CATE - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

CATE - Catalase HPII

UniProt:	P21179	Sequences: MSQHNEKNPHQHQSPLHDSSEAKPGMDSLAPEDGSHRPAAEPTPPGAQPTAPGSLKAPDTRNEKLNSLEDVRKGSENYALTTNQGVRIADDQNSLRAGSRGPTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGSAAHGYFQPYKSLSDITKADFLSDPNKITPVFVRFSTVQGGAGSADTVRDIRGFATKFYTEEGIFDLVGNNTPIFFIQDAHKFPDFVHAVKPEPHWAIPQGQSAHDTFWDYVSLQPETLHNVMWAMSDRGIPRSYRTMEGFGIHTFRLINAEGKATFVRFHWKPLAGKASLVWDEAQKLTGRDPDFHRRELWEAIEAGDFPEYELGFQLIPEEDEFKFDFDLLDPTKLIPEELVPVQRVGKMVLNRNPDNFFAENEQAAFHPGHIVPGLDFTNDPLLQGRLFSYTDTQISRLGGPNFHEIPINRPTCPYHNFQRDGMHRMGIDTNPANYEPNSINDNWPRETPPGPKRGGFESYQERVEGNKVRERSPSFGEYYSHPRLFWLSQTPFEQRHIVDGFSFELSKVVRPYIRERVVDQLAHIDLTLAQAVAKNLGIELTDDQLNITPPPDVNGLKKDPSLSLYAIPDGDVKGRVVAILLNDEVRSADLLAILKALKAKGVHAKLLYSRMGEVTADDGTVLPIAATFAGAPSLTVDAVIVPCGNIADIADNGDANYYLMEAYKHLKPIALAGDARKFKATIKIADQGEEGIVEADSADGSFMDELLTLMAAHRVWSRIPKIDKIPA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10509
Length:	753 (677)
Sequences:	1158 (666)
Seq/√Len:	25.6

ECOLI - CATE
BACSU - CATE CATA CATX

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
515_Q	523_I	6.194	1.00
211_A	410_G	5.011	1.00
338_F	370_V	4.977	1.00
337_G	367_V	4.808	1.00
430_E	450_R	4.799	1.00
221_V	234_S	4.503	1.00
287_T	340_L	4.502	1.00
528_S	561_N	4.485	1.00
94_S	103_T	4.387	1.00
279_L	338_F	4.176	1.00
137_Y	374_V	3.917	1.00
158_K	192_E	3.711	1.00
421_S	448_M	3.706	1.00
139_Q	159_I	3.687	1.00
142_K	368_Q	3.572	1.00
314_D	320_R	3.565	1.00
144_L	370_V	3.522	1.00
176_A	179_V	3.480	1.00
152_F	196_F	3.334	1.00
250_L	550_I	3.333	1.00
141_Y	335_E	3.316	1.00
178_T	302_L	3.292	1.00
341_I	360_I	3.214	1.00
170_Q	221_V	3.207	1.00
151_D	192_E	3.121	1.00
140_P	156_P	3.102	1.00
147_I	340_L	3.087	1.00
178_T	311_T	3.080	1.00
527_F	550_I	3.064	1.00
90_D	93_N	3.038	1.00
345_D	348_K	2.963	1.00
132_S	382_F	2.942	1.00
393_P	412_L	2.940	1.00
603_V	623_L	2.919	1.00
139_Q	157_N	2.820	1.00
268_T	297_A	2.805	1.00
170_Q	232_G	2.766	0.99
250_L	546_Q	2.761	0.99
293_W	373_M	2.742	0.99
252_N	508_P	2.691	0.99
532_S	656_G	2.691	0.99
524_V	557_A	2.676	0.99
137_Y	159_I	2.608	0.99
137_Y	376_N	2.548	0.99
503_E	506_S	2.534	0.99
281_N	285_K	2.521	0.99
176_A	311_T	2.508	0.99
146_D	368_Q	2.506	0.99
110_L	114_I	2.486	0.99
270_E	294_K	2.425	0.99
159_I	376_N	2.414	0.99
135_H	433_I	2.387	0.98
607_L	640_V	2.357	0.98
141_Y	372_K	2.334	0.98
310_L	661_T	2.317	0.98
262_I	307_A	2.316	0.98
396_I	482_F	2.311	0.98
234_S	256_A	2.301	0.98
512_W	524_V	2.219	0.97
296_L	335_E	2.190	0.97
517_P	520_Q	2.153	0.97
172_G	231_Q	2.134	0.97
218_V	221_V	2.109	0.97
694_P	741_V	2.101	0.96
450_R	454_D	2.097	0.96
238_T	459_N	2.096	0.96
287_T	342_P	2.090	0.96
431_I	449_H	2.081	0.96
153_L	196_F	2.080	0.96
465_I	539_I	2.071	0.96
294_K	367_V	2.062	0.96
162_V	189_F	2.061	0.96
335_E	372_K	2.054	0.96
401_D	482_F	2.028	0.96
82_T	109_I	1.999	0.95
333_E	372_K	1.985	0.95
162_V	373_M	1.973	0.95
172_G	223_P	1.972	0.95
293_W	336_L	1.951	0.95
430_E	454_D	1.944	0.94
187_T	373_M	1.936	0.94
632_L	648_L	1.935	0.94
586_P	592_A	1.926	0.94
631_K	662_V	1.924	0.94
512_W	515_Q	1.904	0.94
333_E	374_V	1.898	0.94
420_I	448_M	1.894	0.94
425_G	449_H	1.879	0.93
94_S	110_L	1.878	0.93
143_S	154_S	1.865	0.93
548_A	552_L	1.856	0.93
343_E	347_F	1.853	0.93
203_T	256_A	1.852	0.93
226_H	457_P	1.837	0.93
337_G	369_R	1.810	0.92
341_I	353_L	1.805	0.92
267_R	325_A	1.805	0.92
664_A	736_M	1.803	0.92
141_Y	369_R	1.803	0.92
639_E	650_I	1.802	0.92
179_V	302_L	1.795	0.92
363_E	585_D	1.789	0.92
84_Q	429_H	1.768	0.91
133_A	164_V	1.764	0.91
140_P	143_S	1.760	0.91
250_L	508_P	1.752	0.91
182_I	203_T	1.731	0.90
512_W	523_I	1.731	0.90
253_V	527_F	1.727	0.90
202_N	261_G	1.725	0.90
537_P	541_E	1.694	0.89
203_T	252_N	1.686	0.89
91_D	461_E	1.681	0.89
516_T	592_A	1.681	0.89
697_L	701_A	1.680	0.89
139_Q	155_D	1.680	0.89
162_V	187_T	1.678	0.89
99_S	496_E	1.675	0.89
296_L	374_V	1.668	0.88
141_Y	156_P	1.655	0.88
279_L	370_V	1.634	0.87
623_L	628_V	1.633	0.87
469_W	472_E	1.632	0.87
105_L	110_L	1.620	0.87
278_R	286_A	1.619	0.87
560_K	636_R	1.618	0.87
132_S	379_P	1.613	0.87
652_A	662_V	1.590	0.86
521_R	524_V	1.588	0.86
513_L	520_Q	1.577	0.85
243_V	253_V	1.574	0.85
465_I	536_R	1.571	0.85
509_R	513_L	1.564	0.85
250_L	543_V	1.555	0.84
170_Q	218_V	1.555	0.84
521_R	525_D	1.552	0.84
182_I	252_N	1.550	0.84
296_L	372_K	1.545	0.84
250_L	527_F	1.543	0.84
155_D	158_K	1.538	0.84
144_L	279_L	1.537	0.84
67_S	71_V	1.537	0.84
537_P	649_P	1.534	0.84
604_A	633_L	1.532	0.84
83_N	444_Q	1.530	0.83
151_D	155_D	1.526	0.83
126_I	421_S	1.522	0.83
196_F	393_P	1.512	0.83
310_L	660_L	1.508	0.83
243_V	249_T	1.506	0.82
145_S	154_S	1.503	0.82
154_S	279_L	1.497	0.82
302_L	310_L	1.487	0.82
148_T	153_L	1.486	0.82
603_V	736_M	1.485	0.82
64_K	68_L	1.481	0.81
244_S	543_V	1.478	0.81
132_S	266_Y	1.464	0.81
83_N	429_H	1.457	0.80
254_M	527_F	1.455	0.80
64_K	67_S	1.454	0.80
126_I	233_Q	1.454	0.80
612_R	643_D	1.446	0.80
322_L	332_P	1.442	0.80
607_L	632_L	1.440	0.79
396_I	402_F	1.439	0.79
245_L	464_S	1.431	0.79
598_V	628_V	1.425	0.79
308_Q	313_R	1.424	0.79
664_A	732_L	1.423	0.79
134_A	322_L	1.420	0.78
189_F	198_L	1.418	0.78
605_I	630_A	1.417	0.78
88_I	109_I	1.406	0.78
638_G	650_I	1.405	0.78
335_E	369_R	1.403	0.78
604_A	665_V	1.401	0.78
299_K	590_L	1.399	0.77
187_T	293_W	1.385	0.77
611_V	616_L	1.382	0.77
144_L	338_F	1.375	0.76
620_L	651_A	1.370	0.76
396_I	400_L	1.363	0.76
245_L	542_R	1.354	0.75
233_Q	315_P	1.354	0.75
395_H	429_H	1.351	0.75
69_E	72_R	1.349	0.75
140_P	155_D	1.347	0.75
270_E	369_R	1.346	0.75
606_L	675_I	1.346	0.75
448_M	451_M	1.343	0.74
275_H	403_T	1.336	0.74
139_Q	156_P	1.334	0.74
297_A	325_A	1.333	0.74
249_T	252_N	1.331	0.74
79_A	87_R	1.330	0.74
666_I	698_A	1.320	0.73
292_H	367_V	1.317	0.73
425_G	448_M	1.315	0.73
613_S	644_D	1.309	0.72
256_A	261_G	1.307	0.72
285_K	344_E	1.305	0.72
164_V	187_T	1.300	0.72
296_L	333_E	1.299	0.72
203_T	318_H	1.298	0.72
172_G	228_A	1.298	0.72
147_I	368_Q	1.296	0.72
421_S	449_H	1.291	0.71
683_Y	687_E	1.287	0.71
286_A	486_Q	1.283	0.71
430_E	452_G	1.283	0.71
139_Q	372_K	1.270	0.70
301_S	590_L	1.269	0.70
252_N	274_I	1.265	0.70
325_A	332_P	1.259	0.69
195_I	436_P	1.257	0.69
641_T	647_V	1.254	0.69
602_V	631_K	1.252	0.69
547_L	558_V	1.251	0.69
431_I	448_M	1.251	0.69
692_L	745_I	1.250	0.69
296_L	334_Y	1.243	0.68
262_I	303_V	1.241	0.68
144_L	147_I	1.237	0.68
694_P	736_M	1.236	0.68
327_E	378_N	1.236	0.68
531_L	562_L	1.230	0.68
470_P	473_T	1.228	0.68
697_L	705_K	1.228	0.68
544_V	564_I	1.223	0.67
717_G	741_V	1.222	0.67
244_S	542_R	1.214	0.67
546_Q	550_I	1.213	0.67
469_W	473_T	1.210	0.66
145_S	282_A	1.209	0.66
170_Q	231_Q	1.206	0.66
151_D	158_K	1.197	0.65
243_V	527_F	1.197	0.65
92_Q	461_E	1.189	0.65
679_G	683_Y	1.189	0.65
473_T	476_G	1.189	0.65
218_V	256_A	1.187	0.65
203_T	290_R	1.187	0.65
505_Y	546_Q	1.186	0.65
109_I	484_S	1.185	0.65
83_N	442_N	1.182	0.64
144_L	340_L	1.178	0.64
161_P	437_T	1.174	0.64
140_P	154_S	1.171	0.64
114_I	119_H	1.166	0.63
631_K	652_A	1.161	0.63
619_I	666_I	1.146	0.62
243_V	543_V	1.137	0.61
323_W	386_N	1.134	0.61
331_F	376_N	1.133	0.61
141_Y	338_F	1.132	0.61
79_A	473_T	1.131	0.61
111_R	119_H	1.129	0.61
179_V	311_T	1.127	0.61
159_I	374_V	1.125	0.61
170_Q	233_Q	1.122	0.60
537_P	540_R	1.120	0.60
119_H	421_S	1.118	0.60
135_H	385_E	1.115	0.60
254_M	523_I	1.113	0.60
151_D	154_S	1.110	0.60
288_F	403_T	1.108	0.59
556_Q	560_K	1.106	0.59
268_T	600_G	1.098	0.59
302_L	311_T	1.095	0.58
613_S	643_D	1.094	0.58
616_L	648_L	1.093	0.58
283_E	344_E	1.092	0.58
364_L	583_K	1.087	0.58
97_A	489_V	1.086	0.58
612_R	615_D	1.086	0.58
115_T	119_H	1.084	0.58
518_F	591_Y	1.082	0.58
262_I	318_H	1.081	0.57
642_A	646_T	1.073	0.57
249_T	508_P	1.072	0.57
296_L	369_R	1.070	0.57
267_R	600_G	1.067	0.56
229_I	233_Q	1.064	0.56
520_Q	553_T	1.055	0.56
620_L	624_K	1.052	0.55
613_S	642_A	1.052	0.55
106_E	493_K	1.046	0.55
133_A	389_A	1.044	0.55
145_S	156_P	1.039	0.54
416_T	429_H	1.037	0.54
659_S	688_A	1.034	0.54
665_V	688_A	1.027	0.54
170_Q	257_M	1.026	0.53
65_L	72_R	1.026	0.53
274_I	393_P	1.024	0.53
250_L	253_V	1.023	0.53
342_P	345_D	1.021	0.53
552_L	556_Q	1.014	0.53
137_Y	372_K	1.011	0.52
401_D	484_S	1.011	0.52
86_V	108_F	1.010	0.52
294_K	369_R	1.004	0.52
114_I	359_L	1.003	0.52
71_V	435_R	1.002	0.52
259_D	522_H	1.001	0.52
83_N	116_H	1.001	0.52
238_T	445_R	1.000	0.52
196_F	412_L	0.996	0.51
494_V	498_S	0.994	0.51
395_H	416_T	0.994	0.51
667_V	685_L	0.993	0.51
425_G	431_I	0.993	0.51
176_A	302_L	0.989	0.51
621_K	625_A	0.986	0.51
353_L	360_I	0.986	0.51
83_N	395_H	0.985	0.50
133_A	451_M	0.983	0.50
166_F	269_M	0.983	0.50
97_A	104_L	0.979	0.50
420_I	425_G	0.976	0.50
601_R	739_H	0.975	0.50
616_L	632_L	0.974	0.50
114_I	421_S	0.971	0.49
164_V	293_W	0.969	0.49
154_S	158_K	0.968	0.49
126_I	429_H	0.968	0.49
173_A	228_A	0.967	0.49
229_I	324_E	0.966	0.49
274_I	290_R	0.966	0.49
543_V	546_Q	0.964	0.49
458_A	466_N	0.963	0.49
536_R	539_I	0.963	0.49
620_L	630_A	0.958	0.48
311_T	315_P	0.956	0.48
611_V	642_A	0.955	0.48
538_Y	541_E	0.953	0.48
421_S	425_G	0.953	0.48
679_G	690_K	0.953	0.48
68_L	71_V	0.952	0.48
257_M	547_L	0.951	0.48
115_T	428_F	0.949	0.48
198_L	400_L	0.948	0.48
221_V	256_A	0.944	0.47
487_E	493_K	0.941	0.47
132_S	378_N	0.941	0.47
270_E	295_P	0.940	0.47
103_T	106_E	0.939	0.47
623_L	736_M	0.938	0.47
420_I	426_P	0.937	0.47
268_T	300_A	0.934	0.47
149_K	398_P	0.932	0.47
604_A	668_P	0.932	0.47
438_C	469_W	0.932	0.47
87_R	483_E	0.930	0.46
67_S	70_D	0.929	0.46
307_A	318_H	0.926	0.46
246_Q	249_T	0.923	0.46
702_R	720_E	0.919	0.46
372_K	376_N	0.913	0.45
68_L	72_R	0.909	0.45
293_W	335_E	0.909	0.45
598_V	603_V	0.905	0.45
309_K	313_R	0.904	0.45
346_E	353_L	0.904	0.45
513_L	584_K	0.903	0.44
80_L	91_D	0.902	0.44
186_A	196_F	0.902	0.44
523_I	527_F	0.899	0.44
179_V	232_G	0.895	0.44
267_R	297_A	0.893	0.44
84_Q	392_H	0.893	0.44
321_E	325_A	0.889	0.43
622_A	733_L	0.888	0.43
252_N	290_R	0.888	0.43
641_T	645_G	0.887	0.43
238_T	465_I	0.887	0.43
544_V	555_A	0.886	0.43
221_V	233_Q	0.886	0.43
140_P	157_N	0.884	0.43
244_S	360_I	0.883	0.43
178_T	310_L	0.883	0.43
608_N	669_C	0.878	0.43
685_L	710_I	0.877	0.43
203_T	217_F	0.876	0.43
430_E	451_M	0.873	0.42
598_V	736_M	0.871	0.42
133_A	386_N	0.870	0.42
91_D	109_I	0.869	0.42
395_H	421_S	0.866	0.42
198_L	293_W	0.865	0.42
550_I	558_V	0.864	0.42
170_Q	256_A	0.864	0.42
257_M	527_F	0.864	0.42
521_R	745_I	0.863	0.42
652_A	657_A	0.857	0.41
612_R	644_D	0.855	0.41
264_R	268_T	0.853	0.41
115_T	152_F	0.851	0.41
176_A	315_P	0.850	0.41
297_A	600_G	0.848	0.41
544_V	562_L	0.844	0.40
667_V	681_A	0.843	0.40
151_D	370_V	0.843	0.40
616_L	640_V	0.842	0.40
276_T	403_T	0.841	0.40
297_A	300_A	0.839	0.40
140_P	145_S	0.838	0.40
344_E	348_K	0.835	0.40
84_Q	428_F	0.835	0.40
294_K	593_I	0.833	0.39
148_T	152_F	0.833	0.39
211_A	251_H	0.832	0.39
667_V	701_A	0.832	0.39
553_T	557_A	0.832	0.39
642_A	648_L	0.831	0.39
687_E	739_H	0.830	0.39
182_I	218_V	0.830	0.39
217_F	232_G	0.825	0.39
353_L	403_T	0.825	0.39
628_V	733_L	0.824	0.39
143_S	335_E	0.824	0.39
89_A	481_G	0.822	0.39
688_A	695_I	0.822	0.39
382_F	431_I	0.822	0.39
132_S	323_W	0.821	0.39
342_P	353_L	0.820	0.39
626_K	737_A	0.819	0.38
148_T	279_L	0.818	0.38
93_N	497_R	0.817	0.38
317_F	602_V	0.816	0.38
139_Q	374_V	0.815	0.38
697_L	702_R	0.813	0.38
143_S	146_D	0.811	0.38
166_F	266_Y	0.805	0.38
247_P	504_Y	0.803	0.37
144_L	151_D	0.802	0.37
512_W	553_T	0.800	0.37
144_L	154_S	0.799	0.37
148_T	196_F	0.798	0.37
254_M	508_P	0.796	0.37
74_G	455_T	0.796	0.37
392_H	416_T	0.795	0.37
126_I	393_P	0.795	0.37
170_Q	217_F	0.793	0.37
243_V	550_I	0.792	0.37
132_S	173_A	0.792	0.37
115_T	426_P	0.788	0.36
689_Y	696_A	0.787	0.36
112_E	198_L	0.785	0.36
114_I	395_H	0.783	0.36
539_I	700_D	0.783	0.36
504_Y	508_P	0.782	0.36
266_Y	359_L	0.779	0.36
467_D	471_R	0.778	0.36
251_H	359_L	0.778	0.36
632_L	640_V	0.777	0.36
83_N	112_E	0.777	0.36
105_L	488_R	0.775	0.35
86_V	395_H	0.772	0.35
179_V	318_H	0.772	0.35
294_K	337_G	0.772	0.35
509_R	579_V	0.771	0.35
702_R	722_D	0.771	0.35
364_L	562_L	0.771	0.35
265_S	268_T	0.768	0.35
672_I	676_A	0.767	0.35
703_K	706_A	0.766	0.35
553_T	556_Q	0.766	0.35
590_L	687_E	0.765	0.35
633_L	657_A	0.762	0.35
177_D	382_F	0.761	0.35
132_S	229_I	0.761	0.35
631_K	651_A	0.760	0.34
196_F	392_H	0.760	0.34
87_R	485_Y	0.757	0.34
217_F	221_V	0.756	0.34
347_F	350_D	0.756	0.34
170_Q	234_S	0.755	0.34
541_E	544_V	0.754	0.34
59_D	63_E	0.754	0.34
179_V	233_Q	0.753	0.34
217_F	253_V	0.752	0.34
312_G	315_P	0.752	0.34
265_S	321_E	0.752	0.34
140_P	148_T	0.751	0.34
670_G	699_G	0.751	0.34
515_Q	588_L	0.750	0.34
80_L	212_H	0.749	0.34
149_K	193_E	0.749	0.34
431_I	451_M	0.749	0.34
639_E	649_P	0.749	0.34
657_A	662_V	0.749	0.34
380_D	455_T	0.747	0.34
68_L	453_I	0.747	0.34
94_S	303_V	0.747	0.34
512_W	584_K	0.747	0.34
193_E	480_G	0.747	0.34
516_T	520_Q	0.744	0.33
140_P	144_L	0.744	0.33
121_R	446_D	0.743	0.33
689_Y	697_L	0.742	0.33
682_N	686_M	0.741	0.33
242_Y	526_G	0.740	0.33
272_F	292_H	0.740	0.33
458_A	465_I	0.740	0.33
164_V	274_I	0.740	0.33
719_V	735_L	0.739	0.33
705_K	708_I	0.739	0.33
468_N	471_R	0.738	0.33
367_V	593_I	0.738	0.33
226_H	232_G	0.737	0.33
686_M	690_K	0.736	0.33
327_E	331_F	0.736	0.33
247_P	505_Y	0.736	0.33
521_R	557_A	0.733	0.33
694_P	735_L	0.732	0.33
196_F	396_I	0.731	0.33
168_T	175_S	0.729	0.32
202_N	504_Y	0.728	0.32
154_S	192_E	0.727	0.32
195_I	395_H	0.726	0.32
239_F	253_V	0.725	0.32
244_S	539_I	0.725	0.32
144_L	148_T	0.724	0.32
141_Y	296_L	0.724	0.32
296_L	599_K	0.718	0.32
696_A	733_L	0.718	0.32
541_E	545_D	0.717	0.32
133_A	382_F	0.715	0.32
283_E	703_K	0.714	0.31
247_P	546_Q	0.714	0.31
606_L	667_V	0.712	0.31
360_I	564_I	0.711	0.31
597_D	605_I	0.711	0.31
721_A	728_F	0.710	0.31
233_Q	311_T	0.709	0.31
535_V	652_A	0.709	0.31
153_L	158_K	0.708	0.31
590_L	739_H	0.707	0.31
68_L	73_K	0.707	0.31
182_I	628_V	0.706	0.31
140_P	152_F	0.706	0.31
665_V	695_I	0.706	0.31
62_N	65_L	0.706	0.31
217_F	246_Q	0.705	0.31
84_Q	426_P	0.702	0.31
155_D	192_E	0.701	0.31
412_L	416_T	0.701	0.31
187_T	612_R	0.700	0.31
147_I	287_T	0.700	0.31
445_R	459_N	0.699	0.31
164_V	266_Y	0.699	0.31
666_I	736_M	0.699	0.31
608_N	674_D	0.696	0.30
106_E	503_E	0.695	0.30
202_N	207_F	0.695	0.30
103_T	410_G	0.694	0.30
202_N	269_M	0.694	0.30
297_A	332_P	0.693	0.30
621_K	724_A	0.692	0.30
243_V	261_G	0.691	0.30
286_A	485_Y	0.688	0.30
544_V	566_L	0.688	0.30
392_H	451_M	0.687	0.30
696_A	728_F	0.687	0.30
187_T	198_L	0.687	0.30
275_H	588_L	0.685	0.30
394_G	412_L	0.684	0.30
698_A	701_A	0.684	0.30
510_L	513_L	0.684	0.30
102_P	489_V	0.684	0.30
220_A	262_I	0.684	0.30
615_D	668_P	0.683	0.30
604_A	681_A	0.683	0.30
517_P	521_R	0.683	0.30
730_D	734_T	0.682	0.29
254_M	550_I	0.682	0.29
172_G	232_G	0.680	0.29
532_S	657_A	0.679	0.29
393_P	408_L	0.679	0.29
178_T	603_V	0.679	0.29
683_Y	690_K	0.678	0.29
86_V	482_F	0.676	0.29
505_Y	548_A	0.675	0.29
518_F	742_W	0.674	0.29
341_I	346_E	0.673	0.29
457_P	535_V	0.673	0.29
607_L	671_N	0.672	0.29
431_I	682_N	0.670	0.29
619_I	623_L	0.670	0.29
667_V	671_N	0.670	0.29
342_P	346_E	0.669	0.29
716_E	743_S	0.669	0.29
92_Q	484_S	0.669	0.29
532_S	653_T	0.667	0.29
420_I	449_H	0.667	0.29
323_W	378_N	0.667	0.29
403_T	494_V	0.666	0.29
515_Q	590_L	0.663	0.28
731_E	734_T	0.662	0.28
669_C	700_D	0.661	0.28
140_P	370_V	0.661	0.28
330_D	599_K	0.661	0.28
115_T	196_F	0.660	0.28
182_I	290_R	0.660	0.28
527_F	547_L	0.659	0.28
115_T	416_T	0.658	0.28
308_Q	311_T	0.658	0.28
87_R	480_G	0.658	0.28
334_Y	372_K	0.658	0.28
431_I	642_A	0.657	0.28
606_L	685_L	0.656	0.28
187_T	218_V	0.656	0.28
730_D	737_A	0.656	0.28
233_Q	314_D	0.655	0.28
341_I	345_D	0.653	0.28
203_T	508_P	0.653	0.28
140_P	279_L	0.652	0.28
701_A	738_A	0.652	0.28
152_F	412_L	0.652	0.28
262_I	310_L	0.651	0.28
238_T	412_L	0.650	0.28
137_Y	335_E	0.650	0.28
634_Y	740_R	0.650	0.28
172_G	221_V	0.649	0.28
115_T	429_H	0.648	0.27
512_W	520_Q	0.647	0.27
220_A	565_E	0.646	0.27
65_L	68_L	0.646	0.27
64_K	341_I	0.645	0.27
322_L	325_A	0.643	0.27
330_D	629_H	0.642	0.27
631_K	661_T	0.642	0.27
114_I	218_V	0.641	0.27
488_R	498_S	0.641	0.27
457_P	465_I	0.640	0.27
673_A	703_K	0.640	0.27
395_H	410_G	0.638	0.27
116_H	238_T	0.638	0.27
718_I	741_V	0.637	0.27
639_E	689_Y	0.637	0.27
142_K	156_P	0.637	0.27
261_G	504_Y	0.637	0.27
468_N	473_T	0.636	0.27
280_I	401_D	0.635	0.27
126_I	256_A	0.635	0.27
532_S	637_M	0.634	0.27
177_D	431_I	0.634	0.27
689_Y	694_P	0.632	0.27
108_F	402_F	0.632	0.27
613_S	646_T	0.632	0.27
133_A	282_A	0.631	0.26
67_S	437_T	0.631	0.26
397_V	403_T	0.631	0.26
274_I	508_P	0.630	0.26
624_K	630_A	0.630	0.26
182_I	508_P	0.630	0.26
312_G	660_L	0.629	0.26
617_L	695_I	0.628	0.26
182_I	221_V	0.627	0.26
152_F	397_V	0.627	0.26
706_A	711_A	0.627	0.26
286_A	604_A	0.625	0.26
173_A	223_P	0.625	0.26
685_L	701_A	0.625	0.26
83_N	91_D	0.623	0.26
196_F	394_G	0.622	0.26
244_S	379_P	0.621	0.26
328_A	629_H	0.620	0.26
464_S	539_I	0.620	0.26
685_L	688_A	0.619	0.26
681_A	688_A	0.618	0.26
369_R	372_K	0.617	0.26
278_R	485_Y	0.617	0.26
179_V	256_A	0.616	0.26
251_H	255_W	0.616	0.26
317_F	394_G	0.615	0.26
356_P	503_E	0.615	0.26
89_A	484_S	0.614	0.26
233_Q	534_V	0.614	0.26
695_I	718_I	0.613	0.25
512_W	694_P	0.613	0.25
233_Q	310_L	0.612	0.25
540_R	637_M	0.611	0.25
249_T	523_I	0.611	0.25
141_Y	155_D	0.611	0.25
161_P	433_I	0.610	0.25
153_L	338_F	0.610	0.25
626_K	733_L	0.610	0.25
249_T	359_L	0.609	0.25
115_T	395_H	0.609	0.25
217_F	234_S	0.608	0.25
667_V	674_D	0.607	0.25
201_N	290_R	0.606	0.25
655_A	680_D	0.606	0.25
266_Y	393_P	0.606	0.25
666_I	696_A	0.606	0.25
579_V	582_L	0.606	0.25
701_A	721_A	0.605	0.25
250_L	254_M	0.605	0.25
228_A	446_D	0.605	0.25
643_D	646_T	0.605	0.25
288_F	346_E	0.605	0.25
115_T	392_H	0.603	0.25
262_I	539_I	0.602	0.25
338_F	701_A	0.601	0.25
544_V	552_L	0.601	0.25
228_A	308_Q	0.601	0.25
80_L	132_S	0.601	0.25
382_F	386_N	0.601	0.25
603_V	630_A	0.600	0.25
675_I	681_A	0.599	0.25
60_T	63_E	0.599	0.25
687_E	715_E	0.599	0.25
615_D	669_C	0.598	0.25
84_Q	112_E	0.598	0.25
539_I	582_L	0.597	0.25
226_H	324_E	0.597	0.25
264_R	297_A	0.596	0.25
151_D	193_E	0.596	0.25
278_R	401_D	0.596	0.25
88_I	472_E	0.596	0.25
82_T	88_I	0.595	0.24
617_L	621_K	0.595	0.24
91_D	110_L	0.595	0.24
133_A	675_I	0.594	0.24
149_K	282_A	0.594	0.24
256_A	527_F	0.593	0.24
666_I	732_L	0.592	0.24
565_E	710_I	0.591	0.24
340_L	368_Q	0.591	0.24
538_Y	542_R	0.590	0.24
145_S	710_I	0.590	0.24
305_D	309_K	0.590	0.24
243_V	250_L	0.590	0.24
438_C	692_L	0.589	0.24
270_E	367_V	0.589	0.24
323_W	382_F	0.588	0.24
692_L	741_V	0.587	0.24
340_L	707_T	0.587	0.24
211_A	451_M	0.587	0.24
477_P	483_E	0.587	0.24
140_P	369_R	0.587	0.24
392_H	395_H	0.586	0.24
212_H	218_V	0.586	0.24
211_A	395_H	0.585	0.24
590_L	593_I	0.585	0.24
141_Y	144_L	0.585	0.24
336_L	373_M	0.584	0.24
203_T	262_I	0.584	0.24
379_P	468_N	0.582	0.24
509_R	582_L	0.582	0.24
686_M	708_I	0.582	0.24
679_G	686_M	0.580	0.24
477_P	480_G	0.580	0.24
672_I	675_I	0.579	0.24
92_Q	658_P	0.579	0.24
437_T	600_G	0.578	0.24
630_A	640_V	0.578	0.24
142_K	154_S	0.578	0.24
115_T	473_T	0.578	0.24
480_G	498_S	0.578	0.24
234_S	257_M	0.578	0.24
523_I	539_I	0.578	0.24
110_L	412_L	0.577	0.24
512_W	557_A	0.577	0.24
103_T	409_Q	0.576	0.23
63_E	66_N	0.576	0.23
611_V	668_P	0.576	0.23
114_I	534_V	0.576	0.23
634_Y	650_I	0.576	0.23
128_H	169_V	0.575	0.23
64_K	71_V	0.575	0.23
544_V	548_A	0.574	0.23
105_L	114_I	0.574	0.23
347_F	404_N	0.573	0.23
450_R	453_I	0.573	0.23
133_A	303_V	0.573	0.23
270_E	679_G	0.573	0.23
548_A	570_Q	0.572	0.23
431_I	718_I	0.572	0.23
62_N	66_N	0.572	0.23
73_K	78_Y	0.572	0.23
161_P	374_V	0.572	0.23
624_K	627_G	0.571	0.23
288_F	343_E	0.571	0.23
445_R	454_D	0.571	0.23
267_R	321_E	0.570	0.23
513_L	583_K	0.570	0.23
177_D	325_A	0.570	0.23
601_R	659_S	0.570	0.23
443_F	459_N	0.570	0.23
266_Y	334_Y	0.569	0.23
662_V	689_Y	0.569	0.23
607_L	616_L	0.569	0.23
196_F	279_L	0.569	0.23
187_T	622_A	0.568	0.23
603_V	620_L	0.568	0.23
623_L	630_A	0.567	0.23
325_A	600_G	0.567	0.23
173_A	311_T	0.567	0.23
539_I	737_A	0.566	0.23
701_A	708_I	0.566	0.23
106_E	484_S	0.565	0.23
162_V	198_L	0.565	0.23
372_K	539_I	0.565	0.23
696_A	718_I	0.565	0.23
549_H	570_Q	0.564	0.23
237_D	535_V	0.564	0.23
278_R	426_P	0.564	0.23
639_E	647_V	0.564	0.23
440_Y	467_D	0.563	0.23
240_W	543_V	0.562	0.23
404_N	494_V	0.562	0.23
103_T	108_F	0.562	0.23
244_S	538_Y	0.561	0.23
157_N	618_A	0.559	0.23
147_I	338_F	0.559	0.23
196_F	447_G	0.559	0.23
687_E	694_P	0.559	0.23
305_D	683_Y	0.558	0.23
548_A	567_T	0.557	0.22
159_I	372_K	0.557	0.22
696_A	736_M	0.557	0.22
172_G	218_V	0.557	0.22
324_E	662_V	0.556	0.22
286_A	315_P	0.556	0.22
346_E	497_R	0.555	0.22
249_T	723_S	0.555	0.22
546_Q	549_H	0.554	0.22
247_P	665_V	0.554	0.22
146_D	359_L	0.554	0.22
350_D	583_K	0.554	0.22
62_N	135_H	0.553	0.22
302_L	741_V	0.553	0.22
611_V	665_V	0.553	0.22
105_L	392_H	0.551	0.22
617_L	625_A	0.551	0.22
288_F	365_V	0.550	0.22
92_Q	472_E	0.550	0.22
532_S	650_I	0.550	0.22
277_F	403_T	0.549	0.22
133_A	391_F	0.549	0.22
288_F	360_I	0.549	0.22
259_D	262_I	0.548	0.22
313_R	658_P	0.548	0.22
503_E	544_V	0.548	0.22
105_L	126_I	0.548	0.22
461_E	658_P	0.547	0.22
186_A	676_A	0.547	0.22
353_L	458_A	0.546	0.22
619_I	729_M	0.546	0.22
672_I	704_F	0.546	0.22
440_Y	452_G	0.546	0.22
285_K	342_P	0.546	0.22
238_T	404_N	0.546	0.22
262_I	657_A	0.545	0.22
416_T	436_P	0.545	0.22
233_Q	308_Q	0.545	0.22
300_A	590_L	0.544	0.22
111_R	114_I	0.544	0.22
152_F	156_P	0.543	0.22
119_H	420_I	0.543	0.22
438_C	459_N	0.543	0.22
377_R	380_D	0.542	0.22
404_N	489_V	0.541	0.22
321_E	332_P	0.541	0.22
632_L	650_I	0.540	0.22
392_H	500_S	0.540	0.22
610_E	670_G	0.540	0.22
602_V	694_P	0.539	0.22
379_P	382_F	0.539	0.22
246_Q	462_P	0.539	0.22
362_E	367_V	0.539	0.22
381_N	384_A	0.537	0.21
622_A	626_K	0.536	0.21
273_G	290_R	0.535	0.21
70_D	73_K	0.535	0.21
441_H	689_Y	0.535	0.21
544_V	705_K	0.535	0.21
238_T	456_N	0.534	0.21
382_F	389_A	0.534	0.21
300_A	656_G	0.534	0.21
148_T	254_M	0.533	0.21
179_V	217_F	0.532	0.21
278_R	420_I	0.532	0.21
484_S	487_E	0.532	0.21
395_H	420_I	0.532	0.21
350_D	404_N	0.532	0.21
229_I	437_T	0.531	0.21
268_T	325_A	0.531	0.21
112_E	119_H	0.531	0.21
609_D	636_R	0.531	0.21
682_N	708_I	0.530	0.21
445_R	450_R	0.530	0.21
423_L	431_I	0.530	0.21
97_A	676_A	0.530	0.21
199_V	207_F	0.530	0.21
568_D	722_D	0.529	0.21
458_A	469_W	0.529	0.21
534_V	539_I	0.529	0.21
403_T	505_Y	0.529	0.21
717_G	721_A	0.529	0.21
515_Q	527_F	0.528	0.21
91_D	246_Q	0.528	0.21
472_E	692_L	0.528	0.21
505_Y	590_L	0.528	0.21
350_D	364_L	0.527	0.21
429_H	444_Q	0.527	0.21
521_R	648_L	0.526	0.21
288_F	353_L	0.526	0.21
142_K	338_F	0.526	0.21
91_D	652_A	0.525	0.21
334_Y	373_M	0.525	0.21
345_D	443_F	0.525	0.21
64_K	69_E	0.525	0.21
114_I	431_I	0.525	0.21
202_N	208_I	0.525	0.21
86_V	374_V	0.525	0.21
203_T	458_A	0.525	0.21
506_S	708_I	0.524	0.21
196_F	408_L	0.524	0.21
164_V	296_L	0.523	0.21
672_I	701_A	0.523	0.21
91_D	484_S	0.522	0.21
614_A	625_A	0.522	0.21
91_D	658_P	0.522	0.21
111_R	412_L	0.521	0.21
182_I	256_A	0.521	0.21
239_F	259_D	0.521	0.21
443_F	470_P	0.521	0.21
147_I	279_L	0.521	0.21
193_E	397_V	0.520	0.21
516_T	593_I	0.520	0.21
225_P	458_A	0.520	0.21
109_I	395_H	0.520	0.21
220_A	734_T	0.519	0.21
112_E	213_K	0.519	0.21
461_E	472_E	0.519	0.21
234_S	652_A	0.519	0.21
93_N	247_P	0.518	0.21
70_D	647_V	0.517	0.20
153_L	340_L	0.517	0.20
297_A	599_K	0.517	0.20
199_V	208_I	0.517	0.20
367_V	587_S	0.516	0.20
173_A	382_F	0.516	0.20
154_S	282_A	0.516	0.20
356_P	500_S	0.516	0.20
621_K	706_A	0.515	0.20
201_N	207_F	0.515	0.20
143_S	372_K	0.515	0.20
473_T	483_E	0.515	0.20
244_S	558_V	0.514	0.20
622_A	730_D	0.514	0.20
669_C	699_G	0.514	0.20
425_G	527_F	0.514	0.20
186_A	359_L	0.514	0.20
367_V	554_L	0.514	0.20
118_D	414_S	0.514	0.20
540_R	660_L	0.513	0.20
729_M	733_L	0.513	0.20
694_P	725_D	0.512	0.20
229_I	382_F	0.512	0.20
115_T	421_S	0.512	0.20
261_G	508_P	0.512	0.20
149_K	281_N	0.511	0.20
377_R	609_D	0.511	0.20
92_Q	462_P	0.511	0.20
608_N	671_N	0.511	0.20
288_F	305_D	0.511	0.20
379_P	469_W	0.510	0.20
84_Q	88_I	0.510	0.20
256_A	318_H	0.510	0.20
213_K	314_D	0.510	0.20
360_I	611_V	0.510	0.20
324_E	328_A	0.509	0.20
512_W	645_G	0.509	0.20
201_N	414_S	0.509	0.20
276_T	463_N	0.509	0.20
513_L	581_G	0.508	0.20
500_S	587_S	0.508	0.20
443_F	458_A	0.508	0.20
359_L	588_L	0.507	0.20
257_M	528_S	0.507	0.20
140_P	158_K	0.507	0.20
105_L	111_R	0.506	0.20
369_R	373_M	0.506	0.20
218_V	527_F	0.506	0.20
484_S	495_R	0.506	0.20
115_T	153_L	0.506	0.20
211_A	513_L	0.505	0.20
632_L	668_P	0.505	0.20
74_G	343_E	0.505	0.20
599_K	627_G	0.505	0.20
605_I	626_K	0.505	0.20
217_F	243_V	0.504	0.20
90_D	462_P	0.504	0.20
539_I	690_K	0.504	0.20
318_H	325_A	0.504	0.20
378_N	442_N	0.504	0.20
149_K	685_L	0.503	0.20
305_D	380_D	0.503	0.20
445_R	453_I	0.503	0.20
183_R	531_L	0.503	0.20
328_A	644_D	0.503	0.20
135_H	412_L	0.502	0.20
706_A	712_D	0.502	0.20
188_K	239_F	0.502	0.20
268_T	334_Y	0.501	0.20
282_A	718_I	0.501	0.20
96_R	549_H	0.501	0.20
518_F	593_I	0.501	0.20
736_M	741_V	0.500	0.20
363_E	384_A	0.500	0.20

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3ttvA	4	0.9641	100	0.343	Contact Map
2iufA	4	0.8792	100	0.378	Contact Map
1sy7A	4	0.8805	100	0.38	Contact Map
4aumA	4	0.8831	100	0.387	Contact Map
4cabA	4	0.66	100	0.491	Contact Map
1gweA	4	0.6574	100	0.495	Contact Map
2j2mA	4	0.6361	100	0.496	Contact Map
2isaA	5	0.6388	100	0.498	Contact Map
1si8A	4	0.6295	100	0.498	Contact Map
1qwlA	4	0.6441	100	0.498	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0167 seconds.