PTW3C - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTW3C - PTS system N-acetylglucosamine-specific EIICBA component

UniProt:	P09323	Sequences: MNILGFFQRLGRALQLPIAVLPVAALLLRFGQPDLLNVAFIAQAGGAIFDNLALIFAIGVASSWSKDSAGAAALAGAVGYFVLTKAMVTINPEINMGVLAGIITGLVGGAAYNRWSDIKLPDFLSFFGGKRFVPIATGFFCLVLAAIFGYVWPPVQHAIHAGGEWIVSAGALGSGIFGFINRLLIPTGLHQVLNTIAWFQIGEFTNAAGTVFHGDINRFYAGDGTAGMFMSGFFPIMMFGLPGAALAMYFAAPKERRPMVGGMLLSVAVTAFLTGVTEPLEFLFMFLAPLLYLLHALLTGISLFVATLLGIHAGFSFSAGAIDYALMYNLPAASQNVWMLLVMGVIFFAIYFVVFSLVIRMFNLKTPGREDKEDEIVTEEANSNTEEGLTQLATNYIAAVGGTDNLKAIDACITRLRLTVADSARVNDTMCKRLGASGVVKLNKQTIQVIVGAKAESIGDAMKKVVARGPVAAASAEATPATAAPVAKPQAVPNAVSIAELVSPITGDVVALDQVPDEAFASKAVGDGVAVKPTDKIVVSPAAGTIVKIFNTNHAFCLETEKGAEIVVHMGIDTVALEGKGFKRLVEEGAQVSAGQPILEMDLDYLNANARSMISPVVCSNIDDFSGLIIKAQGHIVAGQTPLYEIKK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10635
Length:	648 (627)
Sequences:	557 (347)
Seq/√Len:	13.8

ECOLI - PTW3C PTOCB
BACSU - PTG3C PTW3C PTOCB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
585_L	597_P	7.376	1.00
570_M	599_L	5.991	1.00
605_Y	609_N	4.892	1.00
587_E	590_A	4.808	1.00
561_E	591_Q	4.778	1.00
181_N	233_F	4.760	1.00
506_T	535_D	4.577	1.00
46_G	50_D	4.553	1.00
250_F	356_S	4.509	1.00
583_K	600_E	4.407	1.00
523_K	527_D	4.354	1.00
545_T	591_Q	4.334	1.00
248_M	264_L	4.220	1.00
243_G	348_F	4.198	1.00
546_I	558_L	3.949	1.00
547_V	559_E	3.875	1.00
253_P	371_D	3.832	1.00
601_M	606_L	3.791	0.99
298_L	354_V	3.698	0.99
508_D	532_K	3.618	0.99
543_A	594_A	3.459	0.99
512_L	618_V	3.423	0.99
233_F	315_F	3.360	0.99
356_S	360_R	3.336	0.99
251_A	360_R	3.318	0.99
183_L	296_A	3.295	0.98
428_D	441_K	3.287	0.98
542_A	558_L	3.248	0.98
585_L	600_E	3.209	0.98
181_N	315_F	3.161	0.98
256_R	372_K	3.150	0.98
365_K	371_D	3.080	0.98
400_V	462_M	3.019	0.97
605_Y	610_A	2.924	0.97
515_V	530_A	2.820	0.96
407_K	421_A	2.799	0.96
593_S	596_Q	2.771	0.95
619_C	622_I	2.746	0.95
549_I	584_R	2.738	0.95
261_G	265_L	2.676	0.95
584_R	599_L	2.676	0.95
251_A	356_S	2.630	0.94
565_E	621_N	2.595	0.94
293_L	297_L	2.563	0.93
238_M	272_F	2.494	0.92
518_E	522_S	2.487	0.92
545_T	559_E	2.461	0.92
146_A	150_Y	2.451	0.91
597_P	600_E	2.444	0.91
177_F	292_Y	2.424	0.91
570_M	601_M	2.405	0.91
606_L	613_M	2.389	0.90
32_Q	42_A	2.378	0.90
546_I	549_I	2.354	0.90
543_A	593_S	2.318	0.89
345_V	349_A	2.304	0.89
537_I	597_P	2.302	0.89
632_A	640_Q	2.292	0.88
144_L	148_F	2.276	0.88
218_R	222_G	2.275	0.88
512_L	523_K	2.260	0.88
250_F	352_F	2.243	0.87
499_A	562_K	2.240	0.87
546_I	586_V	2.202	0.86
339_M	342_V	2.142	0.85
107_V	144_L	2.134	0.84
58_I	77_A	2.133	0.84
549_I	588_E	2.133	0.84
183_L	236_I	2.123	0.84
529_V	619_C	2.121	0.84
537_I	600_E	2.119	0.84
179_F	296_A	2.080	0.83
62_S	106_L	2.066	0.82
341_L	345_V	2.061	0.82
505_I	538_V	2.036	0.81
194_N	299_T	2.031	0.81
54_L	80_Y	2.023	0.81
511_A	514_Q	2.001	0.80
246_L	250_F	1.951	0.78
422_D	552_T	1.916	0.77
48_I	78_V	1.913	0.77
512_L	527_D	1.904	0.77
194_N	233_F	1.869	0.75
212_F	221_A	1.858	0.75
557_C	620_S	1.822	0.73
79_G	137_T	1.800	0.72
397_I	466_V	1.799	0.72
592_V	604_D	1.793	0.72
508_D	635_H	1.793	0.72
329_N	337_V	1.791	0.72
411_A	455_A	1.781	0.71
294_L	358_V	1.776	0.71
119_K	454_K	1.776	0.71
622_I	625_F	1.766	0.71
106_L	110_A	1.758	0.70
206_N	210_T	1.744	0.70
540_S	558_L	1.734	0.69
516_P	614_I	1.730	0.69
194_N	315_F	1.704	0.68
506_T	638_A	1.694	0.67
580_K	609_N	1.683	0.67
525_V	619_C	1.679	0.67
590_A	596_Q	1.650	0.65
422_D	425_R	1.649	0.65
8_Q	11_G	1.639	0.65
566_I	618_V	1.635	0.65
115_W	280_L	1.621	0.64
325_A	329_N	1.615	0.64
397_I	409_I	1.601	0.63
506_T	637_V	1.591	0.62
147_I	151_V	1.582	0.62
592_V	606_L	1.580	0.62
236_I	299_T	1.578	0.62
181_N	194_N	1.575	0.62
143_V	147_I	1.565	0.61
392_L	454_K	1.551	0.60
400_V	449_V	1.542	0.60
350_I	354_V	1.537	0.60
96_M	159_I	1.531	0.59
516_P	612_S	1.522	0.59
396_Y	451_V	1.522	0.59
111_A	140_F	1.502	0.58
249_Y	257_R	1.498	0.58
50_D	280_L	1.479	0.57
181_N	299_T	1.479	0.57
118_I	132_F	1.477	0.56
55_I	315_F	1.470	0.56
250_F	360_R	1.457	0.55
203_E	207_A	1.456	0.55
506_T	534_T	1.455	0.55
55_I	183_L	1.455	0.55
411_A	434_L	1.449	0.55
174_S	228_M	1.445	0.55
179_F	183_L	1.436	0.54
342_V	346_I	1.433	0.54
304_F	315_F	1.433	0.54
181_N	236_I	1.425	0.54
243_G	345_V	1.424	0.54
175_G	179_F	1.422	0.54
549_I	586_V	1.422	0.54
256_R	259_M	1.413	0.53
604_D	607_N	1.403	0.53
176_I	236_I	1.389	0.52
537_I	585_L	1.388	0.52
84_T	93_E	1.386	0.52
54_L	77_A	1.383	0.51
499_A	560_T	1.381	0.51
181_N	292_Y	1.378	0.51
580_K	605_Y	1.376	0.51
49_F	276_V	1.364	0.50
409_I	466_V	1.354	0.50
181_N	306_A	1.341	0.49
233_F	299_T	1.327	0.48
62_S	258_P	1.325	0.48
180_I	193_L	1.325	0.48
413_I	455_A	1.319	0.48
125_S	276_V	1.316	0.48
111_A	136_A	1.316	0.48
513_D	523_K	1.313	0.48
156_Q	229_F	1.306	0.47
15_Q	191_Q	1.301	0.47
63_S	197_A	1.300	0.47
305_V	309_L	1.300	0.47
306_A	311_I	1.299	0.47
331_P	337_V	1.298	0.47
233_F	306_A	1.295	0.47
139_F	143_V	1.289	0.46
510_V	532_K	1.288	0.46
525_V	620_S	1.287	0.46
253_P	365_K	1.280	0.46
112_Y	227_G	1.278	0.46
233_F	292_Y	1.277	0.46
26_L	55_I	1.272	0.45
254_K	257_R	1.263	0.45
26_L	30_F	1.250	0.44
28_L	49_F	1.235	0.44
542_A	560_T	1.226	0.43
570_M	584_R	1.224	0.43
404_D	425_R	1.221	0.43
570_M	615_S	1.221	0.43
78_V	104_T	1.219	0.43
80_Y	545_T	1.219	0.43
174_S	307_T	1.214	0.42
332_A	337_V	1.207	0.42
544_G	558_L	1.202	0.42
551_N	567_V	1.199	0.42
239_F	344_G	1.197	0.41
521_A	643_L	1.195	0.41
84_T	94_I	1.190	0.41
516_P	610_A	1.183	0.41
220_Y	316_S	1.181	0.41
543_A	561_E	1.174	0.40
524_A	557_C	1.171	0.40
114_R	117_D	1.167	0.40
248_M	283_L	1.164	0.40
451_V	459_G	1.163	0.40
503_S	636_I	1.162	0.40
181_N	298_L	1.146	0.39
270_T	273_L	1.145	0.39
3_I	371_D	1.142	0.39
257_R	361_M	1.138	0.38
235_P	306_A	1.137	0.38
151_V	254_K	1.128	0.38
606_L	644_Y	1.127	0.38
183_L	299_T	1.124	0.38
505_I	531_V	1.121	0.38
48_I	290_L	1.119	0.37
183_L	194_N	1.113	0.37
222_G	337_V	1.113	0.37
215_D	227_G	1.100	0.37
328_Y	337_V	1.098	0.36
21_L	61_A	1.098	0.36
58_I	292_Y	1.097	0.36
230_M	306_A	1.096	0.36
55_I	233_F	1.095	0.36
510_V	614_I	1.095	0.36
306_A	315_F	1.094	0.36
25_A	49_F	1.091	0.36
276_V	306_A	1.089	0.36
570_M	628_L	1.085	0.36
529_V	643_L	1.083	0.36
235_P	292_Y	1.081	0.36
97_G	156_Q	1.081	0.36
210_T	213_H	1.080	0.36
235_P	302_S	1.078	0.35
218_R	337_V	1.076	0.35
495_A	618_V	1.076	0.35
174_S	288_A	1.075	0.35
176_I	183_L	1.074	0.35
558_L	598_I	1.074	0.35
512_L	625_F	1.066	0.35
599_L	611_R	1.066	0.35
246_L	356_S	1.065	0.35
374_D	566_I	1.064	0.35
315_F	319_A	1.063	0.35
629_I	633_Q	1.063	0.35
636_I	640_Q	1.062	0.35
209_G	214_G	1.062	0.35
553_N	584_R	1.061	0.35
516_P	616_P	1.058	0.34
538_V	601_M	1.058	0.34
576_A	611_R	1.054	0.34
581_G	609_N	1.053	0.34
525_V	622_I	1.049	0.34
179_F	293_L	1.049	0.34
148_F	212_F	1.044	0.34
552_T	615_S	1.043	0.34
181_N	296_A	1.040	0.34
545_T	594_A	1.036	0.33
9_R	508_D	1.033	0.33
9_R	113_N	1.033	0.33
12_R	410_D	1.024	0.33
434_L	455_A	1.018	0.33
218_R	226_A	1.015	0.32
414_T	533_P	1.015	0.32
354_V	358_V	1.014	0.32
294_L	298_L	1.013	0.32
230_M	235_P	1.013	0.32
233_F	285_M	1.010	0.32
309_L	343_M	1.007	0.32
525_V	568_V	1.004	0.32
155_V	321_A	1.004	0.32
104_T	148_F	1.003	0.32
170_G	173_G	1.002	0.32
531_V	560_T	1.000	0.32
163_G	203_E	0.999	0.32
202_G	226_A	0.997	0.32
252_A	366_T	0.995	0.31
512_L	524_A	0.988	0.31
313_A	328_Y	0.988	0.31
221_A	269_V	0.984	0.31
198_W	237_M	0.978	0.31
559_E	598_I	0.975	0.31
181_N	285_M	0.975	0.31
233_F	236_I	0.973	0.30
607_N	637_V	0.972	0.30
409_I	418_L	0.971	0.30
525_V	557_C	0.971	0.30
218_R	328_Y	0.971	0.30
14_L	112_Y	0.969	0.30
183_L	315_F	0.968	0.30
235_P	295_H	0.968	0.30
512_L	584_R	0.965	0.30
604_D	608_A	0.965	0.30
619_C	625_F	0.963	0.30
136_A	139_F	0.960	0.30
158_A	346_I	0.960	0.30
14_L	215_D	0.960	0.30
25_A	316_S	0.958	0.30
194_N	236_I	0.958	0.30
532_K	606_L	0.957	0.30
233_F	298_L	0.957	0.30
601_M	615_S	0.952	0.29
177_F	312_H	0.952	0.29
215_D	230_M	0.952	0.29
11_G	63_S	0.951	0.29
324_Y	337_V	0.946	0.29
155_V	160_H	0.945	0.29
529_V	630_I	0.939	0.29
80_Y	437_S	0.939	0.29
358_V	362_F	0.938	0.29
290_L	294_L	0.932	0.29
236_I	315_F	0.931	0.29
18_I	264_L	0.930	0.29
618_V	643_L	0.930	0.29
208_A	280_L	0.929	0.28
488_K	493_P	0.928	0.28
454_K	458_I	0.924	0.28
631_K	645_E	0.914	0.28
527_D	622_I	0.914	0.28
420_V	426_V	0.913	0.28
176_I	315_F	0.909	0.28
290_L	346_I	0.904	0.27
449_V	455_A	0.904	0.27
43_Q	86_A	0.903	0.27
568_V	616_P	0.901	0.27
445_Q	521_A	0.900	0.27
519_A	553_N	0.900	0.27
299_T	315_F	0.898	0.27
599_L	610_A	0.896	0.27
194_N	285_M	0.895	0.27
18_I	197_A	0.893	0.27
400_V	418_L	0.892	0.27
49_F	100_A	0.891	0.27
29_R	203_E	0.891	0.27
110_A	115_W	0.891	0.27
138_G	292_Y	0.890	0.27
115_W	617_V	0.890	0.27
77_A	292_Y	0.887	0.27
253_P	373_E	0.886	0.27
249_Y	261_G	0.883	0.26
429_T	521_A	0.882	0.26
599_L	605_Y	0.880	0.26
353_V	357_L	0.878	0.26
55_I	181_N	0.878	0.26
62_S	251_A	0.878	0.26
178_G	303_L	0.876	0.26
16_L	62_S	0.875	0.26
456_E	462_M	0.875	0.26
510_V	530_A	0.874	0.26
576_A	613_M	0.873	0.26
27_L	41_I	0.872	0.26
532_K	605_Y	0.869	0.26
406_L	466_V	0.869	0.26
546_I	572_I	0.869	0.26
549_I	590_A	0.869	0.26
233_F	296_A	0.867	0.26
391_Q	521_A	0.867	0.26
581_G	605_Y	0.864	0.26
536_K	606_L	0.864	0.26
222_G	328_Y	0.863	0.26
486_V	493_P	0.863	0.26
362_F	508_D	0.862	0.26
58_I	639_G	0.862	0.26
556_F	598_I	0.861	0.26
138_G	234_F	0.860	0.26
236_I	285_M	0.857	0.25
560_T	572_I	0.856	0.25
512_L	619_C	0.854	0.25
123_F	169_A	0.853	0.25
411_A	449_V	0.852	0.25
547_V	596_Q	0.851	0.25
498_I	643_L	0.850	0.25
611_R	622_I	0.848	0.25
114_R	562_K	0.847	0.25
14_L	23_V	0.847	0.25
148_F	257_R	0.846	0.25
232_G	320_G	0.843	0.25
136_A	140_F	0.843	0.25
151_V	429_T	0.843	0.25
561_E	640_Q	0.842	0.25
179_F	236_I	0.841	0.25
564_A	625_F	0.838	0.25
486_V	491_A	0.838	0.25
420_V	636_I	0.836	0.25
116_S	340_L	0.836	0.25
539_V	596_Q	0.834	0.24
576_A	610_A	0.833	0.24
462_M	465_V	0.830	0.24
67_D	170_G	0.828	0.24
107_V	248_M	0.827	0.24
183_L	233_F	0.826	0.24
531_V	630_I	0.823	0.24
177_F	180_I	0.823	0.24
198_W	320_G	0.823	0.24
157_H	161_A	0.822	0.24
313_A	340_L	0.822	0.24
485_P	489_P	0.822	0.24
233_F	304_F	0.821	0.24
207_A	211_V	0.810	0.24
257_R	583_K	0.810	0.24
536_K	601_M	0.809	0.23
215_D	295_H	0.808	0.23
276_V	299_T	0.805	0.23
158_A	540_S	0.802	0.23
229_F	295_H	0.801	0.23
585_L	615_S	0.800	0.23
581_G	612_S	0.800	0.23
28_L	100_A	0.799	0.23
324_Y	340_L	0.798	0.23
603_L	610_A	0.795	0.23
485_P	488_K	0.795	0.23
587_E	607_N	0.794	0.23
198_W	318_S	0.792	0.23
420_V	525_V	0.792	0.23
179_F	299_T	0.789	0.23
155_V	221_A	0.788	0.23
391_Q	588_E	0.788	0.23
174_S	263_M	0.787	0.23
421_A	495_A	0.786	0.23
304_F	308_L	0.785	0.23
345_V	348_F	0.784	0.23
112_Y	130_K	0.784	0.23
613_M	632_A	0.784	0.23
594_A	598_I	0.782	0.22
254_K	352_F	0.780	0.22
9_R	400_V	0.779	0.22
585_L	596_Q	0.779	0.22
216_I	222_G	0.779	0.22
547_V	618_V	0.778	0.22
244_A	351_Y	0.776	0.22
585_L	599_L	0.774	0.22
570_M	598_I	0.772	0.22
566_I	619_C	0.769	0.22
84_T	177_F	0.768	0.22
283_L	305_V	0.767	0.22
233_F	313_A	0.767	0.22
540_S	543_A	0.767	0.22
139_F	142_L	0.767	0.22
229_F	273_L	0.766	0.22
162_G	180_I	0.765	0.22
18_I	162_G	0.765	0.22
214_G	218_R	0.763	0.22
406_L	475_S	0.763	0.22
508_D	634_G	0.761	0.22
81_F	137_T	0.761	0.22
19_A	232_G	0.761	0.22
451_V	455_A	0.760	0.22
489_P	580_K	0.759	0.22
298_L	301_I	0.758	0.22
237_M	318_S	0.758	0.22
599_L	609_N	0.756	0.21
124_L	280_L	0.754	0.21
60_V	219_F	0.754	0.21
9_R	199_F	0.753	0.21
155_V	643_L	0.752	0.21
183_L	304_F	0.752	0.21
518_E	594_A	0.752	0.21
165_W	169_A	0.751	0.21
564_A	643_L	0.751	0.21
492_V	561_E	0.750	0.21
144_L	363_N	0.749	0.21
48_I	478_A	0.749	0.21
505_I	568_V	0.748	0.21
27_L	81_F	0.748	0.21
450_I	618_V	0.747	0.21
285_M	299_T	0.747	0.21
521_A	597_P	0.747	0.21
55_I	83_L	0.746	0.21
80_Y	93_E	0.742	0.21
67_D	112_Y	0.740	0.21
282_F	581_G	0.740	0.21
181_N	311_I	0.739	0.21
280_L	626_S	0.739	0.21
394_T	462_M	0.738	0.21
296_A	301_I	0.736	0.21
560_T	564_A	0.735	0.21
466_V	469_G	0.733	0.21
512_L	615_S	0.733	0.21
246_L	251_A	0.733	0.21
244_A	289_P	0.733	0.21
360_R	365_K	0.733	0.21
125_S	451_V	0.731	0.21
596_Q	618_V	0.731	0.21
181_N	283_L	0.731	0.21
22_P	134_P	0.728	0.20
174_S	315_F	0.727	0.20
346_I	427_N	0.726	0.20
566_I	598_I	0.726	0.20
82_V	181_N	0.725	0.20
214_G	226_A	0.723	0.20
27_L	59_G	0.723	0.20
248_M	287_L	0.723	0.20
514_Q	613_M	0.723	0.20
556_F	559_E	0.723	0.20
475_S	604_D	0.722	0.20
197_A	287_L	0.721	0.20
28_L	118_I	0.720	0.20
218_R	224_G	0.720	0.20
392_L	434_L	0.719	0.20
19_A	22_P	0.717	0.20
511_A	521_A	0.717	0.20
82_V	114_R	0.716	0.20
512_L	547_V	0.716	0.20
534_T	578_E	0.715	0.20
607_N	613_M	0.715	0.20
60_V	292_Y	0.714	0.20
9_R	634_G	0.713	0.20
557_C	567_V	0.713	0.20
398_A	568_V	0.712	0.20
572_I	613_M	0.711	0.20
504_P	616_P	0.711	0.20
112_Y	215_D	0.710	0.20
556_F	568_V	0.710	0.20
229_F	260_V	0.709	0.20
305_V	342_V	0.709	0.20
174_S	298_L	0.709	0.20
192_V	226_A	0.708	0.20
419_T	423_S	0.707	0.20
194_N	216_I	0.707	0.20
503_S	622_I	0.707	0.20
305_V	308_L	0.707	0.20
50_D	321_A	0.706	0.20
270_T	306_A	0.706	0.20
48_I	183_L	0.705	0.20
229_F	283_L	0.705	0.20
242_P	351_Y	0.705	0.20
175_G	303_L	0.704	0.20
475_S	496_V	0.701	0.20
163_G	193_L	0.700	0.20
216_I	219_F	0.700	0.20
516_P	581_G	0.699	0.19
82_V	212_F	0.699	0.19
99_L	196_I	0.698	0.19
551_N	565_E	0.697	0.19
290_L	362_F	0.696	0.19
525_V	598_I	0.696	0.19
30_F	157_H	0.696	0.19
558_L	565_E	0.694	0.19
519_A	643_L	0.693	0.19
228_M	312_H	0.693	0.19
508_D	558_L	0.692	0.19
28_L	32_Q	0.691	0.19
40_F	50_D	0.690	0.19
501_L	529_V	0.690	0.19
524_A	531_V	0.689	0.19
37_N	324_Y	0.689	0.19
619_C	643_L	0.688	0.19
23_V	343_M	0.688	0.19
31_G	45_G	0.688	0.19
512_L	551_N	0.687	0.19
159_I	165_W	0.686	0.19
434_L	451_V	0.685	0.19
181_N	304_F	0.685	0.19
297_L	564_A	0.683	0.19
147_I	561_E	0.683	0.19
29_R	32_Q	0.682	0.19
467_A	618_V	0.682	0.19
534_T	637_V	0.681	0.19
308_L	325_A	0.679	0.19
198_W	319_A	0.675	0.19
477_E	493_P	0.675	0.19
196_I	316_S	0.674	0.19
13_A	64_W	0.674	0.19
130_K	215_D	0.673	0.19
19_A	219_F	0.673	0.19
245_A	280_L	0.672	0.19
178_G	198_W	0.672	0.19
179_F	194_N	0.671	0.19
311_I	339_M	0.671	0.19
123_F	265_L	0.670	0.19
71_A	285_M	0.670	0.19
478_A	638_A	0.669	0.18
115_W	221_A	0.669	0.18
489_P	546_I	0.668	0.18
343_M	346_I	0.668	0.18
260_V	616_P	0.667	0.18
55_I	142_L	0.666	0.18
83_L	285_M	0.665	0.18
58_I	73_A	0.665	0.18
7_F	10_L	0.665	0.18
49_F	220_Y	0.664	0.18
18_I	192_V	0.663	0.18
237_M	241_L	0.663	0.18
20_V	47_A	0.663	0.18
114_R	171_A	0.663	0.18
262_G	443_N	0.662	0.18
167_V	177_F	0.661	0.18
48_I	82_V	0.660	0.18
543_A	596_Q	0.660	0.18
295_H	315_F	0.660	0.18
455_A	462_M	0.659	0.18
115_W	353_V	0.659	0.18
126_F	131_R	0.658	0.18
50_D	390_T	0.658	0.18
457_S	460_D	0.658	0.18
60_V	581_G	0.658	0.18
296_A	299_T	0.657	0.18
407_K	419_T	0.656	0.18
532_K	607_N	0.656	0.18
16_L	49_F	0.654	0.18
494_N	618_V	0.654	0.18
513_D	618_V	0.652	0.18
521_A	608_A	0.652	0.18
254_K	349_A	0.652	0.18
568_V	615_S	0.650	0.18
230_M	234_F	0.649	0.18
581_G	585_L	0.647	0.18
553_N	620_S	0.646	0.18
467_A	498_I	0.645	0.18
532_K	614_I	0.645	0.18
141_C	338_W	0.644	0.18
138_G	230_M	0.644	0.18
477_E	490_Q	0.643	0.18
215_D	338_W	0.643	0.18
409_I	440_V	0.642	0.18
418_L	449_V	0.641	0.18
527_D	610_A	0.640	0.18
399_A	434_L	0.638	0.18
488_K	491_A	0.638	0.18
193_L	285_M	0.638	0.18
147_I	407_K	0.638	0.18
174_S	194_N	0.638	0.18
151_V	489_P	0.638	0.18
602_D	605_Y	0.638	0.18
81_F	118_I	0.637	0.17
319_A	340_L	0.636	0.17
487_A	490_Q	0.636	0.17
49_F	270_T	0.636	0.17
298_L	353_V	0.635	0.17
360_R	591_Q	0.634	0.17
362_F	596_Q	0.633	0.17
413_I	434_L	0.633	0.17
374_D	433_R	0.633	0.17
233_F	311_I	0.633	0.17
598_I	639_G	0.632	0.17
536_K	603_L	0.631	0.17
521_A	559_E	0.631	0.17
181_N	216_I	0.631	0.17
509_V	529_V	0.631	0.17
162_G	176_I	0.631	0.17
170_G	298_L	0.630	0.17
613_M	616_P	0.629	0.17
299_T	340_L	0.629	0.17
479_T	493_P	0.629	0.17
377_V	425_R	0.628	0.17
80_Y	88_V	0.627	0.17
165_W	321_A	0.627	0.17
612_S	615_S	0.627	0.17
500_E	619_C	0.625	0.17
518_E	572_I	0.625	0.17
384_N	474_A	0.625	0.17
173_G	177_F	0.624	0.17
312_H	335_Q	0.623	0.17
546_I	645_E	0.623	0.17
511_A	568_V	0.621	0.17
558_L	572_I	0.621	0.17
522_S	591_Q	0.621	0.17
498_I	645_E	0.620	0.17
231_S	312_H	0.620	0.17
350_I	466_V	0.619	0.17
394_T	398_A	0.617	0.17
19_A	180_I	0.617	0.17
238_M	313_A	0.616	0.17
497_S	643_L	0.615	0.17
352_F	356_S	0.615	0.17
440_V	503_S	0.615	0.17
358_V	539_V	0.614	0.17
566_I	608_A	0.614	0.17
530_A	614_I	0.614	0.17
476_A	485_P	0.614	0.17
372_K	547_V	0.613	0.17
458_I	462_M	0.612	0.17
521_A	537_I	0.612	0.17
174_S	179_F	0.612	0.17
611_R	619_C	0.611	0.17
97_G	226_A	0.611	0.17
14_L	31_G	0.610	0.17
168_S	257_R	0.608	0.17
479_T	489_P	0.608	0.17
107_V	456_E	0.607	0.17
321_A	396_Y	0.606	0.17
125_S	203_E	0.606	0.17
531_V	536_K	0.605	0.17
280_L	467_A	0.604	0.16
312_H	315_F	0.604	0.16
100_A	270_T	0.604	0.16
506_T	536_K	0.603	0.16
264_L	288_A	0.603	0.16
497_S	509_V	0.603	0.16
559_E	591_Q	0.602	0.16
615_S	639_G	0.601	0.16
62_S	142_L	0.601	0.16
177_F	309_L	0.601	0.16
22_P	266_S	0.600	0.16
522_S	618_V	0.600	0.16
604_D	609_N	0.600	0.16
612_S	622_I	0.600	0.16
546_I	566_I	0.600	0.16
19_A	327_M	0.599	0.16
506_T	568_V	0.598	0.16
123_F	128_G	0.597	0.16
73_A	248_M	0.597	0.16
280_L	506_T	0.596	0.16
630_I	633_Q	0.596	0.16
415_R	448_Q	0.595	0.16
525_V	610_A	0.594	0.16
292_Y	350_I	0.593	0.16
55_I	160_H	0.592	0.16
404_D	591_Q	0.591	0.16
83_L	94_I	0.591	0.16
477_E	491_A	0.591	0.16
43_Q	46_G	0.590	0.16
313_A	327_M	0.590	0.16
39_A	42_A	0.590	0.16
125_S	265_L	0.590	0.16
4_L	8_Q	0.590	0.16
48_I	217_N	0.589	0.16
9_R	104_T	0.586	0.16
218_R	223_D	0.586	0.16
477_E	501_L	0.586	0.16
558_L	621_N	0.586	0.16
236_I	302_S	0.586	0.16
518_E	539_V	0.585	0.16
548_K	588_E	0.584	0.16
427_N	540_S	0.584	0.16
535_D	540_S	0.584	0.16
58_I	617_V	0.583	0.16
413_I	451_V	0.583	0.16
508_D	534_T	0.582	0.16
46_G	85_K	0.582	0.16
116_S	169_A	0.581	0.16
539_V	597_P	0.581	0.16
174_S	233_F	0.581	0.16
200_Q	455_A	0.578	0.16
238_M	326_L	0.577	0.16
138_G	295_H	0.577	0.16
586_V	598_I	0.577	0.16
176_I	364_L	0.576	0.16
561_E	635_H	0.576	0.16
629_I	643_L	0.575	0.16
32_Q	94_I	0.575	0.16
524_A	529_V	0.574	0.16
529_V	564_A	0.574	0.16
236_I	293_L	0.573	0.16
296_A	403_T	0.573	0.16
619_C	644_Y	0.573	0.16
474_A	478_A	0.572	0.16
288_A	394_T	0.572	0.16
371_D	566_I	0.571	0.16
61_A	135_I	0.571	0.16
451_V	462_M	0.571	0.16
479_T	617_V	0.570	0.15
86_A	192_V	0.570	0.15
525_V	567_V	0.569	0.15
216_I	315_F	0.569	0.15
113_N	462_M	0.568	0.15
584_R	611_R	0.568	0.15
126_F	134_P	0.568	0.15
477_E	578_E	0.568	0.15
447_I	598_I	0.567	0.15
25_A	96_M	0.567	0.15
194_N	296_A	0.566	0.15
503_S	531_V	0.565	0.15
194_N	340_L	0.565	0.15
271_A	521_A	0.565	0.15
136_A	624_D	0.565	0.15
231_S	307_T	0.565	0.15
138_G	235_P	0.565	0.15
293_L	350_I	0.564	0.15
478_A	608_A	0.564	0.15
14_L	227_G	0.564	0.15
610_A	622_I	0.564	0.15
585_L	593_S	0.563	0.15
512_L	559_E	0.563	0.15
537_I	630_I	0.562	0.15
266_S	459_G	0.562	0.15
476_A	491_A	0.562	0.15
125_S	434_L	0.561	0.15
58_I	283_L	0.561	0.15
551_N	606_L	0.560	0.15
80_Y	258_P	0.558	0.15
422_D	565_E	0.558	0.15
76_G	459_G	0.558	0.15
295_H	351_Y	0.558	0.15
594_A	607_N	0.558	0.15
609_N	612_S	0.557	0.15
522_S	535_D	0.557	0.15
14_L	207_A	0.557	0.15
230_M	295_H	0.557	0.15
293_L	304_F	0.556	0.15
200_Q	203_E	0.555	0.15
542_A	566_I	0.555	0.15
187_T	453_A	0.555	0.15
177_F	215_D	0.555	0.15
578_E	598_I	0.554	0.15
529_V	644_Y	0.554	0.15
166_I	263_M	0.554	0.15
222_G	329_N	0.553	0.15
611_R	625_F	0.553	0.15
64_W	125_S	0.553	0.15
130_K	227_G	0.552	0.15
50_D	501_L	0.552	0.15
16_L	118_I	0.552	0.15
522_S	576_A	0.551	0.15
16_L	328_Y	0.550	0.15
13_A	79_G	0.550	0.15
262_G	612_S	0.549	0.15
248_M	260_V	0.549	0.15
77_A	558_L	0.548	0.15
80_Y	512_L	0.548	0.15
264_L	366_T	0.548	0.15
58_I	305_V	0.548	0.15
29_R	342_V	0.547	0.15
267_V	288_A	0.546	0.15
447_I	473_A	0.546	0.15
505_I	616_P	0.546	0.15
546_I	578_E	0.546	0.15
433_R	624_D	0.546	0.15
429_T	488_K	0.546	0.15
395_N	433_R	0.544	0.15
216_I	335_Q	0.544	0.15
503_S	521_A	0.543	0.15
19_A	280_L	0.542	0.15
604_D	629_I	0.540	0.15
155_V	386_E	0.540	0.15
384_N	477_E	0.539	0.15
395_N	430_M	0.539	0.15
489_P	492_V	0.538	0.15
216_I	340_L	0.538	0.15
69_A	112_Y	0.538	0.15
8_Q	410_D	0.537	0.15
59_G	226_A	0.537	0.15
82_V	233_F	0.536	0.15
411_A	458_I	0.535	0.15
408_A	419_T	0.533	0.14
71_A	340_L	0.533	0.14
176_I	181_N	0.533	0.14
488_K	495_A	0.532	0.14
562_K	587_E	0.532	0.14
65_S	539_V	0.532	0.14
253_P	547_V	0.531	0.14
220_Y	234_F	0.531	0.14
486_V	489_P	0.531	0.14
521_A	532_K	0.531	0.14
599_L	616_P	0.531	0.14
512_L	643_L	0.531	0.14
269_V	453_A	0.530	0.14
10_L	166_I	0.530	0.14
195_T	199_F	0.530	0.14
582_F	598_I	0.530	0.14
499_A	629_I	0.530	0.14
28_L	31_G	0.530	0.14
200_Q	243_G	0.530	0.14
218_R	313_A	0.530	0.14
177_F	231_S	0.529	0.14
132_F	136_A	0.529	0.14
393_A	446_T	0.529	0.14
39_A	115_W	0.529	0.14
73_A	183_L	0.528	0.14
503_S	506_T	0.528	0.14
547_V	588_E	0.528	0.14
203_E	228_M	0.528	0.14
80_Y	213_H	0.528	0.14
510_V	633_Q	0.527	0.14
382_N	386_E	0.527	0.14
612_S	616_P	0.526	0.14
512_L	628_L	0.526	0.14
630_I	634_G	0.526	0.14
6_F	60_V	0.525	0.14
113_N	552_T	0.524	0.14
163_G	173_G	0.523	0.14
162_G	174_S	0.523	0.14
50_D	534_T	0.523	0.14
545_T	588_E	0.523	0.14
149_G	292_Y	0.523	0.14
234_F	344_G	0.523	0.14
583_K	599_L	0.522	0.14
119_K	276_V	0.522	0.14
233_F	295_H	0.522	0.14
76_G	292_Y	0.522	0.14
88_V	260_V	0.522	0.14
474_A	600_E	0.522	0.14
547_V	584_R	0.522	0.14
48_I	55_I	0.521	0.14
198_W	232_G	0.521	0.14
605_Y	611_R	0.520	0.14
384_N	608_A	0.520	0.14
101_G	105_G	0.520	0.14
64_W	107_V	0.519	0.14
159_I	162_G	0.519	0.14
385_T	503_S	0.518	0.14
105_G	126_F	0.518	0.14
235_P	616_P	0.518	0.14
178_G	232_G	0.518	0.14
509_V	540_S	0.517	0.14
349_A	353_V	0.516	0.14
253_P	549_I	0.516	0.14
566_I	591_Q	0.516	0.14
552_T	572_I	0.516	0.14
29_R	331_P	0.515	0.14
568_V	617_V	0.514	0.14
327_M	337_V	0.514	0.14
362_F	613_M	0.514	0.14
71_A	459_G	0.514	0.14
306_A	322_I	0.513	0.14
174_S	312_H	0.513	0.14
197_A	264_L	0.513	0.14
195_T	298_L	0.512	0.14
462_M	598_I	0.511	0.14
577_L	605_Y	0.511	0.14
134_P	214_G	0.511	0.14
477_E	593_S	0.510	0.14
342_V	357_L	0.510	0.14
419_T	538_V	0.509	0.14
242_P	344_G	0.509	0.14
321_A	501_L	0.509	0.14
537_I	638_A	0.509	0.14
141_C	451_V	0.509	0.14
9_R	140_F	0.508	0.14
545_T	567_V	0.508	0.14
162_G	165_W	0.508	0.14
4_L	11_G	0.508	0.14
9_R	456_E	0.507	0.14
54_L	81_F	0.507	0.14
490_Q	608_A	0.507	0.14
549_I	598_I	0.507	0.14
48_I	122_D	0.506	0.14
406_L	472_A	0.506	0.14
38_V	222_G	0.506	0.14
506_T	580_K	0.506	0.14
200_Q	204_F	0.505	0.14
292_Y	354_V	0.505	0.14
519_A	621_N	0.504	0.14
181_N	295_H	0.504	0.14
59_G	370_E	0.504	0.14
511_A	518_E	0.503	0.14
502_V	594_A	0.503	0.14
400_V	508_D	0.503	0.14
627_G	645_E	0.502	0.14
522_S	593_S	0.502	0.14
510_V	587_E	0.501	0.14
177_F	342_V	0.501	0.14
488_K	498_I	0.501	0.14
29_R	218_R	0.501	0.14
104_T	144_L	0.501	0.14
27_L	47_A	0.501	0.14
144_L	634_G	0.500	0.14
196_I	267_V	0.500	0.14
187_T	319_A	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3ourB	1	0.2315	100	0.806	Contact Map
1f3zA	2	0.2315	100	0.806	Contact Map
2gprA	1	0.2377	100	0.806	Contact Map
1ax3A	1	0.25	100	0.811	Contact Map
3qnqA	2	0.5617	100	0.813	Contact Map
1ibaA	1	0.1204	99.9	0.912	Contact Map
3bp3A	1	0.125	99.9	0.913	Contact Map
3ipjA	1	0.1435	99.9	0.918	Contact Map
1dczA	1	0.1188	98.6	0.963	Contact Map
2d5dA	1	0.108	98.5	0.963	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0152 seconds.