CSTA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

CSTA - Carbon starvation protein A

UniProt:	P15078	Sequences: MNKSGKYLVWTVLSVMGAFALGYIALNRGEQINALWIVVASVCIYLIAYRFYGLYIAKNVLAVDPTRMTPAVRHNDGLDYVPTDKKVLFGHHFAAIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGMIWLLAGVVLAGAVQDFMVLFVSTRRDGRSLGELVKEEMGPTAGVIALVACFMIMVIILAVLAMIVVKALTHSPWGTYTVAFTIPLALFMGIYLRYLRPGRIGEVSVIGLVFLIFAIISGGWVAESPTWAPYFDFTGVQLTWMLVGYGFVAAVLPVWLLLAPRDYLSTFLKIGTIVGLAVGILIMRPTLTMPALTKFVDGTGPVWTGNLFPFLFITIACGAVSGFHALISSGTTPKMLANEGQACFIGYGGMLMESFVAIMALVSACIIDPGVYFAMNSPMAVLAPAGTADVVASAAQVVSSWGFSITPDTLNQIASEVGEQSIISRAGGAPTLAVGMAYILHGALGGMMDVAFWYHFAILFEALFILTAVDAGTRAARFMLQDLLGVVSPGLKRTDSLPANLLATALCVLAWGYFLHQGVVDPLGGINTLWPLFGIANQMLAGMALMLCAVVLFKMKRQRYAWVALVPTAWLLICTLTAGWQKAFSPDAKVGFLAIANKFQAMIDSGNIPSQYTESQLAQLVFNNRLDAGLTIFFMVVVVVLALFSIKTALAALKDPKPTAKETPYEPMPENVEEIVAQAKGAH	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10167
Length:	701 (671)
Sequences:	633 (245)
Seq/√Len:	9.5

ECOLI - CSTA YJIY
BACSU - CSTA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
613_I	642_N	6.444	1.00
430_Q	434_E	4.893	1.00
133_F	360_A	4.837	1.00
53_G	361_C	4.698	1.00
65_P	356_N	4.339	0.99
226_L	230_I	4.298	0.99
634_Q	637_Q	4.286	0.99
45_Y	372_S	4.105	0.99
174_I	486_A	3.951	0.98
251_F	259_M	3.870	0.98
120_L	375_A	3.800	0.98
118_I	122_A	3.758	0.98
494_A	525_C	3.737	0.98
204_L	208_I	3.725	0.98
502_L	509_L	3.707	0.97
411_S	415_V	3.688	0.97
288_I	370_M	3.582	0.97
151_V	565_L	3.543	0.97
567_A	582_A	3.433	0.96
509_L	520_L	3.358	0.95
456_Y	468_V	3.303	0.95
208_I	274_L	3.232	0.94
186_L	192_G	3.073	0.93
627_P	635_L	3.006	0.92
640_F	644_L	2.962	0.91
65_P	358_G	2.942	0.91
252_T	255_Q	2.906	0.90
61_L	134_M	2.883	0.90
560_G	590_L	2.858	0.89
135_V	566_C	2.840	0.89
595_T	599_Q	2.806	0.89
621_I	639_V	2.766	0.88
629_Q	635_L	2.709	0.87
355_A	359_Q	2.681	0.86
76_D	513_D	2.648	0.85
22_G	32_I	2.644	0.85
416_V	419_W	2.585	0.84
514_S	517_A	2.559	0.83
42_V	46_L	2.556	0.83
135_V	486_A	2.540	0.83
620_M	629_Q	2.502	0.82
307_M	311_T	2.500	0.82
617_F	635_L	2.411	0.79
24_I	27_N	2.411	0.79
576_Q	671_L	2.397	0.79
400_L	442_S	2.389	0.79
601_A	649_T	2.366	0.78
245_W	248_Y	2.347	0.77
611_L	646_A	2.345	0.77
44_I	125_V	2.338	0.77
17_G	43_C	2.325	0.77
140_T	354_L	2.295	0.76
47_I	121_L	2.292	0.76
168_F	498_L	2.286	0.75
258_W	262_G	2.278	0.75
75_N	82_P	2.273	0.75
621_I	636_A	2.231	0.73
43_C	125_V	2.223	0.73
235_S	238_W	2.209	0.73
189_S	473_H	2.203	0.72
242_S	247_P	2.194	0.72
393_M	452_V	2.164	0.71
268_A	522_T	2.150	0.71
124_V	129_A	2.139	0.70
508_G	511_R	2.134	0.70
305_L	383_C	2.123	0.70
617_F	629_Q	2.091	0.68
13_L	47_I	2.071	0.68
626_I	635_L	2.057	0.67
590_L	660_A	2.051	0.67
486_A	493_A	2.051	0.67
621_I	632_E	2.038	0.66
568_V	667_A	2.037	0.66
400_L	441_I	2.030	0.66
7_Y	51_F	2.016	0.65
345_I	486_A	1.992	0.64
22_G	26_L	1.947	0.63
561_M	607_K	1.944	0.62
53_G	63_V	1.928	0.62
174_I	487_V	1.919	0.61
44_I	121_L	1.897	0.60
167_C	486_A	1.892	0.60
258_W	527_L	1.888	0.60
57_A	63_V	1.882	0.60
620_M	635_L	1.864	0.59
284_T	345_I	1.850	0.58
188_H	250_D	1.848	0.58
619_A	622_D	1.820	0.57
626_I	638_L	1.816	0.57
611_L	643_R	1.812	0.57
415_V	419_W	1.806	0.56
166_A	655_V	1.804	0.56
259_M	262_G	1.802	0.56
10_W	388_G	1.793	0.56
618_Q	622_D	1.793	0.56
168_F	525_C	1.788	0.56
33_N	302_R	1.786	0.56
668_L	672_K	1.781	0.55
242_S	245_W	1.778	0.55
594_L	653_M	1.777	0.55
354_L	360_A	1.776	0.55
571_F	579_A	1.773	0.55
74_H	143_D	1.769	0.55
392_A	428_L	1.768	0.55
564_M	663_S	1.756	0.54
86_K	362_F	1.755	0.54
507_P	510_K	1.747	0.54
412_A	416_V	1.744	0.54
62_A	575_R	1.741	0.54
85_K	359_Q	1.739	0.54
14_S	18_A	1.715	0.52
193_T	256_L	1.715	0.52
524_L	652_F	1.709	0.52
172_V	528_A	1.709	0.52
343_A	486_A	1.688	0.51
338_V	589_L	1.687	0.51
63_V	133_F	1.685	0.51
367_G	450_L	1.684	0.51
202_L	228_F	1.680	0.51
214_R	220_E	1.674	0.51
603_S	608_V	1.673	0.51
165_V	181_I	1.665	0.50
174_I	493_A	1.626	0.48
616_K	627_P	1.615	0.48
205_F	224_I	1.613	0.48
570_L	582_A	1.608	0.48
494_A	498_L	1.606	0.48
38_V	380_V	1.606	0.48
571_F	667_A	1.599	0.47
73_R	143_D	1.596	0.47
126_L	584_V	1.595	0.47
126_L	140_T	1.584	0.47
57_A	133_F	1.570	0.46
248_Y	251_F	1.566	0.46
138_V	569_V	1.560	0.46
60_V	570_L	1.552	0.45
145_R	153_E	1.552	0.45
145_R	196_V	1.546	0.45
7_Y	46_L	1.546	0.45
61_L	137_F	1.537	0.45
617_F	620_M	1.533	0.44
148_G	543_G	1.518	0.44
88_L	353_M	1.507	0.43
393_M	449_T	1.505	0.43
106_V	449_T	1.497	0.43
174_I	345_I	1.496	0.43
414_Q	618_Q	1.490	0.42
9_V	15_V	1.489	0.42
662_F	665_K	1.489	0.42
477_L	557_M	1.481	0.42
345_I	487_V	1.468	0.42
20_A	43_C	1.444	0.40
22_G	633_S	1.433	0.40
224_I	228_F	1.431	0.40
121_L	256_L	1.431	0.40
59_N	85_K	1.428	0.40
151_V	521_A	1.420	0.39
393_M	450_L	1.408	0.39
486_A	554_A	1.407	0.39
106_V	656_V	1.406	0.39
620_M	627_P	1.405	0.39
196_V	507_P	1.401	0.39
615_N	619_A	1.400	0.39
145_R	510_K	1.396	0.38
298_I	377_M	1.392	0.38
422_S	425_P	1.389	0.38
673_D	678_A	1.378	0.38
265_F	269_V	1.377	0.38
437_E	473_H	1.374	0.38
518_N	521_A	1.368	0.37
166_A	557_M	1.365	0.37
246_A	296_V	1.362	0.37
133_F	535_Q	1.361	0.37
434_E	465_M	1.353	0.37
106_V	175_L	1.352	0.37
661_L	664_I	1.351	0.37
72_V	355_A	1.350	0.37
48_A	251_F	1.342	0.36
620_M	631_T	1.334	0.36
611_L	642_N	1.328	0.36
241_E	439_S	1.324	0.35
296_V	434_E	1.319	0.35
246_A	250_D	1.318	0.35
498_L	525_C	1.315	0.35
594_L	657_V	1.313	0.35
370_M	486_A	1.311	0.35
269_V	554_A	1.307	0.35
566_C	575_R	1.307	0.35
19_F	23_Y	1.298	0.34
54_L	486_A	1.298	0.34
631_T	634_Q	1.290	0.34
645_D	667_A	1.284	0.34
636_A	639_V	1.283	0.34
611_L	647_G	1.281	0.34
103_V	181_I	1.275	0.33
16_M	292_V	1.270	0.33
498_L	521_A	1.266	0.33
12_V	16_M	1.266	0.33
98_G	481_L	1.264	0.33
217_R	220_E	1.262	0.33
401_A	408_V	1.256	0.33
177_V	547_L	1.250	0.32
603_S	609_G	1.240	0.32
39_V	43_C	1.236	0.32
149_E	504_V	1.233	0.32
632_E	636_A	1.232	0.32
221_V	258_W	1.225	0.32
345_I	528_A	1.224	0.31
42_V	370_M	1.223	0.31
265_F	523_A	1.220	0.31
393_M	431_I	1.219	0.31
117_M	379_L	1.208	0.31
231_F	577_R	1.206	0.31
400_L	415_V	1.201	0.31
21_L	592_C	1.200	0.31
324_N	599_Q	1.198	0.30
205_F	213_L	1.187	0.30
196_V	592_C	1.180	0.30
165_V	651_F	1.178	0.30
9_V	13_L	1.178	0.30
614_A	643_R	1.177	0.30
647_G	651_F	1.175	0.30
16_M	310_L	1.174	0.30
458_L	667_A	1.172	0.30
209_Y	214_R	1.166	0.29
509_L	517_A	1.165	0.29
174_I	177_V	1.164	0.29
196_V	321_W	1.163	0.29
296_V	300_I	1.163	0.29
224_I	346_S	1.163	0.29
620_M	630_Y	1.163	0.29
286_L	477_L	1.161	0.29
375_A	592_C	1.157	0.29
626_I	632_E	1.156	0.29
135_V	343_A	1.154	0.29
84_D	431_I	1.147	0.29
393_M	639_V	1.146	0.29
362_F	367_G	1.145	0.29
532_F	610_F	1.145	0.29
53_G	505_V	1.143	0.28
481_L	565_L	1.137	0.28
37_I	305_L	1.132	0.28
41_S	376_I	1.131	0.28
43_C	487_V	1.128	0.28
292_V	299_L	1.118	0.28
227_V	230_I	1.118	0.28
254_V	258_W	1.117	0.28
389_V	431_I	1.115	0.27
140_T	458_L	1.113	0.27
669_A	673_D	1.113	0.27
244_T	247_P	1.112	0.27
177_V	454_M	1.111	0.27
243_P	622_D	1.109	0.27
32_I	221_V	1.106	0.27
455_A	468_V	1.106	0.27
64_D	388_G	1.103	0.27
22_G	37_I	1.103	0.27
59_N	80_Y	1.103	0.27
143_D	681_T	1.100	0.27
118_I	307_M	1.095	0.27
131_Q	553_I	1.095	0.27
642_N	647_G	1.092	0.27
620_M	638_L	1.091	0.27
628_S	635_L	1.090	0.27
149_E	477_L	1.090	0.27
177_V	656_V	1.089	0.27
458_L	494_A	1.088	0.27
618_Q	678_A	1.087	0.26
286_L	557_M	1.085	0.26
346_S	367_G	1.083	0.26
172_V	309_A	1.081	0.26
212_Y	232_A	1.080	0.26
99_A	111_M	1.077	0.26
228_F	231_F	1.077	0.26
328_F	544_I	1.075	0.26
235_S	511_R	1.072	0.26
46_L	380_V	1.062	0.26
400_L	419_W	1.061	0.26
46_L	345_I	1.060	0.26
635_L	670_A	1.059	0.26
664_I	668_L	1.056	0.25
415_V	418_S	1.055	0.25
617_F	631_T	1.049	0.25
88_L	99_A	1.046	0.25
135_V	174_I	1.044	0.25
179_A	486_A	1.043	0.25
150_L	321_W	1.043	0.25
637_Q	640_F	1.039	0.25
63_V	645_D	1.038	0.25
643_R	647_G	1.038	0.25
416_V	640_F	1.038	0.25
80_Y	205_F	1.037	0.25
640_F	647_G	1.037	0.25
621_I	673_D	1.034	0.25
204_L	251_F	1.034	0.25
7_Y	11_T	1.030	0.25
614_A	642_N	1.025	0.24
20_A	363_I	1.025	0.24
583_L	587_A	1.024	0.24
210_L	221_V	1.023	0.24
24_I	32_I	1.021	0.24
62_A	233_I	1.021	0.24
387_P	610_F	1.020	0.24
257_T	493_A	1.020	0.24
616_K	629_Q	1.020	0.24
262_G	266_V	1.018	0.24
626_I	639_V	1.012	0.24
85_K	356_N	1.010	0.24
187_T	253_G	1.009	0.24
196_V	359_Q	1.004	0.24
431_I	468_V	1.004	0.24
206_M	268_A	1.003	0.24
242_S	622_D	1.002	0.24
389_V	423_I	0.995	0.23
134_M	566_C	0.993	0.23
10_W	64_D	0.992	0.23
493_A	592_C	0.984	0.23
613_I	643_R	0.984	0.23
665_K	669_A	0.983	0.23
58_K	140_T	0.982	0.23
37_I	117_M	0.982	0.23
189_S	437_E	0.976	0.23
88_L	363_I	0.973	0.23
419_W	441_I	0.971	0.23
616_K	620_M	0.971	0.23
409_V	413_A	0.969	0.23
393_M	606_A	0.965	0.22
162_I	658_V	0.963	0.22
486_A	608_V	0.962	0.22
629_Q	638_L	0.957	0.22
21_L	477_L	0.955	0.22
14_S	47_I	0.953	0.22
426_D	661_L	0.953	0.22
86_K	486_A	0.950	0.22
613_I	616_K	0.948	0.22
60_V	581_V	0.945	0.22
127_A	509_L	0.943	0.22
266_V	505_V	0.942	0.22
661_L	665_K	0.939	0.22
21_L	548_W	0.939	0.22
434_E	468_V	0.939	0.22
44_I	126_L	0.938	0.22
16_M	43_C	0.934	0.22
17_G	487_V	0.934	0.22
548_W	614_A	0.932	0.21
277_A	377_M	0.932	0.21
625_N	635_L	0.931	0.21
524_L	657_V	0.930	0.21
55_Y	59_N	0.929	0.21
187_T	547_L	0.927	0.21
223_V	461_A	0.926	0.21
14_S	22_G	0.925	0.21
617_F	627_P	0.924	0.21
601_A	646_A	0.919	0.21
97_A	487_V	0.917	0.21
458_L	568_V	0.916	0.21
21_L	24_I	0.915	0.21
23_Y	676_P	0.914	0.21
499_Q	531_Y	0.912	0.21
16_M	24_I	0.912	0.21
118_I	573_M	0.907	0.21
15_V	644_L	0.904	0.21
174_I	290_T	0.903	0.21
233_I	670_A	0.901	0.21
233_I	522_T	0.900	0.20
85_K	152_K	0.899	0.20
184_K	253_G	0.899	0.20
54_L	58_K	0.899	0.20
206_M	229_L	0.898	0.20
632_E	635_L	0.897	0.20
667_A	671_L	0.896	0.20
363_I	435_V	0.896	0.20
33_N	258_W	0.895	0.20
561_M	623_S	0.891	0.20
85_K	244_T	0.890	0.20
615_N	622_D	0.888	0.20
85_K	133_F	0.888	0.20
590_L	594_L	0.886	0.20
635_L	638_L	0.885	0.20
354_L	546_T	0.884	0.20
310_L	355_A	0.884	0.20
65_P	140_T	0.883	0.20
245_W	254_V	0.883	0.20
15_V	636_A	0.880	0.20
175_L	269_V	0.880	0.20
127_A	515_L	0.879	0.20
41_S	45_Y	0.878	0.20
627_P	642_N	0.876	0.20
242_S	246_A	0.875	0.20
61_L	172_V	0.874	0.20
266_V	370_M	0.873	0.20
645_D	649_T	0.873	0.20
13_L	241_E	0.871	0.20
50_R	107_L	0.869	0.20
284_T	526_V	0.868	0.20
162_I	655_V	0.868	0.20
627_P	630_Y	0.864	0.19
99_A	428_L	0.864	0.19
268_A	408_V	0.863	0.19
188_H	193_T	0.861	0.19
257_T	260_L	0.859	0.19
412_A	645_D	0.858	0.19
509_L	653_M	0.857	0.19
306_T	386_D	0.855	0.19
234_I	463_G	0.855	0.19
195_T	548_W	0.854	0.19
23_Y	584_V	0.854	0.19
624_G	629_Q	0.853	0.19
231_F	661_L	0.851	0.19
16_M	304_T	0.847	0.19
253_G	363_I	0.845	0.19
329_L	440_I	0.843	0.19
499_Q	512_T	0.841	0.19
99_A	470_F	0.840	0.19
296_V	505_V	0.837	0.19
300_I	619_A	0.837	0.19
194_Y	198_F	0.836	0.19
150_L	167_C	0.836	0.19
151_V	662_F	0.833	0.19
295_A	373_F	0.833	0.19
17_G	20_A	0.833	0.19
639_V	678_A	0.832	0.19
619_A	637_Q	0.830	0.19
72_V	159_A	0.829	0.19
7_Y	140_T	0.828	0.18
111_M	470_F	0.827	0.18
45_Y	82_P	0.825	0.18
343_A	664_I	0.824	0.18
627_P	632_E	0.824	0.18
205_F	209_Y	0.824	0.18
514_S	521_A	0.823	0.18
55_Y	578_Y	0.822	0.18
560_G	634_Q	0.822	0.18
159_A	662_F	0.820	0.18
53_G	517_A	0.819	0.18
415_V	532_F	0.818	0.18
180_M	545_N	0.816	0.18
168_F	667_A	0.812	0.18
307_M	383_C	0.812	0.18
253_G	537_V	0.808	0.18
625_N	630_Y	0.808	0.18
300_I	661_L	0.807	0.18
514_S	557_M	0.807	0.18
48_A	293_G	0.805	0.18
98_G	179_A	0.803	0.18
243_P	455_A	0.803	0.18
508_G	672_K	0.802	0.18
624_G	632_E	0.801	0.18
673_D	677_T	0.801	0.18
155_M	565_L	0.799	0.18
527_L	661_L	0.798	0.18
134_M	582_A	0.797	0.18
84_D	639_V	0.796	0.18
616_K	678_A	0.794	0.18
187_T	250_D	0.793	0.18
175_L	416_V	0.790	0.17
410_A	649_T	0.790	0.17
80_Y	681_T	0.786	0.17
168_F	181_I	0.785	0.17
409_V	414_Q	0.785	0.17
68_M	504_V	0.785	0.17
232_A	249_F	0.784	0.17
667_A	670_A	0.784	0.17
290_T	343_A	0.783	0.17
258_W	261_V	0.783	0.17
8_L	639_V	0.783	0.17
249_F	277_A	0.781	0.17
212_Y	252_T	0.780	0.17
598_W	653_M	0.778	0.17
51_F	150_L	0.775	0.17
233_I	678_A	0.771	0.17
174_I	608_V	0.771	0.17
662_F	666_T	0.769	0.17
619_A	630_Y	0.767	0.17
630_Y	635_L	0.766	0.17
21_L	195_T	0.765	0.17
170_I	174_I	0.764	0.17
213_L	457_I	0.763	0.17
198_F	255_Q	0.762	0.17
72_V	120_L	0.761	0.17
20_A	605_D	0.761	0.17
23_Y	411_S	0.761	0.17
59_N	433_S	0.758	0.17
175_L	635_L	0.757	0.17
660_A	669_A	0.756	0.17
124_V	131_Q	0.754	0.17
192_G	481_L	0.751	0.17
353_M	457_I	0.749	0.16
167_C	505_V	0.749	0.16
97_A	550_L	0.749	0.16
103_V	470_F	0.748	0.16
32_I	304_T	0.748	0.16
10_W	13_L	0.748	0.16
64_D	137_F	0.747	0.16
18_A	384_I	0.747	0.16
47_I	486_A	0.747	0.16
290_T	454_M	0.746	0.16
297_G	459_H	0.745	0.16
117_M	493_A	0.744	0.16
99_A	487_V	0.741	0.16
353_M	584_V	0.740	0.16
116_G	450_L	0.740	0.16
330_F	593_T	0.739	0.16
138_V	566_C	0.739	0.16
372_S	474_F	0.739	0.16
23_Y	27_N	0.738	0.16
466_M	575_R	0.738	0.16
8_L	292_V	0.737	0.16
151_V	590_L	0.737	0.16
567_A	579_A	0.737	0.16
261_V	527_L	0.736	0.16
151_V	159_A	0.735	0.16
541_L	634_Q	0.735	0.16
14_S	584_V	0.734	0.16
16_M	367_G	0.734	0.16
616_K	632_E	0.734	0.16
533_L	547_L	0.734	0.16
242_S	248_Y	0.734	0.16
152_K	553_I	0.733	0.16
500_D	533_L	0.731	0.16
11_T	452_V	0.731	0.16
18_A	22_G	0.731	0.16
494_A	626_I	0.731	0.16
347_S	533_L	0.731	0.16
337_A	343_A	0.730	0.16
31_Q	304_T	0.728	0.16
635_L	639_V	0.728	0.16
164_L	213_L	0.727	0.16
454_M	486_A	0.727	0.16
269_V	647_G	0.727	0.16
260_L	408_V	0.726	0.16
467_D	635_L	0.726	0.16
116_G	152_K	0.724	0.16
158_T	245_W	0.724	0.16
121_L	620_M	0.723	0.16
617_F	639_V	0.722	0.16
234_I	509_L	0.722	0.16
414_Q	418_S	0.722	0.16
617_F	634_Q	0.722	0.16
465_M	619_A	0.722	0.16
477_L	586_T	0.721	0.16
48_A	234_I	0.721	0.16
314_V	359_Q	0.720	0.16
367_G	650_I	0.720	0.16
522_T	525_C	0.720	0.16
232_A	235_S	0.719	0.16
416_V	441_I	0.719	0.16
39_V	126_L	0.719	0.16
179_A	487_V	0.718	0.16
135_V	645_D	0.718	0.16
344_L	572_K	0.718	0.16
142_R	326_F	0.718	0.16
459_H	463_G	0.717	0.16
546_T	549_P	0.716	0.16
57_A	570_L	0.716	0.16
640_F	645_D	0.715	0.16
604_P	619_A	0.715	0.16
61_L	566_C	0.715	0.16
35_L	302_R	0.713	0.16
617_F	628_S	0.712	0.16
232_A	590_L	0.711	0.16
277_A	489_A	0.710	0.16
88_L	206_M	0.709	0.15
166_A	192_G	0.708	0.15
180_M	629_Q	0.708	0.15
117_M	441_I	0.708	0.15
66_T	205_F	0.707	0.15
159_A	577_R	0.706	0.15
557_M	601_A	0.706	0.15
619_A	623_S	0.705	0.15
14_S	644_L	0.705	0.15
234_I	435_V	0.704	0.15
9_V	626_I	0.704	0.15
564_M	660_A	0.703	0.15
223_V	433_S	0.702	0.15
675_K	679_K	0.702	0.15
616_K	626_I	0.702	0.15
177_V	290_T	0.702	0.15
265_F	544_I	0.701	0.15
172_V	235_S	0.700	0.15
85_K	653_M	0.700	0.15
354_L	457_I	0.699	0.15
329_L	522_T	0.697	0.15
117_M	121_L	0.697	0.15
610_F	640_F	0.694	0.15
189_S	326_F	0.693	0.15
9_V	14_S	0.691	0.15
397_M	401_A	0.691	0.15
63_V	601_A	0.690	0.15
557_M	655_V	0.690	0.15
218_I	356_N	0.690	0.15
470_F	487_V	0.689	0.15
165_V	679_K	0.688	0.15
354_L	367_G	0.688	0.15
163_A	565_L	0.688	0.15
183_V	374_V	0.686	0.15
23_Y	212_Y	0.686	0.15
193_T	610_F	0.686	0.15
410_A	637_Q	0.684	0.15
172_V	341_F	0.684	0.15
610_F	645_D	0.682	0.15
512_T	518_N	0.681	0.15
514_S	586_T	0.680	0.15
554_A	581_V	0.679	0.15
626_I	631_T	0.679	0.15
413_A	417_S	0.679	0.15
55_Y	544_I	0.678	0.15
98_G	486_A	0.677	0.15
615_N	618_Q	0.677	0.15
63_V	360_A	0.676	0.15
312_K	315_D	0.676	0.15
622_D	633_S	0.676	0.15
647_G	650_I	0.675	0.15
254_V	353_M	0.675	0.15
618_Q	661_L	0.674	0.15
343_A	572_K	0.674	0.15
41_S	172_V	0.673	0.15
20_A	89_F	0.673	0.15
213_L	409_V	0.673	0.15
184_K	477_L	0.672	0.15
57_A	416_V	0.671	0.15
672_K	675_K	0.671	0.15
604_P	626_I	0.669	0.15
202_L	453_G	0.669	0.15
541_L	606_A	0.669	0.15
607_K	681_T	0.668	0.15
150_L	501_L	0.667	0.15
167_C	174_I	0.667	0.15
329_L	516_P	0.667	0.15
38_V	554_A	0.667	0.15
111_M	325_L	0.666	0.15
20_A	505_V	0.665	0.14
649_T	653_M	0.665	0.14
180_M	322_T	0.665	0.14
506_S	510_K	0.664	0.14
621_I	637_Q	0.664	0.14
183_V	476_I	0.663	0.14
121_L	376_I	0.662	0.14
18_A	572_K	0.662	0.14
431_I	653_M	0.662	0.14
409_V	639_V	0.661	0.14
15_V	623_S	0.661	0.14
67_R	228_F	0.661	0.14
86_K	509_L	0.660	0.14
44_I	367_G	0.660	0.14
80_Y	126_L	0.660	0.14
548_W	589_L	0.660	0.14
237_G	241_E	0.659	0.14
314_V	317_T	0.656	0.14
400_L	411_S	0.656	0.14
433_S	438_Q	0.656	0.14
509_L	514_S	0.655	0.14
494_A	665_K	0.655	0.14
619_A	627_P	0.655	0.14
338_V	580_W	0.655	0.14
164_L	167_C	0.653	0.14
416_V	423_I	0.653	0.14
223_V	408_V	0.651	0.14
260_L	376_I	0.651	0.14
13_L	508_G	0.650	0.14
157_P	223_V	0.650	0.14
23_Y	634_Q	0.649	0.14
631_T	676_P	0.649	0.14
13_L	674_P	0.648	0.14
178_L	486_A	0.648	0.14
76_D	227_V	0.648	0.14
321_W	498_L	0.647	0.14
223_V	584_V	0.646	0.14
591_I	639_V	0.646	0.14
155_M	650_I	0.646	0.14
11_T	639_V	0.646	0.14
399_V	627_P	0.646	0.14
163_A	526_V	0.645	0.14
170_I	345_I	0.644	0.14
640_F	643_R	0.644	0.14
654_V	662_F	0.643	0.14
13_L	48_A	0.643	0.14
186_L	481_L	0.643	0.14
140_T	145_R	0.643	0.14
623_S	635_L	0.641	0.14
561_M	597_G	0.640	0.14
98_G	562_A	0.640	0.14
135_V	367_G	0.640	0.14
117_M	467_D	0.638	0.14
668_L	674_P	0.638	0.14
581_V	587_A	0.637	0.14
386_D	393_M	0.637	0.14
575_R	655_V	0.637	0.14
99_A	286_L	0.637	0.14
184_K	449_T	0.636	0.14
218_I	228_F	0.636	0.14
150_L	493_A	0.635	0.14
474_F	502_L	0.635	0.14
18_A	301_M	0.635	0.14
222_S	227_V	0.634	0.14
148_G	547_L	0.634	0.14
47_I	117_M	0.631	0.14
238_W	246_A	0.631	0.14
16_M	158_T	0.631	0.14
47_I	408_V	0.630	0.14
117_M	150_L	0.630	0.14
515_L	519_L	0.629	0.14
255_Q	343_A	0.629	0.14
44_I	47_I	0.628	0.14
307_M	391_F	0.628	0.14
577_R	633_S	0.628	0.14
224_I	594_L	0.627	0.14
625_N	633_S	0.627	0.14
218_I	602_F	0.625	0.14
245_W	640_F	0.625	0.14
69_T	563_L	0.624	0.14
37_I	151_V	0.622	0.14
461_A	521_A	0.621	0.14
89_F	566_C	0.621	0.14
15_V	427_T	0.621	0.14
611_L	615_N	0.621	0.14
67_R	171_M	0.621	0.14
408_V	413_A	0.620	0.14
155_M	494_A	0.620	0.14
179_A	346_S	0.620	0.14
634_Q	660_A	0.620	0.14
86_K	548_W	0.620	0.14
541_L	545_N	0.620	0.14
134_M	494_A	0.618	0.13
458_L	498_L	0.617	0.13
412_A	421_F	0.616	0.13
177_V	610_F	0.616	0.13
359_Q	367_G	0.616	0.13
360_A	535_Q	0.616	0.13
607_K	657_V	0.615	0.13
615_N	644_L	0.615	0.13
47_I	251_F	0.615	0.13
629_Q	634_Q	0.614	0.13
292_V	354_L	0.614	0.13
658_V	675_K	0.614	0.13
10_W	51_F	0.614	0.13
39_V	82_P	0.614	0.13
256_L	362_F	0.613	0.13
548_W	642_N	0.613	0.13
257_T	498_L	0.613	0.13
39_V	223_V	0.612	0.13
209_Y	220_E	0.612	0.13
628_S	661_L	0.612	0.13
301_M	500_D	0.612	0.13
616_K	635_L	0.611	0.13
212_Y	428_L	0.611	0.13
213_L	661_L	0.611	0.13
159_A	444_A	0.611	0.13
64_D	499_Q	0.611	0.13
299_L	588_W	0.610	0.13
205_F	220_E	0.610	0.13
150_L	164_L	0.609	0.13
118_I	656_V	0.609	0.13
152_K	450_L	0.609	0.13
97_A	302_R	0.609	0.13
51_F	321_W	0.609	0.13
268_A	302_R	0.609	0.13
205_F	399_V	0.608	0.13
586_T	598_W	0.608	0.13
233_I	509_L	0.607	0.13
218_I	293_G	0.606	0.13
311_T	665_K	0.606	0.13
560_G	589_L	0.605	0.13
11_T	296_V	0.604	0.13
208_I	213_L	0.604	0.13
72_V	444_A	0.604	0.13
84_D	608_V	0.603	0.13
353_M	500_D	0.603	0.13
430_Q	433_S	0.602	0.13
359_Q	644_L	0.601	0.13
664_I	672_K	0.601	0.13
43_C	163_A	0.601	0.13
618_Q	669_A	0.601	0.13
168_F	502_L	0.600	0.13
190_P	237_G	0.599	0.13
170_I	558_L	0.599	0.13
38_V	219_G	0.599	0.13
125_V	243_P	0.598	0.13
615_N	643_R	0.598	0.13
48_A	300_I	0.598	0.13
7_Y	14_S	0.598	0.13
127_A	565_L	0.597	0.13
645_D	665_K	0.596	0.13
15_V	205_F	0.596	0.13
631_T	638_L	0.595	0.13
43_C	353_M	0.595	0.13
24_I	444_A	0.595	0.13
609_G	653_M	0.594	0.13
250_D	597_G	0.593	0.13
143_D	454_M	0.593	0.13
16_M	524_L	0.592	0.13
99_A	194_Y	0.592	0.13
578_Y	581_V	0.591	0.13
235_S	574_K	0.590	0.13
346_S	433_S	0.590	0.13
42_V	259_M	0.590	0.13
22_G	204_L	0.589	0.13
643_R	656_V	0.589	0.13
172_V	584_V	0.589	0.13
577_R	618_Q	0.588	0.13
32_I	311_T	0.588	0.13
259_M	355_A	0.588	0.13
299_L	520_L	0.587	0.13
161_V	466_M	0.587	0.13
329_L	338_V	0.587	0.13
653_M	657_V	0.587	0.13
354_L	419_W	0.586	0.13
660_A	672_K	0.584	0.13
268_A	634_Q	0.584	0.13
633_S	672_K	0.584	0.13
188_H	645_D	0.583	0.13
388_G	507_P	0.583	0.13
141_R	357_E	0.583	0.13
384_I	501_L	0.582	0.13
84_D	210_L	0.582	0.13
51_F	255_Q	0.581	0.13
195_T	589_L	0.580	0.13
487_V	493_A	0.580	0.13
621_I	657_V	0.578	0.13
642_N	649_T	0.578	0.13
412_A	534_H	0.578	0.13
426_D	429_N	0.578	0.13
117_M	376_I	0.578	0.13
255_Q	305_L	0.577	0.13
232_A	487_V	0.575	0.13
169_M	652_F	0.575	0.13
76_D	659_L	0.575	0.13
218_I	227_V	0.572	0.13
39_V	583_L	0.572	0.13
151_V	155_M	0.571	0.13
63_V	338_V	0.571	0.13
603_S	611_L	0.571	0.13
23_Y	32_I	0.571	0.13
35_L	507_P	0.570	0.13
570_L	575_R	0.569	0.13
190_P	584_V	0.568	0.12
260_L	670_A	0.567	0.12
107_L	526_V	0.567	0.12
381_S	384_I	0.567	0.12
157_P	665_K	0.566	0.12
628_S	632_E	0.565	0.12
647_G	671_L	0.565	0.12
137_F	457_I	0.564	0.12
376_I	389_V	0.564	0.12
636_A	675_K	0.563	0.12
393_M	635_L	0.563	0.12
197_A	385_I	0.562	0.12
205_F	643_R	0.561	0.12
338_V	586_T	0.559	0.12
660_A	668_L	0.559	0.12
193_T	511_R	0.558	0.12
73_R	133_F	0.558	0.12
80_Y	320_V	0.557	0.12
179_A	320_V	0.557	0.12
487_V	560_G	0.556	0.12
354_L	520_L	0.556	0.12
398_A	638_L	0.555	0.12
133_F	338_V	0.555	0.12
438_Q	625_N	0.555	0.12
300_I	591_I	0.555	0.12
38_V	53_G	0.554	0.12
356_N	373_F	0.554	0.12
251_F	266_V	0.554	0.12
76_D	398_A	0.554	0.12
535_Q	573_M	0.554	0.12
663_S	667_A	0.553	0.12
584_V	587_A	0.553	0.12
7_Y	13_L	0.553	0.12
464_G	588_W	0.553	0.12
179_A	468_V	0.552	0.12
381_S	656_V	0.552	0.12
99_A	288_I	0.552	0.12
616_K	634_Q	0.552	0.12
73_R	360_A	0.552	0.12
137_F	360_A	0.552	0.12
517_A	521_A	0.552	0.12
148_G	600_K	0.551	0.12
591_I	622_D	0.551	0.12
619_A	632_E	0.550	0.12
33_N	97_A	0.550	0.12
204_L	363_I	0.549	0.12
164_L	498_L	0.548	0.12
21_L	642_N	0.548	0.12
326_F	471_W	0.547	0.12
126_L	633_S	0.546	0.12
345_I	493_A	0.546	0.12
268_A	415_V	0.545	0.12
421_F	645_D	0.545	0.12
21_L	574_K	0.545	0.12
416_V	614_A	0.544	0.12
673_D	676_P	0.543	0.12
13_L	591_I	0.543	0.12
45_Y	474_F	0.543	0.12
37_I	575_R	0.542	0.12
314_V	646_A	0.542	0.12
175_L	268_A	0.542	0.12
168_F	321_W	0.540	0.12
627_P	634_Q	0.540	0.12
56_I	524_L	0.540	0.12
145_R	494_A	0.540	0.12
666_T	677_T	0.539	0.12
248_Y	640_F	0.539	0.12
202_L	544_I	0.539	0.12
548_W	646_A	0.538	0.12
152_K	515_L	0.537	0.12
178_L	229_L	0.537	0.12
16_M	231_F	0.536	0.12
146_S	173_I	0.536	0.12
162_I	230_I	0.535	0.12
534_H	575_R	0.535	0.12
171_M	497_M	0.534	0.12
604_P	622_D	0.533	0.12
575_R	592_C	0.533	0.12
17_G	169_M	0.533	0.12
222_S	440_I	0.533	0.12
13_L	27_N	0.533	0.12
209_Y	345_I	0.533	0.12
423_I	436_G	0.533	0.12
417_S	422_S	0.531	0.12
163_A	464_G	0.531	0.12
298_I	502_L	0.531	0.12
54_L	86_K	0.531	0.12
494_A	544_I	0.530	0.12
440_I	522_T	0.530	0.12
223_V	291_I	0.529	0.12
564_M	639_V	0.529	0.12
184_K	286_L	0.529	0.12
180_M	183_V	0.528	0.12
11_T	674_P	0.528	0.12
196_V	510_K	0.527	0.12
481_L	526_V	0.527	0.12
142_R	154_E	0.527	0.12
586_T	592_C	0.526	0.12
400_L	416_V	0.526	0.12
238_W	498_L	0.526	0.12
630_Y	634_Q	0.526	0.12
355_A	659_L	0.526	0.12
418_S	664_I	0.525	0.12
316_G	396_P	0.525	0.12
243_P	246_A	0.525	0.12
80_Y	676_P	0.524	0.12
387_P	412_A	0.524	0.12
345_I	668_L	0.524	0.12
409_V	441_I	0.524	0.12
665_K	668_L	0.523	0.12
75_N	353_M	0.523	0.12
617_F	626_I	0.523	0.12
344_L	562_A	0.523	0.12
27_N	669_A	0.522	0.12
427_T	431_I	0.522	0.12
514_S	574_K	0.522	0.12
8_L	24_I	0.522	0.12
623_S	674_P	0.521	0.12
60_V	106_V	0.521	0.12
465_M	671_L	0.521	0.12
386_D	433_S	0.521	0.12
345_I	358_G	0.521	0.12
16_M	675_K	0.520	0.12
409_V	418_S	0.520	0.12
164_L	321_W	0.520	0.12
18_A	60_V	0.520	0.12
233_I	286_L	0.519	0.12
27_N	678_A	0.519	0.12
214_R	249_F	0.517	0.12
654_V	658_V	0.517	0.12
571_F	576_Q	0.517	0.12
613_I	656_V	0.516	0.12
546_T	644_L	0.516	0.12
72_V	592_C	0.516	0.12
435_V	537_V	0.515	0.11
155_M	184_K	0.515	0.11
326_F	473_H	0.515	0.11
15_V	615_N	0.515	0.11
210_L	314_V	0.515	0.11
28_R	309_A	0.515	0.11
223_V	637_Q	0.514	0.11
460_G	465_M	0.514	0.11
269_V	526_V	0.514	0.11
300_I	358_G	0.514	0.11
166_A	516_P	0.513	0.11
15_V	679_K	0.513	0.11
307_M	679_K	0.513	0.11
170_I	344_L	0.512	0.11
481_L	522_T	0.512	0.11
189_S	593_T	0.510	0.11
174_I	565_L	0.510	0.11
614_A	645_D	0.510	0.11
21_L	643_R	0.507	0.11
23_Y	89_F	0.507	0.11
40_A	67_R	0.507	0.11
245_W	413_A	0.507	0.11
375_A	561_M	0.507	0.11
68_M	72_V	0.507	0.11
81_V	274_L	0.507	0.11
9_V	59_N	0.507	0.11
33_N	284_T	0.506	0.11
28_R	117_M	0.504	0.11
148_G	448_P	0.503	0.11
621_I	634_Q	0.503	0.11
20_A	34_A	0.503	0.11
306_T	570_L	0.503	0.11
140_T	579_A	0.503	0.11
189_S	580_W	0.502	0.11
208_I	224_I	0.501	0.11
387_P	532_F	0.501	0.11
510_K	654_V	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3l1lA	2	0.5663	71.2	0.986	Contact Map
2cfqA	1	0.184	53.8	0.988	Contact Map
4wgvA	2	0.4608	44.3	0.988	Contact Map
4px7A	1	0.1127	44	0.988	Contact Map
1pw4A	1	0.1869	28.7	0.99	Contact Map
4q65A	1	0.1512	20.9	0.99	Contact Map
4xnjA	1	0.1683	17	0.991	Contact Map
4j05A	3	0.1869	15.1	0.991	Contact Map
2xq2A	2	0.077	13.5	0.991	Contact Map
3qnqA	2	0.1013	12.2	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0158 seconds.