FUMB - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

FUMB - Fumarate hydratase class I, anaerobic

UniProt:	P14407	Sequences: MSNKPFIYQAPFPMGKDNTEYYLLTSDYVSVADFDGETILKVEPEALTLLAQQAFHDASFMLRPAHQKQVAAILHDPEASENDKYVALQFLRNSEIAAKGVLPTCQDTGTAIIVGKKGQRVWTGGGDEETLSKGVYNTYIEDNLRYSQNAALDMYKEVNTGTNLPAQIDLYAVDGDEYKFLCVAKGGGSANKTYLYQETKALLTPGKLKNFLVEKMRTLGTAACPPYHIAFVIGGTSAETNLKTVKLASAHYYDELPTEGNEHGQAFRDVQLEQELLEEAQKLGLGAQFGGKYFAHDIRVIRLPRHGASCPVGMGVSCSADRNIKAKINREGIWIEKLEHNPGQYIPQELRQAGEGEAVKVDLNRPMKEILAQLSQYPVSTRLSLTGTIIVGRDIAHAKLKELIDAGKELPQYIKDHPIYYAGPAKTPAGYPSGSLGPTTAGRMDSYVDLLQSHGGSMIMLAKGNRSQQVTDACHKHGGFYLGSIGGPAAVLAQQSIKHLECVAYPELGMEAIWKIEVEDFPAFILVDDKGNDFFQQIVNKQCANCTK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10357
Length:	548 (484)
Sequences:	851 (273)
Seq/√Len:	12.4

ECOLI - FUMB FUMA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
399_K	507_E	5.471	1.00
412_Q	416_D	5.238	1.00
202_L	312_V	4.620	1.00
498_K	519_E	4.607	1.00
400_L	410_L	4.572	1.00
191_N	309_S	4.230	1.00
51_A	131_L	4.175	1.00
153_D	156_K	3.859	0.99
468_Q	472_D	3.643	0.99
359_V	381_T	3.537	0.99
47_L	131_L	3.529	0.99
48_T	137_N	3.435	0.98
128_E	132_S	3.342	0.98
449_D	477_H	3.309	0.98
418_P	459_I	3.264	0.98
401_K	405_D	3.247	0.98
403_L	505_Y	3.203	0.97
278_E	281_Q	3.144	0.97
231_F	314_M	3.010	0.96
155_Y	272_L	2.993	0.96
389_I	461_L	2.920	0.95
55_F	111_A	2.884	0.95
183_V	250_A	2.870	0.95
329_N	334_W	2.837	0.95
499_H	517_E	2.785	0.94
452_Q	460_M	2.742	0.93
449_D	476_K	2.742	0.93
360_K	520_D	2.699	0.93
403_L	408_K	2.693	0.93
65_A	251_H	2.686	0.93
403_L	504_A	2.633	0.92
365_R	369_E	2.585	0.91
113_I	131_L	2.573	0.91
453_S	477_H	2.552	0.91
471_T	527_V	2.535	0.90
195_L	241_N	2.473	0.89
201_A	447_Y	2.449	0.89
71_A	75_H	2.407	0.88
39_I	122_W	2.404	0.88
213_V	279_E	2.358	0.87
52_Q	137_N	2.347	0.86
47_L	180_F	2.323	0.86
115_G	170_L	2.320	0.86
58_A	324_I	2.310	0.86
68_K	72_A	2.296	0.85
129_E	132_S	2.267	0.84
414_I	451_L	2.181	0.82
419_I	460_M	2.163	0.81
128_E	171_Y	2.145	0.81
399_K	506_P	2.142	0.81
364_N	517_E	2.128	0.80
401_K	450_L	2.123	0.80
400_L	414_I	2.102	0.80
89_Q	491_V	2.098	0.79
377_Y	525_I	2.082	0.79
102_L	493_A	2.079	0.79
268_R	271_Q	2.070	0.78
259_E	265_Q	2.069	0.78
278_E	282_K	2.068	0.78
373_Q	376_Q	2.060	0.78
138_T	142_D	2.050	0.78
276_L	280_A	2.040	0.77
374_L	480_F	2.031	0.77
241_N	313_G	2.027	0.77
450_L	454_H	2.018	0.77
113_I	135_V	2.009	0.76
459_I	480_F	1.965	0.75
236_T	240_T	1.964	0.75
442_G	446_S	1.942	0.74
209_K	275_E	1.938	0.74
216_M	280_A	1.926	0.73
441_A	462_A	1.893	0.72
193_T	242_L	1.881	0.71
47_L	51_A	1.874	0.71
231_F	276_L	1.844	0.70
450_L	453_S	1.837	0.69
449_D	453_S	1.830	0.69
491_V	495_Q	1.823	0.69
128_E	168_I	1.814	0.68
453_S	476_K	1.811	0.68
403_L	409_E	1.809	0.68
52_Q	141_E	1.808	0.68
261_N	265_Q	1.805	0.68
219_L	222_A	1.797	0.68
229_I	295_A	1.797	0.68
64_P	345_Y	1.794	0.67
125_G	130_T	1.792	0.67
40_L	121_V	1.784	0.67
200_K	310_C	1.766	0.66
158_V	161_G	1.757	0.66
132_S	168_I	1.731	0.65
418_P	480_F	1.714	0.64
400_L	513_I	1.678	0.62
209_K	279_E	1.667	0.61
46_A	333_I	1.650	0.61
229_I	314_M	1.631	0.60
201_A	446_S	1.615	0.59
366_P	418_P	1.585	0.57
419_I	452_Q	1.582	0.57
66_H	70_V	1.569	0.57
399_K	403_L	1.556	0.56
269_D	300_V	1.542	0.55
229_I	276_L	1.523	0.54
361_V	373_Q	1.518	0.54
132_S	166_A	1.500	0.53
363_L	389_I	1.490	0.53
366_P	480_F	1.478	0.52
89_Q	104_T	1.475	0.52
213_V	276_L	1.470	0.52
154_M	233_I	1.467	0.51
129_E	168_I	1.464	0.51
60_F	89_Q	1.432	0.50
193_T	236_T	1.427	0.49
116_K	179_K	1.421	0.49
154_M	208_L	1.416	0.49
137_N	141_E	1.403	0.48
48_T	133_K	1.400	0.48
84_K	476_K	1.394	0.48
504_A	513_I	1.393	0.48
117_K	172_A	1.379	0.47
436_L	500_L	1.361	0.46
414_I	419_I	1.352	0.46
392_G	419_I	1.351	0.46
390_I	503_V	1.345	0.45
324_I	327_K	1.326	0.44
104_T	265_Q	1.319	0.44
47_L	127_D	1.319	0.44
402_E	406_A	1.316	0.44
400_L	451_L	1.300	0.43
229_I	280_A	1.300	0.43
471_T	533_D	1.294	0.43
404_I	454_H	1.286	0.42
135_V	140_I	1.286	0.42
97_A	143_N	1.272	0.42
104_T	491_V	1.269	0.41
116_K	171_Y	1.269	0.41
410_L	414_I	1.265	0.41
123_T	130_T	1.261	0.41
500_L	514_W	1.261	0.41
406_A	409_E	1.260	0.41
56_H	142_D	1.259	0.41
280_A	295_A	1.251	0.41
390_I	414_I	1.242	0.40
312_V	388_T	1.238	0.40
360_K	384_S	1.238	0.40
64_P	68_K	1.234	0.40
398_A	402_E	1.227	0.39
71_A	76_D	1.224	0.39
269_D	302_R	1.224	0.39
361_V	383_L	1.214	0.39
131_L	180_F	1.214	0.39
404_I	409_E	1.213	0.39
193_T	241_N	1.206	0.38
449_D	473_A	1.203	0.38
468_Q	536_Q	1.203	0.38
364_N	499_H	1.200	0.38
222_A	535_F	1.188	0.38
405_D	450_L	1.188	0.38
150_A	160_T	1.183	0.37
89_Q	100_G	1.177	0.37
285_L	505_Y	1.175	0.37
491_V	496_S	1.174	0.37
61_M	89_Q	1.163	0.36
448_V	460_M	1.154	0.36
110_T	197_Q	1.144	0.35
149_N	312_V	1.136	0.35
207_K	210_N	1.136	0.35
348_Q	358_A	1.124	0.35
136_Y	162_T	1.123	0.34
388_T	517_E	1.115	0.34
388_T	417_H	1.115	0.34
229_I	253_Y	1.108	0.34
390_I	417_H	1.106	0.34
419_I	503_V	1.105	0.34
182_C	324_I	1.097	0.33
69_Q	155_Y	1.097	0.33
169_D	240_T	1.091	0.33
276_L	279_E	1.090	0.33
295_A	298_I	1.088	0.33
56_H	61_M	1.084	0.33
388_T	515_K	1.083	0.33
478_G	530_K	1.081	0.33
400_L	409_E	1.075	0.32
251_H	323_N	1.071	0.32
276_L	300_V	1.070	0.32
446_S	499_H	1.067	0.32
279_E	282_K	1.065	0.32
143_N	168_I	1.064	0.32
213_V	217_R	1.063	0.32
195_L	313_G	1.063	0.32
472_D	476_K	1.059	0.32
404_I	450_L	1.057	0.31
193_T	315_G	1.057	0.31
60_F	325_K	1.057	0.31
527_V	535_F	1.055	0.31
272_L	275_E	1.049	0.31
231_F	300_V	1.047	0.31
120_R	176_D	1.046	0.31
155_Y	268_R	1.041	0.31
69_Q	251_H	1.032	0.30
499_H	514_W	1.029	0.30
39_I	117_K	1.023	0.30
95_E	99_K	1.020	0.30
452_Q	458_M	1.018	0.30
182_C	374_L	1.016	0.30
68_K	345_Y	1.013	0.30
71_A	349_E	1.013	0.30
241_N	315_G	1.008	0.29
49_L	53_Q	1.006	0.29
100_G	104_T	1.005	0.29
493_A	500_L	1.004	0.29
95_E	346_I	1.000	0.29
131_L	168_I	0.996	0.29
56_H	100_G	0.993	0.29
366_P	459_I	0.991	0.29
170_L	419_I	0.991	0.29
514_W	517_E	0.988	0.29
390_I	516_I	0.983	0.28
126_G	129_E	0.980	0.28
469_Q	472_D	0.980	0.28
89_Q	295_A	0.975	0.28
324_I	338_L	0.974	0.28
228_H	237_S	0.968	0.28
324_I	519_E	0.965	0.28
60_F	323_N	0.963	0.27
362_D	409_E	0.963	0.27
127_D	170_L	0.961	0.27
154_M	302_R	0.956	0.27
90_F	392_G	0.950	0.27
149_N	198_E	0.950	0.27
446_S	517_E	0.943	0.27
208_L	477_H	0.941	0.27
400_L	449_D	0.936	0.26
409_E	478_G	0.935	0.26
92_R	353_A	0.932	0.26
53_Q	312_V	0.931	0.26
343_G	404_I	0.930	0.26
501_E	515_K	0.930	0.26
55_F	59_S	0.919	0.26
210_N	283_L	0.917	0.26
133_K	136_Y	0.915	0.26
274_Q	330_R	0.912	0.25
191_N	215_K	0.906	0.25
228_H	534_F	0.905	0.25
158_V	458_M	0.905	0.25
207_K	262_E	0.905	0.25
51_A	135_V	0.904	0.25
351_R	400_L	0.900	0.25
47_L	130_T	0.899	0.25
104_T	538_I	0.899	0.25
310_C	471_T	0.898	0.25
266_A	313_G	0.896	0.25
55_F	182_C	0.895	0.25
355_E	358_A	0.894	0.25
200_K	395_I	0.892	0.25
111_A	182_C	0.890	0.25
364_N	388_T	0.889	0.25
343_G	362_D	0.889	0.25
456_G	473_A	0.886	0.24
399_K	504_A	0.882	0.24
484_S	488_P	0.881	0.24
117_K	170_L	0.873	0.24
92_R	351_R	0.870	0.24
402_E	405_D	0.870	0.24
84_K	430_G	0.867	0.24
213_V	283_L	0.867	0.24
198_E	272_L	0.864	0.24
433_S	516_I	0.863	0.24
97_A	352_Q	0.863	0.24
115_G	131_L	0.861	0.24
373_Q	525_I	0.861	0.24
68_K	344_Q	0.860	0.24
528_D	532_N	0.855	0.23
272_L	458_M	0.854	0.23
149_N	502_C	0.851	0.23
484_S	500_L	0.851	0.23
198_E	215_K	0.851	0.23
92_R	349_E	0.851	0.23
128_E	170_L	0.850	0.23
139_Y	308_A	0.850	0.23
215_K	218_T	0.849	0.23
389_I	418_P	0.848	0.23
216_M	276_L	0.848	0.23
357_E	414_I	0.847	0.23
110_T	236_T	0.846	0.23
492_L	496_S	0.846	0.23
45_E	49_L	0.845	0.23
89_Q	496_S	0.839	0.23
369_E	375_S	0.837	0.23
193_T	313_G	0.827	0.22
236_T	241_N	0.826	0.22
60_F	70_V	0.826	0.22
461_L	488_P	0.826	0.22
126_G	174_D	0.825	0.22
503_V	514_W	0.824	0.22
471_T	535_F	0.823	0.22
239_E	303_L	0.823	0.22
60_F	295_A	0.821	0.22
215_K	309_S	0.820	0.22
128_E	166_A	0.820	0.22
57_D	61_M	0.816	0.22
189_S	347_P	0.815	0.22
198_E	216_M	0.815	0.22
161_G	450_L	0.810	0.22
254_D	301_I	0.808	0.22
172_A	313_G	0.807	0.22
345_Y	461_L	0.806	0.22
236_T	538_I	0.806	0.22
229_I	298_I	0.806	0.22
277_L	383_L	0.805	0.22
182_C	473_A	0.805	0.22
66_H	71_A	0.804	0.22
177_E	327_K	0.804	0.22
100_G	460_M	0.803	0.21
44_P	130_T	0.802	0.21
261_N	389_I	0.802	0.21
149_N	194_Y	0.802	0.21
215_K	314_M	0.801	0.21
117_K	127_D	0.800	0.21
174_D	468_Q	0.800	0.21
403_L	406_A	0.799	0.21
104_T	219_L	0.799	0.21
155_Y	274_Q	0.799	0.21
433_S	436_L	0.799	0.21
436_L	516_I	0.799	0.21
216_M	538_I	0.795	0.21
317_S	321_D	0.794	0.21
142_D	313_G	0.794	0.21
96_I	195_L	0.793	0.21
275_E	312_V	0.790	0.21
403_L	451_L	0.787	0.21
456_G	504_A	0.786	0.21
280_A	283_L	0.785	0.21
90_F	535_F	0.783	0.21
432_P	513_I	0.783	0.21
488_P	491_V	0.781	0.21
137_N	262_E	0.780	0.21
112_I	191_N	0.779	0.21
123_T	127_D	0.778	0.21
135_V	389_I	0.777	0.21
179_K	233_I	0.776	0.21
368_K	458_M	0.776	0.21
112_I	309_S	0.774	0.20
427_T	430_G	0.769	0.20
488_P	521_F	0.769	0.20
129_E	373_Q	0.763	0.20
131_L	451_L	0.762	0.20
44_P	309_S	0.761	0.20
161_G	405_D	0.757	0.20
483_G	534_F	0.754	0.20
219_L	314_M	0.753	0.20
100_G	217_R	0.752	0.20
151_A	160_T	0.751	0.20
418_P	432_P	0.751	0.20
60_F	101_V	0.750	0.20
261_N	278_E	0.749	0.20
55_F	212_L	0.748	0.20
191_N	441_A	0.743	0.19
110_T	253_Y	0.741	0.19
274_Q	344_Q	0.739	0.19
194_Y	392_G	0.737	0.19
379_V	533_D	0.736	0.19
231_F	380_S	0.735	0.19
342_P	345_Y	0.735	0.19
135_V	357_E	0.732	0.19
216_M	379_V	0.731	0.19
196_Y	215_K	0.729	0.19
142_D	380_S	0.729	0.19
409_E	415_K	0.728	0.19
133_K	536_Q	0.727	0.19
138_T	184_A	0.727	0.19
162_T	380_S	0.727	0.19
55_F	184_A	0.725	0.19
39_I	176_D	0.724	0.19
153_D	431_Y	0.724	0.19
149_N	216_M	0.723	0.19
80_S	333_I	0.722	0.19
95_E	526_L	0.722	0.19
400_L	450_L	0.721	0.19
374_L	459_I	0.718	0.19
133_K	137_N	0.718	0.19
498_K	517_E	0.717	0.19
70_V	349_E	0.715	0.19
383_L	469_Q	0.713	0.19
409_E	499_H	0.713	0.19
114_V	329_N	0.711	0.18
149_N	395_I	0.711	0.18
241_N	250_A	0.709	0.18
277_L	298_I	0.707	0.18
59_S	104_T	0.707	0.18
150_A	309_S	0.705	0.18
119_Q	272_L	0.705	0.18
67_Q	90_F	0.705	0.18
374_L	529_D	0.704	0.18
282_K	498_K	0.704	0.18
58_A	89_Q	0.704	0.18
136_Y	263_H	0.704	0.18
42_V	98_A	0.704	0.18
404_I	458_M	0.702	0.18
116_K	399_K	0.701	0.18
420_Y	436_L	0.698	0.18
132_S	172_A	0.696	0.18
368_K	459_I	0.696	0.18
84_K	418_P	0.696	0.18
150_A	265_Q	0.695	0.18
162_T	194_Y	0.694	0.18
261_N	310_C	0.694	0.18
236_T	460_M	0.693	0.18
389_I	460_M	0.692	0.18
362_D	386_T	0.691	0.18
72_A	296_H	0.690	0.18
231_F	296_H	0.689	0.18
59_S	207_K	0.689	0.18
160_T	216_M	0.688	0.18
113_I	182_C	0.687	0.18
308_A	396_A	0.686	0.18
143_N	534_F	0.686	0.18
162_T	446_S	0.685	0.18
488_P	515_K	0.684	0.18
240_T	312_V	0.684	0.18
383_L	488_P	0.683	0.18
493_A	498_K	0.683	0.18
377_Y	383_L	0.683	0.18
47_L	480_F	0.682	0.18
179_K	386_T	0.682	0.18
324_I	337_K	0.680	0.18
124_G	130_T	0.678	0.17
161_G	501_E	0.678	0.17
71_A	92_R	0.678	0.17
352_Q	355_E	0.676	0.17
116_K	433_S	0.674	0.17
409_E	454_H	0.671	0.17
470_V	492_L	0.671	0.17
477_H	527_V	0.671	0.17
152_L	208_L	0.670	0.17
110_T	149_N	0.667	0.17
69_Q	459_I	0.667	0.17
502_C	506_P	0.666	0.17
364_N	386_T	0.666	0.17
98_A	460_M	0.666	0.17
258_T	261_N	0.665	0.17
216_M	279_E	0.664	0.17
89_Q	265_Q	0.663	0.17
161_G	476_K	0.662	0.17
44_P	125_G	0.662	0.17
65_A	250_A	0.661	0.17
87_A	479_G	0.659	0.17
383_L	419_I	0.657	0.17
406_A	498_K	0.657	0.17
485_I	492_L	0.657	0.17
216_M	231_F	0.657	0.17
201_A	402_E	0.656	0.17
388_T	477_H	0.655	0.17
352_Q	357_E	0.654	0.17
96_I	383_L	0.654	0.17
353_A	360_K	0.654	0.17
339_E	345_Y	0.653	0.17
366_P	369_E	0.652	0.17
267_F	271_Q	0.651	0.17
231_F	251_H	0.651	0.17
358_A	493_A	0.651	0.17
401_K	451_L	0.649	0.17
505_Y	513_I	0.648	0.17
253_Y	389_I	0.648	0.17
180_F	326_A	0.647	0.17
84_K	345_Y	0.647	0.17
264_G	271_Q	0.643	0.16
114_V	183_V	0.642	0.16
488_P	496_S	0.642	0.16
198_E	207_K	0.641	0.16
104_T	149_N	0.641	0.16
403_L	507_E	0.639	0.16
53_Q	337_K	0.638	0.16
116_K	247_L	0.637	0.16
158_V	247_L	0.636	0.16
324_I	352_Q	0.636	0.16
53_Q	156_K	0.634	0.16
89_Q	283_L	0.633	0.16
392_G	513_I	0.633	0.16
402_E	505_Y	0.630	0.16
39_I	538_I	0.630	0.16
401_K	404_I	0.630	0.16
359_V	373_Q	0.629	0.16
236_T	242_L	0.629	0.16
251_H	254_D	0.628	0.16
64_P	352_Q	0.626	0.16
210_N	213_V	0.626	0.16
191_N	195_L	0.625	0.16
460_M	477_H	0.625	0.16
154_M	300_V	0.624	0.16
448_V	492_L	0.624	0.16
129_E	276_L	0.624	0.16
404_I	408_K	0.624	0.16
207_K	313_G	0.623	0.16
97_A	300_V	0.623	0.16
480_F	529_D	0.622	0.16
222_A	485_I	0.621	0.16
88_L	97_A	0.619	0.16
293_Y	296_H	0.619	0.16
97_A	324_I	0.619	0.16
96_I	431_Y	0.616	0.16
342_P	519_E	0.615	0.16
87_A	268_R	0.615	0.16
374_L	386_T	0.614	0.16
376_Q	477_H	0.614	0.16
231_F	272_L	0.613	0.16
59_S	184_A	0.613	0.16
72_A	349_E	0.613	0.16
96_I	117_K	0.612	0.16
113_I	270_V	0.612	0.16
379_V	459_I	0.611	0.16
375_S	529_D	0.611	0.16
97_A	259_E	0.611	0.16
64_P	344_Q	0.609	0.16
111_A	237_S	0.609	0.16
70_V	229_I	0.609	0.16
278_E	536_Q	0.608	0.16
202_L	447_Y	0.608	0.16
118_G	176_D	0.607	0.15
97_A	388_T	0.607	0.15
183_V	334_W	0.605	0.15
127_D	181_L	0.604	0.15
152_L	526_L	0.603	0.15
406_A	476_K	0.603	0.15
214_E	218_T	0.602	0.15
218_T	376_Q	0.601	0.15
265_Q	491_V	0.601	0.15
150_A	191_N	0.601	0.15
398_A	447_Y	0.599	0.15
272_L	340_H	0.598	0.15
263_H	389_I	0.598	0.15
388_T	418_P	0.597	0.15
476_K	501_E	0.597	0.15
123_T	214_E	0.596	0.15
348_Q	357_E	0.595	0.15
70_V	104_T	0.594	0.15
229_I	310_C	0.594	0.15
97_A	415_K	0.594	0.15
330_R	333_I	0.594	0.15
414_I	450_L	0.594	0.15
67_Q	345_Y	0.593	0.15
403_L	441_A	0.593	0.15
89_Q	495_Q	0.593	0.15
343_G	498_K	0.593	0.15
441_A	488_P	0.592	0.15
346_I	526_L	0.591	0.15
226_P	287_A	0.591	0.15
59_S	119_Q	0.589	0.15
380_S	493_A	0.589	0.15
181_L	325_K	0.587	0.15
368_K	374_L	0.587	0.15
388_T	514_W	0.586	0.15
362_D	365_R	0.586	0.15
469_Q	517_E	0.586	0.15
274_Q	278_E	0.586	0.15
119_Q	122_W	0.586	0.15
337_K	340_H	0.585	0.15
295_A	496_S	0.584	0.15
155_Y	310_C	0.583	0.15
384_S	514_W	0.583	0.15
143_N	379_V	0.583	0.15
149_N	446_S	0.582	0.15
452_Q	479_G	0.582	0.15
309_S	441_A	0.581	0.15
384_S	390_I	0.580	0.15
389_I	518_V	0.579	0.15
70_V	298_I	0.579	0.15
127_D	180_F	0.579	0.15
158_V	262_E	0.578	0.15
312_V	357_E	0.577	0.15
373_Q	477_H	0.577	0.15
114_V	171_Y	0.576	0.15
389_I	408_K	0.576	0.15
366_P	417_H	0.575	0.15
65_A	231_F	0.575	0.15
150_A	158_V	0.574	0.15
70_V	89_Q	0.574	0.15
52_Q	142_D	0.573	0.15
162_T	207_K	0.572	0.15
51_A	115_G	0.571	0.15
449_D	469_Q	0.570	0.15
396_A	399_K	0.570	0.15
70_V	295_A	0.569	0.15
384_S	520_D	0.568	0.14
193_T	266_A	0.568	0.14
140_I	162_T	0.566	0.14
142_D	315_G	0.566	0.14
55_F	131_L	0.566	0.14
112_I	168_I	0.566	0.14
495_Q	536_Q	0.565	0.14
43_E	253_Y	0.564	0.14
184_A	488_P	0.564	0.14
161_G	498_K	0.564	0.14
374_L	470_V	0.563	0.14
61_M	100_G	0.563	0.14
90_F	207_K	0.563	0.14
96_I	491_V	0.561	0.14
369_E	389_I	0.561	0.14
97_A	125_G	0.560	0.14
368_K	375_S	0.559	0.14
143_N	233_I	0.558	0.14
73_I	87_A	0.558	0.14
153_D	200_K	0.558	0.14
236_T	472_D	0.557	0.14
315_G	538_I	0.557	0.14
95_E	280_A	0.556	0.14
116_K	313_G	0.556	0.14
135_V	179_K	0.553	0.14
150_A	450_L	0.552	0.14
285_L	380_S	0.552	0.14
135_V	183_V	0.550	0.14
127_D	131_L	0.549	0.14
99_K	137_N	0.549	0.14
72_A	274_Q	0.549	0.14
183_V	251_H	0.548	0.14
209_K	272_L	0.545	0.14
396_A	508_L	0.545	0.14
70_V	262_E	0.545	0.14
362_D	432_P	0.544	0.14
401_K	449_D	0.544	0.14
296_H	317_S	0.544	0.14
276_L	285_L	0.543	0.14
179_K	505_Y	0.543	0.14
258_T	270_V	0.543	0.14
147_S	189_S	0.542	0.14
241_N	276_L	0.541	0.14
85_Y	382_R	0.541	0.14
119_Q	124_G	0.541	0.14
127_D	178_Y	0.541	0.14
78_E	292_K	0.540	0.14
59_S	495_Q	0.539	0.14
82_N	534_F	0.538	0.14
39_I	120_R	0.538	0.14
285_L	420_Y	0.537	0.14
39_I	141_E	0.536	0.14
142_D	295_A	0.536	0.14
448_V	452_Q	0.536	0.14
39_I	360_K	0.535	0.14
216_M	247_L	0.535	0.14
82_N	93_N	0.535	0.14
219_L	317_S	0.533	0.14
300_V	356_G	0.533	0.14
162_T	263_H	0.532	0.14
99_K	534_F	0.532	0.14
64_P	342_P	0.532	0.14
310_C	401_K	0.532	0.14
373_Q	506_P	0.532	0.14
184_A	491_V	0.531	0.14
69_Q	302_R	0.531	0.14
348_Q	449_D	0.531	0.14
104_T	236_T	0.530	0.14
70_V	302_R	0.530	0.14
137_N	174_D	0.530	0.14
104_T	503_V	0.530	0.14
140_I	400_L	0.530	0.14
212_L	231_F	0.530	0.14
176_D	285_L	0.530	0.14
92_R	191_N	0.529	0.14
177_E	389_I	0.529	0.14
193_T	314_M	0.529	0.14
263_H	406_A	0.529	0.14
197_Q	208_L	0.529	0.14
477_H	498_K	0.528	0.13
175_G	240_T	0.528	0.13
138_T	208_L	0.527	0.13
59_S	283_L	0.527	0.13
77_P	293_Y	0.527	0.13
368_K	498_K	0.526	0.13
390_I	410_L	0.526	0.13
56_H	149_N	0.524	0.13
458_M	472_D	0.524	0.13
357_E	360_K	0.523	0.13
197_Q	236_T	0.521	0.13
167_Q	303_L	0.520	0.13
281_Q	395_I	0.520	0.13
338_L	471_T	0.520	0.13
399_K	479_G	0.520	0.13
182_C	470_V	0.520	0.13
314_M	380_S	0.519	0.13
43_E	233_I	0.519	0.13
237_S	398_A	0.519	0.13
134_G	418_P	0.519	0.13
285_L	334_W	0.518	0.13
409_E	505_Y	0.517	0.13
72_A	113_I	0.517	0.13
431_Y	515_K	0.517	0.13
112_I	151_A	0.517	0.13
254_D	342_P	0.517	0.13
67_Q	502_C	0.517	0.13
55_F	416_D	0.515	0.13
63_R	93_N	0.513	0.13
161_G	464_G	0.513	0.13
122_W	513_I	0.513	0.13
202_L	236_T	0.512	0.13
201_A	398_A	0.512	0.13
121_V	158_V	0.510	0.13
142_D	431_Y	0.510	0.13
140_I	388_T	0.509	0.13
503_V	506_P	0.509	0.13
261_N	277_L	0.509	0.13
532_N	537_Q	0.508	0.13
189_S	309_S	0.507	0.13
211_F	281_Q	0.507	0.13
416_D	451_L	0.507	0.13
49_L	113_I	0.507	0.13
467_S	527_V	0.505	0.13
66_H	382_R	0.505	0.13
180_F	478_G	0.505	0.13
514_W	519_E	0.505	0.13
104_T	380_S	0.504	0.13
65_A	525_I	0.504	0.13
471_T	536_Q	0.504	0.13
415_K	449_D	0.504	0.13
154_M	191_N	0.504	0.13
449_D	454_H	0.504	0.13
262_E	476_K	0.504	0.13
100_G	495_Q	0.503	0.13
216_M	356_G	0.503	0.13
154_M	253_Y	0.502	0.13
123_T	200_K	0.502	0.13
389_I	468_Q	0.501	0.13
122_W	174_D	0.501	0.13
48_T	141_E	0.501	0.13
364_N	368_K	0.501	0.13
42_V	460_M	0.501	0.13
247_L	272_L	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2isbA	1	0.3303	100	0.715	Contact Map
2lrnA	1	0.2372	54.1	0.984	Contact Map
3fkfA	4	0.2336	39.9	0.986	Contact Map
3kcmA	1	0.2026	36.6	0.986	Contact Map
4k9zA	3	0.2354	35.3	0.986	Contact Map
2e28A	3	0.1551	31.3	0.986	Contact Map
3fw2A	2	0.2372	31.3	0.986	Contact Map
3eurA	1	0.2354	25.2	0.987	Contact Map
1jfuA	1	0.3047	23.6	0.987	Contact Map
3clqA	2	0.2318	22.8	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.014 seconds.