T0863_1_670 - CASP12 - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

T0863_1_670 - T0863 1-670

ID:	4	Sequences: MSAETVNNYDYSDWYENAAPTKAPVEVIPPCDPTADEGLFHICIAAISLVVMLVLAILARRQKLSDNQRGLTGLLSPVNFLDHTQHKGLAVAVYGVLFCKLVGMVLSHHPLPFTKEVANKEFWMILALLYYPTLYYPLLACGTLHNKVGYVLGSLLSWTHFGILVWQKVDCPKTPQIYKYYALFGSLPQIACLAFLSFQYPLLLFKGLQNTETANASEDLSSSYYRDYVKKILKKKKPTKISSSTSKPKLFDRLRDAVKSYIYTPEDVFRFPLKLAISVVVAFIALYQMALLLISGVLPTLHIVRRGVDENIAFLLAGFNIILSNDRQEVVRIVVYYLWCVEICYVSAVTLSCLVNLLMLMRSMVLHRSNLKGLYRGDSLNVFNCHRSIRPSRPALVCWMGFTSYQAAFLCLGMAIQTLVFFICILFAVFLIIIPILWGTNLMLFHIIGNLWPFWLTLVLAALIQHVASRFLFIRKDGGTRDLNNRGSLFLLSYILFLVNVMIGVVLGIWRVVITALFNIVHLGRLDISLLNRNVEAFDPGYRCYSHYLKIEVSQSHPVMKAFCGLLLQSSGQDGLSAQRIRDAEEGIQLVQQEKKQNKVSNAKRARAHWQLLYTLVNNPSLVGSRKHFQCQSSESFINGALSRTSKEGSKKDGSVKEPNKEAESAAASN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_10
Length:	670 (609)
Sequences:	114 (64)
Seq/√Len:	2.6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
610_W	619_N	4.128	0.69
619_N	626_R	4.012	0.66
610_W	626_R	3.726	0.60
609_H	616_L	3.623	0.58
616_L	620_P	3.402	0.53
609_H	620_P	3.240	0.49
610_W	620_P	3.220	0.48
527_D	539_D	3.203	0.48
615_T	619_N	3.171	0.47
612_L	626_R	3.123	0.46
609_H	619_N	3.113	0.46
616_L	619_N	3.103	0.46
374_L	377_G	3.096	0.45
607_R	615_T	3.039	0.44
615_T	620_P	3.038	0.44
610_W	616_L	2.995	0.43
61_R	73_G	2.973	0.43
607_R	626_R	2.918	0.41
620_P	626_R	2.869	0.40
511_R	539_D	2.866	0.40
616_L	626_R	2.861	0.40
368_R	377_G	2.854	0.40
348_A	405_Y	2.829	0.39
612_L	622_L	2.784	0.38
494_Y	559_V	2.762	0.38
610_W	615_T	2.709	0.37
609_H	615_T	2.695	0.36
619_N	622_L	2.676	0.36
609_H	626_R	2.657	0.36
609_H	612_L	2.633	0.35
533_R	536_E	2.561	0.34
364_M	515_T	2.547	0.33
615_T	626_R	2.482	0.32
616_L	622_L	2.475	0.32
609_H	622_L	2.440	0.31
157_S	261_Y	2.422	0.31
346_V	459_V	2.421	0.31
188_P	196_L	2.399	0.30
107_S	541_G	2.397	0.30
607_R	612_L	2.337	0.29
622_L	626_R	2.335	0.29
605_R	613_L	2.325	0.29
78_V	376_R	2.325	0.29
42_I	47_I	2.300	0.28
607_R	610_W	2.283	0.28
193_L	196_L	2.281	0.28
137_P	171_C	2.249	0.27
428_A	433_I	2.231	0.27
70_G	531_L	2.220	0.27
612_L	619_N	2.219	0.27
409_F	541_G	2.209	0.27
610_W	614_Y	2.191	0.26
612_L	616_L	2.138	0.25
74_L	200_Y	2.135	0.25
511_R	527_D	2.128	0.25
61_R	72_T	2.079	0.24
607_R	627_K	2.073	0.24
63_K	509_I	2.072	0.24
180_Y	423_I	2.070	0.24
95_G	155_L	2.068	0.24
187_L	236_K	2.067	0.24
465_Q	485_N	2.052	0.24
77_P	95_G	2.050	0.24
504_G	511_R	2.043	0.24
525_R	539_D	2.029	0.24
141_C	196_L	2.015	0.23
612_L	615_T	2.013	0.23
607_R	619_N	1.983	0.23
607_R	616_L	1.979	0.23
378_D	515_T	1.968	0.22
536_E	539_D	1.960	0.22
149_G	533_R	1.937	0.22
504_G	539_D	1.931	0.22
149_G	536_E	1.929	0.22
500_N	504_G	1.927	0.22
229_V	559_V	1.902	0.21
271_F	494_Y	1.891	0.21
95_G	149_G	1.887	0.21
80_F	354_L	1.875	0.21
483_L	517_L	1.870	0.21
80_F	407_A	1.868	0.21
398_C	421_F	1.843	0.21
228_Y	326_D	1.843	0.21
72_T	487_G	1.802	0.20
607_R	622_L	1.800	0.20
193_L	416_I	1.789	0.20
489_L	557_H	1.778	0.20
413_G	567_L	1.765	0.19
429_V	617_V	1.738	0.19
612_L	620_P	1.710	0.19
156_L	498_L	1.710	0.19
489_L	493_S	1.705	0.19
606_A	610_W	1.680	0.18
406_Q	500_N	1.669	0.18
135_Y	140_A	1.660	0.18
610_W	627_K	1.655	0.18
113_F	622_L	1.652	0.18
155_L	416_I	1.649	0.18
188_P	558_P	1.646	0.18
95_G	141_C	1.622	0.17
73_G	255_R	1.622	0.17
558_P	620_P	1.619	0.17
72_T	484_N	1.608	0.17
485_N	541_G	1.598	0.17
137_P	504_G	1.596	0.17
172_P	272_P	1.595	0.17
149_G	463_L	1.587	0.17
141_C	188_P	1.586	0.17
408_A	542_Y	1.573	0.17
511_R	525_R	1.564	0.17
191_A	334_V	1.554	0.16
197_S	200_Y	1.552	0.16
519_N	555_Q	1.545	0.16
171_C	196_L	1.540	0.16
191_A	474_I	1.537	0.16
81_L	351_L	1.536	0.16
56_A	60_R	1.515	0.16
612_L	627_K	1.509	0.16
190_I	204_L	1.495	0.16
234_K	433_I	1.490	0.16
615_T	622_L	1.486	0.16
352_S	363_S	1.482	0.16
378_D	525_R	1.481	0.16
200_Y	502_M	1.481	0.16
171_C	504_G	1.475	0.15
129_L	166_W	1.475	0.15
408_A	435_P	1.472	0.15
345_Y	359_M	1.450	0.15
46_A	315_L	1.444	0.15
435_P	500_N	1.441	0.15
367_H	370_N	1.437	0.15
140_A	541_G	1.436	0.15
536_E	560_M	1.431	0.15
531_L	539_D	1.426	0.15
200_Y	232_I	1.426	0.15
345_Y	370_N	1.414	0.15
190_I	548_Y	1.414	0.15
544_C	617_V	1.411	0.15
465_Q	473_F	1.401	0.15
79_N	101_L	1.394	0.15
421_F	444_L	1.392	0.14
60_R	70_G	1.389	0.14
77_P	94_Y	1.385	0.14
204_L	505_V	1.382	0.14
39_L	43_C	1.381	0.14
528_I	548_Y	1.381	0.14
610_W	613_L	1.370	0.14
197_S	204_L	1.370	0.14
523_L	552_E	1.364	0.14
147_K	409_F	1.355	0.14
511_R	558_P	1.353	0.14
229_V	525_R	1.349	0.14
22_K	35_A	1.345	0.14
240_K	568_L	1.345	0.14
156_L	367_H	1.344	0.14
412_L	519_N	1.343	0.14
357_L	364_M	1.340	0.14
133_T	352_S	1.339	0.14
137_P	141_C	1.338	0.14
104_M	163_I	1.337	0.14
619_N	627_K	1.325	0.14
609_H	623_V	1.321	0.14
361_M	557_H	1.320	0.14
395_A	404_S	1.319	0.14
63_K	230_K	1.318	0.14
141_C	153_G	1.316	0.14
614_Y	627_K	1.315	0.14
421_F	529_S	1.309	0.14
368_R	374_L	1.309	0.14
76_S	407_A	1.307	0.14
99_C	285_A	1.306	0.14
31_C	616_L	1.306	0.14
200_Y	557_H	1.304	0.13
44_I	47_I	1.302	0.13
533_R	560_M	1.294	0.13
453_P	557_H	1.292	0.13
178_Y	371_L	1.292	0.13
35_A	53_L	1.286	0.13
157_S	165_V	1.285	0.13
275_L	462_A	1.280	0.13
396_L	459_V	1.280	0.13
200_Y	521_V	1.275	0.13
255_R	509_I	1.272	0.13
553_V	557_H	1.270	0.13
281_V	525_R	1.265	0.13
172_P	501_V	1.265	0.13
527_D	531_L	1.255	0.13
352_S	361_M	1.247	0.13
242_S	483_L	1.240	0.13
539_D	558_P	1.236	0.13
369_S	528_I	1.235	0.13
504_G	536_E	1.230	0.13
563_F	567_L	1.226	0.13
525_R	606_A	1.225	0.13
75_L	424_C	1.223	0.13
377_G	558_P	1.217	0.13
610_W	622_L	1.208	0.12
372_K	537_A	1.206	0.12
271_F	559_V	1.205	0.12
276_A	487_G	1.203	0.12
615_T	627_K	1.192	0.12
136_Y	352_S	1.185	0.12
485_N	549_L	1.182	0.12
383_F	475_R	1.181	0.12
232_I	472_L	1.180	0.12
359_M	363_S	1.179	0.12
61_R	71_L	1.178	0.12
195_F	234_K	1.176	0.12
453_P	531_L	1.175	0.12
57_I	61_R	1.173	0.12
378_D	410_L	1.172	0.12
401_G	525_R	1.171	0.12
148_V	166_W	1.171	0.12
504_G	531_L	1.171	0.12
91_V	487_G	1.168	0.12
598_N	636_S	1.167	0.12
132_P	156_L	1.166	0.12
519_N	522_H	1.165	0.12
607_R	620_P	1.165	0.12
125_I	463_L	1.160	0.12
552_E	557_H	1.158	0.12
439_G	564_C	1.157	0.12
504_G	527_D	1.157	0.12
202_L	618_N	1.153	0.12
270_R	312_I	1.151	0.12
331_V	433_I	1.147	0.12
100_K	617_V	1.146	0.12
273_L	562_A	1.144	0.12
405_Y	464_I	1.141	0.12
139_L	183_L	1.139	0.12
541_G	567_L	1.132	0.12
163_I	556_S	1.128	0.12
427_F	509_I	1.126	0.12
526_L	536_E	1.125	0.12
365_V	501_V	1.125	0.12
148_V	164_L	1.121	0.12
43_C	568_L	1.113	0.12
616_L	627_K	1.112	0.12
78_V	187_L	1.109	0.12
137_P	153_G	1.109	0.12
509_I	628_H	1.105	0.11
382_V	404_S	1.104	0.11
156_L	160_H	1.098	0.11
180_Y	560_M	1.097	0.11
196_L	435_P	1.095	0.11
205_F	376_R	1.093	0.11
200_Y	587_G	1.092	0.11
188_P	541_G	1.090	0.11
139_L	525_R	1.089	0.11
132_P	519_N	1.087	0.11
112_P	272_P	1.087	0.11
494_Y	598_N	1.085	0.11
506_V	535_V	1.079	0.11
232_I	382_V	1.079	0.11
35_A	231_K	1.077	0.11
55_L	141_C	1.077	0.11
368_R	408_A	1.076	0.11
228_Y	455_W	1.075	0.11
229_V	294_I	1.074	0.11
501_V	534_N	1.073	0.11
636_S	643_S	1.072	0.11
305_R	331_V	1.070	0.11
405_Y	488_S	1.069	0.11
180_Y	193_L	1.068	0.11
229_V	378_D	1.066	0.11
151_V	166_W	1.061	0.11
193_L	269_F	1.061	0.11
429_V	607_R	1.060	0.11
483_L	607_R	1.059	0.11
294_I	378_D	1.058	0.11
401_G	499_V	1.055	0.11
153_G	511_R	1.054	0.11
268_V	423_I	1.052	0.11
423_I	427_F	1.052	0.11
220_L	295_S	1.048	0.11
77_P	558_P	1.046	0.11
501_V	560_M	1.045	0.11
41_H	47_I	1.043	0.11
86_H	149_G	1.041	0.11
432_I	437_L	1.039	0.11
428_A	437_L	1.038	0.11
287_Y	555_Q	1.038	0.11
509_I	533_R	1.036	0.11
288_Q	549_L	1.035	0.11
203_L	348_A	1.035	0.11
271_F	526_L	1.031	0.11
638_I	642_L	1.031	0.11
304_V	315_L	1.026	0.11
165_V	266_E	1.026	0.11
79_N	448_I	1.026	0.11
526_L	534_N	1.025	0.11
550_K	557_H	1.024	0.11
227_D	316_L	1.023	0.11
79_N	544_C	1.021	0.11
306_R	627_K	1.019	0.11
205_F	372_K	1.019	0.11
144_L	490_F	1.018	0.11
54_V	320_N	1.016	0.11
284_I	535_V	1.013	0.11
473_F	485_N	1.011	0.11
94_Y	483_L	1.006	0.11
141_C	406_Q	1.006	0.11
45_A	402_F	1.005	0.11
473_F	558_P	1.000	0.11
620_P	627_K	0.997	0.10
31_C	48_S	0.994	0.10
229_V	232_I	0.993	0.10
262_I	529_S	0.992	0.10
301_L	434_I	0.990	0.10
153_G	171_C	0.988	0.10
95_G	416_I	0.988	0.10
394_P	407_A	0.985	0.10
615_T	618_N	0.981	0.10
505_V	509_I	0.980	0.10
465_Q	610_W	0.980	0.10
316_L	327_R	0.979	0.10
98_F	127_A	0.979	0.10
57_I	643_S	0.977	0.10
287_Y	610_W	0.976	0.10
466_H	525_R	0.975	0.10
102_V	283_F	0.973	0.10
99_C	328_Q	0.969	0.10
383_F	482_D	0.969	0.10
405_Y	472_L	0.966	0.10
500_N	622_L	0.966	0.10
545_Y	552_E	0.962	0.10
141_C	171_C	0.961	0.10
188_P	193_L	0.961	0.10
377_G	404_S	0.959	0.10
126_L	197_S	0.957	0.10
145_H	604_K	0.957	0.10
412_L	555_Q	0.956	0.10
153_G	196_L	0.956	0.10
294_I	613_L	0.954	0.10
60_R	505_V	0.951	0.10
551_I	560_M	0.948	0.10
515_T	538_F	0.946	0.10
52_M	376_R	0.946	0.10
443_M	454_F	0.946	0.10
228_Y	491_L	0.945	0.10
128_L	140_A	0.942	0.10
232_I	440_T	0.942	0.10
367_H	498_L	0.941	0.10
286_L	580_R	0.940	0.10
77_P	137_P	0.940	0.10
290_A	300_T	0.939	0.10
75_L	544_C	0.939	0.10
377_G	408_A	0.939	0.10
76_S	351_L	0.939	0.10
299_P	316_L	0.937	0.10
153_G	539_D	0.937	0.10
166_W	612_L	0.931	0.10
271_F	283_F	0.929	0.10
350_T	551_I	0.928	0.10
430_F	522_H	0.927	0.10
141_C	500_N	0.924	0.10
274_K	407_A	0.923	0.10
228_Y	327_R	0.921	0.10
471_F	599_K	0.920	0.10
511_R	619_N	0.920	0.10
454_F	501_V	0.919	0.10
39_L	195_F	0.917	0.10
269_F	622_L	0.916	0.10
579_Q	601_S	0.914	0.10
549_L	563_F	0.914	0.10
593_Q	613_L	0.914	0.10
57_I	509_I	0.911	0.10
496_L	549_L	0.911	0.10
149_G	155_L	0.911	0.10
129_L	566_L	0.908	0.10
612_L	628_H	0.908	0.10
479_G	524_G	0.904	0.10
609_H	613_L	0.904	0.10
344_C	489_L	0.902	0.10
416_I	512_V	0.901	0.10
606_A	626_R	0.900	0.10
426_L	449_G	0.900	0.10
350_T	470_R	0.899	0.10
465_Q	614_Y	0.899	0.10
376_R	601_S	0.895	0.10
181_Y	461_A	0.895	0.10
223_S	568_L	0.892	0.10
153_G	188_P	0.890	0.10
497_F	504_G	0.889	0.10
130_Y	526_L	0.887	0.10
43_C	48_S	0.885	0.10
495_I	498_L	0.882	0.10
407_A	525_R	0.881	0.10
291_L	351_L	0.879	0.09
27_V	509_I	0.879	0.09
202_L	232_I	0.878	0.09
489_L	553_V	0.877	0.09
223_S	242_S	0.877	0.09
284_I	508_G	0.876	0.09
151_V	483_L	0.876	0.09
435_P	542_Y	0.874	0.09
92_A	360_L	0.874	0.09
301_L	322_I	0.871	0.09
133_T	136_Y	0.871	0.09
500_N	511_R	0.870	0.09
100_K	601_S	0.870	0.09
541_G	558_P	0.869	0.09
156_L	274_K	0.868	0.09
89_L	348_A	0.866	0.09
366_L	375_Y	0.865	0.09
61_R	406_Q	0.865	0.09
300_T	457_T	0.864	0.09
97_L	133_T	0.863	0.09
90_A	423_I	0.862	0.09
181_Y	184_F	0.862	0.09
316_L	319_F	0.861	0.09
413_G	563_F	0.859	0.09
435_P	504_G	0.859	0.09
75_L	613_L	0.857	0.09
529_S	533_R	0.857	0.09
495_I	541_G	0.855	0.09
606_A	619_N	0.854	0.09
48_S	513_V	0.853	0.09
56_A	61_R	0.853	0.09
28_I	621_S	0.852	0.09
23_A	29_P	0.851	0.09
435_P	564_C	0.850	0.09
574_D	597_Q	0.849	0.09
57_I	603_A	0.849	0.09
156_L	519_N	0.849	0.09
361_M	445_F	0.846	0.09
101_L	423_I	0.845	0.09
374_L	382_V	0.844	0.09
294_I	364_M	0.843	0.09
135_Y	368_R	0.841	0.09
613_L	619_N	0.839	0.09
400_M	562_A	0.838	0.09
351_L	529_S	0.838	0.09
279_V	459_V	0.838	0.09
50_V	440_T	0.838	0.09
104_M	271_F	0.836	0.09
149_G	192_C	0.835	0.09
494_Y	511_R	0.835	0.09
171_C	193_L	0.834	0.09
205_F	341_V	0.833	0.09
125_I	231_K	0.831	0.09
149_G	500_N	0.830	0.09
60_R	235_K	0.829	0.09
324_S	371_L	0.827	0.09
302_H	517_L	0.827	0.09
230_K	494_Y	0.826	0.09
67_N	228_Y	0.822	0.09
427_F	570_S	0.821	0.09
504_G	619_N	0.821	0.09
94_Y	474_I	0.820	0.09
55_L	104_M	0.820	0.09
272_P	506_V	0.819	0.09
158_W	201_P	0.818	0.09
233_L	433_I	0.817	0.09
153_G	558_P	0.816	0.09
299_P	371_L	0.815	0.09
171_C	531_L	0.815	0.09
198_F	531_L	0.812	0.09
540_P	568_L	0.811	0.09
608_A	612_L	0.809	0.09
606_A	615_T	0.808	0.09
437_L	448_I	0.807	0.09
522_H	530_L	0.806	0.09
287_Y	494_Y	0.804	0.09
53_L	331_V	0.804	0.09
404_S	505_V	0.803	0.09
182_A	502_M	0.802	0.09
617_V	635_E	0.802	0.09
149_G	374_L	0.801	0.09
152_L	423_I	0.799	0.09
169_V	429_V	0.799	0.09
404_S	408_A	0.797	0.09
293_L	475_R	0.796	0.09
269_F	405_Y	0.796	0.09
610_W	617_V	0.795	0.09
356_N	542_Y	0.794	0.09
597_Q	643_S	0.790	0.09
229_V	414_M	0.790	0.09
377_G	545_Y	0.787	0.09
149_G	298_L	0.787	0.09
614_Y	619_N	0.787	0.09
630_Q	638_I	0.786	0.09
535_V	552_E	0.785	0.09
364_M	410_L	0.785	0.09
472_L	488_S	0.784	0.09
423_I	449_G	0.782	0.09
299_P	355_V	0.781	0.09
422_F	622_L	0.781	0.09
91_V	436_I	0.780	0.09
105_V	121_E	0.779	0.09
171_C	435_P	0.779	0.09
77_P	619_N	0.779	0.09
392_S	397_V	0.779	0.09
29_P	37_E	0.779	0.09
123_W	454_F	0.777	0.09
50_V	57_I	0.776	0.09
614_Y	620_P	0.774	0.09
609_H	627_K	0.773	0.09
130_Y	160_H	0.771	0.09
149_G	436_I	0.771	0.09
143_T	354_L	0.770	0.09
417_Q	493_S	0.770	0.09
272_P	501_V	0.769	0.09
298_L	324_S	0.767	0.09
229_V	364_M	0.765	0.09
136_Y	610_W	0.764	0.09
114_T	509_I	0.764	0.09
376_R	387_R	0.763	0.09
190_I	428_A	0.763	0.09
235_K	559_V	0.762	0.09
131_Y	614_Y	0.760	0.09
434_I	489_L	0.759	0.09
105_V	382_V	0.758	0.09
134_L	398_C	0.757	0.09
30_P	79_N	0.756	0.09
328_Q	387_R	0.756	0.09
50_V	62_Q	0.753	0.09
45_A	51_V	0.753	0.09
55_L	172_P	0.753	0.09
376_R	597_Q	0.752	0.09
111_L	342_E	0.752	0.09
111_L	432_I	0.752	0.09
153_G	465_Q	0.751	0.09
291_L	614_Y	0.749	0.08
45_A	67_N	0.748	0.08
40_F	467_V	0.748	0.08
495_I	519_N	0.748	0.08
190_I	273_L	0.745	0.08
180_Y	227_D	0.743	0.08
100_K	542_Y	0.742	0.08
416_I	533_R	0.742	0.08
347_S	437_L	0.740	0.08
158_W	200_Y	0.740	0.08
495_I	547_H	0.739	0.08
396_L	606_A	0.739	0.08
204_L	517_L	0.738	0.08
297_V	454_F	0.738	0.08
299_P	398_C	0.737	0.08
160_H	519_N	0.737	0.08
368_R	558_P	0.736	0.08
133_T	517_L	0.736	0.08
511_R	616_L	0.735	0.08
193_L	204_L	0.730	0.08
162_G	596_K	0.730	0.08
78_V	387_R	0.730	0.08
408_A	536_E	0.730	0.08
383_F	495_I	0.729	0.08
419_L	456_L	0.727	0.08
374_L	391_P	0.726	0.08
435_P	497_F	0.726	0.08
283_F	446_H	0.726	0.08
390_R	618_N	0.725	0.08
99_C	166_W	0.724	0.08
312_I	476_K	0.724	0.08
103_G	604_K	0.723	0.08
382_V	415_A	0.721	0.08
380_L	432_I	0.720	0.08
161_F	317_A	0.719	0.08
39_L	42_I	0.718	0.08
366_L	389_I	0.718	0.08
39_L	568_L	0.717	0.08
165_V	627_K	0.717	0.08
435_P	496_L	0.714	0.08
147_K	520_I	0.713	0.08
153_G	406_Q	0.713	0.08
467_V	593_Q	0.710	0.08
228_Y	517_L	0.709	0.08
67_N	289_M	0.707	0.08
80_F	497_F	0.705	0.08
491_L	524_G	0.704	0.08
162_G	236_K	0.703	0.08
191_A	629_F	0.703	0.08
22_K	28_I	0.702	0.08
78_V	357_L	0.702	0.08
27_V	32_D	0.702	0.08
403_T	408_A	0.702	0.08
500_N	539_D	0.701	0.08
151_V	280_V	0.700	0.08
377_G	620_P	0.700	0.08
345_Y	367_H	0.698	0.08
525_R	611_Q	0.697	0.08
542_Y	609_H	0.697	0.08
406_Q	504_G	0.697	0.08
126_L	526_L	0.697	0.08
111_L	467_V	0.695	0.08
384_N	403_T	0.695	0.08
199_Q	207_G	0.694	0.08
525_R	558_P	0.694	0.08
507_L	547_H	0.693	0.08
315_L	323_L	0.692	0.08
137_P	274_K	0.692	0.08
71_L	601_S	0.691	0.08
88_G	105_V	0.690	0.08
24_P	457_T	0.689	0.08
567_L	614_Y	0.687	0.08
171_C	497_F	0.686	0.08
232_I	547_H	0.685	0.08
558_P	615_T	0.684	0.08
434_I	592_Q	0.684	0.08
24_P	27_V	0.684	0.08
269_F	610_W	0.683	0.08
270_R	346_V	0.683	0.08
494_Y	532_N	0.683	0.08
79_N	281_V	0.682	0.08
80_F	163_I	0.682	0.08
45_A	526_L	0.681	0.08
87_K	361_M	0.681	0.08
25_V	279_V	0.681	0.08
340_C	410_L	0.681	0.08
284_I	287_Y	0.681	0.08
331_V	389_I	0.680	0.08
94_Y	137_P	0.679	0.08
57_I	352_S	0.679	0.08
35_A	259_K	0.675	0.08
87_K	403_T	0.675	0.08
274_K	412_L	0.675	0.08
409_F	412_L	0.674	0.08
363_S	400_M	0.674	0.08
80_F	275_L	0.672	0.08
78_V	551_I	0.672	0.08
368_R	619_N	0.672	0.08
302_H	305_R	0.671	0.08
137_P	156_L	0.671	0.08
497_F	536_E	0.671	0.08
170_D	542_Y	0.670	0.08
542_Y	560_M	0.669	0.08
135_Y	540_P	0.668	0.08
539_D	619_N	0.667	0.08
271_F	414_M	0.666	0.08
454_F	554_S	0.665	0.08
483_L	521_V	0.664	0.08
90_A	555_Q	0.662	0.08
153_G	500_N	0.662	0.08
107_S	152_L	0.661	0.08
204_L	560_M	0.660	0.08
170_D	509_I	0.660	0.08
486_R	511_R	0.660	0.08
229_V	515_T	0.659	0.08
28_I	33_P	0.657	0.08
162_G	372_K	0.656	0.08
489_L	531_L	0.656	0.08
274_K	519_N	0.655	0.08
142_G	266_E	0.655	0.08
205_F	347_S	0.654	0.08
275_L	556_S	0.653	0.08
404_S	525_R	0.653	0.08
251_F	525_R	0.652	0.08
57_I	73_G	0.652	0.08
77_P	511_R	0.652	0.08
348_A	351_L	0.651	0.08
270_R	396_L	0.651	0.08
169_V	190_I	0.650	0.08
488_S	501_V	0.649	0.08
368_R	504_G	0.649	0.08
433_I	445_F	0.649	0.08
348_A	464_I	0.648	0.08
363_S	367_H	0.648	0.08
323_L	393_R	0.647	0.08
217_S	220_L	0.644	0.08
354_L	409_F	0.643	0.08
229_V	432_I	0.643	0.08
420_V	490_F	0.642	0.08
426_L	496_L	0.641	0.08
326_D	445_F	0.641	0.08
585_E	596_K	0.641	0.08
203_L	235_K	0.641	0.08
494_Y	539_D	0.640	0.08
44_I	64_L	0.638	0.08
607_R	614_Y	0.637	0.08
173_K	219_D	0.637	0.08
79_N	263_Y	0.636	0.08
417_Q	531_L	0.636	0.08
191_A	209_Q	0.635	0.08
22_K	637_F	0.635	0.08
345_Y	383_F	0.635	0.08
167_Q	372_K	0.631	0.08
272_P	558_P	0.630	0.08
372_K	423_I	0.630	0.08
138_L	312_I	0.630	0.08
489_L	522_H	0.629	0.08
53_L	112_P	0.629	0.08
272_P	545_Y	0.627	0.08
344_C	456_L	0.625	0.08
558_P	619_N	0.625	0.08
169_V	178_Y	0.625	0.08
326_D	517_L	0.624	0.08
350_T	394_P	0.624	0.08
281_V	354_L	0.624	0.08
149_G	468_A	0.624	0.08
24_P	586_E	0.624	0.08
170_D	560_M	0.623	0.08
165_V	572_G	0.623	0.08
463_L	612_L	0.622	0.08
141_C	558_P	0.621	0.08
165_V	568_L	0.621	0.08
407_A	495_I	0.620	0.08
505_V	574_D	0.619	0.08
22_K	27_V	0.618	0.08
38_G	69_R	0.617	0.08
396_L	404_S	0.616	0.08
232_I	548_Y	0.616	0.08
527_D	558_P	0.614	0.08
415_A	488_S	0.614	0.08
236_K	419_L	0.613	0.08
278_S	370_N	0.612	0.08
60_R	203_L	0.611	0.08
165_V	282_A	0.610	0.08
55_L	140_A	0.609	0.08
310_E	413_G	0.608	0.08
139_L	508_G	0.608	0.08
99_C	151_V	0.608	0.08
437_L	442_L	0.606	0.08
417_Q	489_L	0.606	0.08
101_L	489_L	0.604	0.07
185_G	320_N	0.604	0.07
233_L	566_L	0.604	0.07
545_Y	557_H	0.603	0.07
78_V	418_T	0.603	0.07
113_F	149_G	0.603	0.07
638_I	643_S	0.602	0.07
507_L	564_C	0.601	0.07
354_L	625_S	0.601	0.07
81_L	529_S	0.601	0.07
28_I	34_T	0.601	0.07
71_L	75_L	0.600	0.07
287_Y	563_F	0.599	0.07
141_C	615_T	0.597	0.07
282_A	484_N	0.597	0.07
181_Y	201_P	0.596	0.07
75_L	282_A	0.596	0.07
269_F	504_G	0.596	0.07
183_L	573_Q	0.596	0.07
91_V	545_Y	0.596	0.07
272_P	499_V	0.595	0.07
502_M	515_T	0.595	0.07
439_G	542_Y	0.595	0.07
152_L	317_A	0.595	0.07
70_G	111_L	0.594	0.07
370_N	402_F	0.593	0.07
456_L	548_Y	0.592	0.07
330_V	437_L	0.592	0.07
114_T	240_K	0.590	0.07
70_G	180_Y	0.590	0.07
166_W	422_F	0.589	0.07
139_L	557_H	0.588	0.07
183_L	529_S	0.587	0.07
335_V	338_L	0.587	0.07
336_Y	585_E	0.585	0.07
111_L	607_R	0.585	0.07
125_I	467_V	0.585	0.07
464_I	472_L	0.584	0.07
90_A	481_R	0.584	0.07
479_G	491_L	0.583	0.07
257_A	548_Y	0.583	0.07
102_V	491_L	0.583	0.07
273_L	278_S	0.582	0.07
70_G	189_Q	0.582	0.07
66_D	350_T	0.581	0.07
85_Q	487_G	0.581	0.07
166_W	240_K	0.581	0.07
36_D	364_M	0.581	0.07
177_I	182_A	0.581	0.07
474_I	482_D	0.580	0.07
349_V	364_M	0.579	0.07
67_N	74_L	0.579	0.07
39_L	612_L	0.578	0.07
113_F	388_S	0.577	0.07
455_W	561_K	0.576	0.07
361_M	413_G	0.576	0.07
120_K	608_A	0.575	0.07
151_V	198_F	0.574	0.07
181_Y	217_S	0.574	0.07
330_V	347_S	0.573	0.07
377_G	552_E	0.573	0.07
178_Y	405_Y	0.573	0.07
136_Y	620_P	0.573	0.07
461_A	475_R	0.572	0.07
142_G	335_V	0.572	0.07
378_D	552_E	0.572	0.07
399_W	552_E	0.570	0.07
43_C	275_L	0.570	0.07
190_I	551_I	0.570	0.07
95_G	333_I	0.569	0.07
376_R	628_H	0.569	0.07
298_L	306_R	0.569	0.07
341_V	507_L	0.567	0.07
230_K	396_L	0.567	0.07
138_L	200_Y	0.567	0.07
423_I	464_I	0.566	0.07
151_V	195_F	0.566	0.07
56_A	95_G	0.565	0.07
346_V	354_L	0.564	0.07
191_A	617_V	0.563	0.07
72_T	78_V	0.563	0.07
428_A	505_V	0.562	0.07
55_L	152_L	0.562	0.07
134_L	299_P	0.561	0.07
73_G	500_N	0.561	0.07
196_L	500_N	0.561	0.07
22_K	30_P	0.561	0.07
125_I	362_R	0.561	0.07
352_S	367_H	0.561	0.07
253_R	517_L	0.560	0.07
521_V	530_L	0.559	0.07
270_R	549_L	0.559	0.07
299_P	345_Y	0.558	0.07
321_I	520_I	0.558	0.07
104_M	515_T	0.558	0.07
184_F	357_L	0.557	0.07
235_K	635_E	0.556	0.07
305_R	460_L	0.554	0.07
159_T	602_N	0.554	0.07
267_D	546_S	0.553	0.07
563_F	620_P	0.552	0.07
120_K	462_A	0.552	0.07
77_P	483_L	0.549	0.07
459_V	470_R	0.549	0.07
61_R	500_N	0.548	0.07
470_R	501_V	0.548	0.07
284_I	499_V	0.547	0.07
113_F	233_L	0.546	0.07
190_I	562_A	0.546	0.07
129_L	218_E	0.544	0.07
200_Y	556_S	0.544	0.07
404_S	558_P	0.543	0.07
494_Y	618_N	0.543	0.07
280_V	286_L	0.542	0.07
132_P	411_C	0.542	0.07
205_F	239_T	0.542	0.07
26_E	30_P	0.542	0.07
404_S	407_A	0.542	0.07
335_V	468_A	0.542	0.07
235_K	551_I	0.541	0.07
26_E	254_L	0.540	0.07
49_L	73_G	0.540	0.07
497_F	519_N	0.540	0.07
475_R	485_N	0.540	0.07
362_R	622_L	0.539	0.07
504_G	525_R	0.536	0.07
368_R	473_F	0.536	0.07
494_Y	561_K	0.535	0.07
305_R	312_I	0.535	0.07
222_S	235_K	0.534	0.07
436_I	518_F	0.533	0.07
42_I	64_L	0.533	0.07
196_L	465_Q	0.532	0.07
79_N	260_S	0.531	0.07
39_L	151_V	0.531	0.07
255_R	427_F	0.530	0.07
606_A	612_L	0.530	0.07
463_L	471_F	0.530	0.07
333_I	348_A	0.530	0.07
35_A	40_F	0.529	0.07
141_C	157_S	0.529	0.07
444_L	505_V	0.527	0.07
234_K	329_E	0.526	0.07
432_I	544_C	0.526	0.07
35_A	52_M	0.525	0.07
320_N	541_G	0.525	0.07
126_L	456_L	0.524	0.07
70_G	316_L	0.524	0.07
286_L	487_G	0.524	0.07
157_S	163_I	0.523	0.07
307_G	556_S	0.522	0.07
153_G	200_Y	0.522	0.07
98_F	292_L	0.522	0.07
272_P	284_I	0.522	0.07
114_T	383_F	0.522	0.07
501_V	541_G	0.522	0.07
140_A	172_P	0.521	0.07
141_C	501_V	0.521	0.07
316_L	324_S	0.520	0.07
331_V	563_F	0.520	0.07
205_F	578_A	0.520	0.07
464_I	622_L	0.520	0.07
233_L	262_I	0.519	0.07
528_I	551_I	0.519	0.07
299_P	319_F	0.518	0.07
285_A	290_A	0.517	0.07
130_Y	345_Y	0.515	0.07
156_L	475_R	0.515	0.07
542_Y	566_L	0.514	0.07
91_V	602_N	0.513	0.07
66_D	551_I	0.511	0.07
269_F	329_E	0.511	0.07
422_F	486_R	0.510	0.07
48_S	367_H	0.509	0.07
30_P	35_A	0.509	0.07
52_M	400_M	0.509	0.07
489_L	554_S	0.509	0.07
560_M	604_K	0.508	0.07
364_M	474_I	0.507	0.07
183_L	236_K	0.507	0.07
484_N	509_I	0.507	0.07
284_I	434_I	0.506	0.07
90_A	367_H	0.506	0.07
418_T	487_G	0.505	0.07
521_V	543_R	0.505	0.07
196_L	564_C	0.504	0.07
247_K	250_L	0.504	0.07
134_L	421_F	0.504	0.07
272_P	281_V	0.503	0.07
74_L	570_S	0.503	0.07
72_T	183_L	0.502	0.07
381_N	489_L	0.502	0.07
188_P	513_V	0.502	0.07
90_A	482_D	0.502	0.07
286_L	535_V	0.501	0.07
96_V	317_A	0.501	0.07
330_V	442_L	0.501	0.07
463_L	521_V	0.501	0.07
612_L	618_N	0.500	0.07
184_F	231_K	0.500	0.07
404_S	536_E	0.500	0.07

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3qho_A	1	0.0239	18.9	0.988	Contact Map
4m5d_A	1	0	12.7	0.989	Contact Map
1cqt_I	1	0.0328	8.1	0.99	Contact Map
4s0v_A	1	0.4388	6.6	0.99	Contact Map
1n7l_A	1	0.0791	5.7	0.99	Contact Map
4x8w_A	1	0.0164	5.6	0.99	Contact Map
3pbl_A	1	0.4328	5.5	0.99	Contact Map
3eff_K	1	0.2015	5.4	0.99	Contact Map
3ol0_A	1	0.0612	5.4	0.99	Contact Map
2kj1_A	1	0.0194	5.4	0.99	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0142 seconds.