	0.39
361_L	467_T	1.049	0.39
284_F	391_P	1.049	0.39
486_E	490_A	1.047	0.39
149_K	180_K	1.045	0.39
243_Q	323_W	1.045	0.39
484_S	539_F	1.045	0.39
119_P	625_E	1.041	0.38
75_I	373_R	1.041	0.38
346_L	397_Y	1.036	0.38
592_M	627_I	1.033	0.38
267_D	307_Q	1.028	0.38
630_L	634_N	1.028	0.38
208_R	539_F	1.028	0.38
281_M	340_E	1.026	0.38
285_M	397_Y	1.022	0.37
680_Y	691_I	1.018	0.37
589_I	608_Y	1.016	0.37
243_Q	434_M	1.015	0.37
135_V	488_I	1.014	0.37
219_G	509_Q	1.008	0.37
257_K	261_S	1.001	0.36
536_E	541_R	1.000	0.36
652_I	688_V	1.000	0.36
271_P	300_A	0.999	0.36
178_P	520_N	0.999	0.36
300_A	410_R	0.999	0.36
253_I	303_G	0.995	0.36
171_A	523_R	0.994	0.36
64_R	448_Q	0.994	0.36
588_L	636_V	0.993	0.36
434_M	437_E	0.991	0.36
197_N	324_S	0.989	0.36
411_A	414_Q	0.989	0.36
78_Y	108_L	0.989	0.36
323_W	446_I	0.987	0.35
64_R	243_Q	0.984	0.35
111_H	128_A	0.982	0.35
490_A	499_A	0.981	0.35
499_A	503_A	0.981	0.35
234_M	701_S	0.978	0.35
242_V	348_G	0.978	0.35
416_I	628_A	0.974	0.35
118_N	533_D	0.972	0.35
392_L	397_Y	0.967	0.34
570_I	573_Q	0.967	0.34
547_Q	606_S	0.965	0.34
176_V	180_K	0.963	0.34
584_R	614_D	0.960	0.34
641_A	671_A	0.960	0.34
323_W	392_L	0.959	0.34
570_I	574_T	0.957	0.34
296_L	300_A	0.956	0.34
616_D	637_H	0.954	0.34
44_L	47_L	0.953	0.34
214_I	269_F	0.953	0.34
25_L	34_A	0.953	0.34
388_T	393_A	0.952	0.34
478_R	482_I	0.950	0.33
256_I	484_S	0.949	0.33
703_R	707_N	0.946	0.33
256_I	266_I	0.945	0.33
649_K	656_V	0.944	0.33
548_C	634_N	0.942	0.33
215_A	218_S	0.941	0.33
161_L	539_F	0.941	0.33
299_E	414_Q	0.940	0.33
664_R	667_I	0.936	0.33
75_I	377_I	0.934	0.33
251_D	422_M	0.930	0.32
54_P	60_V	0.928	0.32
577_F	581_N	0.928	0.32
339_I	379_I	0.925	0.32
210_I	227_I	0.923	0.32
495_A	498_T	0.923	0.32
485_L	489_R	0.921	0.32
136_E	318_C	0.921	0.32
604_I	640_G	0.921	0.32
214_I	227_I	0.920	0.32
440_A	633_E	0.920	0.32
266_I	304_F	0.919	0.32
164_L	224_F	0.919	0.32
641_A	655_L	0.918	0.32
681_A	684_Q	0.917	0.32
52_T	295_Y	0.916	0.32
571_V	580_D	0.914	0.32
213_I	258_A	0.913	0.32
167_Y	569_A	0.911	0.31
542_Y	545_P	0.909	0.31
59_Y	307_Q	0.909	0.31
668_C	689_A	0.908	0.31
330_P	442_E	0.907	0.31
568_D	686_R	0.907	0.31
168_I	178_P	0.905	0.31
472_I	477_V	0.904	0.31
247_F	412_I	0.904	0.31
46_N	50_T	0.904	0.31
39_Y	43_D	0.903	0.31
211_A	262_A	0.903	0.31
485_L	527_T	0.903	0.31
270_A	301_V	0.903	0.31
94_N	99_Q	0.902	0.31
361_L	484_S	0.896	0.31
295_Y	298_S	0.896	0.31
490_A	496_A	0.893	0.31
299_E	302_S	0.890	0.30
413_I	417_D	0.889	0.30
287_V	690_A	0.889	0.30
128_A	198_T	0.881	0.30
32_G	54_P	0.880	0.30
100_K	398_I	0.878	0.30
335_I	378_I	0.876	0.30
638_V	705_V	0.875	0.30
504_L	508_A	0.875	0.30
377_I	423_A	0.873	0.30
543_L	546_S	0.873	0.30
587_I	688_V	0.873	0.30
567_F	611_L	0.870	0.29
78_Y	198_T	0.870	0.29
586_R	614_D	0.867	0.29
122_A	654_E	0.867	0.29
384_E	546_S	0.866	0.29
498_T	685_E	0.864	0.29
182_T	223_R	0.864	0.29
588_L	627_I	0.861	0.29
568_D	700_D	0.860	0.29
66_T	485_L	0.860	0.29
100_K	240_N	0.859	0.29
583_R	635_D	0.857	0.29
361_L	601_A	0.851	0.29
583_R	633_E	0.850	0.28
518_A	522_A	0.848	0.28
84_A	95_L	0.848	0.28
480_E	483_A	0.847	0.28
254_E	423_A	0.845	0.28
604_I	698_M	0.845	0.28
64_R	392_L	0.845	0.28
85_K	519_V	0.844	0.28
361_L	574_T	0.842	0.28
489_R	529_G	0.841	0.28
399_E	402_T	0.840	0.28
166_F	471_E	0.840	0.28
491_T	509_Q	0.839	0.28
261_S	498_T	0.839	0.28
161_L	167_Y	0.838	0.28
54_P	293_A	0.837	0.28
601_A	705_V	0.834	0.28
569_A	703_R	0.833	0.28
100_K	150_M	0.833	0.28
258_A	261_S	0.831	0.28
503_A	512_E	0.831	0.28
36_K	400_S	0.830	0.28
326_T	330_P	0.830	0.28
173_E	523_R	0.825	0.27
548_C	633_E	0.824	0.27
285_M	329_D	0.821	0.27
95_L	426_I	0.821	0.27
171_A	519_V	0.819	0.27
339_I	342_L	0.818	0.27
568_D	572_A	0.817	0.27
100_K	397_Y	0.817	0.27
189_I	201_Y	0.816	0.27
284_F	346_L	0.815	0.27
94_N	150_M	0.815	0.27
143_D	265_K	0.814	0.27
638_V	668_C	0.813	0.27
345_T	588_L	0.812	0.27
252_G	422_M	0.812	0.27
406_V	410_R	0.808	0.27
277_F	316_T	0.807	0.26
546_S	549_V	0.806	0.26
243_Q	426_I	0.806	0.26
79_A	91_Y	0.806	0.26
329_D	371_I	0.805	0.26
386_C	701_S	0.804	0.26
242_V	408_Q	0.804	0.26
38_L	53_L	0.803	0.26
442_E	601_A	0.802	0.26
338_T	378_I	0.801	0.26
78_Y	128_A	0.800	0.26
483_A	533_D	0.799	0.26
346_L	656_V	0.798	0.26
134_T	485_L	0.796	0.26
27_H	387_R	0.796	0.26
519_V	522_A	0.795	0.26
385_L	601_A	0.795	0.26
632_V	639_V	0.790	0.26
592_M	643_S	0.790	0.26
25_L	53_L	0.790	0.26
172_E	176_V	0.790	0.26
266_I	287_V	0.790	0.26
564_A	567_F	0.789	0.26
324_S	340_E	0.789	0.26
241_C	287_V	0.789	0.26
179_D	302_S	0.788	0.26
568_D	571_V	0.786	0.26
618_S	622_S	0.786	0.26
108_L	196_R	0.784	0.25
330_P	656_V	0.784	0.25
616_D	636_V	0.784	0.25
201_Y	405_I	0.783	0.25
185_I	210_I	0.781	0.25
116_S	485_L	0.780	0.25
166_F	406_V	0.779	0.25
407_K	411_A	0.779	0.25
243_Q	283_L	0.778	0.25
42_A	51_G	0.777	0.25
284_F	392_L	0.775	0.25
226_T	368_S	0.775	0.25
49_V	60_V	0.774	0.25
656_V	690_A	0.774	0.25
225_N	272_R	0.773	0.25
78_Y	105_A	0.773	0.25
361_L	410_R	0.772	0.25
136_E	542_Y	0.771	0.25
589_I	638_V	0.771	0.25
245_V	409_A	0.767	0.25
44_L	50_T	0.767	0.25
327_E	442_E	0.764	0.25
569_A	700_D	0.763	0.25
60_V	69_T	0.763	0.25
38_L	404_Q	0.763	0.25
505_T	534_A	0.761	0.24
342_L	346_L	0.759	0.24
223_R	482_I	0.758	0.24
486_E	632_V	0.757	0.24
260_I	306_A	0.756	0.24
247_F	428_A	0.756	0.24
479_N	487_R	0.756	0.24
148_D	177_T	0.755	0.24
483_A	495_A	0.754	0.24
258_A	686_R	0.753	0.24
450_K	589_I	0.753	0.24
265_K	500_A	0.753	0.24
65_A	484_S	0.752	0.24
295_Y	410_R	0.752	0.24
144_Q	216_W	0.750	0.24
242_V	426_I	0.748	0.24
571_V	575_E	0.747	0.24
324_S	337_T	0.747	0.24
490_A	575_E	0.747	0.24
253_I	304_F	0.747	0.24
224_F	519_V	0.746	0.24
288_A	401_L	0.745	0.24
240_N	397_Y	0.742	0.24
171_A	178_P	0.742	0.24
418_E	576_Q	0.742	0.24
576_Q	580_D	0.741	0.24
450_K	567_F	0.741	0.24
213_I	259_A	0.740	0.24
278_G	290_L	0.739	0.23
335_I	570_I	0.739	0.23
286_N	289_M	0.738	0.23
601_A	656_V	0.737	0.23
317_H	353_H	0.737	0.23
190_L	422_M	0.735	0.23
493_D	625_E	0.735	0.23
426_I	434_M	0.734	0.23
167_Y	310_K	0.734	0.23
29_T	39_Y	0.733	0.23
357_F	467_T	0.731	0.23
554_A	592_M	0.731	0.23
277_F	664_R	0.731	0.23
208_R	507_A	0.730	0.23
370_R	461_L	0.729	0.23
295_Y	403_D	0.729	0.23
300_A	303_G	0.729	0.23
496_A	692_Y	0.728	0.23
337_T	340_E	0.728	0.23
29_T	285_M	0.727	0.23
29_T	33_I	0.726	0.23
49_V	54_P	0.725	0.23
235_G	356_A	0.724	0.23
139_K	649_K	0.722	0.23
356_A	535_L	0.721	0.23
108_L	199_Y	0.720	0.23
166_F	451_R	0.719	0.23
204_K	424_K	0.719	0.23
140_V	144_Q	0.719	0.23
412_I	416_I	0.719	0.23
142_F	173_E	0.717	0.23
134_T	235_G	0.716	0.23
104_V	182_T	0.716	0.23
442_E	488_I	0.716	0.23
308_D	689_A	0.715	0.22
42_A	386_C	0.714	0.22
89_A	96_A	0.714	0.22
119_P	639_V	0.713	0.22
704_D	708_L	0.711	0.22
242_V	378_I	0.710	0.22
616_D	629_R	0.709	0.22
108_L	111_H	0.709	0.22
170_A	174_Q	0.708	0.22
393_A	398_I	0.706	0.22
269_F	273_L	0.706	0.22
193_Y	264_L	0.706	0.22
105_A	363_L	0.705	0.22
696_T	701_S	0.705	0.22
134_T	489_R	0.704	0.22
385_L	489_R	0.704	0.22
261_S	483_A	0.703	0.22
564_A	568_D	0.703	0.22
579_A	685_E	0.701	0.22
416_I	430_L	0.701	0.22
45_D	48_E	0.701	0.22
682_F	685_E	0.700	0.22
242_V	285_M	0.700	0.22
226_T	259_A	0.700	0.22
339_I	383_S	0.700	0.22
300_A	542_Y	0.699	0.22
63_P	271_P	0.699	0.22
546_S	688_V	0.698	0.22
249_L	540_D	0.696	0.22
337_T	355_N	0.696	0.22
146_P	149_K	0.695	0.22
197_N	337_T	0.695	0.22
57_P	60_V	0.694	0.22
494_D	661_K	0.694	0.22
410_R	413_I	0.692	0.22
627_I	639_V	0.692	0.22
162_P	532_S	0.692	0.22
187_N	206_S	0.692	0.22
70_A	392_L	0.691	0.22
285_M	405_I	0.691	0.22
497_V	524_V	0.689	0.21
309_P	502_N	0.688	0.21
36_K	40_T	0.687	0.21
197_N	431_P	0.687	0.21
362_G	365_T	0.687	0.21
271_P	415_Q	0.686	0.21
461_L	465_D	0.685	0.21
601_A	688_V	0.684	0.21
150_M	234_M	0.684	0.21
300_A	449_G	0.684	0.21
400_S	403_D	0.682	0.21
166_F	531_I	0.682	0.21
584_R	634_N	0.682	0.21
414_Q	482_I	0.681	0.21
174_Q	213_I	0.680	0.21
277_F	338_T	0.680	0.21
652_I	686_R	0.680	0.21
377_I	607_A	0.680	0.21
216_W	221_M	0.680	0.21
584_R	629_R	0.679	0.21
491_T	579_A	0.677	0.21
299_E	573_Q	0.677	0.21
28_Q	38_L	0.677	0.21
52_T	166_F	0.675	0.21
35_I	346_L	0.675	0.21
629_R	634_N	0.675	0.21
39_Y	397_Y	0.674	0.21
579_A	707_N	0.673	0.21
206_S	360_A	0.673	0.21
250_A	416_I	0.672	0.21
425_A	431_P	0.672	0.21
608_Y	705_V	0.672	0.21
419_A	430_L	0.672	0.21
467_T	545_P	0.671	0.21
572_A	661_K	0.671	0.21
440_A	552_V	0.669	0.21
37_P	66_T	0.668	0.21
83_T	87_S	0.668	0.21
261_S	510_H	0.668	0.21
494_D	504_L	0.667	0.21
506_H	512_E	0.667	0.21
405_I	409_A	0.667	0.21
525_R	601_A	0.666	0.21
572_A	625_E	0.665	0.21
475_V	479_N	0.664	0.20
331_Y	378_I	0.664	0.20
246_A	330_P	0.663	0.20
104_V	142_F	0.663	0.20
389_V	412_I	0.663	0.20
548_C	606_S	0.663	0.20
283_L	528_L	0.663	0.20
630_L	635_D	0.662	0.20
329_D	374_N	0.662	0.20
257_K	303_G	0.662	0.20
293_A	700_D	0.661	0.20
39_Y	54_P	0.661	0.20
630_L	633_E	0.661	0.20
343_A	346_L	0.661	0.20
452_V	482_I	0.661	0.20
95_L	148_D	0.660	0.20
668_C	708_L	0.660	0.20
267_D	306_A	0.659	0.20
656_V	707_N	0.659	0.20
52_T	528_L	0.657	0.20
589_I	627_I	0.655	0.20
166_F	295_Y	0.654	0.20
498_T	503_A	0.653	0.20
158_G	197_N	0.652	0.20
416_I	511_N	0.651	0.20
490_A	517_A	0.650	0.20
690_A	704_D	0.650	0.20
288_A	398_I	0.650	0.20
249_L	416_I	0.649	0.20
277_F	348_G	0.648	0.20
700_D	703_R	0.648	0.20
216_W	220_N	0.648	0.20
223_R	489_R	0.647	0.20
627_I	630_L	0.647	0.20
400_S	407_K	0.647	0.20
29_T	489_R	0.646	0.20
54_P	705_V	0.645	0.20
132_I	144_Q	0.645	0.20
214_I	243_Q	0.645	0.20
29_T	35_I	0.644	0.20
569_A	573_Q	0.644	0.20
665_E	668_C	0.644	0.20
271_P	311_S	0.643	0.20
242_V	392_L	0.642	0.20
163_V	447_D	0.642	0.20
78_Y	197_N	0.642	0.20
111_H	198_T	0.641	0.20
348_G	385_L	0.641	0.20
65_A	295_Y	0.641	0.20
136_E	491_T	0.640	0.20
287_V	346_L	0.640	0.20
392_L	590_A	0.639	0.20
71_Q	253_I	0.638	0.20
412_I	564_A	0.638	0.20
362_G	386_C	0.638	0.20
52_T	299_E	0.638	0.20
240_N	549_V	0.638	0.20
135_V	169_V	0.638	0.20
656_V	660_K	0.637	0.19
116_S	142_F	0.636	0.19
169_V	172_E	0.635	0.19
428_A	431_P	0.635	0.19
59_Y	463_H	0.634	0.19
480_E	486_E	0.634	0.19
450_K	681_A	0.634	0.19
58_P	190_L	0.634	0.19
216_W	459_Y	0.633	0.19
64_R	310_K	0.633	0.19
581_N	617_L	0.632	0.19
566_E	700_D	0.630	0.19
554_A	571_V	0.629	0.19
393_A	691_I	0.629	0.19
25_L	38_L	0.628	0.19
496_A	565_S	0.627	0.19
208_R	218_S	0.626	0.19
259_A	262_A	0.625	0.19
269_F	371_I	0.623	0.19
483_A	486_E	0.623	0.19
512_E	516_A	0.622	0.19
454_V	669_V	0.621	0.19
330_P	334_V	0.620	0.19
134_T	166_F	0.620	0.19
607_A	697_P	0.619	0.19
260_I	265_K	0.618	0.19
64_R	214_I	0.618	0.19
242_V	338_T	0.618	0.19
84_A	206_S	0.617	0.19
142_F	145_I	0.616	0.19
700_D	704_D	0.615	0.19
249_L	426_I	0.615	0.19
609_S	616_D	0.614	0.19
185_I	214_I	0.614	0.19
219_G	407_K	0.614	0.19
31_E	329_D	0.614	0.19
210_I	318_C	0.614	0.19
507_A	511_N	0.612	0.19
167_Y	179_D	0.612	0.19
451_R	656_V	0.612	0.19
334_V	411_A	0.611	0.19
249_L	269_F	0.611	0.19
502_N	641_A	0.610	0.18
219_G	302_S	0.609	0.18
259_A	277_F	0.609	0.18
94_N	664_R	0.609	0.18
449_G	452_V	0.609	0.18
614_D	635_D	0.608	0.18
164_L	253_I	0.607	0.18
211_A	253_I	0.607	0.18
50_T	57_P	0.606	0.18
57_P	295_Y	0.606	0.18
296_L	409_A	0.606	0.18
433_R	547_Q	0.605	0.18
487_R	490_A	0.605	0.18
271_P	310_K	0.605	0.18
136_E	348_G	0.605	0.18
240_N	398_I	0.604	0.18
247_F	434_M	0.601	0.18
30_A	323_W	0.600	0.18
299_E	406_V	0.600	0.18
524_V	705_V	0.599	0.18
548_C	689_A	0.599	0.18
205_P	539_F	0.597	0.18
638_V	708_L	0.597	0.18
135_V	173_E	0.597	0.18
242_V	430_L	0.596	0.18
346_L	398_I	0.594	0.18
91_Y	146_P	0.594	0.18
572_A	575_E	0.592	0.18
254_E	422_M	0.591	0.18
252_G	453_I	0.591	0.18
641_A	686_R	0.589	0.18
104_V	136_E	0.589	0.18
132_I	253_I	0.589	0.18
254_E	304_F	0.588	0.18
145_I	174_Q	0.588	0.18
669_V	693_G	0.588	0.18
309_P	505_T	0.588	0.18
542_Y	628_A	0.588	0.18
657_E	682_F	0.586	0.18
483_A	568_D	0.585	0.18
588_L	622_S	0.585	0.18
52_T	290_L	0.585	0.18
207_M	453_I	0.584	0.18
210_I	213_I	0.584	0.18
624_P	651_L	0.583	0.18
99_Q	393_A	0.582	0.18
323_W	423_A	0.582	0.18
65_A	313_A	0.580	0.17
216_W	449_G	0.580	0.17
579_A	681_A	0.579	0.17
253_I	410_R	0.579	0.17
30_A	442_E	0.579	0.17
85_K	119_P	0.578	0.17
629_R	661_K	0.578	0.17
313_A	700_D	0.577	0.17
240_N	345_T	0.577	0.17
565_S	571_V	0.576	0.17
567_F	601_A	0.576	0.17
64_R	570_I	0.575	0.17
330_P	525_R	0.574	0.17
395_S	401_L	0.574	0.17
30_A	253_I	0.573	0.17
55_G	61_R	0.572	0.17
554_A	568_D	0.572	0.17
290_L	318_C	0.571	0.17
535_L	671_A	0.571	0.17
415_Q	434_M	0.571	0.17
139_K	601_A	0.571	0.17
65_A	323_W	0.570	0.17
488_I	525_R	0.569	0.17
139_K	656_V	0.569	0.17
339_I	416_I	0.569	0.17
64_R	127_K	0.567	0.17
248_T	354_T	0.567	0.17
632_V	654_E	0.567	0.17
300_A	361_L	0.567	0.17
490_A	509_Q	0.567	0.17
46_N	178_P	0.566	0.17
89_A	366_D	0.566	0.17
567_F	637_H	0.565	0.17
330_P	385_L	0.564	0.17
87_S	141_L	0.564	0.17
48_E	51_G	0.564	0.17
671_A	678_Q	0.563	0.17
494_D	527_T	0.563	0.17
576_Q	661_K	0.563	0.17
365_T	383_S	0.562	0.17
64_R	389_V	0.562	0.17
235_G	278_G	0.561	0.17
199_Y	539_F	0.560	0.17
220_N	307_Q	0.560	0.17
283_L	573_Q	0.559	0.17
72_P	75_I	0.559	0.17
654_E	657_E	0.559	0.17
204_K	487_R	0.558	0.17
499_A	502_N	0.558	0.17
459_Y	467_T	0.558	0.17
53_L	60_V	0.558	0.17
189_I	216_W	0.557	0.17
407_K	450_K	0.557	0.17
197_N	541_R	0.557	0.17
29_T	393_A	0.556	0.17
73_W	98_G	0.555	0.17
686_R	691_I	0.555	0.17
104_V	170_A	0.554	0.17
305_G	630_L	0.554	0.17
628_A	632_V	0.554	0.17
419_A	425_A	0.553	0.17
348_G	697_P	0.553	0.17
149_K	504_L	0.553	0.17
52_T	633_E	0.553	0.17
419_A	453_I	0.553	0.17
52_T	56_L	0.552	0.17
649_K	680_Y	0.552	0.17
370_R	542_Y	0.551	0.17
628_A	655_L	0.551	0.17
338_T	385_L	0.551	0.17
40_T	543_L	0.550	0.16
125_V	477_V	0.550	0.16
614_D	630_L	0.550	0.16
547_Q	550_T	0.549	0.16
662_W	665_E	0.549	0.16
65_A	283_L	0.548	0.16
191_K	233_H	0.548	0.16
219_G	506_H	0.547	0.16
258_A	669_V	0.546	0.16
327_E	361_L	0.546	0.16
61_R	393_A	0.546	0.16
432_K	436_E	0.546	0.16
213_I	262_A	0.545	0.16
345_T	383_S	0.545	0.16
414_Q	417_D	0.545	0.16
287_V	423_A	0.544	0.16
510_H	514_L	0.543	0.16
253_I	475_V	0.543	0.16
448_Q	554_A	0.543	0.16
329_D	464_E	0.543	0.16
575_E	578_L	0.542	0.16
256_I	335_I	0.542	0.16
466_E	641_A	0.542	0.16
87_S	94_N	0.542	0.16
172_E	520_N	0.541	0.16
678_Q	686_R	0.541	0.16
128_A	196_R	0.541	0.16
253_I	298_S	0.541	0.16
406_V	552_V	0.541	0.16
199_Y	224_F	0.540	0.16
500_A	503_A	0.540	0.16
479_N	498_T	0.540	0.16
94_N	97_A	0.540	0.16
458_K	699_L	0.540	0.16
224_F	438_A	0.539	0.16
240_N	362_G	0.539	0.16
306_A	311_S	0.538	0.16
112_R	128_A	0.538	0.16
164_L	185_I	0.538	0.16
305_G	543_L	0.537	0.16
302_S	305_G	0.537	0.16
256_I	260_I	0.536	0.16
497_V	527_T	0.536	0.16
587_I	615_V	0.536	0.16
148_D	178_P	0.535	0.16
178_P	652_I	0.535	0.16
317_H	351_S	0.535	0.16
149_K	493_D	0.533	0.16
288_A	393_A	0.533	0.16
109_A	132_I	0.532	0.16
182_T	362_G	0.532	0.16
179_D	299_E	0.532	0.16
634_N	637_H	0.531	0.16
171_A	220_N	0.531	0.16
591_K	595_D	0.531	0.16
155_T	233_H	0.530	0.16
565_S	685_E	0.530	0.16
438_A	664_R	0.530	0.16
578_L	584_R	0.530	0.16
301_V	570_I	0.528	0.16
465_D	483_A	0.528	0.16
132_I	198_T	0.528	0.16
45_D	498_T	0.528	0.16
404_Q	448_Q	0.527	0.16
245_V	289_M	0.527	0.16
57_P	567_F	0.527	0.16
357_F	431_P	0.527	0.16
419_A	428_A	0.527	0.16
86_E	622_S	0.526	0.16
671_A	686_R	0.526	0.16
299_E	424_K	0.526	0.16
604_I	644_L	0.525	0.16
47_L	459_Y	0.525	0.16
381_E	416_I	0.525	0.16
40_T	119_P	0.524	0.16
47_L	403_D	0.524	0.16
511_N	685_E	0.524	0.16
224_F	644_L	0.524	0.16
423_A	503_A	0.523	0.16
381_E	385_L	0.523	0.16
197_N	368_S	0.522	0.16
570_I	587_I	0.522	0.16
488_I	491_T	0.522	0.16
219_G	516_A	0.521	0.16
78_Y	87_S	0.520	0.16
276_F	319_Q	0.520	0.16
265_K	309_P	0.520	0.16
166_F	649_K	0.520	0.16
407_K	480_E	0.519	0.15
92_R	475_V	0.519	0.15
266_I	301_V	0.519	0.15
632_V	664_R	0.518	0.15
348_G	378_I	0.518	0.15
567_F	705_V	0.517	0.15
29_T	387_R	0.517	0.15
214_I	664_R	0.517	0.15
268_D	471_E	0.517	0.15
500_A	520_N	0.516	0.15
346_L	601_A	0.516	0.15
550_T	576_Q	0.516	0.15
210_I	284_F	0.516	0.15
412_I	688_V	0.516	0.15
407_K	410_R	0.516	0.15
408_Q	430_L	0.516	0.15
176_V	519_V	0.515	0.15
519_V	641_A	0.515	0.15
332_N	378_I	0.515	0.15
116_S	125_V	0.514	0.15
688_V	698_M	0.513	0.15
153_S	184_T	0.513	0.15
220_N	405_I	0.513	0.15
334_V	503_A	0.513	0.15
601_A	677_P	0.513	0.15
407_K	537_V	0.512	0.15
214_I	323_W	0.512	0.15
404_Q	407_K	0.512	0.15
601_A	693_G	0.511	0.15
189_I	193_Y	0.511	0.15
177_T	543_L	0.511	0.15
253_I	413_I	0.511	0.15
210_I	223_R	0.510	0.15
486_E	516_A	0.510	0.15
579_A	684_Q	0.510	0.15
38_L	41_E	0.509	0.15
652_I	655_L	0.509	0.15
388_T	574_T	0.509	0.15
249_L	299_E	0.509	0.15
583_R	616_D	0.508	0.15
256_I	607_A	0.508	0.15
198_T	544_V	0.508	0.15
296_L	490_A	0.507	0.15
277_F	430_L	0.507	0.15
241_C	285_M	0.507	0.15
589_I	617_L	0.506	0.15
301_V	392_L	0.506	0.15
99_Q	342_L	0.506	0.15
134_T	525_R	0.506	0.15
571_V	689_A	0.505	0.15
367_F	371_I	0.505	0.15
241_C	286_N	0.505	0.15
414_Q	568_D	0.504	0.15
236_E	276_F	0.504	0.15
342_L	385_L	0.504	0.15
330_P	705_V	0.503	0.15
92_R	504_L	0.503	0.15
549_V	576_Q	0.503	0.15
130_V	141_L	0.503	0.15
633_E	662_W	0.503	0.15
339_I	452_V	0.503	0.15
300_A	414_Q	0.502	0.15
229_I	653_P	0.502	0.15
571_V	574_T	0.502	0.15
43_D	47_L	0.501	0.15
60_V	410_R	0.501	0.15
570_I	611_L	0.501	0.15
461_L	686_R	0.501	0.15
242_V	283_L	0.501	0.15
389_V	526_A	0.501	0.15
109_A	515_L	0.500	0.15
47_L	52_T	0.500	0.15

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2xijA	2	0.9888	100	0.197	Contact Map
1reqA	1	0.986	100	0.2	Contact Map
4r3uA	2	0.7591	100	0.309	Contact Map
1reqB	1	0.8319	100	0.34	Contact Map
4xc8A	2	0.7479	100	0.35	Contact Map
3kp1A	2	0.8922	100	0.528	Contact Map
1ccwB	2	0.6246	100	0.847	Contact Map
3bulA	1	0.3039	99.9	0.923	Contact Map
4r3uC	1	0.1835	99.9	0.929	Contact Map
3ezxA	2	0.2857	99.9	0.929	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0163 seconds.