LDCI - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

LDCI - Lysine decarboxylase, inducible

UniProt:	P0A9H3	Sequences: MNVIAILNHMGVYFKEEPIRELHRALERLNFQIVYPNDRDDLLKLIENNARLCGVIFDWDKYNLELCEEISKMNENLPLYAFANTYSTLDVSLNDLRLQISFFEYALGAAEDIANKIKQTTDEYINTILPPLTKALFKYVREGKYTFCTPGHMGGTAFQKSPVGSLFYDFFGPNTMKSDISISVSELGSLLDHSGPHKEAEQYIARVFNADRSYMVTNGTSTANKIVGMYSAPAGSTILIDRNCHKSLTHLMMMSDVTPIYFRPTRNAYGILGGIPQSEFQHATIAKRVKETPNATWPVHAVITNSTYDGLLYNTDFIKKTLDVKSIHFDSAWVPYTNFSPIYEGKCGMSGGRVEGKVIYETQSTHKLLAAFSQASMIHVKGDVNEETFNEAYMMHTTTSPHYGIVASTETAAAMMKGNAGKRLINGSIERAIKFRKEIKRLRTESDGWFFDVWQPDHIDTTECWPLRSDSTWHGFKNIDNEHMYLDPIKVTLLTPGMEKDGTMSDFGIPASIVAKYLDEHGIVVEKTGPYNLLFLFSIGIDKTKALSLLRALTDFKRAFDLNLRVKNMLPSLYREDPEFYENMRIQELAQNIHKLIVHHNLPDLMYRAFEVLPTMVMTPYAAFQKELHGMTEEVYLDEMVGRINANMILPYPPGVPLVMPGEMITEESRPVLEFLQMLCEIGAHYPGFETDIHGAYRQADGRYTVKVLKEESKK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10131
Length:	715 (669)
Sequences:	637 (278)
Seq/√Len:	10.7

ECOLI - LDCI DCLZ ADIA DCOS DCOR

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
633_E	643_R	7.569	1.00
626_K	631_M	7.204	1.00
559_A	564_L	5.780	1.00
213_S	379_H	5.739	1.00
232_A	257_V	5.645	1.00
563_N	588_E	5.448	1.00
468_R	471_S	5.341	1.00
149_T	181_S	5.318	1.00
375_A	408_S	4.861	1.00
171_F	178_S	4.846	1.00
133_T	410_E	4.667	1.00
80_Y	120_T	4.638	1.00
149_T	183_S	4.245	0.99
205_A	210_A	4.192	0.99
348_G	361_E	3.988	0.99
67_C	79_L	3.860	0.99
565_R	568_N	3.840	0.99
517_Y	555_D	3.796	0.99
322_L	326_S	3.584	0.98
220_T	362_T	3.554	0.98
563_N	585_R	3.537	0.98
432_A	537_F	3.533	0.98
615_T	664_M	3.264	0.96
226_I	397_T	2.977	0.94
636_Y	639_E	2.857	0.92
627_E	656_V	2.825	0.92
53_C	121_T	2.765	0.91
580_F	592_N	2.763	0.91
491_V	537_F	2.760	0.91
187_L	389_F	2.741	0.91
322_L	325_K	2.729	0.90
585_R	588_E	2.720	0.90
638_D	677_Q	2.672	0.89
227_V	360_Y	2.575	0.88
148_C	395_M	2.522	0.86
632_T	646_A	2.516	0.86
203_Y	207_V	2.484	0.85
181_S	527_K	2.470	0.85
149_T	182_I	2.411	0.84
509_I	560_F	2.401	0.83
214_Y	386_E	2.391	0.83
67_C	389_F	2.391	0.83
157_A	416_M	2.350	0.82
167_F	408_S	2.315	0.81
250_H	396_H	2.296	0.80
203_Y	206_R	2.292	0.80
200_A	215_M	2.287	0.80
466_P	482_E	2.268	0.80
217_T	405_I	2.253	0.79
360_Y	389_F	2.200	0.77
197_H	406_V	2.194	0.77
196_P	232_A	2.181	0.77
226_I	550_L	2.179	0.77
521_H	555_D	2.179	0.77
531_Y	594_H	2.131	0.75
465_W	475_G	2.125	0.75
237_T	298_P	2.119	0.75
153_M	181_S	2.113	0.74
435_F	537_F	2.101	0.74
192_D	692_D	2.096	0.74
215_M	409_T	2.075	0.73
234_A	625_Q	2.059	0.72
178_S	628_L	2.047	0.72
252_M	327_I	2.035	0.71
204_I	215_M	2.030	0.71
110_A	114_A	2.003	0.70
601_N	604_D	1.992	0.70
207_V	417_K	1.989	0.70
117_I	285_I	1.987	0.70
196_P	509_I	1.928	0.67
376_S	652_Y	1.924	0.67
225_K	250_H	1.889	0.66
574_Y	578_P	1.887	0.65
175_T	372_F	1.884	0.65
103_F	117_I	1.860	0.64
175_T	404_G	1.849	0.64
223_A	656_V	1.838	0.63
183_S	526_E	1.835	0.63
227_V	257_V	1.828	0.63
220_T	225_K	1.817	0.62
249_T	660_M	1.783	0.61
373_S	401_P	1.774	0.60
439_I	553_L	1.766	0.60
133_T	137_F	1.749	0.59
149_T	306_S	1.746	0.59
130_P	336_Y	1.729	0.58
453_V	458_H	1.713	0.58
287_K	291_E	1.709	0.57
567_K	583_N	1.708	0.57
203_Y	417_K	1.703	0.57
275_I	303_I	1.701	0.57
148_C	181_S	1.701	0.57
139_Y	149_T	1.700	0.57
371_A	377_M	1.692	0.57
165_S	169_D	1.679	0.56
187_L	415_M	1.673	0.56
147_F	274_G	1.672	0.56
191_L	218_N	1.670	0.56
206_R	417_K	1.658	0.55
187_L	197_H	1.650	0.55
173_P	177_K	1.648	0.55
445_E	561_D	1.645	0.54
234_A	621_Y	1.642	0.54
566_V	580_F	1.620	0.53
148_C	180_I	1.611	0.53
674_E	677_Q	1.603	0.52
398_T	692_D	1.602	0.52
206_R	521_H	1.598	0.52
346_K	462_T	1.592	0.52
393_Y	572_S	1.575	0.51
469_S	481_N	1.571	0.51
40_D	48_N	1.567	0.51
237_T	289_V	1.559	0.50
151_G	376_S	1.556	0.50
435_F	491_V	1.555	0.50
412_A	535_F	1.546	0.50
599_H	685_H	1.543	0.50
517_Y	521_H	1.533	0.49
222_T	360_Y	1.521	0.49
471_S	506_D	1.507	0.48
149_T	153_M	1.504	0.48
482_E	506_D	1.504	0.48
314_N	482_E	1.501	0.48
267_N	476_F	1.496	0.47
115_N	143_G	1.489	0.47
604_D	608_R	1.483	0.47
435_F	540_G	1.481	0.47
153_M	183_S	1.474	0.46
143_G	233_P	1.474	0.46
241_D	307_T	1.469	0.46
198_K	202_Q	1.468	0.46
218_N	374_Q	1.467	0.46
170_F	174_N	1.462	0.46
170_F	178_S	1.458	0.46
54_G	80_Y	1.456	0.45
57_F	66_L	1.456	0.45
453_V	492_T	1.449	0.45
349_M	375_A	1.446	0.45
517_Y	559_A	1.437	0.45
218_N	222_T	1.436	0.45
238_I	252_M	1.436	0.45
77_L	626_K	1.431	0.44
157_A	370_A	1.421	0.44
641_V	667_E	1.421	0.44
136_L	407_A	1.416	0.44
171_F	388_T	1.410	0.43
468_R	481_N	1.402	0.43
431_R	546_A	1.399	0.43
247_S	651_P	1.394	0.43
255_S	621_Y	1.392	0.42
171_F	360_Y	1.388	0.42
408_S	674_E	1.386	0.42
141_R	468_R	1.384	0.42
204_I	213_S	1.381	0.42
282_H	286_A	1.379	0.42
455_Q	459_I	1.374	0.42
149_T	527_K	1.369	0.41
340_S	425_I	1.369	0.41
306_S	694_H	1.367	0.41
274_G	331_S	1.365	0.41
331_S	334_V	1.363	0.41
226_I	378_I	1.358	0.41
148_C	153_M	1.344	0.40
378_I	589_L	1.341	0.40
71_S	98_L	1.337	0.40
506_D	598_V	1.336	0.40
363_Q	519_D	1.335	0.40
223_A	553_L	1.332	0.40
398_T	526_E	1.332	0.40
450_F	455_Q	1.325	0.39
225_K	396_H	1.321	0.39
231_S	384_V	1.318	0.39
492_T	532_N	1.314	0.39
240_I	249_T	1.309	0.39
233_P	629_H	1.307	0.39
157_A	491_V	1.306	0.39
206_R	617_V	1.300	0.38
212_R	386_E	1.292	0.38
171_F	363_Q	1.288	0.38
156_T	389_F	1.287	0.38
33_I	65_E	1.285	0.38
184_V	527_K	1.283	0.38
499_E	505_S	1.283	0.38
664_M	668_E	1.279	0.37
499_E	586_I	1.274	0.37
253_M	600_H	1.272	0.37
617_V	664_M	1.269	0.37
138_K	638_D	1.267	0.37
299_V	538_S	1.265	0.37
68_E	98_L	1.259	0.36
163_V	210_A	1.259	0.36
305_N	371_A	1.259	0.36
267_N	497_G	1.258	0.36
287_K	290_K	1.253	0.36
269_Y	544_T	1.252	0.36
222_T	627_E	1.250	0.36
74_N	157_A	1.249	0.36
181_S	534_L	1.242	0.36
305_N	377_M	1.240	0.36
584_M	592_N	1.237	0.35
439_I	501_D	1.235	0.35
221_S	250_H	1.223	0.35
316_D	345_G	1.221	0.35
250_H	395_M	1.217	0.35
505_S	622_A	1.208	0.34
184_V	465_W	1.205	0.34
225_K	249_T	1.200	0.34
204_I	256_D	1.196	0.34
667_E	674_E	1.196	0.34
167_F	171_F	1.190	0.33
55_V	642_G	1.190	0.33
175_T	509_I	1.184	0.33
53_C	56_I	1.183	0.33
40_D	43_L	1.177	0.33
624_F	628_L	1.176	0.33
261_Y	394_M	1.175	0.33
240_I	292_T	1.172	0.33
545_K	614_P	1.171	0.33
368_L	489_I	1.168	0.33
122_D	701_D	1.168	0.33
372_F	402_H	1.158	0.32
666_T	672_V	1.156	0.32
207_V	223_A	1.146	0.32
221_S	401_P	1.142	0.31
283_A	470_D	1.136	0.31
171_F	206_R	1.134	0.31
151_G	652_Y	1.132	0.31
161_S	391_E	1.130	0.31
38_D	363_Q	1.128	0.31
132_L	200_A	1.125	0.31
80_Y	646_A	1.125	0.31
544_T	553_L	1.124	0.31
635_V	673_L	1.124	0.31
149_T	189_S	1.122	0.31
189_S	305_N	1.117	0.30
139_Y	393_Y	1.110	0.30
341_P	531_Y	1.108	0.30
450_F	459_I	1.105	0.30
181_S	184_V	1.104	0.30
157_A	432_A	1.101	0.30
148_C	183_S	1.094	0.30
181_S	185_S	1.091	0.29
301_A	610_F	1.088	0.29
89_L	103_F	1.085	0.29
373_S	545_K	1.085	0.29
64_L	83_A	1.080	0.29
139_Y	280_F	1.079	0.29
376_S	651_P	1.079	0.29
216_V	397_T	1.078	0.29
377_M	409_T	1.075	0.29
597_I	606_M	1.073	0.29
238_I	450_F	1.072	0.29
666_T	674_E	1.072	0.29
160_K	560_F	1.070	0.29
175_T	359_I	1.069	0.29
618_M	626_K	1.066	0.28
148_C	312_L	1.066	0.28
139_Y	220_T	1.065	0.28
240_I	492_T	1.065	0.28
42_L	45_L	1.064	0.28
151_G	272_L	1.059	0.28
427_G	430_E	1.059	0.28
528_T	660_M	1.057	0.28
596_L	658_L	1.056	0.28
591_Q	595_K	1.055	0.28
236_S	299_V	1.054	0.28
250_H	275_I	1.054	0.28
426_N	644_I	1.054	0.28
331_S	346_K	1.050	0.28
255_S	640_M	1.048	0.28
178_S	300_H	1.046	0.28
288_R	291_E	1.046	0.28
341_P	487_D	1.045	0.28
574_Y	577_D	1.042	0.28
372_F	519_D	1.040	0.27
205_A	689_F	1.040	0.27
298_P	432_A	1.035	0.27
324_V	357_K	1.032	0.27
283_A	579_E	1.032	0.27
139_Y	191_L	1.028	0.27
150_P	490_K	1.027	0.27
191_L	399_T	1.026	0.27
220_T	253_M	1.023	0.27
201_E	231_S	1.019	0.27
40_D	461_T	1.018	0.27
254_M	285_I	1.017	0.27
459_I	481_N	1.017	0.27
269_Y	320_K	1.015	0.27
226_I	238_I	1.013	0.26
101_S	107_L	1.012	0.26
290_K	599_H	1.011	0.26
410_E	502_G	1.010	0.26
83_A	91_V	1.007	0.26
57_F	81_A	1.006	0.26
453_V	464_C	1.004	0.26
200_A	409_T	1.003	0.26
135_A	369_L	1.000	0.26
412_A	635_V	0.998	0.26
176_M	427_G	0.997	0.26
64_L	98_L	0.996	0.26
314_N	632_T	0.992	0.26
543_K	547_L	0.990	0.26
325_K	357_K	0.989	0.26
231_S	360_Y	0.984	0.25
363_Q	379_H	0.982	0.25
122_D	503_T	0.981	0.25
149_T	184_V	0.980	0.25
331_S	337_T	0.979	0.25
48_N	51_R	0.975	0.25
133_T	682_I	0.973	0.25
689_F	692_D	0.972	0.25
175_T	402_H	0.972	0.25
181_S	377_M	0.971	0.25
285_I	289_V	0.971	0.25
132_L	303_I	0.967	0.25
401_P	421_G	0.967	0.25
33_I	493_L	0.966	0.25
439_I	554_T	0.965	0.25
223_A	413_A	0.965	0.25
409_T	529_G	0.964	0.25
276_P	486_L	0.963	0.25
272_L	376_S	0.962	0.25
109_A	112_D	0.961	0.25
68_E	94_N	0.960	0.25
208_F	369_L	0.958	0.24
132_L	220_T	0.957	0.24
536_L	545_K	0.956	0.24
237_T	276_P	0.955	0.24
97_R	141_R	0.954	0.24
285_I	318_I	0.954	0.24
486_L	603_P	0.954	0.24
180_I	483_H	0.947	0.24
192_D	304_T	0.946	0.24
551_R	554_T	0.945	0.24
276_P	660_M	0.943	0.24
262_F	280_F	0.942	0.24
312_L	596_L	0.940	0.24
260_I	659_V	0.940	0.24
131_P	421_G	0.940	0.24
191_L	216_V	0.937	0.24
109_A	548_S	0.936	0.24
589_L	689_F	0.935	0.24
112_D	154_G	0.932	0.24
233_P	640_M	0.932	0.24
463_E	579_E	0.930	0.23
94_N	126_N	0.929	0.23
149_T	311_L	0.928	0.23
409_T	691_T	0.926	0.23
225_K	398_T	0.924	0.23
291_E	631_M	0.924	0.23
340_S	648_M	0.924	0.23
430_E	622_A	0.922	0.23
534_L	661_P	0.921	0.23
429_I	489_I	0.920	0.23
392_A	651_P	0.920	0.23
371_A	412_A	0.915	0.23
79_L	627_E	0.914	0.23
513_I	590_A	0.913	0.23
57_F	405_I	0.910	0.23
596_L	600_H	0.909	0.23
189_S	371_A	0.908	0.23
250_H	657_P	0.908	0.23
101_S	128_I	0.906	0.23
183_S	483_H	0.906	0.23
190_L	688_G	0.906	0.23
512_S	673_L	0.905	0.23
335_P	377_M	0.905	0.23
167_F	311_L	0.902	0.23
679_L	683_G	0.901	0.23
224_N	652_Y	0.901	0.23
528_T	602_L	0.900	0.22
590_A	594_H	0.898	0.22
252_M	315_T	0.896	0.22
221_S	396_H	0.895	0.22
55_V	562_L	0.894	0.22
314_N	462_T	0.893	0.22
207_V	413_A	0.893	0.22
69_E	77_L	0.888	0.22
291_E	641_V	0.887	0.22
243_N	371_A	0.887	0.22
506_D	685_H	0.887	0.22
80_Y	303_I	0.886	0.22
253_M	393_Y	0.885	0.22
200_A	223_A	0.883	0.22
176_M	526_E	0.881	0.22
111_E	433_I	0.879	0.22
176_M	340_S	0.879	0.22
149_T	694_H	0.877	0.22
253_M	639_E	0.877	0.22
176_M	525_V	0.877	0.22
311_L	484_M	0.876	0.22
190_L	511_A	0.876	0.22
523_I	644_I	0.876	0.22
115_N	180_I	0.876	0.22
221_S	395_M	0.875	0.22
267_N	370_A	0.874	0.22
262_F	275_I	0.873	0.22
618_M	623_A	0.873	0.22
340_S	361_E	0.869	0.21
79_L	223_A	0.868	0.21
72_K	562_L	0.867	0.21
228_G	384_V	0.867	0.21
115_N	148_C	0.866	0.21
240_I	244_C	0.864	0.21
65_E	439_I	0.864	0.21
103_F	127_T	0.864	0.21
84_N	637_L	0.863	0.21
57_F	470_D	0.860	0.21
473_W	623_A	0.860	0.21
529_G	594_H	0.860	0.21
564_L	576_E	0.860	0.21
101_S	215_M	0.860	0.21
202_Q	260_I	0.859	0.21
528_T	560_F	0.858	0.21
218_N	391_E	0.857	0.21
161_S	218_N	0.856	0.21
497_G	581_Y	0.855	0.21
615_T	674_E	0.854	0.21
551_R	558_R	0.852	0.21
209_N	331_S	0.852	0.21
278_S	284_T	0.851	0.21
398_T	527_K	0.851	0.21
176_M	684_A	0.849	0.21
335_P	623_A	0.848	0.21
227_V	238_I	0.847	0.21
72_K	95_D	0.847	0.21
506_D	575_R	0.847	0.21
372_F	389_F	0.846	0.21
264_P	369_L	0.844	0.21
331_S	485_Y	0.842	0.21
365_T	377_M	0.840	0.21
244_C	304_T	0.840	0.21
200_A	527_K	0.840	0.21
432_A	543_K	0.840	0.21
220_T	652_Y	0.837	0.20
394_M	403_Y	0.836	0.20
82_F	411_T	0.835	0.20
92_S	95_D	0.834	0.20
32_Q	36_P	0.833	0.20
258_T	656_V	0.832	0.20
421_G	487_D	0.832	0.20
178_S	254_M	0.831	0.20
283_A	287_K	0.827	0.20
476_F	497_G	0.827	0.20
213_S	645_N	0.827	0.20
277_Q	354_V	0.826	0.20
211_D	450_F	0.826	0.20
532_N	678_M	0.823	0.20
231_S	300_H	0.822	0.20
271_I	552_A	0.822	0.20
497_G	508_G	0.821	0.20
562_L	674_E	0.821	0.20
84_N	174_N	0.820	0.20
493_L	604_D	0.819	0.20
279_E	288_R	0.818	0.20
222_T	398_T	0.818	0.20
377_M	455_Q	0.816	0.20
92_S	101_S	0.814	0.20
291_E	398_T	0.812	0.20
114_A	438_E	0.812	0.20
435_F	486_L	0.811	0.20
209_N	338_N	0.811	0.20
555_D	558_R	0.811	0.20
181_S	305_N	0.811	0.20
267_N	474_H	0.807	0.20
132_L	204_I	0.807	0.20
218_N	527_K	0.807	0.20
225_K	238_I	0.805	0.19
314_N	392_A	0.805	0.19
38_D	57_F	0.805	0.19
67_C	360_Y	0.799	0.19
138_K	206_R	0.797	0.19
144_K	372_F	0.797	0.19
302_V	692_D	0.796	0.19
71_S	94_N	0.795	0.19
225_K	657_P	0.793	0.19
496_P	581_Y	0.792	0.19
589_L	645_N	0.792	0.19
277_Q	480_D	0.791	0.19
147_F	331_S	0.791	0.19
575_R	608_R	0.791	0.19
67_C	95_D	0.790	0.19
79_L	199_E	0.790	0.19
327_I	359_I	0.789	0.19
531_Y	535_F	0.788	0.19
465_W	474_H	0.786	0.19
182_I	660_M	0.785	0.19
171_F	673_L	0.782	0.19
306_S	391_E	0.780	0.19
489_I	657_P	0.780	0.19
133_T	215_M	0.779	0.19
257_V	678_M	0.777	0.19
66_L	76_N	0.777	0.19
514_V	533_L	0.777	0.19
539_I	597_I	0.776	0.19
304_T	337_T	0.776	0.19
359_I	637_L	0.776	0.19
182_I	262_F	0.775	0.19
505_S	518_L	0.774	0.19
215_M	300_H	0.771	0.18
449_W	557_K	0.771	0.18
148_C	525_V	0.767	0.18
183_S	527_K	0.767	0.18
268_A	659_V	0.766	0.18
96_L	632_T	0.765	0.18
42_L	209_N	0.762	0.18
280_F	372_F	0.761	0.18
60_D	360_Y	0.761	0.18
150_P	695_G	0.761	0.18
302_V	559_A	0.761	0.18
344_E	586_I	0.761	0.18
77_L	181_S	0.759	0.18
34_V	286_A	0.758	0.18
247_S	392_A	0.757	0.18
540_G	560_F	0.757	0.18
186_E	285_I	0.755	0.18
52_L	66_L	0.754	0.18
444_T	561_D	0.752	0.18
140_V	394_M	0.752	0.18
170_F	651_P	0.751	0.18
196_P	693_I	0.750	0.18
431_R	537_F	0.750	0.18
575_R	701_D	0.747	0.18
209_N	511_A	0.745	0.18
558_R	589_L	0.745	0.18
597_I	602_L	0.744	0.18
119_Q	554_T	0.743	0.18
247_S	652_Y	0.742	0.18
182_I	305_N	0.741	0.18
36_P	211_D	0.740	0.18
262_F	570_L	0.739	0.18
163_V	411_T	0.737	0.18
96_L	99_Q	0.736	0.18
69_E	608_R	0.736	0.18
137_F	517_Y	0.734	0.17
34_V	61_K	0.732	0.17
344_E	470_D	0.731	0.17
190_L	410_E	0.731	0.17
481_N	578_P	0.730	0.17
57_F	84_N	0.730	0.17
248_L	302_V	0.729	0.17
311_L	532_N	0.727	0.17
465_W	514_V	0.727	0.17
392_A	679_L	0.726	0.17
289_V	517_Y	0.725	0.17
233_P	702_G	0.724	0.17
296_T	324_V	0.723	0.17
240_I	298_P	0.723	0.17
213_S	405_I	0.722	0.17
292_T	616_M	0.721	0.17
398_T	495_T	0.721	0.17
82_F	103_F	0.720	0.17
523_I	674_E	0.720	0.17
506_D	700_A	0.720	0.17
221_S	373_S	0.720	0.17
170_F	407_A	0.719	0.17
374_Q	527_K	0.719	0.17
218_N	225_K	0.718	0.17
82_F	114_A	0.717	0.17
291_E	314_N	0.716	0.17
139_Y	181_S	0.716	0.17
139_Y	153_M	0.716	0.17
132_L	215_M	0.715	0.17
43_L	583_N	0.714	0.17
272_L	652_Y	0.713	0.17
202_Q	565_R	0.713	0.17
60_D	105_Y	0.712	0.17
374_Q	511_A	0.711	0.17
304_T	657_P	0.710	0.17
49_N	482_E	0.708	0.17
520_E	644_I	0.707	0.17
147_F	347_C	0.707	0.17
300_H	527_K	0.706	0.17
428_S	465_W	0.706	0.17
199_E	570_L	0.706	0.17
305_N	648_M	0.706	0.17
553_L	659_V	0.705	0.17
114_A	285_I	0.705	0.17
331_S	361_E	0.704	0.17
178_S	483_H	0.703	0.17
94_N	481_N	0.703	0.17
57_F	680_C	0.703	0.17
55_V	77_L	0.702	0.17
163_V	290_K	0.700	0.17
527_K	694_H	0.700	0.17
128_I	163_V	0.700	0.17
153_M	650_L	0.700	0.17
566_V	686_Y	0.699	0.17
59_W	609_A	0.699	0.17
139_Y	372_F	0.697	0.16
217_T	254_M	0.696	0.16
79_L	175_T	0.696	0.16
206_R	604_D	0.696	0.16
206_R	420_A	0.695	0.16
175_T	427_G	0.694	0.16
612_V	615_T	0.691	0.16
566_V	574_Y	0.691	0.16
401_P	410_E	0.690	0.16
290_K	355_E	0.690	0.16
56_I	103_F	0.690	0.16
320_K	471_S	0.689	0.16
418_G	478_N	0.688	0.16
171_F	498_M	0.688	0.16
346_K	484_M	0.686	0.16
430_E	434_K	0.685	0.16
171_F	600_H	0.684	0.16
84_N	562_L	0.684	0.16
125_I	280_F	0.683	0.16
526_E	694_H	0.683	0.16
279_E	343_Y	0.683	0.16
499_E	640_M	0.682	0.16
454_W	458_H	0.681	0.16
180_I	228_G	0.680	0.16
50_A	235_G	0.679	0.16
213_S	335_P	0.679	0.16
230_Y	378_I	0.678	0.16
158_F	514_V	0.678	0.16
196_P	255_S	0.677	0.16
288_R	389_F	0.677	0.16
497_G	620_P	0.676	0.16
198_K	553_L	0.676	0.16
473_W	476_F	0.675	0.16
143_G	383_D	0.675	0.16
38_D	408_S	0.674	0.16
184_V	694_H	0.672	0.16
55_V	674_E	0.672	0.16
235_G	619_T	0.672	0.16
184_V	306_S	0.672	0.16
184_V	526_E	0.671	0.16
254_M	389_F	0.671	0.16
524_V	649_I	0.671	0.16
421_G	424_L	0.669	0.16
369_L	540_G	0.668	0.16
108_G	112_D	0.668	0.16
373_S	614_P	0.667	0.16
115_N	198_K	0.666	0.16
618_M	622_A	0.665	0.16
363_Q	403_Y	0.665	0.16
659_V	676_L	0.665	0.16
217_T	491_V	0.663	0.16
84_N	95_D	0.663	0.16
174_N	220_T	0.663	0.16
270_G	465_W	0.663	0.16
450_F	456_P	0.662	0.16
379_H	511_A	0.661	0.16
149_T	526_E	0.660	0.16
342_I	485_Y	0.660	0.16
303_I	515_A	0.660	0.16
274_G	484_M	0.659	0.15
146_T	208_F	0.659	0.15
378_I	389_F	0.657	0.15
447_D	626_K	0.657	0.15
571_P	581_Y	0.656	0.15
161_S	661_P	0.654	0.15
344_E	441_R	0.653	0.15
318_I	533_L	0.652	0.15
32_Q	37_N	0.651	0.15
146_T	646_A	0.650	0.15
358_V	425_I	0.650	0.15
211_D	651_P	0.649	0.15
446_S	463_E	0.649	0.15
271_I	486_L	0.649	0.15
148_C	406_V	0.648	0.15
285_I	531_Y	0.648	0.15
152_H	536_L	0.647	0.15
171_F	554_T	0.647	0.15
203_Y	410_E	0.647	0.15
235_G	258_T	0.647	0.15
522_G	559_A	0.647	0.15
138_K	202_Q	0.646	0.15
185_S	533_L	0.646	0.15
152_H	695_G	0.645	0.15
44_K	57_F	0.645	0.15
135_A	613_L	0.645	0.15
76_N	79_L	0.644	0.15
379_H	614_P	0.643	0.15
371_A	425_I	0.643	0.15
183_S	694_H	0.643	0.15
372_F	379_H	0.643	0.15
187_L	196_P	0.641	0.15
190_L	313_Y	0.641	0.15
101_S	527_K	0.640	0.15
436_R	473_W	0.639	0.15
621_Y	625_Q	0.639	0.15
362_T	374_Q	0.639	0.15
438_E	550_L	0.639	0.15
562_L	642_G	0.639	0.15
391_E	398_T	0.638	0.15
619_T	639_E	0.638	0.15
252_M	606_M	0.638	0.15
225_K	280_F	0.637	0.15
388_T	627_E	0.637	0.15
435_F	546_A	0.637	0.15
199_E	417_K	0.635	0.15
384_V	559_A	0.635	0.15
182_I	185_S	0.635	0.15
374_Q	532_N	0.634	0.15
82_F	562_L	0.633	0.15
553_L	586_I	0.632	0.15
381_K	437_K	0.632	0.15
148_C	197_H	0.632	0.15
223_A	471_S	0.631	0.15
77_L	141_R	0.630	0.15
223_A	234_A	0.629	0.15
516_K	529_G	0.629	0.15
147_F	656_V	0.628	0.15
192_D	398_T	0.627	0.15
428_S	692_D	0.626	0.15
244_C	337_T	0.626	0.15
306_S	334_V	0.626	0.15
198_K	482_E	0.625	0.15
387_E	697_Y	0.625	0.15
148_C	192_D	0.624	0.15
371_A	538_S	0.624	0.15
218_N	661_P	0.624	0.15
186_E	248_L	0.623	0.15
91_V	550_L	0.623	0.15
218_N	398_T	0.623	0.15
55_V	202_Q	0.622	0.15
578_P	582_E	0.622	0.15
111_E	523_I	0.622	0.15
439_I	568_N	0.621	0.15
285_I	674_E	0.621	0.15
103_F	125_I	0.621	0.15
59_W	84_N	0.620	0.15
298_P	532_N	0.620	0.15
249_T	657_P	0.619	0.15
302_V	336_Y	0.618	0.15
92_S	287_K	0.618	0.15
153_M	371_A	0.617	0.14
221_S	225_K	0.616	0.14
380_V	446_S	0.614	0.14
317_F	320_K	0.614	0.14
171_F	176_M	0.614	0.14
228_G	249_T	0.614	0.14
153_M	184_V	0.612	0.14
248_L	672_V	0.611	0.14
251_L	300_H	0.610	0.14
275_I	399_T	0.608	0.14
425_I	648_M	0.608	0.14
160_K	569_M	0.606	0.14
210_A	570_L	0.606	0.14
492_T	594_H	0.605	0.14
365_T	416_M	0.604	0.14
299_V	597_I	0.604	0.14
318_I	691_T	0.604	0.14
182_I	538_S	0.604	0.14
131_P	401_P	0.604	0.14
157_A	449_W	0.604	0.14
224_N	651_P	0.604	0.14
509_I	616_M	0.603	0.14
254_M	628_L	0.603	0.14
192_D	314_N	0.603	0.14
59_W	82_F	0.602	0.14
194_S	398_T	0.602	0.14
396_H	657_P	0.601	0.14
57_F	226_I	0.600	0.14
177_K	541_I	0.600	0.14
154_G	373_S	0.600	0.14
49_N	83_A	0.600	0.14
45_L	67_C	0.599	0.14
517_Y	672_V	0.599	0.14
43_L	49_N	0.598	0.14
221_S	421_G	0.598	0.14
470_D	477_K	0.597	0.14
148_C	694_H	0.597	0.14
306_S	395_M	0.596	0.14
362_T	523_I	0.596	0.14
89_L	92_S	0.595	0.14
225_K	397_T	0.595	0.14
291_E	342_I	0.595	0.14
201_E	560_F	0.595	0.14
527_K	534_L	0.594	0.14
162_P	496_P	0.594	0.14
141_R	289_V	0.593	0.14
70_I	438_E	0.593	0.14
229_M	254_M	0.593	0.14
271_I	563_N	0.591	0.14
393_Y	650_L	0.590	0.14
301_A	689_F	0.589	0.14
91_V	430_E	0.589	0.14
348_G	659_V	0.589	0.14
58_D	91_V	0.588	0.14
499_E	506_D	0.588	0.14
139_Y	144_K	0.588	0.14
340_S	350_S	0.588	0.14
635_V	640_M	0.587	0.14
226_I	635_V	0.587	0.14
683_G	691_T	0.586	0.14
112_D	115_N	0.585	0.14
278_S	288_R	0.585	0.14
190_L	374_Q	0.584	0.14
190_L	526_E	0.584	0.14
305_N	336_Y	0.584	0.14
104_E	125_I	0.583	0.14
334_V	337_T	0.582	0.14
55_V	68_E	0.581	0.14
154_G	415_M	0.581	0.14
377_M	434_K	0.580	0.14
57_F	90_D	0.580	0.14
259_P	370_A	0.579	0.14
99_Q	289_V	0.578	0.14
291_E	643_R	0.578	0.14
136_L	631_M	0.578	0.14
312_L	417_K	0.578	0.14
237_T	532_N	0.578	0.14
513_I	703_R	0.578	0.14
112_D	173_P	0.577	0.14
216_V	586_I	0.576	0.14
44_K	67_C	0.575	0.14
97_R	601_N	0.575	0.14
316_D	448_G	0.574	0.13
482_E	583_N	0.574	0.13
186_E	509_I	0.574	0.13
134_K	206_R	0.574	0.13
221_S	369_L	0.574	0.13
187_L	680_C	0.572	0.13
375_A	522_G	0.571	0.13
181_S	189_S	0.571	0.13
461_T	472_T	0.571	0.13
133_T	213_S	0.571	0.13
239_L	386_E	0.570	0.13
399_T	421_G	0.570	0.13
221_S	424_L	0.570	0.13
243_N	381_K	0.570	0.13
481_N	667_E	0.569	0.13
116_K	528_T	0.569	0.13
191_L	652_Y	0.569	0.13
181_S	526_E	0.568	0.13
657_P	678_M	0.568	0.13
227_V	312_L	0.567	0.13
141_R	586_I	0.567	0.13
42_L	52_L	0.566	0.13
45_L	48_N	0.565	0.13
656_V	659_V	0.565	0.13
663_E	695_G	0.565	0.13
365_T	379_H	0.564	0.13
234_A	628_L	0.564	0.13
148_C	527_K	0.564	0.13
187_L	344_E	0.562	0.13
285_I	293_P	0.562	0.13
288_R	657_P	0.562	0.13
52_L	644_I	0.561	0.13
390_N	675_F	0.561	0.13
492_T	664_M	0.561	0.13
498_M	593_I	0.561	0.13
394_M	646_A	0.561	0.13
154_G	395_M	0.560	0.13
180_I	183_S	0.560	0.13
224_N	247_S	0.559	0.13
138_K	411_T	0.559	0.13
318_I	532_N	0.558	0.13
431_R	491_V	0.558	0.13
230_Y	382_G	0.558	0.13
191_L	225_K	0.557	0.13
244_C	657_P	0.557	0.13
135_A	395_M	0.555	0.13
360_Y	384_V	0.555	0.13
285_I	660_M	0.555	0.13
239_L	689_F	0.554	0.13
232_A	678_M	0.554	0.13
379_H	678_M	0.554	0.13
271_I	298_P	0.553	0.13
288_R	572_S	0.553	0.13
368_L	412_A	0.552	0.13
189_S	244_C	0.552	0.13
338_N	381_K	0.551	0.13
493_L	554_T	0.551	0.13
426_N	430_E	0.549	0.13
198_K	644_I	0.549	0.13
534_L	688_G	0.549	0.13
596_L	602_L	0.549	0.13
84_N	103_F	0.548	0.13
265_T	605_L	0.548	0.13
81_A	95_D	0.547	0.13
282_H	297_W	0.547	0.13
496_P	508_G	0.546	0.13
218_N	382_G	0.546	0.13
394_M	573_L	0.545	0.13
556_F	620_P	0.545	0.13
328_H	560_F	0.545	0.13
36_P	94_N	0.545	0.13
393_Y	636_Y	0.544	0.13
316_D	319_K	0.544	0.13
302_V	640_M	0.544	0.13
329_F	623_A	0.543	0.13
440_K	541_I	0.543	0.13
306_S	331_S	0.543	0.13
121_T	211_D	0.542	0.13
154_G	312_L	0.542	0.13
396_H	646_A	0.542	0.13
221_S	657_P	0.542	0.13
408_S	477_K	0.541	0.13
622_A	668_E	0.541	0.13
91_V	96_L	0.541	0.13
209_N	343_Y	0.541	0.13
180_I	395_M	0.540	0.13
167_F	609_A	0.538	0.13
213_S	377_M	0.538	0.13
142_E	160_K	0.537	0.13
328_H	432_A	0.537	0.13
418_G	422_K	0.537	0.13
342_I	437_K	0.535	0.13
181_S	200_A	0.535	0.13
491_V	546_A	0.535	0.13
61_K	65_E	0.535	0.13
88_T	575_R	0.534	0.13
152_H	164_G	0.533	0.13
183_S	428_S	0.533	0.13
426_N	433_I	0.533	0.13
174_N	623_A	0.533	0.13
215_M	527_K	0.533	0.13
446_S	449_W	0.533	0.13
59_W	63_N	0.532	0.13
480_D	673_L	0.532	0.13
179_D	270_G	0.532	0.13
152_H	179_D	0.532	0.13
216_V	421_G	0.531	0.13
429_I	485_Y	0.530	0.13
194_S	610_F	0.530	0.13
635_V	643_R	0.530	0.13
186_E	222_T	0.530	0.13
216_V	222_T	0.529	0.13
150_P	164_G	0.528	0.13
442_L	680_C	0.528	0.13
91_V	137_F	0.528	0.13
108_G	147_F	0.528	0.13
160_K	512_S	0.528	0.13
295_A	320_K	0.528	0.13
136_L	329_F	0.527	0.12
275_I	623_A	0.527	0.12
427_G	617_V	0.527	0.12
306_S	527_K	0.527	0.12
227_V	553_L	0.526	0.12
185_S	484_M	0.526	0.12
461_T	532_N	0.526	0.12
396_H	421_G	0.526	0.12
477_K	482_E	0.526	0.12
91_V	398_T	0.525	0.12
164_G	270_G	0.525	0.12
664_M	693_I	0.525	0.12
267_N	403_Y	0.525	0.12
279_E	311_L	0.524	0.12
206_R	615_T	0.524	0.12
79_L	633_E	0.524	0.12
44_K	69_E	0.523	0.12
444_T	481_N	0.522	0.12
497_G	594_H	0.522	0.12
393_Y	433_I	0.521	0.12
174_N	651_P	0.521	0.12
213_S	410_E	0.521	0.12
455_Q	606_M	0.521	0.12
648_M	661_P	0.520	0.12
68_E	122_D	0.520	0.12
113_I	555_D	0.520	0.12
372_F	437_K	0.520	0.12
69_E	72_K	0.519	0.12
441_R	583_N	0.519	0.12
183_S	226_I	0.519	0.12
228_G	257_V	0.518	0.12
206_R	460_D	0.518	0.12
104_E	113_I	0.518	0.12
447_D	450_F	0.516	0.12
452_D	458_H	0.516	0.12
101_S	110_A	0.515	0.12
49_N	63_N	0.514	0.12
298_P	368_L	0.514	0.12
134_K	638_D	0.514	0.12
70_I	103_F	0.514	0.12
408_S	644_I	0.513	0.12
176_M	274_G	0.512	0.12
451_F	456_P	0.512	0.12
531_Y	648_M	0.512	0.12
77_L	575_R	0.512	0.12
604_D	622_A	0.511	0.12
250_H	258_T	0.511	0.12
303_I	629_H	0.511	0.12
240_I	532_N	0.511	0.12
246_K	451_F	0.511	0.12
65_E	644_I	0.510	0.12
237_T	271_I	0.510	0.12
462_T	482_E	0.510	0.12
482_E	512_S	0.509	0.12
78_P	581_Y	0.508	0.12
599_H	701_D	0.508	0.12
256_D	382_G	0.507	0.12
140_V	217_T	0.507	0.12
337_T	361_E	0.507	0.12
127_T	577_D	0.507	0.12
656_V	680_C	0.506	0.12
70_I	385_N	0.506	0.12
433_I	643_R	0.505	0.12
267_N	473_W	0.504	0.12
277_Q	482_E	0.504	0.12
314_N	625_Q	0.503	0.12
163_V	233_P	0.503	0.12
169_D	438_E	0.502	0.12
183_S	373_S	0.502	0.12
201_E	537_F	0.502	0.12
102_F	521_H	0.501	0.12
271_I	635_V	0.501	0.12
517_Y	526_E	0.501	0.12
287_K	595_K	0.500	0.12
700_A	703_R	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2vycA	5	0.993	100	0.519	Contact Map
3n75A	4	0.9944	100	0.539	Contact Map
1c4kA	2	0.9566	100	0.554	Contact Map
2x3lA	2	0.5832	100	0.744	Contact Map
4q6rA	2	0.5636	100	0.886	Contact Map
3mc6A	2	0.5399	100	0.896	Contact Map
4w8iA	2	0.4867	99.9	0.921	Contact Map
3bc8A	3	0.5804	99.8	0.933	Contact Map
3hl2A	3	0.5748	99.8	0.935	Contact Map
1iayA	2	0.5259	99.8	0.937	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0167 seconds.