PTM3C - ECOLI - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

PTM3C - PTS system mannitol-specific EIICBA component

UniProt:	P00550	Sequences: MSSDIKIKVQSFGRFLSNMVMPNIGAFIAWGIITALFIPTGWLPNETLAKLVGPMITYLLPLLIGYTGGKLVGGERGGVVGAITTMGVIVGADMPMFLGSMIAGPLGGWCIKHFDRWVDGKIKSGFEMLVNNFSAGIIGMILAILAFLGIGPIVEALSKMLAAGVNFMVVHDMLPLASIFVEPAKILFLNNAINHGIFSPLGIQQSHELGKSIFFLIEANPGPGMGVLLAYMFFGRGSAKQSAGGAAIIHFLGGIHEIYFPYVLMNPRLILAVILGGMTGVFTLTILGGGLVSPASPGSILAVLAMTPKGAYFANIAGVCAAMAVSFVVSAILLKTSKVKEEDDIEAATRRMQDMKAESKGASPLSAGDVTNDLSHVRKIIVACDAGMGSSAMGAGVLRKKIQDAGLSQISVTNSAINNLPPDVDLVITHRDLTERAMRQVPQAQHISLTNFLDSGLYTSLTERLVAAQRHTANEEKVKDSLKDSFDDSSANLFKLGAENIFLGRKAATKEEAIRFAGEQLVKGGYVEPEYVQAMLDREKLTPTYLGESIAVPHGTVEAKDRVLKTGVVFCQYPEGVRFGEEEDDIARLVIGIAARNNEHIQVITSLTNALDDESVIERLAHTTSVDEVLELLAGRK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
EcoGene:	EG10615
Length:	637 (618)
Sequences:	265 (167)
Seq/√Len:	6.7

ECOLI - PTM3C PTMCB
BACSU - PTMCB PTN3B

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
279_T	321_A	5.192	0.99
227_V	273_V	5.107	0.99
289_G	315_N	5.082	0.99
434_T	448_S	4.903	0.99
275_L	329_V	4.334	0.97
284_L	318_G	3.994	0.95
537_D	540_K	3.897	0.95
51_L	90_V	3.767	0.94
625_S	628_E	3.639	0.92
534_A	559_A	3.547	0.91
519_E	523_K	3.450	0.90
304_L	316_I	3.315	0.88
500_N	526_Y	3.274	0.87
357_A	361_G	3.132	0.85
65_G	85_T	3.110	0.84
181_V	217_I	3.096	0.84
566_T	603_V	3.018	0.82
181_V	198_F	2.982	0.82
272_A	330_S	2.970	0.81
578_R	581_E	2.871	0.79
357_A	360_K	2.790	0.77
572_Q	579_F	2.755	0.76
287_L	314_A	2.655	0.73
12_F	15_F	2.650	0.73
588_R	621_A	2.601	0.71
345_I	356_K	2.584	0.71
108_G	142_L	2.514	0.69
275_L	330_S	2.473	0.67
178_S	281_V	2.470	0.67
379_K	423_D	2.455	0.67
287_L	317_A	2.422	0.66
328_V	332_I	2.326	0.62
266_N	337_S	2.301	0.61
186_I	273_V	2.291	0.61
498_A	627_D	2.275	0.61
523_K	577_V	2.210	0.58
113_H	116_R	2.185	0.57
508_A	512_E	2.183	0.57
219_A	294_P	2.178	0.57
271_L	275_L	2.176	0.57
251_F	319_V	2.149	0.56
595_A	604_I	2.128	0.55
25_G	187_L	2.125	0.55
38_I	52_V	2.120	0.55
198_F	217_I	2.093	0.54
45_N	48_L	2.069	0.53
345_I	348_A	2.058	0.53
289_G	314_A	2.056	0.52
114_F	118_V	2.052	0.52
504_G	587_A	2.051	0.52
563_V	591_I	2.048	0.52
162_A	197_I	2.035	0.52
504_G	620_L	2.019	0.51
14_R	214_F	2.007	0.51
283_T	321_A	2.002	0.50
62_L	86_M	1.997	0.50
248_I	252_L	1.963	0.49
121_K	438_M	1.945	0.48
94_M	154_V	1.938	0.48
570_F	603_V	1.910	0.47
180_F	197_I	1.905	0.47
349_T	352_M	1.899	0.47
80_V	556_T	1.888	0.46
380_I	537_D	1.882	0.46
103_A	244_G	1.871	0.46
566_T	595_A	1.865	0.45
528_E	562_R	1.852	0.45
304_L	307_T	1.830	0.44
150_I	173_M	1.823	0.44
322_A	326_S	1.821	0.44
597_N	604_I	1.816	0.44
546_L	608_T	1.814	0.43
287_L	311_A	1.813	0.43
548_E	608_T	1.763	0.42
289_G	311_A	1.763	0.42
580_G	621_A	1.761	0.41
400_K	434_T	1.759	0.41
203_I	215_F	1.737	0.41
284_L	597_N	1.737	0.41
530_E	562_R	1.731	0.40
607_L	617_I	1.728	0.40
597_N	626_V	1.726	0.40
377_V	426_L	1.725	0.40
401_K	405_A	1.717	0.40
25_G	132_N	1.699	0.39
548_E	617_I	1.691	0.39
27_F	95_P	1.682	0.39
513_A	573_Y	1.676	0.38
522_V	532_V	1.667	0.38
46_E	50_K	1.663	0.38
224_G	256_H	1.631	0.37
502_F	516_F	1.625	0.37
352_M	355_M	1.624	0.37
526_Y	579_F	1.624	0.37
557_V	611_L	1.621	0.36
36_L	43_L	1.615	0.36
48_L	144_I	1.602	0.36
568_V	587_A	1.599	0.36
333_L	566_T	1.594	0.36
507_A	573_Y	1.594	0.36
417_I	420_L	1.587	0.35
268_R	333_L	1.577	0.35
300_I	319_V	1.570	0.35
611_L	623_T	1.562	0.34
434_T	446_H	1.551	0.34
458_Y	462_T	1.545	0.34
348_A	356_K	1.532	0.33
528_E	564_L	1.529	0.33
568_V	597_N	1.522	0.33
186_I	263_V	1.520	0.33
114_F	138_I	1.519	0.33
108_G	111_I	1.510	0.33
568_V	612_D	1.506	0.33
334_L	458_Y	1.494	0.32
586_I	589_L	1.491	0.32
206_S	381_I	1.482	0.32
541_L	582_E	1.478	0.32
197_I	614_E	1.476	0.32
27_F	57_T	1.473	0.32
164_G	545_Y	1.470	0.31
265_M	302_A	1.468	0.31
382_V	456_G	1.464	0.31
144_I	197_I	1.461	0.31
27_F	33_I	1.458	0.31
33_I	95_P	1.452	0.31
268_R	633_L	1.449	0.31
268_R	566_T	1.444	0.31
62_L	530_E	1.439	0.30
586_I	630_L	1.434	0.30
214_F	396_G	1.429	0.30
505_R	623_T	1.424	0.30
573_Y	590_V	1.422	0.30
199_S	203_I	1.422	0.30
182_E	256_H	1.419	0.30
498_A	564_L	1.417	0.30
549_S	597_N	1.415	0.30
515_R	536_L	1.414	0.30
563_V	586_I	1.410	0.29
92_A	160_M	1.407	0.29
86_M	90_V	1.405	0.29
545_Y	574_P	1.396	0.29
113_H	495_K	1.393	0.29
201_L	214_F	1.392	0.29
284_L	289_G	1.384	0.29
545_Y	572_Q	1.382	0.29
520_Q	523_K	1.375	0.28
335_K	380_I	1.370	0.28
312_Y	316_I	1.369	0.28
550_I	572_Q	1.365	0.28
546_L	633_L	1.358	0.28
26_A	79_V	1.357	0.28
578_R	623_T	1.355	0.28
546_L	556_T	1.354	0.28
332_I	336_T	1.353	0.28
447_I	456_G	1.346	0.28
533_Q	580_G	1.342	0.27
327_F	393_M	1.337	0.27
163_A	625_S	1.335	0.27
404_D	408_S	1.334	0.27
571_C	595_A	1.334	0.27
519_E	529_P	1.331	0.27
534_A	562_R	1.330	0.27
108_G	465_L	1.330	0.27
239_A	398_L	1.319	0.27
523_K	613_D	1.312	0.27
398_L	458_Y	1.312	0.27
179_I	213_I	1.312	0.27
216_L	237_G	1.308	0.26
217_I	382_V	1.308	0.26
539_E	591_I	1.305	0.26
613_D	619_R	1.298	0.26
550_I	611_L	1.298	0.26
277_G	405_A	1.296	0.26
51_L	88_V	1.293	0.26
289_G	316_I	1.290	0.26
608_T	612_D	1.289	0.26
11_S	591_I	1.282	0.26
80_V	135_A	1.281	0.26
110_C	138_I	1.278	0.26
116_R	119_D	1.274	0.25
603_V	629_V	1.266	0.25
571_C	603_V	1.262	0.25
168_M	284_L	1.262	0.25
627_D	631_E	1.261	0.25
533_Q	537_D	1.260	0.25
201_L	454_D	1.255	0.25
168_M	294_P	1.250	0.25
74_G	151_G	1.250	0.25
577_V	627_D	1.248	0.25
42_W	304_L	1.247	0.25
526_Y	567_G	1.238	0.24
324_A	328_V	1.237	0.24
557_V	616_V	1.236	0.24
445_Q	464_R	1.235	0.24
394_G	452_F	1.224	0.24
328_V	499_E	1.213	0.24
288_G	354_D	1.211	0.24
275_L	504_G	1.209	0.24
144_I	149_G	1.208	0.24
624_T	632_L	1.205	0.24
180_F	205_Q	1.204	0.23
215_F	293_S	1.202	0.23
182_E	224_G	1.202	0.23
122_I	131_N	1.200	0.23
429_T	448_S	1.199	0.23
216_L	303_V	1.199	0.23
505_R	620_L	1.198	0.23
541_L	563_V	1.191	0.23
25_G	57_T	1.190	0.23
185_K	218_E	1.182	0.23
591_I	616_V	1.180	0.23
546_L	563_V	1.178	0.23
132_N	187_L	1.176	0.23
548_E	612_D	1.174	0.23
169_V	302_A	1.172	0.23
579_F	589_L	1.165	0.22
587_A	621_A	1.160	0.22
28_I	262_Y	1.160	0.22
570_F	629_V	1.150	0.22
496_L	603_V	1.149	0.22
627_D	633_L	1.149	0.22
271_L	519_E	1.147	0.22
398_L	449_L	1.146	0.22
572_Q	611_L	1.146	0.22
397_V	458_Y	1.144	0.22
19_M	30_W	1.144	0.22
48_L	161_L	1.142	0.22
156_A	180_F	1.142	0.22
322_A	381_I	1.141	0.22
382_V	418_N	1.140	0.22
603_V	630_L	1.139	0.22
537_D	605_T	1.137	0.22
569_V	573_Y	1.137	0.22
317_A	542_T	1.137	0.22
39_P	45_N	1.135	0.22
10_Q	16_L	1.133	0.22
528_E	563_V	1.132	0.22
21_M	56_I	1.129	0.22
420_L	462_T	1.128	0.21
618_E	631_E	1.124	0.21
33_I	60_L	1.123	0.21
199_S	214_F	1.123	0.21
151_G	313_F	1.122	0.21
548_E	595_A	1.121	0.21
120_G	123_K	1.121	0.21
62_L	90_V	1.118	0.21
186_I	330_S	1.115	0.21
549_S	568_V	1.104	0.21
60_L	97_F	1.103	0.21
582_E	612_D	1.101	0.21
603_V	608_T	1.101	0.21
62_L	273_V	1.099	0.21
548_E	611_L	1.098	0.21
18_N	71_L	1.098	0.21
523_K	619_R	1.097	0.21
103_A	146_A	1.091	0.21
596_R	626_V	1.089	0.21
380_I	485_S	1.083	0.20
62_L	186_I	1.080	0.20
242_S	616_V	1.079	0.20
185_K	224_G	1.077	0.20
598_N	605_T	1.076	0.20
377_V	402_I	1.074	0.20
316_I	380_I	1.073	0.20
182_E	185_K	1.073	0.20
334_L	617_I	1.069	0.20
48_L	129_L	1.068	0.20
504_G	605_T	1.068	0.20
577_V	631_E	1.067	0.20
198_F	569_V	1.063	0.20
546_L	603_V	1.061	0.20
579_F	587_A	1.061	0.20
549_S	586_I	1.060	0.20
185_K	256_H	1.059	0.20
242_S	536_L	1.058	0.20
401_K	455_S	1.058	0.20
493_L	523_K	1.058	0.20
586_I	622_H	1.057	0.20
616_V	623_T	1.056	0.20
453_L	541_L	1.056	0.20
18_N	219_A	1.054	0.20
19_M	22_P	1.053	0.20
401_K	458_Y	1.052	0.20
214_F	449_L	1.049	0.20
550_I	590_V	1.047	0.20
244_G	595_A	1.043	0.19
518_G	532_V	1.040	0.19
73_G	250_H	1.040	0.19
277_G	280_G	1.040	0.19
285_T	438_M	1.039	0.19
461_L	541_L	1.038	0.19
552_V	604_I	1.037	0.19
428_I	461_L	1.035	0.19
155_E	605_T	1.034	0.19
505_R	572_Q	1.033	0.19
197_I	358_E	1.028	0.19
56_I	186_I	1.025	0.19
92_A	155_E	1.025	0.19
595_A	608_T	1.025	0.19
586_I	608_T	1.023	0.19
546_L	611_L	1.023	0.19
182_E	221_P	1.022	0.19
45_N	50_K	1.017	0.19
453_L	579_F	1.012	0.19
227_V	330_S	1.011	0.19
97_F	237_G	1.011	0.19
567_G	579_F	1.009	0.19
130_V	275_L	1.009	0.19
546_L	623_T	1.008	0.19
501_I	629_V	1.006	0.19
137_I	141_I	1.004	0.19
34_T	91_G	1.003	0.18
557_V	608_T	1.001	0.18
280_G	429_T	1.000	0.18
225_M	501_I	0.998	0.18
333_L	430_H	0.998	0.18
573_Y	620_L	0.997	0.18
353_Q	360_K	0.997	0.18
141_I	577_V	0.995	0.18
181_V	281_V	0.995	0.18
18_N	568_V	0.994	0.18
548_E	604_I	0.991	0.18
577_V	587_A	0.991	0.18
526_Y	589_L	0.990	0.18
168_M	537_D	0.986	0.18
572_Q	589_L	0.984	0.18
135_A	277_G	0.982	0.18
611_L	616_V	0.982	0.18
214_F	623_T	0.982	0.18
601_I	608_T	0.974	0.18
524_G	568_V	0.974	0.18
273_V	277_G	0.974	0.18
523_K	587_A	0.973	0.18
580_G	612_D	0.972	0.18
94_M	158_S	0.972	0.18
194_N	199_S	0.972	0.18
59_L	85_T	0.971	0.18
121_K	558_E	0.968	0.18
431_R	597_N	0.965	0.18
219_A	303_V	0.963	0.18
118_V	122_I	0.961	0.18
542_T	556_T	0.960	0.18
328_V	599_E	0.960	0.18
461_L	591_I	0.959	0.18
556_T	563_V	0.959	0.18
310_G	316_I	0.957	0.17
539_E	544_T	0.956	0.17
123_K	231_Y	0.952	0.17
59_L	82_A	0.952	0.17
438_M	628_E	0.951	0.17
168_M	199_S	0.951	0.17
70_K	120_G	0.950	0.17
548_E	628_E	0.949	0.17
572_Q	587_A	0.949	0.17
568_V	598_N	0.949	0.17
618_E	622_H	0.948	0.17
516_F	520_Q	0.948	0.17
333_L	403_Q	0.946	0.17
151_G	545_Y	0.946	0.17
148_L	180_F	0.944	0.17
598_N	613_D	0.941	0.17
53_G	302_A	0.936	0.17
263_V	426_L	0.935	0.17
381_I	401_K	0.934	0.17
401_K	448_S	0.933	0.17
329_V	632_L	0.933	0.17
219_A	295_A	0.931	0.17
514_I	518_G	0.929	0.17
284_L	617_I	0.928	0.17
71_L	98_L	0.927	0.17
539_E	590_V	0.927	0.17
515_R	533_Q	0.924	0.17
277_G	446_H	0.923	0.17
216_L	239_A	0.921	0.17
289_G	507_A	0.920	0.17
542_T	616_V	0.916	0.17
287_L	633_L	0.915	0.17
68_G	265_M	0.915	0.17
107_G	154_V	0.914	0.17
552_V	578_R	0.911	0.17
453_L	461_L	0.909	0.16
514_I	535_M	0.909	0.16
529_P	568_V	0.907	0.16
199_S	294_P	0.902	0.16
44_P	76_R	0.901	0.16
339_V	615_S	0.901	0.16
557_V	599_E	0.898	0.16
296_S	306_M	0.898	0.16
156_A	328_V	0.898	0.16
282_F	285_T	0.897	0.16
245_G	251_F	0.896	0.16
529_P	558_E	0.896	0.16
581_E	612_D	0.896	0.16
220_N	395_A	0.892	0.16
129_L	194_N	0.890	0.16
345_I	352_M	0.889	0.16
88_V	178_S	0.886	0.16
168_M	556_T	0.885	0.16
563_V	596_R	0.885	0.16
549_S	603_V	0.884	0.16
316_I	320_C	0.884	0.16
185_K	221_P	0.884	0.16
233_F	329_V	0.883	0.16
569_V	589_L	0.882	0.16
113_H	515_R	0.881	0.16
84_T	382_V	0.880	0.16
217_I	595_A	0.880	0.16
97_F	154_V	0.879	0.16
280_G	446_H	0.877	0.16
56_I	434_T	0.876	0.16
393_M	607_L	0.874	0.16
599_E	616_V	0.873	0.16
598_N	620_L	0.873	0.16
566_T	604_I	0.872	0.16
550_I	589_L	0.871	0.16
589_L	621_A	0.871	0.16
43_L	354_D	0.870	0.16
278_M	282_F	0.869	0.16
18_N	612_D	0.868	0.16
235_G	239_A	0.866	0.16
284_L	307_T	0.865	0.16
597_N	610_A	0.862	0.16
24_I	28_I	0.861	0.15
199_S	579_F	0.861	0.15
293_S	417_I	0.861	0.15
602_Q	609_N	0.860	0.15
548_E	603_V	0.859	0.15
541_L	557_V	0.859	0.15
273_V	283_T	0.858	0.15
599_E	612_D	0.858	0.15
601_I	605_T	0.858	0.15
182_E	218_E	0.858	0.15
18_N	400_K	0.858	0.15
549_S	588_R	0.857	0.15
588_R	612_D	0.856	0.15
240_K	301_L	0.856	0.15
157_L	288_G	0.855	0.15
557_V	604_I	0.854	0.15
269_L	277_G	0.853	0.15
25_G	95_P	0.853	0.15
610_A	623_T	0.852	0.15
53_G	171_H	0.848	0.15
198_F	633_L	0.848	0.15
32_I	137_I	0.847	0.15
358_E	463_E	0.846	0.15
494_F	626_V	0.846	0.15
431_R	598_N	0.845	0.15
589_L	625_S	0.844	0.15
16_L	68_G	0.843	0.15
177_A	307_T	0.843	0.15
214_F	612_D	0.842	0.15
178_S	278_M	0.841	0.15
56_I	417_I	0.841	0.15
576_G	588_R	0.841	0.15
564_L	596_R	0.840	0.15
571_C	623_T	0.839	0.15
157_L	161_L	0.838	0.15
524_G	564_L	0.837	0.15
548_E	571_C	0.836	0.15
529_P	533_Q	0.835	0.15
310_G	465_L	0.831	0.15
458_Y	548_E	0.829	0.15
239_A	294_P	0.827	0.15
154_V	280_G	0.825	0.15
75_E	140_M	0.823	0.15
581_E	621_A	0.823	0.15
426_L	574_P	0.822	0.15
557_V	620_L	0.822	0.15
591_I	610_A	0.822	0.15
263_V	273_V	0.822	0.15
469_Q	563_V	0.820	0.15
380_I	402_I	0.817	0.15
501_I	597_N	0.816	0.15
523_K	627_D	0.816	0.15
505_R	571_C	0.813	0.15
40_T	72_V	0.813	0.15
136_G	165_V	0.811	0.15
532_V	619_R	0.810	0.15
185_K	291_L	0.810	0.15
541_L	572_Q	0.809	0.14
596_R	632_L	0.807	0.14
91_G	146_A	0.805	0.14
161_L	563_V	0.802	0.14
360_K	578_R	0.800	0.14
455_S	458_Y	0.800	0.14
568_V	630_L	0.800	0.14
401_K	434_T	0.800	0.14
240_K	545_Y	0.799	0.14
51_L	78_G	0.797	0.14
456_G	459_T	0.796	0.14
579_F	617_I	0.796	0.14
523_K	570_F	0.795	0.14
21_M	64_I	0.794	0.14
571_C	608_T	0.794	0.14
121_K	607_L	0.793	0.14
24_I	271_L	0.790	0.14
161_L	164_G	0.789	0.14
358_E	361_G	0.788	0.14
495_K	602_Q	0.788	0.14
545_Y	579_F	0.785	0.14
78_G	351_R	0.785	0.14
529_P	633_L	0.784	0.14
97_F	406_G	0.784	0.14
166_N	305_A	0.783	0.14
300_I	330_S	0.783	0.14
355_M	426_L	0.779	0.14
52_V	302_A	0.778	0.14
536_L	580_G	0.778	0.14
502_F	605_T	0.777	0.14
498_A	562_R	0.776	0.14
12_F	25_G	0.775	0.14
211_K	240_K	0.771	0.14
14_R	455_S	0.768	0.14
148_L	590_V	0.767	0.14
27_F	132_N	0.767	0.14
523_K	575_E	0.767	0.14
303_V	318_G	0.765	0.14
179_I	184_A	0.764	0.14
24_I	218_E	0.764	0.14
571_C	612_D	0.763	0.14
41_G	44_P	0.761	0.14
131_N	414_N	0.760	0.14
586_I	602_Q	0.759	0.14
23_N	37_F	0.759	0.14
153_I	479_K	0.758	0.14
587_A	612_D	0.757	0.14
40_T	296_S	0.756	0.14
344_D	537_D	0.753	0.13
219_A	517_A	0.753	0.13
530_E	558_E	0.752	0.13
505_R	569_V	0.751	0.13
287_L	315_N	0.749	0.13
595_A	603_V	0.749	0.13
221_P	256_H	0.748	0.13
576_G	630_L	0.747	0.13
113_H	152_P	0.746	0.13
549_S	611_L	0.744	0.13
236_R	378_R	0.744	0.13
601_I	604_I	0.743	0.13
241_Q	533_Q	0.740	0.13
552_V	608_T	0.740	0.13
72_V	295_A	0.740	0.13
548_E	582_E	0.739	0.13
123_K	396_G	0.738	0.13
92_A	324_A	0.737	0.13
581_E	623_T	0.737	0.13
610_A	628_E	0.735	0.13
84_T	244_G	0.731	0.13
402_I	420_L	0.730	0.13
252_L	492_N	0.730	0.13
606_S	632_L	0.729	0.13
611_L	620_L	0.728	0.13
343_D	511_E	0.728	0.13
570_F	624_T	0.727	0.13
568_V	591_I	0.727	0.13
549_S	557_V	0.727	0.13
476_E	479_K	0.727	0.13
330_S	334_L	0.726	0.13
161_L	179_I	0.726	0.13
95_P	132_N	0.723	0.13
20_V	65_G	0.723	0.13
340_K	533_Q	0.721	0.13
484_D	490_S	0.720	0.13
349_T	625_S	0.718	0.13
546_L	609_N	0.718	0.13
502_F	564_L	0.718	0.13
13_G	16_L	0.718	0.13
188_F	191_N	0.717	0.13
559_A	626_V	0.716	0.13
147_F	328_V	0.715	0.13
253_G	386_A	0.713	0.13
516_F	556_T	0.713	0.13
338_K	530_E	0.713	0.13
154_V	215_F	0.712	0.13
304_L	312_Y	0.711	0.13
591_I	611_L	0.711	0.13
526_Y	613_D	0.710	0.13
167_F	590_V	0.710	0.13
505_R	536_L	0.710	0.13
610_A	625_S	0.709	0.13
45_N	49_A	0.708	0.13
224_G	262_Y	0.707	0.13
401_K	418_N	0.706	0.13
62_L	283_T	0.706	0.13
552_V	557_V	0.706	0.13
495_K	629_V	0.704	0.13
221_P	224_G	0.703	0.13
123_K	564_L	0.701	0.13
8_K	144_I	0.701	0.13
24_I	182_E	0.701	0.13
550_I	612_D	0.700	0.13
201_L	591_I	0.698	0.13
566_T	608_T	0.698	0.13
270_I	273_V	0.697	0.13
530_E	631_E	0.697	0.13
186_I	270_I	0.696	0.13
446_H	544_T	0.695	0.12
466_V	567_G	0.695	0.12
198_F	291_L	0.694	0.12
295_A	301_L	0.694	0.12
20_V	567_G	0.693	0.12
517_A	521_L	0.693	0.12
65_G	97_F	0.693	0.12
36_L	138_I	0.692	0.12
181_V	382_V	0.692	0.12
329_V	344_D	0.691	0.12
137_I	264_L	0.691	0.12
307_T	312_Y	0.691	0.12
569_V	625_S	0.691	0.12
565_K	619_R	0.690	0.12
587_A	597_N	0.690	0.12
357_A	629_V	0.689	0.12
524_G	570_F	0.689	0.12
307_T	315_N	0.689	0.12
629_V	632_L	0.689	0.12
271_L	406_G	0.689	0.12
55_M	62_L	0.688	0.12
595_A	601_I	0.686	0.12
625_S	632_L	0.685	0.12
203_I	292_V	0.684	0.12
84_T	595_A	0.683	0.12
550_I	604_I	0.683	0.12
249_I	261_P	0.683	0.12
149_G	596_R	0.681	0.12
280_G	283_T	0.680	0.12
311_A	315_N	0.680	0.12
292_V	309_K	0.680	0.12
227_V	258_I	0.679	0.12
56_I	318_G	0.678	0.12
171_H	605_T	0.678	0.12
241_Q	582_E	0.676	0.12
218_E	256_H	0.675	0.12
158_S	304_L	0.675	0.12
67_T	276_G	0.675	0.12
135_A	446_H	0.675	0.12
512_E	606_S	0.674	0.12
83_I	242_S	0.674	0.12
130_V	173_M	0.672	0.12
315_N	559_A	0.671	0.12
376_H	523_K	0.670	0.12
381_I	500_N	0.670	0.12
453_L	563_V	0.670	0.12
548_E	557_V	0.669	0.12
507_A	561_D	0.668	0.12
453_L	572_Q	0.668	0.12
211_K	564_L	0.667	0.12
73_G	449_L	0.666	0.12
147_F	247_A	0.665	0.12
18_N	98_L	0.665	0.12
21_M	30_W	0.665	0.12
559_A	599_E	0.665	0.12
586_I	621_A	0.665	0.12
619_R	628_E	0.664	0.12
520_Q	601_I	0.662	0.12
32_I	171_H	0.662	0.12
109_W	361_G	0.661	0.12
197_I	451_N	0.660	0.12
329_V	540_K	0.659	0.12
22_P	81_G	0.659	0.12
557_V	603_V	0.658	0.12
586_I	603_V	0.658	0.12
10_Q	19_M	0.658	0.12
204_Q	353_Q	0.656	0.12
416_A	449_L	0.656	0.12
70_K	209_L	0.655	0.12
294_P	563_V	0.655	0.12
506_K	618_E	0.654	0.12
351_R	371_T	0.654	0.12
73_G	266_N	0.651	0.12
414_N	446_H	0.650	0.12
13_G	37_F	0.647	0.12
98_L	287_L	0.646	0.12
546_L	557_V	0.645	0.12
540_K	629_V	0.645	0.12
71_L	146_A	0.644	0.12
50_K	57_T	0.643	0.12
552_V	595_A	0.642	0.12
102_I	247_A	0.641	0.12
455_S	617_I	0.641	0.12
250_H	256_H	0.641	0.12
501_I	558_E	0.641	0.12
216_L	269_L	0.637	0.12
27_F	36_L	0.637	0.12
10_Q	13_G	0.636	0.12
96_M	200_P	0.636	0.12
557_V	612_D	0.636	0.12
113_H	629_V	0.636	0.12
498_A	630_L	0.635	0.12
133_F	246_A	0.634	0.12
457_L	550_I	0.634	0.12
548_E	629_V	0.634	0.12
237_G	269_L	0.633	0.12
417_I	462_T	0.633	0.12
396_G	466_V	0.633	0.12
301_L	430_H	0.632	0.11
546_L	595_A	0.630	0.11
14_R	505_R	0.628	0.11
190_N	196_G	0.627	0.11
421_P	424_V	0.626	0.11
566_T	571_C	0.625	0.11
18_N	633_L	0.625	0.11
225_M	236_R	0.625	0.11
546_L	552_V	0.624	0.11
20_V	40_T	0.624	0.11
110_C	313_F	0.624	0.11
40_T	463_E	0.623	0.11
307_T	398_L	0.623	0.11
335_K	514_I	0.622	0.11
579_F	588_R	0.621	0.11
557_V	591_I	0.620	0.11
150_I	591_I	0.620	0.11
56_I	431_R	0.620	0.11
236_R	285_T	0.620	0.11
453_L	608_T	0.619	0.11
608_T	617_I	0.619	0.11
523_K	582_E	0.618	0.11
86_M	321_A	0.618	0.11
91_G	545_Y	0.618	0.11
258_I	322_A	0.618	0.11
150_I	566_T	0.618	0.11
449_L	604_I	0.617	0.11
289_G	307_T	0.617	0.11
611_L	630_L	0.617	0.11
46_E	62_L	0.616	0.11
256_H	262_Y	0.615	0.11
214_F	455_S	0.615	0.11
546_L	630_L	0.614	0.11
118_V	121_K	0.613	0.11
540_K	565_K	0.613	0.11
534_A	615_S	0.610	0.11
530_E	613_D	0.609	0.11
17_S	394_G	0.608	0.11
397_V	453_L	0.607	0.11
350_R	526_Y	0.607	0.11
405_A	458_Y	0.607	0.11
231_Y	266_N	0.606	0.11
605_T	626_V	0.605	0.11
611_L	633_L	0.605	0.11
208_E	345_I	0.604	0.11
560_K	620_L	0.604	0.11
235_G	416_A	0.604	0.11
27_F	88_V	0.603	0.11
515_R	564_L	0.602	0.11
14_R	611_L	0.602	0.11
177_A	318_G	0.602	0.11
495_K	601_I	0.601	0.11
204_Q	214_F	0.601	0.11
34_T	154_V	0.601	0.11
14_R	536_L	0.601	0.11
567_G	572_Q	0.600	0.11
277_G	281_V	0.600	0.11
107_G	307_T	0.600	0.11
476_E	570_F	0.600	0.11
102_I	295_A	0.598	0.11
119_D	512_E	0.597	0.11
13_G	17_S	0.596	0.11
270_I	326_S	0.596	0.11
562_R	587_A	0.596	0.11
62_L	402_I	0.595	0.11
526_Y	610_A	0.595	0.11
52_V	120_G	0.595	0.11
74_G	344_D	0.594	0.11
118_V	575_E	0.592	0.11
541_L	579_F	0.591	0.11
218_E	262_Y	0.590	0.11
232_M	247_A	0.589	0.11
43_L	108_G	0.588	0.11
37_F	41_G	0.588	0.11
214_F	587_A	0.588	0.11
42_W	264_L	0.587	0.11
25_G	82_A	0.586	0.11
33_I	313_F	0.586	0.11
94_M	122_I	0.585	0.11
552_V	586_I	0.585	0.11
68_G	221_P	0.584	0.11
20_V	296_S	0.584	0.11
215_F	333_L	0.583	0.11
167_F	311_A	0.580	0.11
316_I	631_E	0.579	0.11
463_E	628_E	0.579	0.11
72_V	156_A	0.577	0.11
502_F	571_C	0.576	0.11
66_Y	351_R	0.575	0.11
513_A	628_E	0.574	0.11
138_I	564_L	0.574	0.11
114_F	526_Y	0.574	0.11
92_A	149_G	0.574	0.11
247_A	334_L	0.573	0.11
51_L	438_M	0.573	0.11
118_V	524_G	0.573	0.11
516_F	573_Y	0.573	0.11
346_E	565_K	0.573	0.11
529_P	627_D	0.571	0.11
377_V	468_A	0.571	0.11
624_T	628_E	0.569	0.11
65_G	151_G	0.568	0.11
172_D	570_F	0.567	0.11
53_G	62_L	0.567	0.11
573_Y	611_L	0.567	0.11
580_G	586_I	0.565	0.11
523_K	530_E	0.563	0.10
541_L	621_A	0.563	0.10
38_I	272_A	0.563	0.10
520_Q	595_A	0.562	0.10
166_N	459_T	0.562	0.10
339_V	562_R	0.562	0.10
103_A	595_A	0.562	0.10
57_T	120_G	0.562	0.10
310_G	317_A	0.560	0.10
103_A	106_L	0.560	0.10
548_E	578_R	0.559	0.10
354_D	447_I	0.559	0.10
18_N	566_T	0.557	0.10
24_I	256_H	0.557	0.10
546_L	612_D	0.557	0.10
352_M	360_K	0.556	0.10
570_F	596_R	0.556	0.10
34_T	49_A	0.556	0.10
135_A	348_A	0.556	0.10
51_L	597_N	0.555	0.10
415_S	620_L	0.554	0.10
217_I	450_T	0.554	0.10
51_L	324_A	0.554	0.10
14_R	441_V	0.554	0.10
20_V	597_N	0.552	0.10
466_V	570_F	0.552	0.10
66_Y	78_G	0.551	0.10
109_W	301_L	0.551	0.10
361_G	570_F	0.551	0.10
27_F	60_L	0.550	0.10
172_D	603_V	0.549	0.10
281_V	356_K	0.549	0.10
414_N	448_S	0.549	0.10
582_E	603_V	0.548	0.10
18_N	603_V	0.547	0.10
39_P	289_G	0.547	0.10
450_T	548_E	0.545	0.10
449_L	595_A	0.544	0.10
92_A	542_T	0.544	0.10
507_A	590_V	0.542	0.10
463_E	467_A	0.541	0.10
15_F	68_G	0.540	0.10
40_T	288_G	0.539	0.10
251_F	327_F	0.539	0.10
108_G	566_T	0.539	0.10
122_I	443_Q	0.539	0.10
84_T	601_I	0.539	0.10
280_G	401_K	0.538	0.10
552_V	601_I	0.538	0.10
283_T	603_V	0.538	0.10
295_A	556_T	0.538	0.10
443_Q	508_A	0.538	0.10
567_G	587_A	0.537	0.10
25_G	151_G	0.537	0.10
595_A	609_N	0.537	0.10
95_P	187_L	0.536	0.10
612_D	623_T	0.534	0.10
11_S	604_I	0.534	0.10
333_L	558_E	0.534	0.10
541_L	605_T	0.533	0.10
218_E	221_P	0.533	0.10
235_G	398_L	0.533	0.10
546_L	586_I	0.533	0.10
34_T	59_L	0.533	0.10
522_V	562_R	0.532	0.10
505_R	612_D	0.531	0.10
44_P	566_T	0.530	0.10
486_F	626_V	0.529	0.10
347_A	591_I	0.529	0.10
293_S	378_R	0.528	0.10
522_V	612_D	0.527	0.10
332_I	462_T	0.527	0.10
558_E	632_L	0.527	0.10
160_M	320_C	0.527	0.10
116_R	470_R	0.526	0.10
562_R	613_D	0.525	0.10
619_R	631_E	0.525	0.10
114_F	335_K	0.524	0.10
304_L	582_E	0.524	0.10
529_P	596_R	0.523	0.10
40_T	164_G	0.522	0.10
348_A	352_M	0.521	0.10
521_L	538_R	0.521	0.10
309_K	580_G	0.520	0.10
503_L	618_E	0.520	0.10
224_G	444_A	0.519	0.10
489_S	528_E	0.519	0.10
250_H	380_I	0.519	0.10
268_R	595_A	0.517	0.10
616_V	633_L	0.517	0.10
329_V	513_A	0.517	0.10
46_E	208_E	0.516	0.10
403_Q	605_T	0.516	0.10
346_E	619_R	0.516	0.10
108_G	380_I	0.516	0.10
16_L	230_A	0.516	0.10
88_V	558_E	0.515	0.10
597_N	603_V	0.515	0.10
275_L	334_L	0.514	0.10
275_L	542_T	0.514	0.10
121_K	401_K	0.514	0.10
162_A	591_I	0.513	0.10
53_G	170_V	0.513	0.10
182_E	250_H	0.513	0.10
20_V	233_F	0.512	0.10
303_V	628_E	0.512	0.10
294_P	352_M	0.511	0.10
183_P	388_M	0.510	0.10
224_G	253_G	0.509	0.10
126_F	195_H	0.509	0.10
507_A	580_G	0.508	0.10
520_Q	611_L	0.508	0.10
54_P	88_V	0.508	0.10
370_V	492_N	0.506	0.10
338_K	416_A	0.506	0.10
314_A	321_A	0.506	0.10
19_M	134_S	0.505	0.10
484_D	627_D	0.505	0.10
549_S	587_A	0.504	0.10
153_I	540_K	0.504	0.10
411_S	523_K	0.504	0.10
435_E	438_M	0.502	0.10
557_V	597_N	0.501	0.10
227_V	570_F	0.501	0.10
263_V	270_I	0.501	0.10
256_H	444_A	0.500	0.10
294_P	546_L	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1a3aA	2	0.2292	100	0.872	Contact Map
3qnqA	2	0.551	100	0.874	Contact Map
3oxpA	2	0.2276	100	0.884	Contact Map
1a6jA	4	0.2402	100	0.884	Contact Map
3bjvA	2	0.2276	100	0.884	Contact Map
2oq3A	1	0.2261	100	0.884	Contact Map
2oqtA	2	0.2292	100	0.885	Contact Map
4m62S	1	0.2292	100	0.887	Contact Map
2a0jA	1	0.2229	100	0.888	Contact Map
3urrA	2	0.2308	100	0.889	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0159 seconds.