DCOS - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

DCOS - Ornithine decarboxylase, inducible

UniProt:	P24169	Sequences: MSKLKIAVSDSCPDCFTTQRECIYINESRNIDVAAIVLSLNDVTCGKLDEIDATGYGIPVFIATENQERVPAEYLPRISGVFENCESRREFYGRQLETAASHYETQLRPPFFRALVDYVNQGNSAFDCPGHQGGEFFRRHPAGNQFVEYFGEALFRADLCNADVAMGDLLIHEGAPCIAQQHAAKVFNADKTYFVLNGTSSSNKVVLNALLTPGDLVLFDRNNHKSNHHGALLQAGATPVYLETARNPYGFIGGIDAHCFEESYLRELIAEVAPQRAKEARPFRLAVIQLGTYDGTIYNARQVVDKIGHLCDYILFDSAWVGYEQFIPMMADCSPLLLDLNENDPGILVTQSVHKQQAGFSQTSQIHKKDSHIKGQQRYVPHKRMNNAFMMHASTSPFYPLFAALNINAKMHEGVSGRNMWMDCVVNGINARKLILDNCQHIRPFVPELVDGKPWQSYETAQIAVDLRFFQFVPGEHWHSFEGYAENQYFVDPCKLLLTTPGIDARNGEYEAFGVPATILANFLRENGVVPEKCDLNSILFLLTPAEDMAKLQQLVALLVRFEKLLESDAPLAEVLPSIYKQHEERYAGYTLRQLCQEMHDLYARHNVKQLQKEMFRKEHFPRVSMNPQEANYAYLRGEVELVRLPDAEGRIAAEGALPYPPGVLCVVPGEIWGGAVLRYFSALEEGINLLPGFAPELQGVYIEEHDGRKQVWCYVIKPRDAQSTLLKGEKL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10964
Length:	732 (667)
Sequences:	651 (280)
Seq/√Len:	10.8

ECOLI - DCOS DCOR ADIA DCLZ LDCI

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
641_E	651_R	7.458	1.00
634_A	639_E	7.224	1.00
473_V	476_E	5.749	1.00
565_L	570_A	5.661	1.00
192_T	367_H	5.574	1.00
211_L	237_A	5.432	1.00
128_C	160_C	5.113	1.00
569_D	594_Q	5.074	1.00
363_T	404_A	4.874	1.00
61_F	99_A	4.530	1.00
150_F	157_A	4.486	1.00
112_F	406_N	4.308	0.99
48_L	60_V	4.223	0.99
184_A	189_A	4.112	0.99
335_P	349_V	3.833	0.99
128_C	162_A	3.823	0.99
523_F	561_R	3.707	0.98
571_P	574_E	3.565	0.98
199_T	350_T	3.564	0.98
569_D	591_T	3.494	0.98
586_R	598_E	3.420	0.97
428_G	543_L	3.252	0.96
623_R	672_I	3.139	0.95
205_V	393_A	3.125	0.95
644_R	647_D	2.943	0.94
166_M	385_M	2.913	0.93
591_T	594_Q	2.817	0.92
635_Y	664_V	2.787	0.91
447_P	450_V	2.777	0.91
206_V	348_L	2.654	0.89
496_L	543_L	2.554	0.87
182_H	186_V	2.474	0.86
160_C	533_K	2.439	0.85
193_Y	382_H	2.419	0.84
146_F	404_A	2.396	0.84
182_H	185_K	2.377	0.83
273_A	278_K	2.371	0.83
646_P	682_S	2.367	0.83
626_M	634_A	2.316	0.81
127_D	391_M	2.314	0.81
128_C	161_N	2.299	0.81
179_A	194_F	2.269	0.80
136_F	412_H	2.228	0.79
213_P	633_Y	2.211	0.78
515_V	566_L	2.165	0.77
196_L	401_L	2.157	0.76
183_A	194_F	2.152	0.76
89_R	93_G	2.123	0.75
132_Q	160_C	2.116	0.75
175_A	211_L	2.113	0.75
431_A	543_L	2.091	0.74
229_H	392_H	2.080	0.74
51_I	705_E	2.063	0.73
527_N	561_R	2.058	0.73
194_F	405_L	2.055	0.73
96_L	265_L	2.044	0.72
48_L	385_M	2.034	0.72
640_V	654_A	2.029	0.72
348_L	385_M	2.026	0.71
458_Y	463_I	2.017	0.71
537_N	600_H	1.995	0.70
176_P	402_F	1.972	0.69
441_H	567_E	1.942	0.68
470_F	480_S	1.941	0.68
256_D	617_R	1.931	0.68
216_L	283_F	1.925	0.67
259_C	268_L	1.922	0.67
82_F	96_L	1.920	0.67
171_I	697_E	1.906	0.67
202_S	664_V	1.893	0.66
471_Q	487_N	1.885	0.66
154_L	400_P	1.884	0.66
458_Y	469_F	1.883	0.66
175_A	515_V	1.871	0.65
185_K	625_S	1.855	0.64
610_Q	614_E	1.853	0.64
462_Q	466_D	1.847	0.64
154_L	360_F	1.831	0.63
267_E	271_E	1.822	0.63
206_V	237_A	1.822	0.63
149_Y	153_A	1.816	0.63
333_C	467_L	1.813	0.63
186_V	413_E	1.811	0.62
474_P	486_E	1.809	0.62
40_L	65_E	1.779	0.61
231_A	314_I	1.773	0.61
679_R	682_S	1.773	0.61
364_S	660_Y	1.759	0.60
302_Q	305_D	1.755	0.60
359_G	365_Q	1.739	0.59
118_Y	128_C	1.736	0.59
162_A	532_E	1.729	0.59
620_H	623_R	1.705	0.58
205_V	556_V	1.704	0.58
580_Y	584_E	1.697	0.57
625_S	672_I	1.697	0.57
152_E	156_R	1.694	0.57
361_S	397_P	1.678	0.56
128_C	291_G	1.674	0.56
109_P	323_Y	1.660	0.55
263_S	267_E	1.651	0.55
228_H	668_V	1.643	0.55
204_K	229_H	1.635	0.54
166_M	411_M	1.633	0.54
607_N	610_Q	1.615	0.53
132_Q	162_A	1.615	0.53
112_F	116_V	1.610	0.53
308_G	345_P	1.604	0.53
199_T	204_K	1.595	0.52
408_N	541_F	1.589	0.52
505_A	511_E	1.571	0.51
166_M	176_P	1.571	0.51
144_N	148_E	1.566	0.51
182_H	413_E	1.559	0.51
255_I	288_I	1.559	0.51
435_I	559_L	1.549	0.50
150_F	185_K	1.547	0.50
705_E	709_R	1.541	0.50
150_F	348_L	1.540	0.50
197_N	362_Q	1.538	0.50
394_S	697_E	1.534	0.50
431_A	496_L	1.531	0.49
127_D	160_C	1.530	0.49
523_F	565_L	1.513	0.49
440_Q	450_V	1.511	0.48
267_E	270_A	1.511	0.48
170_L	197_N	1.510	0.48
126_F	254_G	1.505	0.48
155_F	230_G	1.501	0.48
157_A	636_L	1.496	0.48
120_N	473_V	1.494	0.48
128_C	132_Q	1.489	0.47
389_F	578_S	1.486	0.47
572_L	586_R	1.472	0.47
597_Q	601_D	1.470	0.46
502_G	587_Y	1.461	0.46
122_G	212_T	1.458	0.46
146_F	150_F	1.457	0.46
299_N	487_N	1.451	0.46
94_R	122_G	1.445	0.45
185_K	413_E	1.444	0.45
201_S	348_L	1.441	0.45
127_D	159_L	1.438	0.45
404_A	679_R	1.437	0.45
453_K	462_Q	1.436	0.45
149_Y	157_A	1.414	0.44
210_L	380_V	1.411	0.44
275_Q	278_K	1.411	0.44
473_V	486_E	1.410	0.44
247_N	481_F	1.408	0.44
394_S	532_E	1.405	0.43
130_G	364_S	1.403	0.43
301_R	332_D	1.401	0.43
632_N	636_L	1.400	0.43
197_N	201_S	1.397	0.43
177_C	181_Q	1.392	0.43
213_P	629_Q	1.384	0.42
247_N	502_G	1.379	0.42
220_D	292_T	1.377	0.42
226_S	659_P	1.374	0.42
185_K	527_N	1.362	0.41
136_F	358_A	1.353	0.41
216_L	269_I	1.342	0.40
336_L	363_T	1.338	0.40
431_A	546_A	1.338	0.40
186_V	202_S	1.335	0.40
573_A	589_G	1.334	0.40
504_D	507_N	1.334	0.40
127_D	132_Q	1.328	0.40
150_F	351_Q	1.318	0.39
128_C	533_K	1.316	0.39
205_V	366_I	1.302	0.39
364_S	659_P	1.302	0.39
258_H	264_Y	1.295	0.38
183_A	192_T	1.294	0.38
266_R	370_D	1.293	0.38
290_L	359_G	1.287	0.38
497_L	538_S	1.281	0.38
406_N	508_G	1.276	0.37
299_N	467_L	1.275	0.37
327_I	421_W	1.269	0.37
207_L	380_V	1.266	0.37
284_R	544_T	1.266	0.37
115_L	403_A	1.258	0.37
427_N	552_L	1.258	0.37
605_R	690_L	1.255	0.37
504_D	509_E	1.251	0.36
454_P	457_S	1.249	0.36
504_D	511_E	1.245	0.36
241_Y	390_M	1.243	0.36
163_D	533_K	1.239	0.36
290_L	365_Q	1.238	0.36
150_F	384_R	1.233	0.36
440_Q	445_F	1.226	0.35
268_L	271_E	1.224	0.35
291_G	699_Q	1.221	0.35
691_L	710_K	1.220	0.35
270_A	278_K	1.215	0.35
261_E	306_K	1.215	0.35
219_F	228_H	1.214	0.35
242_L	576_L	1.214	0.35
55_G	136_F	1.211	0.35
204_K	392_H	1.208	0.34
58_I	120_N	1.204	0.34
249_Y	550_A	1.202	0.34
519_I	596_C	1.202	0.34
512_A	604_A	1.201	0.34
136_F	496_L	1.200	0.34
60_V	202_S	1.200	0.34
135_E	385_M	1.199	0.34
163_D	470_F	1.195	0.34
179_A	202_S	1.194	0.34
447_P	637_R	1.193	0.34
359_G	408_N	1.187	0.34
461_A	706_H	1.182	0.33
476_E	512_A	1.180	0.33
300_A	314_I	1.177	0.33
118_Y	389_F	1.177	0.33
442_I	559_L	1.176	0.33
191_K	382_H	1.176	0.33
205_V	217_V	1.173	0.33
590_Y	598_E	1.170	0.33
649_E	675_G	1.170	0.33
229_H	391_M	1.169	0.33
254_G	318_S	1.162	0.33
504_D	592_L	1.162	0.33
196_L	230_G	1.162	0.33
130_G	660_Y	1.155	0.32
595_L	694_F	1.152	0.32
626_M	630_E	1.143	0.32
318_S	321_V	1.142	0.32
168_D	290_L	1.136	0.31
361_S	551_K	1.135	0.31
487_N	512_A	1.135	0.31
523_F	527_N	1.131	0.31
242_L	260_F	1.129	0.31
534_C	668_V	1.128	0.31
160_C	540_L	1.126	0.31
212_T	637_R	1.123	0.31
183_A	236_G	1.122	0.31
568_S	679_R	1.121	0.31
80_G	91_F	1.120	0.31
65_E	74_Y	1.118	0.31
170_L	195_V	1.116	0.31
160_C	164_V	1.103	0.30
447_P	452_G	1.102	0.30
101_S	705_E	1.101	0.30
313_Y	346_G	1.101	0.30
209_A	366_I	1.100	0.30
118_Y	170_L	1.099	0.30
45_C	64_T	1.098	0.30
127_D	162_A	1.097	0.30
276_R	368_K	1.096	0.30
440_Q	567_E	1.096	0.30
200_S	229_H	1.096	0.30
497_L	600_H	1.094	0.30
208_N	233_L	1.094	0.30
46_G	652_I	1.091	0.30
440_Q	447_P	1.091	0.30
529_V	679_R	1.090	0.30
674_G	677_V	1.086	0.29
426_V	630_E	1.081	0.29
365_Q	405_L	1.080	0.29
140_H	387_N	1.079	0.29
142_A	189_A	1.075	0.29
557_A	560_V	1.075	0.29
584_E	588_A	1.057	0.28
136_F	428_G	1.056	0.28
155_F	327_I	1.056	0.28
70_V	394_S	1.055	0.28
52_D	77_R	1.055	0.28
181_Q	240_V	1.053	0.28
154_L	515_V	1.053	0.28
502_G	514_G	1.053	0.28
171_I	289_Q	1.051	0.28
235_A	648_A	1.050	0.28
351_Q	367_H	1.047	0.28
648_A	651_R	1.047	0.28
200_S	392_H	1.043	0.28
351_Q	519_I	1.040	0.28
362_Q	517_A	1.040	0.28
550_A	559_L	1.040	0.28
200_S	397_P	1.039	0.28
128_C	168_D	1.038	0.28
356_Q	494_C	1.038	0.28
572_L	691_L	1.037	0.28
127_D	297_I	1.037	0.28
202_S	559_L	1.035	0.27
160_C	163_D	1.035	0.27
450_V	457_S	1.033	0.27
202_S	476_E	1.032	0.27
388_A	659_P	1.029	0.27
62_I	74_Y	1.029	0.27
187_F	357_Q	1.026	0.27
310_L	345_P	1.026	0.27
409_A	455_W	1.021	0.27
628_P	631_A	1.020	0.27
71_P	74_Y	1.018	0.27
708_G	712_V	1.017	0.27
204_K	228_H	1.016	0.27
179_A	405_L	1.016	0.27
130_G	252_I	1.014	0.27
118_Y	199_T	1.014	0.27
459_E	614_E	1.010	0.26
425_V	494_C	1.010	0.26
129_P	495_K	1.009	0.26
49_D	77_R	1.007	0.26
80_G	194_F	1.005	0.26
155_F	423_D	1.002	0.26
351_Q	525_R	0.999	0.26
551_K	622_P	0.999	0.26
47_K	57_G	0.999	0.26
429_I	464_A	0.999	0.26
263_S	585_E	0.998	0.26
210_L	348_L	0.997	0.26
111_F	199_T	0.997	0.26
65_E	82_F	0.995	0.26
154_L	423_D	0.994	0.26
513_F	566_L	0.993	0.26
360_F	398_F	0.992	0.26
219_F	497_L	0.991	0.26
186_V	409_A	0.991	0.26
184_A	694_F	0.990	0.26
397_P	417_G	0.988	0.26
572_L	580_Y	0.986	0.26
435_I	507_N	0.984	0.26
252_I	364_S	0.981	0.25
61_F	288_I	0.978	0.25
247_N	478_W	0.977	0.25
201_S	394_S	0.977	0.25
69_R	74_Y	0.976	0.25
88_R	91_F	0.976	0.25
170_L	395_T	0.974	0.25
159_L	488_Q	0.973	0.25
111_F	179_A	0.971	0.25
534_C	566_L	0.967	0.25
347_I	645_L	0.965	0.25
518_T	678_L	0.964	0.25
216_L	256_D	0.964	0.25
229_H	255_I	0.963	0.25
76_P	90_E	0.959	0.25
322_G	372_H	0.955	0.25
169_L	693_G	0.953	0.24
549_M	553_Q	0.952	0.24
652_I	711_Q	0.950	0.24
299_N	589_G	0.950	0.24
82_F	106_Q	0.949	0.24
46_G	435_I	0.947	0.24
301_R	305_D	0.946	0.24
540_L	669_P	0.945	0.24
60_V	178_I	0.944	0.24
251_F	558_L	0.942	0.24
114_A	357_Q	0.941	0.24
206_V	217_V	0.939	0.24
318_S	324_E	0.937	0.24
119_V	390_M	0.935	0.24
168_D	359_G	0.929	0.24
405_L	535_D	0.928	0.24
157_A	285_L	0.927	0.24
435_I	560_V	0.926	0.23
434_L	556_V	0.925	0.23
425_V	490_F	0.923	0.23
195_V	393_A	0.922	0.23
128_C	163_D	0.918	0.23
283_F	428_G	0.917	0.23
80_G	615_M	0.916	0.23
631_A	642_L	0.916	0.23
204_K	394_S	0.914	0.23
445_F	450_V	0.913	0.23
353_V	365_Q	0.912	0.23
180_Q	210_L	0.912	0.23
451_D	468_R	0.911	0.23
153_A	265_L	0.910	0.23
310_L	346_G	0.908	0.23
461_A	639_E	0.908	0.23
112_F	687_G	0.906	0.23
348_L	380_V	0.904	0.23
428_G	549_M	0.900	0.23
473_V	477_H	0.898	0.23
256_D	668_V	0.897	0.23
139_R	575_V	0.894	0.22
639_E	652_I	0.894	0.22
160_C	365_Q	0.893	0.22
564_K	607_N	0.891	0.22
318_S	333_C	0.888	0.22
216_L	274_P	0.887	0.22
247_N	479_H	0.887	0.22
312_D	378_R	0.886	0.22
229_H	665_L	0.886	0.22
266_R	466_D	0.885	0.22
265_L	679_R	0.882	0.22
247_N	358_A	0.879	0.22
201_S	635_Y	0.874	0.22
61_F	654_A	0.869	0.22
389_F	658_L	0.869	0.22
188_N	325_Q	0.866	0.21
116_V	523_F	0.865	0.21
367_H	525_R	0.864	0.21
363_T	528_G	0.864	0.21
561_R	564_K	0.864	0.21
188_N	318_S	0.863	0.21
266_R	282_P	0.858	0.21
154_L	398_F	0.857	0.21
381_P	643_V	0.857	0.21
139_R	566_L	0.854	0.21
45_C	77_R	0.854	0.21
580_Y	583_H	0.853	0.21
431_A	491_V	0.852	0.21
445_F	668_V	0.852	0.21
215_D	284_R	0.852	0.21
529_V	652_I	0.851	0.21
50_E	58_I	0.851	0.21
251_F	643_V	0.850	0.21
222_N	359_G	0.850	0.21
259_C	330_M	0.848	0.21
202_S	610_Q	0.848	0.21
328_P	537_N	0.848	0.21
127_D	531_P	0.846	0.21
262_E	282_P	0.845	0.21
235_A	629_Q	0.844	0.21
111_F	288_I	0.843	0.21
672_I	676_A	0.843	0.21
202_S	409_A	0.842	0.21
265_L	269_I	0.842	0.21
129_P	700_G	0.840	0.21
417_G	492_D	0.840	0.21
155_F	531_P	0.840	0.21
274_P	278_K	0.840	0.21
162_A	488_Q	0.839	0.21
360_F	525_R	0.839	0.21
546_A	566_L	0.839	0.21
117_D	646_P	0.839	0.21
200_S	391_M	0.838	0.21
308_G	378_R	0.837	0.21
226_S	660_Y	0.836	0.21
674_G	679_R	0.834	0.20
557_A	564_K	0.833	0.20
65_E	153_A	0.833	0.20
478_W	481_F	0.832	0.20
240_V	667_V	0.831	0.20
444_P	450_V	0.831	0.20
153_A	199_T	0.831	0.20
128_C	296_T	0.829	0.20
199_T	232_L	0.829	0.20
200_S	361_S	0.826	0.20
199_T	660_Y	0.826	0.20
388_A	676_A	0.825	0.20
397_P	406_N	0.823	0.20
65_E	568_S	0.820	0.20
499_T	505_A	0.820	0.20
197_N	387_N	0.819	0.20
273_A	676_A	0.818	0.20
327_I	349_V	0.817	0.20
631_A	643_V	0.815	0.20
230_G	531_P	0.813	0.20
385_M	550_A	0.810	0.20
149_Y	659_P	0.808	0.20
257_A	342_E	0.806	0.20
228_H	617_R	0.806	0.20
537_N	541_F	0.806	0.20
161_N	242_L	0.806	0.20
160_C	290_L	0.805	0.20
286_A	616_F	0.805	0.20
289_Q	665_L	0.804	0.20
250_G	577_P	0.802	0.20
596_C	600_H	0.802	0.20
408_N	643_V	0.800	0.19
366_I	595_L	0.799	0.19
70_V	116_V	0.799	0.19
390_M	399_Y	0.798	0.19
48_L	74_Y	0.798	0.19
299_N	640_V	0.798	0.19
219_F	223_N	0.798	0.19
538_S	683_A	0.797	0.19
441_H	450_V	0.796	0.19
223_N	289_Q	0.795	0.19
260_F	538_S	0.795	0.19
175_A	235_A	0.794	0.19
296_T	489_Y	0.794	0.19
388_A	684_L	0.791	0.19
60_V	635_Y	0.790	0.19
394_S	533_K	0.788	0.19
262_E	266_R	0.787	0.19
71_P	80_G	0.785	0.19
328_P	492_D	0.785	0.19
602_L	606_H	0.785	0.19
140_H	197_N	0.784	0.19
438_N	560_V	0.783	0.19
256_D	491_V	0.782	0.19
667_V	681_F	0.781	0.19
237_A	683_A	0.781	0.19
161_N	668_V	0.780	0.19
360_F	385_M	0.778	0.19
94_R	159_L	0.778	0.19
63_A	407_I	0.777	0.19
258_H	268_L	0.775	0.19
169_L	517_A	0.774	0.19
426_V	430_N	0.773	0.19
149_Y	380_V	0.772	0.19
128_C	699_Q	0.772	0.19
150_F	678_L	0.770	0.19
210_L	285_L	0.770	0.19
322_G	365_Q	0.770	0.19
244_T	357_Q	0.769	0.19
509_E	513_F	0.767	0.18
372_H	421_W	0.766	0.18
289_Q	324_E	0.765	0.18
114_A	621_F	0.765	0.18
433_K	460_T	0.764	0.18
257_A	485_A	0.764	0.18
169_L	406_N	0.763	0.18
468_R	675_G	0.763	0.18
405_L	696_P	0.763	0.18
528_G	565_L	0.762	0.18
327_I	656_G	0.761	0.18
314_I	531_P	0.760	0.18
270_A	343_N	0.759	0.18
626_M	631_A	0.759	0.18
487_N	589_G	0.758	0.18
269_I	630_E	0.757	0.18
571_P	649_E	0.756	0.18
133_G	411_M	0.756	0.18
159_L	207_L	0.755	0.18
203_N	659_P	0.754	0.18
110_P	417_G	0.753	0.18
204_K	665_L	0.752	0.18
629_Q	641_E	0.752	0.18
470_F	520_L	0.752	0.18
197_N	669_P	0.751	0.18
192_T	653_A	0.751	0.18
542_L	551_K	0.750	0.18
203_N	660_Y	0.750	0.18
155_F	689_N	0.749	0.18
299_N	388_A	0.749	0.18
153_A	659_P	0.747	0.18
258_H	305_D	0.747	0.18
363_T	401_L	0.747	0.18
238_T	664_V	0.745	0.18
291_G	387_N	0.744	0.18
127_D	176_P	0.741	0.18
427_N	543_L	0.741	0.18
284_R	603_Y	0.740	0.18
86_E	211_L	0.740	0.18
307_I	491_V	0.740	0.18
512_A	558_L	0.740	0.18
118_Y	160_C	0.739	0.18
118_Y	132_Q	0.738	0.18
204_K	458_Y	0.737	0.18
86_E	559_L	0.737	0.18
157_A	488_Q	0.736	0.18
192_T	401_L	0.736	0.18
353_V	367_H	0.735	0.18
448_E	654_A	0.735	0.18
384_R	635_Y	0.735	0.18
226_S	388_A	0.733	0.18
154_L	347_I	0.732	0.17
383_K	702_Y	0.730	0.17
190_D	433_K	0.728	0.17
230_G	498_L	0.728	0.17
146_F	296_T	0.727	0.17
251_F	445_F	0.726	0.17
126_F	334_S	0.726	0.17
175_A	698_L	0.724	0.17
76_P	564_K	0.724	0.17
366_I	385_M	0.723	0.17
318_S	490_F	0.722	0.17
179_A	533_K	0.722	0.17
296_T	538_S	0.722	0.17
390_M	579_I	0.721	0.17
344_D	378_R	0.721	0.17
132_Q	658_L	0.718	0.17
263_S	601_D	0.718	0.17
271_E	649_E	0.717	0.17
265_L	303_V	0.717	0.17
346_G	372_H	0.716	0.17
251_F	491_V	0.716	0.17
223_N	665_L	0.716	0.17
310_L	313_Y	0.715	0.17
240_V	408_N	0.715	0.17
93_G	434_L	0.713	0.17
512_A	690_L	0.712	0.17
190_D	659_P	0.711	0.17
270_A	605_R	0.711	0.17
114_A	363_T	0.710	0.17
414_G	483_G	0.709	0.17
126_F	318_S	0.709	0.17
360_F	367_H	0.709	0.17
52_D	73_E	0.708	0.17
214_G	238_T	0.707	0.17
440_Q	453_K	0.707	0.17
431_A	552_L	0.707	0.17
214_G	530_V	0.706	0.17
442_I	463_I	0.706	0.17
159_L	367_H	0.706	0.17
237_A	401_L	0.705	0.17
587_Y	595_L	0.705	0.17
53_A	58_I	0.703	0.17
171_I	394_S	0.702	0.17
142_A	407_I	0.701	0.17
684_L	688_I	0.699	0.17
202_S	213_P	0.696	0.17
288_I	521_A	0.696	0.17
117_D	185_K	0.696	0.17
286_A	694_F	0.695	0.16
80_G	533_K	0.695	0.16
162_A	533_K	0.694	0.16
142_A	270_A	0.690	0.16
52_D	79_S	0.690	0.16
101_S	509_E	0.690	0.16
162_A	424_C	0.689	0.16
602_L	666_C	0.689	0.16
113_R	646_P	0.688	0.16
115_L	630_E	0.687	0.16
130_G	631_A	0.687	0.16
385_M	710_K	0.684	0.16
207_L	228_H	0.684	0.16
139_R	632_N	0.684	0.16
163_D	699_Q	0.681	0.16
161_N	290_L	0.681	0.16
437_D	561_R	0.680	0.16
171_I	299_N	0.680	0.16
269_I	523_F	0.680	0.16
462_Q	486_E	0.680	0.16
424_C	470_F	0.679	0.16
194_F	285_L	0.678	0.16
624_V	634_A	0.678	0.16
252_I	660_Y	0.678	0.16
163_D	291_G	0.678	0.16
115_L	649_E	0.678	0.16
161_N	164_V	0.677	0.16
80_G	107_L	0.675	0.16
275_Q	394_S	0.675	0.16
570_A	582_Q	0.674	0.16
223_N	324_E	0.674	0.16
140_H	669_P	0.671	0.16
481_F	502_G	0.670	0.16
245_A	611_L	0.669	0.16
494_C	665_L	0.668	0.16
440_Q	446_V	0.666	0.16
80_G	554_Q	0.666	0.16
175_A	472_F	0.665	0.16
181_Q	571_P	0.664	0.16
612_Q	616_F	0.664	0.16
365_Q	444_P	0.664	0.16
127_D	402_F	0.663	0.16
155_F	532_E	0.663	0.16
429_I	652_I	0.662	0.16
533_K	699_Q	0.661	0.16
197_N	533_K	0.661	0.16
351_Q	399_Y	0.661	0.16
545_P	603_Y	0.660	0.16
417_G	420_M	0.660	0.16
112_F	194_F	0.658	0.16
448_E	467_L	0.657	0.16
672_I	698_L	0.657	0.16
296_T	609_K	0.657	0.16
526_E	652_I	0.657	0.16
107_L	142_A	0.656	0.15
99_A	241_Y	0.656	0.15
532_E	699_Q	0.655	0.15
201_S	445_F	0.655	0.15
684_L	712_V	0.654	0.15
444_P	447_P	0.653	0.15
437_D	585_E	0.651	0.15
329_M	625_S	0.651	0.15
44_T	529_V	0.651	0.15
193_Y	503_I	0.650	0.15
62_I	529_V	0.650	0.15
388_A	686_E	0.649	0.15
125_A	654_A	0.649	0.15
392_H	667_V	0.649	0.15
427_N	496_L	0.648	0.15
501_P	587_Y	0.648	0.15
418_R	643_V	0.648	0.15
200_S	420_M	0.647	0.15
169_L	362_Q	0.647	0.15
73_E	105_T	0.646	0.15
150_F	155_F	0.645	0.15
197_N	394_S	0.645	0.15
401_L	646_P	0.644	0.15
127_D	137_F	0.644	0.15
524_L	563_E	0.644	0.15
55_G	515_V	0.643	0.15
502_G	628_P	0.643	0.15
470_F	479_H	0.641	0.15
279_E	679_R	0.641	0.15
498_L	610_Q	0.641	0.15
150_F	560_V	0.641	0.15
192_T	322_G	0.640	0.15
218_L	694_F	0.640	0.15
346_G	379_Y	0.640	0.15
287_V	697_E	0.638	0.15
508_G	652_I	0.638	0.15
53_A	568_S	0.636	0.15
423_D	461_A	0.635	0.15
169_L	532_E	0.633	0.15
71_P	644_R	0.633	0.15
242_L	255_I	0.633	0.15
290_L	323_Y	0.632	0.15
451_D	458_Y	0.631	0.15
459_E	462_Q	0.631	0.15
58_I	160_C	0.631	0.15
269_I	585_E	0.631	0.15
290_L	656_G	0.630	0.15
131_H	158_D	0.629	0.15
266_R	308_G	0.629	0.15
132_Q	163_D	0.628	0.15
150_F	503_I	0.628	0.15
391_M	632_N	0.627	0.15
503_I	599_M	0.627	0.15
322_G	527_N	0.627	0.15
227_N	287_V	0.626	0.15
270_A	312_D	0.625	0.15
200_S	204_K	0.625	0.15
299_N	333_C	0.624	0.15
190_D	240_V	0.624	0.15
177_C	487_N	0.624	0.15
315_L	566_L	0.624	0.15
387_N	394_S	0.623	0.15
456_Q	631_A	0.623	0.15
559_L	667_V	0.622	0.15
482_E	637_R	0.622	0.15
49_D	178_I	0.622	0.15
51_I	82_F	0.622	0.15
362_Q	538_S	0.622	0.15
359_G	421_W	0.621	0.15
45_C	73_E	0.620	0.15
126_F	664_V	0.619	0.15
426_V	461_A	0.619	0.15
270_A	342_E	0.619	0.15
204_K	217_V	0.618	0.15
164_V	539_I	0.618	0.15
423_D	426_V	0.617	0.15
53_A	74_Y	0.617	0.15
386_N	680_Y	0.617	0.15
111_F	194_F	0.616	0.15
127_D	171_I	0.616	0.15
255_I	298_Y	0.616	0.15
359_G	544_T	0.616	0.15
188_N	517_A	0.615	0.15
356_Q	408_N	0.614	0.14
365_Q	430_N	0.614	0.14
165_A	265_L	0.613	0.14
522_N	535_D	0.613	0.14
143_G	250_G	0.612	0.14
196_L	496_L	0.612	0.14
227_N	677_V	0.612	0.14
579_I	583_H	0.612	0.14
203_N	364_S	0.608	0.14
193_Y	383_K	0.607	0.14
111_F	183_A	0.605	0.14
353_V	412_H	0.604	0.14
418_R	528_G	0.604	0.14
74_Y	434_L	0.603	0.14
218_L	382_H	0.603	0.14
133_G	361_S	0.603	0.14
180_Q	470_F	0.603	0.14
357_Q	546_A	0.603	0.14
128_C	532_E	0.602	0.14
350_T	362_Q	0.602	0.14
209_A	308_G	0.601	0.14
113_R	159_L	0.600	0.14
169_L	298_Y	0.598	0.14
131_H	700_G	0.598	0.14
78_I	202_S	0.597	0.14
512_A	581_K	0.595	0.14
104_E	260_F	0.595	0.14
69_R	77_R	0.594	0.14
610_Q	630_E	0.594	0.14
362_Q	533_K	0.594	0.14
65_E	610_Q	0.594	0.14
530_V	657_A	0.594	0.14
123_N	360_F	0.594	0.14
284_R	421_W	0.593	0.14
194_F	206_V	0.592	0.14
232_L	389_F	0.591	0.14
90_E	148_E	0.591	0.14
63_A	262_E	0.590	0.14
242_L	395_T	0.590	0.14
675_G	679_R	0.590	0.14
163_D	532_E	0.589	0.14
626_M	629_Q	0.588	0.14
195_V	201_S	0.587	0.14
178_I	227_N	0.586	0.14
312_D	344_D	0.586	0.14
270_A	568_S	0.584	0.14
274_P	336_L	0.584	0.14
423_D	434_L	0.584	0.14
51_I	381_P	0.583	0.14
219_F	600_H	0.583	0.14
185_K	416_S	0.583	0.14
223_N	421_W	0.581	0.14
133_G	391_M	0.581	0.14
444_P	531_P	0.580	0.14
232_L	402_F	0.580	0.14
329_M	490_F	0.578	0.14
173_E	394_S	0.578	0.14
125_A	187_F	0.577	0.14
435_I	575_V	0.577	0.14
604_A	679_R	0.576	0.14
150_F	229_H	0.576	0.14
482_E	487_N	0.575	0.14
59_P	587_Y	0.575	0.14
178_I	413_E	0.574	0.14
330_M	563_E	0.574	0.14
507_N	512_A	0.573	0.14
285_L	533_K	0.573	0.14
248_P	667_V	0.573	0.14
367_H	390_M	0.572	0.14
318_S	349_V	0.572	0.14
275_Q	281_R	0.571	0.13
512_A	705_E	0.571	0.13
423_D	641_E	0.570	0.13
68_E	630_E	0.570	0.13
287_V	323_Y	0.569	0.13
112_F	205_V	0.568	0.13
498_L	560_V	0.568	0.13
110_P	255_I	0.567	0.13
267_E	465_V	0.567	0.13
422_M	652_I	0.566	0.13
423_D	512_A	0.566	0.13
220_D	315_L	0.566	0.13
477_H	507_N	0.566	0.13
124_S	385_M	0.566	0.13
177_C	559_L	0.565	0.13
498_L	632_N	0.565	0.13
125_A	496_L	0.565	0.13
577_P	587_Y	0.564	0.13
51_I	76_P	0.563	0.13
270_A	273_A	0.563	0.13
42_D	46_G	0.563	0.13
218_L	286_A	0.563	0.13
698_L	703_I	0.563	0.13
294_D	320_W	0.562	0.13
162_A	699_Q	0.561	0.13
49_D	101_S	0.561	0.13
97_E	267_E	0.560	0.13
289_Q	408_N	0.560	0.13
63_A	441_H	0.560	0.13
81_V	574_E	0.559	0.13
150_F	400_P	0.559	0.13
113_R	185_K	0.558	0.13
110_P	397_P	0.557	0.13
49_D	73_E	0.557	0.13
118_Y	260_F	0.557	0.13
209_A	342_E	0.557	0.13
440_Q	452_G	0.556	0.13
192_T	360_F	0.556	0.13
265_L	695_A	0.556	0.13
520_L	539_I	0.556	0.13
131_H	143_G	0.555	0.13
318_S	406_N	0.555	0.13
540_L	693_G	0.554	0.13
202_S	445_F	0.554	0.13
178_I	576_L	0.554	0.13
251_F	569_D	0.554	0.13
93_G	156_R	0.553	0.13
64_T	405_L	0.552	0.13
100_A	194_F	0.552	0.13
346_G	421_W	0.551	0.13
81_V	89_R	0.551	0.13
263_S	475_G	0.551	0.13
278_K	602_L	0.551	0.13
423_D	625_S	0.550	0.13
257_A	487_N	0.550	0.13
141_P	501_P	0.550	0.13
497_L	672_I	0.550	0.13
185_K	705_E	0.549	0.13
108_R	286_A	0.549	0.13
627_N	647_D	0.548	0.13
164_V	241_Y	0.548	0.13
166_M	175_A	0.548	0.13
468_R	620_H	0.548	0.13
694_F	697_E	0.548	0.13
177_C	180_Q	0.547	0.13
173_E	616_F	0.547	0.13
361_S	622_P	0.547	0.13
131_H	671_E	0.547	0.13
132_Q	359_G	0.546	0.13
197_N	204_K	0.546	0.13
704_E	709_R	0.545	0.13
111_F	215_D	0.545	0.13
149_Y	403_A	0.545	0.13
90_E	707_D	0.544	0.13
111_F	219_F	0.544	0.13
217_V	231_A	0.544	0.13
271_E	468_R	0.543	0.13
665_L	683_A	0.543	0.13
165_A	227_N	0.543	0.13
472_F	650_G	0.543	0.13
214_G	686_E	0.542	0.13
435_I	658_L	0.542	0.13
38_L	73_E	0.541	0.13
122_G	371_S	0.541	0.13
96_L	582_Q	0.540	0.13
188_N	330_M	0.539	0.13
475_G	646_P	0.539	0.13
204_K	233_L	0.539	0.13
437_D	706_H	0.539	0.13
152_E	386_N	0.539	0.13
496_L	552_L	0.538	0.13
254_G	489_Y	0.538	0.13
74_Y	573_A	0.537	0.13
290_L	321_V	0.537	0.13
147_V	193_Y	0.536	0.13
182_H	406_N	0.536	0.13
129_P	143_G	0.536	0.13
340_L	429_I	0.536	0.13
210_L	616_F	0.536	0.13
197_N	370_D	0.536	0.13
162_A	291_G	0.535	0.13
313_Y	372_H	0.535	0.13
274_P	285_L	0.534	0.13
110_P	420_M	0.534	0.13
41_N	49_D	0.534	0.13
190_D	226_S	0.534	0.13
467_L	559_L	0.533	0.13
76_P	120_N	0.533	0.13
249_Y	306_K	0.532	0.13
404_A	482_E	0.532	0.13
446_V	450_V	0.531	0.13
564_K	568_S	0.531	0.13
161_N	544_T	0.530	0.13
146_F	523_F	0.530	0.13
176_P	387_N	0.530	0.13
284_R	313_Y	0.530	0.13
127_D	699_Q	0.530	0.13
381_P	385_M	0.530	0.13
568_S	650_G	0.529	0.13
60_V	437_D	0.529	0.13
177_C	652_I	0.528	0.13
82_F	280_A	0.528	0.13
182_H	401_L	0.527	0.13
367_H	551_K	0.527	0.13
146_F	229_H	0.527	0.13
533_K	538_S	0.526	0.13
384_R	621_F	0.526	0.13
57_G	323_Y	0.525	0.12
216_L	466_D	0.525	0.12
168_D	223_N	0.525	0.12
167_G	172_H	0.524	0.12
237_A	648_A	0.522	0.12
544_T	668_V	0.522	0.12
308_G	322_G	0.521	0.12
485_A	678_L	0.521	0.12
414_G	418_R	0.521	0.12
171_I	244_T	0.520	0.12
61_F	384_R	0.520	0.12
390_M	654_A	0.519	0.12
60_V	75_L	0.519	0.12
202_S	241_Y	0.519	0.12
404_A	652_I	0.517	0.12
63_A	568_S	0.517	0.12
291_G	318_S	0.517	0.12
125_A	543_L	0.517	0.12
160_C	668_V	0.517	0.12
475_G	499_T	0.516	0.12
166_M	685_E	0.516	0.12
46_G	73_E	0.516	0.12
643_V	678_L	0.516	0.12
133_G	297_I	0.516	0.12
159_L	162_A	0.516	0.12
219_F	283_F	0.514	0.12
65_E	645_L	0.513	0.12
160_C	179_A	0.513	0.12
512_A	518_T	0.512	0.12
573_A	588_A	0.512	0.12
93_G	265_L	0.512	0.12
287_V	565_L	0.511	0.12
69_R	90_E	0.511	0.12
392_H	654_A	0.511	0.12
441_H	445_F	0.510	0.12
64_T	70_V	0.510	0.12
656_G	669_P	0.510	0.12
170_L	417_G	0.510	0.12
522_N	583_H	0.510	0.12
165_A	201_S	0.509	0.12
48_L	73_E	0.508	0.12
394_S	500_T	0.508	0.12
167_G	250_G	0.508	0.12
58_I	482_E	0.507	0.12
283_F	356_Q	0.506	0.12
260_F	360_F	0.506	0.12
170_L	204_K	0.506	0.12
442_I	450_V	0.506	0.12
51_I	84_N	0.505	0.12
91_F	146_F	0.505	0.12
222_N	369_K	0.505	0.12
302_Q	333_C	0.504	0.12
216_L	251_F	0.504	0.12
199_T	364_S	0.503	0.12
501_P	514_G	0.503	0.12
267_E	601_D	0.503	0.12
389_F	523_F	0.502	0.12
187_F	651_R	0.501	0.12
170_L	199_T	0.501	0.12
190_D	235_A	0.501	0.12
153_A	177_C	0.501	0.12
595_L	653_A	0.500	0.12
48_L	70_V	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1c4kA	2	0.9904	100	0.51	Contact Map
2vycA	5	0.9645	100	0.538	Contact Map
3n75A	4	0.929	100	0.583	Contact Map
2x3lA	2	0.5738	100	0.739	Contact Map
4q6rA	2	0.571	100	0.888	Contact Map
3mc6A	2	0.5396	100	0.892	Contact Map
4w8iA	2	0.4822	99.9	0.92	Contact Map
3bc8A	3	0.5683	99.8	0.935	Contact Map
3hl2A	3	0.5779	99.8	0.937	Contact Map
1js3A	2	0.5574	99.8	0.938	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0161 seconds.