INGK - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

INGK - Inosine-guanosine kinase

UniProt:	P0AEW6	Sequences: MKFPGKRKSKHYFPVNARDPLLQQFQPENETSAAWVVGIDQTLVDIEAKVDDEFIERYGLSAGHSLVIEDDVAEALYQELKQKNLITHQFAGGTIGNTMHNYSVLADDRSVLLGVMCSNIEIGSYAYRYLCNTSSRTDLNYLQGVDGPIGRCFTLIGESGERTFAISPGHMNQLRAESIPEDVIAGASALVLTSYLVRCKPGEPMPEATMKAIEYAKKYNVPVVLTLGTKFVIAENPQWWQQFLKDHVSILAMNEDEAEALTGESDPLLASDKALDWVDLVLCTAGPIGLYMAGFTEDEAKRKTQHPLLPGAIAEFNQYEFSRAMRHKDCQNPLRVYSHIAPYMGGPEKIMNTNGAGDGALAALLHDITANSYHRSNVPNSSKHKFTWLTYSSLAQVCKYANRVSYQVLNQHSPRLTRGLPEREDSLEESYWDR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11102
Length:	434 (431)
Sequences:	138 (68)
Seq/√Len:	3.3

ECOLI - INGK

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
133_T	136_R	4.940	0.89
131_C	135_S	4.680	0.87
131_C	134_S	4.466	0.84
131_C	136_R	3.592	0.67
135_S	138_D	3.583	0.67
132_N	135_S	2.755	0.46
35_W	430_S	2.697	0.44
362_A	433_D	2.668	0.44
132_N	139_L	2.632	0.43
310_P	315_E	2.586	0.42
16_N	22_L	2.507	0.40
6_K	9_S	2.470	0.39
202_G	433_D	2.460	0.38
359_G	404_V	2.453	0.38
9_S	18_R	2.412	0.37
326_R	329_D	2.273	0.34
133_T	137_T	2.220	0.33
305_Q	336_V	2.199	0.32
6_K	315_E	2.197	0.32
37_V	113_L	2.177	0.32
34_A	394_L	2.161	0.31
35_W	184_I	2.158	0.31
244_L	278_V	2.135	0.31
134_S	137_T	2.114	0.30
324_A	394_L	2.113	0.30
40_D	93_G	2.104	0.30
133_T	138_D	2.080	0.30
168_P	184_I	2.065	0.29
184_I	430_S	2.036	0.29
16_N	24_Q	2.027	0.28
131_C	138_D	2.026	0.28
131_C	137_T	1.999	0.28
18_R	58_Y	1.997	0.28
202_G	425_D	1.995	0.28
214_E	220_N	1.966	0.27
39_I	93_G	1.962	0.27
19_D	23_Q	1.932	0.26
23_Q	28_E	1.872	0.25
407_Q	410_N	1.860	0.25
97_N	358_D	1.852	0.25
61_S	64_H	1.850	0.25
34_A	433_D	1.845	0.25
202_G	434_R	1.840	0.25
273_K	276_D	1.836	0.24
352_N	393_S	1.828	0.24
133_T	139_L	1.801	0.24
23_Q	203_E	1.792	0.24
19_D	22_L	1.785	0.23
227_L	253_M	1.782	0.23
18_R	213_I	1.734	0.23
22_L	203_E	1.728	0.22
336_V	394_L	1.675	0.21
159_S	237_P	1.673	0.21
6_K	18_R	1.670	0.21
17_A	24_Q	1.636	0.21
67_V	172_N	1.630	0.21
98_T	162_R	1.629	0.21
214_E	218_K	1.626	0.21
16_N	30_E	1.626	0.21
25_F	312_A	1.600	0.20
134_S	138_D	1.586	0.20
132_N	136_R	1.585	0.20
136_R	139_L	1.570	0.20
150_G	255_E	1.567	0.20
17_A	32_S	1.566	0.20
92_G	357_G	1.554	0.19
94_T	154_T	1.550	0.19
60_L	152_C	1.550	0.19
187_A	190_L	1.545	0.19
24_Q	29_N	1.537	0.19
16_N	33_A	1.528	0.19
238_Q	241_Q	1.528	0.19
25_F	30_E	1.523	0.19
19_D	310_P	1.515	0.19
394_L	433_D	1.508	0.19
18_R	21_L	1.501	0.19
250_I	362_A	1.499	0.19
220_N	331_Q	1.492	0.18
36_V	111_V	1.489	0.18
18_R	57_R	1.480	0.18
61_S	251_L	1.476	0.18
254_N	257_E	1.470	0.18
176_A	242_Q	1.461	0.18
203_E	395_A	1.440	0.18
9_S	204_P	1.435	0.18
2_K	22_L	1.434	0.18
9_S	196_L	1.434	0.18
113_L	271_S	1.431	0.17
6_K	35_W	1.426	0.17
19_D	24_Q	1.423	0.17
22_L	32_S	1.417	0.17
25_F	29_N	1.411	0.17
153_F	237_P	1.405	0.17
351_M	368_I	1.403	0.17
6_K	368_I	1.402	0.17
187_A	194_S	1.400	0.17
122_I	341_A	1.396	0.17
29_N	203_E	1.395	0.17
6_K	250_I	1.395	0.17
321_F	359_G	1.388	0.17
205_M	232_V	1.388	0.17
34_A	324_A	1.382	0.17
24_Q	49_K	1.379	0.17
93_G	184_I	1.368	0.17
362_A	434_R	1.354	0.16
18_R	23_Q	1.351	0.16
87_T	163_T	1.351	0.16
203_E	412_H	1.350	0.16
16_N	29_N	1.348	0.16
43_L	231_F	1.345	0.16
22_L	30_E	1.345	0.16
9_S	64_H	1.339	0.16
181_E	185_A	1.322	0.16
6_K	31_T	1.322	0.16
348_E	433_D	1.312	0.16
20_P	23_Q	1.310	0.16
18_R	79_E	1.309	0.16
22_L	29_N	1.307	0.16
94_T	130_L	1.306	0.16
29_N	32_S	1.304	0.16
43_L	70_D	1.301	0.16
18_R	66_L	1.301	0.16
16_N	231_F	1.300	0.16
9_S	203_E	1.300	0.16
417_T	428_E	1.299	0.16
327_H	349_K	1.298	0.16
25_F	75_A	1.292	0.15
19_D	64_H	1.289	0.15
16_N	37_V	1.279	0.15
178_S	199_C	1.277	0.15
153_F	292_M	1.277	0.15
22_L	33_A	1.274	0.15
95_I	191_V	1.274	0.15
15_V	40_D	1.273	0.15
203_E	407_Q	1.266	0.15
24_Q	33_A	1.262	0.15
177_E	214_E	1.256	0.15
114_G	353_T	1.254	0.15
301_K	310_P	1.252	0.15
18_R	64_H	1.252	0.15
28_E	31_T	1.248	0.15
37_V	185_A	1.244	0.15
214_E	247_H	1.241	0.15
16_N	23_Q	1.240	0.15
394_L	417_T	1.236	0.15
9_S	19_D	1.234	0.15
51_D	136_R	1.233	0.15
112_L	378_V	1.232	0.15
348_E	386_F	1.228	0.15
6_K	19_D	1.227	0.15
9_S	29_N	1.222	0.15
105_L	284_T	1.220	0.14
255_E	270_A	1.201	0.14
61_S	205_M	1.200	0.14
113_L	278_V	1.199	0.14
39_I	70_D	1.198	0.14
93_G	426_S	1.196	0.14
25_F	28_E	1.195	0.14
70_D	233_I	1.192	0.14
58_Y	69_E	1.191	0.14
29_N	202_G	1.191	0.14
47_E	196_L	1.191	0.14
271_S	281_V	1.190	0.14
39_I	46_I	1.190	0.14
149_I	425_D	1.185	0.14
6_K	203_E	1.177	0.14
21_L	32_S	1.176	0.14
6_K	249_S	1.174	0.14
351_M	407_Q	1.167	0.14
119_N	332_N	1.166	0.14
19_D	203_E	1.162	0.14
16_N	203_E	1.161	0.14
205_M	394_L	1.159	0.14
283_C	412_H	1.156	0.14
80_L	255_E	1.156	0.14
33_A	36_V	1.156	0.14
57_R	79_E	1.152	0.14
34_A	203_E	1.151	0.14
129_Y	204_P	1.151	0.14
238_Q	242_Q	1.146	0.14
108_D	209_T	1.145	0.14
67_V	205_M	1.145	0.14
9_S	79_E	1.137	0.13
43_L	91_A	1.136	0.13
16_N	168_P	1.131	0.13
76_L	178_S	1.128	0.13
31_T	205_M	1.127	0.13
23_Q	30_E	1.120	0.13
21_L	310_P	1.120	0.13
49_K	202_G	1.119	0.13
18_R	30_E	1.118	0.13
9_S	412_H	1.116	0.13
218_K	234_A	1.116	0.13
69_E	72_V	1.115	0.13
175_R	192_L	1.112	0.13
166_I	354_N	1.110	0.13
64_H	197_V	1.107	0.13
16_N	31_T	1.104	0.13
16_N	202_G	1.103	0.13
261_L	340_I	1.100	0.13
162_R	353_T	1.095	0.13
71_D	214_E	1.094	0.13
20_P	24_Q	1.093	0.13
8_K	18_R	1.090	0.13
17_A	49_K	1.087	0.13
193_T	433_D	1.086	0.13
150_G	353_T	1.085	0.13
9_S	22_L	1.084	0.13
21_L	205_M	1.081	0.13
20_P	430_S	1.081	0.13
340_I	429_E	1.080	0.13
216_A	284_T	1.076	0.13
2_K	19_D	1.074	0.13
192_L	348_E	1.071	0.13
122_I	310_P	1.070	0.13
39_I	209_T	1.067	0.13
55_I	159_S	1.065	0.13
92_G	355_G	1.063	0.13
131_C	139_L	1.063	0.13
57_R	213_I	1.057	0.13
17_A	22_L	1.047	0.12
350_I	354_N	1.047	0.12
286_G	357_G	1.046	0.12
92_G	286_G	1.046	0.12
112_L	191_V	1.046	0.12
172_N	390_T	1.043	0.12
9_S	42_T	1.037	0.12
16_N	25_F	1.036	0.12
24_Q	202_G	1.035	0.12
277_W	283_C	1.028	0.12
157_G	368_I	1.026	0.12
6_K	184_I	1.024	0.12
117_C	351_M	1.019	0.12
60_L	65_S	1.012	0.12
135_S	139_L	1.012	0.12
17_A	23_Q	1.008	0.12
164_F	228_G	1.001	0.12
249_S	351_M	0.999	0.12
80_L	270_A	0.997	0.12
125_Y	408_V	0.997	0.12
18_R	31_T	0.995	0.12
93_G	357_G	0.995	0.12
129_Y	282_L	0.995	0.12
106_A	117_C	0.994	0.12
202_G	430_S	0.993	0.12
398_C	429_E	0.993	0.12
18_R	434_R	0.990	0.12
202_G	349_K	0.990	0.12
22_L	425_D	0.984	0.12
18_R	42_T	0.984	0.12
29_N	430_S	0.980	0.12
242_Q	397_V	0.977	0.12
210_M	413_S	0.975	0.12
398_C	434_R	0.972	0.12
9_S	16_N	0.970	0.12
17_A	29_N	0.965	0.11
30_E	34_A	0.965	0.11
91_A	209_T	0.962	0.11
105_L	356_A	0.962	0.11
19_D	240_W	0.960	0.11
22_L	25_F	0.960	0.11
249_S	326_R	0.959	0.11
9_S	21_L	0.958	0.11
19_D	30_E	0.950	0.11
6_K	58_Y	0.950	0.11
249_S	368_I	0.949	0.11
175_R	178_S	0.948	0.11
429_E	434_R	0.945	0.11
261_L	282_L	0.942	0.11
61_S	214_E	0.941	0.11
28_E	34_A	0.940	0.11
22_L	26_Q	0.939	0.11
214_E	327_H	0.933	0.11
70_D	93_G	0.932	0.11
20_P	124_S	0.931	0.11
6_K	64_H	0.930	0.11
32_S	36_V	0.930	0.11
126_A	151_R	0.928	0.11
23_Q	26_Q	0.928	0.11
108_D	235_E	0.927	0.11
97_N	356_A	0.925	0.11
23_Q	34_A	0.924	0.11
34_A	202_G	0.921	0.11
314_A	349_K	0.919	0.11
32_S	425_D	0.915	0.11
109_R	236_N	0.915	0.11
8_K	57_R	0.915	0.11
100_H	166_I	0.914	0.11
25_F	32_S	0.911	0.11
24_Q	28_E	0.910	0.11
19_D	430_S	0.908	0.11
17_A	26_Q	0.908	0.11
157_G	282_L	0.908	0.11
152_C	395_A	0.907	0.11
16_N	118_S	0.903	0.11
313_I	390_T	0.900	0.11
183_V	218_K	0.900	0.11
35_W	336_V	0.899	0.11
210_M	419_G	0.896	0.11
87_T	192_L	0.895	0.11
9_S	24_Q	0.893	0.11
23_Q	42_T	0.893	0.11
64_H	251_L	0.892	0.11
90_F	375_R	0.890	0.11
90_F	395_A	0.889	0.11
235_E	419_G	0.888	0.11
26_Q	32_S	0.885	0.11
94_T	160_G	0.885	0.11
18_R	61_S	0.885	0.11
30_E	33_A	0.884	0.11
34_A	205_M	0.883	0.11
167_S	395_A	0.881	0.11
102_Y	110_S	0.881	0.11
197_V	235_E	0.873	0.11
17_A	156_I	0.872	0.11
19_D	311_G	0.870	0.11
19_D	433_D	0.870	0.11
28_E	33_A	0.870	0.11
18_R	202_G	0.870	0.11
23_Q	202_G	0.867	0.10
30_E	202_G	0.867	0.10
24_Q	31_T	0.866	0.10
143_Q	190_L	0.865	0.10
25_F	31_T	0.859	0.10
6_K	62_A	0.858	0.10
33_A	203_E	0.856	0.10
22_L	235_E	0.854	0.10
19_D	205_M	0.854	0.10
17_A	28_E	0.853	0.10
341_A	412_H	0.853	0.10
67_V	324_A	0.852	0.10
100_H	360_A	0.851	0.10
24_Q	30_E	0.850	0.10
67_V	390_T	0.849	0.10
20_P	25_F	0.848	0.10
18_R	22_L	0.847	0.10
69_E	369_T	0.839	0.10
16_N	21_L	0.835	0.10
36_V	183_V	0.833	0.10
6_K	119_N	0.833	0.10
26_Q	249_S	0.833	0.10
19_D	33_A	0.832	0.10
187_A	386_F	0.831	0.10
271_S	369_T	0.830	0.10
57_R	202_G	0.829	0.10
6_K	168_P	0.823	0.10
57_R	433_D	0.822	0.10
114_G	150_G	0.822	0.10
51_D	131_C	0.821	0.10
296_T	398_C	0.819	0.10
28_E	202_G	0.819	0.10
6_K	351_M	0.819	0.10
23_Q	33_A	0.818	0.10
101_N	105_L	0.818	0.10
49_K	249_S	0.815	0.10
16_N	32_S	0.813	0.10
246_D	292_M	0.812	0.10
364_L	382_S	0.811	0.10
202_G	314_A	0.808	0.10
26_Q	37_V	0.808	0.10
196_L	213_I	0.808	0.10
22_L	42_T	0.807	0.10
55_I	144_G	0.806	0.10
28_E	119_N	0.805	0.10
18_R	118_S	0.804	0.10
9_S	57_R	0.801	0.10
6_K	117_C	0.800	0.10
162_R	229_T	0.800	0.10
26_Q	29_N	0.798	0.10
153_F	167_S	0.798	0.10
58_Y	213_I	0.798	0.10
23_Q	410_N	0.798	0.10
16_N	185_A	0.796	0.10
209_T	430_S	0.794	0.10
17_A	30_E	0.792	0.10
112_L	124_S	0.791	0.10
76_L	386_F	0.791	0.10
17_A	202_G	0.789	0.10
137_T	335_R	0.789	0.10
410_N	433_D	0.789	0.10
152_C	309_L	0.788	0.10
150_G	170_H	0.785	0.10
144_G	192_L	0.784	0.10
97_N	357_G	0.782	0.10
92_G	97_N	0.782	0.10
31_T	37_V	0.779	0.10
43_L	163_T	0.779	0.10
40_D	91_A	0.777	0.10
23_Q	31_T	0.776	0.10
154_T	195_Y	0.771	0.10
205_M	390_T	0.771	0.10
47_E	89_Q	0.767	0.10
36_V	74_E	0.767	0.10
76_L	237_P	0.765	0.10
16_N	19_D	0.762	0.09
67_V	336_V	0.761	0.09
22_L	202_G	0.761	0.09
194_S	236_N	0.756	0.09
20_P	42_T	0.752	0.09
282_L	429_E	0.750	0.09
57_R	70_D	0.746	0.09
9_S	33_A	0.746	0.09
20_P	199_C	0.743	0.09
8_K	204_P	0.742	0.09
40_D	108_D	0.740	0.09
178_S	206_P	0.739	0.09
169_G	353_T	0.736	0.09
68_I	93_G	0.735	0.09
138_D	298_D	0.735	0.09
6_K	388_W	0.733	0.09
9_S	61_S	0.732	0.09
9_S	66_L	0.731	0.09
195_Y	225_L	0.730	0.09
203_E	430_S	0.729	0.09
19_D	314_A	0.727	0.09
197_V	232_V	0.722	0.09
17_A	418_R	0.720	0.09
9_S	23_Q	0.720	0.09
24_Q	430_S	0.719	0.09
70_D	433_D	0.718	0.09
24_Q	203_E	0.718	0.09
58_Y	397_V	0.717	0.09
62_A	159_S	0.715	0.09
55_I	237_P	0.714	0.09
6_K	196_L	0.712	0.09
64_H	205_M	0.712	0.09
18_R	433_D	0.709	0.09
328_K	376_S	0.706	0.09
178_S	388_W	0.706	0.09
288_I	315_E	0.705	0.09
33_A	202_G	0.705	0.09
425_D	430_S	0.705	0.09
150_G	262_T	0.704	0.09
53_E	292_M	0.704	0.09
28_E	419_G	0.703	0.09
282_L	340_I	0.701	0.09
119_N	203_E	0.699	0.09
217_K	244_L	0.698	0.09
29_N	37_V	0.698	0.09
21_L	24_Q	0.698	0.09
82_Q	90_F	0.697	0.09
6_K	66_L	0.695	0.09
184_I	209_T	0.692	0.09
94_T	127_Y	0.691	0.09
53_E	246_D	0.691	0.09
157_G	183_V	0.690	0.09
401_A	413_S	0.689	0.09
43_L	153_F	0.689	0.09
282_L	364_L	0.688	0.09
10_K	15_V	0.687	0.09
261_L	290_L	0.686	0.09
28_E	32_S	0.685	0.09
394_L	401_A	0.680	0.09
101_N	284_T	0.678	0.09
249_S	349_K	0.677	0.09
229_T	253_M	0.677	0.09
19_D	288_I	0.677	0.09
52_D	62_A	0.675	0.09
18_R	24_Q	0.674	0.09
143_Q	223_V	0.673	0.09
110_S	268_L	0.673	0.09
28_E	203_E	0.672	0.09
56_E	84_N	0.671	0.09
37_V	54_F	0.671	0.09
58_Y	187_A	0.669	0.09
92_G	257_E	0.669	0.09
17_A	21_L	0.669	0.09
257_E	357_G	0.669	0.09
31_T	271_S	0.669	0.09
166_I	229_T	0.668	0.09
16_N	109_R	0.667	0.09
34_A	417_T	0.667	0.09
274_A	310_P	0.665	0.09
50_V	62_A	0.664	0.09
118_S	410_N	0.663	0.09
205_M	324_A	0.662	0.09
204_P	410_N	0.658	0.09
243_F	401_A	0.656	0.09
94_T	195_Y	0.654	0.09
59_G	364_L	0.653	0.09
113_L	380_N	0.653	0.09
47_E	57_R	0.652	0.09
351_M	433_D	0.650	0.09
194_S	410_N	0.649	0.09
162_R	166_I	0.648	0.09
20_P	207_E	0.648	0.09
71_D	185_A	0.648	0.09
94_T	226_T	0.646	0.08
203_E	410_N	0.646	0.08
18_R	170_H	0.644	0.08
8_K	282_L	0.643	0.08
107_D	161_E	0.642	0.08
19_D	207_E	0.641	0.08
185_A	246_D	0.641	0.08
118_S	217_K	0.641	0.08
364_L	397_V	0.640	0.08
166_I	228_G	0.640	0.08
23_Q	430_S	0.639	0.08
195_Y	294_G	0.639	0.08
100_H	228_G	0.636	0.08
210_M	315_E	0.636	0.08
19_D	28_E	0.636	0.08
20_P	425_D	0.635	0.08
196_L	203_E	0.632	0.08
137_T	234_A	0.631	0.08
103_S	268_L	0.630	0.08
36_V	61_S	0.627	0.08
21_L	29_N	0.625	0.08
20_P	202_G	0.622	0.08
375_R	394_L	0.622	0.08
112_L	160_G	0.621	0.08
43_L	46_I	0.620	0.08
2_K	32_S	0.620	0.08
21_L	412_H	0.617	0.08
8_K	79_E	0.614	0.08
139_L	160_G	0.614	0.08
94_T	395_A	0.614	0.08
258_A	295_F	0.612	0.08
351_M	410_N	0.611	0.08
151_R	361_L	0.610	0.08
25_F	385_K	0.610	0.08
80_L	160_G	0.609	0.08
275_L	302_R	0.607	0.08
30_E	425_D	0.605	0.08
179_I	232_V	0.604	0.08
104_V	278_V	0.604	0.08
197_V	204_P	0.604	0.08
56_E	146_D	0.603	0.08
252_A	339_H	0.602	0.08
94_T	112_L	0.602	0.08
23_Q	170_H	0.600	0.08
117_C	149_I	0.600	0.08
401_A	433_D	0.600	0.08
62_A	73_A	0.598	0.08
30_E	433_D	0.597	0.08
37_V	53_E	0.597	0.08
41_Q	44_V	0.596	0.08
220_N	329_D	0.595	0.08
33_A	39_I	0.595	0.08
94_T	162_R	0.593	0.08
21_L	283_C	0.593	0.08
76_L	128_R	0.590	0.08
21_L	25_F	0.586	0.08
208_A	263_G	0.586	0.08
152_C	293_A	0.585	0.08
149_I	423_R	0.585	0.08
227_L	354_N	0.584	0.08
249_S	388_W	0.584	0.08
29_N	33_A	0.583	0.08
148_P	156_I	0.582	0.08
109_R	119_N	0.581	0.08
72_V	179_I	0.580	0.08
32_S	385_K	0.579	0.08
184_I	203_E	0.578	0.08
26_Q	33_A	0.578	0.08
93_G	108_D	0.577	0.08
6_K	197_V	0.576	0.08
196_L	413_S	0.576	0.08
318_Q	423_R	0.575	0.08
344_M	348_E	0.574	0.08
94_T	394_L	0.574	0.08
155_L	294_G	0.573	0.08
22_L	385_K	0.573	0.08
25_F	182_D	0.573	0.08
40_D	194_S	0.570	0.08
9_S	410_N	0.566	0.08
75_A	191_V	0.565	0.08
9_S	47_E	0.565	0.08
32_S	376_S	0.564	0.08
6_K	29_N	0.559	0.08
138_D	433_D	0.556	0.08
17_A	82_Q	0.552	0.08
271_S	283_C	0.551	0.08
111_V	184_I	0.550	0.08
19_D	412_H	0.549	0.08
286_G	289_G	0.548	0.08
66_L	328_K	0.548	0.08
173_Q	217_K	0.548	0.08
370_A	405_S	0.546	0.08
117_C	417_T	0.546	0.08
18_R	249_S	0.543	0.08
165_A	236_N	0.543	0.08
162_R	227_L	0.543	0.08
228_G	253_M	0.541	0.08
91_A	426_S	0.539	0.08
43_L	58_Y	0.538	0.08
43_L	336_V	0.537	0.08
116_M	149_I	0.536	0.08
81_K	295_F	0.534	0.08
113_L	184_I	0.534	0.08
129_Y	157_G	0.533	0.08
179_I	426_S	0.531	0.08
6_K	28_E	0.530	0.08
113_L	187_A	0.529	0.08
22_L	66_L	0.529	0.08
42_T	57_R	0.529	0.08
168_P	232_V	0.527	0.08
98_T	229_T	0.526	0.08
171_M	252_A	0.526	0.08
42_T	434_R	0.526	0.08
9_S	306_H	0.526	0.08
9_S	17_A	0.526	0.08
318_Q	324_A	0.526	0.08
68_I	237_P	0.526	0.08
55_I	136_R	0.525	0.08
24_Q	246_D	0.525	0.08
87_T	106_A	0.524	0.08
220_N	299_E	0.524	0.08
23_Q	32_S	0.523	0.08
100_H	229_T	0.522	0.08
94_T	150_G	0.521	0.08
26_Q	433_D	0.521	0.08
23_Q	117_C	0.521	0.08
84_N	202_G	0.520	0.08
218_K	314_A	0.520	0.08
6_K	410_N	0.520	0.08
338_S	398_C	0.519	0.08
18_R	29_N	0.519	0.08
261_L	429_E	0.519	0.08
26_Q	52_D	0.518	0.08
116_M	422_E	0.517	0.07
46_I	144_G	0.517	0.07
67_V	209_T	0.516	0.07
51_D	134_S	0.515	0.07
192_L	195_Y	0.514	0.07
286_G	355_G	0.514	0.07
40_D	426_S	0.511	0.07
33_A	430_S	0.511	0.07
198_R	228_G	0.511	0.07
214_E	376_S	0.511	0.07
240_W	283_C	0.510	0.07
20_P	112_L	0.509	0.07
329_D	375_R	0.508	0.07
344_M	349_K	0.507	0.07
29_N	246_D	0.506	0.07
122_I	283_C	0.506	0.07
205_M	273_K	0.506	0.07
92_G	358_D	0.506	0.07
375_R	430_S	0.505	0.07
74_E	117_C	0.503	0.07
60_L	293_A	0.503	0.07
76_L	173_Q	0.503	0.07
360_A	366_H	0.502	0.07
273_K	372_S	0.501	0.07
25_F	61_S	0.501	0.07
227_L	258_A	0.500	0.07

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3vasA	1	0.7488	100	0.71	Contact Map
4k8kA	2	0.7627	100	0.715	Contact Map
3otxA	1	0.7396	100	0.719	Contact Map
3looA	1	0.7419	100	0.72	Contact Map
1bx4A	1	0.7419	100	0.721	Contact Map
2absA	1	0.735	100	0.727	Contact Map
2rbcA	2	0.7005	100	0.745	Contact Map
2fv7A	2	0.6866	100	0.749	Contact Map
4xdaA	2	0.6866	100	0.752	Contact Map
3iq0A	2	0.7005	100	0.753	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0111 seconds.