NARY - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

NARY - Respiratory nitrate reductase 2 beta chain

UniProt:	P19318	Sequences: MKIRSQVGMVLNLDKCIGCHTCSVTCKNVWTGREGMEYAWFNNVETKPGIGYPKNWEDQEEWQGGWVRDVNGKIRPRLGNKMGVITKIFANPVVPQIDDYYEPFTFDYEHLHSAPEGKHIPTARPRSLIDGKRMDKVIWGPNWEELLGGEFEKRARDRNFEAMQKEMYGQFENTFMMYLPRLCEHCLNPSCVATCPSGAIYKREEDGIVLIDQDKCRGWRLCISGCPYKKIYFNWKSGKSEKCIFCYPRIESGQPTVCSETCVGRIRYLGVLLYDADRIEEAASTEREVDLYERQCEVFLDPHDPSVIEEALKQGIPQNVIDAAQRSPVYKMAMDWKLALPLHPEYRTLPMVWYVPPLSPIQSYADAGGLPKSEGVLPAIESLRIPVQYLANMLSAGDTGPVLRALKRMMAMRHYMRSQTVEGVTDTRAIDEVGLSVAQVEEMYRYLAIANYEDRFVIPTSHREMAGDAFAERNGCGFTFGDGCHGSDSKFNLFNSSRIDAINITEVRDKAEGE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10647
Length:	514 (483)
Sequences:	586 (186)
Seq/√Len:	8.5

ECOLI - NARY NARH
BACSU - NARH

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
321_I	325_Q	7.216	1.00
310_E	314_Q	6.882	1.00
312_L	318_Q	6.015	1.00
97_I	129_I	4.339	0.99
338_L	447_L	4.040	0.98
55_N	58_D	3.757	0.97
36_M	39_A	3.747	0.97
194_T	225_G	3.709	0.96
46_T	176_M	3.677	0.96
278_R	281_E	3.610	0.96
388_Q	399_T	3.573	0.96
211_I	240_S	3.515	0.95
192_V	200_I	3.486	0.95
211_I	231_I	3.411	0.94
381_E	403_L	3.408	0.94
259_S	269_L	3.239	0.92
126_R	133_R	3.191	0.92
427_T	437_V	3.067	0.90
68_R	286_E	2.999	0.89
478_F	485_H	2.923	0.88
200_I	231_I	2.911	0.87
430_I	440_V	2.886	0.87
162_A	392_N	2.871	0.87
76_P	190_S	2.849	0.86
299_F	334_M	2.834	0.86
3_I	307_V	2.818	0.86
60_E	77_R	2.797	0.85
293_E	297_E	2.747	0.84
11_L	182_L	2.742	0.84
91_N	221_L	2.741	0.84
84_V	194_T	2.684	0.83
47_K	144_E	2.626	0.81
190_S	225_G	2.602	0.81
78_L	84_V	2.602	0.81
478_F	484_C	2.598	0.80
482_D	485_H	2.521	0.78
292_Y	296_C	2.517	0.78
401_P	405_A	2.507	0.78
67_V	77_R	2.491	0.77
7_V	271_V	2.451	0.76
296_C	337_K	2.370	0.74
114_A	117_G	2.368	0.74
335_D	439_Q	2.322	0.72
40_W	101_Y	2.319	0.72
402_V	405_A	2.278	0.71
50_I	54_K	2.267	0.70
47_K	54_K	2.184	0.67
330_Y	334_M	2.159	0.66
436_S	439_Q	2.112	0.64
308_I	325_Q	2.101	0.64
199_A	240_S	2.080	0.63
303_H	325_Q	2.050	0.62
245_F	250_I	2.012	0.61
430_I	437_V	1.981	0.59
287_R	290_D	1.938	0.58
336_W	443_M	1.901	0.56
93_V	140_G	1.895	0.56
438_A	442_E	1.855	0.54
8_G	81_K	1.839	0.53
416_M	419_Q	1.829	0.53
115_P	294_R	1.816	0.52
478_F	482_D	1.809	0.52
128_L	140_G	1.789	0.51
332_M	338_L	1.771	0.51
245_F	269_L	1.763	0.50
91_N	94_V	1.758	0.50
272_L	299_F	1.746	0.49
476_C	483_G	1.739	0.49
129_I	313_K	1.712	0.48
280_E	284_S	1.702	0.48
67_V	312_L	1.688	0.47
310_E	313_K	1.686	0.47
250_I	346_Y	1.667	0.46
144_E	150_E	1.666	0.46
3_I	71_N	1.621	0.44
28_N	235_W	1.616	0.44
387_V	403_L	1.614	0.44
298_V	420_T	1.613	0.44
5_S	320_V	1.601	0.43
418_S	426_D	1.595	0.43
193_A	200_I	1.575	0.42
352_V	385_I	1.566	0.42
271_V	405_A	1.561	0.42
437_V	441_E	1.561	0.42
306_S	309_E	1.548	0.41
407_K	432_E	1.542	0.41
32_G	473_R	1.535	0.41
104_F	422_E	1.535	0.41
200_I	215_K	1.496	0.39
25_T	257_V	1.494	0.39
2_K	314_Q	1.487	0.39
141_P	254_Q	1.487	0.39
293_E	296_C	1.452	0.37
146_L	178_Y	1.451	0.37
4_R	204_E	1.445	0.37
75_R	355_V	1.442	0.37
88_I	435_L	1.442	0.37
25_T	260_E	1.426	0.36
256_T	259_S	1.417	0.36
272_L	333_A	1.410	0.36
346_Y	398_D	1.405	0.35
266_I	421_V	1.401	0.35
338_L	355_V	1.401	0.35
84_V	225_G	1.396	0.35
395_S	401_P	1.383	0.35
119_H	199_A	1.370	0.34
39_A	383_L	1.354	0.34
120_I	199_A	1.348	0.33
429_A	440_V	1.343	0.33
240_S	279_I	1.342	0.33
50_I	144_E	1.336	0.33
375_G	378_P	1.331	0.33
151_F	154_R	1.326	0.32
388_Q	408_R	1.321	0.32
142_N	444_Y	1.317	0.32
294_R	409_M	1.315	0.32
282_A	285_T	1.307	0.32
50_I	139_W	1.306	0.32
161_E	436_S	1.306	0.32
7_V	269_L	1.296	0.31
109_E	113_S	1.283	0.31
481_G	484_C	1.282	0.31
145_E	149_G	1.282	0.31
106_F	146_L	1.281	0.31
380_I	410_M	1.280	0.31
278_R	297_E	1.278	0.31
330_Y	333_A	1.278	0.31
449_I	454_D	1.273	0.31
41_F	447_L	1.261	0.30
150_E	154_R	1.259	0.30
436_S	442_E	1.258	0.30
200_I	278_R	1.255	0.30
17_I	24_V	1.242	0.29
408_R	433_V	1.237	0.29
39_A	140_G	1.235	0.29
52_Y	439_Q	1.235	0.29
307_V	314_Q	1.232	0.29
159_N	392_N	1.232	0.29
291_L	295_Q	1.231	0.29
8_G	398_D	1.228	0.29
164_Q	394_L	1.227	0.29
271_V	435_L	1.206	0.28
296_C	381_E	1.205	0.28
474_N	477_G	1.198	0.28
4_R	114_A	1.191	0.28
240_S	294_R	1.188	0.28
217_R	448_A	1.187	0.28
298_V	442_E	1.183	0.27
272_L	329_V	1.183	0.27
355_V	437_V	1.179	0.27
379_A	410_M	1.168	0.27
211_I	446_Y	1.163	0.27
148_G	221_L	1.160	0.27
129_I	436_S	1.159	0.27
318_Q	333_A	1.155	0.27
340_L	402_V	1.153	0.26
56_W	266_I	1.147	0.26
322_D	326_R	1.146	0.26
76_P	408_R	1.144	0.26
266_I	336_W	1.140	0.26
419_Q	441_E	1.138	0.26
279_I	451_N	1.137	0.26
68_R	237_S	1.129	0.26
128_L	200_I	1.128	0.26
56_W	383_L	1.128	0.26
54_K	139_W	1.128	0.26
165_K	168_Y	1.123	0.25
479_T	485_H	1.117	0.25
80_N	84_V	1.115	0.25
473_R	477_G	1.114	0.25
91_N	192_V	1.113	0.25
104_F	233_F	1.110	0.25
400_G	403_L	1.109	0.25
117_G	421_V	1.105	0.25
313_K	326_R	1.098	0.25
162_A	224_S	1.096	0.25
24_V	120_I	1.092	0.24
159_N	430_I	1.090	0.24
36_M	120_I	1.085	0.24
36_M	221_L	1.078	0.24
77_R	156_R	1.078	0.24
481_G	485_H	1.077	0.24
271_V	319_N	1.077	0.24
67_V	75_R	1.075	0.24
184_E	353_W	1.073	0.24
54_K	144_E	1.072	0.24
192_V	474_N	1.069	0.24
299_F	330_Y	1.067	0.24
135_D	141_P	1.066	0.24
193_A	247_Y	1.065	0.24
47_K	362_Q	1.061	0.24
293_E	337_K	1.055	0.23
296_C	330_Y	1.053	0.23
97_I	140_G	1.053	0.23
182_L	435_L	1.053	0.23
412_M	443_M	1.052	0.23
405_A	408_R	1.050	0.23
87_K	140_G	1.042	0.23
47_K	50_I	1.040	0.23
298_V	334_M	1.039	0.23
309_E	313_K	1.036	0.23
177_M	456_F	1.034	0.23
278_R	298_V	1.030	0.23
60_E	318_Q	1.028	0.23
292_Y	353_W	1.024	0.22
352_V	448_A	1.021	0.22
479_T	483_G	1.021	0.22
88_I	254_Q	1.020	0.22
4_R	28_N	1.018	0.22
106_F	145_E	1.016	0.22
82_M	431_D	1.015	0.22
106_F	138_I	1.010	0.22
171_F	245_F	1.009	0.22
479_T	484_C	1.006	0.22
349_L	355_V	1.005	0.22
372_K	376_V	1.004	0.22
63_Q	93_V	1.004	0.22
28_N	120_I	1.003	0.22
122_T	279_I	0.999	0.22
346_Y	387_V	0.997	0.22
61_E	178_Y	0.995	0.22
352_V	359_S	0.993	0.22
115_P	149_G	0.985	0.21
63_Q	331_K	0.981	0.21
3_I	118_K	0.981	0.21
355_V	374_E	0.979	0.21
132_K	387_V	0.976	0.21
223_I	437_V	0.972	0.21
160_F	225_G	0.972	0.21
164_Q	392_N	0.968	0.21
313_K	335_D	0.967	0.21
331_K	335_D	0.962	0.21
182_L	245_F	0.961	0.21
318_Q	322_D	0.956	0.20
296_C	334_M	0.955	0.20
114_A	454_D	0.950	0.20
41_F	292_Y	0.948	0.20
96_Q	259_S	0.948	0.20
247_Y	409_M	0.947	0.20
256_T	352_V	0.946	0.20
415_Y	437_V	0.945	0.20
308_I	331_K	0.945	0.20
58_D	392_N	0.944	0.20
133_R	326_R	0.944	0.20
418_S	425_T	0.943	0.20
39_A	141_P	0.939	0.20
355_V	399_T	0.938	0.20
29_V	257_V	0.938	0.20
309_E	312_L	0.935	0.20
331_K	443_M	0.934	0.20
50_I	338_L	0.932	0.20
77_R	166_E	0.932	0.20
28_N	336_W	0.929	0.20
184_E	476_C	0.929	0.20
79_G	292_Y	0.928	0.20
177_M	394_L	0.927	0.20
46_T	52_Y	0.924	0.20
340_L	395_S	0.923	0.20
166_E	321_I	0.922	0.20
271_V	460_T	0.921	0.20
257_V	340_L	0.912	0.19
80_N	409_M	0.910	0.19
231_I	329_V	0.908	0.19
109_E	396_A	0.908	0.19
3_I	314_Q	0.907	0.19
415_Y	441_E	0.904	0.19
259_S	352_V	0.901	0.19
161_E	298_V	0.899	0.19
212_D	434_G	0.894	0.19
235_W	336_W	0.889	0.19
245_F	352_V	0.888	0.19
355_V	423_G	0.886	0.19
303_H	321_I	0.881	0.19
145_E	169_G	0.875	0.18
133_R	149_G	0.873	0.18
40_W	94_V	0.872	0.18
122_T	167_M	0.870	0.18
104_F	403_L	0.869	0.18
74_I	284_S	0.867	0.18
312_L	322_D	0.867	0.18
285_T	301_D	0.866	0.18
120_I	235_W	0.864	0.18
184_E	333_A	0.860	0.18
330_Y	337_K	0.858	0.18
325_Q	330_Y	0.858	0.18
91_N	224_S	0.856	0.18
128_L	472_E	0.855	0.18
144_E	477_G	0.854	0.18
61_E	113_S	0.852	0.18
297_E	334_M	0.851	0.18
41_F	129_I	0.851	0.18
365_A	370_L	0.848	0.18
333_A	447_L	0.847	0.18
250_I	269_L	0.847	0.18
329_V	338_L	0.844	0.18
47_K	477_G	0.844	0.18
319_N	377_L	0.843	0.18
107_D	452_Y	0.842	0.18
182_L	477_G	0.842	0.18
200_I	211_I	0.841	0.18
4_R	473_R	0.840	0.17
160_F	316_I	0.839	0.17
39_A	405_A	0.836	0.17
62_W	214_D	0.833	0.17
4_R	474_N	0.832	0.17
63_Q	94_V	0.832	0.17
257_V	261_T	0.828	0.17
96_Q	346_Y	0.827	0.17
478_F	483_G	0.825	0.17
71_N	298_V	0.823	0.17
94_V	411_A	0.822	0.17
290_D	293_E	0.819	0.17
261_T	338_L	0.819	0.17
411_A	433_V	0.813	0.17
24_V	260_E	0.812	0.17
82_M	86_T	0.809	0.17
98_D	138_I	0.807	0.17
78_L	93_V	0.806	0.17
223_I	263_V	0.805	0.17
337_K	431_D	0.805	0.17
144_E	247_Y	0.804	0.17
8_G	394_L	0.802	0.17
130_D	449_I	0.801	0.17
105_T	272_L	0.800	0.17
193_A	225_G	0.800	0.17
250_I	299_F	0.799	0.17
355_V	415_Y	0.798	0.16
73_K	454_D	0.796	0.16
408_R	430_I	0.796	0.16
410_M	478_F	0.793	0.16
7_V	355_V	0.793	0.16
387_V	399_T	0.791	0.16
112_H	332_M	0.789	0.16
105_T	240_S	0.789	0.16
271_V	296_C	0.789	0.16
76_P	145_E	0.788	0.16
93_V	224_S	0.788	0.16
8_G	184_E	0.788	0.16
140_G	254_Q	0.786	0.16
25_T	261_T	0.785	0.16
303_H	335_D	0.785	0.16
140_G	272_L	0.784	0.16
418_S	441_E	0.782	0.16
200_I	223_I	0.782	0.16
130_D	436_S	0.780	0.16
184_E	398_D	0.777	0.16
144_E	422_E	0.777	0.16
39_A	56_W	0.777	0.16
381_E	385_I	0.776	0.16
214_D	366_D	0.773	0.16
112_H	451_N	0.773	0.16
359_S	406_L	0.772	0.16
25_T	32_G	0.771	0.16
479_T	482_D	0.770	0.16
167_M	346_Y	0.770	0.16
184_E	256_T	0.769	0.16
28_N	363_S	0.767	0.16
125_P	233_F	0.767	0.16
118_K	383_L	0.765	0.16
93_V	141_P	0.765	0.16
244_I	252_S	0.764	0.16
331_K	336_W	0.761	0.16
401_P	404_R	0.760	0.16
8_G	212_D	0.759	0.16
325_Q	331_K	0.757	0.16
225_G	362_Q	0.757	0.16
82_M	129_I	0.756	0.16
192_V	254_Q	0.755	0.16
319_N	462_H	0.755	0.16
392_N	477_G	0.754	0.15
25_T	352_V	0.754	0.15
171_F	392_N	0.750	0.15
132_K	137_V	0.750	0.15
77_R	475_G	0.749	0.15
166_E	340_L	0.746	0.15
4_R	238_G	0.746	0.15
116_E	409_M	0.745	0.15
200_I	244_I	0.745	0.15
141_P	148_G	0.744	0.15
172_E	260_E	0.744	0.15
105_T	199_A	0.742	0.15
124_R	130_D	0.742	0.15
39_A	125_P	0.741	0.15
213_Q	350_P	0.739	0.15
175_F	447_L	0.737	0.15
128_L	231_I	0.737	0.15
78_L	194_T	0.736	0.15
373_S	376_V	0.735	0.15
56_W	477_G	0.734	0.15
414_H	432_E	0.731	0.15
308_I	330_Y	0.730	0.15
272_L	404_R	0.728	0.15
160_F	168_Y	0.728	0.15
244_I	261_T	0.725	0.15
200_I	245_F	0.725	0.15
158_R	295_Q	0.725	0.15
36_M	90_A	0.724	0.15
105_T	149_G	0.724	0.15
436_S	463_R	0.724	0.15
332_M	446_Y	0.723	0.15
25_T	412_M	0.723	0.15
24_V	261_T	0.723	0.15
98_D	115_P	0.722	0.15
285_T	290_D	0.721	0.15
370_L	378_P	0.720	0.15
271_V	292_Y	0.719	0.15
238_G	383_L	0.716	0.15
32_G	231_I	0.713	0.15
161_E	306_S	0.713	0.15
39_A	120_I	0.713	0.15
443_M	460_T	0.712	0.15
380_I	407_K	0.710	0.15
173_N	399_T	0.707	0.14
148_G	473_R	0.707	0.14
54_K	449_I	0.706	0.14
430_I	433_V	0.706	0.14
99_D	263_V	0.704	0.14
146_L	169_G	0.704	0.14
247_Y	457_V	0.703	0.14
349_L	408_R	0.702	0.14
40_W	433_V	0.701	0.14
409_M	447_L	0.701	0.14
159_N	372_K	0.701	0.14
3_I	300_L	0.700	0.14
364_Y	383_L	0.698	0.14
47_K	159_N	0.698	0.14
478_F	481_G	0.698	0.14
25_T	239_K	0.698	0.14
104_F	237_S	0.697	0.14
8_G	67_V	0.696	0.14
94_V	364_Y	0.692	0.14
192_V	278_R	0.690	0.14
67_V	194_T	0.690	0.14
159_N	373_S	0.690	0.14
266_I	332_M	0.690	0.14
104_F	416_M	0.689	0.14
240_S	320_V	0.689	0.14
154_R	194_T	0.689	0.14
148_G	383_L	0.688	0.14
94_V	238_G	0.687	0.14
29_V	261_T	0.687	0.14
303_H	331_K	0.686	0.14
310_E	316_I	0.686	0.14
289_V	398_D	0.686	0.14
165_K	340_L	0.685	0.14
81_K	369_G	0.684	0.14
469_A	482_D	0.684	0.14
245_F	430_I	0.684	0.14
378_P	477_G	0.682	0.14
115_P	393_M	0.682	0.14
272_L	285_T	0.680	0.14
56_W	271_V	0.680	0.14
77_R	463_R	0.679	0.14
122_T	190_S	0.676	0.14
308_I	321_I	0.676	0.14
170_Q	173_N	0.675	0.14
132_K	409_M	0.674	0.14
11_L	32_G	0.673	0.14
476_C	484_C	0.673	0.14
281_E	303_H	0.672	0.14
318_Q	321_I	0.672	0.14
154_R	169_G	0.671	0.14
2_K	326_R	0.667	0.14
122_T	466_A	0.667	0.14
214_D	394_L	0.666	0.14
120_I	141_P	0.666	0.14
129_I	378_P	0.664	0.14
76_P	86_T	0.664	0.14
67_V	436_S	0.662	0.14
438_A	441_E	0.662	0.14
129_I	259_S	0.662	0.14
296_C	333_A	0.661	0.14
133_R	145_E	0.660	0.14
240_S	473_R	0.659	0.14
260_E	452_Y	0.658	0.13
94_V	221_L	0.658	0.13
60_E	278_R	0.658	0.13
77_R	113_S	0.658	0.13
208_I	250_I	0.657	0.13
150_E	153_K	0.657	0.13
70_V	278_R	0.657	0.13
137_V	247_Y	0.656	0.13
476_C	479_T	0.656	0.13
172_E	462_H	0.655	0.13
29_V	349_L	0.654	0.13
116_E	134_M	0.654	0.13
382_S	414_H	0.654	0.13
160_F	296_C	0.652	0.13
394_L	402_V	0.651	0.13
212_D	255_P	0.651	0.13
237_S	322_D	0.651	0.13
107_D	387_V	0.647	0.13
150_E	156_R	0.646	0.13
4_R	29_V	0.646	0.13
224_S	380_I	0.646	0.13
169_G	469_A	0.646	0.13
109_E	200_I	0.645	0.13
381_E	468_D	0.643	0.13
184_E	260_E	0.643	0.13
98_D	463_R	0.641	0.13
467_G	472_E	0.641	0.13
429_A	432_E	0.641	0.13
223_I	361_I	0.639	0.13
6_Q	10_V	0.638	0.13
193_A	375_G	0.638	0.13
394_L	477_G	0.638	0.13
106_F	112_H	0.638	0.13
81_K	266_I	0.637	0.13
106_F	422_E	0.637	0.13
427_T	430_I	0.635	0.13
322_D	387_V	0.634	0.13
61_E	326_R	0.634	0.13
58_D	281_E	0.633	0.13
187_L	298_V	0.633	0.13
76_P	83_G	0.632	0.13
117_G	148_G	0.632	0.13
259_S	359_S	0.632	0.13
297_E	475_G	0.631	0.13
244_I	338_L	0.630	0.13
293_E	299_F	0.629	0.13
256_T	359_S	0.628	0.13
466_A	469_A	0.628	0.13
76_P	259_S	0.628	0.13
97_I	401_P	0.627	0.13
392_N	462_H	0.626	0.13
306_S	426_D	0.625	0.13
166_E	402_V	0.623	0.13
171_F	448_A	0.622	0.13
255_P	260_E	0.621	0.13
331_K	337_K	0.621	0.13
172_E	457_V	0.620	0.13
94_V	383_L	0.619	0.13
8_G	250_I	0.618	0.13
194_T	318_Q	0.618	0.13
76_P	401_P	0.617	0.13
2_K	87_K	0.617	0.13
261_T	352_V	0.617	0.13
94_V	254_Q	0.617	0.13
427_T	438_A	0.616	0.13
160_F	362_Q	0.614	0.13
79_G	353_W	0.612	0.13
394_L	480_F	0.612	0.13
305_P	346_Y	0.610	0.13
171_F	435_L	0.608	0.13
225_G	240_S	0.608	0.13
24_V	399_T	0.608	0.13
27_K	95_P	0.607	0.13
200_I	240_S	0.607	0.13
187_L	247_Y	0.607	0.13
235_W	378_P	0.606	0.12
233_F	410_M	0.605	0.12
288_E	321_I	0.605	0.12
81_K	120_I	0.605	0.12
164_Q	168_Y	0.601	0.12
392_N	430_I	0.600	0.12
175_F	259_S	0.599	0.12
367_A	377_L	0.598	0.12
77_R	287_R	0.598	0.12
168_Y	279_I	0.598	0.12
377_L	402_V	0.597	0.12
61_E	313_K	0.597	0.12
193_A	454_D	0.596	0.12
119_H	340_L	0.595	0.12
7_V	272_L	0.594	0.12
237_S	261_T	0.594	0.12
161_E	164_Q	0.593	0.12
105_T	128_L	0.593	0.12
175_F	450_A	0.592	0.12
120_I	192_V	0.592	0.12
260_E	443_M	0.591	0.12
151_F	160_F	0.591	0.12
4_R	56_W	0.590	0.12
176_M	245_F	0.590	0.12
359_S	452_Y	0.590	0.12
158_R	340_L	0.590	0.12
377_L	380_I	0.589	0.12
69_D	73_K	0.588	0.12
80_N	214_D	0.588	0.12
77_R	278_R	0.588	0.12
12_N	175_F	0.588	0.12
441_E	449_I	0.588	0.12
257_V	381_E	0.588	0.12
4_R	363_S	0.588	0.12
87_K	141_P	0.587	0.12
182_L	321_I	0.587	0.12
151_F	168_Y	0.587	0.12
134_M	138_I	0.586	0.12
24_V	291_L	0.585	0.12
73_K	326_R	0.585	0.12
221_L	401_P	0.585	0.12
175_F	359_S	0.584	0.12
107_D	110_H	0.584	0.12
61_E	419_Q	0.584	0.12
363_S	394_L	0.583	0.12
15_K	30_W	0.583	0.12
144_E	151_F	0.582	0.12
279_I	362_Q	0.581	0.12
160_F	388_Q	0.580	0.12
338_L	408_R	0.579	0.12
3_I	6_Q	0.579	0.12
47_K	93_V	0.578	0.12
70_V	289_V	0.578	0.12
10_V	14_D	0.577	0.12
10_V	217_R	0.577	0.12
137_V	174_T	0.573	0.12
245_F	470_F	0.572	0.12
94_V	279_I	0.572	0.12
152_E	355_V	0.571	0.12
70_V	82_M	0.570	0.12
415_Y	428_R	0.570	0.12
32_G	84_V	0.570	0.12
286_E	325_Q	0.569	0.12
166_E	257_V	0.569	0.12
131_G	187_L	0.569	0.12
214_D	218_G	0.569	0.12
4_R	235_W	0.569	0.12
184_E	352_V	0.568	0.12
25_T	259_S	0.568	0.12
160_F	403_L	0.566	0.12
272_L	325_Q	0.566	0.12
388_Q	405_A	0.566	0.12
161_E	430_I	0.565	0.12
77_R	458_I	0.565	0.12
155_A	165_K	0.564	0.12
75_R	87_K	0.563	0.12
373_S	402_V	0.563	0.12
2_K	383_L	0.563	0.12
88_I	388_Q	0.562	0.12
50_I	171_F	0.560	0.12
298_V	313_K	0.560	0.12
189_P	396_A	0.560	0.12
88_I	208_I	0.559	0.12
257_V	352_V	0.559	0.12
39_A	114_A	0.558	0.12
349_L	376_V	0.555	0.12
118_K	409_M	0.554	0.12
233_F	368_G	0.554	0.12
177_M	208_I	0.553	0.12
361_I	378_P	0.553	0.12
167_M	421_V	0.552	0.12
11_L	184_E	0.551	0.12
238_G	411_A	0.550	0.11
272_L	349_L	0.547	0.11
7_V	118_K	0.546	0.11
337_K	408_R	0.546	0.11
84_V	88_I	0.546	0.11
12_N	450_A	0.544	0.11
245_F	467_G	0.544	0.11
60_E	80_N	0.542	0.11
221_L	481_G	0.541	0.11
76_P	122_T	0.540	0.11
154_R	160_F	0.538	0.11
427_T	436_S	0.537	0.11
79_G	352_V	0.537	0.11
94_V	399_T	0.537	0.11
159_N	376_V	0.535	0.11
80_N	411_A	0.531	0.11
32_G	107_D	0.530	0.11
62_W	353_W	0.530	0.11
184_E	394_L	0.530	0.11
59_Q	229_K	0.529	0.11
97_I	269_L	0.529	0.11
56_W	456_F	0.528	0.11
24_V	314_Q	0.527	0.11
265_R	353_W	0.527	0.11
81_K	155_A	0.527	0.11
137_V	163_M	0.527	0.11
177_M	299_F	0.526	0.11
67_V	329_V	0.526	0.11
112_H	160_F	0.526	0.11
254_Q	338_L	0.526	0.11
163_M	387_V	0.526	0.11
257_V	260_E	0.525	0.11
430_I	436_S	0.525	0.11
290_D	442_E	0.525	0.11
333_A	353_W	0.524	0.11
62_W	146_L	0.523	0.11
58_D	94_V	0.523	0.11
14_D	20_H	0.522	0.11
78_L	94_V	0.521	0.11
393_M	432_E	0.521	0.11
88_I	236_K	0.521	0.11
245_F	484_C	0.520	0.11
81_K	115_P	0.520	0.11
25_T	256_T	0.520	0.11
13_L	22_C	0.519	0.11
13_L	19_C	0.519	0.11
16_C	19_C	0.519	0.11
19_C	22_C	0.519	0.11
16_C	22_C	0.519	0.11
13_L	16_C	0.519	0.11
126_R	319_N	0.518	0.11
138_I	374_E	0.518	0.11
237_S	377_L	0.518	0.11
109_E	475_G	0.517	0.11
194_T	380_I	0.517	0.11
290_D	415_Y	0.517	0.11
240_S	440_V	0.515	0.11
427_T	431_D	0.513	0.11
171_F	175_F	0.513	0.11
166_E	306_S	0.512	0.11
104_F	112_H	0.512	0.11
418_S	423_G	0.509	0.11
336_W	421_V	0.509	0.11
97_I	288_E	0.509	0.11
259_S	460_T	0.509	0.11
309_E	314_Q	0.509	0.11
150_E	171_F	0.509	0.11
106_F	148_G	0.508	0.11
166_E	308_I	0.508	0.11
156_R	296_C	0.508	0.11
133_R	170_Q	0.506	0.11
158_R	377_L	0.505	0.11
97_I	259_S	0.505	0.11
50_I	114_A	0.504	0.11
1_M	6_Q	0.504	0.11
141_P	468_D	0.503	0.11
184_E	292_Y	0.503	0.11
70_V	346_Y	0.501	0.11
470_F	478_F	0.501	0.11
221_L	238_G	0.501	0.11
109_E	237_S	0.500	0.11
55_N	161_E	0.500	0.11
63_Q	313_K	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1q16B	2	0.9883	100	0.456	Contact Map
2ivfB	1	0.6556	100	0.718	Contact Map
1ti6B	2	0.5195	100	0.901	Contact Map
1h0hB	1	0.4027	99.9	0.912	Contact Map
2vpzB	2	0.3735	99.9	0.912	Contact Map
1kqfB	3	0.4903	99.9	0.917	Contact Map
4z3xE	2	0.3268	99.5	0.946	Contact Map
1jnrB	1	0.2724	99.4	0.95	Contact Map
3mm5B	2	0.5097	99.2	0.954	Contact Map
3gyxB	1	0.2977	99.1	0.956	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0129 seconds.