FUMA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

FUMA - Fumarate hydratase class I, aerobic

UniProt:	P0AC33	Sequences: MSNKPFHYQAPFPLKKDDTEYYLLTSEHVSVSEFEGQEILKVAPEALTLLARQAFHDASFMLRPAHQQQVADILRDPEASENDKYVALQFLRNSDIAAKGVLPTCQDTGTAIIVGKKGQRVWTGGGDEAALARGVYNTYIEDNLRYSQNAPLDMYKEVNTGTNLPAQIDLYAVDGDEYKFLCIAKGGGSANKTYLYQETKALLTPGKLKNYLVEKMRTLGTAACPPYHIAFVIGGTSAETNLKTVKLASAKYYDELPTEGNEHGQAFRDVELEKELLIEAQNLGLGAQFGGKYFAHDIRVIRLPRHGASCPVGMGVSCSADRNIKAKINRQGIWIEKLEHNPGKYIPEELRKAGEGEAVRVDLNRPMKEILAQLSQYPVSTRLSLNGTIIVGRDIAHAKLKERMDNGEGLPQYIKDHPIYYAGPAKTPEGYASGSLGPTTAGRMDSYVDQLQAQGGSMIMLAKGNRSQQVTDACKKHGGFYLGSIGGPAAVLAQGSIKSLECVEYPELGMEAIWKIEVEDFPAFILVDDKGNDFFQQIQLTQCTRCVK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10356
Length:	548 (483)
Sequences:	856 (269)
Seq/√Len:	12.2

ECOLI - FUMA FUMB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
399_K	507_E	5.600	1.00
412_Q	416_D	5.230	1.00
400_L	410_L	4.685	1.00
202_L	312_V	4.618	1.00
498_K	519_E	4.558	1.00
191_N	309_S	4.400	1.00
51_A	131_L	4.178	1.00
153_D	156_K	3.842	0.99
468_Q	472_D	3.783	0.99
359_V	381_T	3.557	0.99
47_L	131_L	3.533	0.99
449_D	477_H	3.499	0.98
128_E	132_A	3.454	0.98
48_T	137_N	3.389	0.98
418_P	459_I	3.330	0.98
401_K	405_D	3.242	0.97
403_R	505_Y	3.182	0.97
278_I	281_Q	3.074	0.96
231_F	314_M	3.052	0.96
155_Y	272_L	3.009	0.96
389_I	461_L	2.981	0.96
55_F	111_A	2.950	0.95
183_I	250_A	2.936	0.95
329_N	334_W	2.893	0.95
449_D	476_K	2.831	0.94
360_R	520_D	2.809	0.94
499_S	517_E	2.783	0.94
452_Q	460_M	2.777	0.94
65_A	251_K	2.708	0.93
403_R	408_E	2.677	0.92
113_I	131_L	2.650	0.92
453_A	477_H	2.632	0.92
365_R	369_E	2.593	0.91
471_T	527_V	2.541	0.90
403_R	504_E	2.535	0.90
213_V	279_E	2.487	0.89
195_L	241_N	2.482	0.89
201_A	447_Y	2.478	0.89
150_A	160_T	2.448	0.88
115_G	170_L	2.446	0.88
68_Q	72_D	2.420	0.88
52_R	137_N	2.408	0.87
47_L	180_F	2.354	0.86
58_A	324_I	2.333	0.86
414_I	451_L	2.244	0.83
128_E	171_Y	2.221	0.83
419_I	460_M	2.208	0.82
129_A	132_A	2.193	0.82
399_K	506_P	2.176	0.81
89_Q	491_V	2.149	0.81
364_N	517_E	2.143	0.80
377_Y	525_I	2.142	0.80
268_R	271_E	2.137	0.80
276_L	280_A	2.109	0.79
401_K	450_Q	2.095	0.79
102_L	493_A	2.087	0.78
138_T	142_D	2.077	0.78
374_L	480_F	2.073	0.78
241_N	313_G	2.072	0.78
278_I	282_N	2.063	0.78
125_G	130_A	2.039	0.77
450_Q	453_A	2.035	0.77
459_I	480_F	2.004	0.76
259_E	265_Q	1.995	0.75
236_T	240_T	1.981	0.75
400_L	414_I	1.969	0.74
113_I	135_V	1.951	0.73
442_G	446_S	1.939	0.73
441_A	462_A	1.939	0.73
209_K	275_E	1.935	0.73
216_M	280_A	1.926	0.72
373_Q	376_Q	1.922	0.72
193_T	242_L	1.904	0.72
450_Q	454_Q	1.887	0.71
453_A	476_K	1.863	0.70
52_R	141_E	1.847	0.69
128_E	168_I	1.845	0.69
219_L	222_A	1.837	0.69
40_L	121_V	1.822	0.68
47_L	51_A	1.817	0.68
231_F	276_L	1.815	0.68
449_D	453_A	1.812	0.68
261_N	265_Q	1.807	0.67
418_P	480_F	1.780	0.66
64_P	345_Y	1.772	0.66
158_V	161_G	1.765	0.66
200_K	310_C	1.764	0.65
132_A	168_I	1.762	0.65
229_I	295_A	1.756	0.65
403_R	409_G	1.741	0.64
366_P	418_P	1.683	0.62
209_K	279_E	1.667	0.61
229_I	314_M	1.660	0.61
400_L	513_I	1.656	0.60
419_I	452_Q	1.632	0.59
46_A	333_I	1.626	0.59
366_P	480_F	1.623	0.59
201_A	446_S	1.621	0.59
66_H	70_V	1.581	0.57
269_D	300_V	1.579	0.57
361_V	373_Q	1.553	0.55
129_A	168_I	1.526	0.54
363_L	389_I	1.509	0.53
399_K	403_R	1.508	0.53
89_Q	104_T	1.487	0.52
229_I	276_L	1.484	0.52
132_A	166_A	1.483	0.52
154_M	233_I	1.482	0.52
137_N	141_E	1.453	0.50
193_T	236_T	1.450	0.50
60_F	89_Q	1.432	0.49
104_T	265_Q	1.413	0.48
154_M	208_L	1.411	0.48
116_K	179_K	1.406	0.48
48_T	133_R	1.391	0.47
84_K	476_K	1.388	0.47
414_I	419_I	1.385	0.47
436_L	500_L	1.361	0.46
104_T	491_V	1.355	0.45
135_V	140_I	1.338	0.44
390_I	503_V	1.337	0.44
360_R	384_S	1.337	0.44
213_V	276_L	1.336	0.44
117_K	172_A	1.331	0.44
402_E	406_N	1.331	0.44
471_T	533_D	1.325	0.44
47_L	127_D	1.320	0.44
504_E	513_I	1.317	0.43
400_L	451_L	1.313	0.43
324_I	327_K	1.310	0.43
116_K	171_Y	1.301	0.43
97_A	143_N	1.296	0.42
392_G	419_I	1.291	0.42
404_M	454_Q	1.278	0.41
312_V	388_T	1.273	0.41
280_A	295_A	1.270	0.41
110_T	148_Q	1.268	0.41
390_I	414_I	1.267	0.41
56_H	142_D	1.259	0.41
269_D	302_R	1.244	0.40
131_L	180_F	1.242	0.40
229_I	280_A	1.241	0.40
361_V	383_L	1.240	0.40
406_N	409_G	1.240	0.40
500_L	514_W	1.237	0.39
123_T	130_A	1.229	0.39
398_A	402_E	1.228	0.39
410_L	414_I	1.226	0.39
364_N	499_S	1.212	0.38
491_V	496_S	1.211	0.38
71_A	76_D	1.205	0.38
89_Q	100_G	1.202	0.38
285_L	505_Y	1.202	0.38
449_D	473_A	1.194	0.37
405_D	450_Q	1.192	0.37
136_Y	162_T	1.192	0.37
155_Y	268_R	1.187	0.37
61_M	89_Q	1.182	0.37
419_I	503_V	1.179	0.37
64_P	68_Q	1.175	0.36
222_A	535_F	1.168	0.36
448_V	460_M	1.166	0.36
69_Q	155_Y	1.165	0.36
193_T	241_N	1.163	0.36
110_T	197_Q	1.149	0.35
468_Q	536_Q	1.129	0.34
149_N	236_T	1.122	0.34
251_K	323_N	1.122	0.34
368_K	458_M	1.114	0.34
229_I	253_Y	1.112	0.34
182_C	324_I	1.112	0.34
149_N	312_V	1.109	0.33
388_T	417_H	1.107	0.33
348_E	358_A	1.106	0.33
207_K	210_N	1.104	0.33
213_V	217_R	1.103	0.33
400_L	409_G	1.102	0.33
390_I	417_H	1.097	0.33
231_F	300_V	1.095	0.33
478_G	530_K	1.095	0.33
388_T	517_E	1.092	0.33
169_D	240_T	1.087	0.32
388_T	515_K	1.086	0.32
149_N	198_E	1.085	0.32
404_M	450_Q	1.069	0.32
56_H	61_M	1.068	0.32
68_Q	345_Y	1.067	0.32
279_E	282_N	1.066	0.32
193_T	315_G	1.060	0.31
324_I	338_L	1.054	0.31
60_F	325_K	1.044	0.31
472_D	476_K	1.044	0.31
95_D	99_K	1.043	0.31
195_L	313_G	1.040	0.30
170_L	419_I	1.036	0.30
295_A	298_I	1.035	0.30
131_L	168_I	1.032	0.30
143_N	168_I	1.032	0.30
343_G	362_D	1.030	0.30
182_C	374_L	1.029	0.30
276_L	300_V	1.025	0.30
527_V	535_F	1.025	0.30
241_N	315_G	1.025	0.30
276_L	279_E	1.020	0.30
207_K	262_E	1.019	0.30
272_L	275_E	1.016	0.29
514_W	517_E	1.005	0.29
499_S	514_W	1.004	0.29
92_R	353_A	1.004	0.29
120_R	176_D	1.002	0.29
100_G	104_T	0.998	0.29
446_S	499_S	0.989	0.28
452_Q	458_M	0.987	0.28
69_Q	251_K	0.986	0.28
51_A	135_V	0.979	0.28
366_P	459_I	0.974	0.28
60_F	323_N	0.968	0.27
493_A	500_L	0.966	0.27
71_A	349_E	0.962	0.27
228_H	534_F	0.960	0.27
126_G	129_A	0.959	0.27
456_G	473_A	0.959	0.27
228_H	237_S	0.958	0.27
400_L	449_D	0.958	0.27
154_M	302_R	0.955	0.27
56_H	100_G	0.953	0.27
90_F	392_G	0.953	0.27
95_D	346_I	0.951	0.27
446_S	517_E	0.949	0.27
104_T	538_I	0.941	0.26
310_C	471_T	0.940	0.26
390_I	516_I	0.940	0.26
89_Q	295_A	0.937	0.26
404_M	409_G	0.934	0.26
431_Y	494_Q	0.933	0.26
49_L	53_Q	0.930	0.26
97_A	352_K	0.928	0.26
127_D	170_L	0.926	0.26
469_Q	472_D	0.920	0.26
53_Q	312_V	0.919	0.25
501_E	515_K	0.917	0.25
47_L	130_A	0.913	0.25
272_L	458_M	0.907	0.25
198_E	272_L	0.906	0.25
133_R	136_Y	0.906	0.25
266_A	313_G	0.904	0.25
364_N	388_T	0.903	0.25
324_I	519_E	0.901	0.25
117_K	170_L	0.900	0.25
213_V	283_L	0.899	0.25
351_R	400_L	0.893	0.24
55_F	59_S	0.892	0.24
208_L	477_H	0.892	0.24
275_E	312_V	0.890	0.24
484_S	488_P	0.889	0.24
55_F	182_C	0.888	0.24
357_E	414_I	0.884	0.24
200_K	395_I	0.882	0.24
213_V	494_Q	0.879	0.24
193_T	313_G	0.874	0.24
182_C	473_A	0.874	0.24
111_A	182_C	0.874	0.24
215_K	218_T	0.872	0.24
236_T	538_I	0.869	0.24
399_K	504_E	0.869	0.24
343_G	404_M	0.868	0.24
210_N	283_L	0.866	0.23
503_V	514_W	0.865	0.23
45_E	49_L	0.862	0.23
177_E	327_K	0.861	0.23
128_E	170_L	0.861	0.23
66_H	71_A	0.860	0.23
389_I	418_P	0.859	0.23
261_N	389_I	0.858	0.23
373_Q	525_I	0.856	0.23
89_Q	496_S	0.853	0.23
409_G	478_G	0.852	0.23
433_S	516_I	0.852	0.23
528_D	532_N	0.852	0.23
484_S	500_L	0.850	0.23
191_N	215_K	0.848	0.23
44_P	130_A	0.848	0.23
402_E	405_D	0.847	0.23
115_G	131_L	0.845	0.23
492_L	496_S	0.840	0.23
110_T	236_T	0.840	0.23
92_R	351_R	0.837	0.22
112_I	191_N	0.835	0.22
90_F	535_F	0.835	0.22
155_Y	274_K	0.829	0.22
198_E	216_M	0.828	0.22
161_G	450_Q	0.824	0.22
132_A	172_A	0.823	0.22
162_T	380_S	0.823	0.22
112_I	309_S	0.821	0.22
239_E	303_L	0.820	0.22
198_E	215_K	0.816	0.22
189_S	347_P	0.814	0.22
44_P	309_S	0.814	0.22
158_V	458_M	0.814	0.22
172_A	313_G	0.814	0.22
123_T	127_D	0.812	0.22
104_T	219_L	0.812	0.22
96_I	195_L	0.811	0.22
117_K	127_D	0.811	0.22
139_Y	308_A	0.809	0.21
60_F	70_V	0.808	0.21
274_K	330_R	0.807	0.21
216_M	276_L	0.805	0.21
436_L	516_I	0.805	0.21
84_K	430_G	0.805	0.21
494_Q	505_Y	0.803	0.21
369_E	375_S	0.802	0.21
317_S	321_D	0.801	0.21
368_K	459_I	0.801	0.21
149_N	389_I	0.800	0.21
229_I	298_I	0.799	0.21
433_S	436_L	0.798	0.21
57_D	61_M	0.795	0.21
355_E	358_A	0.794	0.21
150_A	161_G	0.793	0.21
60_F	295_A	0.792	0.21
488_P	491_V	0.792	0.21
128_E	166_A	0.787	0.21
215_K	314_M	0.787	0.21
60_F	101_V	0.784	0.21
100_G	460_M	0.783	0.21
100_G	217_R	0.780	0.20
254_D	301_I	0.779	0.20
135_V	389_I	0.779	0.20
483_G	534_F	0.778	0.20
345_Y	461_L	0.778	0.20
142_D	313_G	0.777	0.20
92_R	349_E	0.777	0.20
409_G	415_K	0.775	0.20
231_F	296_H	0.775	0.20
174_D	468_Q	0.770	0.20
362_D	409_G	0.769	0.20
126_G	174_D	0.768	0.20
488_P	521_F	0.767	0.20
366_P	369_E	0.766	0.20
191_N	441_A	0.764	0.20
461_L	488_P	0.764	0.20
456_G	504_E	0.762	0.20
149_N	446_S	0.756	0.20
231_F	380_S	0.756	0.20
261_N	278_I	0.755	0.20
324_I	352_K	0.754	0.20
277_L	383_L	0.753	0.20
215_K	309_S	0.752	0.20
280_A	283_L	0.751	0.20
471_T	535_F	0.748	0.19
47_L	480_F	0.746	0.19
110_T	253_Y	0.745	0.19
161_G	501_E	0.745	0.19
379_V	533_D	0.741	0.19
342_P	345_Y	0.741	0.19
150_A	369_E	0.740	0.19
404_M	458_M	0.738	0.19
219_L	314_M	0.738	0.19
89_Q	265_Q	0.737	0.19
236_T	241_N	0.736	0.19
133_R	536_Q	0.735	0.19
131_L	451_L	0.734	0.19
364_N	386_N	0.733	0.19
153_D	431_Y	0.732	0.19
95_D	526_L	0.730	0.19
432_A	513_I	0.730	0.19
196_Y	215_K	0.730	0.19
194_Y	392_G	0.729	0.19
241_N	250_A	0.728	0.19
142_D	380_S	0.726	0.19
149_N	309_S	0.726	0.19
44_P	125_G	0.724	0.19
149_N	395_I	0.724	0.19
58_A	89_Q	0.723	0.19
179_K	233_I	0.723	0.19
162_T	446_S	0.721	0.19
406_N	498_K	0.718	0.19
152_L	208_L	0.718	0.19
149_N	194_Y	0.717	0.18
498_K	517_E	0.715	0.18
260_G	263_H	0.714	0.18
138_T	184_A	0.713	0.18
389_I	460_M	0.712	0.18
427_T	430_G	0.711	0.18
55_F	184_A	0.710	0.18
282_N	498_K	0.709	0.18
59_S	104_T	0.708	0.18
68_Q	344_K	0.707	0.18
67_Q	90_F	0.705	0.18
383_L	469_Q	0.702	0.18
72_D	349_E	0.702	0.18
80_S	333_I	0.699	0.18
42_V	357_E	0.699	0.18
400_L	450_Q	0.697	0.18
420_Y	436_L	0.692	0.18
260_G	264_G	0.692	0.18
135_V	357_E	0.691	0.18
383_L	488_P	0.690	0.18
162_T	194_Y	0.689	0.18
84_K	418_P	0.688	0.18
152_L	526_L	0.687	0.18
308_A	396_A	0.687	0.18
409_G	499_S	0.687	0.18
148_Q	197_Q	0.686	0.18
236_T	460_M	0.684	0.18
143_N	534_F	0.684	0.18
374_L	529_D	0.683	0.17
71_A	92_R	0.683	0.17
59_S	207_K	0.682	0.17
116_K	433_S	0.682	0.17
352_K	357_E	0.681	0.17
148_Q	167_Q	0.680	0.17
265_Q	491_V	0.679	0.17
418_P	432_A	0.678	0.17
116_K	399_K	0.677	0.17
114_V	183_I	0.676	0.17
216_M	379_V	0.676	0.17
388_T	477_H	0.675	0.17
377_Y	383_L	0.674	0.17
374_L	459_I	0.673	0.17
65_A	250_A	0.672	0.17
155_Y	258_T	0.671	0.17
96_I	383_L	0.669	0.17
277_L	298_I	0.667	0.17
214_E	218_T	0.667	0.17
150_A	389_I	0.666	0.17
216_M	231_F	0.664	0.17
84_K	345_Y	0.664	0.17
119_Q	272_L	0.664	0.17
113_I	182_C	0.664	0.17
72_D	296_H	0.664	0.17
161_G	476_K	0.663	0.17
114_V	329_N	0.662	0.17
137_N	262_E	0.662	0.17
324_I	337_K	0.659	0.17
374_L	386_N	0.659	0.17
97_A	259_E	0.658	0.17
160_T	216_M	0.658	0.17
236_T	242_L	0.657	0.17
198_E	207_K	0.656	0.17
216_M	279_E	0.656	0.17
274_K	344_K	0.654	0.17
183_I	334_W	0.653	0.17
89_Q	283_L	0.653	0.17
488_P	496_S	0.653	0.17
379_V	459_I	0.651	0.17
401_K	451_L	0.650	0.17
261_N	310_C	0.648	0.16
278_I	536_Q	0.647	0.16
69_Q	459_I	0.647	0.16
177_E	494_Q	0.646	0.16
102_L	494_Q	0.645	0.16
502_C	506_P	0.644	0.16
392_G	513_I	0.642	0.16
253_Y	389_I	0.642	0.16
201_A	402_E	0.642	0.16
389_I	408_E	0.641	0.16
97_A	324_I	0.641	0.16
216_M	538_I	0.640	0.16
129_A	276_L	0.640	0.16
251_K	254_D	0.639	0.16
116_K	247_L	0.639	0.16
161_G	405_D	0.636	0.16
404_M	408_E	0.635	0.16
403_R	406_N	0.635	0.16
231_F	251_K	0.634	0.16
191_N	195_L	0.633	0.16
488_P	515_K	0.633	0.16
448_V	492_L	0.631	0.16
375_S	529_D	0.628	0.16
56_H	149_N	0.628	0.16
97_A	125_G	0.628	0.16
222_A	485_I	0.628	0.16
293_Y	296_H	0.628	0.16
59_S	119_Q	0.628	0.16
295_A	496_S	0.627	0.16
180_F	326_A	0.626	0.16
123_T	214_E	0.626	0.16
53_Q	337_K	0.626	0.16
55_F	212_L	0.624	0.16
412_Q	513_I	0.624	0.16
368_K	374_L	0.624	0.16
384_S	514_W	0.623	0.16
179_K	386_N	0.623	0.16
51_A	115_G	0.622	0.16
272_L	340_H	0.621	0.16
343_G	498_K	0.620	0.16
258_T	270_V	0.620	0.16
111_A	237_S	0.619	0.16
72_D	113_I	0.618	0.16
403_R	451_L	0.617	0.16
493_A	498_K	0.616	0.16
231_F	272_L	0.616	0.16
470_V	492_L	0.615	0.16
148_Q	441_A	0.615	0.16
202_L	447_Y	0.615	0.16
383_L	419_I	0.614	0.16
113_I	270_V	0.613	0.16
389_I	518_V	0.612	0.15
133_R	137_N	0.611	0.15
330_R	333_I	0.611	0.15
398_A	447_Y	0.610	0.15
236_T	472_D	0.610	0.15
218_T	376_Q	0.610	0.15
161_G	498_K	0.610	0.15
59_S	184_A	0.609	0.15
441_A	488_P	0.608	0.15
127_D	181_L	0.608	0.15
119_Q	122_W	0.607	0.15
503_V	506_P	0.607	0.15
358_A	493_A	0.607	0.15
70_V	229_I	0.607	0.15
264_G	271_E	0.607	0.15
409_G	454_Q	0.606	0.15
98_A	460_M	0.606	0.15
97_A	300_V	0.606	0.15
485_I	492_L	0.605	0.15
53_Q	156_K	0.605	0.15
312_V	357_E	0.602	0.15
352_K	355_E	0.602	0.15
70_V	104_T	0.601	0.15
96_I	117_K	0.601	0.15
342_P	519_E	0.600	0.15
112_I	258_T	0.600	0.15
114_V	171_Y	0.600	0.15
449_D	454_Q	0.600	0.15
127_D	180_F	0.600	0.15
88_L	97_A	0.599	0.15
261_N	274_K	0.598	0.15
135_V	183_I	0.597	0.15
460_M	477_H	0.597	0.15
207_K	313_G	0.596	0.15
118_G	176_D	0.596	0.15
142_D	315_G	0.595	0.15
158_V	247_L	0.595	0.15
67_Q	345_Y	0.594	0.15
138_T	208_L	0.593	0.15
477_H	527_V	0.593	0.15
226_P	287_A	0.593	0.15
309_S	441_A	0.593	0.15
414_I	450_Q	0.591	0.15
452_Q	479_G	0.590	0.15
267_F	271_E	0.589	0.15
143_N	379_V	0.589	0.15
61_M	100_G	0.589	0.15
368_K	389_I	0.588	0.15
359_V	373_Q	0.588	0.15
87_A	268_R	0.587	0.15
380_S	493_A	0.587	0.15
274_K	278_I	0.585	0.15
154_M	300_V	0.585	0.15
229_I	310_C	0.585	0.15
339_E	345_Y	0.585	0.15
210_N	213_V	0.584	0.15
92_R	191_N	0.584	0.15
70_V	349_E	0.582	0.15
409_G	505_Y	0.581	0.15
402_E	505_Y	0.580	0.15
357_E	360_R	0.580	0.15
403_R	441_A	0.577	0.15
374_L	470_V	0.575	0.15
149_N	191_N	0.574	0.15
129_A	373_Q	0.574	0.15
82_N	534_F	0.573	0.14
99_K	534_F	0.572	0.14
183_I	251_K	0.572	0.14
388_T	514_W	0.572	0.14
116_K	313_G	0.572	0.14
167_Q	303_L	0.570	0.14
480_F	529_D	0.570	0.14
97_A	388_T	0.570	0.14
143_N	233_I	0.569	0.14
59_S	380_S	0.568	0.14
431_Y	515_K	0.568	0.14
373_Q	477_H	0.568	0.14
240_T	312_V	0.566	0.14
70_V	89_Q	0.565	0.14
376_Q	477_H	0.564	0.14
156_K	513_I	0.564	0.14
396_A	399_K	0.563	0.14
366_P	417_H	0.563	0.14
43_A	253_Y	0.563	0.14
49_L	113_I	0.563	0.14
396_A	508_L	0.562	0.14
95_D	280_A	0.561	0.14
52_R	142_D	0.561	0.14
348_E	357_E	0.561	0.14
346_I	526_L	0.560	0.14
73_I	87_A	0.559	0.14
140_I	162_T	0.557	0.14
182_C	470_V	0.557	0.14
310_C	401_K	0.555	0.14
158_V	262_E	0.554	0.14
401_K	404_M	0.554	0.14
64_P	352_K	0.554	0.14
193_T	266_A	0.554	0.14
112_I	168_I	0.553	0.14
181_L	325_K	0.552	0.14
260_G	266_A	0.552	0.14
99_K	494_Q	0.552	0.14
258_T	261_N	0.551	0.14
104_T	236_T	0.551	0.14
184_A	488_P	0.551	0.14
505_Y	513_I	0.550	0.14
96_I	491_V	0.550	0.14
285_L	380_S	0.549	0.14
469_Q	517_E	0.549	0.14
41_K	71_A	0.549	0.14
458_M	472_D	0.549	0.14
276_L	285_L	0.549	0.14
180_F	478_G	0.547	0.14
99_K	137_N	0.547	0.14
153_D	200_K	0.544	0.14
153_D	173_V	0.544	0.14
296_H	317_S	0.544	0.14
368_K	375_S	0.543	0.14
216_M	247_L	0.543	0.14
404_M	475_K	0.542	0.14
156_K	459_I	0.542	0.14
65_A	525_I	0.541	0.14
70_V	298_I	0.541	0.14
172_A	414_I	0.541	0.14
494_Q	504_E	0.540	0.14
140_I	400_L	0.539	0.14
51_A	113_I	0.538	0.14
388_T	418_P	0.538	0.14
149_N	380_S	0.538	0.14
384_S	390_I	0.537	0.14
140_I	388_T	0.536	0.14
147_S	189_S	0.536	0.14
49_L	131_L	0.536	0.14
403_R	507_E	0.535	0.14
399_K	479_G	0.535	0.14
219_L	317_S	0.535	0.14
362_D	365_R	0.534	0.14
104_T	503_V	0.534	0.14
412_Q	471_T	0.533	0.14
348_E	449_D	0.533	0.14
362_D	432_A	0.533	0.14
43_A	233_I	0.532	0.13
389_I	468_Q	0.532	0.13
467_S	527_V	0.531	0.13
179_K	505_Y	0.530	0.13
90_F	207_K	0.530	0.13
41_K	283_L	0.530	0.13
82_N	93_N	0.530	0.13
183_I	241_N	0.529	0.13
406_N	476_K	0.529	0.13
209_K	272_L	0.529	0.13
250_A	275_E	0.529	0.13
70_V	295_A	0.529	0.13
42_V	98_A	0.528	0.13
64_P	344_K	0.528	0.13
78_E	292_K	0.527	0.13
272_L	278_I	0.527	0.13
194_Y	218_T	0.527	0.13
67_Q	502_C	0.526	0.13
212_L	231_F	0.526	0.13
77_P	293_Y	0.526	0.13
348_E	519_E	0.525	0.13
136_Y	251_K	0.525	0.13
87_A	479_G	0.525	0.13
175_G	240_T	0.523	0.13
281_Q	395_I	0.523	0.13
471_T	536_Q	0.522	0.13
142_D	515_K	0.522	0.13
149_N	202_L	0.519	0.13
448_V	452_Q	0.519	0.13
434_G	466_R	0.519	0.13
77_P	254_D	0.519	0.13
55_F	131_L	0.518	0.13
71_A	526_L	0.518	0.13
149_N	502_C	0.518	0.13
285_L	420_Y	0.518	0.13
197_Q	208_L	0.518	0.13
161_G	464_G	0.518	0.13
72_D	274_K	0.518	0.13
476_K	501_E	0.517	0.13
155_Y	310_C	0.517	0.13
142_D	295_A	0.517	0.13
148_Q	305_R	0.517	0.13
337_K	340_H	0.516	0.13
193_T	314_M	0.516	0.13
315_G	538_I	0.516	0.13
64_P	342_P	0.516	0.13
247_L	253_Y	0.515	0.13
401_K	449_D	0.515	0.13
136_Y	263_H	0.514	0.13
115_G	180_F	0.512	0.13
449_D	469_Q	0.512	0.13
161_G	389_I	0.512	0.13
338_L	471_T	0.511	0.13
97_A	415_K	0.511	0.13
196_Y	312_V	0.511	0.13
135_V	179_K	0.510	0.13
184_A	491_V	0.509	0.13
237_S	398_A	0.509	0.13
63_R	93_N	0.509	0.13
350_L	355_E	0.509	0.13
386_N	529_D	0.508	0.13
197_Q	236_T	0.508	0.13
59_S	283_L	0.508	0.13
161_G	209_K	0.507	0.13
122_W	174_D	0.507	0.13
263_H	406_N	0.507	0.13
134_G	418_P	0.507	0.13
314_M	380_S	0.507	0.13
48_T	141_E	0.507	0.13
202_L	236_T	0.507	0.13
171_Y	380_S	0.506	0.13
416_D	451_L	0.505	0.13
51_A	324_I	0.505	0.13
158_V	276_L	0.505	0.13
104_T	380_S	0.504	0.13
390_I	410_L	0.504	0.13
309_S	449_D	0.503	0.13
79_A	475_K	0.502	0.13
127_D	178_Y	0.501	0.13
415_K	449_D	0.501	0.13
176_D	285_L	0.501	0.13
156_K	361_V	0.500	0.13
528_D	531_G	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2isbA	1	0.3303	100	0.715	Contact Map
2lrnA	1	0.2372	62.9	0.984	Contact Map
3kcmA	1	0.2026	44.5	0.985	Contact Map
3fkfA	4	0.2336	42.9	0.985	Contact Map
3eurA	1	0.2354	42.4	0.985	Contact Map
3fw2A	2	0.2372	33.6	0.986	Contact Map
2b1kA	1	0.2318	31.4	0.986	Contact Map
3eytA	4	0.2391	31.4	0.986	Contact Map
2e28A	3	0.1551	31.4	0.986	Contact Map
2ljaA	1	0.2445	28.5	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0124 seconds.