T0930_1_670 - CASP12 - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

T0930_1_670 - T0930 1-670

ID:	99	Sequences: MSAETVNNYDYSDWYENAAPTKAPVEVIPPCDPTADEGLFHICIAAISLVVMLVLAILARRQKLSDNQRGLTGLLSPVNFLDHTQHKGLAVAVYGVLFCKLVGMVLSHHPLPFTKEVANKEFWMILALLYYPTLYYPLLACGTLHNKVGYVLGSLLSWTHFGILVWQKVDCPKTPQIYKYYALFGSLPQIACLAFLSFQYPLLLFKGLQNTETANASEDLSSSYYRDYVKKILKKKKPTKISSSTSKPKLFDRLRDAVKSYIYTPEDVFRFPLKLAISVVVAFIALYQMALLLISGVLPTLHIVRRGVDENIAFLLAGFNIILSNDRQEVVRIVVYYLWCVEICYVSAVTLSCLVNLLMLMRSMVLHRSNLKGLYRGDSLNVFNCHRSIRPSRPALVCWMGFTSYQAAFLCLGMAIQTLVFFICILFAVFLIIIPILWGTNLMLFHIIGNLWPFWLTLVLAALIQHVASRFLFIRKDGGTRDLNNRGSLFLLSYILFLVNVMIGVVLGIWRVVITALFNIVHLGRLDISLLNRNVEAFDPGYRCYSHYLKIEVSQSHPVMKAFCGLLLQSSGQDGLSAQRIRDAEEGIQLVQQEKKQNKVSNAKRARAHWQLLYTLVNNPSLVGSRKHFQCQSSESFINGALSRTSKEGSKKDGSVKEPNKEAESAAASN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_10
Length:	670 (607)
Sequences:	107 (59)
Seq/√Len:	2.4

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
609_H	616_L	3.959	0.62
368_R	377_G	3.726	0.57
619_N	626_R	3.638	0.55
609_H	620_P	3.469	0.51
616_L	619_N	3.426	0.50
610_W	619_N	3.399	0.49
610_W	620_P	3.368	0.49
615_T	620_P	3.354	0.48
612_L	622_L	3.335	0.48
610_W	626_R	3.325	0.48
620_P	626_R	3.273	0.46
616_L	626_R	3.268	0.46
610_W	616_L	3.146	0.44
616_L	620_P	3.043	0.41
616_L	622_L	3.030	0.41
494_Y	559_V	2.920	0.39
527_D	539_D	2.885	0.38
346_V	459_V	2.807	0.36
188_P	196_L	2.777	0.36
607_R	615_T	2.728	0.35
504_G	511_R	2.652	0.33
612_L	626_R	2.652	0.33
607_R	626_R	2.635	0.33
63_K	509_I	2.611	0.32
504_G	539_D	2.590	0.32
511_R	539_D	2.590	0.32
615_T	619_N	2.579	0.32
42_I	47_I	2.578	0.32
348_A	405_Y	2.570	0.32
61_R	73_G	2.537	0.31
609_H	619_N	2.521	0.31
374_L	377_G	2.517	0.31
619_N	622_L	2.506	0.30
364_M	515_T	2.455	0.29
609_H	626_R	2.432	0.29
607_R	612_L	2.418	0.29
141_C	188_P	2.405	0.28
428_A	433_I	2.395	0.28
607_R	616_L	2.387	0.28
80_F	354_L	2.374	0.28
610_W	614_Y	2.355	0.28
137_P	153_G	2.337	0.27
609_H	622_L	2.249	0.26
615_T	626_R	2.248	0.26
536_E	539_D	2.241	0.26
609_H	612_L	2.239	0.25
193_L	196_L	2.192	0.25
107_S	541_G	2.188	0.25
533_R	536_E	2.174	0.24
429_V	617_V	2.171	0.24
605_R	613_L	2.152	0.24
187_L	236_K	2.128	0.24
607_R	610_W	2.118	0.23
612_L	616_L	2.097	0.23
77_P	95_G	2.097	0.23
271_F	494_Y	2.096	0.23
465_Q	485_N	2.095	0.23
368_R	374_L	2.095	0.23
610_W	615_T	2.080	0.23
153_G	171_C	2.070	0.23
61_R	72_T	2.057	0.23
544_C	617_V	2.035	0.22
155_L	416_I	2.029	0.22
149_G	533_R	2.022	0.22
357_L	364_M	1.978	0.21
72_T	487_G	1.962	0.21
149_G	536_E	1.943	0.21
70_G	531_L	1.937	0.21
622_L	626_R	1.927	0.21
95_G	155_L	1.919	0.20
234_K	433_I	1.902	0.20
149_G	463_L	1.897	0.20
607_R	622_L	1.884	0.20
228_Y	326_D	1.872	0.20
489_L	493_S	1.865	0.20
180_Y	423_I	1.845	0.19
78_V	376_R	1.832	0.19
531_L	539_D	1.828	0.19
95_G	416_I	1.820	0.19
409_F	541_G	1.818	0.19
504_G	527_D	1.816	0.19
511_R	527_D	1.816	0.19
423_I	427_F	1.798	0.19
345_Y	359_M	1.786	0.19
607_R	619_N	1.777	0.18
140_A	541_G	1.772	0.18
609_H	615_T	1.768	0.18
519_N	555_Q	1.759	0.18
229_V	559_V	1.758	0.18
377_G	408_A	1.758	0.18
74_L	200_Y	1.728	0.18
77_P	137_P	1.725	0.18
395_A	404_S	1.723	0.18
525_R	539_D	1.713	0.18
421_F	444_L	1.701	0.17
137_P	171_C	1.700	0.17
129_L	166_W	1.697	0.17
551_I	560_M	1.695	0.17
612_L	620_P	1.673	0.17
612_L	615_T	1.671	0.17
56_A	60_R	1.670	0.17
527_D	531_L	1.660	0.17
273_L	562_A	1.638	0.17
76_S	407_A	1.637	0.17
398_C	421_F	1.635	0.17
494_Y	618_N	1.635	0.17
361_M	557_H	1.628	0.16
77_P	558_P	1.590	0.16
95_G	149_G	1.590	0.16
73_G	255_R	1.582	0.16
500_N	504_G	1.579	0.16
500_N	511_R	1.579	0.16
104_M	163_I	1.568	0.16
614_Y	627_K	1.561	0.16
44_I	47_I	1.560	0.16
464_I	474_I	1.559	0.16
607_R	620_P	1.540	0.15
413_G	567_L	1.524	0.15
275_L	462_A	1.521	0.15
22_K	35_A	1.509	0.15
607_R	627_K	1.496	0.15
139_L	525_R	1.493	0.15
200_Y	502_M	1.487	0.15
536_E	560_M	1.484	0.15
500_N	539_D	1.458	0.14
483_L	517_L	1.454	0.14
276_A	487_G	1.445	0.14
485_N	541_G	1.444	0.14
352_S	363_S	1.438	0.14
290_A	300_T	1.437	0.14
141_C	196_L	1.431	0.14
135_Y	140_A	1.430	0.14
612_L	619_N	1.422	0.14
606_A	610_W	1.393	0.14
439_G	564_C	1.383	0.14
404_S	408_A	1.380	0.14
552_E	557_H	1.377	0.14
496_L	549_L	1.376	0.14
156_L	498_L	1.374	0.14
378_D	515_T	1.370	0.14
367_H	370_N	1.364	0.13
281_V	525_R	1.360	0.13
352_S	361_M	1.358	0.13
331_V	433_I	1.349	0.13
100_K	617_V	1.345	0.13
172_P	501_V	1.345	0.13
485_N	549_L	1.342	0.13
465_Q	473_F	1.341	0.13
235_K	559_V	1.338	0.13
615_T	622_L	1.336	0.13
287_Y	563_F	1.334	0.13
46_A	315_L	1.330	0.13
271_F	559_V	1.326	0.13
401_G	499_V	1.326	0.13
223_S	568_L	1.324	0.13
157_S	261_Y	1.315	0.13
200_Y	587_G	1.306	0.13
405_Y	464_I	1.303	0.13
525_R	606_A	1.299	0.13
304_V	315_L	1.292	0.13
233_L	566_L	1.292	0.13
394_P	407_A	1.292	0.13
376_R	387_R	1.289	0.13
262_I	529_S	1.285	0.13
190_I	204_L	1.283	0.13
100_K	601_S	1.283	0.13
63_K	230_K	1.280	0.13
616_L	627_K	1.276	0.13
412_L	519_N	1.275	0.13
41_H	47_I	1.273	0.13
77_P	511_R	1.273	0.13
77_P	504_G	1.273	0.13
579_Q	601_S	1.272	0.13
291_L	614_Y	1.271	0.13
28_I	621_S	1.270	0.13
153_G	504_G	1.269	0.13
153_G	511_R	1.269	0.13
519_N	522_H	1.262	0.12
190_I	548_Y	1.256	0.12
193_L	416_I	1.254	0.12
188_P	558_P	1.252	0.12
287_Y	610_W	1.251	0.12
141_C	558_P	1.251	0.12
229_V	378_D	1.250	0.12
506_V	535_V	1.249	0.12
141_C	153_G	1.244	0.12
102_V	283_F	1.243	0.12
383_F	482_D	1.242	0.12
156_L	160_H	1.242	0.12
511_R	525_R	1.241	0.12
504_G	525_R	1.241	0.12
284_I	535_V	1.233	0.12
72_T	484_N	1.233	0.12
79_N	281_V	1.231	0.12
610_W	627_K	1.229	0.12
81_L	351_L	1.224	0.12
135_Y	540_P	1.220	0.12
558_P	620_P	1.216	0.12
345_Y	370_N	1.215	0.12
540_P	568_L	1.211	0.12
383_F	475_R	1.209	0.12
197_S	200_Y	1.203	0.12
523_L	552_E	1.201	0.12
156_L	367_H	1.196	0.12
57_I	509_I	1.194	0.12
91_V	436_I	1.193	0.12
104_M	271_F	1.192	0.12
465_Q	610_W	1.190	0.12
171_C	196_L	1.188	0.12
153_G	539_D	1.186	0.12
188_P	193_L	1.185	0.12
350_T	551_I	1.183	0.12
136_Y	352_S	1.181	0.12
133_T	352_S	1.180	0.12
382_V	404_S	1.180	0.12
287_Y	494_Y	1.179	0.12
233_L	433_I	1.178	0.12
257_A	548_Y	1.176	0.12
271_F	526_L	1.174	0.12
203_L	348_A	1.166	0.12
533_R	560_M	1.163	0.12
45_A	402_F	1.163	0.12
80_F	407_A	1.161	0.11
368_R	408_A	1.154	0.11
229_V	525_R	1.152	0.11
378_D	525_R	1.152	0.11
94_Y	616_L	1.150	0.11
270_R	346_V	1.150	0.11
316_L	327_R	1.140	0.11
280_V	286_L	1.139	0.11
233_L	413_G	1.134	0.11
305_R	331_V	1.132	0.11
153_G	188_P	1.131	0.11
129_L	220_L	1.122	0.11
55_L	141_C	1.120	0.11
614_Y	619_N	1.119	0.11
99_C	328_Q	1.116	0.11
504_G	619_N	1.114	0.11
511_R	619_N	1.114	0.11
620_P	627_K	1.109	0.11
87_K	403_T	1.109	0.11
609_H	613_L	1.109	0.11
612_L	627_K	1.108	0.11
153_G	619_N	1.100	0.11
69_R	605_R	1.097	0.11
405_Y	472_L	1.095	0.11
204_L	505_V	1.095	0.11
345_Y	363_S	1.094	0.11
95_G	141_C	1.094	0.11
471_F	599_K	1.091	0.11
401_G	525_R	1.090	0.11
200_Y	232_I	1.089	0.11
99_C	285_A	1.086	0.11
57_I	61_R	1.084	0.11
274_K	407_A	1.083	0.11
378_D	410_L	1.078	0.11
205_F	578_A	1.076	0.11
112_P	272_P	1.070	0.11
193_L	233_L	1.068	0.11
363_S	367_H	1.062	0.11
54_V	320_N	1.061	0.11
149_G	468_A	1.059	0.11
615_T	627_K	1.056	0.11
396_L	459_V	1.055	0.11
377_G	558_P	1.054	0.11
340_C	410_L	1.053	0.11
123_W	454_F	1.052	0.11
78_V	187_L	1.051	0.11
501_V	560_M	1.046	0.10
137_P	563_F	1.045	0.10
144_L	490_F	1.043	0.10
509_I	533_R	1.041	0.10
113_F	622_L	1.041	0.10
77_P	404_S	1.040	0.10
501_V	534_N	1.039	0.10
428_A	437_L	1.037	0.10
271_F	613_L	1.033	0.10
190_I	428_A	1.032	0.10
43_C	275_L	1.031	0.10
504_G	558_P	1.030	0.10
511_R	558_P	1.030	0.10
278_S	370_N	1.029	0.10
359_M	367_H	1.028	0.10
409_F	412_L	1.028	0.10
417_Q	531_L	1.028	0.10
324_S	371_L	1.027	0.10
421_F	529_S	1.026	0.10
273_L	278_S	1.025	0.10
56_A	61_R	1.025	0.10
35_A	53_L	1.021	0.10
153_G	558_P	1.021	0.10
135_Y	377_G	1.020	0.10
272_P	506_V	1.019	0.10
70_G	111_L	1.015	0.10
125_I	463_L	1.013	0.10
170_D	542_Y	1.010	0.10
172_P	272_P	1.002	0.10
149_G	374_L	1.001	0.10
272_P	564_C	1.000	0.10
149_G	155_L	1.000	0.10
223_S	242_S	1.000	0.10
368_R	558_P	0.999	0.10
35_A	231_K	0.999	0.10
102_V	491_L	0.996	0.10
166_W	612_L	0.996	0.10
232_I	382_V	0.995	0.10
271_F	283_F	0.994	0.10
563_F	567_L	0.992	0.10
143_T	354_L	0.989	0.10
612_L	628_H	0.988	0.10
55_L	140_A	0.987	0.10
232_I	472_L	0.986	0.10
45_A	526_L	0.986	0.10
57_I	60_R	0.986	0.10
293_L	542_Y	0.981	0.10
45_A	51_V	0.979	0.10
77_P	539_D	0.979	0.10
94_Y	137_P	0.979	0.10
180_Y	560_M	0.978	0.10
638_I	642_L	0.978	0.10
80_F	163_I	0.977	0.10
230_K	618_N	0.976	0.10
327_R	371_L	0.975	0.10
151_V	166_W	0.970	0.10
202_L	232_I	0.968	0.10
60_R	70_G	0.967	0.10
78_V	387_R	0.967	0.10
43_C	568_L	0.965	0.10
139_L	183_L	0.962	0.10
374_L	382_V	0.961	0.10
185_G	320_N	0.961	0.10
61_R	606_A	0.961	0.10
345_Y	383_F	0.959	0.10
161_F	192_C	0.956	0.10
193_L	567_L	0.956	0.10
60_R	203_L	0.955	0.10
377_G	619_N	0.954	0.10
326_D	517_L	0.953	0.10
430_F	522_H	0.953	0.10
28_I	34_T	0.952	0.10
281_V	378_D	0.951	0.10
135_Y	152_L	0.949	0.10
483_L	607_R	0.949	0.10
148_V	166_W	0.947	0.10
367_H	498_L	0.945	0.10
104_M	563_F	0.945	0.10
137_P	504_G	0.945	0.10
137_P	511_R	0.945	0.10
283_F	446_H	0.944	0.10
138_L	229_V	0.944	0.10
347_S	437_L	0.943	0.10
494_Y	532_N	0.942	0.10
267_D	382_V	0.941	0.10
148_V	164_L	0.940	0.10
52_M	376_R	0.937	0.10
91_V	487_G	0.937	0.10
352_S	367_H	0.934	0.10
377_G	404_S	0.933	0.10
31_C	616_L	0.931	0.10
392_S	397_V	0.931	0.10
31_C	58_L	0.930	0.10
70_G	113_F	0.930	0.10
338_L	409_F	0.929	0.10
432_I	544_C	0.929	0.10
466_H	525_R	0.928	0.10
61_R	71_L	0.927	0.10
606_A	626_R	0.923	0.09
103_G	604_K	0.922	0.09
57_I	230_K	0.921	0.09
545_Y	552_E	0.921	0.09
74_L	570_S	0.920	0.09
426_L	449_G	0.920	0.09
262_I	417_Q	0.918	0.09
132_P	156_L	0.916	0.09
294_I	364_M	0.915	0.09
539_D	558_P	0.914	0.09
345_Y	367_H	0.913	0.09
45_A	67_N	0.913	0.09
100_K	542_Y	0.911	0.09
529_S	533_R	0.910	0.09
377_G	545_Y	0.910	0.09
545_Y	557_H	0.908	0.09
72_T	183_L	0.904	0.09
502_M	515_T	0.903	0.09
366_L	375_Y	0.903	0.09
610_W	622_L	0.900	0.09
370_N	555_Q	0.900	0.09
205_F	341_V	0.900	0.09
79_N	101_L	0.897	0.09
454_F	501_V	0.895	0.09
35_A	259_K	0.893	0.09
526_L	534_N	0.892	0.09
228_Y	327_R	0.892	0.09
431_L	531_L	0.892	0.09
191_A	629_F	0.891	0.09
131_Y	614_Y	0.889	0.09
619_N	627_K	0.888	0.09
75_L	544_C	0.887	0.09
408_A	536_E	0.886	0.09
350_T	470_R	0.885	0.09
539_D	619_N	0.879	0.09
197_S	204_L	0.877	0.09
197_S	288_Q	0.877	0.09
160_H	519_N	0.876	0.09
630_Q	638_I	0.875	0.09
368_R	473_F	0.872	0.09
190_I	595_K	0.872	0.09
396_L	404_S	0.870	0.09
435_P	564_C	0.870	0.09
204_L	542_Y	0.868	0.09
370_N	377_G	0.867	0.09
541_G	567_L	0.867	0.09
175_P	297_V	0.866	0.09
39_L	568_L	0.866	0.09
193_L	204_L	0.866	0.09
526_L	536_E	0.865	0.09
406_Q	500_N	0.862	0.09
278_S	421_F	0.862	0.09
133_T	136_Y	0.861	0.09
129_L	566_L	0.860	0.09
200_Y	521_V	0.857	0.09
593_Q	613_L	0.857	0.09
282_A	484_N	0.857	0.09
227_D	316_L	0.856	0.09
270_R	312_I	0.855	0.09
92_A	360_L	0.852	0.09
374_L	391_P	0.846	0.09
177_I	351_L	0.846	0.09
205_F	372_K	0.845	0.09
60_R	505_V	0.845	0.09
405_Y	488_S	0.844	0.09
528_I	548_Y	0.843	0.09
408_A	435_P	0.840	0.09
105_V	382_V	0.840	0.09
286_L	295_S	0.839	0.09
278_S	494_Y	0.838	0.09
137_P	141_C	0.835	0.09
453_P	531_L	0.834	0.09
610_W	613_L	0.834	0.09
473_F	485_N	0.832	0.09
94_Y	419_L	0.831	0.09
432_I	437_L	0.829	0.09
111_L	432_I	0.828	0.09
354_L	372_K	0.828	0.09
67_N	228_Y	0.826	0.09
57_I	603_A	0.825	0.09
501_V	541_G	0.825	0.09
28_I	33_P	0.824	0.09
169_V	423_I	0.823	0.09
229_V	232_I	0.823	0.09
415_A	488_S	0.823	0.09
475_R	482_D	0.822	0.09
404_S	536_E	0.822	0.09
298_L	314_F	0.821	0.09
636_S	643_S	0.819	0.09
80_F	275_L	0.809	0.09
306_R	392_S	0.809	0.09
419_L	469_S	0.808	0.09
235_K	551_I	0.807	0.09
459_V	470_R	0.806	0.09
196_L	567_L	0.806	0.09
75_L	139_L	0.805	0.09
30_P	35_A	0.805	0.09
433_I	445_F	0.805	0.09
408_A	542_Y	0.804	0.09
137_P	539_D	0.804	0.09
598_N	636_S	0.803	0.09
191_A	474_I	0.803	0.09
423_I	625_S	0.803	0.09
105_V	121_E	0.802	0.09
558_P	619_N	0.801	0.09
378_D	552_E	0.800	0.09
346_V	502_M	0.800	0.09
522_H	530_L	0.799	0.09
130_Y	160_H	0.797	0.09
558_P	615_T	0.797	0.09
149_G	192_C	0.796	0.09
412_L	555_Q	0.796	0.09
162_G	372_K	0.795	0.09
78_V	357_L	0.794	0.09
81_L	545_Y	0.794	0.09
181_Y	217_S	0.792	0.09
240_K	568_L	0.792	0.09
284_I	508_G	0.790	0.09
368_R	619_N	0.790	0.09
204_L	560_M	0.790	0.09
151_V	280_V	0.788	0.08
87_K	361_M	0.786	0.08
453_P	557_H	0.786	0.08
302_H	305_R	0.785	0.08
495_I	519_N	0.784	0.08
138_L	200_Y	0.784	0.08
56_A	524_G	0.783	0.08
136_Y	610_W	0.783	0.08
505_V	509_I	0.783	0.08
298_L	324_S	0.783	0.08
291_L	318_G	0.780	0.08
354_L	625_S	0.779	0.08
39_L	43_C	0.778	0.08
57_I	512_V	0.778	0.08
408_A	545_Y	0.778	0.08
135_Y	368_R	0.777	0.08
229_V	364_M	0.776	0.08
151_V	335_V	0.775	0.08
57_I	643_S	0.775	0.08
98_F	127_A	0.774	0.08
376_R	601_S	0.774	0.08
199_Q	207_G	0.774	0.08
73_G	436_I	0.773	0.08
29_P	37_E	0.769	0.08
111_L	467_V	0.769	0.08
132_P	519_N	0.767	0.08
291_L	351_L	0.766	0.08
80_F	238_P	0.765	0.08
426_L	496_L	0.765	0.08
169_V	190_I	0.765	0.08
251_F	525_R	0.764	0.08
95_G	192_C	0.762	0.08
39_L	195_F	0.759	0.08
43_C	556_S	0.759	0.08
550_K	557_H	0.758	0.08
140_A	473_F	0.757	0.08
467_V	593_Q	0.757	0.08
396_L	606_A	0.757	0.08
229_V	515_T	0.755	0.08
609_H	623_V	0.755	0.08
489_L	554_S	0.755	0.08
495_I	498_L	0.754	0.08
86_H	149_G	0.754	0.08
165_V	266_E	0.754	0.08
418_T	487_G	0.753	0.08
90_A	367_H	0.752	0.08
71_L	601_S	0.751	0.08
474_I	482_D	0.751	0.08
137_P	619_N	0.750	0.08
44_I	105_V	0.749	0.08
307_G	316_L	0.746	0.08
66_D	350_T	0.745	0.08
412_L	541_G	0.745	0.08
521_V	530_L	0.744	0.08
139_L	557_H	0.744	0.08
165_V	282_A	0.744	0.08
135_Y	564_C	0.740	0.08
278_S	351_L	0.740	0.08
128_L	412_L	0.739	0.08
54_V	483_L	0.739	0.08
170_D	469_S	0.739	0.08
262_I	531_L	0.736	0.08
135_Y	373_G	0.736	0.08
369_S	528_I	0.733	0.08
245_T	248_P	0.731	0.08
336_Y	432_I	0.730	0.08
182_A	502_M	0.730	0.08
300_T	457_T	0.729	0.08
551_I	579_Q	0.728	0.08
279_V	459_V	0.727	0.08
269_F	469_S	0.726	0.08
75_L	424_C	0.726	0.08
104_M	515_T	0.725	0.08
417_Q	493_S	0.725	0.08
170_D	560_M	0.724	0.08
368_R	620_P	0.722	0.08
89_L	348_A	0.721	0.08
190_I	560_M	0.721	0.08
169_V	429_V	0.718	0.08
157_S	165_V	0.716	0.08
489_L	557_H	0.714	0.08
78_V	551_I	0.712	0.08
609_H	627_K	0.712	0.08
78_V	418_T	0.711	0.08
27_V	32_D	0.711	0.08
525_R	536_E	0.711	0.08
147_K	520_I	0.707	0.08
162_G	596_K	0.706	0.08
137_P	558_P	0.705	0.08
73_G	500_N	0.703	0.08
171_C	413_G	0.702	0.08
60_R	235_K	0.702	0.08
335_V	338_L	0.700	0.08
132_P	555_Q	0.698	0.08
553_V	557_H	0.698	0.08
35_A	514_I	0.695	0.08
525_R	619_N	0.694	0.08
134_L	398_C	0.694	0.08
515_T	544_C	0.693	0.08
54_V	376_R	0.693	0.08
502_M	517_L	0.691	0.08
178_Y	405_Y	0.691	0.08
228_Y	517_L	0.689	0.08
344_C	456_L	0.689	0.08
414_M	612_L	0.689	0.08
159_T	372_K	0.688	0.08
22_K	28_I	0.685	0.08
125_I	362_R	0.684	0.08
53_L	112_P	0.684	0.08
435_P	500_N	0.683	0.08
305_R	460_L	0.683	0.08
171_C	504_G	0.682	0.08
171_C	511_R	0.682	0.08
472_L	488_S	0.681	0.08
91_V	545_Y	0.681	0.08
163_I	556_S	0.681	0.08
305_R	312_I	0.680	0.08
159_T	164_L	0.680	0.08
513_V	621_S	0.679	0.08
169_V	235_K	0.679	0.08
338_L	606_A	0.678	0.08
181_Y	184_F	0.676	0.08
50_V	440_T	0.675	0.08
137_P	188_P	0.675	0.08
104_M	286_L	0.674	0.08
165_V	467_V	0.674	0.08
287_Y	567_L	0.673	0.08
468_A	534_N	0.673	0.08
500_N	626_R	0.672	0.08
280_V	566_L	0.672	0.08
286_L	487_G	0.671	0.08
494_Y	561_K	0.669	0.08
354_L	409_F	0.668	0.08
99_C	166_W	0.667	0.08
287_Y	485_N	0.665	0.08
61_R	87_K	0.664	0.08
232_I	440_T	0.664	0.08
145_H	604_K	0.664	0.08
166_W	560_M	0.664	0.08
39_L	58_L	0.663	0.08
445_F	561_K	0.663	0.08
511_R	531_L	0.663	0.08
504_G	531_L	0.663	0.08
134_L	299_P	0.661	0.08
205_F	376_R	0.661	0.08
73_G	451_L	0.659	0.08
89_L	284_I	0.659	0.08
271_F	414_M	0.657	0.08
80_F	497_F	0.656	0.08
205_F	347_S	0.653	0.08
320_N	541_G	0.652	0.08
387_R	605_R	0.650	0.08
315_L	323_L	0.650	0.08
192_C	424_C	0.648	0.08
427_F	509_I	0.648	0.08
221_S	305_R	0.648	0.08
255_R	313_A	0.648	0.08
180_Y	193_L	0.646	0.08
66_D	551_I	0.645	0.08
353_C	455_W	0.645	0.08
183_L	431_L	0.645	0.08
195_F	234_K	0.644	0.08
500_N	622_L	0.644	0.08
422_F	486_R	0.644	0.08
149_G	432_I	0.643	0.08
229_V	294_I	0.643	0.08
377_G	542_Y	0.643	0.08
157_S	624_G	0.642	0.08
607_R	614_Y	0.642	0.08
380_L	432_I	0.642	0.08
511_R	536_E	0.641	0.08
504_G	536_E	0.641	0.08
77_P	94_Y	0.641	0.08
104_M	544_C	0.641	0.08
463_L	521_V	0.641	0.08
25_V	279_V	0.639	0.08
75_L	96_V	0.638	0.08
91_V	191_A	0.638	0.08
288_Q	502_M	0.638	0.08
500_N	527_D	0.637	0.07
270_R	549_L	0.637	0.07
522_H	528_I	0.637	0.07
298_L	306_R	0.636	0.07
67_N	74_L	0.635	0.07
259_K	529_S	0.634	0.07
190_I	194_A	0.633	0.07
90_A	383_F	0.633	0.07
183_L	363_S	0.632	0.07
272_P	499_V	0.632	0.07
146_N	164_L	0.632	0.07
364_M	410_L	0.631	0.07
193_L	287_Y	0.630	0.07
622_L	627_K	0.629	0.07
23_A	29_P	0.629	0.07
270_R	396_L	0.628	0.07
212_E	334_V	0.628	0.07
323_L	344_C	0.628	0.07
61_R	406_Q	0.627	0.07
515_T	538_F	0.627	0.07
356_N	542_Y	0.626	0.07
525_R	611_Q	0.625	0.07
35_A	52_M	0.624	0.07
183_L	529_S	0.624	0.07
299_P	371_L	0.623	0.07
71_L	75_L	0.622	0.07
269_F	622_L	0.622	0.07
141_C	541_G	0.621	0.07
486_R	504_G	0.620	0.07
486_R	511_R	0.620	0.07
366_L	389_I	0.619	0.07
125_I	231_K	0.619	0.07
307_G	311_N	0.618	0.07
181_Y	201_P	0.617	0.07
24_P	53_L	0.615	0.07
146_N	409_F	0.615	0.07
610_W	617_V	0.614	0.07
79_N	164_L	0.613	0.07
263_Y	287_Y	0.613	0.07
536_E	548_Y	0.613	0.07
229_V	414_M	0.613	0.07
127_A	523_L	0.612	0.07
388_S	517_L	0.612	0.07
175_P	502_M	0.611	0.07
55_L	61_R	0.610	0.07
138_L	312_I	0.609	0.07
494_Y	511_R	0.609	0.07
494_Y	504_G	0.609	0.07
126_L	456_L	0.609	0.07
93_V	275_L	0.609	0.07
615_T	618_N	0.608	0.07
102_V	402_F	0.607	0.07
301_L	322_I	0.606	0.07
272_P	545_Y	0.606	0.07
435_P	542_Y	0.606	0.07
359_M	363_S	0.606	0.07
422_F	452_W	0.606	0.07
198_F	531_L	0.605	0.07
509_I	560_M	0.604	0.07
383_F	386_H	0.604	0.07
377_G	620_P	0.603	0.07
372_K	514_I	0.603	0.07
75_L	282_A	0.603	0.07
496_L	563_F	0.603	0.07
263_Y	486_R	0.602	0.07
141_C	615_T	0.601	0.07
407_A	525_R	0.601	0.07
464_I	472_L	0.600	0.07
335_V	340_C	0.599	0.07
614_Y	626_R	0.599	0.07
139_L	203_L	0.598	0.07
70_G	189_Q	0.598	0.07
26_E	254_L	0.598	0.07
46_A	428_A	0.597	0.07
228_Y	455_W	0.596	0.07
555_Q	567_L	0.595	0.07
147_K	426_L	0.594	0.07
294_I	378_D	0.594	0.07
120_K	608_A	0.593	0.07
39_L	133_T	0.593	0.07
183_L	596_K	0.592	0.07
198_F	335_V	0.591	0.07
151_V	487_G	0.591	0.07
444_L	505_V	0.590	0.07
316_L	324_S	0.589	0.07
31_C	48_S	0.587	0.07
38_G	69_R	0.587	0.07
191_A	415_A	0.587	0.07
454_F	554_S	0.587	0.07
26_E	248_P	0.587	0.07
417_Q	489_L	0.587	0.07
141_C	171_C	0.585	0.07
172_P	530_L	0.585	0.07
394_P	474_I	0.585	0.07
297_V	469_S	0.584	0.07
133_T	542_Y	0.583	0.07
149_G	171_C	0.583	0.07
141_C	157_S	0.581	0.07
31_C	622_L	0.580	0.07
32_D	613_L	0.580	0.07
272_P	530_L	0.579	0.07
151_V	220_L	0.579	0.07
87_K	525_R	0.579	0.07
372_K	537_A	0.579	0.07
193_L	269_F	0.578	0.07
91_V	232_I	0.577	0.07
183_L	188_P	0.577	0.07
140_A	172_P	0.576	0.07
473_F	558_P	0.576	0.07
302_H	517_L	0.576	0.07
212_E	432_I	0.576	0.07
236_K	419_L	0.575	0.07
549_L	563_F	0.575	0.07
158_W	201_P	0.573	0.07
100_K	206_K	0.572	0.07
171_C	539_D	0.571	0.07
184_F	357_L	0.571	0.07
147_K	612_L	0.569	0.07
527_D	536_E	0.569	0.07
585_E	596_K	0.568	0.07
274_K	412_L	0.567	0.07
184_F	231_K	0.566	0.07
188_P	541_G	0.565	0.07
344_C	371_L	0.565	0.07
232_I	416_I	0.564	0.07
368_R	371_L	0.564	0.07
181_Y	461_A	0.563	0.07
197_S	564_C	0.563	0.07
104_M	503_I	0.563	0.07
483_L	612_L	0.563	0.07
202_L	618_N	0.562	0.07
597_Q	643_S	0.562	0.07
87_K	474_I	0.561	0.07
90_A	555_Q	0.561	0.07
190_I	551_I	0.561	0.07
136_Y	542_Y	0.561	0.07
156_L	339_W	0.560	0.07
93_V	132_P	0.558	0.07
120_K	462_A	0.558	0.07
314_F	509_I	0.558	0.07
271_F	525_R	0.557	0.07
219_D	316_L	0.557	0.07
151_V	198_F	0.557	0.07
374_L	408_A	0.557	0.07
463_L	612_L	0.556	0.07
126_L	197_S	0.556	0.07
612_L	618_N	0.556	0.07
133_T	411_C	0.555	0.07
530_L	545_Y	0.554	0.07
53_L	423_I	0.554	0.07
183_L	573_Q	0.553	0.07
24_P	457_T	0.552	0.07
72_T	78_V	0.552	0.07
70_G	180_Y	0.551	0.07
354_L	368_R	0.550	0.07
101_L	499_V	0.549	0.07
135_Y	370_N	0.549	0.07
295_S	419_L	0.549	0.07
153_G	527_D	0.547	0.07
126_L	396_L	0.545	0.07
74_L	140_A	0.545	0.07
260_S	533_R	0.545	0.07
161_F	317_A	0.545	0.07
180_Y	196_L	0.544	0.07
430_F	519_N	0.543	0.07
341_V	507_L	0.542	0.07
435_P	496_L	0.541	0.07
373_G	490_F	0.540	0.07
138_L	342_E	0.540	0.07
50_V	62_Q	0.539	0.07
156_L	519_N	0.539	0.07
157_S	166_W	0.538	0.07
380_L	611_Q	0.538	0.07
153_G	196_L	0.538	0.07
77_P	416_I	0.537	0.07
180_Y	458_L	0.537	0.07
437_L	448_I	0.537	0.07
304_V	436_I	0.535	0.07
485_N	610_W	0.533	0.07
533_R	605_R	0.532	0.07
403_T	408_A	0.531	0.07
488_S	515_T	0.531	0.07
437_L	442_L	0.530	0.07
247_K	250_L	0.530	0.07
272_P	284_I	0.529	0.07
50_V	57_I	0.529	0.07
32_D	50_V	0.528	0.07
233_L	262_I	0.528	0.07
278_S	548_Y	0.528	0.07
399_W	552_E	0.528	0.07
381_N	490_F	0.528	0.07
318_G	351_L	0.526	0.07
548_Y	569_Q	0.526	0.07
130_Y	526_L	0.526	0.07
94_Y	274_K	0.526	0.07
628_H	638_I	0.526	0.07
120_K	275_L	0.525	0.07
217_S	297_V	0.525	0.07
122_F	567_L	0.524	0.07
39_L	151_V	0.524	0.07
217_S	220_L	0.524	0.07
422_F	566_L	0.523	0.07
397_V	483_L	0.523	0.07
180_Y	218_E	0.522	0.07
43_C	48_S	0.521	0.07
401_G	418_T	0.521	0.07
250_L	271_F	0.520	0.07
262_I	422_F	0.520	0.07
171_C	563_F	0.520	0.07
204_L	220_L	0.519	0.07
61_R	500_N	0.518	0.07
80_F	305_R	0.517	0.07
284_I	390_R	0.517	0.07
60_R	159_T	0.517	0.07
204_L	517_L	0.517	0.07
347_S	370_N	0.516	0.07
131_Y	345_Y	0.515	0.07
197_S	545_Y	0.514	0.07
274_K	555_Q	0.514	0.07
339_W	367_H	0.513	0.07
22_K	30_P	0.512	0.07
242_S	278_S	0.511	0.07
416_I	512_V	0.511	0.07
269_F	405_Y	0.509	0.07
93_V	519_N	0.508	0.07
44_I	121_E	0.508	0.07
336_Y	518_F	0.508	0.07
235_K	635_E	0.508	0.07
406_Q	412_L	0.507	0.07
114_T	240_K	0.506	0.07
95_G	559_V	0.505	0.07
434_I	535_V	0.504	0.07
142_G	266_E	0.502	0.07
189_Q	476_K	0.502	0.07
284_I	287_Y	0.502	0.07
330_V	333_I	0.502	0.07
383_F	495_I	0.502	0.07
139_L	508_G	0.502	0.07
99_C	120_K	0.502	0.07
79_N	544_C	0.502	0.07
197_S	506_V	0.502	0.07
104_M	614_Y	0.501	0.07
350_T	407_A	0.500	0.07
192_C	494_Y	0.500	0.07
415_A	461_A	0.500	0.07

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3qho_A	1	0.0239	23.7	0.988	Contact Map
4s0v_A	1	0.4418	19.7	0.988	Contact Map
4m5d_A	1	0	11.1	0.989	Contact Map
3pbl_A	1	0.4299	10.6	0.99	Contact Map
4ib4_A	1	0.4418	10.2	0.99	Contact Map
3ol0_A	1	0.0612	10.1	0.99	Contact Map
5dhg_A	1	0.3672	9.6	0.99	Contact Map
1cqt_I	1	0.0328	8.1	0.99	Contact Map
4grv_A	1	0.4537	5.2	0.991	Contact Map
2kj1_A	1	0.0194	5.2	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0149 seconds.