VIAA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

VIAA - Protein ViaA

UniProt:	P0ADN0	Sequences: MLTLDTLNVMLAVSEEGLIEEMIIALLASPQLAVFFEKFPRLKAAITDDVPRWREALRSRLKDARVPPELTEEVMCYQQSQLLSTPQFIVQLPQILDLLHRLNSPWAEQARQLVDANSTITSALHTLFLQRWRLSLIVQATTLNQQLLEEEREQLLSEVQERMTLSGQLEPILADNNTAAGRLWDMSAGQLKRGDYQLIVKYGEFLNEQPELKRLAEQLGRSREAKSIPRNDAQMETFRTMVREPATVPEQVDGLQQSDDILRLLPPELATLGITELEYEFYRRLVEKQLLTYRLHGESWREKVIERPVVHKDYDEQPRGPFIVCVDTSGSMGGFNEQCAKAFCLALMRIALAENRRCYIMLFSTEIVRYELSGPQGIEQAIRFLSQQFRGGTDLASCFRAIMERLQSREWFDADAVVISDFIAQRLPDDVTSKVKELQRVHQHRFHAVAMSAHGKPGIMRIFDHIWRFDTGMRSRLLRRWRR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11730
Length:	483 (447)
Sequences:	334 (236)
Seq/√Len:	11.1

ECOLI - VIAA
SULSO - Q97W75

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
258_S	292_T	5.412	1.00
396_A	428_P	4.381	1.00
406_L	444_H	3.489	0.98
406_L	416_A	3.117	0.96
61_L	76_C	2.881	0.93
448_A	463_F	2.822	0.93
407_Q	434_K	2.772	0.92
406_L	409_R	2.753	0.92
398_C	416_A	2.724	0.91
321_P	414_A	2.723	0.91
293_Y	398_C	2.654	0.90
404_E	434_K	2.602	0.89
420_S	467_W	2.588	0.89
395_L	418_V	2.570	0.88
422_F	463_F	2.568	0.88
255_L	289_Q	2.531	0.88
271_T	284_R	2.471	0.86
254_G	325_C	2.396	0.84
132_W	422_F	2.320	0.82
384_F	394_D	2.317	0.82
277_L	337_E	2.314	0.82
264_L	288_K	2.285	0.81
348_M	364_S	2.284	0.81
216_A	347_L	2.276	0.81
281_F	361_M	2.271	0.81
337_E	384_F	2.244	0.80
415_D	421_D	2.222	0.80
396_A	449_V	2.175	0.78
326_V	384_F	2.115	0.76
136_L	398_C	2.069	0.74
416_A	444_H	2.052	0.74
341_K	345_L	2.047	0.73
340_A	384_F	1.977	0.71
163_M	189_G	1.973	0.71
385_L	388_Q	1.963	0.70
159_V	404_E	1.950	0.70
431_V	435_V	1.935	0.69
411_W	469_F	1.908	0.68
395_L	422_F	1.876	0.67
416_A	446_F	1.873	0.66
260_D	399_F	1.870	0.66
327_D	331_S	1.843	0.65
220_G	331_S	1.843	0.65
220_G	327_D	1.843	0.65
320_G	331_S	1.843	0.65
220_G	320_G	1.843	0.65
320_G	327_D	1.843	0.65
137_I	364_S	1.816	0.64
254_G	332_M	1.789	0.63
216_A	350_I	1.781	0.62
403_M	438_L	1.771	0.62
73_E	277_L	1.762	0.61
339_C	417_V	1.723	0.60
182_R	445_R	1.668	0.57
429_D	432_T	1.662	0.57
328_T	345_L	1.654	0.56
281_F	285_L	1.654	0.56
258_S	361_M	1.652	0.56
181_G	185_D	1.650	0.56
94_Q	168_Q	1.644	0.56
211_E	214_R	1.623	0.55
320_G	329_S	1.622	0.55
220_G	329_S	1.622	0.55
285_L	353_A	1.621	0.55
291_L	372_L	1.617	0.55
132_W	446_F	1.614	0.54
169_L	322_F	1.611	0.54
402_I	416_A	1.602	0.54
269_L	296_H	1.592	0.53
102_L	215_L	1.588	0.53
327_D	415_D	1.552	0.51
331_S	415_D	1.552	0.51
327_D	421_D	1.552	0.51
331_S	421_D	1.552	0.51
320_G	421_D	1.552	0.51
220_G	415_D	1.552	0.51
320_G	415_D	1.552	0.51
220_G	421_D	1.552	0.51
344_C	402_I	1.550	0.51
385_L	389_F	1.545	0.51
127_L	136_L	1.537	0.51
341_K	385_L	1.527	0.50
342_A	345_L	1.517	0.50
439_Q	449_V	1.510	0.49
423_I	463_F	1.507	0.49
293_Y	297_G	1.506	0.49
259_D	353_A	1.495	0.49
422_F	467_W	1.493	0.49
364_S	384_F	1.478	0.48
323_I	405_R	1.475	0.48
252_V	361_M	1.470	0.48
221_R	294_R	1.463	0.47
148_L	252_V	1.460	0.47
106_W	132_W	1.457	0.47
212_L	347_L	1.456	0.47
297_G	347_L	1.449	0.46
393_T	399_F	1.449	0.46
391_G	415_D	1.437	0.46
391_G	421_D	1.437	0.46
323_I	440_R	1.434	0.46
176_N	261_I	1.431	0.46
214_R	419_I	1.429	0.46
401_A	404_E	1.425	0.45
235_M	238_F	1.405	0.44
132_W	463_F	1.405	0.44
28_A	58_R	1.404	0.44
349_R	411_W	1.401	0.44
385_L	467_W	1.399	0.44
322_F	460_M	1.391	0.44
266_P	330_G	1.390	0.44
139_Q	206_L	1.388	0.44
161_E	285_L	1.381	0.43
264_L	269_L	1.374	0.43
210_P	371_E	1.363	0.42
321_P	356_R	1.361	0.42
332_M	340_A	1.352	0.42
262_L	269_L	1.348	0.42
263_R	293_Y	1.346	0.42
332_M	384_F	1.345	0.42
418_V	423_I	1.343	0.41
258_S	261_I	1.341	0.41
176_N	419_I	1.339	0.41
184_W	346_A	1.337	0.41
329_S	421_D	1.330	0.41
329_S	415_D	1.330	0.41
206_L	297_G	1.329	0.41
328_T	332_M	1.329	0.41
249_P	280_E	1.328	0.41
42_L	63_D	1.324	0.41
320_G	356_R	1.324	0.41
220_G	356_R	1.324	0.41
331_S	356_R	1.324	0.41
327_D	356_R	1.324	0.41
218_Q	326_V	1.322	0.40
219_L	447_H	1.322	0.40
278_E	282_Y	1.308	0.40
268_E	363_F	1.299	0.39
274_I	284_R	1.298	0.39
278_E	463_F	1.297	0.39
196_Y	200_V	1.295	0.39
220_G	268_E	1.291	0.39
268_E	327_D	1.291	0.39
268_E	320_G	1.291	0.39
268_E	331_S	1.291	0.39
291_L	297_G	1.289	0.39
448_A	467_W	1.282	0.39
348_M	399_F	1.265	0.38
265_L	321_P	1.262	0.38
293_Y	424_A	1.259	0.38
293_Y	395_L	1.257	0.37
94_Q	265_L	1.254	0.37
266_P	332_M	1.253	0.37
108_E	215_L	1.248	0.37
290_L	337_E	1.246	0.37
216_A	346_A	1.243	0.37
287_E	345_L	1.242	0.37
334_G	389_F	1.242	0.37
270_A	427_L	1.234	0.36
185_D	385_L	1.230	0.36
326_V	445_R	1.228	0.36
128_F	136_L	1.227	0.36
281_F	467_W	1.223	0.36
61_L	92_L	1.219	0.36
400_R	434_K	1.216	0.36
132_W	420_S	1.209	0.35
334_G	337_E	1.208	0.35
216_A	276_E	1.199	0.35
114_V	404_E	1.199	0.35
281_F	347_L	1.195	0.35
254_G	384_F	1.193	0.35
284_R	345_L	1.192	0.35
321_P	334_G	1.190	0.34
396_A	439_Q	1.187	0.34
79_Q	430_D	1.186	0.34
351_A	420_S	1.186	0.34
354_E	449_V	1.181	0.34
199_I	384_F	1.173	0.34
290_L	328_T	1.170	0.34
394_D	403_M	1.169	0.34
256_Q	289_Q	1.165	0.33
446_F	463_F	1.162	0.33
358_C	385_L	1.158	0.33
203_G	346_A	1.151	0.33
319_R	350_I	1.145	0.33
422_F	448_A	1.144	0.32
281_F	331_S	1.143	0.32
220_G	281_F	1.143	0.32
281_F	320_G	1.143	0.32
281_F	327_D	1.143	0.32
106_W	215_L	1.142	0.32
272_L	337_E	1.140	0.32
35_F	411_W	1.139	0.32
360_I	396_A	1.125	0.32
239_R	312_K	1.125	0.32
328_T	384_F	1.122	0.32
46_I	435_V	1.121	0.32
62_K	71_T	1.119	0.31
112_Q	153_E	1.118	0.31
100_H	146_Q	1.117	0.31
398_C	451_M	1.108	0.31
252_V	422_F	1.102	0.31
130_Q	273_G	1.102	0.31
195_D	286_V	1.100	0.31
235_M	307_R	1.094	0.30
329_S	356_R	1.090	0.30
206_L	344_C	1.090	0.30
295_L	342_A	1.090	0.30
339_C	451_M	1.085	0.30
196_Y	406_L	1.082	0.30
336_N	343_F	1.082	0.30
398_C	420_S	1.078	0.30
118_S	255_L	1.076	0.30
271_T	277_L	1.071	0.29
315_D	438_L	1.069	0.29
356_R	414_A	1.068	0.29
263_R	398_C	1.066	0.29
429_D	433_S	1.061	0.29
324_V	398_C	1.053	0.29
268_E	329_S	1.051	0.29
320_G	332_M	1.049	0.29
327_D	332_M	1.049	0.29
220_G	332_M	1.049	0.29
385_L	420_S	1.049	0.29
203_G	361_M	1.047	0.29
290_L	334_G	1.044	0.28
289_Q	359_Y	1.042	0.28
56_A	80_S	1.041	0.28
245_P	251_Q	1.041	0.28
341_K	392_G	1.039	0.28
202_Y	398_C	1.038	0.28
260_D	449_V	1.035	0.28
331_S	363_F	1.034	0.28
320_G	363_F	1.034	0.28
327_D	363_F	1.034	0.28
220_G	363_F	1.034	0.28
356_R	415_D	1.033	0.28
356_R	421_D	1.033	0.28
52_R	453_A	1.028	0.28
163_M	412_F	1.021	0.28
221_R	445_R	1.015	0.27
21_E	24_I	1.009	0.27
283_R	466_I	1.005	0.27
157_S	451_M	1.005	0.27
264_L	292_T	1.003	0.27
297_G	392_G	1.003	0.27
216_A	444_H	1.000	0.27
268_E	421_D	1.000	0.27
268_E	415_D	1.000	0.27
113_L	380_Q	0.998	0.27
204_E	403_M	0.987	0.26
30_P	34_V	0.984	0.26
183_L	467_W	0.984	0.26
255_L	412_F	0.983	0.26
135_S	382_I	0.983	0.26
336_N	411_W	0.981	0.26
213_K	416_A	0.979	0.26
202_Y	346_A	0.974	0.26
248_V	364_S	0.971	0.26
341_K	389_F	0.965	0.25
306_E	312_K	0.964	0.25
199_I	349_R	0.956	0.25
423_I	452_S	0.952	0.25
199_I	385_L	0.951	0.25
360_I	364_S	0.949	0.25
295_L	298_E	0.940	0.24
132_W	358_C	0.939	0.24
321_P	358_C	0.936	0.24
35_F	38_K	0.936	0.24
221_R	347_L	0.935	0.24
223_R	439_Q	0.935	0.24
30_P	36_F	0.930	0.24
295_L	360_I	0.929	0.24
109_Q	412_F	0.928	0.24
257_Q	361_M	0.927	0.24
366_E	412_F	0.926	0.24
393_T	415_D	0.925	0.24
393_T	421_D	0.925	0.24
276_E	322_F	0.925	0.24
324_V	344_C	0.922	0.24
173_L	383_R	0.916	0.24
250_E	297_G	0.916	0.24
126_T	199_I	0.913	0.24
394_D	420_S	0.911	0.23
164_T	264_L	0.907	0.23
337_E	389_F	0.906	0.23
139_Q	204_E	0.904	0.23
156_L	420_S	0.904	0.23
424_A	452_S	0.903	0.23
182_R	326_V	0.903	0.23
260_D	353_A	0.902	0.23
96_L	348_M	0.901	0.23
119_T	433_S	0.900	0.23
378_I	465_H	0.900	0.23
422_F	446_F	0.900	0.23
389_F	469_F	0.900	0.23
105_P	112_Q	0.899	0.23
399_F	418_V	0.898	0.23
251_Q	425_Q	0.893	0.23
326_V	344_C	0.892	0.23
205_F	444_H	0.889	0.23
261_I	291_L	0.887	0.23
30_P	40_P	0.887	0.23
326_V	371_E	0.887	0.23
342_A	372_L	0.885	0.23
337_E	341_K	0.884	0.23
159_V	221_R	0.883	0.23
342_A	459_I	0.883	0.23
422_F	450_A	0.880	0.22
153_E	325_C	0.877	0.22
263_R	295_L	0.877	0.22
217_E	383_R	0.876	0.22
282_Y	362_L	0.875	0.22
203_G	445_R	0.873	0.22
420_S	471_T	0.870	0.22
201_K	407_Q	0.868	0.22
281_F	329_S	0.866	0.22
179_A	273_G	0.865	0.22
296_H	439_Q	0.858	0.22
227_S	347_L	0.855	0.22
101_R	223_R	0.851	0.21
278_E	423_I	0.849	0.21
270_A	288_K	0.848	0.21
27_L	32_L	0.846	0.21
235_M	311_H	0.845	0.21
249_P	284_R	0.844	0.21
221_R	424_A	0.843	0.21
418_V	422_F	0.841	0.21
83_L	89_I	0.839	0.21
215_L	225_A	0.839	0.21
193_R	207_N	0.839	0.21
48_D	52_R	0.838	0.21
58_R	61_L	0.838	0.21
261_I	290_L	0.837	0.21
254_G	364_S	0.836	0.21
36_F	261_I	0.832	0.21
136_L	464_D	0.831	0.21
49_D	382_I	0.830	0.21
392_G	421_D	0.829	0.21
392_G	415_D	0.829	0.21
242_V	315_D	0.829	0.21
259_D	262_L	0.828	0.21
109_Q	204_E	0.828	0.21
104_S	117_N	0.825	0.21
290_L	389_F	0.824	0.21
288_K	360_I	0.824	0.21
418_V	463_F	0.820	0.20
288_K	438_L	0.820	0.20
110_A	113_L	0.819	0.20
148_L	265_L	0.819	0.20
327_D	391_G	0.815	0.20
331_S	391_G	0.815	0.20
320_G	391_G	0.815	0.20
220_G	391_G	0.815	0.20
204_E	382_I	0.814	0.20
230_R	349_R	0.814	0.20
254_G	323_I	0.811	0.20
128_F	322_F	0.811	0.20
94_Q	100_H	0.811	0.20
152_R	422_F	0.810	0.20
305_I	376_Q	0.809	0.20
194_G	372_L	0.807	0.20
339_C	424_A	0.806	0.20
23_I	270_A	0.805	0.20
212_L	221_R	0.805	0.20
260_D	466_I	0.802	0.20
255_L	330_G	0.802	0.20
281_F	415_D	0.801	0.20
281_F	421_D	0.801	0.20
150_E	400_R	0.801	0.20
218_Q	270_A	0.801	0.20
239_R	275_T	0.799	0.20
325_C	347_L	0.797	0.20
98_L	451_M	0.796	0.20
329_S	332_M	0.795	0.20
254_G	337_E	0.794	0.20
262_L	398_C	0.791	0.20
324_V	343_F	0.791	0.20
163_M	231_N	0.788	0.19
403_M	434_K	0.787	0.19
408_S	430_D	0.787	0.19
75_M	404_E	0.785	0.19
326_V	419_I	0.784	0.19
329_S	363_F	0.784	0.19
324_V	375_P	0.782	0.19
398_C	422_F	0.782	0.19
326_V	335_F	0.782	0.19
277_L	384_F	0.780	0.19
389_F	394_D	0.780	0.19
284_R	349_R	0.779	0.19
347_L	351_A	0.779	0.19
347_L	361_M	0.777	0.19
269_L	298_E	0.772	0.19
72_E	153_E	0.770	0.19
161_E	264_L	0.769	0.19
361_M	367_I	0.769	0.19
213_K	360_I	0.766	0.19
22_M	37_E	0.764	0.19
396_A	417_V	0.763	0.19
237_T	310_V	0.761	0.19
108_E	112_Q	0.760	0.19
92_L	96_L	0.760	0.19
446_F	467_W	0.760	0.19
395_L	424_A	0.759	0.19
87_Q	436_K	0.759	0.19
120_I	124_L	0.759	0.19
266_P	451_M	0.756	0.19
381_A	384_F	0.756	0.19
332_M	415_D	0.755	0.18
332_M	421_D	0.755	0.18
38_K	212_L	0.753	0.18
358_C	371_E	0.750	0.18
322_F	346_A	0.749	0.18
447_H	465_H	0.749	0.18
88_F	91_Q	0.747	0.18
204_E	207_N	0.745	0.18
283_R	456_K	0.745	0.18
283_R	346_A	0.744	0.18
281_F	363_F	0.743	0.18
363_F	421_D	0.741	0.18
363_F	415_D	0.741	0.18
216_A	362_L	0.741	0.18
235_M	241_M	0.740	0.18
73_E	77_Y	0.740	0.18
358_C	447_H	0.740	0.18
268_E	356_R	0.737	0.18
362_L	398_C	0.735	0.18
294_R	452_S	0.734	0.18
224_E	312_K	0.731	0.18
185_D	372_L	0.731	0.18
321_P	332_M	0.729	0.18
131_R	138_V	0.727	0.18
326_V	412_F	0.726	0.18
73_E	99_L	0.724	0.18
258_S	352_L	0.722	0.18
263_R	274_I	0.718	0.17
240_T	313_D	0.715	0.17
194_G	432_T	0.713	0.17
420_S	444_H	0.712	0.17
341_K	384_F	0.712	0.17
95_I	111_R	0.709	0.17
266_P	328_T	0.705	0.17
420_S	463_F	0.702	0.17
272_L	352_L	0.702	0.17
217_E	439_Q	0.701	0.17
191_L	370_Y	0.700	0.17
186_M	324_V	0.700	0.17
118_S	408_S	0.700	0.17
283_R	411_W	0.700	0.17
284_R	371_E	0.699	0.17
223_R	242_V	0.699	0.17
196_Y	252_V	0.698	0.17
88_F	99_L	0.694	0.17
259_D	360_I	0.693	0.17
101_R	119_T	0.693	0.17
235_M	306_E	0.691	0.17
70_L	73_E	0.691	0.17
278_E	352_L	0.691	0.17
324_V	412_F	0.691	0.17
238_F	313_D	0.691	0.17
122_S	126_T	0.691	0.17
344_C	452_S	0.690	0.17
67_P	73_E	0.689	0.17
195_D	406_L	0.687	0.17
132_W	136_L	0.686	0.17
328_T	337_E	0.685	0.17
255_L	461_R	0.680	0.16
207_N	403_M	0.679	0.16
360_I	394_D	0.678	0.16
252_V	290_L	0.676	0.16
35_F	40_P	0.674	0.16
119_T	122_S	0.674	0.16
90_V	94_Q	0.673	0.16
47_T	72_E	0.671	0.16
68_P	94_Q	0.671	0.16
238_F	243_R	0.670	0.16
203_G	357_R	0.669	0.16
153_E	399_F	0.669	0.16
228_I	276_E	0.669	0.16
85_T	275_T	0.668	0.16
95_I	463_F	0.666	0.16
325_C	358_C	0.665	0.16
444_H	463_F	0.665	0.16
413_D	445_R	0.664	0.16
203_G	299_S	0.663	0.16
414_A	421_D	0.663	0.16
254_G	359_Y	0.663	0.16
37_E	319_R	0.662	0.16
249_P	398_C	0.661	0.16
251_Q	271_T	0.658	0.16
434_K	437_E	0.657	0.16
213_K	330_G	0.657	0.16
149_E	153_E	0.654	0.16
242_V	310_V	0.653	0.16
298_E	338_Q	0.652	0.16
240_T	308_P	0.652	0.16
94_Q	122_S	0.650	0.16
24_I	34_V	0.650	0.16
398_C	446_F	0.650	0.16
433_S	437_E	0.649	0.16
297_G	342_A	0.648	0.16
56_A	68_P	0.647	0.16
243_R	326_V	0.646	0.16
109_Q	232_D	0.645	0.15
395_L	402_I	0.643	0.15
283_R	322_F	0.643	0.15
172_I	260_D	0.642	0.15
157_S	204_E	0.642	0.15
160_Q	261_I	0.641	0.15
272_L	290_L	0.640	0.15
397_S	403_M	0.636	0.15
83_L	267_P	0.635	0.15
191_L	366_E	0.635	0.15
77_Y	128_F	0.633	0.15
203_G	242_V	0.632	0.15
27_L	36_F	0.630	0.15
151_E	439_Q	0.630	0.15
51_P	139_Q	0.630	0.15
104_S	420_S	0.629	0.15
123_A	419_I	0.628	0.15
120_I	449_V	0.628	0.15
262_L	287_E	0.628	0.15
384_F	389_F	0.628	0.15
449_V	458_G	0.627	0.15
219_L	358_C	0.626	0.15
280_E	283_R	0.625	0.15
39_F	46_I	0.625	0.15
90_V	101_R	0.625	0.15
418_V	462_I	0.622	0.15
219_L	463_F	0.622	0.15
230_R	419_I	0.621	0.15
290_L	356_R	0.620	0.15
256_Q	448_A	0.619	0.15
112_Q	117_N	0.619	0.15
252_V	262_L	0.617	0.15
285_L	352_L	0.616	0.15
114_V	417_V	0.616	0.15
116_A	429_D	0.615	0.15
226_K	280_E	0.612	0.15
206_L	457_P	0.612	0.15
281_F	393_T	0.610	0.15
100_H	112_Q	0.609	0.15
40_P	43_K	0.607	0.15
258_S	285_L	0.606	0.15
297_G	365_T	0.606	0.15
397_S	469_F	0.603	0.14
100_H	434_K	0.603	0.14
293_Y	362_L	0.599	0.14
53_W	377_G	0.598	0.14
289_Q	374_G	0.597	0.14
219_L	420_S	0.595	0.14
137_I	145_Q	0.592	0.14
222_S	242_V	0.591	0.14
199_I	394_D	0.590	0.14
259_D	288_K	0.589	0.14
258_S	431_V	0.587	0.14
324_V	330_G	0.587	0.14
448_A	454_H	0.587	0.14
67_P	75_M	0.585	0.14
53_W	422_F	0.583	0.14
280_E	290_L	0.583	0.14
335_F	451_M	0.582	0.14
114_V	117_N	0.582	0.14
58_R	71_T	0.581	0.14
280_E	362_L	0.581	0.14
37_E	404_E	0.581	0.14
243_R	349_R	0.580	0.14
339_C	343_F	0.579	0.14
463_F	467_W	0.579	0.14
24_I	27_L	0.579	0.14
293_Y	447_H	0.578	0.14
265_L	323_I	0.577	0.14
395_L	405_R	0.577	0.14
288_K	403_M	0.576	0.14
424_A	448_A	0.575	0.14
94_Q	404_E	0.575	0.14
186_M	319_R	0.574	0.14
87_Q	433_S	0.573	0.14
238_F	311_H	0.572	0.14
134_L	138_V	0.571	0.14
184_W	202_Y	0.570	0.14
137_I	178_T	0.570	0.14
306_E	310_V	0.570	0.14
297_G	459_I	0.570	0.14
290_L	342_A	0.568	0.14
329_S	391_G	0.567	0.14
109_Q	146_Q	0.566	0.14
269_L	325_C	0.565	0.14
92_L	186_M	0.565	0.14
118_S	406_L	0.564	0.14
340_A	389_F	0.563	0.14
208_E	410_E	0.562	0.13
357_R	390_R	0.562	0.13
138_V	192_K	0.562	0.13
272_L	389_F	0.561	0.13
257_Q	343_F	0.561	0.13
208_E	404_E	0.560	0.13
166_S	417_V	0.560	0.13
215_L	343_F	0.559	0.13
174_A	213_K	0.556	0.13
106_W	276_E	0.556	0.13
81_Q	145_Q	0.556	0.13
219_L	422_F	0.555	0.13
297_G	377_G	0.555	0.13
286_V	451_M	0.552	0.13
181_G	385_L	0.552	0.13
109_Q	239_R	0.551	0.13
87_Q	190_Q	0.551	0.13
239_R	242_V	0.551	0.13
435_V	447_H	0.551	0.13
157_S	214_R	0.551	0.13
252_V	463_F	0.550	0.13
136_L	143_L	0.549	0.13
62_K	65_R	0.549	0.13
95_I	184_W	0.547	0.13
449_V	469_F	0.547	0.13
169_L	403_M	0.545	0.13
219_L	384_F	0.544	0.13
254_G	328_T	0.544	0.13
59_S	63_D	0.542	0.13
79_Q	432_T	0.541	0.13
62_K	199_I	0.540	0.13
413_D	443_Q	0.539	0.13
104_S	128_F	0.538	0.13
224_E	317_Q	0.538	0.13
225_A	416_A	0.538	0.13
386_S	414_A	0.534	0.13
42_L	403_M	0.533	0.13
25_A	461_R	0.531	0.13
156_L	445_R	0.531	0.13
157_S	191_L	0.531	0.13
97_D	306_E	0.530	0.13
109_Q	432_T	0.530	0.13
281_F	356_R	0.529	0.13
320_G	393_T	0.529	0.13
331_S	393_T	0.529	0.13
220_G	393_T	0.529	0.13
297_G	372_L	0.529	0.13
327_D	393_T	0.529	0.13
103_N	115_D	0.528	0.13
134_L	137_I	0.528	0.13
73_E	384_F	0.527	0.13
203_G	206_L	0.526	0.13
145_Q	212_L	0.526	0.13
201_K	440_R	0.525	0.13
231_N	310_V	0.524	0.13
172_I	277_L	0.524	0.13
306_E	442_H	0.523	0.13
274_I	279_Y	0.523	0.13
287_E	389_F	0.522	0.13
278_E	446_F	0.521	0.13
422_F	444_H	0.520	0.13
394_D	467_W	0.518	0.13
272_L	341_K	0.518	0.13
58_R	80_S	0.515	0.12
282_Y	346_A	0.514	0.12
332_M	362_L	0.511	0.12
148_L	335_F	0.510	0.12
188_A	265_L	0.510	0.12
398_C	444_H	0.509	0.12
236_E	294_R	0.507	0.12
237_T	313_D	0.504	0.12
155_L	293_Y	0.504	0.12
240_T	305_I	0.504	0.12
212_L	408_S	0.503	0.12
37_E	75_M	0.503	0.12
171_P	233_A	0.503	0.12
121_T	125_H	0.502	0.12
452_S	456_K	0.502	0.12
146_Q	430_D	0.502	0.12
76_C	350_I	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2x31A	2	0.3437	99.7	0.863	Contact Map
1n3yA	1	0.3416	99.6	0.873	Contact Map
1q0pA	1	0.3188	99.6	0.874	Contact Map
1mf7A	1	0.3478	99.6	0.876	Contact Map
4rckA	2	0.3354	99.6	0.876	Contact Map
4jduA	1	0.3271	99.6	0.877	Contact Map
1ijbA	1	0.3644	99.5	0.878	Contact Map
4hqoA	1	0.3727	99.5	0.879	Contact Map
4f1jA	1	0.3478	99.5	0.879	Contact Map
4okrA	1	0.3292	99.5	0.88	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0121 seconds.