NARH - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

NARH - Respiratory nitrate reductase 1 beta chain

UniProt:	P11349	Sequences: MKIRSQVGMVLNLDKCIGCHTCSVTCKNVWTSREGVEYAWFNNVETKPGQGFPTDWENQEKYKGGWIRKINGKLQPRMGNRAMLLGKIFANPHLPGIDDYYEPFDFDYQNLHTAPEGSKSQPIARPRSLITGERMAKIEKGPNWEDDLGGEFDKLAKDKNFDNIQKAMYSQFENTFMMYLPRLCEHCLNPACVATCPSGAIYKREEDGIVLIDQDKCRGWRMCITGCPYKKIYFNWKSGKSEKCIFCYPRIEAGQPTVCSETCVGRIRYLGVLLYDADAIERAASTENEKDLYQRQLDVFLDPNDPKVIEQAIKDGIPLSVIEAAQQSPVYKMAMEWKLALPLHPEYRTLPMVWYVPPLSPIQSAADAGELGSNGILPDVESLRIPVQYLANLLTAGDTKPVLRALKRMLAMRHYKRAETVDGKVDTRALEEVGLTEAQAQEMYRYLAIANYEDRFVVPSSHRELAREAFPEKNGCGFTFGDGCHGSDTKFNLFNSRRIDAIDVTSKTEPHP	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10639
Length:	512 (483)
Sequences:	584 (185)
Seq/√Len:	8.4

ECOLI - NARH NARY
BACSU - NARH

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
322_I	326_Q	7.458	1.00
311_Q	315_D	6.819	1.00
313_I	319_L	5.874	1.00
97_I	130_I	4.357	0.99
339_L	447_L	3.857	0.97
36_V	39_A	3.834	0.97
55_D	58_N	3.831	0.97
279_A	282_R	3.718	0.96
46_T	177_M	3.689	0.96
388_Q	399_T	3.589	0.96
193_V	201_I	3.572	0.95
381_E	403_L	3.554	0.95
212_I	241_S	3.492	0.95
195_T	226_G	3.355	0.94
212_I	232_I	3.348	0.93
260_S	270_L	3.264	0.93
127_R	134_R	3.235	0.92
427_T	437_E	3.190	0.92
163_N	392_N	2.986	0.89
478_F	484_C	2.983	0.89
76_P	191_A	2.970	0.88
3_I	308_V	2.968	0.88
84_L	195_T	2.964	0.88
300_F	335_M	2.945	0.88
68_R	287_E	2.924	0.88
201_I	232_I	2.899	0.87
478_F	485_H	2.883	0.87
430_L	440_A	2.849	0.86
78_M	84_L	2.835	0.86
11_L	183_L	2.823	0.86
47_K	145_E	2.762	0.84
91_N	222_M	2.686	0.82
60_E	77_R	2.682	0.82
401_P	405_A	2.680	0.82
294_Q	298_D	2.668	0.82
293_Y	297_L	2.643	0.81
191_A	226_G	2.596	0.80
40_W	101_Y	2.437	0.76
67_I	77_R	2.429	0.75
336_E	439_Q	2.388	0.74
7_V	272_V	2.380	0.74
482_D	485_H	2.369	0.73
309_I	326_Q	2.300	0.71
402_V	405_A	2.278	0.70
331_Y	335_M	2.251	0.69
50_Q	54_T	2.242	0.69
47_K	54_T	2.233	0.69
114_A	117_G	2.209	0.68
297_L	338_K	2.203	0.68
200_A	241_S	2.107	0.64
436_T	439_Q	2.083	0.63
246_F	251_I	2.020	0.61
304_N	326_Q	1.970	0.59
93_H	141_G	1.964	0.58
288_N	291_D	1.958	0.58
117_G	120_S	1.941	0.57
430_L	437_E	1.878	0.55
337_W	443_M	1.841	0.53
416_K	419_E	1.838	0.53
478_F	482_D	1.817	0.52
438_A	442_E	1.812	0.52
273_L	300_F	1.799	0.51
3_I	71_N	1.795	0.51
246_F	270_L	1.783	0.51
333_M	339_L	1.778	0.51
129_L	141_G	1.765	0.50
145_E	151_E	1.747	0.49
251_I	347_Y	1.737	0.49
91_N	94_L	1.714	0.48
281_E	285_S	1.711	0.48
67_I	313_I	1.706	0.48
2_K	315_D	1.702	0.47
5_S	321_V	1.672	0.46
28_N	236_W	1.671	0.46
311_Q	314_K	1.665	0.46
88_I	435_L	1.612	0.44
299_V	420_T	1.586	0.43
273_L	334_A	1.585	0.42
194_A	201_I	1.582	0.42
437_E	441_Q	1.563	0.42
353_V	385_I	1.542	0.41
4_R	205_E	1.528	0.40
407_K	432_E	1.527	0.40
8_G	81_R	1.523	0.40
25_T	258_V	1.520	0.40
32_S	473_K	1.517	0.40
104_F	422_D	1.515	0.40
418_A	426_D	1.509	0.39
147_D	179_Y	1.508	0.39
387_V	403_L	1.501	0.39
272_V	405_A	1.499	0.39
75_Q	356_V	1.479	0.38
201_I	216_K	1.461	0.37
25_T	261_E	1.456	0.37
395_T	401_P	1.449	0.37
84_L	226_G	1.435	0.36
339_L	356_V	1.432	0.36
39_A	383_L	1.427	0.36
130_I	314_K	1.425	0.36
162_D	436_T	1.404	0.35
388_Q	408_R	1.401	0.35
257_T	260_S	1.394	0.35
142_P	255_Q	1.379	0.34
295_R	409_M	1.375	0.34
152_F	155_L	1.366	0.34
267_I	421_V	1.352	0.33
476_C	483_G	1.349	0.33
307_K	310_E	1.337	0.33
294_Q	297_L	1.326	0.32
241_S	280_I	1.320	0.32
143_N	444_Y	1.315	0.32
50_Q	145_E	1.314	0.32
474_N	477_G	1.312	0.32
449_I	454_D	1.312	0.32
331_Y	334_A	1.306	0.32
106_F	147_D	1.304	0.32
17_I	24_V	1.303	0.31
120_S	200_A	1.295	0.31
279_A	298_D	1.284	0.31
347_Y	398_D	1.280	0.31
201_I	279_A	1.278	0.31
7_V	270_L	1.274	0.30
379_D	410_L	1.264	0.30
52_F	439_Q	1.263	0.30
292_L	296_Q	1.261	0.30
146_D	150_G	1.256	0.30
50_Q	140_K	1.255	0.30
283_A	286_T	1.250	0.30
76_P	408_R	1.246	0.29
41_F	447_L	1.244	0.29
419_E	441_Q	1.238	0.29
300_F	331_Y	1.235	0.29
160_N	392_N	1.232	0.29
149_G	222_M	1.231	0.29
115_P	295_R	1.222	0.29
429_A	440_A	1.218	0.28
481_G	484_C	1.217	0.28
218_R	448_A	1.211	0.28
121_Q	200_A	1.200	0.28
408_R	433_V	1.192	0.28
39_A	141_G	1.192	0.28
380_V	410_L	1.190	0.28
319_L	334_A	1.186	0.27
56_W	267_I	1.180	0.27
151_E	155_L	1.180	0.27
36_V	121_Q	1.175	0.27
272_V	435_L	1.170	0.27
8_G	398_D	1.170	0.27
47_K	363_Q	1.168	0.27
297_L	381_E	1.166	0.27
356_V	437_E	1.161	0.27
436_T	442_E	1.158	0.26
341_L	402_V	1.158	0.26
68_R	238_S	1.155	0.26
299_V	442_E	1.154	0.26
280_I	451_N	1.153	0.26
77_R	157_K	1.152	0.26
314_K	327_Q	1.146	0.26
80_N	84_L	1.139	0.26
212_I	446_Y	1.137	0.26
273_L	330_V	1.136	0.26
415_Y	437_E	1.133	0.26
109_Q	113_T	1.132	0.26
117_G	421_V	1.128	0.26
479_T	483_G	1.127	0.25
412_M	443_M	1.124	0.25
405_A	408_R	1.120	0.25
54_T	145_E	1.120	0.25
481_G	485_H	1.117	0.25
54_T	140_K	1.117	0.25
104_F	234_F	1.116	0.25
478_F	483_G	1.116	0.25
375_G	378_P	1.115	0.25
56_W	383_L	1.109	0.25
61_K	179_Y	1.109	0.25
350_L	356_V	1.106	0.25
67_I	75_Q	1.106	0.25
267_I	337_W	1.104	0.25
129_L	201_I	1.103	0.25
279_A	299_V	1.097	0.25
87_K	141_G	1.091	0.24
163_N	225_T	1.090	0.24
28_N	121_Q	1.088	0.24
185_E	354_W	1.086	0.24
479_T	484_C	1.083	0.24
400_K	403_L	1.072	0.24
165_Q	394_L	1.066	0.24
91_N	193_V	1.066	0.24
47_K	50_Q	1.061	0.23
178_M	456_F	1.060	0.23
63_K	93_H	1.059	0.23
116_E	409_M	1.058	0.23
479_T	485_H	1.058	0.23
299_V	335_M	1.057	0.23
4_R	114_A	1.057	0.23
39_A	142_P	1.051	0.23
294_Q	338_K	1.050	0.23
78_M	195_T	1.048	0.23
137_K	322_I	1.047	0.23
473_K	477_G	1.047	0.23
323_E	327_Q	1.046	0.23
106_F	146_D	1.044	0.23
293_Y	354_W	1.042	0.23
297_L	331_Y	1.039	0.23
24_V	121_Q	1.037	0.23
183_L	477_G	1.037	0.23
241_S	295_R	1.034	0.23
308_V	315_D	1.033	0.23
291_D	294_Q	1.029	0.22
4_R	28_N	1.028	0.22
194_A	248_Y	1.025	0.22
183_L	435_L	1.022	0.22
133_E	387_V	1.019	0.22
69_K	73_K	1.013	0.22
114_A	454_D	1.011	0.22
353_V	448_A	1.010	0.22
272_V	320_S	1.005	0.22
98_D	139_E	0.996	0.22
96_G	260_S	0.996	0.22
185_E	476_C	0.995	0.21
161_F	226_G	0.992	0.21
353_V	360_S	0.990	0.21
123_I	280_I	0.986	0.21
314_K	336_E	0.986	0.21
160_N	430_L	0.980	0.21
41_F	293_Y	0.979	0.21
60_E	319_L	0.977	0.21
162_D	299_V	0.966	0.21
56_W	477_G	0.965	0.21
79_G	293_Y	0.963	0.21
131_T	449_I	0.963	0.21
297_L	335_M	0.962	0.21
46_T	52_F	0.961	0.21
183_L	246_F	0.960	0.21
82_A	431_E	0.960	0.21
298_D	335_M	0.955	0.20
172_F	246_F	0.955	0.20
356_V	423_G	0.954	0.20
332_K	443_M	0.950	0.20
257_T	353_V	0.949	0.20
73_K	454_D	0.944	0.20
310_E	314_K	0.944	0.20
94_L	222_M	0.943	0.20
130_I	436_T	0.941	0.20
58_N	392_N	0.938	0.20
149_G	473_K	0.935	0.20
28_N	337_W	0.935	0.20
168_M	347_Y	0.933	0.20
77_R	167_A	0.929	0.20
50_Q	339_L	0.929	0.20
332_K	336_E	0.923	0.20
133_E	138_I	0.922	0.19
387_V	399_T	0.919	0.19
272_V	460_S	0.918	0.19
62_Y	215_D	0.916	0.19
69_K	75_Q	0.915	0.19
146_D	170_S	0.915	0.19
36_V	222_M	0.913	0.19
107_D	387_V	0.912	0.19
415_Y	441_Q	0.906	0.19
418_A	425_V	0.904	0.19
236_W	337_W	0.901	0.19
29_V	258_V	0.899	0.19
80_N	409_M	0.898	0.19
319_L	323_E	0.898	0.19
309_I	332_K	0.898	0.19
338_K	431_E	0.894	0.19
165_Q	392_N	0.894	0.19
248_Y	409_M	0.893	0.19
411_A	433_V	0.893	0.19
63_K	94_L	0.892	0.19
109_Q	396_A	0.890	0.19
381_E	385_I	0.890	0.19
161_F	317_I	0.889	0.19
224_I	264_V	0.886	0.19
88_I	255_Q	0.884	0.19
193_V	474_N	0.884	0.19
341_L	395_T	0.881	0.18
134_R	327_Q	0.880	0.18
70_I	287_E	0.876	0.18
82_A	130_I	0.876	0.18
36_V	90_A	0.875	0.18
107_D	452_Y	0.871	0.18
185_E	398_D	0.870	0.18
74_L	285_S	0.869	0.18
310_E	313_I	0.868	0.18
297_L	334_A	0.867	0.18
260_S	353_V	0.864	0.18
63_K	332_K	0.864	0.18
167_A	322_I	0.862	0.18
185_E	334_A	0.861	0.18
121_Q	236_W	0.861	0.18
251_I	300_F	0.859	0.18
356_V	415_Y	0.857	0.18
215_D	367_D	0.857	0.18
93_H	225_T	0.855	0.18
178_M	394_L	0.854	0.18
201_I	212_I	0.854	0.18
201_I	246_F	0.853	0.18
58_N	282_R	0.852	0.18
28_N	364_S	0.850	0.18
69_K	409_M	0.848	0.18
8_G	394_L	0.844	0.18
145_E	248_Y	0.841	0.17
309_I	331_Y	0.839	0.17
94_L	411_A	0.836	0.17
71_N	299_V	0.831	0.17
3_I	315_D	0.831	0.17
262_T	339_L	0.830	0.17
91_N	225_T	0.830	0.17
172_F	392_N	0.828	0.17
331_Y	338_K	0.828	0.17
134_R	150_G	0.825	0.17
385_I	476_C	0.824	0.17
8_G	185_E	0.823	0.17
356_V	374_N	0.822	0.17
159_K	296_Q	0.822	0.17
39_A	56_W	0.821	0.17
347_Y	387_V	0.821	0.17
251_I	270_L	0.821	0.17
152_F	169_Y	0.820	0.17
73_K	327_Q	0.819	0.17
401_P	404_R	0.817	0.17
98_D	463_R	0.816	0.17
24_V	261_E	0.815	0.17
32_S	232_I	0.815	0.17
176_F	447_L	0.815	0.17
126_P	137_K	0.814	0.17
334_A	447_L	0.813	0.17
226_G	363_Q	0.813	0.17
4_R	473_K	0.812	0.17
258_V	262_T	0.810	0.17
246_F	353_V	0.808	0.17
4_R	239_G	0.807	0.17
25_T	262_T	0.805	0.17
25_T	32_S	0.805	0.17
185_E	257_T	0.805	0.17
76_P	146_D	0.802	0.17
47_K	160_N	0.801	0.16
430_L	433_V	0.799	0.16
155_L	195_T	0.798	0.16
112_H	333_M	0.797	0.16
304_N	322_I	0.795	0.16
93_H	142_P	0.794	0.16
414_H	432_E	0.793	0.16
360_S	406_L	0.792	0.16
56_W	272_V	0.792	0.16
356_V	399_T	0.792	0.16
320_S	377_L	0.790	0.16
194_A	226_G	0.789	0.16
105_D	273_L	0.788	0.16
112_H	451_N	0.788	0.16
246_F	430_L	0.786	0.16
418_A	441_Q	0.785	0.16
104_F	403_L	0.782	0.16
69_K	114_A	0.781	0.16
224_I	437_E	0.780	0.16
25_T	353_V	0.778	0.16
273_L	326_Q	0.778	0.16
145_E	477_G	0.777	0.16
96_G	168_M	0.777	0.16
41_F	130_I	0.776	0.16
54_T	449_I	0.776	0.16
145_E	422_D	0.775	0.16
97_I	401_P	0.774	0.16
4_R	474_N	0.772	0.16
29_V	350_L	0.769	0.16
47_K	477_G	0.766	0.16
39_A	121_Q	0.766	0.16
193_V	279_A	0.766	0.16
394_L	480_F	0.765	0.16
436_T	463_R	0.765	0.16
245_I	262_T	0.765	0.16
155_L	170_S	0.764	0.16
76_P	86_G	0.762	0.16
61_K	327_Q	0.762	0.16
438_A	441_Q	0.761	0.16
166_K	169_Y	0.760	0.16
141_G	255_Q	0.758	0.16
129_L	232_I	0.756	0.15
239_G	383_L	0.755	0.15
133_E	409_M	0.751	0.15
213_D	434_G	0.750	0.15
106_F	139_E	0.750	0.15
40_W	94_L	0.746	0.15
333_M	446_Y	0.746	0.15
290_K	398_D	0.743	0.15
25_T	412_M	0.743	0.15
394_L	402_V	0.743	0.15
81_R	115_P	0.742	0.15
123_I	466_A	0.739	0.15
47_K	93_H	0.738	0.15
97_I	141_G	0.737	0.15
162_D	307_K	0.734	0.15
173_E	261_E	0.733	0.15
365_A	383_L	0.732	0.15
320_S	462_H	0.731	0.15
273_L	404_R	0.730	0.15
193_V	255_Q	0.727	0.15
109_Q	137_K	0.725	0.15
56_W	364_S	0.724	0.15
245_I	253_A	0.723	0.15
2_K	327_Q	0.722	0.15
194_A	375_G	0.721	0.15
142_P	149_G	0.721	0.15
109_Q	201_I	0.721	0.15
109_Q	475_G	0.720	0.15
118_S	121_Q	0.720	0.15
241_S	440_A	0.719	0.15
25_T	240_K	0.719	0.15
326_Q	331_Y	0.716	0.15
393_L	432_E	0.715	0.15
176_F	450_A	0.714	0.15
408_R	430_L	0.714	0.15
267_I	333_M	0.713	0.15
332_K	337_W	0.713	0.15
76_P	401_P	0.713	0.15
99_D	264_V	0.713	0.15
232_I	330_V	0.710	0.14
24_V	292_L	0.710	0.14
67_I	436_T	0.707	0.14
304_N	332_K	0.707	0.14
11_L	32_S	0.706	0.14
225_T	380_V	0.705	0.14
61_K	113_T	0.701	0.14
137_K	142_P	0.700	0.14
94_L	225_T	0.700	0.14
214_Q	351_P	0.699	0.14
273_L	350_L	0.699	0.14
224_I	362_I	0.699	0.14
149_G	383_L	0.698	0.14
4_R	364_S	0.698	0.14
201_I	224_I	0.697	0.14
78_M	93_H	0.697	0.14
333_M	468_E	0.696	0.14
24_V	262_T	0.695	0.14
169_Y	280_I	0.695	0.14
121_Q	142_P	0.693	0.14
392_N	462_H	0.692	0.14
123_I	191_A	0.692	0.14
273_L	286_T	0.691	0.14
104_F	200_A	0.690	0.14
350_L	408_R	0.689	0.14
94_L	239_G	0.688	0.14
248_Y	457_V	0.685	0.14
241_S	321_V	0.684	0.14
123_I	309_I	0.683	0.14
326_Q	332_K	0.683	0.14
201_I	245_I	0.682	0.14
79_G	354_W	0.682	0.14
135_M	139_E	0.680	0.14
120_S	454_D	0.679	0.14
105_D	129_L	0.678	0.14
394_L	474_N	0.676	0.14
286_T	291_D	0.676	0.14
272_V	297_L	0.675	0.14
160_N	376_I	0.673	0.14
241_S	473_K	0.671	0.14
313_I	323_E	0.671	0.14
29_V	262_T	0.670	0.14
289_E	434_G	0.670	0.14
130_I	260_S	0.670	0.14
372_G	376_I	0.669	0.14
39_A	126_P	0.667	0.14
319_L	322_I	0.666	0.14
6_Q	10_V	0.666	0.14
104_F	416_K	0.664	0.14
171_Q	238_S	0.664	0.14
185_E	261_E	0.663	0.14
261_E	452_Y	0.663	0.14
138_I	248_Y	0.662	0.14
245_I	339_L	0.661	0.13
234_F	410_L	0.659	0.13
215_D	394_L	0.657	0.13
151_E	154_K	0.655	0.13
81_R	121_Q	0.655	0.13
164_I	387_V	0.654	0.13
350_L	376_I	0.653	0.13
366_A	370_E	0.652	0.13
81_R	267_I	0.652	0.13
3_I	301_L	0.651	0.13
134_R	146_D	0.650	0.13
106_F	422_D	0.650	0.13
174_N	399_T	0.650	0.13
76_P	260_S	0.649	0.13
133_E	467_R	0.649	0.13
201_I	225_T	0.648	0.13
258_V	381_E	0.647	0.13
77_R	458_V	0.644	0.13
330_V	339_L	0.644	0.13
47_K	376_I	0.643	0.13
105_D	241_S	0.642	0.13
298_D	475_G	0.642	0.13
257_T	360_S	0.641	0.13
332_K	338_K	0.639	0.13
126_P	234_F	0.638	0.13
443_M	460_S	0.637	0.13
256_P	261_E	0.637	0.13
161_F	297_L	0.636	0.13
39_A	405_A	0.636	0.13
476_C	484_C	0.634	0.13
12_N	176_F	0.634	0.13
260_S	360_S	0.634	0.13
7_V	356_V	0.633	0.13
304_N	336_E	0.633	0.13
307_K	426_D	0.633	0.13
105_D	200_A	0.633	0.13
40_W	433_V	0.633	0.13
323_E	387_V	0.632	0.13
427_T	436_T	0.632	0.13
163_N	273_L	0.631	0.13
213_D	256_P	0.631	0.13
121_Q	193_V	0.626	0.13
173_E	457_V	0.626	0.13
1_M	6_Q	0.626	0.13
115_P	150_G	0.625	0.13
161_F	388_Q	0.625	0.13
160_N	163_N	0.625	0.13
2_K	87_K	0.624	0.13
282_R	374_N	0.623	0.13
188_L	299_V	0.622	0.13
67_I	195_T	0.619	0.13
287_E	326_Q	0.619	0.13
394_L	477_G	0.619	0.13
380_V	407_K	0.618	0.13
107_D	110_N	0.616	0.13
10_V	14_D	0.615	0.13
4_R	56_W	0.615	0.13
167_A	402_V	0.613	0.13
87_K	142_P	0.613	0.13
77_R	113_T	0.612	0.13
4_R	236_W	0.611	0.13
170_S	347_Y	0.611	0.13
466_A	469_A	0.606	0.12
129_L	472_E	0.606	0.12
261_E	443_M	0.603	0.12
299_V	314_K	0.599	0.12
96_G	347_Y	0.598	0.12
94_L	255_Q	0.598	0.12
222_M	481_G	0.597	0.12
209_I	251_I	0.595	0.12
25_T	260_S	0.594	0.12
104_F	238_S	0.593	0.12
362_I	378_P	0.593	0.12
161_F	363_Q	0.592	0.12
238_S	377_L	0.592	0.12
360_S	452_Y	0.592	0.12
88_I	388_Q	0.591	0.12
8_G	67_I	0.590	0.12
167_A	341_L	0.590	0.12
76_P	123_I	0.590	0.12
469_A	482_D	0.590	0.12
94_L	365_A	0.589	0.12
8_G	213_D	0.589	0.12
77_R	463_R	0.589	0.12
314_K	408_R	0.587	0.12
131_T	436_T	0.587	0.12
118_S	145_E	0.587	0.12
258_V	341_L	0.587	0.12
195_T	319_L	0.585	0.12
120_S	341_L	0.584	0.12
151_E	172_F	0.584	0.12
236_W	378_P	0.584	0.12
120_S	281_E	0.583	0.12
309_I	322_I	0.581	0.12
15_K	30_W	0.581	0.12
262_T	353_V	0.580	0.12
84_L	88_I	0.580	0.12
141_G	273_L	0.578	0.12
71_N	291_D	0.578	0.12
4_R	29_V	0.577	0.12
161_F	169_Y	0.576	0.12
11_L	185_E	0.576	0.12
185_E	353_V	0.574	0.12
112_H	120_S	0.574	0.12
162_D	430_L	0.572	0.12
239_G	411_A	0.572	0.12
194_A	454_D	0.572	0.12
94_L	280_I	0.571	0.12
105_D	150_G	0.571	0.12
97_I	260_S	0.570	0.12
362_I	411_A	0.570	0.12
12_N	450_A	0.569	0.12
79_G	353_V	0.569	0.12
32_S	84_L	0.568	0.12
80_N	215_D	0.568	0.12
61_K	314_K	0.567	0.12
378_P	477_G	0.566	0.12
427_T	431_E	0.566	0.12
112_H	161_F	0.566	0.12
172_F	448_A	0.565	0.12
152_F	161_F	0.564	0.12
429_A	432_E	0.564	0.12
138_I	164_I	0.564	0.12
479_T	482_D	0.563	0.12
138_I	175_T	0.562	0.12
59_Q	230_K	0.562	0.12
418_A	423_G	0.562	0.12
333_M	447_L	0.561	0.12
297_L	395_T	0.561	0.12
178_M	209_I	0.561	0.12
215_D	219_G	0.561	0.12
3_I	6_Q	0.560	0.12
88_I	174_N	0.560	0.12
11_L	25_T	0.558	0.12
25_T	257_T	0.557	0.12
272_V	293_Y	0.557	0.12
147_D	170_S	0.555	0.12
168_M	378_P	0.555	0.12
282_R	304_N	0.554	0.12
258_V	353_V	0.553	0.12
339_L	430_L	0.553	0.12
77_R	288_N	0.552	0.11
246_F	467_R	0.552	0.11
7_V	273_L	0.551	0.11
94_L	383_L	0.550	0.11
178_M	402_V	0.550	0.11
157_K	297_L	0.550	0.11
238_S	323_E	0.549	0.11
61_K	419_E	0.549	0.11
188_L	248_Y	0.548	0.11
116_E	463_R	0.547	0.11
130_I	378_P	0.547	0.11
82_A	86_G	0.546	0.11
116_E	382_S	0.546	0.11
183_L	322_I	0.545	0.11
255_Q	339_L	0.543	0.11
380_V	479_T	0.543	0.11
106_F	112_H	0.543	0.11
382_S	414_H	0.542	0.11
69_K	287_E	0.542	0.11
280_I	363_Q	0.541	0.11
159_K	341_L	0.541	0.11
258_V	261_E	0.541	0.11
141_G	253_A	0.541	0.11
225_T	426_D	0.540	0.11
179_Y	387_V	0.539	0.11
339_L	408_R	0.539	0.11
56_W	456_F	0.538	0.11
178_M	300_F	0.538	0.11
139_E	167_A	0.538	0.11
67_I	330_V	0.538	0.11
157_K	308_V	0.537	0.11
294_Q	408_R	0.537	0.11
80_N	411_A	0.537	0.11
62_Y	354_W	0.536	0.11
60_E	279_A	0.535	0.11
168_M	421_V	0.534	0.11
87_K	463_R	0.534	0.11
388_Q	405_A	0.533	0.11
127_R	320_S	0.532	0.11
24_V	399_T	0.532	0.11
81_R	156_A	0.532	0.11
3_I	118_S	0.531	0.11
94_L	399_T	0.531	0.11
117_G	394_L	0.530	0.11
97_I	439_Q	0.529	0.11
364_S	394_L	0.529	0.11
142_P	468_E	0.528	0.11
377_L	380_V	0.528	0.11
334_A	354_W	0.528	0.11
151_E	157_K	0.528	0.11
341_L	405_A	0.527	0.11
179_Y	191_A	0.527	0.11
171_Q	174_N	0.526	0.11
14_D	20_H	0.526	0.11
155_L	161_F	0.526	0.11
377_L	402_V	0.524	0.11
90_A	121_Q	0.524	0.11
106_F	149_G	0.524	0.11
238_S	262_T	0.524	0.11
161_F	403_L	0.523	0.11
63_K	288_N	0.523	0.11
114_A	393_L	0.522	0.11
253_A	363_Q	0.521	0.11
339_L	405_A	0.521	0.11
13_L	19_C	0.521	0.11
16_C	22_C	0.521	0.11
13_L	16_C	0.521	0.11
13_L	22_C	0.521	0.11
16_C	19_C	0.521	0.11
19_C	22_C	0.521	0.11
76_P	83_M	0.521	0.11
140_K	396_A	0.521	0.11
159_K	377_L	0.520	0.11
294_Q	300_F	0.520	0.11
177_M	246_F	0.519	0.11
363_Q	375_G	0.518	0.11
185_E	293_Y	0.518	0.11
176_F	383_L	0.517	0.11
310_E	315_D	0.515	0.11
309_I	317_I	0.514	0.11
135_M	311_Q	0.514	0.11
311_Q	317_I	0.514	0.11
257_T	450_A	0.513	0.11
139_E	374_N	0.513	0.11
248_Y	418_A	0.513	0.11
104_F	410_L	0.513	0.11
161_F	165_Q	0.510	0.11
55_D	162_D	0.510	0.11
373_S	376_I	0.510	0.11
114_A	154_K	0.510	0.11
234_F	381_E	0.509	0.11
168_M	267_I	0.508	0.11
142_P	253_A	0.508	0.11
234_F	369_G	0.508	0.11
2_K	454_D	0.507	0.11
201_I	449_I	0.507	0.11
209_I	213_D	0.507	0.11
12_N	177_M	0.507	0.11
425_V	437_E	0.507	0.11
145_E	160_N	0.506	0.11
190_P	321_V	0.506	0.11
4_R	280_I	0.506	0.11
326_Q	445_R	0.505	0.11
125_R	131_T	0.505	0.11
115_P	168_M	0.503	0.11
5_S	339_L	0.503	0.11
176_F	333_M	0.502	0.11
170_S	469_A	0.502	0.11
191_A	195_T	0.502	0.11
176_F	360_S	0.501	0.11
266_R	354_W	0.501	0.11
4_R	222_M	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1q16B	2	0.9922	100	0.447	Contact Map
2ivfB	1	0.6582	100	0.718	Contact Map
1ti6B	2	0.5176	100	0.902	Contact Map
1h0hB	1	0.4082	99.9	0.913	Contact Map
2vpzB	2	0.375	99.9	0.913	Contact Map
1kqfB	3	0.4863	99.9	0.919	Contact Map
4z3xE	2	0.3281	99.5	0.947	Contact Map
1jnrB	1	0.2734	99.4	0.95	Contact Map
3mm5B	2	0.5117	99.2	0.955	Contact Map
3gyxB	1	0.2988	99.1	0.956	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0127 seconds.