NHAB - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

NHAB - Na(+)/H(+) antiporter NhaB

UniProt:	P0AFA7	Sequences: MEISWGRALWRNFLGQSPDWYKLALIIFLIVNPLIFLISPFVAGWLLVAEFIFTLAMALKCYPLLPGGLLAIEAVFIGMTSAEHVREEVAANLEVLLLLMFMVAGIYFMKQLLLFIFTRLLLSIRSKMLLSLSFCVAAAFLSAFLDALTVVAVVISVAVGFYGIYHRVASSRTEDTDLQDDSHIDKHYKVVLEQFRGFLRSLMMHAGVGTALGGVMTMVGEPQNLIIAKAAGWHFGDFFLRMSPVTVPVLICGLLTCLLVEKLRWFGYGETLPEKVREVLQQFDDQSRHQRTRQDKIRLIVQAIIGVWLVTALALHLAEVGLIGLSVIILATSLTGVTDEHAIGKAFTESLPFTALLTVFFSVVAVIIDQQLFSPIIQFVLQASEHAQLSLFYIFNGLLSSISDNVFVGTIYINEAKAAMESGAITLKQYELLAVAINTGTNLPSVATPNGQAAFLFLLTSALAPLIRLSYGRMVWMALPYTLVLTLVGLLCVEFTLAPVTEWFMQMGWIATL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11392
Length:	513 (493)
Sequences:	269 (105)
Seq/√Len:	4.7

ECOLI - NHAB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
394_I	486_T	5.865	0.99
80_T	369_D	5.606	0.98
308_W	326_S	4.741	0.95
17_S	338_T	4.368	0.92
90_A	93_L	4.241	0.91
242_M	246_T	4.015	0.88
94_E	319_E	4.007	0.88
260_V	263_L	3.971	0.88
358_T	402_I	3.690	0.83
231_A	420_M	3.678	0.83
35_I	46_L	3.610	0.82
206_A	331_A	3.528	0.80
135_C	257_C	3.178	0.73
305_I	331_A	3.075	0.70
154_V	206_A	2.948	0.67
201_S	385_E	2.936	0.66
339_D	348_T	2.934	0.66
140_F	310_V	2.754	0.61
218_M	228_A	2.749	0.61
427_L	431_E	2.702	0.59
197_G	270_E	2.684	0.59
39_S	43_A	2.628	0.57
247_V	251_I	2.624	0.57
75_V	80_T	2.565	0.55
154_V	331_A	2.429	0.51
395_F	416_A	2.387	0.50
89_V	93_L	2.385	0.49
383_A	391_L	2.363	0.49
151_V	409_G	2.363	0.49
368_I	409_G	2.258	0.45
237_D	485_L	2.244	0.45
226_I	409_G	2.216	0.44
358_T	493_V	2.214	0.44
228_A	310_V	2.209	0.44
17_S	401_S	2.209	0.44
376_I	428_K	2.205	0.44
218_M	409_G	2.203	0.44
337_V	343_I	2.175	0.43
48_V	331_A	2.150	0.42
26_I	30_I	2.067	0.40
401_S	486_T	2.064	0.40
226_I	368_I	2.060	0.39
206_A	368_I	2.021	0.38
345_K	392_F	1.995	0.37
36_F	77_I	1.981	0.37
164_I	409_G	1.959	0.36
133_S	226_I	1.922	0.35
388_Q	429_Q	1.895	0.35
137_A	228_A	1.877	0.34
133_S	409_G	1.855	0.33
172_R	176_T	1.842	0.33
443_L	485_L	1.835	0.33
216_M	395_F	1.830	0.33
329_I	333_S	1.830	0.33
239_F	402_I	1.824	0.33
133_S	368_I	1.814	0.32
417_K	421_E	1.812	0.32
229_K	319_E	1.802	0.32
151_V	207_G	1.797	0.32
171_S	176_T	1.788	0.32
93_L	100_M	1.776	0.31
203_M	467_I	1.765	0.31
151_V	226_I	1.721	0.30
31_V	43_A	1.696	0.29
231_A	430_Y	1.695	0.29
401_S	427_L	1.676	0.29
164_I	402_I	1.663	0.28
229_K	485_L	1.659	0.28
365_A	490_L	1.654	0.28
120_L	123_S	1.652	0.28
151_V	368_I	1.632	0.27
138_A	391_L	1.627	0.27
486_T	490_L	1.615	0.27
326_S	393_Y	1.609	0.27
65_L	246_T	1.596	0.27
226_I	429_Q	1.595	0.27
156_S	201_S	1.594	0.27
394_I	490_L	1.593	0.27
463_L	467_I	1.573	0.26
100_M	207_G	1.570	0.26
138_A	231_A	1.569	0.26
85_V	250_L	1.569	0.26
230_A	417_K	1.563	0.26
312_A	326_S	1.554	0.26
4_S	7_R	1.553	0.26
308_W	393_Y	1.551	0.26
133_S	151_V	1.548	0.25
48_V	241_R	1.547	0.25
303_A	307_V	1.536	0.25
298_R	305_I	1.520	0.25
391_L	443_L	1.507	0.24
319_E	343_I	1.500	0.24
120_L	133_S	1.483	0.24
338_T	348_T	1.479	0.24
151_V	206_A	1.469	0.24
84_H	87_E	1.467	0.24
151_V	260_V	1.460	0.23
57_M	443_L	1.456	0.23
100_M	164_I	1.455	0.23
164_I	358_T	1.455	0.23
237_D	241_R	1.434	0.23
384_S	467_I	1.431	0.23
136_V	184_I	1.423	0.23
379_F	416_A	1.415	0.22
277_R	350_S	1.414	0.22
218_M	226_I	1.414	0.22
65_L	348_T	1.413	0.22
87_E	279_V	1.412	0.22
164_I	368_I	1.411	0.22
368_I	371_Q	1.406	0.22
201_S	426_T	1.400	0.22
443_L	484_V	1.395	0.22
207_G	409_G	1.393	0.22
48_V	368_I	1.393	0.22
48_V	411_I	1.382	0.22
66_P	114_L	1.382	0.22
241_R	331_A	1.377	0.22
215_V	439_T	1.372	0.21
14_L	28_F	1.371	0.21
201_S	477_M	1.371	0.21
118_T	137_A	1.368	0.21
65_L	337_V	1.363	0.21
48_V	206_A	1.362	0.21
128_M	258_L	1.362	0.21
279_V	365_A	1.358	0.21
46_L	156_S	1.344	0.21
82_A	492_C	1.342	0.21
181_D	268_Y	1.341	0.21
164_I	422_S	1.334	0.21
329_I	491_L	1.333	0.21
377_I	392_F	1.318	0.20
203_M	306_G	1.317	0.20
79_M	401_S	1.314	0.20
41_F	329_I	1.306	0.20
129_L	258_L	1.297	0.20
228_A	231_A	1.295	0.20
41_F	355_A	1.294	0.20
246_T	250_L	1.279	0.20
239_F	247_V	1.274	0.19
374_S	486_T	1.273	0.19
77_I	203_M	1.271	0.19
120_L	189_K	1.267	0.19
66_P	228_A	1.267	0.19
226_I	260_V	1.255	0.19
485_L	488_V	1.254	0.19
335_T	393_Y	1.251	0.19
305_I	409_G	1.250	0.19
167_R	312_A	1.249	0.19
93_L	164_I	1.248	0.19
331_A	335_T	1.245	0.19
203_M	384_S	1.244	0.19
66_P	168_V	1.239	0.19
36_F	43_A	1.233	0.19
72_I	343_I	1.227	0.19
79_M	226_I	1.222	0.18
48_V	154_V	1.222	0.18
184_I	189_K	1.222	0.18
197_G	473_R	1.217	0.18
218_M	329_I	1.216	0.18
177_D	337_V	1.214	0.18
39_S	42_V	1.210	0.18
39_S	226_I	1.210	0.18
263_L	493_V	1.205	0.18
379_F	395_F	1.201	0.18
71_A	411_I	1.197	0.18
443_L	488_V	1.194	0.18
26_I	345_K	1.192	0.18
216_M	226_I	1.190	0.18
259_L	300_I	1.176	0.18
41_F	257_C	1.173	0.18
206_A	241_R	1.171	0.18
57_M	241_R	1.165	0.17
84_H	151_V	1.161	0.17
386_H	426_T	1.160	0.17
207_G	218_M	1.159	0.17
226_I	247_V	1.159	0.17
122_L	382_Q	1.156	0.17
186_K	435_V	1.156	0.17
96_L	206_A	1.152	0.17
237_D	292_T	1.145	0.17
75_V	85_V	1.145	0.17
75_V	369_D	1.144	0.17
189_K	193_E	1.141	0.17
30_I	34_L	1.139	0.17
96_L	305_I	1.137	0.17
65_L	477_M	1.134	0.17
157_V	376_I	1.131	0.17
86_R	90_A	1.130	0.17
17_S	193_E	1.130	0.17
283_F	287_S	1.128	0.17
17_S	191_V	1.127	0.17
24_A	79_M	1.117	0.17
12_N	468_R	1.112	0.16
215_V	413_I	1.107	0.16
196_R	468_R	1.106	0.16
76_F	290_Q	1.099	0.16
300_I	304_I	1.099	0.16
124_I	379_F	1.094	0.16
35_I	333_S	1.092	0.16
305_I	365_A	1.091	0.16
194_Q	496_T	1.086	0.16
226_I	389_L	1.084	0.16
133_S	339_D	1.084	0.16
401_S	409_G	1.083	0.16
4_S	418_A	1.077	0.16
337_V	398_L	1.076	0.16
96_L	409_G	1.073	0.16
91_A	485_L	1.070	0.16
246_T	315_L	1.066	0.16
96_L	164_I	1.061	0.16
91_A	414_N	1.060	0.16
193_E	239_F	1.060	0.16
41_F	91_A	1.055	0.16
113_L	302_Q	1.054	0.15
86_R	151_V	1.054	0.15
138_A	250_L	1.052	0.15
358_T	409_G	1.049	0.15
402_I	409_G	1.046	0.15
91_A	229_K	1.044	0.15
47_L	468_R	1.044	0.15
379_F	383_A	1.044	0.15
228_A	335_T	1.043	0.15
122_L	201_S	1.042	0.15
154_V	164_I	1.040	0.15
191_V	395_F	1.039	0.15
172_R	376_I	1.037	0.15
383_A	409_G	1.037	0.15
294_Q	307_V	1.032	0.15
123_S	130_L	1.029	0.15
291_R	365_A	1.026	0.15
7_R	315_L	1.026	0.15
306_G	342_A	1.025	0.15
420_M	488_V	1.025	0.15
230_A	414_N	1.022	0.15
34_L	319_E	1.021	0.15
393_Y	429_Q	1.016	0.15
96_L	371_Q	1.006	0.15
47_L	196_R	1.002	0.15
178_L	416_A	1.002	0.15
197_G	420_M	0.999	0.15
177_D	181_D	0.996	0.15
317_L	326_S	0.995	0.15
260_V	371_Q	0.994	0.15
57_M	383_A	0.987	0.14
331_A	402_I	0.987	0.14
60_K	388_Q	0.985	0.14
43_A	206_A	0.983	0.14
229_K	232_G	0.982	0.14
177_D	264_R	0.981	0.14
304_I	333_S	0.980	0.14
242_M	490_L	0.977	0.14
330_L	333_S	0.976	0.14
154_V	203_M	0.973	0.14
123_S	188_Y	0.972	0.14
93_L	358_T	0.970	0.14
157_V	429_Q	0.969	0.14
426_T	431_E	0.967	0.14
365_A	401_S	0.966	0.14
75_V	410_T	0.966	0.14
252_C	488_V	0.965	0.14
268_Y	435_V	0.965	0.14
79_M	311_T	0.961	0.14
259_L	483_L	0.961	0.14
228_A	488_V	0.961	0.14
236_G	255_L	0.955	0.14
125_R	363_V	0.955	0.14
326_S	331_A	0.954	0.14
236_G	259_L	0.954	0.14
11_R	16_Q	0.953	0.14
86_R	206_A	0.952	0.14
26_I	418_A	0.951	0.14
308_W	312_A	0.951	0.14
339_D	431_E	0.950	0.14
151_V	402_I	0.950	0.14
6_G	463_L	0.944	0.14
131_S	376_I	0.939	0.14
267_G	473_R	0.939	0.14
188_Y	315_L	0.939	0.14
401_S	487_L	0.938	0.14
252_C	484_V	0.938	0.14
384_S	463_L	0.935	0.14
118_T	257_C	0.934	0.14
164_I	371_Q	0.934	0.14
79_M	486_T	0.934	0.14
240_L	251_I	0.933	0.14
307_V	362_S	0.932	0.14
277_R	281_Q	0.931	0.14
201_S	386_H	0.927	0.14
151_V	389_L	0.926	0.13
93_L	275_K	0.924	0.13
172_R	178_L	0.924	0.13
168_V	171_S	0.923	0.13
428_K	431_E	0.921	0.13
30_I	255_L	0.920	0.13
140_F	263_L	0.917	0.13
264_R	271_T	0.916	0.13
125_R	398_L	0.914	0.13
178_L	462_A	0.914	0.13
345_K	348_T	0.911	0.13
363_V	476_W	0.909	0.13
194_Q	487_L	0.908	0.13
368_I	402_I	0.908	0.13
118_T	228_A	0.905	0.13
123_S	292_T	0.904	0.13
86_R	226_I	0.904	0.13
16_Q	24_A	0.902	0.13
280_L	302_Q	0.899	0.13
331_A	368_I	0.898	0.13
48_V	151_V	0.897	0.13
112_L	473_R	0.896	0.13
4_S	8_A	0.895	0.13
34_L	240_L	0.894	0.13
121_L	366_V	0.890	0.13
158_A	329_I	0.889	0.13
17_S	112_L	0.885	0.13
305_I	330_L	0.882	0.13
86_R	389_L	0.879	0.13
39_S	151_V	0.878	0.13
239_F	260_V	0.878	0.13
206_A	226_I	0.877	0.13
319_E	402_I	0.875	0.13
81_S	85_V	0.872	0.13
183_H	483_L	0.870	0.13
215_V	242_M	0.866	0.13
77_I	154_V	0.865	0.13
228_A	418_A	0.864	0.13
128_M	286_Q	0.864	0.13
311_T	428_K	0.862	0.13
218_M	429_Q	0.861	0.13
169_A	268_Y	0.856	0.12
84_H	291_R	0.854	0.12
345_K	376_I	0.853	0.12
96_L	331_A	0.852	0.12
247_V	389_L	0.846	0.12
151_V	358_T	0.846	0.12
91_A	232_G	0.845	0.12
135_C	393_Y	0.840	0.12
66_P	473_R	0.839	0.12
226_I	383_A	0.838	0.12
279_V	362_S	0.837	0.12
8_A	12_N	0.835	0.12
188_Y	265_W	0.835	0.12
124_I	339_D	0.834	0.12
169_A	172_R	0.834	0.12
371_Q	402_I	0.834	0.12
110_K	156_S	0.834	0.12
230_A	435_V	0.830	0.12
10_W	333_S	0.830	0.12
164_I	429_Q	0.829	0.12
258_L	483_L	0.828	0.12
228_A	476_W	0.828	0.12
338_T	428_K	0.827	0.12
159_V	477_M	0.824	0.12
111_Q	207_G	0.824	0.12
234_H	237_D	0.822	0.12
355_A	463_L	0.821	0.12
24_A	38_I	0.821	0.12
196_R	411_I	0.819	0.12
277_R	291_R	0.819	0.12
271_T	301_V	0.818	0.12
128_M	131_S	0.817	0.12
247_V	254_L	0.815	0.12
11_R	330_L	0.815	0.12
66_P	477_M	0.813	0.12
167_R	398_L	0.813	0.12
76_F	326_S	0.812	0.12
131_S	301_V	0.811	0.12
371_Q	422_S	0.809	0.12
84_H	369_D	0.809	0.12
100_M	409_G	0.808	0.12
140_F	322_L	0.799	0.12
31_V	394_I	0.798	0.12
216_M	416_A	0.798	0.12
201_S	252_C	0.797	0.12
289_H	393_Y	0.797	0.12
151_V	383_A	0.796	0.12
19_D	23_L	0.789	0.12
109_M	475_V	0.788	0.12
91_A	230_A	0.787	0.12
312_A	319_E	0.785	0.12
264_R	310_V	0.781	0.12
48_V	335_T	0.779	0.11
260_V	306_G	0.779	0.11
35_I	76_F	0.778	0.11
206_A	402_I	0.777	0.11
237_D	262_K	0.773	0.11
124_I	395_F	0.772	0.11
203_M	289_H	0.771	0.11
154_V	305_I	0.771	0.11
93_L	402_I	0.770	0.11
247_V	363_V	0.769	0.11
37_L	43_A	0.767	0.11
284_D	291_R	0.767	0.11
216_M	288_R	0.765	0.11
84_H	485_L	0.764	0.11
77_I	331_A	0.760	0.11
49_A	339_D	0.759	0.11
71_A	85_V	0.759	0.11
342_A	345_K	0.759	0.11
113_L	280_L	0.759	0.11
391_L	416_A	0.759	0.11
114_L	168_V	0.758	0.11
226_I	308_W	0.758	0.11
306_G	427_L	0.758	0.11
163_G	178_L	0.757	0.11
385_E	426_T	0.755	0.11
279_V	348_T	0.755	0.11
135_C	263_L	0.754	0.11
185_D	311_T	0.754	0.11
122_L	130_L	0.753	0.11
250_L	300_I	0.752	0.11
94_E	393_Y	0.750	0.11
122_L	401_S	0.748	0.11
286_Q	296_K	0.747	0.11
251_I	317_L	0.747	0.11
193_E	303_A	0.746	0.11
35_I	38_I	0.746	0.11
107_Y	169_A	0.746	0.11
323_I	437_I	0.746	0.11
136_V	426_T	0.739	0.11
11_R	363_V	0.738	0.11
268_Y	468_R	0.738	0.11
201_S	493_V	0.738	0.11
303_A	365_A	0.738	0.11
193_E	439_T	0.735	0.11
355_A	415_E	0.734	0.11
5_W	398_L	0.734	0.11
137_A	310_V	0.733	0.11
93_L	329_I	0.732	0.11
89_V	358_T	0.732	0.11
36_F	298_R	0.732	0.11
65_L	343_I	0.732	0.11
158_A	310_V	0.731	0.11
71_A	75_V	0.731	0.11
137_A	277_R	0.730	0.11
36_F	226_I	0.730	0.11
26_I	296_K	0.729	0.11
206_A	335_T	0.729	0.11
57_M	388_Q	0.729	0.11
260_V	368_I	0.728	0.11
308_W	368_I	0.728	0.11
85_V	330_L	0.726	0.11
206_A	326_S	0.726	0.11
122_L	167_R	0.725	0.11
163_G	462_A	0.724	0.11
120_L	265_W	0.724	0.11
115_F	119_R	0.723	0.11
115_F	290_Q	0.722	0.11
90_A	329_I	0.721	0.11
39_S	409_G	0.720	0.11
11_R	307_V	0.720	0.11
228_A	272_L	0.719	0.11
8_A	189_K	0.718	0.11
413_I	423_G	0.717	0.11
317_L	398_L	0.715	0.11
423_G	428_K	0.713	0.11
8_A	50_E	0.712	0.11
245_V	398_L	0.712	0.11
131_S	294_Q	0.711	0.11
11_R	26_I	0.711	0.11
186_K	275_K	0.710	0.11
370_Q	433_L	0.709	0.11
308_W	389_L	0.708	0.11
30_I	374_S	0.708	0.11
271_T	303_A	0.704	0.11
297_I	329_I	0.704	0.11
176_T	191_V	0.700	0.11
229_K	414_N	0.700	0.11
178_L	231_A	0.699	0.10
308_W	317_L	0.698	0.10
36_F	206_A	0.696	0.10
308_W	409_G	0.696	0.10
5_W	483_L	0.694	0.10
329_I	392_F	0.694	0.10
124_I	133_S	0.693	0.10
11_R	312_A	0.692	0.10
280_L	468_R	0.692	0.10
158_A	300_I	0.691	0.10
196_R	268_Y	0.690	0.10
307_V	327_V	0.689	0.10
264_R	486_T	0.688	0.10
242_M	428_K	0.687	0.10
296_K	485_L	0.687	0.10
439_T	472_G	0.686	0.10
159_V	203_M	0.685	0.10
116_I	463_L	0.682	0.10
122_L	228_A	0.681	0.10
46_L	491_L	0.679	0.10
35_I	123_S	0.679	0.10
197_G	285_D	0.678	0.10
343_I	371_Q	0.677	0.10
385_E	493_V	0.676	0.10
81_S	363_V	0.676	0.10
272_L	429_Q	0.676	0.10
276_V	462_A	0.675	0.10
48_V	71_A	0.674	0.10
41_F	379_F	0.670	0.10
66_P	231_A	0.668	0.10
138_A	379_F	0.667	0.10
66_P	322_L	0.667	0.10
206_A	409_G	0.666	0.10
402_I	422_S	0.664	0.10
418_A	421_E	0.664	0.10
120_L	184_I	0.664	0.10
208_V	250_L	0.664	0.10
94_E	100_M	0.664	0.10
297_I	339_D	0.663	0.10
154_V	201_S	0.663	0.10
207_G	226_I	0.662	0.10
154_V	308_W	0.662	0.10
46_L	49_A	0.661	0.10
166_H	170_S	0.660	0.10
193_E	287_S	0.659	0.10
65_L	339_D	0.658	0.10
44_G	118_T	0.658	0.10
43_A	77_I	0.657	0.10
251_I	293_R	0.657	0.10
362_S	366_V	0.655	0.10
65_L	138_A	0.655	0.10
306_G	486_T	0.655	0.10
31_V	38_I	0.654	0.10
65_L	159_V	0.653	0.10
159_V	443_L	0.653	0.10
207_G	260_V	0.653	0.10
114_L	366_V	0.652	0.10
112_L	472_G	0.648	0.10
392_F	420_M	0.647	0.10
116_I	154_V	0.646	0.10
334_L	463_L	0.645	0.10
279_V	327_V	0.645	0.10
167_R	182_S	0.644	0.10
188_Y	485_L	0.643	0.10
194_Q	263_L	0.642	0.10
292_T	295_D	0.642	0.10
296_K	473_R	0.642	0.10
30_I	245_V	0.640	0.10
215_V	477_M	0.640	0.10
245_V	259_L	0.639	0.10
206_A	358_T	0.639	0.10
6_G	363_V	0.638	0.10
392_F	416_A	0.638	0.10
41_F	252_C	0.638	0.10
176_T	184_I	0.637	0.10
115_F	288_R	0.636	0.10
163_G	476_W	0.635	0.10
31_V	378_Q	0.634	0.10
366_V	380_V	0.634	0.10
322_L	369_D	0.633	0.10
151_V	331_A	0.633	0.10
66_P	122_L	0.632	0.10
385_E	391_L	0.632	0.10
252_C	485_L	0.632	0.10
66_P	476_W	0.631	0.10
72_I	285_D	0.630	0.10
201_S	428_K	0.629	0.10
184_I	240_L	0.629	0.10
395_F	494_E	0.629	0.10
123_S	315_L	0.629	0.10
76_F	270_E	0.628	0.10
443_L	489_G	0.628	0.10
5_W	329_I	0.627	0.10
154_V	385_E	0.627	0.10
229_K	338_T	0.626	0.10
138_A	159_V	0.624	0.10
304_I	330_L	0.623	0.10
167_R	234_H	0.622	0.10
307_V	487_L	0.621	0.10
178_L	348_T	0.621	0.10
111_Q	298_R	0.621	0.10
107_Y	170_S	0.621	0.10
485_L	492_C	0.621	0.10
165_Y	302_Q	0.620	0.10
114_L	121_L	0.619	0.10
110_K	132_L	0.617	0.10
260_V	327_V	0.616	0.10
170_S	415_E	0.615	0.10
279_V	388_Q	0.615	0.10
87_E	90_A	0.614	0.10
137_A	184_I	0.613	0.10
137_A	401_S	0.610	0.09
311_T	315_L	0.610	0.09
263_L	487_L	0.609	0.09
41_F	49_A	0.608	0.09
305_I	402_I	0.607	0.09
47_L	268_Y	0.607	0.09
203_M	477_M	0.605	0.09
169_A	181_D	0.605	0.09
46_L	229_K	0.604	0.09
158_A	398_L	0.601	0.09
107_Y	239_F	0.600	0.09
31_V	259_L	0.599	0.09
429_Q	435_V	0.598	0.09
79_M	230_A	0.598	0.09
298_R	308_W	0.597	0.09
197_G	283_F	0.597	0.09
109_M	402_I	0.597	0.09
279_V	380_V	0.596	0.09
389_L	393_Y	0.596	0.09
334_L	348_T	0.596	0.09
379_F	382_Q	0.595	0.09
246_T	339_D	0.594	0.09
401_S	443_L	0.594	0.09
395_F	401_S	0.593	0.09
41_F	79_M	0.593	0.09
21_Y	121_L	0.592	0.09
39_S	368_I	0.591	0.09
365_A	486_T	0.590	0.09
123_S	278_E	0.588	0.09
159_V	201_S	0.588	0.09
21_Y	118_T	0.588	0.09
133_S	140_F	0.587	0.09
185_D	333_S	0.587	0.09
121_L	257_C	0.586	0.09
93_L	264_R	0.586	0.09
7_R	335_T	0.586	0.09
473_R	477_M	0.585	0.09
268_Y	280_L	0.585	0.09
492_C	496_T	0.584	0.09
140_F	226_I	0.583	0.09
383_A	395_F	0.581	0.09
193_E	386_H	0.581	0.09
23_L	310_V	0.581	0.09
110_K	475_V	0.581	0.09
258_L	317_L	0.577	0.09
259_L	263_L	0.576	0.09
164_I	226_I	0.575	0.09
107_Y	351_L	0.574	0.09
203_M	429_Q	0.573	0.09
156_S	286_Q	0.573	0.09
311_T	494_E	0.573	0.09
327_V	418_A	0.572	0.09
203_M	463_L	0.571	0.09
311_T	329_I	0.571	0.09
190_V	236_G	0.570	0.09
41_F	424_A	0.570	0.09
483_L	486_T	0.568	0.09
264_R	345_K	0.567	0.09
129_L	259_L	0.564	0.09
42_V	384_S	0.563	0.09
153_V	381_L	0.562	0.09
36_F	310_V	0.562	0.09
207_G	366_V	0.561	0.09
279_V	288_R	0.560	0.09
210_T	433_L	0.559	0.09
393_Y	487_L	0.558	0.09
216_M	337_V	0.557	0.09
279_V	428_K	0.556	0.09
5_W	339_D	0.556	0.09
176_T	395_F	0.555	0.09
121_L	380_V	0.555	0.09
120_L	297_I	0.555	0.09
107_Y	177_D	0.554	0.09
31_V	110_K	0.553	0.09
434_A	464_A	0.552	0.09
122_L	288_R	0.550	0.09
243_S	342_A	0.550	0.09
130_L	275_K	0.549	0.09
189_K	319_E	0.549	0.09
124_I	172_R	0.548	0.09
42_V	496_T	0.548	0.09
83_E	398_L	0.548	0.09
47_L	366_V	0.548	0.09
258_L	378_Q	0.547	0.09
290_Q	493_V	0.546	0.09
96_L	358_T	0.545	0.09
171_S	376_I	0.544	0.09
151_V	218_M	0.544	0.09
411_I	446_V	0.543	0.09
382_Q	409_G	0.542	0.09
17_S	25_L	0.542	0.09
312_A	420_M	0.541	0.09
363_V	495_F	0.541	0.09
93_L	218_M	0.539	0.09
48_V	207_G	0.537	0.09
77_I	317_L	0.537	0.09
402_I	428_K	0.535	0.09
179_Q	183_H	0.533	0.09
312_A	379_F	0.533	0.09
311_T	317_L	0.532	0.09
21_Y	276_V	0.532	0.09
242_M	305_I	0.530	0.09
113_L	196_R	0.530	0.09
23_L	251_I	0.529	0.09
86_R	368_I	0.528	0.09
358_T	371_Q	0.528	0.09
133_S	206_A	0.528	0.09
50_E	329_I	0.528	0.09
125_R	393_Y	0.528	0.09
411_I	425_I	0.527	0.09
167_R	411_I	0.525	0.09
190_V	271_T	0.524	0.09
374_S	378_Q	0.524	0.09
76_F	393_Y	0.523	0.09
246_T	267_G	0.523	0.09
72_I	402_I	0.523	0.09
154_V	247_V	0.522	0.09
79_M	363_V	0.522	0.09
30_I	343_I	0.522	0.09
191_V	393_Y	0.520	0.09
156_S	385_E	0.520	0.09
343_I	422_S	0.520	0.09
5_W	9_L	0.519	0.09
137_A	496_T	0.517	0.09
178_L	427_L	0.517	0.09
169_A	228_A	0.516	0.09
41_F	93_L	0.516	0.09
393_Y	421_E	0.515	0.09
77_I	241_R	0.515	0.09
433_L	482_T	0.515	0.09
376_I	431_E	0.515	0.09
84_H	389_L	0.515	0.09
31_V	304_I	0.515	0.09
84_H	365_A	0.514	0.08
111_Q	315_L	0.513	0.08
86_R	358_T	0.512	0.08
28_F	107_Y	0.512	0.08
284_D	288_R	0.512	0.08
308_W	383_A	0.512	0.08
385_E	429_Q	0.512	0.08
433_L	466_L	0.512	0.08
140_F	368_I	0.511	0.08
132_L	472_G	0.510	0.08
21_Y	327_V	0.509	0.08
158_A	203_M	0.509	0.08
118_T	312_A	0.508	0.08
394_I	491_L	0.508	0.08
4_S	48_V	0.508	0.08
327_V	343_I	0.508	0.08
300_I	311_T	0.508	0.08
234_H	363_V	0.506	0.08
110_K	369_D	0.506	0.08
207_G	368_I	0.505	0.08
111_Q	184_I	0.504	0.08
17_S	402_I	0.503	0.08
491_L	495_F	0.502	0.08
7_R	492_C	0.502	0.08
24_A	133_S	0.501	0.08
94_E	317_L	0.501	0.08
133_S	342_A	0.500	0.08
112_L	365_A	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4f35D	2	0.8031	99.7	0.938	Contact Map
4r0cA	3	0.8012	96.7	0.975	Contact Map
4r1iA	2	0.8382	96.3	0.975	Contact Map
3hzqA	3	0.1501	25.4	0.989	Contact Map
3rvyA	3	0.3957	20.6	0.989	Contact Map
4twkA	2	0.4659	16.4	0.99	Contact Map
1kkxA	1	0.1676	14	0.99	Contact Map
2oarA	7	0.1832	12.9	0.99	Contact Map
2j6bA	2	0.191	12.4	0.99	Contact Map
4xp4A	1	0.1657	9.6	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.