PRC - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PRC - Tail-specific protease

UniProt:	P23865	Sequences: MNMFFRLTALAGLLAIAGQTFAVEDITRADQIPVLKEETQHATVSERVTSRFTRSHYRQFDLDQAFSAKIFDRYLNLLDYSHNVLLASDVEQFAKKKTELGDELRSGKLDVFYDLYNLAQKRRFERYQYALSVLEKPMDFTGNDTYNLDRSKAPWPKNEAELNALWDSKVKFDELSLKLTGKTDKEIRETLTRRYKFAIRRLAQTNSEDVFSLAMTAFAREIDPHTNYLSPRNTEQFNTEMSLSLEGIGAVLQMDDDYTVINSMVAGGPAAKSKAISVGDKIVGVGQTGKPMVDVIGWRLDDVVALIKGPKGSKVRLEILPAGKGTKTRTVTLTRERIRLEDRAVKMSVKTVGKEKVGVLDIPGFYVGLTDDVKVQLQKLEKQNVSSVIIDLRSNGGGALTEAVSLSGLFIPAGPIVQVRDNNGKVREDSDTDGQVFYKGPLVVLVDRFSASASEIFAAAMQDYGRALVVGEPTFGKGTVQQYRSLNRIYDQMLRPEWPALGSVQYTIQKFYRVNGGSTQRKGVTPDIIMPTGNEETETGEKFEDNALPWDSIDAATYVKSGDLTAFEPELLKEHNARIAKDPEFQNIMKDIARFNAMKDKRNIVSLNYAVREKENNEDDATRLARLNERFKREGKPELKKLDDLPKDYQEPDPYLDETVNIALDLAKLEKARPAEQPAPVK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10760
Length:	682 (639)
Sequences:	826 (559)
Seq/√Len:	22.1

ECOLI - PRC

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
446_V	474_T	10.498	1.00
461_M	467_A	9.623	1.00
385_V	388_V	7.928	1.00
87_A	91_E	7.490	1.00
394_S	447_D	6.678	1.00
64_Q	101_G	5.987	1.00
377_L	388_V	5.170	1.00
273_S	333_L	4.425	1.00
72_D	97_K	4.349	1.00
68_A	97_K	4.262	1.00
143_N	611_V	3.985	1.00
64_Q	102_D	3.946	1.00
376_Q	379_K	3.927	1.00
286_G	292_M	3.875	1.00
284_G	292_M	3.836	1.00
412_P	435_Q	3.824	1.00
92_Q	118_L	3.811	1.00
390_I	457_F	3.736	1.00
82_H	154_P	3.587	1.00
407_S	416_I	3.532	1.00
94_A	97_K	3.515	1.00
362_I	390_I	3.433	1.00
164_A	167_D	3.374	1.00
276_I	319_I	3.335	1.00
144_D	168_S	3.164	1.00
459_A	517_G	3.155	1.00
443_V	470_V	3.108	1.00
443_V	663_A	3.047	1.00
122_R	125_E	3.039	1.00
156_P	162_L	3.001	1.00
293_V	306_L	2.998	0.99
357_V	387_S	2.973	0.99
512_Y	551_D	2.856	0.99
236_Q	308_K	2.839	0.99
239_T	308_K	2.815	0.99
377_L	385_V	2.768	0.99
314_K	334_T	2.748	0.99
314_K	332_T	2.734	0.99
355_E	386_S	2.612	0.99
86_L	122_R	2.554	0.98
412_P	436_V	2.522	0.98
470_V	659_T	2.494	0.98
347_M	376_Q	2.458	0.98
68_A	94_A	2.434	0.98
86_L	162_L	2.434	0.98
624_L	628_N	2.390	0.97
510_K	551_D	2.386	0.97
140_F	175_L	2.357	0.97
158_N	161_E	2.356	0.97
164_A	168_S	2.350	0.97
273_S	319_I	2.327	0.97
333_L	338_I	2.324	0.97
178_K	609_Y	2.244	0.96
459_A	515_N	2.231	0.96
239_T	245_L	2.222	0.96
259_T	303_V	2.189	0.96
407_S	461_M	2.186	0.96
157_K	161_E	2.172	0.95
347_M	379_K	2.160	0.95
316_R	330_T	2.158	0.95
144_D	167_D	2.156	0.95
449_F	539_T	2.148	0.95
144_D	171_K	2.143	0.95
351_T	356_K	2.109	0.95
68_A	72_D	2.105	0.95
130_A	170_V	2.088	0.94
64_Q	67_S	2.073	0.94
87_A	94_A	2.053	0.94
174_E	187_I	2.046	0.94
614_K	618_E	2.025	0.93
369_L	438_Y	2.013	0.93
74_Y	115_L	1.991	0.93
380_L	388_V	1.986	0.93
68_A	98_T	1.982	0.93
91_E	94_A	1.982	0.93
184_D	188_R	1.979	0.92
121_K	125_E	1.972	0.92
211_F	215_M	1.964	0.92
183_T	186_E	1.959	0.92
511_F	519_T	1.958	0.92
273_S	331_V	1.947	0.92
160_A	163_N	1.905	0.91
273_S	276_I	1.892	0.91
579_I	585_F	1.849	0.90
617_N	621_A	1.810	0.89
388_V	442_L	1.807	0.89
433_D	436_V	1.796	0.88
261_I	273_S	1.780	0.88
362_I	369_L	1.761	0.87
311_K	336_E	1.756	0.87
145_T	604_I	1.750	0.87
232_R	305_A	1.732	0.86
85_L	90_V	1.732	0.86
159_E	163_N	1.717	0.86
377_L	381_E	1.707	0.85
404_V	416_I	1.699	0.85
62_L	70_I	1.695	0.85
609_Y	613_E	1.692	0.85
38_E	41_H	1.678	0.84
266_A	403_A	1.657	0.84
132_S	163_N	1.654	0.84
275_A	329_R	1.644	0.83
374_K	437_F	1.640	0.83
426_V	554_D	1.630	0.83
170_V	173_D	1.621	0.82
167_D	171_K	1.619	0.82
373_V	406_L	1.617	0.82
345_V	373_V	1.613	0.82
129_Y	133_V	1.609	0.82
63_D	546_N	1.607	0.82
368_G	371_D	1.597	0.81
281_K	320_L	1.590	0.81
368_G	467_A	1.574	0.80
89_D	122_R	1.573	0.80
139_D	142_G	1.564	0.80
381_E	440_G	1.545	0.79
411_I	431_D	1.535	0.79
292_M	318_E	1.527	0.78
591_D	626_R	1.527	0.78
374_K	435_Q	1.524	0.78
286_G	289_G	1.521	0.78
150_R	165_L	1.516	0.78
624_L	627_L	1.500	0.77
243_L	344_A	1.499	0.77
251_V	263_S	1.496	0.77
87_A	154_P	1.494	0.77
209_D	299_R	1.489	0.76
85_L	115_L	1.487	0.76
135_E	192_T	1.487	0.76
211_F	297_G	1.483	0.76
275_A	319_I	1.468	0.75
143_N	608_N	1.465	0.75
347_M	383_Q	1.465	0.75
93_F	118_L	1.454	0.75
110_D	283_V	1.452	0.75
238_N	503_S	1.450	0.74
113_Y	210_V	1.448	0.74
245_L	258_Y	1.445	0.74
606_S	611_V	1.434	0.74
387_S	663_A	1.430	0.73
67_S	101_G	1.425	0.73
389_I	443_V	1.419	0.73
309_G	335_R	1.408	0.72
19_Q	23_V	1.387	0.71
357_V	663_A	1.387	0.71
126_R	163_N	1.372	0.70
658_E	662_I	1.368	0.70
30_D	33_P	1.363	0.70
76_N	82_H	1.357	0.69
412_P	433_D	1.349	0.69
251_V	265_V	1.348	0.69
184_D	187_I	1.345	0.69
518_S	550_W	1.344	0.69
124_F	199_I	1.327	0.68
250_A	480_V	1.305	0.66
26_I	30_D	1.290	0.65
230_S	303_V	1.279	0.65
349_V	385_V	1.274	0.64
99_E	158_N	1.268	0.64
375_V	378_Q	1.256	0.63
368_G	461_M	1.253	0.63
247_G	335_R	1.241	0.62
459_A	514_V	1.234	0.62
26_I	29_A	1.233	0.62
74_Y	84_V	1.228	0.61
528_I	662_I	1.219	0.61
75_L	90_V	1.219	0.61
411_I	433_D	1.217	0.61
247_G	309_G	1.216	0.61
336_E	433_D	1.213	0.60
389_I	625_A	1.211	0.60
269_P	297_G	1.209	0.60
142_G	171_K	1.208	0.60
186_E	189_E	1.206	0.60
367_V	399_A	1.202	0.60
137_P	184_D	1.200	0.60
226_T	253_Q	1.199	0.59
468_L	666_L	1.197	0.59
261_I	331_V	1.194	0.59
370_T	405_S	1.189	0.59
292_M	330_T	1.188	0.59
356_K	383_Q	1.187	0.59
403_A	409_L	1.186	0.59
360_L	442_L	1.175	0.58
350_K	660_V	1.170	0.58
236_Q	239_T	1.168	0.57
408_G	431_D	1.168	0.57
401_T	405_S	1.166	0.57
457_F	467_A	1.162	0.57
237_F	396_G	1.157	0.57
27_T	31_Q	1.156	0.57
385_V	442_L	1.154	0.57
658_E	665_D	1.152	0.56
157_K	189_E	1.151	0.56
125_E	159_E	1.149	0.56
606_S	615_E	1.145	0.56
417_V	478_G	1.145	0.56
375_V	379_K	1.141	0.56
594_R	622_T	1.135	0.55
129_Y	163_N	1.129	0.55
174_E	184_D	1.129	0.55
468_L	662_I	1.128	0.55
431_D	436_V	1.127	0.55
64_Q	98_T	1.125	0.55
302_D	558_Y	1.125	0.55
585_F	589_M	1.124	0.54
345_V	360_L	1.123	0.54
70_I	470_V	1.120	0.54
379_K	383_Q	1.119	0.54
381_E	439_K	1.119	0.54
103_E	108_K	1.116	0.54
111_V	115_L	1.116	0.54
630_R	634_E	1.108	0.53
586_Q	589_M	1.106	0.53
21_F	25_D	1.106	0.53
245_L	264_M	1.103	0.53
362_I	438_Y	1.102	0.53
624_L	631_F	1.100	0.53
246_E	311_K	1.098	0.53
595_F	599_K	1.095	0.53
347_M	380_L	1.092	0.52
231_P	246_E	1.088	0.52
572_L	576_N	1.088	0.52
573_K	577_A	1.087	0.52
662_I	665_D	1.083	0.52
71_F	97_K	1.079	0.51
377_L	380_L	1.076	0.51
629_E	632_K	1.071	0.51
404_V	430_S	1.066	0.51
247_G	478_G	1.065	0.50
27_T	30_D	1.056	0.50
521_R	547_A	1.051	0.50
86_L	140_F	1.049	0.49
103_E	111_V	1.049	0.49
115_L	119_A	1.049	0.49
177_L	180_T	1.048	0.49
412_P	431_D	1.047	0.49
404_V	429_D	1.046	0.49
247_G	417_V	1.040	0.49
88_S	122_R	1.039	0.49
483_Y	505_Q	1.030	0.48
145_T	160_A	1.028	0.48
230_S	339_R	1.026	0.48
473_P	525_T	1.021	0.47
331_V	641_K	1.020	0.47
178_K	181_G	1.019	0.47
522_K	525_T	1.017	0.47
575_H	578_R	1.016	0.47
618_E	622_T	1.016	0.47
248_I	478_G	1.015	0.47
110_D	597_A	1.014	0.47
399_A	403_A	1.013	0.47
91_E	99_E	1.013	0.47
622_T	625_A	1.011	0.47
358_G	380_L	1.010	0.47
370_T	406_L	1.010	0.47
283_V	328_T	1.010	0.47
169_K	173_D	1.009	0.47
52_F	505_Q	1.009	0.47
270_A	273_S	1.008	0.47
610_A	613_E	1.007	0.47
371_D	467_A	1.006	0.46
73_R	221_E	1.005	0.46
576_N	580_A	1.003	0.46
192_T	196_K	1.002	0.46
286_G	316_R	1.001	0.46
248_I	335_R	1.000	0.46
160_A	576_N	0.999	0.46
469_V	611_V	0.995	0.46
85_L	468_L	0.994	0.46
411_I	436_V	0.993	0.46
85_L	119_A	0.992	0.46
357_V	386_S	0.987	0.45
150_R	153_A	0.985	0.45
457_F	461_M	0.985	0.45
377_L	439_K	0.984	0.45
640_K	644_D	0.983	0.45
461_M	588_I	0.983	0.45
258_Y	333_L	0.982	0.45
140_F	171_K	0.981	0.45
157_K	474_T	0.981	0.45
73_R	546_N	0.978	0.45
155_W	194_R	0.977	0.45
608_N	611_V	0.971	0.44
141_T	610_A	0.968	0.44
291_P	338_I	0.968	0.44
146_Y	223_D	0.967	0.44
44_V	208_E	0.966	0.44
331_V	361_D	0.965	0.44
621_A	659_T	0.964	0.44
74_Y	159_E	0.963	0.44
73_R	222_I	0.962	0.43
247_G	456_I	0.960	0.43
125_E	132_S	0.959	0.43
245_L	340_L	0.959	0.43
405_S	420_R	0.957	0.43
308_K	368_G	0.954	0.43
193_R	299_R	0.952	0.43
407_S	444_V	0.947	0.42
613_E	617_N	0.947	0.42
624_L	630_R	0.947	0.42
145_T	168_S	0.946	0.42
417_V	456_I	0.942	0.42
182_K	186_E	0.939	0.42
411_I	414_G	0.937	0.42
21_F	27_T	0.931	0.41
264_M	270_A	0.928	0.41
586_Q	590_K	0.924	0.41
469_V	580_A	0.923	0.41
370_T	663_A	0.922	0.41
86_L	156_P	0.922	0.41
577_A	580_A	0.916	0.40
98_T	101_G	0.915	0.40
143_N	382_K	0.912	0.40
237_F	250_A	0.911	0.40
178_K	187_I	0.910	0.40
246_E	299_R	0.909	0.40
637_P	640_K	0.909	0.40
90_V	352_V	0.908	0.40
65_A	271_A	0.906	0.40
632_K	636_K	0.905	0.40
381_E	438_Y	0.904	0.40
74_Y	331_V	0.904	0.40
107_G	518_S	0.903	0.40
286_G	290_K	0.902	0.40
276_I	399_A	0.901	0.39
443_V	474_T	0.900	0.39
232_R	545_D	0.898	0.39
265_V	333_L	0.898	0.39
308_K	456_I	0.898	0.39
248_I	309_G	0.894	0.39
629_E	634_E	0.894	0.39
345_V	480_V	0.894	0.39
457_F	547_A	0.892	0.39
74_Y	595_F	0.889	0.39
221_E	509_Q	0.888	0.39
201_R	265_V	0.888	0.39
335_R	417_V	0.887	0.39
219_A	229_L	0.886	0.38
135_E	196_K	0.885	0.38
253_Q	338_I	0.884	0.38
628_N	636_K	0.883	0.38
575_H	658_E	0.883	0.38
88_S	296_I	0.881	0.38
444_V	467_A	0.881	0.38
357_V	528_I	0.879	0.38
237_F	252_L	0.879	0.38
131_L	192_T	0.878	0.38
345_V	376_Q	0.877	0.38
630_R	636_K	0.876	0.38
187_I	612_R	0.873	0.38
335_R	478_G	0.872	0.38
252_L	480_V	0.872	0.38
641_K	644_D	0.871	0.38
295_V	306_L	0.871	0.38
403_A	437_F	0.869	0.37
658_E	663_A	0.864	0.37
414_G	431_D	0.863	0.37
333_L	336_E	0.862	0.37
590_K	622_T	0.861	0.37
25_D	30_D	0.860	0.37
348_S	590_K	0.857	0.37
261_I	522_K	0.856	0.37
570_E	574_E	0.854	0.36
308_K	335_R	0.853	0.36
183_T	187_I	0.853	0.36
568_E	572_L	0.852	0.36
87_A	157_K	0.851	0.36
628_N	635_G	0.844	0.36
456_I	478_G	0.843	0.36
19_Q	25_D	0.843	0.36
112_F	214_A	0.839	0.35
148_L	223_D	0.838	0.35
530_M	579_I	0.836	0.35
248_I	417_V	0.835	0.35
578_R	658_E	0.834	0.35
239_T	504_V	0.832	0.35
260_V	508_I	0.832	0.35
335_R	456_I	0.831	0.35
23_V	26_I	0.830	0.35
312_G	419_V	0.828	0.35
211_F	269_P	0.827	0.35
153_A	165_L	0.826	0.35
611_V	614_K	0.826	0.35
265_V	407_S	0.825	0.35
239_T	368_G	0.824	0.35
20_T	23_V	0.823	0.35
321_P	329_R	0.822	0.34
611_V	615_E	0.820	0.34
237_F	241_M	0.818	0.34
251_V	458_A	0.818	0.34
400_L	456_I	0.818	0.34
315_V	335_R	0.817	0.34
128_Q	199_I	0.816	0.34
54_R	556_A	0.811	0.34
67_S	97_K	0.811	0.34
71_F	548_L	0.809	0.34
515_N	558_Y	0.809	0.34
231_P	297_G	0.808	0.34
347_M	662_I	0.808	0.34
100_L	214_A	0.803	0.33
82_H	284_G	0.802	0.33
200_R	542_K	0.802	0.33
103_E	535_E	0.800	0.33
558_Y	561_S	0.800	0.33
157_K	160_A	0.799	0.33
143_N	621_A	0.798	0.33
74_Y	632_K	0.798	0.33
175_L	609_Y	0.786	0.32
316_R	332_T	0.786	0.32
641_K	645_L	0.785	0.32
100_L	603_N	0.782	0.32
243_L	612_R	0.781	0.32
309_G	417_V	0.781	0.32
216_T	341_E	0.781	0.32
170_V	446_V	0.780	0.32
444_V	461_M	0.780	0.32
276_I	331_V	0.779	0.32
71_F	208_E	0.779	0.32
21_F	31_Q	0.773	0.31
582_D	661_N	0.771	0.31
82_H	152_K	0.771	0.31
459_A	524_V	0.770	0.31
396_G	454_S	0.769	0.31
456_I	519_T	0.769	0.31
82_H	165_L	0.767	0.31
405_S	485_S	0.767	0.31
315_V	456_I	0.766	0.31
179_L	612_R	0.766	0.31
306_L	329_R	0.766	0.31
265_V	275_A	0.765	0.31
189_E	193_R	0.765	0.31
451_A	455_E	0.765	0.31
172_F	467_A	0.764	0.31
35_L	226_T	0.764	0.31
583_P	586_Q	0.763	0.31
250_A	307_I	0.763	0.31
253_Q	262_N	0.760	0.31
521_R	525_T	0.758	0.31
444_V	473_P	0.758	0.31
75_L	424_G	0.758	0.31
23_V	31_Q	0.757	0.31
248_I	285_V	0.755	0.30
443_V	582_D	0.753	0.30
465_G	563_D	0.753	0.30
357_V	375_V	0.753	0.30
255_D	438_Y	0.752	0.30
465_G	585_F	0.752	0.30
248_I	519_T	0.751	0.30
349_V	356_K	0.750	0.30
63_D	219_A	0.750	0.30
48_V	275_A	0.750	0.30
254_M	300_L	0.749	0.30
438_Y	442_L	0.749	0.30
248_I	308_K	0.748	0.30
140_F	143_N	0.746	0.30
574_E	577_A	0.745	0.30
296_I	340_L	0.745	0.30
286_G	330_T	0.744	0.30
204_Q	299_R	0.744	0.30
610_A	614_K	0.744	0.30
467_A	588_I	0.743	0.30
462_Q	527_D	0.742	0.30
388_V	597_A	0.739	0.30
190_T	257_D	0.738	0.29
86_L	91_E	0.738	0.29
247_G	315_V	0.735	0.29
302_D	616_N	0.735	0.29
577_A	581_K	0.734	0.29
574_E	668_K	0.734	0.29
315_V	417_V	0.732	0.29
142_G	167_D	0.732	0.29
638_E	642_L	0.731	0.29
20_T	29_A	0.729	0.29
318_E	330_T	0.729	0.29
148_L	447_D	0.728	0.29
269_P	359_V	0.727	0.29
29_A	32_I	0.727	0.29
255_D	389_I	0.726	0.29
109_L	615_E	0.725	0.29
459_A	626_R	0.725	0.29
102_D	158_N	0.721	0.29
428_E	431_D	0.720	0.28
250_A	335_R	0.720	0.28
87_A	98_T	0.720	0.28
345_V	407_S	0.720	0.28
94_A	98_T	0.719	0.28
380_L	446_V	0.718	0.28
630_R	635_G	0.718	0.28
248_I	456_I	0.718	0.28
71_F	558_Y	0.717	0.28
234_T	313_S	0.715	0.28
290_K	316_R	0.711	0.28
418_Q	607_L	0.711	0.28
96_K	111_V	0.710	0.28
631_F	636_K	0.710	0.28
276_I	298_W	0.709	0.28
47_R	484_R	0.707	0.28
290_K	314_K	0.704	0.28
554_D	654_P	0.704	0.28
20_T	25_D	0.704	0.28
606_S	612_R	0.704	0.28
371_D	461_M	0.702	0.27
628_N	631_F	0.702	0.27
146_Y	168_S	0.702	0.27
598_M	601_K	0.702	0.27
338_I	579_I	0.701	0.27
564_L	568_E	0.700	0.27
445_L	611_V	0.700	0.27
261_I	630_R	0.700	0.27
594_R	625_A	0.700	0.27
418_Q	467_A	0.699	0.27
519_T	524_V	0.699	0.27
345_V	362_I	0.698	0.27
193_R	200_R	0.697	0.27
197_F	530_M	0.697	0.27
356_K	522_K	0.696	0.27
242_S	505_Q	0.695	0.27
304_V	307_I	0.695	0.27
208_E	229_L	0.694	0.27
309_G	315_V	0.692	0.27
309_G	456_I	0.691	0.27
253_Q	321_P	0.691	0.27
27_T	468_L	0.689	0.27
64_Q	329_R	0.688	0.27
191_L	194_R	0.688	0.27
417_V	480_V	0.687	0.27
229_L	294_D	0.687	0.27
248_I	480_V	0.686	0.27
465_G	560_K	0.685	0.27
631_F	639_L	0.684	0.27
320_L	416_I	0.684	0.27
279_G	325_G	0.683	0.26
389_I	614_K	0.682	0.26
621_A	625_A	0.682	0.26
319_I	576_N	0.681	0.26
219_A	656_L	0.681	0.26
522_K	550_W	0.681	0.26
24_E	31_Q	0.678	0.26
138_M	174_E	0.678	0.26
214_A	222_I	0.678	0.26
252_L	300_L	0.678	0.26
202_L	552_S	0.678	0.26
185_K	382_K	0.677	0.26
35_L	210_V	0.677	0.26
214_A	218_F	0.677	0.26
295_V	635_G	0.677	0.26
48_V	521_R	0.677	0.26
323_G	623_R	0.676	0.26
431_D	435_Q	0.676	0.26
212_S	406_L	0.676	0.26
186_E	514_V	0.675	0.26
530_M	659_T	0.675	0.26
470_V	530_M	0.675	0.26
463_D	513_R	0.673	0.26
85_L	296_I	0.672	0.26
113_Y	664_L	0.672	0.26
309_G	478_G	0.671	0.26
642_L	645_L	0.671	0.26
275_A	331_V	0.669	0.26
338_I	533_G	0.669	0.26
147_N	223_D	0.668	0.26
222_I	504_V	0.668	0.26
584_E	630_R	0.667	0.26
264_M	506_Y	0.666	0.26
172_F	612_R	0.666	0.26
200_R	338_I	0.665	0.26
250_A	304_V	0.665	0.26
122_R	345_V	0.664	0.25
258_Y	293_V	0.663	0.25
315_V	478_G	0.663	0.25
335_R	400_L	0.663	0.25
375_V	447_D	0.663	0.25
370_T	634_E	0.662	0.25
45_S	659_T	0.662	0.25
211_F	241_M	0.661	0.25
383_Q	425_K	0.660	0.25
85_L	470_V	0.660	0.25
50_S	206_N	0.660	0.25
23_V	28_R	0.659	0.25
459_A	556_A	0.658	0.25
272_K	336_E	0.658	0.25
578_R	665_D	0.658	0.25
88_S	91_E	0.657	0.25
456_I	480_V	0.657	0.25
242_S	356_K	0.657	0.25
570_E	573_K	0.657	0.25
517_G	522_K	0.657	0.25
88_S	98_T	0.657	0.25
41_H	211_F	0.656	0.25
322_A	338_I	0.655	0.25
143_N	359_V	0.655	0.25
205_T	544_E	0.655	0.25
130_A	169_K	0.653	0.25
469_V	593_A	0.653	0.25
465_G	660_V	0.652	0.25
629_E	633_R	0.652	0.25
474_T	572_L	0.651	0.25
272_K	277_S	0.650	0.25
117_N	331_V	0.650	0.25
321_P	376_Q	0.649	0.25
468_L	568_E	0.647	0.25
190_T	281_K	0.647	0.25
189_E	572_L	0.647	0.25
373_V	390_I	0.647	0.25
593_A	597_A	0.646	0.25
417_V	519_T	0.646	0.25
407_S	411_I	0.644	0.24
126_R	179_L	0.644	0.24
601_K	654_P	0.643	0.24
459_A	588_I	0.643	0.24
170_V	227_N	0.642	0.24
86_L	89_D	0.642	0.24
386_S	664_L	0.641	0.24
338_I	591_D	0.640	0.24
22_A	25_D	0.638	0.24
26_I	34_V	0.638	0.24
349_V	383_Q	0.637	0.24
112_F	137_P	0.637	0.24
424_G	614_K	0.636	0.24
342_D	404_V	0.635	0.24
136_K	439_K	0.634	0.24
247_G	519_T	0.634	0.24
106_S	574_E	0.633	0.24
265_V	545_D	0.632	0.24
247_G	308_K	0.632	0.24
514_V	558_Y	0.629	0.24
217_A	560_K	0.629	0.24
157_K	346_K	0.628	0.24
21_F	34_V	0.628	0.24
39_T	125_E	0.627	0.24
333_L	657_D	0.627	0.24
272_K	598_M	0.627	0.24
360_L	373_V	0.625	0.23
559_V	636_K	0.625	0.23
71_F	94_A	0.625	0.23
63_D	311_K	0.625	0.23
408_G	433_D	0.625	0.23
343_R	406_L	0.624	0.23
68_A	611_V	0.624	0.23
439_K	458_A	0.624	0.23
246_E	310_P	0.623	0.23
308_K	478_G	0.623	0.23
594_R	626_R	0.623	0.23
628_N	638_E	0.623	0.23
231_P	309_G	0.622	0.23
314_K	514_V	0.622	0.23
105_R	577_A	0.622	0.23
158_N	289_G	0.620	0.23
319_I	331_V	0.620	0.23
407_S	457_F	0.620	0.23
61_D	275_A	0.619	0.23
191_L	284_G	0.619	0.23
576_N	593_A	0.616	0.23
147_N	604_I	0.615	0.23
261_I	294_D	0.614	0.23
76_N	146_Y	0.614	0.23
296_I	570_E	0.614	0.23
312_G	336_E	0.614	0.23
342_D	474_T	0.614	0.23
601_K	615_E	0.614	0.23
21_F	24_E	0.613	0.23
252_L	317_L	0.613	0.23
298_W	306_L	0.612	0.23
26_I	31_Q	0.612	0.23
98_T	637_P	0.611	0.23
128_Q	132_S	0.611	0.23
294_D	304_V	0.611	0.23
240_E	294_D	0.610	0.23
313_S	485_S	0.608	0.23
236_Q	486_L	0.608	0.23
617_N	659_T	0.608	0.23
316_R	334_T	0.608	0.23
245_L	259_T	0.607	0.23
609_Y	617_N	0.607	0.23
148_L	276_I	0.606	0.23
313_S	436_V	0.606	0.23
22_A	28_R	0.605	0.23
80_Y	210_V	0.605	0.23
236_Q	405_S	0.604	0.22
172_F	176_S	0.604	0.22
118_L	121_K	0.604	0.22
22_A	30_D	0.604	0.22
62_L	577_A	0.603	0.22
257_D	297_G	0.603	0.22
344_A	509_Q	0.603	0.22
335_R	519_T	0.603	0.22
521_R	542_K	0.602	0.22
133_V	167_D	0.602	0.22
403_A	407_S	0.602	0.22
209_D	319_I	0.602	0.22
403_A	448_R	0.602	0.22
446_V	526_P	0.602	0.22
143_N	214_A	0.601	0.22
22_A	27_T	0.600	0.22
248_I	304_V	0.600	0.22
219_A	508_I	0.600	0.22
240_E	482_Q	0.600	0.22
153_A	474_T	0.599	0.22
215_M	585_F	0.599	0.22
605_V	638_E	0.599	0.22
78_L	295_V	0.599	0.22
444_V	457_F	0.598	0.22
469_V	649_Y	0.598	0.22
268_G	518_S	0.598	0.22
152_K	375_V	0.598	0.22
418_Q	522_K	0.597	0.22
526_P	539_T	0.596	0.22
185_K	538_E	0.596	0.22
243_L	343_R	0.596	0.22
654_P	664_L	0.594	0.22
512_Y	628_N	0.594	0.22
313_S	335_R	0.593	0.22
120_Q	590_K	0.593	0.22
202_L	342_D	0.592	0.22
252_L	315_V	0.590	0.22
71_F	377_L	0.590	0.22
67_S	71_F	0.589	0.22
190_T	253_Q	0.589	0.22
134_L	161_E	0.589	0.22
390_I	556_A	0.589	0.22
297_G	475_F	0.588	0.22
334_T	379_K	0.588	0.22
23_V	29_A	0.588	0.22
146_Y	260_V	0.588	0.22
191_L	195_Y	0.587	0.22
567_F	625_A	0.587	0.22
59_Q	329_R	0.587	0.22
265_V	308_K	0.587	0.22
312_G	335_R	0.586	0.22
387_S	443_V	0.586	0.22
74_Y	255_D	0.586	0.22
92_Q	95_K	0.586	0.22
629_E	636_K	0.586	0.22
419_V	509_Q	0.585	0.22
567_F	620_D	0.584	0.22
257_D	475_F	0.584	0.22
285_V	309_G	0.584	0.22
248_I	315_V	0.584	0.22
478_G	540_G	0.584	0.22
84_V	369_L	0.584	0.22
459_A	513_R	0.583	0.21
584_E	654_P	0.582	0.21
44_V	486_L	0.580	0.21
113_Y	448_R	0.579	0.21
575_H	579_I	0.579	0.21
218_F	222_I	0.578	0.21
349_V	548_L	0.578	0.21
583_P	628_N	0.578	0.21
252_L	417_V	0.578	0.21
263_S	515_N	0.577	0.21
519_T	550_W	0.577	0.21
247_G	313_S	0.576	0.21
518_S	522_K	0.576	0.21
532_T	587_N	0.576	0.21
454_S	513_R	0.575	0.21
289_G	334_T	0.574	0.21
400_L	417_V	0.573	0.21
100_L	637_P	0.573	0.21
74_Y	311_K	0.573	0.21
91_E	160_A	0.573	0.21
88_S	610_A	0.572	0.21
25_D	28_R	0.571	0.21
308_K	315_V	0.571	0.21
279_G	324_K	0.571	0.21
27_T	384_N	0.570	0.21
419_V	446_V	0.570	0.21
169_K	300_L	0.570	0.21
151_S	445_L	0.570	0.21
378_Q	381_E	0.569	0.21
304_V	417_V	0.569	0.21
158_N	567_F	0.569	0.21
52_F	218_F	0.569	0.21
421_D	425_K	0.568	0.21
273_S	419_V	0.568	0.21
47_R	482_Q	0.567	0.21
592_I	643_D	0.567	0.21
596_N	600_D	0.564	0.21
227_N	362_I	0.563	0.21
309_G	400_L	0.563	0.21
75_L	114_D	0.563	0.21
269_P	510_K	0.562	0.21
247_G	400_L	0.561	0.20
194_R	304_V	0.561	0.20
201_R	302_D	0.561	0.20
389_I	659_T	0.560	0.20
338_I	374_K	0.560	0.20
218_F	512_Y	0.559	0.20
339_R	612_R	0.558	0.20
459_A	501_L	0.558	0.20
369_L	505_Q	0.558	0.20
363_P	466_R	0.558	0.20
149_D	246_E	0.555	0.20
362_I	518_S	0.555	0.20
48_V	189_E	0.555	0.20
77_L	474_T	0.555	0.20
76_N	545_D	0.554	0.20
175_L	349_V	0.553	0.20
212_S	475_F	0.553	0.20
19_Q	27_T	0.553	0.20
178_K	302_D	0.553	0.20
295_V	298_W	0.551	0.20
325_G	525_T	0.551	0.20
121_K	338_I	0.551	0.20
274_K	355_E	0.550	0.20
349_V	388_V	0.550	0.20
461_M	473_P	0.550	0.20
37_E	443_V	0.549	0.20
428_E	517_G	0.549	0.20
331_V	569_P	0.548	0.20
588_I	655_Y	0.548	0.20
181_G	549_P	0.548	0.20
584_E	634_E	0.548	0.20
590_K	593_A	0.548	0.20
261_I	524_V	0.547	0.20
311_K	514_V	0.547	0.20
250_A	276_I	0.546	0.20
144_D	214_A	0.545	0.20
401_T	420_R	0.545	0.20
234_T	503_S	0.544	0.20
210_V	482_Q	0.544	0.20
229_L	367_V	0.543	0.20
285_V	317_L	0.543	0.20
445_L	511_F	0.543	0.20
241_M	480_V	0.542	0.20
458_A	479_T	0.542	0.20
99_E	102_D	0.542	0.20
150_R	269_P	0.541	0.20
193_R	256_D	0.541	0.20
78_L	115_L	0.541	0.20
264_M	529_I	0.541	0.20
140_F	188_R	0.540	0.20
28_R	31_Q	0.540	0.20
241_M	252_L	0.540	0.20
169_K	336_E	0.540	0.20
302_D	501_L	0.539	0.20
179_L	295_V	0.539	0.20
407_S	467_A	0.538	0.19
63_D	171_K	0.538	0.19
47_R	508_I	0.538	0.19
84_V	616_N	0.538	0.19
114_D	118_L	0.538	0.19
132_S	153_A	0.537	0.19
75_L	531_P	0.537	0.19
449_F	512_Y	0.536	0.19
580_A	638_E	0.535	0.19
147_N	603_N	0.535	0.19
184_D	389_I	0.534	0.19
374_K	378_Q	0.534	0.19
48_V	385_V	0.534	0.19
250_A	299_R	0.534	0.19
90_V	341_E	0.534	0.19
552_S	555_A	0.534	0.19
259_T	294_D	0.533	0.19
316_R	467_A	0.533	0.19
289_G	314_K	0.533	0.19
588_I	594_R	0.533	0.19
445_L	659_T	0.533	0.19
290_K	605_V	0.532	0.19
162_L	341_E	0.532	0.19
197_F	301_D	0.531	0.19
66_F	521_R	0.530	0.19
70_I	192_T	0.530	0.19
275_A	577_A	0.529	0.19
121_K	568_E	0.529	0.19
80_Y	296_I	0.528	0.19
22_A	469_V	0.528	0.19
175_L	178_K	0.528	0.19
148_L	608_N	0.527	0.19
460_A	478_G	0.527	0.19
44_V	82_H	0.527	0.19
119_A	123_R	0.527	0.19
89_D	502_G	0.527	0.19
245_L	593_A	0.526	0.19
228_Y	426_V	0.526	0.19
296_I	635_G	0.525	0.19
275_A	620_D	0.525	0.19
231_P	502_G	0.525	0.19
556_A	620_D	0.524	0.19
309_G	519_T	0.524	0.19
117_N	128_Q	0.524	0.19
46_E	146_Y	0.524	0.19
309_G	312_G	0.524	0.19
222_I	626_R	0.523	0.19
647_K	655_Y	0.523	0.19
229_L	475_F	0.522	0.19
247_G	480_V	0.522	0.19
295_V	593_A	0.522	0.19
448_R	542_K	0.522	0.19
465_G	561_S	0.521	0.19
269_P	475_F	0.521	0.19
323_G	552_S	0.521	0.19
487_N	666_L	0.521	0.19
303_V	448_R	0.520	0.19
187_I	472_E	0.520	0.19
582_D	587_N	0.519	0.19
487_N	500_A	0.519	0.19
262_N	512_Y	0.519	0.19
283_V	320_L	0.519	0.19
447_D	542_K	0.518	0.19
381_E	622_T	0.518	0.19
20_T	34_V	0.518	0.19
156_P	165_L	0.518	0.19
285_V	333_L	0.518	0.19
291_P	316_R	0.518	0.19
175_L	606_S	0.517	0.19
48_V	306_L	0.517	0.19
21_F	290_K	0.515	0.19
444_V	547_A	0.515	0.19
22_A	26_I	0.515	0.19
472_E	609_Y	0.515	0.19
363_P	415_P	0.514	0.18
276_I	338_I	0.514	0.18
421_D	530_M	0.513	0.18
315_V	480_V	0.513	0.18
62_L	233_N	0.512	0.18
575_H	665_D	0.512	0.18
250_A	345_V	0.511	0.18
109_L	547_A	0.511	0.18
104_L	487_N	0.511	0.18
542_K	587_N	0.510	0.18
620_D	624_L	0.510	0.18
320_L	659_T	0.510	0.18
337_R	575_H	0.510	0.18
204_Q	235_E	0.509	0.18
290_K	640_K	0.509	0.18
300_L	317_L	0.509	0.18
570_E	621_A	0.509	0.18
239_T	276_I	0.508	0.18
377_L	605_V	0.508	0.18
272_K	294_D	0.508	0.18
335_R	480_V	0.507	0.18
444_V	571_L	0.507	0.18
71_F	114_D	0.507	0.18
234_T	509_Q	0.507	0.18
570_E	604_I	0.507	0.18
112_F	227_N	0.506	0.18
631_F	635_G	0.506	0.18
290_K	357_V	0.506	0.18
378_Q	437_F	0.505	0.18
472_E	532_T	0.505	0.18
484_R	506_Y	0.505	0.18
442_L	548_L	0.505	0.18
176_S	319_I	0.505	0.18
376_Q	380_L	0.504	0.18
135_E	382_K	0.504	0.18
421_D	654_P	0.504	0.18
341_E	444_V	0.504	0.18
145_T	468_L	0.503	0.18
454_S	466_R	0.502	0.18
274_K	430_S	0.502	0.18
268_G	340_L	0.502	0.18
83_N	156_P	0.502	0.18
217_A	310_P	0.501	0.18
90_V	118_L	0.501	0.18
632_K	635_G	0.501	0.18
139_D	151_S	0.501	0.18
478_G	519_T	0.500	0.18

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4ql6A	2	0.673	100	0.451	Contact Map
1fc6A	1	0.544	100	0.698	Contact Map
4c2eA	2	0.5997	100	0.707	Contact Map
3k50A	1	0.5073	100	0.713	Contact Map
4lurA	1	0.4311	100	0.746	Contact Map
1k32A	5	0.6906	100	0.756	Contact Map
4ghnA	1	0.5367	100	0.759	Contact Map
3dorA	2	0.5455	100	0.761	Contact Map
1j7xA	1	0.4223	100	0.779	Contact Map
4l8kA	3	0.4428	100	0.81	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0157 seconds.