HIS7 - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

HIS7 - Histidine biosynthesis bifunctional protein HisB

UniProt:	P06987	Sequences: MSQKYLFIDRDGTLISEPPSDFQVDRFDKLAFEPGVIPELLKLQKAGYKLVMITNQDGLGTQSFPQADFDGPHNLMMQIFTSQGVQFDEVLICPHLPADECDCRKPKVKLVERYLAEQAMDRANSYVIGDRATDIQLAENMGITGLRYDRETLNWPMIGEQLTRRDRYAHVVRNTKETQIDVQVWLDREGGSKINTGVGFFDHMLDQIATHGGFRMEINVKGDLYIDDHHTVEDTGLALGEALKIALGDKRGICRFGFVLPMDECLARCALDISGRPHLEYKAEFTYQRVGDLSTEMIEHFFRSLSYTMGVTLHLKTKGKNDHHRVESLFKAFGRTLRQAIRVEGDTLPSSKGVL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10445
Length:	355 (351)
Sequences:	474 (215)
Seq/√Len:	11.5

ECOLI - HIS7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
135_I	145_G	6.816	1.00
77_M	90_V	6.468	1.00
15_I	24_V	5.912	1.00
14_L	80_F	5.747	1.00
174_N	179_Q	5.167	1.00
27_F	72_P	4.250	1.00
27_F	75_L	4.028	0.99
243_L	305_L	3.795	0.99
266_L	270_A	3.720	0.99
66_Q	70_D	3.474	0.98
170_H	183_Q	3.425	0.98
95_H	101_C	3.192	0.97
198_V	292_D	3.168	0.96
15_I	76_M	3.161	0.96
111_V	141_M	2.875	0.94
241_E	245_I	2.847	0.93
89_E	113_R	2.807	0.93
232_V	293_L	2.747	0.92
192_S	209_A	2.746	0.92
127_V	137_L	2.522	0.88
172_V	179_Q	2.509	0.88
244_K	310_G	2.410	0.86
35_G	154_N	2.407	0.86
237_L	308_T	2.388	0.85
322_D	325_R	2.338	0.84
265_C	328_S	2.271	0.82
38_P	41_L	2.239	0.81
30_L	76_M	2.236	0.81
79_I	82_S	2.234	0.81
192_S	206_D	2.231	0.81
37_I	79_I	2.210	0.80
193_K	217_E	2.156	0.79
259_V	270_A	2.155	0.78
210_T	351_S	2.000	0.73
305_L	311_V	1.998	0.73
20_S	24_V	1.990	0.73
3_Q	49_K	1.982	0.72
49_K	88_D	1.977	0.72
170_H	181_D	1.941	0.71
33_E	148_Y	1.848	0.67
298_I	326_V	1.848	0.67
171_V	220_V	1.817	0.65
52_M	90_V	1.799	0.64
319_G	325_R	1.799	0.64
38_P	83_Q	1.783	0.64
78_Q	81_T	1.769	0.63
15_I	20_S	1.741	0.62
72_P	75_L	1.737	0.62
39_E	156_P	1.720	0.61
209_A	333_F	1.711	0.60
132_A	147_R	1.700	0.60
315_L	329_L	1.693	0.60
108_V	111_V	1.682	0.59
237_L	277_P	1.674	0.59
212_G	341_I	1.658	0.58
289_R	292_D	1.656	0.58
95_H	103_C	1.656	0.58
199_G	225_Y	1.650	0.57
64_F	68_D	1.643	0.57
256_F	334_G	1.641	0.57
315_L	326_V	1.634	0.57
265_C	317_T	1.632	0.57
101_C	107_K	1.624	0.56
80_F	265_C	1.612	0.56
93_C	103_C	1.578	0.54
279_L	299_E	1.574	0.54
35_G	156_P	1.566	0.53
91_L	111_V	1.561	0.53
27_F	71_G	1.548	0.53
107_K	136_Q	1.540	0.52
348_L	354_V	1.538	0.52
94_P	103_C	1.479	0.49
45_K	159_G	1.477	0.49
4_K	124_N	1.474	0.49
32_F	79_I	1.461	0.48
264_E	274_S	1.456	0.48
136_Q	139_E	1.455	0.48
52_M	64_F	1.445	0.47
48_Y	166_D	1.430	0.47
5_Y	49_K	1.412	0.46
28_D	75_L	1.410	0.46
111_V	137_L	1.409	0.46
43_L	50_L	1.402	0.45
73_H	90_V	1.400	0.45
14_L	37_I	1.391	0.45
26_R	30_L	1.361	0.43
36_V	80_F	1.356	0.43
220_V	235_T	1.354	0.43
44_Q	50_L	1.352	0.43
287_Y	296_E	1.340	0.42
293_L	298_I	1.340	0.42
254_C	274_S	1.331	0.42
220_V	238_A	1.330	0.42
63_S	96_L	1.329	0.42
192_S	333_F	1.325	0.42
72_P	76_M	1.316	0.41
91_L	115_L	1.311	0.41
303_R	307_Y	1.310	0.41
93_C	101_C	1.304	0.41
176_K	335_R	1.300	0.40
42_K	159_G	1.295	0.40
335_R	338_R	1.261	0.39
159_G	163_T	1.260	0.39
73_H	76_M	1.254	0.38
317_T	328_S	1.251	0.38
15_I	37_I	1.249	0.38
208_I	333_F	1.232	0.37
267_A	328_S	1.228	0.37
95_H	110_L	1.213	0.36
225_Y	289_R	1.203	0.36
81_T	86_Q	1.197	0.36
73_H	77_M	1.186	0.35
195_N	219_N	1.180	0.35
48_Y	158_I	1.179	0.35
108_V	184_V	1.176	0.35
267_A	311_V	1.175	0.35
226_I	238_A	1.173	0.35
226_I	274_S	1.171	0.35
15_I	22_F	1.170	0.34
179_Q	221_K	1.164	0.34
31_A	82_S	1.153	0.34
45_K	163_T	1.150	0.34
8_I	194_I	1.149	0.34
94_P	101_C	1.146	0.33
181_D	217_E	1.142	0.33
62_Q	67_A	1.138	0.33
314_H	318_K	1.137	0.33
101_C	110_L	1.106	0.32
292_D	342_R	1.101	0.31
228_D	294_S	1.100	0.31
91_L	109_K	1.097	0.31
122_R	141_M	1.094	0.31
208_I	236_G	1.080	0.31
241_E	297_M	1.073	0.30
52_M	80_F	1.064	0.30
198_V	209_A	1.064	0.30
188_R	215_R	1.063	0.30
8_I	128_I	1.063	0.30
26_R	68_D	1.062	0.30
132_A	135_I	1.061	0.30
31_A	78_Q	1.061	0.30
141_M	220_V	1.050	0.29
4_K	48_Y	1.049	0.29
54_T	139_E	1.045	0.29
190_G	206_D	1.039	0.29
294_S	299_E	1.037	0.29
22_F	183_Q	1.036	0.29
54_T	76_M	1.034	0.29
199_G	292_D	1.028	0.28
15_I	30_L	1.017	0.28
183_Q	217_E	1.016	0.28
282_K	318_K	1.015	0.28
206_D	346_D	1.012	0.28
26_R	75_L	1.007	0.28
285_F	329_L	0.998	0.27
212_G	274_S	0.997	0.27
37_I	76_M	0.996	0.27
16_S	31_A	0.995	0.27
281_Y	298_I	0.990	0.27
42_K	45_K	0.978	0.26
68_D	72_P	0.977	0.26
73_H	170_H	0.964	0.26
171_V	238_A	0.963	0.26
226_I	306_S	0.961	0.26
116_A	119_A	0.960	0.26
48_Y	62_Q	0.956	0.26
320_K	325_R	0.946	0.25
209_A	328_S	0.944	0.25
85_V	141_M	0.940	0.25
135_I	147_R	0.940	0.25
30_L	72_P	0.937	0.25
21_D	29_K	0.937	0.25
80_F	143_I	0.935	0.25
218_I	235_T	0.935	0.25
199_G	249_D	0.934	0.25
277_P	308_T	0.933	0.25
271_L	337_L	0.928	0.25
14_L	30_L	0.927	0.25
41_L	44_Q	0.924	0.24
24_V	72_P	0.920	0.24
36_V	85_V	0.918	0.24
22_F	97_P	0.913	0.24
288_Q	294_S	0.911	0.24
180_I	242_A	0.909	0.24
317_T	329_L	0.908	0.24
168_Y	183_Q	0.907	0.24
273_I	309_M	0.899	0.24
199_G	289_R	0.897	0.24
62_Q	226_I	0.896	0.23
271_L	336_T	0.889	0.23
282_K	316_K	0.886	0.23
93_C	312_T	0.879	0.23
66_Q	71_G	0.879	0.23
135_I	146_L	0.878	0.23
18_P	21_D	0.878	0.23
24_V	64_F	0.876	0.23
50_L	152_T	0.875	0.23
127_V	138_A	0.870	0.23
164_R	343_V	0.869	0.23
124_N	216_M	0.864	0.22
27_F	64_F	0.862	0.22
75_L	114_Y	0.857	0.22
328_S	332_A	0.856	0.22
228_D	273_I	0.854	0.22
4_K	288_Q	0.853	0.22
89_E	218_I	0.850	0.22
111_V	122_R	0.849	0.22
136_Q	226_I	0.846	0.22
185_W	215_R	0.844	0.22
283_A	329_L	0.843	0.22
141_M	317_T	0.843	0.22
68_D	71_G	0.841	0.22
31_A	98_A	0.837	0.21
162_L	275_G	0.835	0.21
180_I	238_A	0.835	0.21
209_A	241_E	0.833	0.21
126_Y	146_L	0.832	0.21
89_E	112_E	0.832	0.21
210_T	256_F	0.831	0.21
120_M	325_R	0.829	0.21
16_S	146_L	0.825	0.21
25_D	29_K	0.824	0.21
101_C	136_Q	0.818	0.21
111_V	120_M	0.817	0.21
269_C	315_L	0.814	0.21
266_L	316_K	0.806	0.20
226_I	242_A	0.805	0.20
146_L	153_L	0.803	0.20
37_I	97_P	0.802	0.20
256_F	332_A	0.802	0.20
148_Y	351_S	0.799	0.20
171_V	277_P	0.796	0.20
35_G	39_E	0.793	0.20
4_K	248_G	0.785	0.20
32_F	311_V	0.784	0.20
271_L	342_R	0.784	0.20
208_I	271_L	0.782	0.20
171_V	242_A	0.782	0.20
93_C	273_I	0.782	0.20
193_K	219_N	0.780	0.20
317_T	325_R	0.774	0.19
208_I	337_L	0.771	0.19
75_L	79_I	0.768	0.19
159_G	335_R	0.768	0.19
73_H	92_I	0.765	0.19
39_E	206_D	0.761	0.19
170_H	217_E	0.760	0.19
93_C	107_K	0.760	0.19
97_P	110_L	0.758	0.19
251_R	345_G	0.755	0.19
214_F	337_L	0.752	0.19
169_A	238_A	0.748	0.19
14_L	38_P	0.746	0.19
259_V	268_R	0.745	0.19
182_V	231_T	0.743	0.19
266_L	314_H	0.742	0.18
282_K	314_H	0.742	0.18
253_I	271_L	0.741	0.18
259_V	266_L	0.739	0.18
146_L	239_L	0.738	0.18
225_Y	237_L	0.738	0.18
91_L	110_L	0.737	0.18
232_V	346_D	0.737	0.18
148_Y	258_F	0.736	0.18
48_Y	124_N	0.736	0.18
22_F	27_F	0.736	0.18
91_L	145_G	0.736	0.18
273_I	312_T	0.730	0.18
254_C	315_L	0.730	0.18
73_H	158_I	0.730	0.18
48_Y	81_T	0.727	0.18
110_L	182_V	0.725	0.18
73_H	347_T	0.724	0.18
108_V	122_R	0.723	0.18
319_G	322_D	0.722	0.18
80_F	85_V	0.719	0.18
296_E	325_R	0.718	0.18
110_L	212_G	0.717	0.18
312_T	334_G	0.716	0.18
37_I	80_F	0.716	0.18
32_F	325_R	0.715	0.18
94_P	110_L	0.713	0.18
190_G	215_R	0.712	0.18
280_E	351_S	0.710	0.18
33_E	149_D	0.708	0.17
46_A	83_Q	0.706	0.17
97_P	114_Y	0.706	0.17
35_G	220_V	0.701	0.17
30_L	73_H	0.700	0.17
184_V	218_I	0.699	0.17
5_Y	16_S	0.699	0.17
193_K	354_V	0.698	0.17
141_M	256_F	0.696	0.17
77_M	163_T	0.695	0.17
95_H	182_V	0.694	0.17
294_S	312_T	0.693	0.17
120_M	322_D	0.691	0.17
228_D	343_V	0.691	0.17
16_S	20_S	0.690	0.17
5_Y	117_E	0.689	0.17
257_G	336_T	0.688	0.17
24_V	149_D	0.687	0.17
44_Q	136_Q	0.685	0.17
30_L	75_L	0.684	0.17
126_Y	136_Q	0.683	0.17
266_L	338_R	0.683	0.17
81_T	341_I	0.682	0.17
43_L	107_K	0.682	0.17
42_K	100_E	0.681	0.17
309_M	312_T	0.681	0.17
279_L	308_T	0.680	0.17
264_E	299_E	0.680	0.17
116_A	317_T	0.678	0.17
115_L	141_M	0.677	0.17
108_V	112_E	0.677	0.17
237_L	346_D	0.676	0.17
157_M	160_E	0.675	0.17
160_E	315_L	0.674	0.17
249_D	348_L	0.673	0.17
213_G	242_A	0.669	0.16
268_R	314_H	0.669	0.16
48_Y	344_E	0.666	0.16
290_V	306_S	0.666	0.16
153_L	212_G	0.664	0.16
42_K	88_D	0.663	0.16
282_K	320_K	0.662	0.16
195_N	199_G	0.662	0.16
93_C	294_S	0.659	0.16
29_K	64_F	0.659	0.16
83_Q	215_R	0.659	0.16
208_I	265_C	0.658	0.16
280_E	314_H	0.652	0.16
15_I	123_A	0.650	0.16
249_D	306_S	0.650	0.16
259_V	271_L	0.650	0.16
277_P	335_R	0.648	0.16
73_H	340_A	0.648	0.16
150_R	206_D	0.648	0.16
294_S	334_G	0.646	0.16
290_V	320_K	0.644	0.16
275_G	303_R	0.644	0.16
133_T	194_I	0.643	0.16
215_R	228_D	0.641	0.16
75_L	99_D	0.640	0.16
228_D	287_Y	0.640	0.16
73_H	79_I	0.637	0.16
100_E	111_V	0.637	0.16
39_E	159_G	0.636	0.16
312_T	329_L	0.635	0.16
314_H	337_L	0.634	0.15
139_E	154_N	0.634	0.15
68_D	237_L	0.632	0.15
144_T	219_N	0.632	0.15
318_K	325_R	0.632	0.15
5_Y	135_I	0.631	0.15
209_A	292_D	0.631	0.15
171_V	226_I	0.630	0.15
311_V	325_R	0.628	0.15
197_G	202_D	0.628	0.15
161_Q	333_F	0.627	0.15
180_I	285_F	0.627	0.15
37_I	41_L	0.626	0.15
169_A	244_K	0.625	0.15
159_G	164_R	0.625	0.15
160_E	164_R	0.624	0.15
296_E	322_D	0.622	0.15
312_T	349_P	0.619	0.15
264_E	325_R	0.617	0.15
186_L	253_I	0.617	0.15
54_T	94_P	0.616	0.15
83_Q	188_R	0.615	0.15
50_L	85_V	0.615	0.15
141_M	271_L	0.614	0.15
52_M	89_E	0.614	0.15
243_L	311_V	0.613	0.15
91_L	113_R	0.612	0.15
208_I	259_V	0.612	0.15
148_Y	308_T	0.612	0.15
13_T	18_P	0.612	0.15
268_R	318_K	0.612	0.15
32_F	273_I	0.611	0.15
27_F	297_M	0.609	0.15
192_S	328_S	0.608	0.15
256_F	351_S	0.608	0.15
46_A	298_I	0.607	0.15
254_C	264_E	0.606	0.15
210_T	333_F	0.603	0.15
138_A	145_G	0.603	0.15
170_H	179_Q	0.600	0.15
64_F	72_P	0.599	0.15
113_R	124_N	0.598	0.15
159_G	305_L	0.597	0.15
269_C	329_L	0.595	0.15
317_T	332_A	0.595	0.15
305_L	335_R	0.594	0.14
3_Q	235_T	0.593	0.14
213_G	249_D	0.593	0.14
218_I	239_L	0.592	0.14
149_D	308_T	0.591	0.14
18_P	30_L	0.591	0.14
124_N	245_I	0.590	0.14
212_G	345_G	0.589	0.14
30_L	50_L	0.589	0.14
182_V	226_I	0.588	0.14
53_I	251_R	0.587	0.14
97_P	107_K	0.586	0.14
198_V	299_E	0.586	0.14
81_T	236_G	0.585	0.14
148_Y	210_T	0.584	0.14
169_A	210_T	0.582	0.14
209_A	216_M	0.582	0.14
33_E	264_E	0.581	0.14
210_T	329_L	0.581	0.14
22_F	37_I	0.580	0.14
232_V	326_V	0.580	0.14
256_F	269_C	0.580	0.14
123_A	174_N	0.579	0.14
62_Q	192_S	0.579	0.14
24_V	146_L	0.578	0.14
146_L	161_Q	0.577	0.14
21_D	63_S	0.577	0.14
93_C	102_D	0.575	0.14
136_Q	168_Y	0.575	0.14
305_L	315_L	0.574	0.14
292_D	320_K	0.574	0.14
100_E	149_D	0.573	0.14
101_C	148_Y	0.573	0.14
158_I	162_L	0.573	0.14
62_Q	145_G	0.573	0.14
220_V	231_T	0.571	0.14
228_D	334_G	0.568	0.14
271_L	305_L	0.567	0.14
66_Q	94_P	0.566	0.14
122_R	309_M	0.566	0.14
265_C	279_L	0.566	0.14
86_Q	235_T	0.561	0.14
120_M	281_Y	0.561	0.14
237_L	282_K	0.560	0.14
110_L	143_I	0.559	0.14
14_L	99_D	0.557	0.14
216_M	312_T	0.557	0.14
62_Q	74_N	0.555	0.14
198_V	224_L	0.554	0.14
89_E	110_L	0.554	0.14
169_A	184_V	0.554	0.14
278_H	322_D	0.553	0.14
225_Y	292_D	0.553	0.14
90_V	343_V	0.552	0.13
311_V	320_K	0.551	0.13
113_R	253_I	0.551	0.13
141_M	325_R	0.550	0.13
71_G	269_C	0.545	0.13
52_M	73_H	0.545	0.13
54_T	239_L	0.544	0.13
214_F	245_I	0.544	0.13
256_F	309_M	0.544	0.13
70_D	74_N	0.543	0.13
67_A	80_F	0.542	0.13
236_G	297_M	0.540	0.13
163_T	209_A	0.540	0.13
312_T	319_G	0.539	0.13
273_I	311_V	0.539	0.13
148_Y	157_M	0.539	0.13
236_G	311_V	0.536	0.13
264_E	317_T	0.535	0.13
174_N	237_L	0.535	0.13
63_S	137_L	0.534	0.13
208_I	213_G	0.534	0.13
214_F	338_R	0.534	0.13
214_F	243_L	0.530	0.13
197_G	224_L	0.530	0.13
75_L	97_P	0.529	0.13
187_D	287_Y	0.529	0.13
254_C	338_R	0.529	0.13
209_A	354_V	0.527	0.13
85_V	112_E	0.527	0.13
215_R	336_T	0.526	0.13
8_I	13_T	0.526	0.13
167_R	204_M	0.525	0.13
281_Y	311_V	0.525	0.13
136_Q	225_Y	0.523	0.13
73_H	151_E	0.522	0.13
15_I	26_R	0.522	0.13
44_Q	243_L	0.521	0.13
54_T	249_D	0.521	0.13
168_Y	290_V	0.521	0.13
14_L	52_M	0.521	0.13
28_D	68_D	0.520	0.13
209_A	335_R	0.520	0.13
243_L	335_R	0.520	0.13
292_D	341_I	0.520	0.13
221_K	293_L	0.519	0.13
93_C	334_G	0.518	0.13
213_G	236_G	0.518	0.13
48_Y	293_L	0.517	0.13
147_R	305_L	0.517	0.13
228_D	285_F	0.516	0.13
133_T	220_V	0.516	0.13
3_Q	103_C	0.514	0.13
148_Y	329_L	0.514	0.13
184_V	237_L	0.514	0.13
43_L	152_T	0.513	0.13
278_H	307_Y	0.513	0.13
157_M	267_A	0.513	0.13
5_Y	112_E	0.512	0.13
24_V	220_V	0.511	0.13
150_R	153_L	0.511	0.13
109_K	170_H	0.511	0.13
10_R	17_E	0.511	0.13
12_G	17_E	0.511	0.13
62_Q	144_T	0.510	0.13
174_N	221_K	0.509	0.13
266_L	322_D	0.509	0.13
122_R	143_I	0.508	0.13
259_V	348_L	0.508	0.13
33_E	39_E	0.507	0.12
14_L	32_F	0.507	0.12
13_T	127_V	0.506	0.12
123_A	144_T	0.505	0.12
5_Y	340_A	0.504	0.12
20_S	136_Q	0.504	0.12
74_N	238_A	0.503	0.12
14_L	79_I	0.501	0.12
237_L	347_T	0.501	0.12
22_F	113_R	0.501	0.12
182_V	218_I	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4mu3A	6	0.5127	100	0.552	Contact Map
1rhyA	4	0.4901	100	0.554	Contact Map
2ae8A	5	0.4817	100	0.556	Contact Map
4gquA	6	0.5127	100	0.556	Contact Map
2fprA	2	0.4535	100	0.863	Contact Map
3l8hA	1	0.5042	99.9	0.879	Contact Map
2gmwA	1	0.4563	99.9	0.89	Contact Map
4pnhA	4	0.3887	99.8	0.891	Contact Map
2o2xA	1	0.5099	99.8	0.892	Contact Map
3zvlA	1	0.8592	99.8	0.899	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0103 seconds.