DLD - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

DLD - D-lactate dehydrogenase

UniProt:	P06149	Sequences: MSSMTTTDNKAFLNELARLVGSSHLLTDPAKTARYRKGFRSGQGDALAVVFPGSLLELWRVLKACVTADKIILMQAANTGLTEGSTPNGNDYDRDVVIISTLRLDKLHVLGKGEQVLAYPGTTLYSLEKALKPLGREPHSVIGSSCIGASVIGGICNNSGGSLVQRGPAYTEMSLFARINEDGKLTLVNHLGIDLGETPEQILSKLDDDRIKDDDVRHDGRHAHDYDYVHRVRDIEADTPARYNADPDRLFESSGCAGKLAVFAVRLDTFEAEKNQQVFYIGTNQPEVLTEIRRHILANFENLPVAGEYMHRDIYDIAEKYGKDTFLMIDKLGTDKMPFFFNLKGRTDAMLEKVKFFRPHFTDRAMQKFGHLFPSHLPPRMKNWRDKYEHHLLLKMAGDGVGEAKSWLVDYFKQAEGDFFVCTPEEGSKAFLHRFAAAGAAIRYQAVHSDEVEDILALDIALRRNDTEWYEHLPPEIDSQLVHKLYYGHFMCYVFHQDYIVKKGVDVHALKEQMLELLQQRGAQYPAEHNVGHLYKAPETLQKFYRENDPTNSMNPGIGKTSKRKNWQEVE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10231
Length:	571 (549)
Sequences:	326 (187)
Seq/√Len:	8.0

ECOLI - DLD

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
463_R	466_D	6.546	1.00
524_Q	538_P	5.128	1.00
400_G	404_A	4.365	0.98
405_K	421_V	4.286	0.98
180_N	186_T	4.086	0.98
319_E	375_S	4.003	0.97
310_M	437_A	3.832	0.96
32_T	36_R	3.764	0.96
41_S	83_E	3.712	0.96
396_M	404_A	3.642	0.95
174_S	253_S	3.633	0.95
108_H	211_I	3.534	0.94
116_V	119_Y	3.303	0.92
396_M	400_G	3.273	0.92
107_L	122_T	3.203	0.91
296_I	300_F	3.048	0.88
190_H	252_E	2.970	0.87
445_Q	511_K	2.921	0.86
205_K	210_R	2.866	0.85
478_D	484_K	2.817	0.84
306_A	431_F	2.794	0.83
315_Y	382_K	2.794	0.83
178_R	186_T	2.781	0.83
118_A	193_I	2.676	0.80
300_F	400_G	2.626	0.79
164_V	491_M	2.588	0.78
326_F	376_H	2.571	0.78
62_L	554_M	2.527	0.76
541_L	545_Y	2.520	0.76
56_L	204_S	2.491	0.75
278_V	427_G	2.491	0.75
400_G	403_E	2.471	0.75
316_D	385_R	2.460	0.74
173_M	223_A	2.443	0.74
296_I	396_M	2.415	0.73
330_D	429_K	2.405	0.72
319_E	382_K	2.400	0.72
62_L	261_A	2.377	0.71
53_G	103_R	2.372	0.71
179_I	553_S	2.340	0.70
290_T	495_F	2.309	0.69
56_L	60_R	2.296	0.69
315_Y	381_M	2.279	0.68
119_Y	511_K	2.268	0.68
393_L	431_F	2.256	0.67
375_S	382_K	2.231	0.66
300_F	396_M	2.202	0.65
438_A	487_Y	2.181	0.65
260_L	544_F	2.171	0.64
83_E	88_N	2.163	0.64
351_L	362_T	2.156	0.64
111_G	114_E	2.098	0.61
198_T	201_Q	2.086	0.61
234_D	237_A	2.068	0.60
438_A	441_A	2.062	0.60
300_F	404_A	2.057	0.60
227_D	248_D	2.049	0.59
64_A	68_A	2.000	0.57
306_A	393_L	1.991	0.57
62_L	185_L	1.976	0.57
295_H	407_W	1.973	0.56
56_L	198_T	1.963	0.56
57_E	60_R	1.960	0.56
247_P	540_T	1.960	0.56
286_P	470_Y	1.954	0.56
511_K	515_L	1.945	0.55
185_L	554_M	1.945	0.55
300_F	403_E	1.927	0.55
12_F	64_A	1.921	0.54
231_R	445_Q	1.913	0.54
155_I	267_L	1.889	0.53
41_S	511_K	1.878	0.53
314_I	437_A	1.864	0.52
480_Q	513_Q	1.844	0.51
156_C	524_Q	1.842	0.51
305_V	398_G	1.836	0.51
12_F	70_K	1.824	0.50
235_I	298_A	1.787	0.49
508_H	512_E	1.780	0.49
396_M	403_E	1.771	0.48
106_K	207_D	1.760	0.48
117_L	267_L	1.759	0.48
13_L	17_A	1.757	0.48
325_T	436_A	1.749	0.47
77_A	386_D	1.745	0.47
74_M	261_A	1.744	0.47
63_K	67_T	1.735	0.47
115_Q	119_Y	1.713	0.46
476_E	513_Q	1.697	0.45
417_G	420_F	1.692	0.45
115_Q	118_A	1.679	0.44
312_R	389_E	1.678	0.44
275_N	398_G	1.672	0.44
475_P	479_S	1.663	0.44
105_D	126_S	1.639	0.43
388_Y	417_G	1.631	0.42
296_I	400_G	1.627	0.42
427_G	431_F	1.623	0.42
316_D	319_E	1.622	0.42
77_A	100_S	1.615	0.42
83_E	345_G	1.601	0.41
396_M	491_M	1.597	0.41
524_Q	540_T	1.593	0.41
296_I	404_A	1.593	0.41
165_Q	256_C	1.583	0.41
37_K	260_L	1.582	0.41
508_H	515_L	1.573	0.40
477_I	510_L	1.569	0.40
422_C	426_E	1.567	0.40
119_Y	456_L	1.555	0.39
174_S	260_L	1.554	0.39
348_D	362_T	1.550	0.39
271_E	411_Y	1.548	0.39
441_A	498_D	1.547	0.39
62_L	177_A	1.531	0.39
423_T	427_G	1.527	0.38
271_E	419_F	1.515	0.38
201_Q	204_S	1.514	0.38
83_E	445_Q	1.496	0.37
99_I	491_M	1.489	0.37
301_E	403_E	1.478	0.36
179_I	261_A	1.474	0.36
96_V	165_Q	1.473	0.36
272_A	306_A	1.469	0.36
70_K	95_D	1.465	0.36
286_P	327_L	1.453	0.36
62_L	72_I	1.429	0.35
447_V	470_Y	1.424	0.34
178_R	181_E	1.423	0.34
381_M	433_H	1.416	0.34
102_L	397_A	1.412	0.34
453_E	501_V	1.405	0.34
394_L	404_A	1.376	0.33
174_S	495_F	1.372	0.33
51_F	83_E	1.364	0.32
12_F	68_A	1.359	0.32
106_K	126_S	1.350	0.32
327_L	373_F	1.350	0.32
83_E	456_L	1.346	0.32
83_E	351_L	1.343	0.32
442_I	446_A	1.341	0.31
400_G	407_W	1.339	0.31
129_K	335_D	1.332	0.31
212_K	215_D	1.329	0.31
207_D	327_L	1.328	0.31
156_C	348_D	1.323	0.31
512_E	515_L	1.316	0.31
77_A	102_L	1.311	0.30
231_R	511_K	1.308	0.30
223_A	349_A	1.305	0.30
471_E	486_Y	1.291	0.30
256_C	260_L	1.288	0.30
111_G	115_Q	1.284	0.29
60_R	198_T	1.280	0.29
46_A	98_I	1.277	0.29
343_L	388_Y	1.272	0.29
83_E	511_K	1.271	0.29
453_E	503_K	1.270	0.29
538_P	541_L	1.269	0.29
396_M	401_V	1.254	0.28
198_T	235_I	1.246	0.28
211_I	215_D	1.243	0.28
41_S	88_N	1.241	0.28
319_E	436_A	1.241	0.28
41_S	445_Q	1.240	0.28
67_T	107_L	1.239	0.28
224_H	524_Q	1.238	0.28
146_C	150_S	1.234	0.28
337_M	340_F	1.215	0.27
508_H	511_K	1.211	0.27
35_Y	51_F	1.209	0.27
314_I	445_Q	1.202	0.27
273_E	398_G	1.201	0.27
86_T	348_D	1.196	0.27
296_I	403_E	1.195	0.27
438_A	485_L	1.195	0.27
58_L	104_L	1.195	0.27
50_V	61_V	1.192	0.26
357_F	361_F	1.191	0.26
245_A	337_M	1.189	0.26
152_I	427_G	1.189	0.26
284_N	389_E	1.186	0.26
236_E	294_R	1.186	0.26
137_E	306_A	1.181	0.26
101_T	150_S	1.176	0.26
485_L	514_M	1.171	0.26
276_Q	398_G	1.167	0.26
398_G	401_V	1.167	0.26
173_M	360_H	1.166	0.26
151_V	314_I	1.164	0.26
137_E	431_F	1.162	0.26
454_D	460_I	1.150	0.25
58_L	261_A	1.146	0.25
416_E	420_F	1.143	0.25
300_F	407_W	1.141	0.25
128_E	146_C	1.138	0.25
486_Y	497_Q	1.138	0.25
225_D	248_D	1.137	0.25
229_V	303_L	1.135	0.25
107_L	417_G	1.133	0.25
110_L	222_H	1.132	0.25
156_C	538_P	1.130	0.25
438_A	514_M	1.128	0.24
480_Q	505_V	1.119	0.24
130_A	133_P	1.116	0.24
448_H	455_I	1.114	0.24
407_W	554_M	1.113	0.24
505_V	510_L	1.105	0.24
125_Y	292_I	1.097	0.24
524_Q	541_L	1.097	0.24
315_Y	384_W	1.094	0.23
77_A	99_I	1.092	0.23
296_I	491_M	1.091	0.23
35_Y	98_I	1.089	0.23
72_I	181_E	1.087	0.23
259_K	366_M	1.087	0.23
302_N	400_G	1.085	0.23
58_L	72_I	1.085	0.23
119_Y	445_Q	1.084	0.23
235_I	256_C	1.081	0.23
122_T	542_Q	1.076	0.23
524_Q	539_E	1.075	0.23
35_Y	54_S	1.072	0.23
147_I	337_M	1.071	0.23
36_R	58_L	1.070	0.23
83_E	119_Y	1.067	0.23
295_H	300_F	1.059	0.22
71_I	93_D	1.055	0.22
58_L	453_E	1.054	0.22
441_A	487_Y	1.050	0.22
77_A	202_I	1.046	0.22
83_E	231_R	1.038	0.22
475_P	478_D	1.034	0.22
518_L	534_L	1.033	0.22
25_L	31_K	1.031	0.22
328_M	349_A	1.024	0.21
349_A	403_E	1.023	0.21
175_L	261_A	1.016	0.21
105_D	366_M	1.015	0.21
137_E	305_V	1.014	0.21
95_D	360_H	1.011	0.21
65_C	95_D	1.010	0.21
70_K	98_I	1.010	0.21
453_E	507_V	1.010	0.21
423_T	426_E	1.007	0.21
481_L	501_V	1.006	0.21
19_L	90_N	1.004	0.21
337_M	345_G	1.003	0.21
222_H	226_Y	1.003	0.21
172_E	207_D	1.002	0.21
26_L	32_T	1.001	0.21
445_Q	456_L	1.000	0.21
165_Q	178_R	0.998	0.21
152_I	262_V	0.998	0.21
502_K	551_T	0.995	0.21
34_R	345_G	0.992	0.21
24_H	53_G	0.990	0.21
122_T	162_S	0.986	0.20
134_L	364_R	0.985	0.20
180_N	419_F	0.982	0.20
276_Q	314_I	0.981	0.20
151_V	247_P	0.980	0.20
34_R	364_R	0.978	0.20
74_M	99_I	0.976	0.20
317_I	485_L	0.976	0.20
497_Q	521_R	0.976	0.20
323_K	503_K	0.975	0.20
351_L	358_R	0.970	0.20
277_Q	398_G	0.968	0.20
155_I	542_Q	0.967	0.20
61_V	120_P	0.965	0.20
172_E	256_C	0.962	0.20
361_F	365_A	0.960	0.20
164_V	545_Y	0.958	0.20
73_L	205_K	0.957	0.20
272_A	553_S	0.955	0.20
119_Y	151_V	0.953	0.20
173_M	343_L	0.952	0.20
122_T	353_K	0.952	0.20
77_A	385_R	0.952	0.20
114_E	118_A	0.951	0.20
69_D	100_S	0.951	0.20
324_D	443_R	0.948	0.19
46_A	152_I	0.946	0.19
30_A	251_F	0.942	0.19
286_P	369_F	0.940	0.19
276_Q	437_A	0.939	0.19
315_Y	371_H	0.939	0.19
336_K	339_F	0.935	0.19
194_D	215_D	0.934	0.19
485_L	500_I	0.930	0.19
326_F	377_L	0.928	0.19
56_L	208_D	0.921	0.19
418_D	422_C	0.920	0.19
419_F	472_H	0.920	0.19
151_V	353_K	0.917	0.19
109_V	155_I	0.914	0.19
147_I	329_I	0.912	0.19
325_T	366_M	0.911	0.19
207_D	463_R	0.910	0.18
384_W	405_K	0.909	0.18
176_F	406_S	0.907	0.18
58_L	64_A	0.907	0.18
181_E	239_T	0.907	0.18
392_L	534_L	0.907	0.18
172_E	515_L	0.906	0.18
418_D	421_V	0.906	0.18
165_Q	273_E	0.906	0.18
172_E	296_I	0.906	0.18
288_V	416_E	0.903	0.18
207_D	480_Q	0.903	0.18
204_S	238_D	0.902	0.18
66_V	179_I	0.901	0.18
332_L	373_F	0.901	0.18
353_K	553_S	0.900	0.18
456_L	460_I	0.899	0.18
71_I	514_M	0.899	0.18
33_A	69_D	0.898	0.18
388_Y	544_F	0.898	0.18
47_L	312_R	0.896	0.18
110_L	220_G	0.896	0.18
41_S	551_T	0.893	0.18
285_Q	386_D	0.890	0.18
33_A	46_A	0.889	0.18
104_L	516_E	0.887	0.18
245_A	438_A	0.886	0.18
441_A	485_L	0.885	0.18
30_A	350_M	0.885	0.18
102_L	345_G	0.884	0.18
14_N	17_A	0.883	0.18
454_D	457_A	0.882	0.18
314_I	519_Q	0.880	0.18
463_R	514_M	0.879	0.18
466_D	514_M	0.875	0.18
41_S	351_L	0.874	0.18
314_I	511_K	0.873	0.18
60_R	208_D	0.873	0.18
147_I	211_I	0.873	0.18
45_D	243_Y	0.873	0.18
147_I	332_L	0.871	0.18
221_R	251_F	0.871	0.18
398_G	415_A	0.869	0.17
196_G	199_P	0.866	0.17
96_V	237_A	0.864	0.17
394_L	491_M	0.863	0.17
235_I	463_R	0.862	0.17
256_C	500_I	0.860	0.17
77_A	261_A	0.854	0.17
17_A	260_L	0.852	0.17
53_G	57_E	0.851	0.17
19_L	64_A	0.849	0.17
105_D	256_C	0.849	0.17
365_A	548_N	0.849	0.17
535_Y	538_P	0.847	0.17
134_L	178_R	0.847	0.17
438_A	498_D	0.845	0.17
393_L	427_G	0.844	0.17
12_F	58_L	0.843	0.17
346_R	352_E	0.842	0.17
46_A	349_A	0.841	0.17
54_S	365_A	0.840	0.17
448_H	453_E	0.839	0.17
548_N	554_M	0.837	0.17
376_H	495_F	0.837	0.17
39_F	328_M	0.835	0.17
150_S	367_Q	0.831	0.17
179_I	351_L	0.831	0.17
178_R	442_I	0.830	0.17
114_E	119_Y	0.829	0.17
89_G	500_I	0.829	0.17
114_E	117_L	0.828	0.17
317_I	487_Y	0.827	0.17
511_K	551_T	0.826	0.16
247_P	270_F	0.826	0.16
296_I	401_V	0.825	0.16
432_L	435_F	0.824	0.16
116_V	151_V	0.823	0.16
108_H	111_G	0.820	0.16
41_S	456_L	0.818	0.16
165_Q	513_Q	0.818	0.16
31_K	63_K	0.818	0.16
277_Q	456_L	0.818	0.16
36_R	458_L	0.817	0.16
61_V	383_N	0.816	0.16
74_M	439_G	0.814	0.16
231_R	305_V	0.813	0.16
102_L	553_S	0.813	0.16
24_H	57_E	0.811	0.16
110_L	433_H	0.811	0.16
17_A	25_L	0.810	0.16
155_I	423_T	0.809	0.16
278_V	393_L	0.806	0.16
177_A	554_M	0.806	0.16
367_Q	412_F	0.805	0.16
81_L	487_Y	0.805	0.16
270_F	381_M	0.803	0.16
151_V	345_G	0.803	0.16
162_S	395_K	0.799	0.16
125_Y	305_V	0.799	0.16
436_A	457_A	0.798	0.16
178_R	185_L	0.797	0.16
11_A	475_P	0.797	0.16
86_T	146_C	0.796	0.16
491_M	548_N	0.796	0.16
73_L	173_M	0.793	0.16
77_A	275_N	0.792	0.16
14_N	67_T	0.791	0.16
184_K	409_V	0.790	0.16
315_Y	337_M	0.789	0.16
118_A	207_D	0.789	0.16
328_M	351_L	0.788	0.16
54_S	198_T	0.788	0.16
436_A	514_M	0.788	0.16
205_K	209_D	0.787	0.16
388_Y	418_D	0.783	0.16
69_D	310_M	0.782	0.16
107_L	179_I	0.781	0.16
96_V	366_M	0.779	0.15
243_Y	315_Y	0.779	0.15
41_S	362_T	0.778	0.15
70_K	96_V	0.776	0.15
132_K	381_M	0.776	0.15
51_F	72_I	0.774	0.15
335_D	366_M	0.774	0.15
476_E	520_Q	0.772	0.15
254_S	554_M	0.771	0.15
315_Y	375_S	0.769	0.15
24_H	388_Y	0.763	0.15
99_I	296_I	0.763	0.15
273_E	397_A	0.762	0.15
314_I	456_L	0.761	0.15
268_D	458_L	0.761	0.15
305_V	397_A	0.760	0.15
274_K	318_A	0.759	0.15
71_I	96_V	0.759	0.15
15_E	67_T	0.759	0.15
184_K	384_W	0.758	0.15
197_E	201_Q	0.758	0.15
29_P	46_A	0.757	0.15
78_N	146_C	0.753	0.15
61_V	483_H	0.752	0.15
204_S	208_D	0.751	0.15
152_I	511_K	0.751	0.15
234_D	248_D	0.749	0.15
41_S	51_F	0.747	0.15
180_N	221_R	0.747	0.15
145_S	249_R	0.744	0.15
74_M	429_K	0.743	0.15
63_K	185_L	0.742	0.15
448_H	503_K	0.742	0.15
98_I	152_I	0.741	0.15
292_I	388_Y	0.740	0.15
291_E	388_Y	0.740	0.15
178_R	256_C	0.739	0.15
95_D	201_Q	0.738	0.15
441_A	514_M	0.737	0.15
298_A	400_G	0.737	0.15
54_S	194_D	0.736	0.15
54_S	379_P	0.735	0.15
13_L	478_D	0.735	0.15
392_L	498_D	0.734	0.15
364_R	447_V	0.732	0.14
215_D	468_E	0.732	0.14
146_C	249_R	0.730	0.14
67_T	387_K	0.730	0.14
477_I	480_Q	0.729	0.14
334_T	458_L	0.729	0.14
424_P	428_S	0.729	0.14
343_L	346_R	0.728	0.14
146_C	501_V	0.728	0.14
292_I	427_G	0.728	0.14
346_R	502_K	0.727	0.14
107_L	310_M	0.727	0.14
91_D	230_H	0.722	0.14
37_K	495_F	0.721	0.14
202_I	256_C	0.720	0.14
83_E	314_I	0.719	0.14
125_Y	352_E	0.717	0.14
450_D	547_E	0.717	0.14
221_R	358_R	0.716	0.14
72_I	179_I	0.713	0.14
283_T	510_L	0.711	0.14
14_N	208_D	0.710	0.14
65_C	70_K	0.710	0.14
211_I	551_T	0.709	0.14
346_R	354_V	0.708	0.14
129_K	460_I	0.706	0.14
291_E	509_A	0.705	0.14
27_T	100_S	0.705	0.14
227_D	318_A	0.703	0.14
395_K	498_D	0.702	0.14
194_D	210_R	0.701	0.14
207_D	285_Q	0.700	0.14
323_K	514_M	0.699	0.14
146_C	156_C	0.698	0.14
72_I	467_T	0.698	0.14
186_T	194_D	0.694	0.14
375_S	407_W	0.693	0.14
300_F	447_V	0.693	0.14
176_F	251_F	0.690	0.14
334_T	460_I	0.690	0.14
334_T	441_A	0.689	0.14
380_R	426_E	0.689	0.14
362_T	383_N	0.687	0.14
65_C	97_V	0.686	0.14
290_T	460_I	0.686	0.14
109_V	360_H	0.686	0.14
182_D	186_T	0.686	0.14
155_I	419_F	0.686	0.14
402_G	405_K	0.686	0.14
172_E	198_T	0.684	0.14
173_M	224_H	0.683	0.14
428_S	439_G	0.683	0.14
501_V	507_V	0.681	0.13
201_Q	274_K	0.680	0.13
310_M	352_E	0.680	0.13
312_R	386_D	0.680	0.13
37_K	558_I	0.679	0.13
180_N	247_P	0.678	0.13
310_M	314_I	0.677	0.13
39_F	366_M	0.677	0.13
39_F	442_I	0.676	0.13
62_L	179_I	0.674	0.13
396_M	407_W	0.673	0.13
155_I	388_Y	0.673	0.13
447_V	453_E	0.673	0.13
224_H	248_D	0.672	0.13
132_K	182_D	0.672	0.13
98_I	147_I	0.670	0.13
156_C	553_S	0.668	0.13
438_A	486_Y	0.668	0.13
100_S	383_N	0.668	0.13
448_H	452_V	0.667	0.13
272_A	393_L	0.667	0.13
33_A	352_E	0.667	0.13
347_T	362_T	0.667	0.13
305_V	396_M	0.666	0.13
83_E	512_E	0.666	0.13
417_G	421_V	0.664	0.13
225_D	249_R	0.664	0.13
205_K	371_H	0.664	0.13
224_H	268_D	0.662	0.13
56_L	203_L	0.662	0.13
61_V	287_E	0.662	0.13
337_M	438_A	0.662	0.13
33_A	83_E	0.662	0.13
250_L	465_N	0.661	0.13
328_M	437_A	0.661	0.13
468_E	482_V	0.659	0.13
251_F	352_E	0.659	0.13
362_T	366_M	0.658	0.13
69_D	211_I	0.657	0.13
20_V	256_C	0.657	0.13
241_A	314_I	0.657	0.13
379_P	383_N	0.655	0.13
29_P	354_V	0.655	0.13
180_N	554_M	0.654	0.13
481_L	510_L	0.652	0.13
102_L	296_I	0.652	0.13
417_G	422_C	0.651	0.13
323_K	396_M	0.651	0.13
421_V	426_E	0.650	0.13
277_Q	310_M	0.650	0.13
216_V	221_R	0.650	0.13
256_C	515_L	0.649	0.13
407_W	491_M	0.649	0.13
295_H	299_N	0.648	0.13
39_F	439_G	0.648	0.13
132_K	281_I	0.647	0.13
455_I	486_Y	0.647	0.13
60_R	286_P	0.647	0.13
281_I	448_H	0.646	0.13
392_L	490_F	0.646	0.13
272_A	446_A	0.645	0.13
179_I	350_M	0.644	0.13
283_T	318_A	0.644	0.13
460_I	486_Y	0.644	0.13
367_Q	443_R	0.643	0.13
105_D	345_G	0.642	0.13
280_Y	391_H	0.642	0.13
280_Y	486_Y	0.639	0.13
29_P	406_S	0.638	0.13
83_E	362_T	0.638	0.13
295_H	447_V	0.637	0.13
47_L	313_D	0.636	0.13
371_H	450_D	0.635	0.13
306_A	395_K	0.635	0.13
77_A	256_C	0.634	0.13
125_Y	512_E	0.634	0.13
241_A	445_Q	0.632	0.13
180_N	184_K	0.631	0.13
272_A	524_Q	0.631	0.13
17_A	286_P	0.627	0.12
156_C	262_V	0.626	0.12
117_L	431_F	0.626	0.12
286_P	463_R	0.625	0.12
402_G	406_S	0.623	0.12
335_D	401_V	0.622	0.12
90_N	429_K	0.622	0.12
328_M	382_K	0.621	0.12
265_V	318_A	0.621	0.12
137_E	272_A	0.620	0.12
83_E	335_D	0.620	0.12
90_N	178_R	0.620	0.12
89_G	237_A	0.619	0.12
180_N	371_H	0.618	0.12
174_S	275_N	0.616	0.12
286_P	478_D	0.615	0.12
32_T	58_L	0.615	0.12
302_N	399_D	0.614	0.12
392_L	457_A	0.614	0.12
224_H	327_L	0.614	0.12
41_S	119_Y	0.614	0.12
37_K	230_H	0.613	0.12
261_A	276_Q	0.613	0.12
231_R	507_V	0.611	0.12
174_S	283_T	0.611	0.12
428_S	502_K	0.611	0.12
354_V	383_N	0.611	0.12
223_A	248_D	0.610	0.12
77_A	107_L	0.610	0.12
420_F	426_E	0.609	0.12
100_S	174_S	0.609	0.12
178_R	407_W	0.609	0.12
531_V	541_L	0.608	0.12
328_M	456_L	0.608	0.12
170_Y	451_E	0.608	0.12
176_F	188_V	0.608	0.12
207_D	517_L	0.607	0.12
98_I	383_N	0.607	0.12
98_I	326_F	0.606	0.12
33_A	224_H	0.605	0.12
234_D	302_N	0.605	0.12
51_F	104_L	0.605	0.12
41_S	231_R	0.605	0.12
345_G	352_E	0.604	0.12
125_Y	427_G	0.604	0.12
53_G	467_T	0.603	0.12
102_L	398_G	0.603	0.12
182_D	298_A	0.602	0.12
194_D	198_T	0.602	0.12
217_R	238_D	0.601	0.12
384_W	418_D	0.599	0.12
95_D	453_E	0.599	0.12
272_A	276_Q	0.596	0.12
396_M	551_T	0.596	0.12
380_R	423_T	0.596	0.12
410_D	414_Q	0.594	0.12
162_S	487_Y	0.591	0.12
225_D	278_V	0.587	0.12
261_A	477_I	0.587	0.12
119_Y	305_V	0.587	0.12
343_L	402_G	0.586	0.12
115_Q	208_D	0.586	0.12
364_R	449_S	0.585	0.12
234_D	319_E	0.585	0.12
271_E	442_I	0.585	0.12
90_N	276_Q	0.582	0.12
64_A	453_E	0.582	0.12
63_K	409_V	0.582	0.12
313_D	487_Y	0.582	0.12
123_T	367_Q	0.580	0.12
66_V	211_I	0.579	0.12
51_F	445_Q	0.578	0.12
480_Q	510_L	0.577	0.12
537_A	540_T	0.576	0.12
60_R	402_G	0.576	0.12
196_G	202_I	0.575	0.12
288_V	403_E	0.575	0.12
260_L	540_T	0.575	0.12
460_I	495_F	0.575	0.12
328_M	332_L	0.574	0.12
162_S	419_F	0.574	0.12
301_E	477_I	0.574	0.12
305_V	349_A	0.573	0.12
349_A	400_G	0.573	0.12
90_N	274_K	0.573	0.12
23_S	30_A	0.572	0.12
114_E	306_A	0.571	0.12
514_M	518_L	0.571	0.12
173_M	514_M	0.571	0.12
46_A	83_E	0.570	0.11
427_G	437_A	0.570	0.11
46_A	395_K	0.569	0.11
62_L	323_K	0.568	0.11
47_L	102_L	0.566	0.11
245_A	441_A	0.566	0.11
111_G	272_A	0.564	0.11
190_H	289_L	0.564	0.11
101_T	348_D	0.563	0.11
413_K	547_E	0.563	0.11
51_F	397_A	0.563	0.11
245_A	334_T	0.563	0.11
207_D	428_S	0.563	0.11
47_L	373_F	0.562	0.11
272_A	379_P	0.562	0.11
506_D	509_A	0.562	0.11
506_D	510_L	0.560	0.11
17_A	96_V	0.560	0.11
392_L	518_L	0.559	0.11
276_Q	395_K	0.558	0.11
505_V	513_Q	0.558	0.11
198_T	460_I	0.557	0.11
46_A	450_D	0.556	0.11
132_K	198_T	0.556	0.11
12_F	20_V	0.556	0.11
61_V	216_V	0.556	0.11
412_F	417_G	0.556	0.11
470_Y	495_F	0.556	0.11
243_Y	369_F	0.555	0.11
338_P	525_Y	0.555	0.11
391_H	516_E	0.555	0.11
243_Y	402_G	0.555	0.11
380_R	420_F	0.554	0.11
33_A	107_L	0.554	0.11
113_G	119_Y	0.553	0.11
50_V	179_I	0.553	0.11
133_P	342_N	0.552	0.11
122_T	209_D	0.552	0.11
285_Q	544_F	0.551	0.11
43_Q	109_V	0.551	0.11
115_Q	151_V	0.550	0.11
245_A	487_Y	0.550	0.11
23_S	175_L	0.549	0.11
37_K	43_Q	0.548	0.11
120_P	334_T	0.548	0.11
317_I	366_M	0.548	0.11
37_K	456_L	0.547	0.11
452_V	503_K	0.547	0.11
352_E	356_F	0.547	0.11
383_N	546_R	0.546	0.11
72_I	107_L	0.545	0.11
102_L	106_K	0.544	0.11
288_V	414_Q	0.544	0.11
248_D	516_E	0.544	0.11
96_V	384_W	0.544	0.11
314_I	508_H	0.543	0.11
95_D	482_V	0.543	0.11
66_V	89_G	0.543	0.11
271_E	288_V	0.542	0.11
260_L	460_I	0.542	0.11
265_V	498_D	0.541	0.11
23_S	28_D	0.541	0.11
156_C	256_C	0.540	0.11
165_Q	276_Q	0.539	0.11
162_S	447_V	0.537	0.11
183_G	492_C	0.537	0.11
260_L	442_I	0.537	0.11
249_R	435_F	0.536	0.11
225_D	231_R	0.536	0.11
200_E	235_I	0.536	0.11
183_G	422_C	0.536	0.11
98_I	355_K	0.535	0.11
392_L	395_K	0.535	0.11
98_I	510_L	0.535	0.11
108_H	483_H	0.533	0.11
78_N	150_S	0.533	0.11
176_F	291_E	0.533	0.11
199_P	202_I	0.533	0.11
96_V	106_K	0.532	0.11
276_Q	351_L	0.531	0.11
317_I	441_A	0.531	0.11
253_S	463_R	0.531	0.11
51_F	88_N	0.530	0.11
72_I	229_V	0.530	0.11
231_R	456_L	0.529	0.11
100_S	117_L	0.529	0.11
327_L	352_E	0.528	0.11
193_I	424_P	0.528	0.11
36_R	518_L	0.528	0.11
490_F	498_D	0.528	0.11
477_I	515_L	0.527	0.11
111_G	116_V	0.527	0.11
442_I	516_E	0.525	0.11
315_Y	358_R	0.525	0.11
516_E	543_K	0.524	0.11
71_I	325_T	0.524	0.11
519_Q	525_Y	0.522	0.11
164_V	301_E	0.521	0.11
28_D	31_K	0.520	0.11
424_P	491_M	0.520	0.11
146_C	435_F	0.518	0.11
68_A	501_V	0.517	0.11
369_F	373_F	0.517	0.11
445_Q	512_E	0.516	0.11
54_S	343_L	0.516	0.11
328_M	345_G	0.515	0.11
448_H	451_E	0.515	0.11
107_L	524_Q	0.515	0.11
425_E	429_K	0.514	0.11
96_V	351_L	0.514	0.11
16_L	50_V	0.514	0.11
436_A	441_A	0.513	0.11
340_F	437_A	0.513	0.11
287_E	291_E	0.513	0.11
108_H	175_L	0.511	0.11
36_R	414_Q	0.511	0.11
310_M	456_L	0.510	0.11
209_D	292_I	0.510	0.11
419_F	554_M	0.510	0.11
111_G	119_Y	0.509	0.11
190_H	518_L	0.509	0.11
15_E	277_Q	0.508	0.10
96_V	107_L	0.508	0.10
299_N	356_F	0.507	0.10
212_K	260_L	0.507	0.10
479_S	502_K	0.506	0.10
456_L	507_V	0.506	0.10
64_A	181_E	0.506	0.10
123_T	267_L	0.506	0.10
384_W	508_H	0.506	0.10
375_S	505_V	0.505	0.10
137_E	162_S	0.504	0.10
17_A	184_K	0.504	0.10
322_G	486_Y	0.504	0.10
317_I	544_F	0.504	0.10
35_Y	347_T	0.504	0.10
490_F	534_L	0.502	0.10
238_D	379_P	0.502	0.10
198_T	204_S	0.501	0.10
41_S	345_G	0.501	0.10
126_S	310_M	0.501	0.10
172_E	507_V	0.500	0.10
118_A	358_R	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1f0xA	1	0.8792	100	0.611	Contact Map
4bbyA	2	0.7863	100	0.836	Contact Map
3pm9A	5	0.7618	100	0.851	Contact Map
2uuuA	2	0.7776	100	0.857	Contact Map
2exrA	1	0.7303	100	0.866	Contact Map
1w1oA	1	0.7058	100	0.874	Contact Map
4o95A	1	0.6743	100	0.875	Contact Map
1wvfA	2	0.8179	100	0.876	Contact Map
4mlaA	1	0.711	100	0.884	Contact Map
1e8gA	5	0.8266	100	0.888	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0144 seconds.