KBAZ - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

KBAZ - D-tagatose-1,6-bisphosphate aldolase subunit KbaZ

UniProt:	P0C8K0	Sequences: MKHLTEMVRQHKAGKTNGIYAVCSAHPLVLEAAIRYASANQTPLLIEATSNQVDQFGGYTGMTPADFRGFVCQLADSLNFPQDALILGGDHLGPNRWQNLPAAQAMANADDLIKSYVAAGFKKIHLDCSMSCQDDPIPLTDDIVAERAARLAKVAEETCLEHFGEADLEYVIGTEVPVPGGAHETLSELAVTTPDAARATLEAHRHAFEKQGLNAIWPRIIALVVQPGVEFDHTNVIDYQPAKASALSQMVENYETLIFEAHSTDYQTPQSLRQLVIDHFAILKVGPALTFALREALFSLAAIEEELVPAKACSGLRQVLEDVMLDRPEYWQSHYHGDGNARRLARGYSYSDRVRYYWPDSQIDDAFAHLVRNLADSPIPLPLISQYLPLQYVKVRSGELQPTPRELIINHIQDILAQYHTACEGQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG12763
Length:	426 (419)
Sequences:	366 (254)
Seq/√Len:	12.4

ECOLI - KBAZ GATZ

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
239_Y	278_D	6.986	1.00
110_D	150_R	6.105	1.00
76_D	82_Q	4.939	1.00
241_P	277_I	4.618	1.00
371_V	408_I	4.544	1.00
117_V	124_I	4.014	0.99
100_L	108_N	3.971	0.99
31_E	77_S	3.788	0.99
10_Q	15_K	3.663	0.99
171_V	222_A	3.648	0.99
337_G	346_R	3.621	0.99
153_K	157_E	3.589	0.99
238_D	396_R	3.585	0.99
323_V	363_I	3.493	0.99
113_I	154_V	3.463	0.98
415_I	418_Q	3.360	0.98
31_E	78_L	3.339	0.98
394_K	410_N	3.338	0.98
304_E	373_N	3.126	0.97
50_S	96_R	3.125	0.97
304_E	314_S	3.102	0.97
156_E	170_Y	3.037	0.96
408_I	412_I	3.019	0.96
56_F	108_N	2.913	0.95
321_E	346_R	2.910	0.95
54_D	96_R	2.906	0.95
34_I	44_L	2.873	0.95
320_L	363_I	2.736	0.93
314_S	373_N	2.694	0.93
50_S	95_N	2.629	0.92
35_R	409_I	2.491	0.90
100_L	104_Q	2.486	0.89
36_Y	413_Q	2.460	0.89
261_A	280_F	2.440	0.89
30_L	84_A	2.425	0.88
113_I	155_A	2.329	0.86
68_R	87_L	2.249	0.84
197_A	223_L	2.244	0.84
306_E	348_Y	2.222	0.83
28_L	371_V	2.217	0.83
142_D	199_A	2.098	0.79
131_S	178_V	2.079	0.79
30_L	74_L	2.071	0.78
269_P	421_T	2.044	0.77
182_A	230_E	2.021	0.77
375_A	404_P	2.013	0.76
403_T	406_E	1.967	0.75
174_T	204_H	1.956	0.74
410_N	417_A	1.918	0.73
339_G	342_R	1.914	0.73
350_Y	381_L	1.879	0.71
22_V	416_L	1.859	0.70
33_A	44_L	1.833	0.69
314_S	319_V	1.773	0.66
10_Q	13_A	1.757	0.66
273_R	277_I	1.741	0.65
96_R	112_L	1.736	0.65
36_Y	40_N	1.714	0.64
345_A	350_Y	1.688	0.62
44_L	85_L	1.684	0.62
146_E	210_K	1.682	0.62
63_T	191_V	1.678	0.62
375_A	403_T	1.665	0.61
50_S	98_Q	1.657	0.61
296_A	408_I	1.653	0.61
384_I	402_P	1.640	0.60
131_S	135_D	1.627	0.59
204_H	358_W	1.607	0.59
174_T	358_W	1.606	0.58
178_V	334_H	1.583	0.57
117_V	159_C	1.582	0.57
272_L	288_A	1.579	0.57
54_D	301_A	1.569	0.57
301_A	319_V	1.549	0.56
401_Q	406_E	1.516	0.54
19_I	86_I	1.511	0.54
18_G	276_V	1.502	0.53
220_I	255_E	1.502	0.53
195_D	213_L	1.497	0.53
111_D	114_K	1.489	0.53
4_L	221_I	1.480	0.52
24_S	67_F	1.447	0.50
31_E	405_R	1.440	0.50
111_D	115_S	1.438	0.50
255_E	361_S	1.438	0.50
11_H	279_H	1.435	0.50
391_Q	410_N	1.431	0.50
62_M	70_F	1.423	0.49
301_A	314_S	1.416	0.49
298_F	321_E	1.409	0.48
68_R	74_L	1.407	0.48
298_F	347_G	1.401	0.48
296_A	412_I	1.389	0.47
288_A	410_N	1.389	0.47
101_P	104_Q	1.379	0.47
325_L	395_V	1.375	0.47
248_S	387_Y	1.368	0.46
34_I	78_L	1.357	0.46
395_V	402_P	1.355	0.46
48_A	121_F	1.352	0.46
220_I	257_L	1.338	0.45
222_A	327_R	1.332	0.45
316_L	367_F	1.325	0.44
251_V	279_H	1.325	0.44
46_I	71_V	1.324	0.44
297_L	367_F	1.318	0.44
293_L	297_L	1.314	0.44
54_D	108_N	1.307	0.43
150_R	196_A	1.303	0.43
292_A	415_I	1.301	0.43
103_A	134_D	1.296	0.43
391_Q	411_H	1.292	0.43
77_S	107_A	1.280	0.42
144_V	178_V	1.279	0.42
131_S	144_V	1.275	0.42
202_E	206_H	1.271	0.42
207_A	210_K	1.267	0.41
44_L	54_D	1.265	0.41
102_A	134_D	1.255	0.41
305_E	313_C	1.253	0.41
122_K	166_A	1.252	0.41
251_V	350_Y	1.251	0.41
269_P	418_Q	1.249	0.40
24_S	29_V	1.247	0.40
132_C	261_A	1.231	0.40
55_Q	112_L	1.219	0.39
395_V	407_L	1.204	0.38
95_N	174_T	1.198	0.38
95_N	334_H	1.197	0.38
8_V	12_K	1.194	0.38
209_E	214_N	1.181	0.37
12_K	30_L	1.171	0.37
148_A	280_F	1.169	0.37
70_F	191_V	1.168	0.37
298_F	320_L	1.161	0.36
304_E	363_I	1.159	0.36
198_R	253_N	1.158	0.36
184_E	194_P	1.149	0.36
302_A	404_P	1.145	0.35
31_E	74_L	1.145	0.35
392_Y	395_V	1.139	0.35
168_L	279_H	1.136	0.35
96_R	109_A	1.127	0.35
72_C	85_L	1.122	0.34
76_D	375_A	1.121	0.34
122_K	167_D	1.105	0.34
115_S	118_A	1.099	0.33
413_Q	417_A	1.085	0.33
54_D	112_L	1.082	0.33
148_A	261_A	1.082	0.33
128_C	279_H	1.077	0.32
98_Q	109_A	1.073	0.32
394_K	414_D	1.064	0.32
37_A	422_A	1.063	0.32
182_A	186_L	1.062	0.32
205_R	217_W	1.058	0.31
241_P	274_Q	1.053	0.31
80_F	85_L	1.049	0.31
44_L	340_N	1.035	0.30
114_K	158_T	1.031	0.30
6_E	38_S	1.031	0.30
182_A	321_E	1.021	0.30
304_E	315_G	1.020	0.30
132_C	174_T	1.020	0.30
153_K	211_Q	1.019	0.30
201_L	254_Y	1.017	0.30
55_Q	108_N	1.013	0.30
22_V	261_A	1.010	0.29
141_D	346_R	1.004	0.29
178_V	232_D	0.999	0.29
391_Q	400_L	0.996	0.29
20_Y	140_T	0.990	0.29
103_A	404_P	0.990	0.29
98_Q	112_L	0.985	0.28
95_N	358_W	0.985	0.28
50_S	144_V	0.981	0.28
72_C	82_Q	0.977	0.28
350_Y	392_Y	0.974	0.28
132_C	197_A	0.973	0.28
295_E	385_S	0.971	0.28
222_A	404_P	0.971	0.28
116_Y	121_F	0.970	0.28
20_Y	420_H	0.969	0.28
30_L	70_F	0.965	0.28
297_L	316_L	0.965	0.28
50_S	112_L	0.960	0.27
343_R	346_R	0.960	0.27
390_L	414_D	0.952	0.27
121_F	226_Q	0.952	0.27
41_Q	84_A	0.947	0.27
11_H	252_E	0.946	0.27
98_Q	131_S	0.942	0.27
205_R	369_H	0.940	0.27
11_H	98_Q	0.938	0.26
226_Q	351_S	0.936	0.26
293_L	418_Q	0.934	0.26
132_C	204_H	0.933	0.26
232_D	423_C	0.928	0.26
19_I	212_G	0.926	0.26
81_P	195_D	0.925	0.26
30_L	299_S	0.924	0.26
48_A	54_D	0.921	0.26
6_E	79_N	0.920	0.26
37_A	44_L	0.917	0.26
26_H	95_N	0.915	0.26
244_A	278_D	0.910	0.25
31_E	359_P	0.909	0.25
205_R	209_E	0.909	0.25
171_V	333_S	0.906	0.25
334_H	408_I	0.906	0.25
48_A	68_R	0.904	0.25
400_L	420_H	0.903	0.25
280_F	358_W	0.902	0.25
132_C	280_F	0.902	0.25
39_A	193_T	0.901	0.25
402_P	407_L	0.896	0.25
6_E	9_R	0.894	0.25
301_A	304_E	0.893	0.25
35_R	413_Q	0.889	0.25
97_W	231_F	0.888	0.25
36_Y	416_L	0.887	0.24
384_I	403_T	0.886	0.24
271_S	415_I	0.885	0.24
56_F	112_L	0.883	0.24
76_D	255_E	0.882	0.24
68_R	72_C	0.882	0.24
184_E	336_H	0.881	0.24
153_K	215_A	0.879	0.24
50_S	223_L	0.870	0.24
338_D	341_A	0.870	0.24
95_N	186_L	0.869	0.24
385_S	392_Y	0.868	0.24
20_Y	42_T	0.863	0.24
320_L	334_H	0.862	0.24
112_L	154_V	0.857	0.23
384_I	404_P	0.857	0.23
98_Q	233_H	0.854	0.23
56_F	100_L	0.852	0.23
10_Q	14_G	0.848	0.23
304_E	391_Q	0.845	0.23
96_R	128_C	0.844	0.23
50_S	197_A	0.840	0.23
54_D	141_D	0.839	0.23
103_A	107_A	0.837	0.23
95_N	132_C	0.834	0.23
69_G	416_L	0.834	0.23
302_A	387_Y	0.833	0.23
102_A	261_A	0.830	0.22
204_H	261_A	0.830	0.22
268_T	396_R	0.829	0.22
135_D	232_D	0.828	0.22
412_I	416_L	0.828	0.22
384_I	407_L	0.825	0.22
168_L	272_L	0.825	0.22
80_F	84_A	0.825	0.22
104_Q	187_S	0.824	0.22
251_V	330_Y	0.821	0.22
83_D	214_N	0.820	0.22
187_S	404_P	0.819	0.22
413_Q	416_L	0.819	0.22
19_I	349_S	0.815	0.22
54_D	354_V	0.815	0.22
112_L	391_Q	0.814	0.22
250_M	274_Q	0.811	0.22
56_F	288_A	0.809	0.22
39_A	413_Q	0.809	0.22
279_H	423_C	0.808	0.22
70_F	384_I	0.808	0.22
73_Q	412_I	0.806	0.22
102_A	107_A	0.805	0.22
202_E	214_N	0.805	0.22
317_R	416_L	0.804	0.21
160_L	164_G	0.798	0.21
171_V	369_H	0.798	0.21
272_L	341_A	0.797	0.21
112_L	135_D	0.797	0.21
72_C	76_D	0.797	0.21
50_S	54_D	0.796	0.21
186_L	421_T	0.796	0.21
28_L	208_F	0.796	0.21
385_S	398_G	0.795	0.21
132_C	275_L	0.795	0.21
272_L	392_Y	0.793	0.21
50_S	288_A	0.792	0.21
50_S	272_L	0.792	0.21
222_A	374_L	0.789	0.21
30_L	44_L	0.785	0.21
276_V	351_S	0.784	0.21
233_H	345_A	0.783	0.21
65_A	103_A	0.782	0.21
272_L	422_A	0.781	0.21
204_H	275_L	0.781	0.21
50_S	384_I	0.781	0.21
103_A	318_Q	0.780	0.21
4_L	42_T	0.779	0.21
26_H	354_V	0.779	0.21
100_L	140_T	0.777	0.21
36_Y	272_L	0.776	0.21
95_N	204_H	0.773	0.20
171_V	382_P	0.773	0.20
216_I	223_L	0.772	0.20
320_L	323_V	0.771	0.20
204_H	233_H	0.771	0.20
250_M	259_F	0.769	0.20
227_P	351_S	0.769	0.20
26_H	148_A	0.767	0.20
121_F	415_I	0.765	0.20
361_S	365_D	0.765	0.20
190_A	408_I	0.765	0.20
250_M	279_H	0.764	0.20
34_I	38_S	0.764	0.20
131_S	334_H	0.762	0.20
30_L	71_V	0.762	0.20
409_I	420_H	0.760	0.20
201_L	250_M	0.760	0.20
15_K	421_T	0.759	0.20
111_D	375_A	0.759	0.20
240_Q	243_K	0.758	0.20
74_L	78_L	0.758	0.20
56_F	391_Q	0.753	0.20
171_V	405_R	0.750	0.20
20_Y	422_A	0.750	0.20
402_P	415_I	0.750	0.20
399_E	403_T	0.747	0.20
36_Y	420_H	0.746	0.20
297_L	388_L	0.746	0.20
220_I	413_Q	0.743	0.19
30_L	407_L	0.740	0.19
316_L	370_L	0.740	0.19
319_V	322_D	0.738	0.19
202_E	205_R	0.737	0.19
100_L	259_F	0.735	0.19
130_M	244_A	0.733	0.19
28_L	408_I	0.732	0.19
24_S	230_E	0.732	0.19
241_P	278_D	0.731	0.19
257_L	338_D	0.731	0.19
30_L	412_I	0.731	0.19
80_F	191_V	0.731	0.19
74_L	108_N	0.729	0.19
50_S	391_Q	0.725	0.19
198_R	213_L	0.725	0.19
144_V	301_A	0.723	0.19
80_F	282_I	0.722	0.19
131_S	232_D	0.722	0.19
4_L	71_V	0.720	0.19
194_P	197_A	0.719	0.19
337_G	341_A	0.719	0.19
377_S	394_K	0.718	0.19
301_A	382_P	0.718	0.19
254_Y	323_V	0.717	0.19
185_T	401_Q	0.717	0.19
20_Y	416_L	0.716	0.19
388_L	407_L	0.716	0.19
406_E	417_A	0.715	0.19
117_V	199_A	0.715	0.19
20_Y	40_N	0.715	0.19
409_I	421_T	0.714	0.19
131_S	138_P	0.713	0.19
80_F	384_I	0.711	0.18
113_I	158_T	0.711	0.18
337_G	343_R	0.710	0.18
169_E	217_W	0.709	0.18
322_D	362_Q	0.708	0.18
167_D	199_A	0.708	0.18
76_D	274_Q	0.707	0.18
154_V	158_T	0.707	0.18
384_I	395_V	0.706	0.18
239_Y	404_P	0.706	0.18
397_S	418_Q	0.706	0.18
194_P	244_A	0.706	0.18
289_L	298_F	0.706	0.18
42_T	293_L	0.705	0.18
320_L	354_V	0.704	0.18
368_A	371_V	0.704	0.18
38_S	74_L	0.704	0.18
148_A	204_H	0.702	0.18
153_K	242_A	0.700	0.18
258_I	366_A	0.699	0.18
286_G	355_R	0.697	0.18
408_I	420_H	0.696	0.18
207_A	348_Y	0.695	0.18
348_Y	387_Y	0.695	0.18
25_A	230_E	0.693	0.18
185_T	414_D	0.692	0.18
184_E	255_E	0.692	0.18
339_G	346_R	0.692	0.18
315_G	318_Q	0.689	0.18
68_R	400_L	0.688	0.18
82_Q	403_T	0.688	0.18
82_Q	85_L	0.686	0.18
334_H	397_S	0.684	0.18
30_L	399_E	0.684	0.18
152_A	216_I	0.683	0.18
217_W	235_N	0.683	0.18
313_C	361_S	0.681	0.18
397_S	412_I	0.677	0.17
4_L	24_S	0.677	0.17
76_D	79_N	0.677	0.17
187_S	372_R	0.676	0.17
20_Y	418_Q	0.675	0.17
107_A	203_A	0.674	0.17
339_G	371_V	0.673	0.17
144_V	233_H	0.673	0.17
128_C	154_V	0.673	0.17
27_P	102_A	0.671	0.17
195_D	218_P	0.671	0.17
202_E	378_P	0.668	0.17
40_N	387_Y	0.667	0.17
376_D	408_I	0.667	0.17
196_A	316_L	0.666	0.17
30_L	402_P	0.664	0.17
80_F	143_I	0.663	0.17
148_A	174_T	0.659	0.17
30_L	43_P	0.659	0.17
337_G	345_A	0.658	0.17
327_R	360_D	0.656	0.17
172_I	374_L	0.652	0.17
168_L	278_D	0.651	0.17
184_E	187_S	0.650	0.17
54_D	154_V	0.649	0.17
307_L	377_S	0.649	0.17
270_Q	313_C	0.647	0.17
109_A	416_L	0.646	0.17
234_T	350_Y	0.646	0.17
130_M	351_S	0.646	0.17
303_I	379_I	0.644	0.16
303_I	383_L	0.644	0.16
48_A	189_L	0.644	0.16
103_A	157_E	0.644	0.16
301_A	305_E	0.642	0.16
132_C	358_W	0.641	0.16
307_L	379_I	0.641	0.16
174_T	233_H	0.641	0.16
168_L	239_Y	0.639	0.16
35_R	122_K	0.639	0.16
191_V	395_V	0.638	0.16
130_M	386_Q	0.638	0.16
209_E	327_R	0.638	0.16
210_K	365_D	0.635	0.16
231_F	236_V	0.635	0.16
152_A	158_T	0.634	0.16
241_P	272_L	0.634	0.16
206_H	210_K	0.633	0.16
192_T	266_Y	0.632	0.16
350_Y	416_L	0.630	0.16
23_C	49_T	0.629	0.16
282_I	349_S	0.628	0.16
49_T	286_G	0.626	0.16
333_S	407_L	0.626	0.16
49_T	355_R	0.626	0.16
38_S	41_Q	0.625	0.16
206_H	246_A	0.625	0.16
157_E	215_A	0.624	0.16
200_T	227_P	0.623	0.16
184_E	189_L	0.622	0.16
26_H	327_R	0.621	0.16
205_R	249_Q	0.620	0.16
280_F	354_V	0.619	0.16
132_C	148_A	0.617	0.16
38_S	334_H	0.616	0.16
140_T	413_Q	0.612	0.16
201_L	330_Y	0.610	0.16
323_V	360_D	0.610	0.16
56_F	411_H	0.610	0.16
35_R	78_L	0.606	0.15
60_T	200_T	0.606	0.15
322_D	412_I	0.606	0.15
405_R	409_I	0.605	0.15
96_R	279_H	0.603	0.15
332_Q	365_D	0.602	0.15
251_V	346_R	0.602	0.15
157_E	372_R	0.600	0.15
41_Q	377_S	0.599	0.15
23_C	29_V	0.597	0.15
159_C	168_L	0.597	0.15
76_D	384_I	0.596	0.15
354_V	391_Q	0.596	0.15
44_L	396_R	0.596	0.15
279_H	321_E	0.595	0.15
263_S	267_Q	0.594	0.15
188_E	243_K	0.594	0.15
43_P	189_L	0.594	0.15
50_S	128_C	0.593	0.15
232_D	279_H	0.592	0.15
401_Q	421_T	0.592	0.15
319_V	323_V	0.591	0.15
244_A	351_S	0.590	0.15
397_S	402_P	0.589	0.15
246_A	277_I	0.589	0.15
115_S	159_C	0.589	0.15
128_C	164_G	0.587	0.15
7_M	14_G	0.586	0.15
350_Y	382_P	0.583	0.15
233_H	349_S	0.582	0.15
146_E	399_E	0.581	0.15
36_Y	384_I	0.580	0.15
188_E	218_P	0.580	0.15
201_L	405_R	0.580	0.15
131_S	252_E	0.579	0.15
76_D	409_I	0.579	0.15
378_P	387_Y	0.579	0.15
210_K	246_A	0.577	0.15
37_A	217_W	0.576	0.15
65_A	142_D	0.574	0.15
95_N	261_A	0.573	0.15
207_A	330_Y	0.572	0.15
183_H	233_H	0.571	0.15
14_G	34_I	0.571	0.15
198_R	406_E	0.571	0.15
40_N	293_L	0.570	0.15
102_A	358_W	0.569	0.14
44_L	139_L	0.569	0.14
47_E	263_S	0.568	0.14
154_V	172_I	0.568	0.14
244_A	248_S	0.567	0.14
178_V	233_H	0.566	0.14
8_V	256_T	0.566	0.14
79_N	189_L	0.565	0.14
318_Q	413_Q	0.565	0.14
414_D	417_A	0.563	0.14
73_Q	406_E	0.563	0.14
315_G	321_E	0.563	0.14
146_E	207_A	0.563	0.14
298_F	363_I	0.562	0.14
9_R	322_D	0.562	0.14
24_S	289_L	0.561	0.14
82_Q	362_Q	0.561	0.14
30_L	303_I	0.560	0.14
118_A	302_A	0.559	0.14
354_V	358_W	0.559	0.14
114_K	118_A	0.558	0.14
340_N	343_R	0.557	0.14
270_Q	412_I	0.556	0.14
399_E	418_Q	0.556	0.14
122_K	165_E	0.555	0.14
142_D	222_A	0.555	0.14
7_M	146_E	0.554	0.14
263_S	294_R	0.553	0.14
218_P	329_E	0.553	0.14
159_C	307_L	0.553	0.14
342_R	420_H	0.553	0.14
226_Q	259_F	0.552	0.14
38_S	81_P	0.551	0.14
6_E	410_N	0.550	0.14
86_I	241_P	0.550	0.14
135_D	350_Y	0.550	0.14
394_K	417_A	0.550	0.14
219_R	358_W	0.550	0.14
157_E	245_S	0.549	0.14
174_T	261_A	0.549	0.14
337_G	342_R	0.549	0.14
73_Q	270_Q	0.547	0.14
258_I	413_Q	0.546	0.14
172_I	348_Y	0.546	0.14
194_P	387_Y	0.545	0.14
326_D	338_D	0.545	0.14
128_C	234_T	0.545	0.14
7_M	348_Y	0.545	0.14
286_G	290_T	0.544	0.14
290_T	355_R	0.544	0.14
77_S	201_L	0.540	0.14
5_T	410_N	0.539	0.14
200_T	225_V	0.539	0.14
20_Y	394_K	0.538	0.14
320_L	337_G	0.538	0.14
179_P	227_P	0.536	0.14
154_V	216_I	0.535	0.14
80_F	83_D	0.535	0.14
30_L	392_Y	0.534	0.14
126_L	204_H	0.532	0.14
130_M	276_V	0.531	0.14
96_R	289_L	0.530	0.14
185_T	188_E	0.530	0.14
381_L	389_P	0.530	0.14
159_C	274_Q	0.530	0.14
89_G	263_S	0.526	0.13
22_V	48_A	0.526	0.13
46_I	397_S	0.524	0.13
95_N	116_Y	0.524	0.13
233_H	391_Q	0.524	0.13
68_R	405_R	0.524	0.13
108_N	216_I	0.523	0.13
186_L	190_A	0.522	0.13
402_P	408_I	0.520	0.13
186_L	237_I	0.520	0.13
98_Q	288_A	0.520	0.13
263_S	352_D	0.520	0.13
141_D	169_E	0.520	0.13
238_D	297_L	0.519	0.13
388_L	411_H	0.519	0.13
117_V	275_L	0.519	0.13
216_I	371_V	0.518	0.13
39_A	378_P	0.517	0.13
33_A	108_N	0.517	0.13
321_E	339_G	0.517	0.13
25_A	67_F	0.517	0.13
267_Q	352_D	0.516	0.13
22_V	102_A	0.515	0.13
216_I	273_R	0.515	0.13
269_P	390_L	0.515	0.13
13_A	332_Q	0.514	0.13
275_L	358_W	0.513	0.13
184_E	344_L	0.513	0.13
168_L	382_P	0.513	0.13
395_V	406_E	0.513	0.13
395_V	400_L	0.512	0.13
413_Q	422_A	0.511	0.13
392_Y	396_R	0.510	0.13
109_A	324_M	0.510	0.13
187_S	403_T	0.510	0.13
137_I	201_L	0.509	0.13
22_V	33_A	0.509	0.13
73_Q	77_S	0.509	0.13
385_S	391_Q	0.509	0.13
4_L	19_I	0.509	0.13
77_S	421_T	0.509	0.13
259_F	291_F	0.509	0.13
298_F	346_R	0.506	0.13
146_E	404_P	0.505	0.13
206_H	215_A	0.504	0.13
99_N	399_E	0.504	0.13
8_V	363_I	0.504	0.13
26_H	261_A	0.504	0.13
132_C	159_C	0.503	0.13
34_I	344_L	0.501	0.13
99_N	214_N	0.500	0.13
131_S	233_H	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2fiqA	4	0.9648	100	0.382	Contact Map
3txvA	2	0.9085	100	0.396	Contact Map
4to8A	2	0.6268	99.9	0.873	Contact Map
3elfA	4	0.7183	99.9	0.876	Contact Map
1gvfA	3	0.6432	99.9	0.882	Contact Map
3pm6A	2	0.6549	98.9	0.936	Contact Map
1rvgA	3	0.6455	98.8	0.939	Contact Map
2iswA	2	0.6667	98.7	0.94	Contact Map
3qm3A	4	0.7113	98.6	0.942	Contact Map
1dosA	2	0.6901	98.6	0.942	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.012 seconds.