DCOR - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

DCOR - Ornithine decarboxylase, constitutive

UniProt:	P21169	Sequences: MKSMNIAASSELVSRLSSHRRVVALGDTDFTDVAAVVITAADSRSGILALLKRTGFHLPVFLYSEHAVELPAGVTAVINGNEQQWLELESAACQYEENLLPPFYDTLTQYVEMGNSTFACPGHQHGAFFKKHPAGRHFYDFFGENVFRADMCNADVKLGDLLIHEGSAKDAQKFAAKVFHADKTYFVLNGTSAANKVVTNALLTRGDLVLFDRNNHKSNHHGALIQAGATPVYLEASRNPFGFIGGIDAHCFNEEYLRQQIRDVAPEKADLPRPYRLAIIQLGTYDGTVYNARQVIDTVGHLCDYILFDSAWVGYEQFIPMMADSSPLLLELNENDPGIFVTQSVHKQQAGFSQTSQIHKKDNHIRGQARFCPHKRLNNAFMLHASTSPFYPLFAALDVNAKIHEGESGRRLWAECVEIGIEARKAILARCKLFRPFIPPVVDGKLWQDYPTSVLASDRRFFSFEPGAKWHGFEGYAADQYFVDPCKLLLTTPGIDAETGEYSDFGVPATILAHYLRENGIVPEKCDLNSILFLLTPAESHEKLAQLVAMLAQFEQHIEDDSPLVEVLPSVYNKYPVRYRDYTLRQLCQEMHDLYVSFDVKDLQKAMFRQQSFPSVVMNPQDAHSAYIRGDVELVRIRDAEGRIAAEGALPYPPGVLCVVPGEVWGGAVQRYFLALEEGVNLLPGFSPELQGVYSETDADGVKRLYGYVLK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10961
Length:	711 (650)
Sequences:	658 (287)
Seq/√Len:	11.3

ECOLI - DCOR DCOS ADIA DCLZ LDCI

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
626_A	631_D	7.218	1.00
633_E	643_R	6.895	1.00
557_H	562_S	6.248	1.00
465_E	468_A	5.824	1.00
203_L	229_A	5.534	1.00
184_T	359_H	5.531	1.00
61_F	91_A	5.199	1.00
120_C	152_C	5.029	1.00
561_D	586_Q	4.951	1.00
355_T	396_A	4.732	1.00
104_Y	398_D	4.481	1.00
142_F	149_A	4.392	1.00
191_T	342_T	4.042	0.99
176_A	181_A	3.956	0.99
48_L	60_V	3.936	0.99
327_P	341_V	3.880	0.99
515_Y	553_Q	3.788	0.99
120_C	154_A	3.749	0.99
563_P	566_E	3.515	0.98
578_R	590_E	3.498	0.98
615_S	664_V	3.383	0.97
561_D	583_T	3.346	0.97
420_G	535_L	3.119	0.96
197_V	385_A	3.117	0.96
583_T	586_Q	2.897	0.94
627_Y	656_V	2.828	0.93
636_R	639_D	2.790	0.92
198_V	340_F	2.665	0.90
158_L	377_L	2.644	0.90
152_C	525_K	2.514	0.88
88_L	257_L	2.487	0.87
119_A	383_L	2.454	0.86
509_A	516_L	2.451	0.86
488_L	535_L	2.441	0.86
138_F	396_A	2.391	0.85
185_Y	374_H	2.363	0.84
174_F	177_K	2.358	0.84
174_F	178_V	2.326	0.83
171_A	186_F	2.315	0.83
48_L	377_L	2.311	0.83
519_N	553_Q	2.286	0.82
120_C	153_N	2.283	0.82
168_A	394_F	2.229	0.80
205_R	625_S	2.208	0.79
188_L	393_L	2.203	0.79
82_E	86_L	2.193	0.79
439_P	442_V	2.180	0.79
128_F	404_H	2.168	0.78
529_N	592_H	2.166	0.78
124_Q	152_C	2.160	0.78
507_V	558_I	2.144	0.77
175_A	186_F	2.095	0.76
450_Y	461_F	2.082	0.75
340_F	377_L	2.069	0.75
450_Y	455_L	2.056	0.74
144_E	148_R	2.038	0.74
259_Q	263_D	2.034	0.73
564_L	578_R	2.031	0.73
163_I	689_E	2.006	0.72
167_S	203_L	1.983	0.71
198_V	229_A	1.981	0.71
146_V	392_P	1.972	0.71
251_C	260_Q	1.952	0.70
463_S	479_D	1.941	0.70
423_A	535_L	1.936	0.70
212_D	284_T	1.933	0.69
632_V	646_A	1.926	0.69
186_F	397_L	1.918	0.69
208_L	275_Y	1.897	0.68
497_A	503_S	1.895	0.68
178_V	405_E	1.892	0.68
146_V	352_F	1.856	0.66
248_D	609_R	1.836	0.65
671_R	674_L	1.834	0.65
351_G	357_Q	1.826	0.65
189_N	354_Q	1.821	0.65
221_H	384_H	1.812	0.64
40_A	65_E	1.792	0.63
572_Y	576_P	1.783	0.63
466_P	478_A	1.779	0.63
104_Y	108_T	1.754	0.62
110_Y	120_C	1.751	0.61
381_F	570_S	1.745	0.61
433_L	442_V	1.736	0.61
136_R	140_D	1.732	0.61
162_L	189_N	1.711	0.60
167_S	507_V	1.686	0.58
191_T	196_K	1.679	0.58
124_Q	154_A	1.679	0.58
294_Q	297_D	1.674	0.58
386_S	524_E	1.674	0.58
194_A	656_V	1.673	0.58
386_S	689_E	1.657	0.57
154_A	524_E	1.654	0.57
197_V	548_V	1.651	0.57
433_L	559_E	1.644	0.56
599_D	602_D	1.635	0.56
141_F	145_N	1.632	0.56
353_S	389_P	1.629	0.56
177_K	405_E	1.624	0.55
196_K	221_H	1.622	0.55
325_S	459_R	1.615	0.55
638_R	674_L	1.603	0.54
120_C	283_G	1.601	0.54
101_P	315_Y	1.578	0.53
220_H	660_V	1.570	0.53
149_A	628_I	1.566	0.53
602_D	606_A	1.562	0.52
107_L	395_A	1.557	0.52
509_A	543_K	1.553	0.52
174_F	405_E	1.551	0.52
120_C	124_Q	1.545	0.52
423_A	488_L	1.544	0.52
400_N	533_F	1.536	0.51
218_S	651_P	1.535	0.51
427_I	551_L	1.534	0.51
496_D	499_T	1.529	0.51
224_L	306_I	1.528	0.51
75_T	79_N	1.520	0.50
462_F	472_G	1.520	0.50
356_S	652_Y	1.517	0.50
465_E	478_A	1.512	0.50
515_Y	557_H	1.512	0.50
291_N	479_D	1.510	0.50
239_N	494_G	1.493	0.49
141_F	149_A	1.490	0.49
119_A	151_M	1.478	0.48
158_L	403_I	1.474	0.48
177_K	519_N	1.470	0.48
300_G	337_P	1.462	0.48
589_Q	593_D	1.459	0.47
169_K	173_K	1.458	0.47
118_F	246_G	1.452	0.47
119_A	152_C	1.442	0.47
504_D	573_N	1.441	0.47
496_D	501_E	1.438	0.46
257_L	671_R	1.436	0.46
617_V	664_V	1.428	0.46
58_L	112_E	1.427	0.46
145_N	257_L	1.422	0.46
189_N	193_A	1.418	0.45
423_A	538_A	1.418	0.45
142_F	177_K	1.412	0.45
69_E	74_V	1.410	0.45
119_A	124_Q	1.401	0.45
453_S	631_D	1.400	0.45
618_M	626_A	1.380	0.44
158_L	168_A	1.372	0.43
128_F	350_A	1.365	0.43
127_A	377_L	1.356	0.42
504_D	596_V	1.348	0.42
49_A	73_G	1.347	0.42
209_V	224_L	1.346	0.42
134_A	181_A	1.346	0.42
250_H	256_Y	1.338	0.42
162_L	187_V	1.334	0.41
396_A	671_R	1.328	0.41
45_S	64_S	1.328	0.41
328_L	355_T	1.325	0.41
142_F	343_Q	1.324	0.41
468_A	504_D	1.323	0.41
208_L	261_I	1.319	0.41
196_K	384_H	1.308	0.40
283_G	691_Q	1.308	0.40
120_C	525_K	1.308	0.40
433_L	437_F	1.306	0.40
152_C	532_L	1.304	0.40
221_H	383_L	1.298	0.40
128_F	488_L	1.296	0.40
162_L	387_T	1.295	0.40
247_I	280_I	1.295	0.40
83_Q	86_L	1.293	0.39
114_G	204_T	1.289	0.39
82_E	85_W	1.286	0.39
239_N	473_F	1.283	0.39
504_D	550_M	1.281	0.39
226_Q	257_L	1.280	0.39
243_F	550_M	1.274	0.39
597_S	682_L	1.272	0.38
183_K	374_H	1.271	0.38
304_D	362_D	1.271	0.38
319_I	413_W	1.269	0.38
624_H	628_I	1.267	0.38
496_D	503_S	1.265	0.38
177_K	617_V	1.263	0.38
233_Y	382_M	1.260	0.38
175_A	228_G	1.259	0.38
197_V	209_V	1.256	0.38
262_R	270_D	1.251	0.38
160_D	282_L	1.251	0.38
565_V	581_D	1.246	0.37
587_L	686_F	1.245	0.37
192_S	384_H	1.245	0.37
204_T	700_D	1.238	0.37
122_G	652_Y	1.235	0.37
489_L	530_S	1.232	0.37
511_I	516_L	1.232	0.37
175_A	184_T	1.228	0.36
112_E	465_E	1.228	0.36
419_I	544_L	1.223	0.36
193_A	340_F	1.221	0.36
549_A	552_A	1.218	0.36
352_F	390_F	1.212	0.36
49_A	77_V	1.206	0.35
142_F	340_F	1.206	0.35
211_F	220_H	1.205	0.35
201_A	358_I	1.200	0.35
348_Q	486_C	1.198	0.35
253_N	298_T	1.198	0.35
499_T	504_D	1.195	0.35
293_R	324_D	1.194	0.35
696_E	701_G	1.192	0.35
342_T	354_Q	1.189	0.35
282_L	351_G	1.189	0.35
103_F	191_T	1.188	0.35
246_G	310_S	1.188	0.35
138_F	142_F	1.187	0.35
499_T	509_A	1.182	0.34
45_S	73_G	1.180	0.34
254_E	258_R	1.178	0.34
241_F	542_E	1.172	0.34
343_Q	359_H	1.170	0.34
357_Q	397_L	1.169	0.34
205_R	621_Q	1.166	0.34
572_Y	575_Y	1.161	0.34
417_V	486_C	1.160	0.33
197_V	358_I	1.156	0.33
232_V	659_V	1.154	0.33
310_S	313_V	1.154	0.33
211_F	264_V	1.153	0.33
401_A	447_W	1.152	0.33
122_G	356_S	1.151	0.33
397_L	527_D	1.150	0.33
479_D	504_D	1.149	0.33
132_H	379_N	1.148	0.33
244_I	356_S	1.146	0.33
171_A	194_A	1.138	0.33
55_G	128_F	1.138	0.33
259_Q	262_R	1.136	0.32
543_K	614_P	1.136	0.32
110_Y	252_F	1.129	0.32
202_L	372_C	1.129	0.32
541_H	545_A	1.127	0.32
234_L	568_L	1.125	0.32
351_G	400_N	1.122	0.32
503_S	622_D	1.122	0.32
75_T	78_I	1.122	0.32
121_P	487_K	1.120	0.32
451_P	454_V	1.119	0.32
494_G	579_Y	1.119	0.32
282_L	357_Q	1.113	0.31
666_G	671_R	1.110	0.31
582_Y	590_E	1.109	0.31
125_H	403_I	1.107	0.31
147_F	415_E	1.104	0.31
187_V	385_A	1.102	0.31
267_E	270_D	1.100	0.31
588_C	592_H	1.100	0.31
521_I	671_R	1.097	0.31
617_V	644_I	1.094	0.31
564_L	572_Y	1.085	0.30
560_D	671_R	1.084	0.30
612_S	615_S	1.081	0.30
189_N	379_N	1.080	0.30
192_S	353_S	1.076	0.30
119_A	154_A	1.076	0.30
526_C	558_I	1.075	0.30
345_V	357_Q	1.075	0.30
520_G	557_H	1.075	0.30
173_K	232_V	1.071	0.30
526_C	660_V	1.070	0.30
291_N	581_D	1.070	0.30
152_C	156_V	1.070	0.30
429_A	581_D	1.065	0.29
491_T	497_A	1.065	0.29
609_R	613_F	1.061	0.29
302_L	337_P	1.059	0.29
142_F	376_R	1.057	0.29
511_I	588_C	1.057	0.29
155_D	525_K	1.055	0.29
103_F	280_I	1.051	0.29
356_S	651_P	1.043	0.29
199_T	372_C	1.041	0.29
641_E	667_G	1.040	0.28
104_Y	679_G	1.040	0.28
489_L	592_H	1.039	0.28
696_E	699_A	1.038	0.28
243_F	437_F	1.034	0.28
178_V	194_A	1.034	0.28
377_L	542_E	1.029	0.28
659_V	673_F	1.027	0.28
81_N	86_L	1.024	0.28
120_C	288_T	1.023	0.28
151_M	480_Q	1.022	0.28
291_N	459_R	1.021	0.28
103_F	171_A	1.018	0.28
496_D	584_L	1.014	0.27
353_S	543_K	1.013	0.27
522_V	649_A	1.010	0.27
171_A	397_L	1.009	0.27
376_R	627_Y	1.008	0.27
254_E	274_P	1.007	0.27
198_V	209_V	1.007	0.27
542_E	551_L	1.003	0.27
427_I	552_A	1.003	0.27
88_L	637_I	1.002	0.27
305_Y	338_G	1.002	0.27
195_N	651_P	1.002	0.27
196_K	220_H	0.999	0.27
569_P	579_Y	0.989	0.27
314_G	357_Q	0.985	0.26
666_G	669_V	0.981	0.26
501_E	505_F	0.979	0.26
250_H	260_Q	0.978	0.26
262_R	453_S	0.977	0.26
214_N	351_G	0.975	0.26
50_L	58_L	0.974	0.26
510_T	670_Q	0.971	0.26
46_G	644_I	0.969	0.26
281_Q	657_L	0.968	0.26
286_D	312_W	0.966	0.26
128_F	420_G	0.966	0.26
180_H	310_S	0.965	0.26
417_V	482_F	0.963	0.26
664_V	690_L	0.963	0.26
120_C	155_D	0.962	0.25
195_N	652_Y	0.962	0.25
120_C	160_D	0.962	0.25
163_I	281_Q	0.962	0.25
553_Q	556_Q	0.956	0.25
358_I	377_L	0.956	0.25
423_A	483_V	0.955	0.25
218_S	652_Y	0.954	0.25
515_Y	519_N	0.954	0.25
194_A	468_A	0.953	0.25
549_A	556_Q	0.953	0.25
161_L	398_D	0.950	0.25
255_E	504_D	0.948	0.25
61_F	280_I	0.947	0.25
239_N	470_W	0.946	0.25
194_A	401_A	0.946	0.25
258_R	362_D	0.946	0.25
276_R	536_T	0.943	0.25
179_F	349_Q	0.942	0.25
224_L	292_A	0.941	0.25
512_L	516_L	0.941	0.25
248_D	483_V	0.936	0.25
310_S	316_E	0.934	0.24
152_C	155_D	0.933	0.24
108_T	515_Y	0.929	0.24
389_P	398_D	0.929	0.24
225_I	381_F	0.928	0.24
207_D	276_R	0.927	0.24
161_L	685_G	0.927	0.24
265_A	270_D	0.923	0.24
343_Q	511_I	0.923	0.24
146_V	390_F	0.916	0.24
500_G	509_A	0.915	0.24
443_D	460_R	0.911	0.24
389_P	409_G	0.908	0.24
71_P	80_G	0.908	0.24
255_E	453_S	0.907	0.24
47_I	57_H	0.904	0.23
470_W	473_F	0.903	0.23
373_P	635_V	0.903	0.23
119_A	289_V	0.901	0.23
227_A	621_Q	0.900	0.23
380_A	668_A	0.899	0.23
257_L	265_A	0.899	0.23
105_D	638_R	0.897	0.23
192_S	389_P	0.893	0.23
619_N	639_D	0.892	0.23
45_S	68_V	0.892	0.23
239_N	471_H	0.889	0.23
310_S	325_S	0.887	0.23
234_L	252_F	0.885	0.23
276_R	595_Y	0.882	0.23
192_S	221_H	0.882	0.23
178_V	401_A	0.881	0.23
152_C	282_L	0.880	0.23
260_Q	263_D	0.879	0.23
194_A	551_L	0.878	0.23
538_A	558_I	0.877	0.22
314_G	364_H	0.876	0.22
65_E	560_D	0.876	0.22
153_N	234_L	0.875	0.22
257_L	261_I	0.875	0.22
560_D	642_G	0.874	0.22
255_E	259_Q	0.872	0.22
221_H	657_L	0.871	0.22
211_F	489_L	0.870	0.22
564_L	683_L	0.869	0.22
320_P	484_D	0.869	0.22
504_D	580_R	0.868	0.22
138_F	288_T	0.865	0.22
70_L	259_Q	0.864	0.22
97_E	259_Q	0.863	0.22
420_G	541_H	0.862	0.22
202_L	340_F	0.859	0.22
46_G	427_I	0.859	0.22
270_D	594_L	0.859	0.22
604_Q	608_F	0.856	0.22
192_S	387_T	0.854	0.22
215_N	316_E	0.854	0.22
189_N	304_D	0.853	0.22
594_L	598_F	0.852	0.22
221_H	247_I	0.850	0.22
206_G	522_V	0.850	0.22
106_T	349_Q	0.849	0.22
60_V	170_D	0.848	0.22
192_S	196_K	0.848	0.22
293_R	297_D	0.847	0.21
509_A	517_R	0.846	0.21
319_I	648_G	0.846	0.21
149_A	277_L	0.845	0.21
530_S	675_A	0.845	0.21
173_K	563_P	0.844	0.21
291_N	380_A	0.842	0.21
106_T	355_T	0.838	0.21
184_T	393_L	0.837	0.21
172_Q	462_F	0.837	0.21
479_D	581_D	0.836	0.21
615_S	671_R	0.836	0.21
122_G	244_I	0.836	0.21
418_E	453_S	0.835	0.21
65_E	145_N	0.832	0.21
52_K	77_V	0.831	0.21
299_V	483_V	0.831	0.21
93_C	501_E	0.829	0.21
686_F	689_E	0.828	0.21
380_A	651_P	0.827	0.21
110_Y	152_C	0.827	0.21
165_E	608_F	0.827	0.21
467_G	474_E	0.826	0.21
449_D	639_D	0.825	0.21
204_T	629_R	0.824	0.21
196_K	386_S	0.824	0.21
180_H	317_Q	0.822	0.21
60_V	194_A	0.821	0.21
426_A	548_V	0.820	0.21
191_T	225_I	0.819	0.21
160_D	351_G	0.818	0.21
196_K	252_F	0.815	0.20
149_A	480_Q	0.815	0.20
200_N	226_Q	0.815	0.20
146_V	339_I	0.814	0.20
418_E	422_E	0.811	0.20
421_I	456_A	0.811	0.20
193_A	627_Y	0.810	0.20
250_H	297_D	0.810	0.20
154_A	525_K	0.807	0.20
579_Y	587_L	0.806	0.20
354_Q	509_A	0.800	0.20
111_V	382_M	0.800	0.20
195_N	218_S	0.800	0.20
110_Y	162_L	0.800	0.20
91_A	109_Q	0.799	0.20
364_H	413_W	0.798	0.20
300_G	314_G	0.796	0.20
300_G	370_R	0.796	0.20
161_L	524_E	0.795	0.20
409_G	412_L	0.791	0.20
99_L	134_A	0.791	0.20
186_F	277_L	0.791	0.20
138_F	515_Y	0.790	0.20
261_I	622_D	0.789	0.20
439_P	629_R	0.788	0.20
107_L	631_D	0.785	0.20
423_A	544_L	0.784	0.19
355_T	520_G	0.782	0.19
571_V	575_Y	0.781	0.19
215_N	281_Q	0.780	0.19
201_A	300_G	0.777	0.19
192_S	543_K	0.777	0.19
176_A	686_F	0.777	0.19
118_F	326_S	0.776	0.19
189_N	525_K	0.776	0.19
631_D	674_L	0.775	0.19
397_L	688_P	0.774	0.19
119_A	168_A	0.772	0.19
147_F	523_P	0.771	0.19
53_R	560_D	0.769	0.19
493_P	506_G	0.769	0.19
338_G	364_H	0.769	0.19
336_D	370_R	0.768	0.19
465_E	469_K	0.767	0.19
281_Q	316_E	0.766	0.19
504_D	682_L	0.764	0.19
432_K	559_E	0.762	0.19
145_N	191_T	0.761	0.19
70_L	86_L	0.760	0.19
473_F	494_G	0.759	0.19
532_L	661_P	0.757	0.19
153_N	660_V	0.757	0.19
61_F	646_A	0.756	0.19
262_R	335_N	0.754	0.19
664_V	668_A	0.754	0.19
302_L	338_G	0.754	0.19
676_L	680_V	0.753	0.19
262_R	597_S	0.750	0.18
320_P	529_N	0.749	0.18
194_A	233_Y	0.749	0.18
440_P	646_A	0.748	0.18
460_R	612_S	0.748	0.18
147_F	319_I	0.748	0.18
281_Q	400_N	0.746	0.18
253_N	256_Y	0.745	0.18
120_C	691_Q	0.745	0.18
251_C	322_M	0.744	0.18
302_L	305_Y	0.744	0.18
154_A	480_Q	0.744	0.18
117_T	646_A	0.743	0.18
246_G	572_Y	0.742	0.18
71_P	576_P	0.742	0.18
310_S	398_D	0.742	0.18
433_L	450_Y	0.739	0.18
354_Q	525_K	0.738	0.18
91_A	645_A	0.738	0.18
631_D	644_I	0.738	0.18
359_H	517_R	0.737	0.18
162_L	196_K	0.737	0.18
211_F	215_N	0.737	0.18
258_R	274_P	0.736	0.18
252_F	352_F	0.736	0.18
88_L	393_L	0.736	0.18
459_R	479_D	0.735	0.18
76_A	678_E	0.734	0.18
218_S	380_A	0.734	0.18
529_N	533_F	0.733	0.18
65_E	602_D	0.732	0.18
159_G	164_H	0.731	0.18
131_K	624_H	0.731	0.18
134_A	399_V	0.730	0.18
510_T	516_L	0.729	0.18
521_I	644_I	0.729	0.18
110_Y	381_F	0.728	0.18
377_L	640_A	0.728	0.18
45_S	79_N	0.727	0.18
255_E	577_V	0.726	0.18
590_E	639_D	0.726	0.18
147_F	387_T	0.726	0.18
554_F	620_P	0.724	0.18
236_A	349_Q	0.722	0.18
192_S	412_L	0.722	0.18
472_G	508_P	0.720	0.18
437_F	660_V	0.719	0.18
345_V	359_H	0.718	0.18
358_I	587_L	0.718	0.18
245_G	286_D	0.716	0.17
215_N	413_W	0.715	0.17
283_G	379_N	0.715	0.17
165_E	386_S	0.714	0.17
532_L	685_G	0.714	0.17
172_Q	202_L	0.713	0.17
159_G	238_R	0.713	0.17
210_L	278_A	0.712	0.17
249_A	477_A	0.711	0.17
142_F	147_F	0.708	0.17
151_M	650_L	0.707	0.17
154_A	416_C	0.707	0.17
288_T	530_S	0.706	0.17
92_A	182_D	0.705	0.17
63_Y	560_D	0.705	0.17
146_V	548_V	0.702	0.17
152_C	357_Q	0.702	0.17
71_P	74_V	0.701	0.17
304_D	370_R	0.700	0.17
145_N	651_P	0.699	0.17
215_N	339_I	0.699	0.17
380_A	676_L	0.699	0.17
469_K	499_T	0.698	0.17
343_Q	391_Y	0.697	0.17
146_V	415_E	0.696	0.17
202_L	277_L	0.695	0.17
310_S	482_F	0.694	0.17
174_F	398_D	0.693	0.17
125_H	353_S	0.693	0.17
386_S	525_K	0.692	0.17
429_A	460_R	0.692	0.17
117_T	488_L	0.692	0.17
170_D	219_N	0.689	0.17
271_L	671_R	0.689	0.17
106_T	613_F	0.688	0.17
169_K	172_Q	0.687	0.17
276_R	305_Y	0.686	0.17
282_L	315_Y	0.686	0.17
508_P	536_T	0.686	0.17
138_F	642_G	0.686	0.17
132_H	189_N	0.685	0.17
124_Q	650_L	0.682	0.17
109_Q	177_K	0.682	0.17
361_K	425_K	0.681	0.17
247_I	290_Y	0.679	0.16
151_M	199_T	0.679	0.16
153_N	282_L	0.677	0.16
307_L	558_I	0.676	0.16
427_I	499_T	0.675	0.16
224_L	448_Q	0.675	0.16
556_Q	560_D	0.675	0.16
62_L	74_V	0.673	0.16
85_W	144_E	0.672	0.16
154_A	197_V	0.672	0.16
576_P	580_R	0.671	0.16
382_M	391_Y	0.670	0.16
245_G	312_W	0.670	0.16
357_Q	438_I	0.670	0.16
414_A	644_I	0.670	0.16
460_R	496_D	0.669	0.16
338_G	413_W	0.668	0.16
254_E	302_L	0.666	0.16
160_D	215_N	0.665	0.16
199_T	220_H	0.665	0.16
275_Y	420_G	0.665	0.16
110_Y	191_T	0.664	0.16
563_P	641_E	0.664	0.16
117_T	535_L	0.664	0.16
46_G	664_V	0.664	0.16
146_V	507_V	0.664	0.16
247_I	387_T	0.662	0.16
158_L	323_A	0.662	0.16
282_L	313_V	0.661	0.16
62_L	86_L	0.661	0.16
556_Q	599_D	0.661	0.16
123_H	150_D	0.660	0.16
193_A	386_S	0.660	0.16
409_G	484_D	0.660	0.16
167_S	690_L	0.659	0.16
105_D	151_M	0.659	0.16
255_E	593_D	0.658	0.16
648_G	661_P	0.658	0.16
70_L	386_S	0.658	0.16
345_V	404_H	0.656	0.16
193_A	437_F	0.656	0.16
147_F	634_L	0.655	0.16
151_M	532_L	0.655	0.16
171_A	525_K	0.652	0.16
380_A	628_I	0.652	0.16
233_Y	488_L	0.652	0.16
110_Y	124_Q	0.651	0.16
343_Q	517_R	0.651	0.16
457_S	596_V	0.651	0.16
537_P	595_Y	0.650	0.16
124_Q	351_G	0.648	0.16
496_D	640_A	0.648	0.16
167_S	227_A	0.647	0.16
351_G	528_L	0.646	0.16
133_P	511_I	0.646	0.16
437_F	442_V	0.646	0.16
430_R	677_E	0.645	0.16
196_K	450_Y	0.645	0.16
230_T	656_V	0.643	0.16
277_L	525_K	0.643	0.16
381_F	421_I	0.643	0.16
690_L	695_S	0.643	0.16
486_C	657_L	0.643	0.16
157_K	219_N	0.641	0.15
348_Q	400_N	0.641	0.15
572_Y	584_L	0.641	0.15
349_Q	538_A	0.641	0.15
161_L	386_S	0.640	0.15
194_A	437_F	0.640	0.15
172_Q	558_I	0.640	0.15
153_N	156_V	0.638	0.15
279_I	689_E	0.638	0.15
667_G	671_R	0.637	0.15
219_N	279_I	0.637	0.15
189_N	196_K	0.636	0.15
226_Q	465_E	0.636	0.15
232_V	400_N	0.636	0.15
142_F	552_A	0.635	0.15
147_F	681_N	0.635	0.15
312_W	387_T	0.633	0.15
351_G	413_W	0.633	0.15
134_A	262_R	0.632	0.15
103_F	186_F	0.631	0.15
386_S	389_P	0.631	0.15
196_K	209_V	0.630	0.15
359_H	382_M	0.630	0.15
333_N	336_D	0.629	0.15
189_N	386_S	0.629	0.15
551_L	659_V	0.628	0.15
208_L	248_D	0.628	0.15
279_I	315_Y	0.628	0.15
430_R	490_L	0.627	0.15
109_Q	399_V	0.627	0.15
319_I	341_V	0.626	0.15
184_T	645_A	0.626	0.15
71_P	639_D	0.626	0.15
169_K	479_D	0.625	0.15
189_N	342_T	0.625	0.15
387_T	409_G	0.625	0.15
70_L	108_T	0.625	0.15
53_R	596_V	0.624	0.15
131_K	500_G	0.624	0.15
512_L	531_I	0.622	0.15
72_A	76_A	0.621	0.15
579_Y	623_A	0.620	0.15
525_K	691_Q	0.619	0.15
338_G	371_F	0.619	0.15
525_K	530_S	0.617	0.15
119_A	394_F	0.617	0.15
46_G	593_D	0.616	0.15
427_I	650_L	0.616	0.15
116_S	377_L	0.615	0.15
188_L	488_L	0.615	0.15
259_Q	410_R	0.615	0.15
459_R	551_L	0.614	0.15
219_N	669_V	0.614	0.15
278_A	608_F	0.614	0.15
415_E	453_S	0.614	0.15
191_T	198_V	0.613	0.15
141_F	651_P	0.612	0.15
151_M	383_L	0.612	0.15
155_D	283_G	0.611	0.15
210_L	374_H	0.611	0.15
203_L	210_L	0.611	0.15
63_Y	399_V	0.610	0.15
221_H	617_V	0.609	0.15
518_E	644_I	0.609	0.15
196_K	657_L	0.609	0.15
192_S	509_A	0.608	0.15
342_T	521_I	0.608	0.15
42_D	49_A	0.607	0.15
353_S	387_T	0.607	0.15
525_K	532_L	0.607	0.15
460_R	577_V	0.606	0.15
249_A	479_D	0.606	0.15
302_L	364_H	0.605	0.15
375_K	694_Y	0.605	0.15
73_G	573_N	0.604	0.15
206_G	230_T	0.603	0.15
594_L	658_C	0.603	0.15
49_A	170_D	0.603	0.15
186_F	207_D	0.603	0.15
234_L	247_I	0.603	0.15
415_E	617_V	0.602	0.15
237_S	603_L	0.601	0.14
523_P	691_Q	0.600	0.14
414_A	418_E	0.600	0.14
188_L	226_Q	0.597	0.14
416_C	462_F	0.597	0.14
240_P	659_V	0.597	0.14
226_Q	377_L	0.596	0.14
185_Y	495_I	0.596	0.14
283_G	525_K	0.595	0.14
147_F	524_E	0.594	0.14
46_G	97_E	0.591	0.14
65_E	142_F	0.591	0.14
336_D	341_V	0.590	0.14
51_L	437_F	0.589	0.14
104_Y	186_F	0.589	0.14
74_V	637_I	0.588	0.14
574_K	702_V	0.588	0.14
619_N	641_E	0.588	0.14
69_E	170_D	0.587	0.14
307_L	420_G	0.587	0.14
119_A	523_P	0.586	0.14
122_G	623_A	0.586	0.14
163_I	386_S	0.586	0.14
308_F	623_A	0.585	0.14
239_N	350_A	0.585	0.14
67_A	98_N	0.584	0.14
261_I	515_Y	0.583	0.14
38_I	62_L	0.582	0.14
135_G	242_G	0.581	0.14
276_R	364_H	0.581	0.14
321_M	482_F	0.581	0.14
229_A	393_L	0.581	0.14
154_A	283_G	0.581	0.14
288_T	481_Y	0.580	0.14
177_K	408_S	0.579	0.14
109_Q	638_R	0.577	0.14
117_T	179_F	0.577	0.14
118_F	310_S	0.577	0.14
162_L	191_T	0.576	0.14
53_R	58_L	0.576	0.14
416_C	689_E	0.575	0.14
551_L	574_K	0.575	0.14
162_L	409_G	0.574	0.14
170_D	405_E	0.574	0.14
526_C	600_V	0.573	0.14
295_V	531_I	0.572	0.14
131_K	558_I	0.572	0.14
264_V	616_V	0.571	0.14
121_P	692_G	0.570	0.14
257_L	392_P	0.570	0.14
352_F	517_R	0.570	0.14
657_L	675_A	0.570	0.14
81_N	131_K	0.570	0.14
415_E	633_E	0.570	0.14
280_I	629_R	0.569	0.14
454_V	461_F	0.569	0.14
151_M	386_S	0.569	0.14
425_K	452_T	0.569	0.14
238_R	579_Y	0.568	0.14
596_V	671_R	0.568	0.14
149_A	226_Q	0.568	0.14
75_T	468_A	0.568	0.14
206_G	678_E	0.567	0.14
44_R	47_I	0.567	0.14
157_K	257_L	0.567	0.14
132_H	661_P	0.567	0.14
191_T	652_Y	0.567	0.14
124_Q	155_D	0.567	0.14
125_H	289_V	0.567	0.14
286_D	387_T	0.566	0.14
184_T	314_G	0.565	0.14
509_A	515_Y	0.564	0.14
451_P	606_A	0.563	0.14
351_G	536_T	0.563	0.14
618_M	622_D	0.562	0.14
419_I	535_L	0.562	0.14
224_L	604_Q	0.562	0.14
119_A	163_I	0.562	0.14
495_I	591_M	0.562	0.14
684_P	692_G	0.561	0.14
162_L	356_S	0.561	0.14
493_P	579_Y	0.561	0.14
258_R	300_G	0.560	0.14
154_A	691_Q	0.559	0.14
681_N	701_G	0.559	0.14
142_F	648_G	0.559	0.14
477_A	670_Q	0.559	0.14
103_F	207_D	0.559	0.14
142_F	495_I	0.558	0.13
433_L	480_Q	0.558	0.13
243_F	483_V	0.558	0.13
69_E	98_N	0.557	0.13
192_S	383_L	0.557	0.13
623_A	692_G	0.557	0.13
378_N	466_P	0.556	0.13
327_P	659_V	0.556	0.13
186_F	198_V	0.556	0.13
226_Q	360_K	0.555	0.13
292_A	512_L	0.555	0.13
145_N	169_K	0.555	0.13
192_S	409_G	0.555	0.13
283_G	313_V	0.555	0.13
446_L	515_Y	0.555	0.13
114_G	363_N	0.555	0.13
241_F	298_T	0.554	0.13
112_E	637_I	0.554	0.13
511_I	515_Y	0.554	0.13
246_G	481_Y	0.554	0.13
154_A	353_S	0.553	0.13
51_L	426_A	0.553	0.13
155_D	691_Q	0.553	0.13
152_C	283_G	0.552	0.13
340_F	372_C	0.552	0.13
384_H	409_G	0.551	0.13
189_N	661_P	0.551	0.13
186_F	401_A	0.551	0.13
242_G	569_P	0.551	0.13
500_G	516_L	0.551	0.13
180_H	322_M	0.550	0.13
189_N	308_F	0.550	0.13
699_A	702_V	0.550	0.13
132_H	252_F	0.546	0.13
93_C	504_D	0.545	0.13
256_Y	332_L	0.544	0.13
438_I	442_V	0.544	0.13
51_L	373_P	0.543	0.13
214_N	278_A	0.543	0.13
89_E	504_D	0.542	0.13
105_D	398_D	0.542	0.13
162_L	245_G	0.542	0.13
210_L	686_F	0.541	0.13
478_A	576_P	0.539	0.13
617_V	687_S	0.539	0.13
109_Q	280_I	0.538	0.13
536_T	660_V	0.537	0.13
542_E	546_Q	0.537	0.13
88_L	145_N	0.536	0.13
50_L	259_Q	0.535	0.13
380_A	678_E	0.535	0.13
181_A	547_L	0.535	0.13
60_V	507_V	0.535	0.13
226_Q	230_T	0.535	0.13
187_V	308_F	0.534	0.13
161_L	290_Y	0.534	0.13
48_L	73_G	0.534	0.13
103_F	175_A	0.533	0.13
219_N	373_P	0.533	0.13
243_F	418_E	0.533	0.13
142_F	670_Q	0.532	0.13
93_C	622_D	0.531	0.13
516_L	543_K	0.531	0.13
214_N	335_N	0.531	0.13
641_E	666_G	0.531	0.13
41_A	49_A	0.530	0.13
314_G	519_N	0.530	0.13
135_G	159_G	0.530	0.13
141_F	372_C	0.530	0.13
354_Q	530_S	0.529	0.13
229_A	675_A	0.529	0.13
616_V	626_A	0.529	0.13
97_E	501_E	0.528	0.13
277_L	636_R	0.528	0.13
91_A	233_Y	0.528	0.13
465_E	638_R	0.528	0.13
452_T	523_P	0.528	0.13
158_L	677_E	0.527	0.13
207_D	304_D	0.526	0.13
163_I	291_N	0.525	0.13
534_L	543_K	0.524	0.13
199_T	229_A	0.524	0.13
357_Q	422_E	0.524	0.13
208_L	229_A	0.523	0.13
429_A	553_Q	0.523	0.13
256_Y	293_R	0.523	0.13
139_Y	185_Y	0.522	0.13
282_L	387_T	0.522	0.13
396_A	644_I	0.522	0.13
524_E	691_Q	0.522	0.13
283_G	310_S	0.521	0.13
226_Q	350_A	0.521	0.13
598_F	697_T	0.521	0.13
510_T	515_Y	0.520	0.13
278_A	351_G	0.520	0.13
271_L	577_V	0.520	0.13
67_A	637_I	0.519	0.13
288_T	352_F	0.519	0.13
276_R	413_W	0.519	0.13
275_Y	348_Q	0.519	0.13
573_N	580_R	0.519	0.13
450_Y	472_G	0.518	0.13
608_F	692_G	0.518	0.13
49_A	53_R	0.518	0.13
65_E	140_D	0.516	0.13
384_H	387_T	0.516	0.13
415_E	418_E	0.516	0.13
322_M	680_V	0.515	0.13
279_I	557_H	0.515	0.13
102_P	409_G	0.515	0.13
44_R	521_I	0.515	0.13
266_P	328_L	0.515	0.13
325_S	481_Y	0.514	0.13
49_A	93_C	0.514	0.13
100_L	278_A	0.514	0.13
220_H	609_R	0.513	0.12
574_K	668_A	0.513	0.12
473_F	614_P	0.512	0.12
392_P	659_V	0.512	0.12
457_S	469_K	0.512	0.12
444_G	447_W	0.512	0.12
350_A	393_L	0.511	0.12
259_Q	593_D	0.511	0.12
158_L	167_S	0.510	0.12
48_L	83_Q	0.510	0.12
74_V	77_V	0.510	0.12
69_E	75_T	0.509	0.12
186_F	528_L	0.509	0.12
146_V	429_A	0.508	0.12
193_A	682_L	0.508	0.12
164_H	692_G	0.507	0.12
383_L	624_H	0.507	0.12
156_V	233_Y	0.507	0.12
352_F	359_H	0.506	0.12
111_V	188_L	0.505	0.12
306_I	319_I	0.505	0.12
62_L	144_E	0.505	0.12
151_M	154_A	0.505	0.12
195_N	356_S	0.504	0.12
357_Q	370_R	0.504	0.12
251_C	256_Y	0.503	0.12
528_L	536_T	0.503	0.12
162_L	198_V	0.502	0.12
206_G	407_E	0.502	0.12
571_V	577_V	0.502	0.12
399_V	574_K	0.502	0.12
384_H	659_V	0.501	0.12
304_D	356_S	0.501	0.12
121_P	150_D	0.501	0.12
268_K	618_M	0.501	0.12
97_E	580_R	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1c4kA	2	0.993	100	0.501	Contact Map
2vycA	5	0.9803	100	0.529	Contact Map
3n75A	4	0.9451	100	0.58	Contact Map
2x3lA	2	0.5907	100	0.726	Contact Map
4q6rA	2	0.5865	100	0.882	Contact Map
3mc6A	2	0.557	100	0.886	Contact Map
4w8iA	2	0.4979	99.9	0.914	Contact Map
3bc8A	3	0.5837	99.9	0.927	Contact Map
3hl2A	3	0.5935	99.8	0.931	Contact Map
1js3A	2	0.5668	99.8	0.932	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0158 seconds.