DCUC - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

DCUC - Anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuC

UniProt:	P0ABP3	Sequences: MLTFIELLIGVVVIVGVARYIIKGYSATGVLFVGGLLLLIISAIMGHKVLPSSQASTGYSATDIVEYVKILLMSRGGDLGMMIMMLCGFAAYMTHIGANDMVVKLASKPLQYINSPYLLMIAAYFVACLMSLAVSSATGLGVLLMATLFPVMVNVGISRGAAAAICASPAAIILAPTSGDVVLAAQASEMSLIDFAFKTTLPISIAAIIGMAIAHFFWQRYLDKKEHISHEMLDVSEITTTAPAFYAILPFTPIIGVLIFDGKWGPQLHIITILVICMLIASILEFLRSFNTQKVFSGLEVAYRGMADAFANVVMLLVAAGVFAQGLSTIGFIQSLISIATSFGSASIILMLVLVILTMLAAVTTGSGNAPFYAFVEMIPKLAHSSGINPAYLTIPMLQASNLGRTLSPVSGVVVAVAGMAKISPFEVVKRTSVPVLVGLVIVIVATELMVPGTAAAVTGK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG13545
Length:	461 (441)
Sequences:	392 (278)
Seq/√Len:	13.2

ECOLI - DCUC DCUD

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
214_A	438_V	7.701	1.00
215_H	219_Q	5.923	1.00
210_G	438_V	5.232	1.00
245_F	284_L	4.434	1.00
175_A	196_A	4.389	1.00
13_V	34_G	4.130	1.00
191_S	194_D	3.981	1.00
210_G	442_I	3.801	0.99
276_I	280_I	3.443	0.99
205_I	209_I	3.246	0.98
257_V	320_A	3.001	0.97
285_E	288_R	2.995	0.97
220_R	224_K	2.987	0.97
167_A	428_V	2.811	0.95
17_V	34_G	2.801	0.95
66_E	69_K	2.785	0.95
75_R	321_G	2.673	0.94
26_S	300_E	2.641	0.93
12_V	44_I	2.458	0.91
69_K	269_H	2.446	0.90
164_A	215_H	2.403	0.89
437_L	441_V	2.379	0.89
160_G	412_G	2.359	0.89
365_T	410_V	2.358	0.89
219_Q	223_D	2.340	0.88
225_K	239_T	2.317	0.88
221_Y	225_K	2.261	0.86
320_A	415_V	2.257	0.86
302_A	305_G	2.217	0.85
255_I	441_V	2.171	0.84
393_L	419_G	2.167	0.84
164_A	212_A	2.157	0.84
105_L	244_A	2.152	0.83
135_S	270_I	2.149	0.83
72_L	318_V	2.145	0.83
174_L	399_Q	2.110	0.82
137_A	413_V	2.098	0.82
316_L	412_G	2.088	0.81
157_I	162_A	2.080	0.81
103_V	137_A	2.057	0.80
10_G	332_F	2.046	0.80
141_G	413_V	2.043	0.80
127_A	169_P	2.018	0.79
196_A	410_V	2.000	0.78
86_L	175_A	1.994	0.78
418_A	428_V	1.992	0.78
168_S	215_H	1.976	0.78
289_S	292_T	1.952	0.77
101_M	247_A	1.948	0.77
90_A	267_Q	1.905	0.75
359_M	404_G	1.897	0.75
9_I	41_I	1.859	0.73
402_N	412_G	1.842	0.72
387_G	411_S	1.815	0.71
304_R	308_D	1.805	0.71
359_M	412_G	1.781	0.70
180_D	369_N	1.758	0.69
107_S	342_S	1.748	0.68
79_L	89_F	1.741	0.68
411_S	415_V	1.734	0.67
218_W	434_V	1.734	0.67
164_A	219_Q	1.721	0.67
291_N	294_K	1.716	0.67
179_G	373_Y	1.716	0.67
13_V	37_L	1.710	0.66
118_L	449_L	1.682	0.65
79_L	123_A	1.657	0.64
175_A	416_A	1.653	0.64
212_A	215_H	1.651	0.64
406_T	439_G	1.646	0.63
256_G	276_I	1.622	0.62
257_V	364_T	1.619	0.62
99_N	155_V	1.613	0.62
147_T	327_L	1.611	0.62
8_L	36_L	1.597	0.61
15_V	283_I	1.592	0.61
65_V	276_I	1.592	0.61
200_T	204_S	1.552	0.59
168_S	172_I	1.544	0.58
21_I	327_L	1.541	0.58
13_V	38_L	1.536	0.58
97_G	215_H	1.526	0.57
203_I	212_A	1.521	0.57
149_F	418_A	1.514	0.57
124_Y	131_S	1.503	0.56
148_L	330_I	1.483	0.55
120_M	161_A	1.482	0.55
95_H	301_V	1.474	0.55
73_M	77_G	1.468	0.54
104_K	118_L	1.459	0.54
38_L	432_T	1.455	0.54
170_A	174_L	1.445	0.53
219_Q	224_K	1.430	0.52
270_I	420_M	1.425	0.52
334_Q	338_S	1.424	0.52
102_V	317_L	1.423	0.52
32_F	322_V	1.422	0.52
186_Q	189_E	1.420	0.52
252_T	318_V	1.419	0.52
275_V	360_L	1.413	0.51
125_F	129_L	1.411	0.51
11_V	237_E	1.410	0.51
338_S	341_T	1.397	0.50
210_G	283_I	1.396	0.50
209_I	213_I	1.395	0.50
232_M	426_F	1.382	0.50
131_S	171_A	1.368	0.49
371_P	374_A	1.356	0.48
269_H	272_T	1.343	0.48
112_Y	349_I	1.315	0.46
356_I	437_L	1.313	0.46
84_M	310_F	1.304	0.46
18_A	418_A	1.290	0.45
248_I	439_G	1.287	0.45
254_I	400_A	1.278	0.44
257_V	400_A	1.276	0.44
154_N	186_Q	1.276	0.44
311_A	315_M	1.275	0.44
209_I	227_H	1.272	0.44
174_L	417_V	1.271	0.44
227_H	230_H	1.269	0.44
116_P	369_N	1.265	0.44
137_A	316_L	1.263	0.43
251_F	342_S	1.257	0.43
138_T	374_A	1.255	0.43
170_A	316_L	1.254	0.43
164_A	436_V	1.244	0.42
37_L	294_K	1.240	0.42
44_I	209_I	1.232	0.42
37_L	237_E	1.223	0.41
352_L	444_I	1.217	0.41
83_I	103_V	1.217	0.41
252_T	439_G	1.216	0.41
127_A	168_S	1.206	0.40
123_A	188_S	1.204	0.40
126_V	309_A	1.197	0.40
27_A	89_F	1.189	0.40
218_W	222_L	1.187	0.40
257_V	343_F	1.187	0.40
211_M	227_H	1.173	0.39
116_P	316_L	1.170	0.39
248_I	438_V	1.165	0.38
289_S	294_K	1.156	0.38
317_L	423_I	1.152	0.38
57_T	66_E	1.146	0.37
172_I	208_I	1.136	0.37
355_V	388_I	1.135	0.37
202_P	208_I	1.134	0.37
169_P	415_V	1.132	0.37
152_M	261_D	1.132	0.37
80_G	396_P	1.130	0.37
190_M	291_N	1.129	0.37
237_E	360_L	1.128	0.37
17_V	374_A	1.128	0.37
243_P	380_P	1.125	0.36
225_K	279_L	1.124	0.36
125_F	283_I	1.119	0.36
72_L	130_M	1.119	0.36
389_N	441_V	1.117	0.36
195_F	398_L	1.116	0.36
15_V	18_A	1.114	0.36
196_A	416_A	1.112	0.36
400_A	427_E	1.109	0.36
49_V	410_V	1.106	0.36
17_V	266_P	1.106	0.36
144_L	166_C	1.104	0.35
245_F	441_V	1.100	0.35
211_M	439_G	1.098	0.35
130_M	152_M	1.097	0.35
35_G	326_G	1.089	0.35
199_T	256_G	1.087	0.35
22_I	68_V	1.087	0.35
326_G	425_P	1.086	0.35
175_A	180_D	1.085	0.35
16_G	233_L	1.085	0.35
131_S	406_T	1.082	0.34
107_S	155_V	1.079	0.34
187_A	320_A	1.076	0.34
215_H	218_W	1.074	0.34
8_L	12_V	1.074	0.34
11_V	37_L	1.073	0.34
118_L	239_T	1.072	0.34
38_L	326_G	1.072	0.34
419_G	436_V	1.070	0.34
259_I	265_G	1.066	0.34
133_A	180_D	1.065	0.34
105_L	283_I	1.064	0.34
58_G	358_T	1.059	0.33
283_I	349_I	1.058	0.33
172_I	403_L	1.057	0.33
110_L	252_T	1.052	0.33
15_V	237_E	1.052	0.33
72_L	146_A	1.051	0.33
276_I	295_V	1.050	0.33
8_L	231_E	1.039	0.32
48_K	335_S	1.037	0.32
119_L	199_T	1.033	0.32
209_I	283_I	1.033	0.32
78_D	333_I	1.031	0.32
9_I	172_I	1.030	0.32
125_F	213_I	1.028	0.32
89_F	139_G	1.027	0.32
197_F	201_L	1.020	0.31
152_M	157_I	1.019	0.31
189_E	281_A	1.016	0.31
422_K	430_K	1.014	0.31
65_V	279_L	1.013	0.31
212_A	354_L	1.013	0.31
194_D	213_I	1.007	0.31
16_G	441_V	1.001	0.31
316_L	369_N	0.998	0.30
194_D	248_I	0.994	0.30
59_Y	62_T	0.981	0.30
329_T	387_G	0.980	0.30
367_S	375_F	0.977	0.30
147_T	432_T	0.973	0.29
79_L	139_G	0.973	0.29
108_K	224_K	0.972	0.29
183_L	417_V	0.970	0.29
320_A	365_T	0.969	0.29
90_A	324_A	0.968	0.29
291_N	295_V	0.966	0.29
111_Q	255_I	0.966	0.29
312_N	320_A	0.964	0.29
161_A	223_D	0.960	0.29
179_G	429_V	0.953	0.29
315_M	320_A	0.953	0.29
128_C	178_S	0.950	0.28
239_T	384_H	0.950	0.28
371_P	411_S	0.948	0.28
400_A	407_L	0.945	0.28
156_G	352_L	0.945	0.28
213_I	231_E	0.945	0.28
363_V	439_G	0.942	0.28
276_I	428_V	0.938	0.28
39_L	322_V	0.934	0.28
25_Y	110_L	0.934	0.28
320_A	410_V	0.932	0.28
12_V	283_I	0.931	0.28
132_L	356_I	0.927	0.27
57_T	159_R	0.927	0.27
121_I	181_V	0.927	0.27
27_A	382_L	0.927	0.27
187_A	295_V	0.926	0.27
46_G	49_V	0.925	0.27
277_C	386_S	0.924	0.27
32_F	414_V	0.923	0.27
87_C	142_V	0.921	0.27
82_M	420_M	0.921	0.27
131_S	172_I	0.921	0.27
165_I	213_I	0.920	0.27
361_A	365_T	0.920	0.27
221_Y	256_G	0.919	0.27
108_K	111_Q	0.918	0.27
318_V	412_G	0.912	0.27
174_L	412_G	0.912	0.27
144_L	432_T	0.906	0.27
112_Y	225_K	0.900	0.26
384_H	426_F	0.899	0.26
175_A	402_N	0.898	0.26
254_I	320_A	0.898	0.26
164_A	168_S	0.896	0.26
180_D	376_V	0.896	0.26
221_Y	260_F	0.889	0.26
232_M	235_V	0.886	0.26
106_A	121_I	0.886	0.26
218_W	221_Y	0.886	0.26
27_A	142_V	0.885	0.26
129_L	186_Q	0.883	0.26
133_A	321_G	0.878	0.25
292_T	296_F	0.878	0.25
414_V	418_A	0.876	0.25
353_V	410_V	0.873	0.25
316_L	359_M	0.871	0.25
145_M	320_A	0.869	0.25
8_L	32_F	0.869	0.25
66_E	189_E	0.868	0.25
158_S	414_V	0.868	0.25
79_L	376_V	0.865	0.25
325_Q	328_S	0.863	0.25
149_F	277_C	0.862	0.25
177_T	180_D	0.861	0.25
109_P	158_S	0.860	0.25
83_I	89_F	0.860	0.25
272_T	352_L	0.858	0.25
119_L	155_V	0.857	0.25
313_V	424_S	0.856	0.25
270_I	371_P	0.855	0.24
283_I	348_I	0.854	0.24
103_V	400_A	0.853	0.24
329_T	411_S	0.852	0.24
151_V	347_S	0.852	0.24
151_V	441_V	0.852	0.24
378_M	397_M	0.851	0.24
22_I	428_V	0.848	0.24
148_L	245_F	0.848	0.24
361_A	410_V	0.846	0.24
157_I	406_T	0.845	0.24
103_V	401_S	0.843	0.24
77_G	334_Q	0.843	0.24
10_G	304_R	0.841	0.24
97_G	219_Q	0.840	0.24
202_P	205_I	0.839	0.24
104_K	242_A	0.836	0.24
280_I	449_L	0.834	0.24
135_S	398_L	0.833	0.24
155_V	315_M	0.832	0.24
405_R	408_S	0.831	0.24
208_I	211_M	0.830	0.24
414_V	429_V	0.830	0.24
193_I	386_S	0.828	0.23
209_I	395_I	0.828	0.23
174_L	178_S	0.827	0.23
148_L	281_A	0.826	0.23
173_I	403_L	0.824	0.23
37_L	188_S	0.824	0.23
161_A	165_I	0.824	0.23
80_G	98_A	0.823	0.23
317_L	418_A	0.819	0.23
42_S	97_G	0.818	0.23
386_S	399_Q	0.817	0.23
169_P	175_A	0.816	0.23
80_G	316_L	0.812	0.23
175_A	178_S	0.811	0.23
293_Q	424_S	0.808	0.23
126_V	292_T	0.804	0.23
22_I	163_A	0.803	0.23
213_I	338_S	0.803	0.23
131_S	218_W	0.802	0.22
172_I	178_S	0.802	0.22
140_L	402_N	0.799	0.22
314_V	416_A	0.799	0.22
186_Q	267_Q	0.798	0.22
310_F	398_L	0.797	0.22
204_S	218_W	0.797	0.22
33_V	418_A	0.795	0.22
21_I	410_V	0.795	0.22
24_G	254_I	0.795	0.22
163_A	417_V	0.793	0.22
274_L	370_A	0.792	0.22
18_A	21_I	0.791	0.22
190_M	199_T	0.787	0.22
88_G	320_A	0.787	0.22
420_M	428_V	0.781	0.22
80_G	314_V	0.779	0.22
94_T	154_N	0.777	0.22
82_M	145_M	0.777	0.22
369_N	380_P	0.773	0.21
129_L	252_T	0.772	0.21
42_S	332_F	0.772	0.21
102_V	273_I	0.772	0.21
149_F	163_A	0.771	0.21
268_L	276_I	0.769	0.21
359_M	363_V	0.768	0.21
128_C	173_I	0.768	0.21
69_K	339_I	0.767	0.21
207_A	392_Y	0.767	0.21
57_T	357_L	0.766	0.21
139_G	375_F	0.765	0.21
89_F	377_E	0.765	0.21
94_T	413_V	0.765	0.21
323_F	421_A	0.765	0.21
127_A	254_I	0.763	0.21
285_E	289_S	0.763	0.21
105_L	109_P	0.762	0.21
192_L	328_S	0.762	0.21
180_D	374_A	0.758	0.21
224_K	227_H	0.756	0.21
215_H	223_D	0.755	0.21
424_S	445_V	0.755	0.21
87_C	257_V	0.755	0.21
125_F	212_A	0.755	0.21
198_K	275_V	0.753	0.21
252_T	276_I	0.751	0.21
37_L	205_I	0.748	0.21
350_L	410_V	0.747	0.21
38_L	330_I	0.747	0.21
229_S	445_V	0.747	0.21
135_S	168_S	0.745	0.20
313_V	360_L	0.745	0.20
160_G	303_Y	0.743	0.20
189_E	357_L	0.742	0.20
231_E	234_D	0.742	0.20
83_I	137_A	0.739	0.20
107_S	119_L	0.737	0.20
158_S	166_C	0.734	0.20
268_L	427_E	0.734	0.20
11_V	442_I	0.734	0.20
29_G	332_F	0.733	0.20
21_I	340_A	0.731	0.20
79_L	169_P	0.730	0.20
120_M	168_S	0.727	0.20
11_V	228_I	0.726	0.20
231_E	236_S	0.724	0.20
90_A	365_T	0.724	0.20
57_T	295_V	0.724	0.20
227_H	333_I	0.723	0.20
90_A	381_K	0.722	0.20
124_Y	310_F	0.720	0.20
208_I	212_A	0.720	0.20
63_D	68_V	0.719	0.20
102_V	175_A	0.718	0.20
12_V	226_E	0.717	0.20
315_M	427_E	0.716	0.19
89_F	415_V	0.716	0.19
178_S	196_A	0.714	0.19
80_G	84_M	0.713	0.19
383_A	425_P	0.712	0.19
183_L	376_V	0.711	0.19
121_I	155_V	0.711	0.19
16_G	34_G	0.711	0.19
194_D	211_M	0.711	0.19
268_L	361_A	0.709	0.19
320_A	411_S	0.709	0.19
21_I	206_A	0.707	0.19
386_S	393_L	0.707	0.19
58_G	397_M	0.707	0.19
204_S	213_I	0.707	0.19
73_M	79_L	0.704	0.19
304_R	311_A	0.700	0.19
146_A	358_T	0.698	0.19
80_G	373_Y	0.697	0.19
119_L	146_A	0.694	0.19
94_T	157_I	0.690	0.19
29_G	299_L	0.690	0.19
285_E	435_P	0.690	0.19
316_L	367_S	0.689	0.19
151_V	161_A	0.689	0.19
121_I	394_T	0.688	0.19
79_L	133_A	0.686	0.19
140_L	301_V	0.685	0.18
116_P	380_P	0.684	0.18
18_A	327_L	0.684	0.18
32_F	319_A	0.684	0.18
164_A	320_A	0.684	0.18
102_V	402_N	0.682	0.18
32_F	353_V	0.681	0.18
191_S	262_G	0.680	0.18
352_L	448_E	0.679	0.18
31_L	316_L	0.678	0.18
7_L	234_D	0.678	0.18
160_G	423_I	0.678	0.18
128_C	174_L	0.676	0.18
26_S	313_V	0.675	0.18
77_G	134_V	0.675	0.18
256_G	280_I	0.673	0.18
268_L	277_C	0.672	0.18
217_F	360_L	0.671	0.18
138_T	303_Y	0.671	0.18
8_L	205_I	0.671	0.18
348_I	356_I	0.670	0.18
368_G	405_R	0.669	0.18
10_G	319_A	0.667	0.18
20_Y	388_I	0.665	0.18
118_L	194_D	0.662	0.18
143_L	260_F	0.661	0.18
281_A	360_L	0.660	0.18
112_Y	290_F	0.658	0.18
102_V	177_T	0.658	0.18
314_V	352_L	0.657	0.18
139_G	143_L	0.657	0.18
142_V	273_I	0.657	0.18
80_G	249_L	0.656	0.18
113_I	330_I	0.653	0.17
41_I	198_K	0.653	0.17
255_I	407_L	0.653	0.17
248_I	265_G	0.652	0.17
281_A	284_L	0.651	0.17
255_I	384_H	0.649	0.17
59_Y	321_G	0.649	0.17
72_L	142_V	0.647	0.17
291_N	360_L	0.646	0.17
124_Y	215_H	0.644	0.17
13_V	126_V	0.644	0.17
154_N	373_Y	0.643	0.17
173_I	410_V	0.643	0.17
284_L	393_L	0.642	0.17
178_S	181_V	0.642	0.17
142_V	180_D	0.642	0.17
14_I	235_V	0.639	0.17
142_V	146_A	0.639	0.17
85_M	417_V	0.638	0.17
135_S	258_L	0.637	0.17
11_V	353_V	0.637	0.17
195_F	395_I	0.636	0.17
226_E	430_K	0.636	0.17
287_L	291_N	0.635	0.17
311_A	319_A	0.635	0.17
92_Y	96_I	0.635	0.17
313_V	351_M	0.634	0.17
177_T	404_G	0.633	0.17
193_I	258_L	0.630	0.17
371_P	415_V	0.630	0.17
85_M	323_F	0.630	0.17
413_V	443_V	0.630	0.17
26_S	39_L	0.629	0.17
344_G	394_T	0.628	0.17
86_L	403_L	0.628	0.17
157_I	439_G	0.627	0.17
297_S	449_L	0.626	0.17
36_L	74_S	0.625	0.17
140_L	260_F	0.624	0.17
86_L	180_D	0.622	0.17
137_A	169_P	0.621	0.17
158_S	222_L	0.621	0.17
80_G	246_Y	0.621	0.17
99_N	358_T	0.621	0.17
27_A	71_L	0.620	0.16
290_F	307_A	0.617	0.16
35_G	375_F	0.617	0.16
189_E	232_M	0.617	0.16
24_G	251_F	0.616	0.16
21_I	254_I	0.616	0.16
214_A	218_W	0.615	0.16
20_Y	378_M	0.615	0.16
19_R	37_L	0.614	0.16
44_I	248_I	0.613	0.16
339_I	406_T	0.613	0.16
187_A	284_L	0.612	0.16
99_N	121_I	0.612	0.16
212_A	216_F	0.612	0.16
125_F	209_I	0.611	0.16
324_A	365_T	0.609	0.16
96_I	103_V	0.608	0.16
41_I	233_L	0.606	0.16
217_F	441_V	0.606	0.16
59_Y	411_S	0.606	0.16
225_K	333_I	0.606	0.16
320_A	371_P	0.605	0.16
90_A	429_V	0.605	0.16
209_I	241_T	0.605	0.16
145_M	420_M	0.603	0.16
91_A	171_A	0.603	0.16
28_T	274_L	0.603	0.16
368_G	374_A	0.603	0.16
179_G	208_I	0.602	0.16
332_F	344_G	0.600	0.16
258_L	327_L	0.598	0.16
332_F	447_T	0.598	0.16
42_S	164_A	0.597	0.16
22_I	129_L	0.597	0.16
8_L	20_Y	0.596	0.16
279_L	283_I	0.596	0.16
36_L	111_Q	0.590	0.16
133_A	369_N	0.589	0.16
210_G	214_A	0.589	0.16
199_T	266_P	0.588	0.16
328_S	432_T	0.587	0.16
430_K	433_S	0.583	0.15
102_V	421_A	0.582	0.15
308_D	410_V	0.581	0.15
112_Y	231_E	0.581	0.15
202_P	209_I	0.580	0.15
254_I	395_I	0.579	0.15
10_G	352_L	0.579	0.15
124_Y	314_V	0.579	0.15
213_I	335_S	0.578	0.15
180_D	196_A	0.578	0.15
258_L	438_V	0.574	0.15
21_I	373_Y	0.574	0.15
315_M	345_S	0.573	0.15
128_C	398_L	0.572	0.15
81_M	126_V	0.572	0.15
25_Y	30_V	0.570	0.15
23_K	441_V	0.570	0.15
68_V	322_V	0.570	0.15
399_Q	411_S	0.568	0.15
61_A	189_E	0.567	0.15
166_C	195_F	0.565	0.15
13_V	17_V	0.564	0.15
163_A	416_A	0.563	0.15
155_V	401_S	0.563	0.15
39_L	168_S	0.562	0.15
117_Y	220_R	0.561	0.15
17_V	388_I	0.561	0.15
284_L	288_R	0.561	0.15
120_M	181_V	0.560	0.15
168_S	432_T	0.560	0.15
31_L	162_A	0.559	0.15
34_G	85_M	0.555	0.15
101_M	116_P	0.555	0.15
254_I	358_T	0.554	0.15
36_L	411_S	0.554	0.15
133_A	149_F	0.553	0.15
127_A	144_L	0.552	0.15
84_M	243_P	0.550	0.15
24_G	227_H	0.549	0.15
359_M	374_A	0.549	0.15
222_L	226_E	0.549	0.15
31_L	305_G	0.548	0.15
286_F	291_N	0.548	0.15
323_F	418_A	0.548	0.15
231_E	437_L	0.547	0.14
181_V	362_A	0.546	0.14
233_L	239_T	0.543	0.14
139_G	326_G	0.542	0.14
131_S	137_A	0.542	0.14
167_A	414_V	0.541	0.14
192_L	277_C	0.540	0.14
170_A	432_T	0.540	0.14
184_A	372_F	0.540	0.14
9_I	258_L	0.540	0.14
309_A	377_E	0.539	0.14
347_S	393_L	0.539	0.14
157_I	319_A	0.538	0.14
130_M	140_L	0.537	0.14
18_A	186_Q	0.537	0.14
318_V	362_A	0.535	0.14
191_S	233_L	0.533	0.14
91_A	206_A	0.533	0.14
90_A	126_V	0.532	0.14
186_Q	285_E	0.532	0.14
374_A	393_L	0.531	0.14
329_T	377_E	0.531	0.14
356_I	445_V	0.530	0.14
229_S	233_L	0.529	0.14
285_E	432_T	0.528	0.14
174_L	177_T	0.528	0.14
216_F	219_Q	0.527	0.14
96_I	143_L	0.526	0.14
233_L	284_L	0.525	0.14
245_F	283_I	0.525	0.14
67_Y	301_V	0.524	0.14
237_E	297_S	0.524	0.14
173_I	178_S	0.523	0.14
90_A	142_V	0.523	0.14
153_V	350_L	0.522	0.14
66_E	70_I	0.522	0.14
163_A	180_D	0.522	0.14
191_S	293_Q	0.522	0.14
327_L	419_G	0.521	0.14
41_I	424_S	0.520	0.14
27_A	320_A	0.520	0.14
388_I	430_K	0.519	0.14
20_Y	110_L	0.519	0.14
155_V	363_V	0.519	0.14
376_V	394_T	0.518	0.14
82_M	357_L	0.518	0.14
212_A	219_Q	0.517	0.14
210_G	213_I	0.515	0.14
14_I	322_V	0.515	0.14
192_L	283_I	0.515	0.14
365_T	393_L	0.515	0.14
17_V	437_L	0.515	0.14
17_V	415_V	0.514	0.14
85_M	333_I	0.514	0.14
86_L	102_V	0.513	0.14
245_F	338_S	0.513	0.14
377_E	419_G	0.512	0.14
80_G	117_Y	0.512	0.14
76_G	252_T	0.511	0.14
141_G	281_A	0.510	0.14
44_I	294_K	0.508	0.13
310_F	404_G	0.508	0.13
211_M	214_A	0.507	0.13
206_A	418_A	0.506	0.13
8_L	16_G	0.506	0.13
367_S	370_A	0.506	0.13
120_M	131_S	0.506	0.13
9_I	294_K	0.506	0.13
71_L	321_G	0.501	0.13
137_A	399_Q	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4f35D	2	0.8633	100	0.833	Contact Map
4r1iA	2	0.9371	99.9	0.838	Contact Map
4r0cA	3	0.9349	99.9	0.844	Contact Map
2kv5A	1	0.0716	12.3	0.983	Contact Map
3giaA	1	0.4642	11.7	0.983	Contact Map
2kncA	1	0.115	10.4	0.984	Contact Map
1jb0K	1	0.0846	7.9	0.984	Contact Map
4ikvA	1	0.397	7.7	0.985	Contact Map
4dx5A	3	0.3427	7.3	0.985	Contact Map
2qi9A	2	0.4382	7.2	0.985	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0117 seconds.