FHUB - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

FHUB - Iron(3+)-hydroxamate import system permease protein FhuB

UniProt:	P06972	Sequences: MSKRIALFPALLLALLVIVATALTWMNFSQALPRSQWAQAAWSPDIDVIEQMIFHYSLLPRLAISLLVGAGLGLVGVLFQQVLRNPLAEPTTLGVATGAQLGITVTTLWAIPGAMASQFAAQAGACVVGLIVFGVAWGKRLSPVTLILAGLVVSLYCGAINQLLVIFHHDQLQSMFLWSTGTLTQTDWGGVERLWPQLLGGVMLTLLLLRPLTLMGLDDGVARNLGLALSLARLAALSLAIVISALLVNAVGIIGFIGLFAPLLAKMLGARRLLPRLMLASLIGALILWLSDQIILWLTRVWMEVSTGSVTALIGAPLLLWLLPRLRSISAPDMKVNDRVAAERQHVLAFALAGGVLLLMAVVVALSFGRDAHGWTWASGALLEDLMPWRWPRIMAALFAGVMLAVAGCIIQRLTGNPMASPEVLGISSGAAFGVVLMLFLVPGNAFGWLLPAGSLGAAVTLLIIMIAAGRGGFSPHRMLLAGMALSTAFTMLLMMLQASGDPRMAQVLTWISGSTYNATDAQVWRTGIVMVILLAITPLCRRWLTILPLGGDTARAVGMALTPTRIALLLLAACLTATATMTIGPLSFVGLMAPHIARMMGFRRTMPHIVISALVGGLLLVFADWCGRMVLFPFQIPAGLLSTFIGAPYFIYLLRKQSR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10303
Length:	660 (645)
Sequences:	340 (247)
Seq/√Len:	9.7

ECOLI - FHUB

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
64_I	191_V	5.660	1.00
603_F	612_I	3.946	0.98
410_I	569_L	3.933	0.98
89_E	491_T	3.782	0.98
398_L	618_G	3.602	0.97
137_W	141_L	3.555	0.97
71_G	247_L	3.490	0.97
176_F	636_Q	3.462	0.96
195_W	199_L	3.392	0.96
628_G	639_A	3.214	0.95
158_G	476_P	3.203	0.94
265_A	270_A	3.053	0.93
129_G	241_I	3.005	0.92
179_S	488_T	2.992	0.92
155_L	508_V	2.903	0.91
157_C	649_P	2.897	0.91
33_P	37_W	2.858	0.90
76_G	90_P	2.857	0.90
365_A	394_I	2.841	0.90
44_P	51_Q	2.778	0.89
486_L	620_L	2.650	0.86
268_L	279_L	2.647	0.86
403_M	576_L	2.646	0.86
102_G	120_A	2.629	0.86
64_I	68_V	2.612	0.85
405_A	621_L	2.580	0.85
90_P	262_P	2.576	0.85
541_C	646_I	2.559	0.84
593_M	644_T	2.492	0.82
546_T	606_T	2.443	0.81
97_T	508_V	2.424	0.81
152_V	576_L	2.396	0.80
353_A	356_V	2.362	0.79
64_I	251_V	2.335	0.78
396_A	519_A	2.324	0.78
354_G	615_L	2.305	0.77
76_G	262_P	2.299	0.77
581_T	628_G	2.273	0.76
295_I	465_I	2.271	0.76
427_I	447_F	2.239	0.75
393_R	625_D	2.237	0.75
32_L	37_W	2.221	0.74
437_L	441_L	2.203	0.74
359_L	363_V	2.195	0.73
155_L	255_G	2.181	0.73
434_G	437_L	2.144	0.71
127_V	361_A	2.129	0.71
67_L	206_L	2.109	0.70
163_L	496_M	2.094	0.70
56_Y	578_A	2.082	0.69
364_V	532_V	2.043	0.68
174_S	291_S	2.042	0.68
89_E	179_S	2.038	0.67
161_N	411_I	2.034	0.67
131_I	268_L	2.028	0.67
68_V	247_L	2.002	0.66
566_R	629_R	1.976	0.65
40_A	44_P	1.971	0.65
79_F	293_Q	1.966	0.64
406_V	614_A	1.931	0.63
52_M	370_R	1.916	0.62
419_M	656_R	1.883	0.61
434_G	651_F	1.872	0.61
125_A	546_T	1.806	0.58
280_A	644_T	1.806	0.58
362_V	395_M	1.800	0.57
627_C	642_L	1.799	0.57
70_A	281_S	1.791	0.57
431_A	454_G	1.782	0.57
411_I	427_I	1.773	0.56
156_Y	389_W	1.765	0.56
395_M	528_G	1.762	0.56
95_V	237_L	1.758	0.55
630_M	636_Q	1.747	0.55
75_V	639_A	1.738	0.55
196_P	517_Y	1.738	0.55
433_F	657_K	1.735	0.54
159_A	646_I	1.731	0.54
37_W	51_Q	1.717	0.54
176_F	431_A	1.711	0.53
391_W	521_D	1.709	0.53
361_A	533_I	1.685	0.52
653_Y	657_K	1.678	0.52
131_I	157_C	1.674	0.52
83_L	90_P	1.663	0.51
82_V	236_A	1.663	0.51
461_T	484_M	1.660	0.51
227_L	232_A	1.660	0.51
180_T	652_I	1.653	0.51
307_T	311_T	1.649	0.51
125_A	216_G	1.647	0.50
64_I	190_G	1.642	0.50
129_G	648_A	1.639	0.50
407_A	577_T	1.628	0.50
566_R	638_P	1.623	0.49
638_P	643_S	1.620	0.49
225_L	558_V	1.620	0.49
306_S	309_S	1.617	0.49
454_G	656_R	1.608	0.49
18_I	537_I	1.608	0.49
469_A	654_L	1.600	0.48
63_A	191_V	1.600	0.48
289_W	295_I	1.591	0.48
453_A	651_F	1.585	0.48
194_L	251_V	1.573	0.47
248_V	500_S	1.572	0.47
610_I	646_I	1.569	0.47
488_T	642_L	1.564	0.47
129_G	154_S	1.564	0.47
357_L	533_I	1.563	0.47
253_I	494_L	1.563	0.47
76_G	83_L	1.562	0.47
195_W	536_A	1.537	0.46
356_V	560_M	1.537	0.46
59_L	176_F	1.533	0.45
83_L	172_L	1.533	0.45
147_I	488_T	1.526	0.45
511_W	651_F	1.520	0.45
91_T	423_E	1.519	0.45
65_S	290_L	1.515	0.45
581_T	639_A	1.514	0.45
159_A	655_L	1.509	0.44
176_F	518_N	1.505	0.44
90_P	94_G	1.503	0.44
316_A	651_F	1.502	0.44
125_A	648_A	1.502	0.44
71_G	175_M	1.502	0.44
496_M	606_T	1.501	0.44
89_E	169_H	1.500	0.44
318_L	548_L	1.499	0.44
129_G	620_L	1.494	0.44
102_G	411_I	1.485	0.43
20_A	23_L	1.482	0.43
567_I	631_V	1.479	0.43
58_L	296_L	1.476	0.43
392_P	625_D	1.473	0.43
423_E	458_A	1.470	0.43
19_V	522_A	1.469	0.43
532_V	536_A	1.468	0.42
270_A	275_P	1.464	0.42
277_L	584_I	1.461	0.42
588_S	620_L	1.453	0.42
305_V	310_V	1.450	0.42
33_P	36_Q	1.447	0.42
174_S	179_S	1.447	0.42
163_L	180_T	1.443	0.41
218_D	280_A	1.442	0.41
89_E	293_Q	1.439	0.41
108_L	133_F	1.434	0.41
144_V	561_A	1.434	0.41
91_T	494_L	1.432	0.41
316_A	628_G	1.429	0.41
147_I	386_L	1.429	0.41
28_F	463_L	1.424	0.41
261_A	311_T	1.424	0.41
237_L	642_L	1.423	0.40
79_F	96_A	1.421	0.40
175_M	215_M	1.412	0.40
144_V	620_L	1.406	0.40
268_L	286_L	1.406	0.40
126_C	606_T	1.398	0.39
356_V	646_I	1.395	0.39
48_V	429_S	1.389	0.39
44_P	361_A	1.378	0.39
316_A	454_G	1.376	0.38
267_M	320_L	1.359	0.38
257_I	509_L	1.358	0.38
107_T	151_L	1.351	0.37
389_W	403_M	1.349	0.37
76_G	94_G	1.348	0.37
517_Y	626_W	1.347	0.37
313_L	400_A	1.339	0.37
19_V	22_A	1.337	0.37
502_D	637_I	1.336	0.37
134_G	280_A	1.334	0.37
102_G	195_W	1.319	0.36
65_S	296_L	1.314	0.36
36_Q	48_V	1.312	0.36
123_A	538_T	1.302	0.35
171_Q	175_M	1.301	0.35
431_A	469_A	1.301	0.35
96_A	162_Q	1.298	0.35
75_V	95_V	1.291	0.35
364_V	368_F	1.290	0.35
611_V	618_G	1.287	0.35
629_R	643_S	1.283	0.35
65_S	293_Q	1.281	0.34
539_P	607_M	1.281	0.34
43_S	547_I	1.280	0.34
519_A	540_L	1.276	0.34
590_V	596_H	1.276	0.34
610_I	615_L	1.276	0.34
219_D	245_A	1.269	0.34
555_A	560_M	1.268	0.34
410_I	471_R	1.264	0.34
608_P	616_V	1.260	0.34
290_L	464_I	1.260	0.34
355_G	359_L	1.259	0.34
247_L	260_F	1.257	0.34
195_W	362_V	1.252	0.33
545_L	610_I	1.249	0.33
311_T	318_L	1.246	0.33
149_A	270_A	1.245	0.33
304_E	613_S	1.243	0.33
137_W	389_W	1.242	0.33
166_I	651_F	1.238	0.33
104_T	218_D	1.236	0.33
488_T	491_T	1.231	0.32
166_I	171_Q	1.224	0.32
91_T	424_V	1.221	0.32
253_I	539_P	1.221	0.32
133_F	461_T	1.220	0.32
125_A	654_L	1.219	0.32
219_D	633_F	1.211	0.32
73_G	289_W	1.208	0.32
273_L	276_R	1.202	0.31
260_F	636_Q	1.200	0.31
429_S	450_L	1.200	0.31
119_F	612_I	1.199	0.31
126_C	584_I	1.198	0.31
229_L	652_I	1.189	0.31
570_L	628_G	1.182	0.31
113_G	116_A	1.182	0.31
83_L	262_P	1.181	0.31
159_A	396_A	1.178	0.30
530_V	579_T	1.177	0.30
100_Q	635_F	1.176	0.30
233_R	415_T	1.173	0.30
61_R	292_D	1.173	0.30
537_I	575_C	1.172	0.30
469_A	636_Q	1.162	0.30
133_F	424_V	1.162	0.30
170_D	636_Q	1.158	0.30
89_E	488_T	1.157	0.30
265_A	283_I	1.155	0.30
35_S	352_L	1.155	0.30
605_R	608_P	1.154	0.29
365_A	470_G	1.154	0.29
21_T	232_A	1.153	0.29
396_A	548_L	1.150	0.29
565_T	645_F	1.150	0.29
66_L	286_L	1.148	0.29
145_T	154_S	1.146	0.29
632_L	636_Q	1.142	0.29
55_H	409_C	1.139	0.29
156_Y	293_Q	1.137	0.29
79_F	162_Q	1.137	0.29
516_T	628_G	1.136	0.29
151_L	302_W	1.136	0.29
130_L	157_C	1.136	0.29
186_T	651_F	1.135	0.29
149_A	441_L	1.131	0.29
147_I	492_M	1.127	0.28
298_L	529_I	1.125	0.28
89_E	104_T	1.125	0.28
257_I	383_L	1.124	0.28
83_L	641_L	1.123	0.28
463_L	528_G	1.118	0.28
105_V	109_W	1.117	0.28
16_L	355_G	1.115	0.28
118_Q	648_A	1.115	0.28
89_E	527_T	1.113	0.28
488_T	645_F	1.113	0.28
88_A	550_L	1.112	0.28
113_G	296_L	1.112	0.28
306_S	484_M	1.112	0.28
96_A	655_L	1.111	0.28
174_S	547_I	1.110	0.28
30_Q	122_Q	1.107	0.28
144_V	513_S	1.106	0.28
34_R	136_A	1.102	0.28
508_V	620_L	1.099	0.27
465_I	547_I	1.098	0.27
206_L	360_M	1.097	0.27
12_L	355_G	1.094	0.27
89_E	468_A	1.093	0.27
157_C	651_F	1.093	0.27
73_G	163_L	1.088	0.27
389_W	474_F	1.082	0.27
21_T	624_A	1.080	0.27
501_G	594_A	1.078	0.27
629_R	638_P	1.078	0.27
104_T	176_F	1.077	0.27
104_T	484_M	1.076	0.27
400_A	431_A	1.075	0.27
23_L	562_L	1.069	0.26
469_A	507_Q	1.069	0.26
196_P	214_L	1.068	0.26
313_L	637_I	1.067	0.26
79_F	95_V	1.067	0.26
235_A	541_C	1.066	0.26
176_F	654_L	1.065	0.26
19_V	354_G	1.065	0.26
359_L	364_V	1.065	0.26
203_M	235_A	1.063	0.26
139_K	644_T	1.062	0.26
343_E	347_V	1.062	0.26
320_L	453_A	1.061	0.26
206_L	261_A	1.058	0.26
233_R	580_A	1.057	0.26
167_F	651_F	1.056	0.26
272_R	275_P	1.056	0.26
89_E	327_R	1.055	0.26
179_S	635_F	1.053	0.26
133_F	419_M	1.049	0.26
625_D	639_A	1.048	0.26
14_A	360_M	1.047	0.26
88_A	233_R	1.046	0.26
63_A	353_A	1.045	0.26
561_A	573_A	1.044	0.26
107_T	125_A	1.039	0.25
89_E	540_L	1.039	0.25
28_F	33_P	1.036	0.25
125_A	414_L	1.036	0.25
566_R	643_S	1.036	0.25
639_A	651_F	1.035	0.25
232_A	464_I	1.034	0.25
18_I	22_A	1.032	0.25
123_A	610_I	1.032	0.25
423_E	624_A	1.032	0.25
190_G	250_A	1.029	0.25
174_S	248_V	1.027	0.25
441_L	525_W	1.026	0.25
89_E	649_P	1.026	0.25
191_V	196_P	1.024	0.25
61_R	94_G	1.024	0.25
121_A	309_S	1.023	0.25
71_G	243_I	1.021	0.25
61_R	76_G	1.021	0.25
273_L	320_L	1.020	0.25
79_F	89_E	1.019	0.25
151_L	180_T	1.019	0.25
261_A	275_P	1.018	0.25
21_T	123_A	1.016	0.25
146_L	465_I	1.015	0.25
61_R	266_K	1.015	0.25
431_A	649_P	1.014	0.25
314_I	597_I	1.007	0.24
311_T	584_I	1.007	0.24
170_D	651_F	1.007	0.24
100_Q	434_G	1.006	0.24
137_W	490_F	1.004	0.24
285_A	532_V	1.002	0.24
89_E	539_P	1.002	0.24
167_F	234_L	1.001	0.24
84_R	139_K	1.000	0.24
113_G	159_A	0.999	0.24
113_G	260_F	0.998	0.24
131_I	509_L	0.998	0.24
218_D	490_F	0.997	0.24
105_V	613_S	0.996	0.24
601_M	609_H	0.996	0.24
508_V	609_H	0.995	0.24
100_Q	637_I	0.991	0.24
437_L	646_I	0.991	0.24
239_L	427_I	0.989	0.24
96_A	484_M	0.983	0.23
187_D	552_G	0.981	0.23
353_A	537_I	0.980	0.23
89_E	244_S	0.978	0.23
272_R	310_V	0.977	0.23
255_G	405_A	0.977	0.23
596_H	650_Y	0.976	0.23
159_A	620_L	0.976	0.23
118_Q	279_L	0.974	0.23
427_I	467_I	0.973	0.23
188_W	258_G	0.973	0.23
51_Q	55_H	0.967	0.23
255_G	326_L	0.966	0.23
65_S	493_L	0.964	0.23
147_I	546_T	0.963	0.23
239_L	533_I	0.962	0.23
170_D	498_Q	0.957	0.23
358_L	614_A	0.956	0.23
79_F	403_M	0.956	0.23
215_M	290_L	0.953	0.23
59_L	609_H	0.953	0.23
464_I	536_A	0.952	0.23
435_V	496_M	0.951	0.22
179_S	651_F	0.951	0.22
114_A	492_M	0.950	0.22
167_F	218_D	0.950	0.22
420_A	476_P	0.948	0.22
91_T	429_S	0.948	0.22
196_P	377_W	0.945	0.22
61_R	543_R	0.944	0.22
15_L	21_T	0.944	0.22
66_L	285_A	0.943	0.22
628_G	637_I	0.943	0.22
329_I	560_M	0.942	0.22
129_G	142_S	0.941	0.22
372_A	377_W	0.941	0.22
316_A	556_R	0.941	0.22
534_L	572_L	0.940	0.22
149_A	313_L	0.940	0.22
370_R	374_G	0.940	0.22
65_S	148_L	0.939	0.22
48_V	622_V	0.938	0.22
177_L	253_I	0.937	0.22
83_L	94_G	0.937	0.22
192_E	463_L	0.936	0.22
132_V	248_V	0.930	0.22
61_R	90_P	0.929	0.22
385_D	416_G	0.925	0.22
131_I	153_V	0.923	0.22
94_G	262_P	0.923	0.22
431_A	630_M	0.923	0.22
125_A	238_S	0.921	0.22
160_I	419_M	0.918	0.21
434_G	453_A	0.917	0.21
161_N	227_L	0.916	0.21
152_V	322_L	0.915	0.21
538_T	614_A	0.915	0.21
517_Y	628_G	0.912	0.21
232_A	583_T	0.911	0.21
316_A	498_Q	0.910	0.21
104_T	492_M	0.908	0.21
465_I	479_M	0.906	0.21
170_D	637_I	0.906	0.21
391_W	525_W	0.905	0.21
12_L	590_V	0.903	0.21
315_G	638_P	0.901	0.21
21_T	537_I	0.900	0.21
203_M	282_L	0.898	0.21
192_E	195_W	0.897	0.21
144_V	151_L	0.896	0.21
199_L	471_R	0.896	0.21
158_G	637_I	0.895	0.21
18_I	30_Q	0.895	0.21
311_T	504_R	0.894	0.21
151_L	504_R	0.894	0.21
255_G	462_L	0.893	0.21
377_W	475_S	0.892	0.21
480_L	643_S	0.891	0.21
304_E	645_F	0.891	0.21
499_A	557_A	0.891	0.21
89_E	157_C	0.890	0.21
106_T	201_G	0.888	0.21
368_F	529_I	0.888	0.21
369_G	641_L	0.888	0.21
141_L	652_I	0.887	0.21
81_Q	276_R	0.887	0.21
141_L	657_K	0.884	0.20
211_P	240_A	0.882	0.20
594_A	617_G	0.882	0.20
61_R	413_R	0.881	0.20
53_I	62_L	0.878	0.20
96_A	515_S	0.878	0.20
127_V	568_A	0.878	0.20
537_I	622_V	0.878	0.20
360_M	568_A	0.876	0.20
78_L	513_S	0.876	0.20
141_L	146_L	0.874	0.20
459_A	622_V	0.874	0.20
262_P	594_A	0.873	0.20
143_P	225_L	0.872	0.20
581_T	626_W	0.871	0.20
151_L	414_L	0.869	0.20
450_L	508_V	0.869	0.20
210_R	578_A	0.869	0.20
42_W	355_G	0.868	0.20
101_L	431_A	0.867	0.20
233_R	629_R	0.867	0.20
100_Q	423_E	0.865	0.20
45_D	528_G	0.865	0.20
196_P	636_Q	0.864	0.20
272_R	531_M	0.862	0.20
326_L	605_R	0.860	0.20
576_L	650_Y	0.860	0.20
35_S	360_M	0.860	0.20
26_M	657_K	0.859	0.20
266_K	543_R	0.857	0.20
54_F	498_Q	0.857	0.20
97_T	280_A	0.855	0.20
517_Y	639_A	0.854	0.20
313_L	619_L	0.852	0.20
586_P	589_F	0.851	0.19
285_A	369_G	0.850	0.19
180_T	491_T	0.850	0.19
402_V	406_V	0.849	0.19
419_M	502_D	0.848	0.19
79_F	173_Q	0.847	0.19
259_L	602_G	0.846	0.19
152_V	484_M	0.842	0.19
406_V	534_L	0.839	0.19
419_M	630_M	0.838	0.19
248_V	454_G	0.838	0.19
562_L	608_P	0.835	0.19
78_L	205_T	0.835	0.19
23_L	487_S	0.835	0.19
416_G	544_W	0.834	0.19
146_L	394_I	0.831	0.19
364_V	606_T	0.831	0.19
264_L	295_I	0.829	0.19
89_E	144_V	0.827	0.19
34_R	37_W	0.825	0.19
286_L	298_L	0.825	0.19
197_Q	255_G	0.823	0.19
177_L	648_A	0.822	0.19
52_M	547_I	0.820	0.19
76_G	400_A	0.820	0.19
244_S	298_L	0.819	0.19
322_L	629_R	0.819	0.19
235_A	365_A	0.819	0.19
402_V	579_T	0.817	0.19
74_L	281_S	0.816	0.19
141_L	490_F	0.816	0.19
281_S	451_L	0.816	0.19
68_V	429_S	0.815	0.18
179_S	491_T	0.812	0.18
179_S	645_F	0.810	0.18
176_F	312_A	0.810	0.18
154_S	176_F	0.810	0.18
57_S	187_D	0.810	0.18
399_F	524_V	0.810	0.18
132_V	153_V	0.808	0.18
445_N	479_M	0.808	0.18
152_V	624_A	0.805	0.18
45_D	136_A	0.803	0.18
307_T	396_A	0.803	0.18
52_M	171_Q	0.803	0.18
108_L	638_P	0.803	0.18
151_L	582_M	0.802	0.18
471_R	538_T	0.801	0.18
16_L	438_M	0.799	0.18
282_L	427_I	0.799	0.18
304_E	488_T	0.798	0.18
432_A	576_L	0.797	0.18
309_S	313_L	0.797	0.18
316_A	573_A	0.793	0.18
66_L	272_R	0.792	0.18
71_G	267_M	0.790	0.18
57_S	652_I	0.789	0.18
459_A	623_F	0.789	0.18
196_P	519_A	0.789	0.18
68_V	639_A	0.787	0.18
410_I	574_A	0.787	0.18
16_L	28_F	0.785	0.18
494_L	654_L	0.784	0.18
439_L	503_P	0.780	0.18
590_V	600_M	0.779	0.18
236_A	512_I	0.778	0.17
348_L	354_G	0.776	0.17
349_A	529_I	0.775	0.17
123_A	202_V	0.775	0.17
353_A	615_L	0.774	0.17
209_L	545_L	0.772	0.17
174_S	630_M	0.772	0.17
66_L	159_A	0.772	0.17
61_R	83_L	0.771	0.17
233_R	480_L	0.770	0.17
64_I	573_A	0.770	0.17
163_L	398_L	0.769	0.17
512_I	573_A	0.769	0.17
143_P	233_R	0.768	0.17
172_L	207_L	0.767	0.17
116_A	531_M	0.767	0.17
127_V	206_L	0.766	0.17
177_L	475_S	0.766	0.17
486_L	521_D	0.764	0.17
15_L	278_M	0.764	0.17
352_L	360_M	0.763	0.17
245_A	547_I	0.762	0.17
225_L	233_R	0.762	0.17
262_P	281_S	0.761	0.17
636_Q	642_L	0.759	0.17
169_H	179_S	0.759	0.17
99_A	285_A	0.758	0.17
270_A	279_L	0.758	0.17
151_L	616_V	0.757	0.17
512_I	547_I	0.756	0.17
48_V	616_V	0.756	0.17
497_L	503_P	0.756	0.17
211_P	629_R	0.754	0.17
282_L	529_I	0.754	0.17
38_A	41_A	0.754	0.17
95_V	458_A	0.753	0.17
214_L	546_T	0.752	0.17
312_A	320_L	0.750	0.17
59_L	146_L	0.750	0.17
18_I	557_A	0.750	0.17
186_T	309_S	0.749	0.17
626_W	639_A	0.749	0.17
491_T	565_T	0.749	0.17
84_R	323_L	0.747	0.17
302_W	446_A	0.747	0.17
268_L	314_I	0.747	0.17
166_I	354_G	0.747	0.17
86_P	580_A	0.745	0.17
249_N	279_L	0.744	0.17
479_M	648_A	0.744	0.17
498_Q	651_F	0.743	0.17
109_W	493_L	0.742	0.17
200_G	253_I	0.737	0.16
105_V	355_G	0.736	0.16
154_S	179_S	0.735	0.16
19_V	352_L	0.734	0.16
197_Q	310_V	0.734	0.16
326_L	478_R	0.730	0.16
321_W	407_A	0.729	0.16
180_T	488_T	0.729	0.16
18_I	623_F	0.728	0.16
159_A	444_G	0.728	0.16
101_L	325_R	0.727	0.16
21_T	360_M	0.727	0.16
574_A	639_A	0.724	0.16
120_A	651_F	0.724	0.16
146_L	187_D	0.724	0.16
148_L	648_A	0.719	0.16
62_L	485_A	0.718	0.16
577_T	641_L	0.718	0.16
74_L	524_V	0.717	0.16
48_V	257_I	0.715	0.16
54_F	78_L	0.714	0.16
414_L	618_G	0.714	0.16
536_A	597_I	0.713	0.16
19_V	353_A	0.713	0.16
289_W	434_G	0.712	0.16
393_R	431_A	0.711	0.16
587_L	633_F	0.710	0.16
172_L	485_A	0.710	0.16
398_L	636_Q	0.708	0.16
309_S	629_R	0.708	0.16
291_S	620_L	0.708	0.16
182_T	472_G	0.708	0.16
198_L	262_P	0.706	0.16
403_M	531_M	0.705	0.16
578_A	655_L	0.703	0.16
316_A	436_V	0.703	0.16
141_L	616_V	0.702	0.16
133_F	224_N	0.701	0.16
120_A	446_A	0.699	0.16
130_L	395_M	0.698	0.15
342_A	579_T	0.697	0.15
232_A	571_L	0.696	0.15
292_D	413_R	0.695	0.15
86_P	141_L	0.695	0.15
549_P	580_A	0.694	0.15
480_L	580_A	0.692	0.15
42_W	353_A	0.691	0.15
142_S	581_T	0.690	0.15
436_V	494_L	0.689	0.15
415_T	550_L	0.688	0.15
172_L	389_W	0.688	0.15
73_G	359_L	0.688	0.15
49_I	424_V	0.688	0.15
145_T	323_L	0.687	0.15
205_T	531_M	0.686	0.15
64_I	424_V	0.686	0.15
125_A	174_S	0.685	0.15
40_A	587_L	0.685	0.15
316_A	517_Y	0.684	0.15
151_L	423_E	0.684	0.15
153_V	177_L	0.683	0.15
169_H	637_I	0.681	0.15
633_F	648_A	0.681	0.15
501_G	578_A	0.680	0.15
35_S	123_A	0.679	0.15
206_L	209_L	0.678	0.15
119_F	140_R	0.678	0.15
582_M	588_S	0.677	0.15
68_V	508_V	0.677	0.15
491_T	613_S	0.675	0.15
305_V	610_I	0.673	0.15
318_L	504_R	0.673	0.15
42_W	633_F	0.672	0.15
76_G	594_A	0.671	0.15
643_S	657_K	0.670	0.15
73_G	268_L	0.670	0.15
521_D	533_I	0.669	0.15
180_T	289_W	0.668	0.15
13_L	28_F	0.668	0.15
429_S	491_T	0.668	0.15
16_L	370_R	0.668	0.15
532_V	613_S	0.667	0.15
187_D	369_G	0.666	0.15
18_I	34_R	0.666	0.15
169_H	429_S	0.666	0.15
397_A	641_L	0.666	0.15
17_V	341_A	0.665	0.15
14_A	352_L	0.664	0.15
138_G	638_P	0.663	0.15
237_L	646_I	0.662	0.15
97_T	215_M	0.661	0.15
168_H	636_Q	0.661	0.15
302_W	305_V	0.660	0.15
68_V	477_H	0.660	0.15
102_G	371_D	0.658	0.15
108_L	164_L	0.658	0.15
263_L	400_A	0.657	0.15
14_A	560_M	0.657	0.15
411_I	621_L	0.656	0.15
84_R	474_F	0.656	0.15
90_P	594_A	0.655	0.15
166_I	234_L	0.655	0.15
66_L	561_A	0.654	0.14
469_A	561_A	0.654	0.14
574_A	581_T	0.653	0.14
201_G	319_L	0.651	0.14
89_E	506_A	0.649	0.14
120_A	305_V	0.649	0.14
173_Q	636_Q	0.648	0.14
626_W	650_Y	0.648	0.14
238_S	278_M	0.646	0.14
153_V	341_A	0.646	0.14
388_P	471_R	0.645	0.14
18_I	657_K	0.645	0.14
522_A	532_V	0.645	0.14
350_F	612_I	0.644	0.14
132_V	427_I	0.643	0.14
232_A	289_W	0.642	0.14
234_L	536_A	0.641	0.14
127_V	286_L	0.641	0.14
639_A	647_G	0.640	0.14
137_W	218_D	0.640	0.14
410_I	429_S	0.640	0.14
550_L	587_L	0.640	0.14
386_L	629_R	0.637	0.14
171_Q	402_V	0.635	0.14
356_V	360_M	0.634	0.14
579_T	593_M	0.634	0.14
133_F	519_A	0.634	0.14
179_S	309_S	0.631	0.14
419_M	504_R	0.631	0.14
465_I	618_G	0.630	0.14
289_W	490_F	0.630	0.14
394_I	622_V	0.630	0.14
41_A	616_V	0.629	0.14
478_R	485_A	0.628	0.14
90_P	168_H	0.628	0.14
411_I	414_L	0.627	0.14
130_L	204_L	0.627	0.14
93_L	188_W	0.626	0.14
354_G	361_A	0.624	0.14
152_V	403_M	0.624	0.14
156_Y	229_L	0.623	0.14
398_L	590_V	0.623	0.14
65_S	356_V	0.622	0.14
322_L	480_L	0.622	0.14
564_P	657_K	0.621	0.14
186_T	648_A	0.619	0.14
423_E	582_M	0.619	0.14
19_V	607_M	0.617	0.14
460_V	575_C	0.616	0.14
384_E	613_S	0.616	0.14
64_I	187_D	0.615	0.14
384_E	410_I	0.614	0.14
207_L	279_L	0.614	0.14
97_T	620_L	0.614	0.14
596_H	626_W	0.614	0.14
95_V	432_A	0.613	0.14
117_S	279_L	0.613	0.14
168_H	201_G	0.613	0.14
151_L	170_D	0.612	0.14
169_H	291_S	0.611	0.14
261_A	550_L	0.611	0.14
161_N	613_S	0.611	0.14
77_V	402_V	0.611	0.14
338_D	414_L	0.610	0.14
18_I	202_V	0.609	0.14
130_L	610_I	0.608	0.13
553_D	560_M	0.607	0.13
598_A	646_I	0.607	0.13
286_L	366_L	0.607	0.13
316_A	429_S	0.605	0.13
13_L	353_A	0.605	0.13
62_L	298_L	0.605	0.13
111_I	247_L	0.604	0.13
335_K	360_M	0.604	0.13
292_D	543_R	0.604	0.13
416_G	548_L	0.604	0.13
95_V	656_R	0.604	0.13
18_I	334_M	0.603	0.13
180_T	434_G	0.603	0.13
197_Q	276_R	0.602	0.13
87_L	545_L	0.602	0.13
228_A	413_R	0.602	0.13
156_Y	320_L	0.600	0.13
20_A	236_A	0.600	0.13
70_A	262_P	0.600	0.13
389_W	576_L	0.600	0.13
261_A	307_T	0.599	0.13
223_R	265_A	0.598	0.13
84_R	240_A	0.597	0.13
82_V	512_I	0.596	0.13
42_W	290_L	0.595	0.13
134_G	146_L	0.595	0.13
88_A	629_R	0.594	0.13
613_S	655_L	0.593	0.13
259_L	524_V	0.593	0.13
28_F	349_A	0.591	0.13
440_F	502_D	0.591	0.13
381_A	437_L	0.590	0.13
250_A	347_V	0.590	0.13
79_F	237_L	0.590	0.13
158_G	248_V	0.590	0.13
429_S	565_T	0.589	0.13
78_L	621_L	0.586	0.13
566_R	599_R	0.585	0.13
438_M	453_A	0.585	0.13
276_R	443_P	0.585	0.13
180_T	651_F	0.584	0.13
356_V	575_C	0.584	0.13
64_I	234_L	0.584	0.13
225_L	415_T	0.583	0.13
161_N	224_N	0.581	0.13
148_L	633_F	0.581	0.13
264_L	289_W	0.581	0.13
276_R	316_A	0.581	0.13
157_C	244_S	0.580	0.13
624_A	652_I	0.580	0.13
13_L	19_V	0.579	0.13
545_L	602_G	0.579	0.13
410_I	541_C	0.579	0.13
519_A	572_L	0.578	0.13
52_M	416_G	0.578	0.13
604_R	613_S	0.577	0.13
223_R	427_I	0.577	0.13
91_T	491_T	0.576	0.13
147_I	406_V	0.576	0.13
248_V	570_L	0.576	0.13
151_L	642_L	0.573	0.13
57_S	305_V	0.573	0.13
283_I	302_W	0.572	0.13
65_S	557_A	0.572	0.13
403_M	504_R	0.572	0.13
110_A	448_G	0.572	0.13
67_L	198_L	0.572	0.13
202_V	360_M	0.571	0.13
332_P	497_L	0.571	0.13
127_V	358_L	0.570	0.13
305_V	475_S	0.568	0.13
516_T	639_A	0.568	0.13
28_F	41_A	0.568	0.13
547_I	556_R	0.568	0.13
95_V	596_H	0.567	0.13
65_S	108_L	0.567	0.13
73_G	276_R	0.567	0.13
13_L	529_I	0.567	0.13
63_A	604_R	0.567	0.13
218_D	314_I	0.566	0.13
313_L	573_A	0.566	0.13
59_L	654_L	0.566	0.13
156_Y	603_F	0.565	0.13
151_L	507_Q	0.565	0.13
147_I	535_L	0.565	0.13
25_W	203_M	0.564	0.13
27_N	187_D	0.564	0.13
76_G	84_R	0.563	0.13
167_F	174_S	0.562	0.13
175_M	498_Q	0.562	0.13
322_L	400_A	0.562	0.13
116_A	312_A	0.561	0.13
498_Q	570_L	0.561	0.13
179_S	576_L	0.560	0.13
549_P	615_L	0.559	0.12
168_H	262_P	0.559	0.12
239_L	297_W	0.558	0.12
451_L	455_S	0.557	0.12
176_F	450_L	0.557	0.12
404_L	427_I	0.555	0.12
137_W	143_P	0.555	0.12
168_H	171_Q	0.554	0.12
199_L	290_L	0.554	0.12
584_I	587_L	0.553	0.12
149_A	363_V	0.553	0.12
241_I	323_L	0.552	0.12
421_S	495_M	0.550	0.12
476_P	569_L	0.549	0.12
470_G	488_T	0.549	0.12
561_A	571_L	0.549	0.12
319_L	544_W	0.548	0.12
391_W	508_V	0.547	0.12
163_L	584_I	0.546	0.12
105_V	529_I	0.545	0.12
176_F	642_L	0.545	0.12
117_S	324_P	0.544	0.12
105_V	108_L	0.543	0.12
216_G	280_A	0.543	0.12
291_S	324_P	0.543	0.12
198_L	575_C	0.541	0.12
548_L	599_R	0.541	0.12
108_L	151_L	0.541	0.12
383_L	540_L	0.540	0.12
217_L	406_V	0.540	0.12
100_Q	145_T	0.539	0.12
467_I	583_T	0.539	0.12
581_T	651_F	0.537	0.12
158_G	428_S	0.537	0.12
350_F	361_A	0.535	0.12
339_R	657_K	0.535	0.12
346_H	349_A	0.534	0.12
236_A	263_L	0.534	0.12
75_V	244_S	0.532	0.12
131_I	597_I	0.532	0.12
234_L	597_I	0.532	0.12
265_A	455_S	0.530	0.12
154_S	469_A	0.529	0.12
78_L	128_V	0.529	0.12
335_K	565_T	0.528	0.12
134_G	352_L	0.527	0.12
491_T	495_M	0.526	0.12
362_V	533_I	0.526	0.12
61_R	262_P	0.525	0.12
351_A	463_L	0.525	0.12
59_L	192_E	0.524	0.12
356_V	460_V	0.524	0.12
141_L	154_S	0.524	0.12
361_A	619_L	0.524	0.12
36_Q	353_A	0.523	0.12
225_L	544_W	0.523	0.12
143_P	423_E	0.522	0.12
486_L	636_Q	0.522	0.12
57_S	76_G	0.522	0.12
68_V	601_M	0.521	0.12
487_S	573_A	0.520	0.12
406_V	646_I	0.520	0.12
489_A	534_L	0.518	0.12
434_G	535_L	0.518	0.12
392_P	516_T	0.518	0.12
456_L	536_A	0.518	0.12
528_G	596_H	0.517	0.12
324_P	478_R	0.517	0.12
487_S	638_P	0.516	0.12
624_A	640_G	0.516	0.12
174_S	635_F	0.516	0.12
125_A	331_A	0.516	0.12
102_G	267_M	0.515	0.12
154_S	450_L	0.515	0.12
277_L	427_I	0.515	0.12
257_I	578_A	0.515	0.12
176_F	523_Q	0.514	0.12
144_V	486_L	0.514	0.12
103_I	477_H	0.514	0.12
113_G	138_G	0.513	0.12
176_F	210_R	0.513	0.12
174_S	309_S	0.513	0.12
83_L	588_S	0.513	0.12
566_R	577_T	0.512	0.12
146_L	439_L	0.512	0.12
90_P	198_L	0.512	0.12
479_M	618_G	0.512	0.12
304_E	643_S	0.512	0.12
78_L	176_F	0.511	0.12
264_L	487_S	0.511	0.12
56_Y	166_I	0.511	0.12
151_L	593_M	0.510	0.12
89_E	180_T	0.509	0.12
451_L	601_M	0.509	0.12
86_P	480_L	0.509	0.12
458_A	624_A	0.509	0.12
131_I	623_F	0.508	0.12
296_L	307_T	0.508	0.12
188_W	309_S	0.507	0.11
445_N	651_F	0.507	0.11
260_F	465_I	0.507	0.11
441_L	651_F	0.507	0.11
180_T	535_L	0.507	0.11
260_F	461_T	0.507	0.11
17_V	362_V	0.507	0.11
33_P	601_M	0.506	0.11
487_S	643_S	0.505	0.11
83_L	86_P	0.505	0.11
128_V	452_P	0.504	0.11
119_F	484_M	0.504	0.11
96_A	125_A	0.503	0.11
132_V	428_S	0.501	0.11
143_P	311_T	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qi9A	2	0.4864	100	0.743	Contact Map
4g1uA	2	0.447	100	0.746	Contact Map
2nq2A	2	0.4636	100	0.748	Contact Map
2m20A	2	0.0364	11.1	0.989	Contact Map
3ffvA	1	0.0909	6.4	0.99	Contact Map
2m67A	1	0.0742	6	0.99	Contact Map
2l9uA	2	0.0409	4.2	0.991	Contact Map
4cbkA	3	0.0667	4.2	0.991	Contact Map
1iijA	1	0.053	3.1	0.991	Contact Map
2kluA	1	0.0576	2.7	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0147 seconds.