PITA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PITA - Low-affinity inorganic phosphate transporter 1

UniProt:	P0AFJ7	Sequences: MLHLFAGLDLHTGLLLLLALAFVLFYEAINGFHDTANAVATVIYTRAMRSQLAVVMAAVFNFLGVLLGGLSVAYAIVHMLPTDLLLNMGSSHGLAMVFSMLLAAIIWNLGTWYFGLPASSSHTLIGAIIGIGLTNALMTGTSVVDALNIPKVLSIFGSLIVSPIVGLVFAGGLIFLLRRYWSGTKKRARIHLTPAEREKKDGKKKPPFWTRIALILSAIGVAFSHGANDGQKGIGLVMLVLIGVAPAGFVVNMNATGYEITRTRDAINNVEAYFEQHPALLKQATGADQLVPAPEAGATQPAEFHCHPSNTINALNRLKGMLTTDVESYDKLSLDQRSQMRRIMLCVSDTIDKVVKMPGVSADDQRLLKKLKSDMLSTIEYAPVWIIMAVALALGIGTMIGWRRVATTIGEKIGKKGMTYAQGMSAQMTAAVSIGLASYTGMPVSTTHVLSSSVAGTMVVDGGGLQRKTVTSILMAWVFTLPAAVLLSGGLYWLSLQFL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG12230
Length:	499 (466)
Sequences:	360 (170)
Seq/√Len:	7.9

ECOLI - PITA PITB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
151_K	154_S	5.737	1.00
177_L	181_W	5.058	0.99
118_A	484_A	4.834	0.99
267_I	371_L	4.727	0.99
48_M	60_F	4.621	0.99
178_R	461_D	4.380	0.98
164_I	168_V	3.716	0.96
348_S	372_K	3.160	0.90
74_Y	381_Y	3.076	0.88
161_V	165_V	2.982	0.87
56_M	219_I	2.966	0.86
227_A	438_S	2.940	0.86
417_G	427_Q	2.913	0.85
129_I	348_S	2.563	0.77
88_M	103_A	2.561	0.77
354_V	428_M	2.527	0.76
71_S	441_G	2.522	0.76
156_F	224_S	2.481	0.74
190_I	197_R	2.469	0.74
165_V	224_S	2.462	0.74
220_G	431_A	2.376	0.71
133_L	141_T	2.309	0.69
137_L	489_G	2.304	0.68
74_Y	473_I	2.229	0.66
87_N	496_L	2.212	0.65
297_G	311_T	2.124	0.62
484_A	488_S	2.123	0.62
113_Y	116_L	2.105	0.61
106_I	116_L	2.094	0.61
82_T	379_I	2.033	0.58
123_T	449_V	2.025	0.58
134_T	486_L	2.015	0.57
399_M	403_R	2.013	0.57
50_S	496_L	2.003	0.57
217_S	427_Q	1.972	0.56
155_I	412_K	1.960	0.55
118_A	136_A	1.939	0.54
136_A	496_L	1.935	0.54
149_I	453_S	1.924	0.54
77_V	428_M	1.913	0.53
151_K	242_I	1.899	0.53
60_F	63_L	1.894	0.53
157_G	161_V	1.890	0.52
102_L	392_L	1.883	0.52
105_I	458_M	1.869	0.52
422_Q	458_M	1.868	0.52
110_G	116_L	1.858	0.51
75_A	156_F	1.831	0.50
88_M	242_I	1.820	0.50
327_E	403_R	1.819	0.50
134_T	493_W	1.814	0.49
368_L	435_G	1.811	0.49
167_L	459_V	1.792	0.48
327_E	498_F	1.788	0.48
106_I	483_A	1.785	0.48
198_E	201_D	1.782	0.48
139_T	496_L	1.781	0.48
442_M	453_S	1.745	0.47
220_G	224_S	1.734	0.46
88_M	356_K	1.696	0.45
438_S	449_V	1.691	0.44
149_I	152_V	1.683	0.44
215_I	311_T	1.672	0.44
60_F	381_Y	1.669	0.44
434_I	481_L	1.667	0.43
86_L	90_S	1.661	0.43
416_K	468_K	1.660	0.43
24_L	90_S	1.655	0.43
154_S	347_V	1.651	0.43
133_L	442_M	1.650	0.43
294_P	301_P	1.647	0.43
48_M	424_M	1.639	0.42
23_V	433_S	1.634	0.42
223_F	453_S	1.629	0.42
59_V	425_S	1.622	0.42
57_A	152_V	1.615	0.41
303_E	472_S	1.612	0.41
242_I	276_Q	1.609	0.41
59_V	62_F	1.600	0.41
382_A	387_I	1.594	0.41
89_G	124_L	1.581	0.40
106_I	202_G	1.577	0.40
18_L	359_G	1.537	0.38
42_V	223_F	1.526	0.38
85_L	234_I	1.525	0.38
368_L	421_A	1.522	0.38
425_S	472_S	1.516	0.38
172_G	310_N	1.511	0.37
63_L	492_Y	1.504	0.37
68_G	382_A	1.496	0.37
118_A	488_S	1.495	0.37
138_M	412_K	1.491	0.37
361_S	365_Q	1.489	0.36
374_D	495_S	1.487	0.36
165_V	441_G	1.483	0.36
184_T	197_R	1.482	0.36
425_S	428_M	1.469	0.36
88_M	93_G	1.460	0.35
133_L	136_A	1.454	0.35
202_G	205_K	1.453	0.35
110_G	114_F	1.450	0.35
326_V	344_M	1.443	0.35
436_L	440_T	1.432	0.34
336_Q	492_Y	1.428	0.34
115_G	423_G	1.427	0.34
55_V	138_M	1.424	0.34
210_T	453_S	1.413	0.34
395_G	465_L	1.409	0.34
19_A	47_A	1.405	0.33
92_H	242_I	1.403	0.33
103_A	470_V	1.402	0.33
74_Y	349_D	1.396	0.33
133_L	139_T	1.396	0.33
305_H	361_S	1.393	0.33
406_A	460_V	1.388	0.33
371_L	392_L	1.388	0.33
29_I	427_Q	1.386	0.33
216_L	484_A	1.385	0.33
56_M	218_A	1.384	0.33
350_T	493_W	1.383	0.33
47_A	322_L	1.366	0.32
103_A	263_T	1.363	0.32
70_L	382_A	1.362	0.32
91_S	171_G	1.359	0.32
220_G	457_T	1.349	0.31
156_F	164_I	1.344	0.31
388_M	484_A	1.341	0.31
49_R	253_M	1.340	0.31
271_E	320_G	1.329	0.31
59_V	67_L	1.328	0.31
18_L	201_D	1.319	0.30
60_F	412_K	1.317	0.30
83_D	463_G	1.314	0.30
337_R	370_K	1.306	0.30
69_G	382_A	1.302	0.30
463_G	478_V	1.302	0.30
20_L	390_V	1.292	0.29
273_Y	367_L	1.290	0.29
252_N	400_I	1.279	0.29
220_G	422_Q	1.275	0.29
60_F	136_A	1.267	0.29
22_F	263_T	1.249	0.28
24_L	393_A	1.248	0.28
218_A	427_Q	1.236	0.28
171_G	326_V	1.235	0.28
479_F	485_V	1.232	0.27
328_S	350_T	1.230	0.27
143_V	295_E	1.223	0.27
245_A	442_M	1.222	0.27
361_S	364_D	1.213	0.27
124_L	152_V	1.211	0.27
265_D	269_N	1.209	0.27
256_T	334_L	1.206	0.27
165_V	169_F	1.206	0.27
277_H	364_D	1.204	0.27
106_I	484_A	1.201	0.26
200_K	205_K	1.197	0.26
136_A	142_S	1.196	0.26
486_L	489_G	1.194	0.26
133_L	496_L	1.194	0.26
378_T	473_I	1.194	0.26
114_F	283_Q	1.192	0.26
146_A	409_I	1.187	0.26
250_V	424_M	1.185	0.26
77_V	215_I	1.184	0.26
242_I	270_V	1.179	0.26
161_V	361_S	1.175	0.26
203_K	354_V	1.171	0.26
402_W	420_Y	1.169	0.25
292_P	340_M	1.163	0.25
105_I	422_Q	1.162	0.25
198_E	416_K	1.158	0.25
334_L	486_L	1.156	0.25
253_M	256_T	1.152	0.25
133_L	198_E	1.147	0.25
106_I	205_K	1.145	0.25
172_G	176_L	1.143	0.25
174_I	384_V	1.143	0.25
103_A	484_A	1.142	0.25
174_I	460_V	1.140	0.25
157_G	473_I	1.137	0.24
352_D	484_A	1.133	0.24
364_D	367_L	1.129	0.24
103_A	390_V	1.126	0.24
271_E	275_E	1.124	0.24
22_F	495_S	1.123	0.24
244_V	459_V	1.119	0.24
97_V	118_A	1.116	0.24
55_V	168_V	1.114	0.24
152_V	158_S	1.113	0.24
147_L	379_I	1.112	0.24
20_L	135_N	1.112	0.24
69_G	177_L	1.108	0.24
421_A	425_S	1.108	0.24
69_G	387_I	1.104	0.23
69_G	270_V	1.104	0.23
472_S	479_F	1.097	0.23
89_G	338_S	1.094	0.23
217_S	417_G	1.081	0.23
70_L	438_S	1.080	0.23
338_S	492_Y	1.072	0.23
77_V	488_S	1.071	0.23
94_L	249_F	1.071	0.23
278_P	340_M	1.070	0.23
47_A	493_W	1.068	0.22
218_A	417_G	1.066	0.22
263_T	344_M	1.065	0.22
255_A	337_R	1.064	0.22
350_T	467_R	1.064	0.22
127_A	396_I	1.061	0.22
66_L	388_M	1.060	0.22
34_D	37_N	1.060	0.22
233_G	241_L	1.059	0.22
470_V	474_L	1.059	0.22
209_W	212_I	1.057	0.22
375_M	379_I	1.053	0.22
303_E	478_V	1.049	0.22
223_F	449_V	1.047	0.22
47_A	87_N	1.047	0.22
242_I	247_A	1.046	0.22
301_P	313_N	1.040	0.22
201_D	204_K	1.039	0.22
97_V	123_T	1.035	0.22
208_F	473_I	1.030	0.21
147_L	386_I	1.029	0.21
47_A	78_H	1.027	0.21
340_M	358_P	1.027	0.21
339_Q	484_A	1.024	0.21
314_A	344_M	1.023	0.21
114_F	479_F	1.023	0.21
274_F	277_H	1.022	0.21
190_I	433_S	1.022	0.21
244_V	442_M	1.016	0.21
245_A	311_T	1.013	0.21
263_T	326_V	1.013	0.21
425_S	474_L	1.013	0.21
272_A	276_Q	1.009	0.21
374_D	473_I	1.009	0.21
243_G	399_M	1.005	0.21
151_K	467_R	1.005	0.21
91_S	137_L	1.003	0.21
155_I	266_A	1.003	0.21
70_L	387_I	0.997	0.21
208_F	479_F	0.993	0.20
442_M	489_G	0.986	0.20
340_M	371_L	0.978	0.20
124_L	209_W	0.977	0.20
328_S	432_V	0.975	0.20
92_H	179_R	0.973	0.20
100_M	430_A	0.973	0.20
242_I	343_I	0.968	0.20
438_S	441_G	0.968	0.20
245_A	449_V	0.968	0.20
278_P	317_R	0.968	0.20
381_Y	473_I	0.968	0.20
164_I	310_N	0.967	0.20
150_P	198_E	0.966	0.20
87_N	322_L	0.966	0.20
76_I	215_I	0.965	0.20
85_L	344_M	0.965	0.20
94_L	234_I	0.962	0.20
198_E	215_I	0.960	0.20
155_I	353_K	0.959	0.20
118_A	306_C	0.957	0.19
123_T	438_S	0.957	0.19
297_G	400_I	0.955	0.19
209_W	451_S	0.952	0.19
97_V	399_M	0.951	0.19
386_I	460_V	0.949	0.19
177_L	421_A	0.946	0.19
129_I	317_R	0.944	0.19
317_R	428_M	0.943	0.19
75_A	304_F	0.940	0.19
88_M	98_F	0.940	0.19
318_L	379_I	0.939	0.19
138_M	493_W	0.935	0.19
415_K	472_S	0.933	0.19
299_T	302_A	0.933	0.19
340_M	485_V	0.929	0.19
282_K	388_M	0.925	0.19
298_A	436_L	0.923	0.19
75_A	247_A	0.921	0.19
468_K	486_L	0.917	0.18
75_A	240_V	0.915	0.18
136_A	141_T	0.913	0.18
148_N	337_R	0.913	0.18
165_V	475_M	0.913	0.18
68_G	387_I	0.912	0.18
49_R	483_A	0.912	0.18
164_I	362_A	0.910	0.18
60_F	354_V	0.909	0.18
440_T	484_A	0.906	0.18
245_A	274_F	0.905	0.18
154_S	474_L	0.901	0.18
295_E	299_T	0.901	0.18
180_Y	425_S	0.900	0.18
113_Y	399_M	0.899	0.18
270_V	273_Y	0.899	0.18
118_A	123_T	0.898	0.18
369_K	425_S	0.897	0.18
336_Q	370_K	0.894	0.18
123_T	227_A	0.894	0.18
155_I	161_V	0.893	0.18
69_G	264_R	0.890	0.18
60_F	254_N	0.889	0.18
172_G	300_Q	0.888	0.18
142_S	355_V	0.888	0.18
14_L	161_V	0.887	0.18
135_N	390_V	0.886	0.18
136_A	353_K	0.885	0.18
354_V	360_V	0.883	0.18
247_A	263_T	0.881	0.18
256_T	475_M	0.879	0.18
205_K	405_V	0.876	0.17
161_V	492_Y	0.875	0.17
75_A	349_D	0.874	0.17
63_L	103_A	0.870	0.17
176_L	478_V	0.870	0.17
77_V	355_V	0.869	0.17
50_S	395_G	0.869	0.17
95_A	415_K	0.868	0.17
265_D	310_N	0.864	0.17
217_S	418_M	0.864	0.17
17_L	136_A	0.860	0.17
116_L	165_V	0.855	0.17
247_A	320_G	0.855	0.17
116_L	358_P	0.852	0.17
40_A	115_G	0.851	0.17
345_L	387_I	0.849	0.17
164_I	176_L	0.849	0.17
178_R	425_S	0.848	0.17
179_R	277_H	0.847	0.17
88_M	430_A	0.846	0.17
315_L	322_L	0.845	0.17
177_L	425_S	0.845	0.17
234_I	427_Q	0.843	0.17
160_I	354_V	0.842	0.17
91_S	486_L	0.841	0.17
86_L	136_A	0.839	0.17
142_S	198_E	0.837	0.17
28_A	386_I	0.836	0.17
234_I	382_A	0.836	0.17
69_G	483_A	0.834	0.17
57_A	453_S	0.834	0.17
177_L	208_F	0.832	0.16
223_F	474_L	0.829	0.16
145_D	495_S	0.827	0.16
77_V	298_A	0.827	0.16
30_N	33_H	0.827	0.16
16_L	40_A	0.827	0.16
28_A	167_L	0.826	0.16
342_R	436_L	0.826	0.16
260_I	292_P	0.824	0.16
329_Y	492_Y	0.823	0.16
326_V	329_Y	0.820	0.16
140_G	282_K	0.820	0.16
56_M	427_Q	0.820	0.16
442_M	460_V	0.819	0.16
60_F	496_L	0.819	0.16
108_N	446_T	0.818	0.16
16_L	42_V	0.815	0.16
242_I	245_A	0.815	0.16
89_G	234_I	0.814	0.16
51_Q	91_S	0.811	0.16
136_A	254_N	0.810	0.16
131_I	455_A	0.810	0.16
353_K	470_V	0.810	0.16
169_F	172_G	0.809	0.16
269_N	367_L	0.809	0.16
137_L	365_Q	0.808	0.16
327_E	377_S	0.807	0.16
267_I	367_L	0.807	0.16
227_A	449_V	0.807	0.16
179_R	360_V	0.807	0.16
70_L	210_T	0.806	0.16
310_N	489_G	0.804	0.16
305_H	355_V	0.803	0.16
190_I	343_I	0.801	0.16
184_T	215_I	0.801	0.16
165_V	484_A	0.801	0.16
138_M	318_L	0.801	0.16
424_M	453_S	0.801	0.16
99_S	259_E	0.800	0.16
177_L	260_I	0.800	0.16
49_R	60_F	0.799	0.16
172_G	197_R	0.799	0.16
48_M	274_F	0.799	0.16
259_E	498_F	0.799	0.16
178_R	271_E	0.799	0.16
29_I	234_I	0.797	0.16
18_L	116_L	0.797	0.16
298_A	318_L	0.795	0.16
26_Y	50_S	0.794	0.16
88_M	92_H	0.792	0.16
244_V	396_I	0.792	0.16
276_Q	310_N	0.792	0.16
152_V	479_F	0.792	0.16
296_A	359_G	0.790	0.16
68_G	381_Y	0.787	0.15
21_A	431_A	0.787	0.15
312_I	333_S	0.787	0.15
220_G	454_V	0.785	0.15
490_G	494_L	0.784	0.15
141_T	496_L	0.781	0.15
116_L	479_F	0.778	0.15
319_K	492_Y	0.777	0.15
133_L	467_R	0.774	0.15
21_A	470_V	0.773	0.15
260_I	439_Y	0.773	0.15
145_D	342_R	0.772	0.15
17_L	484_A	0.764	0.15
20_L	396_I	0.764	0.15
48_M	67_L	0.762	0.15
69_G	151_K	0.761	0.15
157_G	364_D	0.761	0.15
295_E	298_A	0.758	0.15
70_L	234_I	0.753	0.15
56_M	217_S	0.753	0.15
198_E	486_L	0.753	0.15
198_E	472_S	0.747	0.15
215_I	404_R	0.745	0.15
235_G	446_T	0.744	0.15
294_P	297_G	0.740	0.15
233_G	402_W	0.740	0.15
146_A	386_I	0.739	0.15
253_M	261_T	0.737	0.14
327_E	439_Y	0.736	0.14
49_R	103_A	0.736	0.14
197_R	347_V	0.736	0.14
343_I	429_T	0.735	0.14
21_A	215_I	0.735	0.14
274_F	349_D	0.733	0.14
366_R	418_M	0.732	0.14
133_L	484_A	0.731	0.14
127_A	461_D	0.730	0.14
225_H	235_G	0.728	0.14
321_M	334_L	0.724	0.14
247_A	270_V	0.724	0.14
180_Y	442_M	0.721	0.14
133_L	462_G	0.720	0.14
275_E	324_T	0.719	0.14
106_I	183_G	0.718	0.14
47_A	149_I	0.715	0.14
205_K	248_G	0.713	0.14
52_L	329_Y	0.712	0.14
139_T	331_K	0.712	0.14
40_A	423_G	0.711	0.14
368_L	451_S	0.704	0.14
307_H	363_D	0.704	0.14
89_G	174_I	0.704	0.14
264_R	267_I	0.702	0.14
214_L	419_T	0.702	0.14
214_L	341_R	0.700	0.14
476_A	481_L	0.700	0.14
224_S	441_G	0.700	0.14
350_T	354_V	0.699	0.14
313_N	319_K	0.697	0.14
118_A	462_G	0.697	0.14
129_I	459_V	0.695	0.14
17_L	388_M	0.694	0.14
85_L	144_V	0.693	0.14
458_M	463_G	0.692	0.14
47_A	181_W	0.691	0.14
271_E	368_L	0.691	0.14
326_V	403_R	0.690	0.14
180_Y	184_T	0.689	0.14
158_S	340_M	0.688	0.14
178_R	335_D	0.687	0.13
177_L	272_A	0.684	0.13
349_D	364_D	0.683	0.13
87_N	244_V	0.683	0.13
129_I	479_F	0.682	0.13
209_W	458_M	0.681	0.13
283_Q	428_M	0.679	0.13
247_A	339_Q	0.677	0.13
45_T	111_T	0.677	0.13
217_S	274_F	0.676	0.13
152_V	168_V	0.676	0.13
173_L	178_R	0.676	0.13
58_A	79_M	0.675	0.13
102_L	492_Y	0.674	0.13
50_S	471_T	0.672	0.13
133_L	264_R	0.670	0.13
261_T	380_E	0.670	0.13
97_V	304_F	0.670	0.13
319_K	375_M	0.668	0.13
171_G	497_Q	0.665	0.13
138_M	475_M	0.665	0.13
242_I	311_T	0.664	0.13
372_K	400_I	0.663	0.13
362_A	373_S	0.658	0.13
162_S	422_Q	0.658	0.13
326_V	366_R	0.656	0.13
55_V	403_R	0.656	0.13
485_V	492_Y	0.654	0.13
158_S	367_L	0.654	0.13
78_H	244_V	0.653	0.13
269_N	468_K	0.653	0.13
86_L	314_A	0.653	0.13
43_I	230_G	0.652	0.13
202_G	440_T	0.651	0.13
259_E	276_Q	0.647	0.13
49_R	352_D	0.647	0.13
217_S	346_C	0.646	0.13
210_T	351_I	0.646	0.13
295_E	302_A	0.643	0.13
264_R	333_S	0.641	0.13
198_E	370_K	0.641	0.13
322_L	496_L	0.640	0.13
422_Q	457_T	0.639	0.13
265_D	403_R	0.639	0.13
77_V	350_T	0.637	0.13
358_P	494_L	0.636	0.13
433_S	438_S	0.634	0.13
147_L	199_K	0.634	0.13
165_V	364_D	0.633	0.12
156_F	449_V	0.631	0.12
95_A	221_V	0.631	0.12
93_G	481_L	0.630	0.12
435_G	439_Y	0.629	0.12
154_S	484_A	0.628	0.12
345_L	396_I	0.628	0.12
68_G	234_I	0.627	0.12
477_W	480_T	0.626	0.12
113_Y	123_T	0.625	0.12
209_W	422_Q	0.623	0.12
18_L	245_A	0.622	0.12
69_G	234_I	0.621	0.12
479_F	483_A	0.620	0.12
314_A	400_I	0.620	0.12
431_A	459_V	0.619	0.12
255_A	418_M	0.618	0.12
94_L	140_G	0.617	0.12
356_K	498_F	0.614	0.12
495_S	498_F	0.614	0.12
253_M	380_E	0.612	0.12
354_V	362_A	0.612	0.12
74_Y	372_K	0.611	0.12
279_A	478_V	0.610	0.12
48_M	439_Y	0.609	0.12
136_A	151_K	0.608	0.12
177_L	416_K	0.605	0.12
202_G	478_V	0.605	0.12
94_L	427_Q	0.604	0.12
165_V	362_A	0.603	0.12
93_G	393_A	0.603	0.12
218_A	346_C	0.602	0.12
113_Y	157_G	0.602	0.12
142_S	416_K	0.601	0.12
139_T	473_I	0.599	0.12
177_L	365_Q	0.598	0.12
402_W	469_T	0.597	0.12
329_Y	333_S	0.594	0.12
183_G	416_K	0.594	0.12
103_A	336_Q	0.593	0.12
54_V	406_A	0.591	0.12
352_D	462_G	0.591	0.12
326_V	333_S	0.591	0.12
38_A	481_L	0.590	0.12
46_R	94_L	0.587	0.12
91_S	106_I	0.586	0.12
430_A	476_A	0.586	0.12
133_L	244_V	0.584	0.12
158_S	162_S	0.584	0.12
116_L	353_K	0.583	0.12
165_V	317_R	0.583	0.12
61_N	166_G	0.583	0.12
113_Y	244_V	0.582	0.12
82_T	243_G	0.581	0.12
337_R	374_D	0.581	0.12
30_N	166_G	0.580	0.12
165_V	367_L	0.579	0.12
294_P	298_A	0.579	0.12
279_A	311_T	0.578	0.12
21_A	198_E	0.578	0.12
168_V	489_G	0.577	0.12
457_T	468_K	0.576	0.12
23_V	234_I	0.575	0.11
250_V	352_D	0.575	0.11
224_S	406_A	0.575	0.11
46_R	116_L	0.574	0.11
212_I	368_L	0.573	0.11
255_A	339_Q	0.572	0.11
344_M	416_K	0.571	0.11
462_G	498_F	0.571	0.11
293_A	490_G	0.571	0.11
59_V	253_M	0.571	0.11
240_V	495_S	0.570	0.11
59_V	352_D	0.570	0.11
428_M	483_A	0.570	0.11
136_A	242_I	0.569	0.11
68_G	345_L	0.568	0.11
174_I	498_F	0.568	0.11
141_T	486_L	0.568	0.11
18_L	102_L	0.568	0.11
369_K	372_K	0.566	0.11
32_F	112_W	0.566	0.11
257_G	328_S	0.566	0.11
20_L	237_V	0.564	0.11
169_F	242_I	0.564	0.11
87_N	181_W	0.561	0.11
26_Y	29_I	0.560	0.11
386_I	461_D	0.560	0.11
142_S	392_L	0.559	0.11
74_Y	418_M	0.559	0.11
348_S	351_I	0.558	0.11
131_I	147_L	0.557	0.11
203_K	366_R	0.556	0.11
108_N	112_W	0.556	0.11
124_L	473_I	0.554	0.11
166_G	398_T	0.554	0.11
155_I	417_G	0.554	0.11
277_H	334_L	0.553	0.11
337_R	380_E	0.552	0.11
255_A	358_P	0.551	0.11
199_K	205_K	0.551	0.11
388_M	494_L	0.551	0.11
94_L	438_S	0.551	0.11
300_Q	331_K	0.548	0.11
198_E	244_V	0.548	0.11
224_S	461_D	0.546	0.11
208_F	435_G	0.546	0.11
77_V	311_T	0.545	0.11
97_V	261_T	0.545	0.11
261_T	389_A	0.543	0.11
149_I	156_F	0.542	0.11
68_G	380_E	0.541	0.11
18_L	267_I	0.540	0.11
84_L	402_W	0.540	0.11
352_D	454_V	0.539	0.11
416_K	488_S	0.537	0.11
83_D	462_G	0.536	0.11
328_S	362_A	0.535	0.11
184_T	275_E	0.535	0.11
138_M	497_Q	0.535	0.11
129_I	133_L	0.535	0.11
113_Y	133_L	0.534	0.11
370_K	389_A	0.534	0.11
184_T	198_E	0.534	0.11
81_P	414_G	0.533	0.11
59_V	184_T	0.533	0.11
227_A	386_I	0.533	0.11
247_A	462_G	0.531	0.11
320_G	352_D	0.531	0.11
110_G	153_L	0.531	0.11
241_L	402_W	0.531	0.11
204_K	347_V	0.530	0.11
328_S	333_S	0.529	0.11
436_L	449_V	0.528	0.11
241_L	420_Y	0.528	0.11
165_V	216_L	0.528	0.11
349_D	380_E	0.528	0.11
100_M	103_A	0.528	0.11
345_L	382_A	0.527	0.11
50_S	99_S	0.527	0.11
328_S	495_S	0.526	0.11
17_L	339_Q	0.525	0.11
33_H	112_W	0.525	0.11
96_M	434_I	0.525	0.11
84_L	420_Y	0.523	0.11
125_I	425_S	0.523	0.11
245_A	378_T	0.522	0.11
26_Y	149_I	0.522	0.11
153_L	272_A	0.522	0.11
242_I	320_G	0.519	0.11
151_K	353_K	0.519	0.11
108_N	235_G	0.517	0.11
248_G	329_Y	0.517	0.11
27_E	32_F	0.515	0.11
214_L	485_V	0.514	0.11
365_Q	369_K	0.513	0.11
106_I	374_D	0.513	0.11
51_Q	87_N	0.513	0.11
116_L	154_S	0.512	0.10
156_F	313_N	0.512	0.10
74_Y	438_S	0.512	0.10
136_A	262_R	0.511	0.10
298_A	421_A	0.511	0.10
226_G	446_T	0.510	0.10
199_K	409_I	0.510	0.10
471_T	483_A	0.509	0.10
19_A	368_L	0.509	0.10
35_T	39_V	0.508	0.10
74_Y	449_V	0.508	0.10
328_S	486_L	0.508	0.10
231_Q	482_P	0.508	0.10
60_F	67_L	0.507	0.10
245_A	263_T	0.506	0.10
467_R	496_L	0.506	0.10
181_W	432_V	0.504	0.10
190_I	416_K	0.504	0.10
116_L	349_D	0.503	0.10
17_L	158_S	0.503	0.10
63_L	488_S	0.503	0.10
111_T	121_S	0.503	0.10
220_G	388_M	0.501	0.10
100_M	395_G	0.500	0.10
36_A	79_M	0.500	0.10
178_R	375_M	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2jlnA	1	0.3547	68.2	0.979	Contact Map
2xq2A	2	0.4469	46.9	0.982	Contact Map
3qe7A	2	0.3387	36	0.983	Contact Map
4m5bA	1	0.2305	26.5	0.984	Contact Map
4xk8I	1	0.0581	14	0.986	Contact Map
1jb0I	1	0.0762	11.9	0.986	Contact Map
3zbhA	2	0.1944	10.1	0.987	Contact Map
4i0xB	1	0.1703	10	0.987	Contact Map
2ls4A	1	0.0461	9.4	0.987	Contact Map
2wscI	1	0.0601	9.4	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0118 seconds.