TNAA - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

TNAA - Tryptophanase

UniProt:	P0A853	Sequences: MENFKHLPEPFRIRVIEPVKRTTRAYREEAIIKSGMNPFLLDSEDVFIDLLTDSGTGAVTQSMQAAMMRGDEAYSGSRSYYALAESVKNIFGYQYTIPTHQGRGAEQIYIPVLIKKREQEKGLDRSKMVAFSNYFFDTTQGHSQINGCTVRNVYIKEAFDTGVRYDFKGNFDLEGLERGIEEVGPNNVPYIVATITSNSAGGQPVSLANLKAMYSIAKKYDIPVVMDSARFAENAYFIKQREAEYKDWTIEQITRETYKYADMLAMSAKKDAMVPMGGLLCMKDDSFFDVYTECRTLCVVQEGFPTYGGLEGGAMERLAVGLYDGMNLDWLAYRIAQVQYLVDGLEEIGVVCQQAGGHAAFVDAGKLLPHIPADQFPAQALACELYKVAGIRAVEIGSFLLGRDPKTGKQLPCPAELLRLTIPRATYTQTHMDFIIEAFKHVKENAANIKGLTFTYEPKVLRHFTAKLKEV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG11005
Length:	471 (451)
Sequences:	478 (278)
Seq/√Len:	13.1

ECOLI - TNAA
HALSA - TNAA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
453_T	469_K	6.455	1.00
191_I	217_A	6.132	1.00
214_Y	218_K	5.749	1.00
66_A	320_V	5.373	1.00
389_A	438_A	4.172	1.00
177_E	219_K	4.067	1.00
180_I	184_G	3.841	0.99
11_F	333_Y	3.816	0.99
225_V	263_M	3.779	0.99
94_Q	283_K	3.747	0.99
208_A	212_A	3.711	0.99
207_L	245_Y	3.622	0.99
443_K	446_A	3.504	0.99
118_E	189_P	3.387	0.98
180_I	222_I	3.330	0.98
367_L	446_A	3.146	0.98
31_I	387_K	3.106	0.97
31_I	383_C	3.086	0.97
155_I	165_Y	3.079	0.97
177_E	181_E	3.047	0.97
131_F	189_P	3.008	0.97
38_P	382_A	2.910	0.96
86_S	323_Y	2.868	0.96
195_I	257_T	2.772	0.95
240_Q	339_Q	2.762	0.95
248_W	252_Q	2.709	0.94
193_A	210_L	2.696	0.94
13_I	428_T	2.608	0.93
24_R	28_E	2.603	0.93
89_N	323_Y	2.592	0.92
173_L	216_I	2.567	0.92
341_L	436_I	2.541	0.92
244_E	248_W	2.508	0.91
156_K	175_G	2.490	0.91
115_K	118_E	2.483	0.91
384_E	445_N	2.402	0.89
164_R	353_Q	2.401	0.89
207_L	238_I	2.399	0.89
342_V	355_A	2.353	0.88
367_L	443_K	2.347	0.88
245_Y	248_W	2.315	0.87
130_A	189_P	2.312	0.87
239_K	328_L	2.277	0.86
144_Q	150_V	2.265	0.86
243_A	246_K	2.261	0.86
346_E	353_Q	2.247	0.86
43_S	73_A	2.230	0.85
107_Q	146_N	2.170	0.84
33_K	45_D	2.106	0.82
346_E	351_V	2.071	0.80
66_A	79_S	2.069	0.80
35_G	467_K	2.028	0.79
276_M	311_E	2.025	0.79
14_R	17_E	2.004	0.78
339_Q	343_D	1.993	0.78
212_A	215_S	1.955	0.76
376_F	410_Q	1.936	0.76
239_K	253_I	1.913	0.75
211_K	256_E	1.910	0.75
8_P	434_F	1.890	0.74
245_Y	256_E	1.864	0.73
62_S	69_R	1.858	0.72
221_D	350_V	1.858	0.72
398_S	416_E	1.821	0.71
399_F	468_L	1.820	0.71
42_D	45_D	1.788	0.69
362_V	439_F	1.760	0.68
396_I	400_L	1.750	0.68
344_G	433_D	1.724	0.67
140_Q	152_N	1.690	0.65
256_E	259_K	1.673	0.64
228_S	258_Y	1.665	0.64
348_I	440_K	1.656	0.63
310_L	315_M	1.643	0.63
95_Y	285_D	1.601	0.61
64_Q	275_P	1.597	0.60
79_S	320_V	1.591	0.60
355_A	360_A	1.590	0.60
9_E	13_I	1.585	0.60
131_F	179_G	1.580	0.60
79_S	82_A	1.575	0.59
137_D	463_H	1.569	0.59
59_V	275_P	1.563	0.59
173_L	212_A	1.546	0.58
180_I	188_V	1.545	0.58
237_F	357_G	1.540	0.57
118_E	187_N	1.532	0.57
235_A	257_T	1.529	0.57
66_A	274_V	1.529	0.57
238_I	257_T	1.524	0.57
440_K	444_E	1.522	0.57
157_E	170_N	1.519	0.56
23_T	26_Y	1.514	0.56
59_V	317_R	1.506	0.56
30_A	41_L	1.483	0.55
178_R	182_E	1.470	0.54
87_V	96_T	1.468	0.54
184_G	222_I	1.459	0.53
36_M	470_E	1.454	0.53
210_L	214_Y	1.438	0.52
110_I	190_Y	1.433	0.52
82_A	316_E	1.408	0.51
232_A	254_T	1.395	0.50
171_F	216_I	1.393	0.50
232_A	331_L	1.390	0.50
141_G	300_V	1.362	0.48
275_P	317_R	1.361	0.48
66_A	82_A	1.360	0.48
93_Y	261_A	1.349	0.48
284_D	287_F	1.348	0.47
275_P	314_A	1.339	0.47
180_I	185_P	1.337	0.47
38_P	393_A	1.333	0.47
112_V	294_C	1.330	0.47
39_F	51_L	1.316	0.46
30_A	45_D	1.312	0.46
161_T	366_K	1.306	0.45
129_V	151_R	1.285	0.44
140_Q	197_S	1.267	0.43
368_L	380_A	1.266	0.43
90_I	180_I	1.262	0.43
57_G	426_T	1.254	0.43
350_V	439_F	1.248	0.42
249_T	252_Q	1.238	0.42
80_Y	84_A	1.237	0.42
59_V	64_Q	1.225	0.41
250_I	254_T	1.217	0.41
97_I	104_G	1.214	0.41
44_E	78_R	1.212	0.40
77_S	426_T	1.212	0.40
62_S	320_V	1.211	0.40
274_V	318_L	1.208	0.40
258_Y	272_A	1.207	0.40
42_D	81_Y	1.195	0.40
180_I	216_I	1.194	0.40
129_V	183_V	1.186	0.39
142_H	301_Q	1.178	0.39
177_E	220_Y	1.171	0.38
131_F	143_S	1.170	0.38
160_D	366_K	1.167	0.38
272_A	325_G	1.163	0.38
10_P	13_I	1.163	0.38
137_D	194_T	1.160	0.38
60_T	425_A	1.159	0.38
232_A	272_A	1.148	0.37
393_A	420_L	1.145	0.37
441_H	444_E	1.144	0.37
382_A	418_L	1.144	0.37
88_K	94_Q	1.140	0.37
83_L	291_Y	1.138	0.37
207_L	257_T	1.137	0.37
108_I	297_L	1.136	0.37
221_D	349_G	1.134	0.37
167_F	280_L	1.131	0.36
231_F	254_T	1.127	0.36
183_V	189_P	1.124	0.36
226_M	261_A	1.122	0.36
132_S	229_A	1.119	0.36
95_Y	291_Y	1.109	0.35
144_Q	402_G	1.108	0.35
268_A	318_L	1.107	0.35
9_E	430_T	1.103	0.35
29_E	33_K	1.101	0.35
388_V	445_N	1.100	0.35
114_I	148_C	1.099	0.35
250_I	326_M	1.098	0.35
118_E	131_F	1.096	0.35
91_F	326_M	1.094	0.35
11_F	465_T	1.091	0.34
94_Q	285_D	1.087	0.34
66_A	316_E	1.083	0.34
72_E	312_G	1.075	0.34
129_V	179_G	1.070	0.34
64_Q	314_A	1.065	0.33
396_I	463_H	1.060	0.33
210_L	213_M	1.058	0.33
188_V	215_S	1.057	0.33
455_T	469_K	1.055	0.33
403_R	457_E	1.053	0.33
404_D	407_T	1.049	0.33
210_L	224_V	1.044	0.32
32_I	246_K	1.036	0.32
87_V	281_C	1.035	0.32
29_E	32_I	1.033	0.32
445_N	448_N	1.031	0.32
435_I	439_F	1.026	0.31
391_I	394_V	1.020	0.31
22_T	30_A	1.014	0.31
194_T	231_F	1.013	0.31
73_A	141_G	1.009	0.31
429_Q	433_D	1.003	0.30
344_G	437_E	1.002	0.30
276_M	310_L	0.995	0.30
313_G	317_R	0.992	0.30
110_I	463_H	0.991	0.30
135_F	192_V	0.990	0.30
238_I	265_A	0.988	0.30
364_A	381_L	0.987	0.30
200_A	401_L	0.984	0.30
167_F	242_E	0.981	0.29
254_T	272_A	0.980	0.29
191_I	222_I	0.973	0.29
456_Y	467_K	0.971	0.29
271_D	334_R	0.970	0.29
362_V	418_L	0.967	0.29
180_I	183_V	0.965	0.29
109_Y	265_A	0.961	0.29
107_Q	301_Q	0.961	0.29
336_A	429_Q	0.958	0.28
194_T	463_H	0.958	0.28
57_G	273_M	0.955	0.28
132_S	143_S	0.953	0.28
439_F	446_A	0.950	0.28
340_Y	433_D	0.949	0.28
305_P	402_G	0.947	0.28
173_L	213_M	0.942	0.28
222_I	433_D	0.942	0.28
41_L	45_D	0.937	0.28
252_Q	329_D	0.936	0.28
207_L	244_E	0.936	0.28
380_A	449_I	0.931	0.27
228_S	264_L	0.929	0.27
378_A	403_R	0.928	0.27
9_E	428_T	0.926	0.27
363_D	366_K	0.923	0.27
373_A	412_P	0.922	0.27
29_E	185_P	0.920	0.27
344_G	436_I	0.919	0.27
275_P	313_G	0.917	0.27
383_C	389_A	0.916	0.27
243_A	339_Q	0.915	0.27
174_E	219_K	0.914	0.27
400_L	463_H	0.913	0.27
233_E	334_R	0.908	0.26
350_V	393_A	0.906	0.26
170_N	208_A	0.905	0.26
223_P	391_I	0.905	0.26
108_I	468_L	0.904	0.26
372_P	375_Q	0.904	0.26
439_F	442_V	0.902	0.26
255_R	323_Y	0.900	0.26
86_S	272_A	0.898	0.26
385_L	418_L	0.896	0.26
256_E	260_Y	0.896	0.26
187_N	249_T	0.892	0.26
211_K	244_E	0.887	0.26
137_D	396_I	0.886	0.26
214_Y	224_V	0.886	0.26
305_P	465_T	0.883	0.25
214_Y	260_Y	0.878	0.25
207_L	259_K	0.875	0.25
250_I	332_A	0.875	0.25
404_D	409_K	0.874	0.25
207_L	256_E	0.873	0.25
332_A	453_T	0.873	0.25
17_E	70_G	0.872	0.25
238_I	245_Y	0.868	0.25
434_F	438_A	0.866	0.25
236_Y	345_L	0.864	0.25
35_G	456_Y	0.863	0.25
28_E	387_K	0.863	0.25
208_A	246_K	0.859	0.24
362_V	385_L	0.857	0.24
389_A	434_F	0.854	0.24
129_V	180_I	0.849	0.24
135_F	143_S	0.847	0.24
135_F	150_V	0.846	0.24
211_K	245_Y	0.846	0.24
171_F	193_A	0.845	0.24
44_E	285_D	0.843	0.24
299_V	421_T	0.841	0.24
90_I	323_Y	0.838	0.24
83_L	96_T	0.836	0.24
190_Y	224_V	0.836	0.24
422_I	435_I	0.836	0.24
185_P	447_A	0.836	0.24
14_R	70_G	0.836	0.24
22_T	390_G	0.831	0.23
304_F	398_S	0.829	0.23
368_L	449_I	0.821	0.23
184_G	188_V	0.818	0.23
154_Y	158_A	0.817	0.23
331_L	335_I	0.816	0.23
190_Y	193_A	0.814	0.23
82_A	86_S	0.813	0.23
22_T	26_Y	0.811	0.23
15_V	160_D	0.810	0.23
336_A	343_D	0.806	0.22
230_R	271_D	0.805	0.22
254_T	258_Y	0.801	0.22
107_Q	142_H	0.801	0.22
207_L	248_W	0.800	0.22
91_F	258_Y	0.800	0.22
8_P	337_Q	0.799	0.22
208_A	243_A	0.799	0.22
422_I	432_M	0.790	0.22
23_T	391_I	0.788	0.22
28_E	32_I	0.788	0.22
195_I	224_V	0.787	0.22
230_R	358_H	0.785	0.22
84_A	295_R	0.784	0.22
422_I	440_K	0.783	0.22
43_S	235_A	0.781	0.22
239_K	252_Q	0.780	0.22
65_A	79_S	0.777	0.21
311_E	314_A	0.777	0.21
104_G	452_L	0.777	0.21
395_E	418_L	0.776	0.21
108_I	434_F	0.772	0.21
9_E	340_Y	0.771	0.21
129_V	188_V	0.767	0.21
230_R	334_R	0.767	0.21
114_I	190_Y	0.766	0.21
215_S	444_E	0.766	0.21
80_Y	391_I	0.765	0.21
8_P	47_F	0.764	0.21
92_G	436_I	0.762	0.21
268_A	396_I	0.759	0.21
115_K	224_V	0.759	0.21
295_R	449_I	0.758	0.21
360_A	391_I	0.757	0.21
95_Y	336_A	0.757	0.21
235_A	254_T	0.757	0.21
243_A	468_L	0.755	0.21
294_C	426_T	0.755	0.21
59_V	313_G	0.751	0.21
273_M	276_M	0.750	0.20
214_Y	217_A	0.749	0.20
64_Q	313_G	0.748	0.20
253_I	357_G	0.747	0.20
15_V	67_M	0.747	0.20
60_T	324_D	0.746	0.20
291_Y	295_R	0.745	0.20
117_R	418_L	0.745	0.20
384_E	387_K	0.743	0.20
40_L	180_I	0.743	0.20
367_L	447_A	0.741	0.20
57_G	217_A	0.740	0.20
250_I	331_L	0.737	0.20
385_L	439_F	0.736	0.20
188_V	223_P	0.736	0.20
76_G	364_A	0.735	0.20
362_V	449_I	0.733	0.20
199_S	463_H	0.731	0.20
99_T	238_I	0.731	0.20
79_S	421_T	0.730	0.20
135_F	153_V	0.730	0.20
210_L	260_Y	0.729	0.20
259_K	283_K	0.727	0.20
7_L	11_F	0.725	0.20
273_M	330_W	0.724	0.20
199_S	396_I	0.723	0.20
83_L	97_I	0.722	0.20
151_R	422_I	0.721	0.19
229_A	318_L	0.720	0.19
137_D	394_V	0.718	0.19
379_Q	399_F	0.718	0.19
93_Y	465_T	0.718	0.19
364_A	370_H	0.718	0.19
81_Y	85_E	0.717	0.19
90_I	326_M	0.716	0.19
134_Y	434_F	0.716	0.19
264_L	281_C	0.714	0.19
194_T	197_S	0.713	0.19
35_G	213_M	0.712	0.19
13_I	17_E	0.711	0.19
211_K	249_T	0.711	0.19
207_L	347_E	0.708	0.19
137_D	199_S	0.708	0.19
197_S	224_V	0.707	0.19
49_D	54_S	0.707	0.19
24_R	388_V	0.705	0.19
56_T	217_A	0.705	0.19
228_S	418_L	0.704	0.19
224_V	261_A	0.704	0.19
371_I	449_I	0.703	0.19
64_Q	68_M	0.702	0.19
196_T	233_E	0.701	0.19
31_I	445_N	0.701	0.19
110_I	396_I	0.701	0.19
401_L	410_Q	0.700	0.19
285_D	449_I	0.699	0.19
40_L	467_K	0.699	0.19
359_A	368_L	0.699	0.19
12_R	21_R	0.698	0.19
388_V	438_A	0.698	0.19
258_Y	330_W	0.698	0.19
244_E	366_K	0.697	0.19
413_C	454_F	0.697	0.19
369_P	447_A	0.696	0.19
436_I	440_K	0.695	0.19
342_V	360_A	0.695	0.19
49_D	53_D	0.694	0.19
66_A	365_G	0.694	0.19
200_A	361_F	0.694	0.19
97_I	291_Y	0.691	0.19
143_S	190_Y	0.689	0.18
9_E	14_R	0.688	0.18
43_S	382_A	0.687	0.18
157_E	165_Y	0.687	0.18
311_E	386_Y	0.687	0.18
229_A	394_V	0.687	0.18
32_I	453_T	0.687	0.18
135_F	304_F	0.686	0.18
254_T	326_M	0.685	0.18
380_A	411_L	0.684	0.18
148_C	173_L	0.683	0.18
205_V	330_W	0.679	0.18
86_S	90_I	0.678	0.18
137_D	197_S	0.677	0.18
197_S	229_A	0.677	0.18
247_D	453_T	0.675	0.18
359_A	465_T	0.674	0.18
178_R	187_N	0.674	0.18
57_G	359_A	0.671	0.18
247_D	459_K	0.670	0.18
50_L	310_L	0.669	0.18
429_Q	432_M	0.668	0.18
295_R	305_P	0.667	0.18
402_G	468_L	0.664	0.18
131_F	171_F	0.662	0.18
338_V	429_Q	0.660	0.18
137_D	400_L	0.660	0.18
64_Q	317_R	0.659	0.18
385_L	438_A	0.657	0.17
317_R	363_D	0.656	0.17
29_E	187_N	0.656	0.17
59_V	63_M	0.656	0.17
148_C	366_K	0.656	0.17
85_E	216_I	0.654	0.17
160_D	163_V	0.653	0.17
65_A	445_N	0.653	0.17
391_I	396_I	0.651	0.17
48_I	459_K	0.651	0.17
180_I	440_K	0.648	0.17
345_L	363_D	0.647	0.17
364_A	416_E	0.645	0.17
196_T	359_A	0.645	0.17
421_T	432_M	0.645	0.17
393_A	418_L	0.644	0.17
338_V	422_I	0.641	0.17
13_I	18_P	0.641	0.17
324_D	425_A	0.640	0.17
195_I	205_V	0.640	0.17
108_I	456_Y	0.640	0.17
150_V	396_I	0.638	0.17
79_S	233_E	0.638	0.17
181_E	211_K	0.637	0.17
100_H	302_E	0.637	0.17
43_S	156_K	0.636	0.17
164_R	249_T	0.636	0.17
236_Y	240_Q	0.636	0.17
247_D	406_K	0.635	0.17
64_Q	72_E	0.635	0.17
247_D	469_K	0.634	0.17
149_T	406_K	0.633	0.17
205_V	258_Y	0.632	0.17
371_I	447_A	0.632	0.17
344_G	347_E	0.632	0.17
207_L	439_F	0.631	0.17
211_K	260_Y	0.631	0.17
110_I	137_D	0.630	0.17
104_G	421_T	0.629	0.17
249_T	255_R	0.628	0.17
236_Y	256_E	0.626	0.17
340_Y	429_Q	0.626	0.17
327_N	382_A	0.625	0.17
171_F	224_V	0.625	0.17
350_V	444_E	0.625	0.17
382_A	393_A	0.624	0.16
196_T	431_H	0.623	0.16
69_R	320_V	0.622	0.16
373_A	398_S	0.621	0.16
280_L	448_N	0.620	0.16
404_D	411_L	0.619	0.16
157_E	167_F	0.618	0.16
179_G	183_V	0.616	0.16
192_V	229_A	0.613	0.16
25_A	28_E	0.612	0.16
32_I	36_M	0.612	0.16
80_Y	388_V	0.612	0.16
130_A	143_S	0.612	0.16
264_L	468_L	0.612	0.16
67_M	275_P	0.612	0.16
363_D	389_A	0.611	0.16
394_V	463_H	0.611	0.16
183_V	222_I	0.609	0.16
52_T	363_D	0.609	0.16
243_A	332_A	0.608	0.16
96_T	152_N	0.608	0.16
193_A	213_M	0.608	0.16
197_S	396_I	0.607	0.16
220_Y	260_Y	0.606	0.16
111_P	145_I	0.605	0.16
166_D	241_R	0.604	0.16
21_R	225_V	0.604	0.16
217_A	224_V	0.604	0.16
32_I	459_K	0.603	0.16
229_A	401_L	0.603	0.16
65_A	77_S	0.603	0.16
351_V	398_S	0.602	0.16
215_S	219_K	0.602	0.16
287_F	320_V	0.602	0.16
162_G	366_K	0.602	0.16
72_E	269_K	0.601	0.16
348_I	435_I	0.601	0.16
80_Y	148_C	0.598	0.16
369_P	461_L	0.597	0.16
231_F	325_G	0.597	0.16
331_L	463_H	0.596	0.16
97_I	295_R	0.596	0.16
48_I	422_I	0.596	0.16
145_I	458_P	0.596	0.16
197_S	400_L	0.595	0.16
110_I	422_I	0.595	0.16
171_F	251_E	0.595	0.16
216_I	387_K	0.594	0.16
92_G	264_L	0.593	0.16
159_F	197_S	0.592	0.16
337_Q	422_I	0.591	0.16
212_A	455_T	0.591	0.16
79_S	152_N	0.590	0.16
263_M	280_L	0.590	0.16
132_S	401_L	0.590	0.16
194_T	331_L	0.589	0.16
192_V	225_V	0.589	0.16
22_T	44_E	0.587	0.15
116_K	247_D	0.587	0.15
255_R	259_K	0.585	0.15
314_A	317_R	0.585	0.15
229_A	460_V	0.584	0.15
236_Y	328_L	0.583	0.15
367_L	442_V	0.583	0.15
130_A	298_C	0.583	0.15
181_E	445_N	0.582	0.15
264_L	279_L	0.582	0.15
271_D	358_H	0.580	0.15
215_S	244_E	0.580	0.15
99_T	296_T	0.580	0.15
333_Y	367_L	0.580	0.15
189_P	300_V	0.580	0.15
73_A	299_V	0.579	0.15
153_V	179_G	0.579	0.15
269_K	312_G	0.579	0.15
350_V	391_I	0.576	0.15
406_K	455_T	0.575	0.15
297_L	420_L	0.574	0.15
14_R	360_A	0.574	0.15
117_R	167_F	0.574	0.15
240_Q	293_E	0.573	0.15
70_G	312_G	0.571	0.15
32_I	81_Y	0.569	0.15
33_K	42_D	0.569	0.15
229_A	283_K	0.568	0.15
20_K	47_F	0.568	0.15
73_A	258_Y	0.568	0.15
188_V	459_K	0.567	0.15
266_M	431_H	0.567	0.15
178_R	244_E	0.567	0.15
112_V	293_E	0.565	0.15
248_W	256_E	0.565	0.15
401_L	413_C	0.565	0.15
78_R	310_L	0.564	0.15
130_A	388_V	0.564	0.15
263_M	282_M	0.562	0.15
191_I	216_I	0.562	0.15
150_V	463_H	0.562	0.15
383_C	387_K	0.561	0.15
247_D	375_Q	0.561	0.15
108_I	154_Y	0.561	0.15
245_Y	257_T	0.560	0.15
47_F	61_Q	0.560	0.15
208_A	240_Q	0.560	0.15
197_S	463_H	0.560	0.15
67_M	84_A	0.558	0.15
118_E	279_L	0.557	0.15
174_E	178_R	0.557	0.15
229_A	400_L	0.557	0.15
263_M	298_C	0.557	0.15
14_R	342_V	0.557	0.15
174_E	186_N	0.556	0.15
343_D	450_K	0.555	0.15
247_D	339_Q	0.555	0.15
137_D	229_A	0.554	0.15
343_D	355_A	0.554	0.15
50_L	358_H	0.554	0.15
104_G	176_L	0.554	0.15
132_S	197_S	0.553	0.15
36_M	468_L	0.553	0.15
334_R	358_H	0.553	0.15
361_F	403_R	0.553	0.15
65_A	215_S	0.552	0.15
115_K	447_A	0.552	0.15
91_F	294_C	0.551	0.14
337_Q	432_M	0.550	0.14
347_E	444_E	0.549	0.14
292_T	459_K	0.548	0.14
52_T	386_Y	0.548	0.14
60_T	63_M	0.547	0.14
137_D	331_L	0.546	0.14
376_F	409_K	0.546	0.14
137_D	231_F	0.545	0.14
352_C	417_L	0.544	0.14
44_E	188_V	0.543	0.14
176_L	213_M	0.543	0.14
191_I	339_Q	0.543	0.14
333_Y	465_T	0.542	0.14
345_L	357_G	0.542	0.14
56_T	233_E	0.541	0.14
19_V	33_K	0.540	0.14
76_G	416_E	0.540	0.14
85_E	406_K	0.539	0.14
156_K	218_K	0.539	0.14
174_E	221_D	0.538	0.14
70_G	78_R	0.536	0.14
395_E	417_L	0.535	0.14
163_V	236_Y	0.535	0.14
216_I	254_T	0.535	0.14
269_K	334_R	0.534	0.14
22_T	46_V	0.533	0.14
63_M	324_D	0.533	0.14
194_T	383_C	0.530	0.14
67_M	317_R	0.530	0.14
280_L	294_C	0.530	0.14
77_S	458_P	0.529	0.14
186_N	293_E	0.528	0.14
293_E	296_T	0.528	0.14
80_Y	89_N	0.527	0.14
211_K	246_K	0.527	0.14
86_S	259_K	0.526	0.14
64_Q	363_D	0.526	0.14
190_Y	280_L	0.526	0.14
77_S	457_E	0.525	0.14
238_I	259_K	0.525	0.14
149_T	170_N	0.525	0.14
293_E	343_D	0.525	0.14
373_A	378_A	0.524	0.14
194_T	232_A	0.523	0.14
346_E	350_V	0.523	0.14
12_R	17_E	0.522	0.14
400_L	403_R	0.522	0.14
9_E	12_R	0.521	0.14
321_G	424_R	0.521	0.14
96_T	454_F	0.521	0.14
180_I	187_N	0.520	0.14
370_H	377_P	0.520	0.14
229_A	418_L	0.520	0.14
194_T	396_I	0.520	0.14
85_E	170_N	0.519	0.14
219_K	249_T	0.519	0.14
275_P	360_A	0.519	0.14
38_P	394_V	0.518	0.14
231_F	235_A	0.518	0.14
65_A	409_K	0.517	0.14
376_F	398_S	0.516	0.14
152_N	197_S	0.514	0.14
293_E	346_E	0.514	0.14
365_G	373_A	0.513	0.14
70_G	313_G	0.513	0.14
197_S	394_V	0.512	0.14
160_D	459_K	0.512	0.14
106_E	423_P	0.510	0.13
165_Y	170_N	0.510	0.13
153_V	299_V	0.510	0.13
17_E	72_E	0.508	0.13
85_E	88_K	0.508	0.13
62_S	66_A	0.507	0.13
261_A	460_V	0.506	0.13
157_E	163_V	0.505	0.13
60_T	75_S	0.505	0.13
19_V	166_D	0.504	0.13
82_A	320_V	0.504	0.13
293_E	376_F	0.502	0.13
28_E	164_R	0.502	0.13
164_R	343_D	0.501	0.13
129_V	187_N	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2ez2A	4	0.966	100	0.689	Contact Map
2oqxA	4	0.9873	100	0.698	Contact Map
1ax4A	4	0.983	100	0.758	Contact Map
4iw7A	2	0.6794	100	0.872	Contact Map
1jg8A	4	0.707	99.9	0.879	Contact Map
4lnjA	4	0.6858	99.9	0.895	Contact Map
3wgcA	4	0.6815	99.9	0.899	Contact Map
3b46A	2	0.8301	99.9	0.9	Contact Map
1v72A	4	0.6964	99.8	0.902	Contact Map
1svvA	4	0.6943	99.8	0.905	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0126 seconds.