T0945_c90_1_409 - CASP12 - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

T0945_c90_1_409 - T0945_c90 1-409

ID:	132	Sequences: SMWAFSELPMPLLINLIVSLLGFVATVTLIPAFRGHFIAARLCGQDLNKTSRQQIPESQGVISGAVFLIILFCFIPFPFLNCFVKEQCKAFPHHEFVALIGALLAICCMIFLGFADDVLNLRWRHKLLLPTAASLPLLMVYFTNFGNTTIVVPKPFRPILGLHLDLGILYYVYMGLLAVFCTNAINILAGINGLEAGQSLVISASIIVFNLVELEGDCRDDHVFSLYFMIPFFFTTLGLLYHNWYPSRVFVGDTFCYFAGMTFAGVGILGHFSKTMLLFFMPQVFNFLYSLPQLLHIIPCPRHRIPRLNIKTGKLEMSYSKFKTKSLSFLGTFILKVAESLQLVTVHQSETEDGEFTECNNMTLINLLLKVLGPIHERNLTLLLLLLQILGSAITFSIRYQLVRLFYDV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_10
Length:	409 (400)
Sequences:	250 (156)
Seq/√Len:	7.8

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
240_L	244_W	6.305	1.00
309_N	316_E	4.588	0.99
232_F	259_A	4.549	0.99
207_I	226_L	3.978	0.97
181_C	280_F	3.848	0.96
197_G	385_L	3.507	0.94
207_I	233_F	3.361	0.92
59_Q	62_I	3.166	0.90
258_F	270_G	3.150	0.89
289_Y	360_N	2.892	0.85
393_A	397_S	2.878	0.84
338_A	343_L	2.861	0.84
200_L	233_F	2.730	0.81
368_L	387_L	2.690	0.80
236_T	255_F	2.687	0.80
131_T	179_V	2.671	0.79
47_L	305_I	2.623	0.78
194_L	384_L	2.589	0.77
152_V	176_L	2.555	0.76
196_A	236_T	2.499	0.74
134_S	150_I	2.490	0.74
181_C	267_G	2.449	0.73
206_I	322_F	2.449	0.73
335_L	346_V	2.410	0.72
228_F	240_L	2.352	0.70
244_W	382_L	2.333	0.69
63_S	298_I	2.323	0.69
48_N	315_L	2.274	0.67
281_M	288_L	2.223	0.65
392_S	400_Y	2.169	0.63
344_V	362_M	2.156	0.63
308_L	313_G	2.119	0.61
128_L	179_V	2.070	0.59
48_N	308_L	2.055	0.59
315_L	364_L	2.042	0.58
347_H	358_E	2.030	0.58
317_M	370_K	2.008	0.57
47_L	230_I	1.941	0.54
245_Y	364_L	1.885	0.52
23_F	241_Y	1.857	0.51
160_L	201_V	1.844	0.50
43_C	54_Q	1.844	0.50
127_L	182_T	1.833	0.50
311_K	314_K	1.828	0.50
182_T	400_Y	1.827	0.50
48_N	313_G	1.815	0.49
22_G	70_I	1.794	0.48
157_R	161_G	1.773	0.47
176_L	297_I	1.771	0.47
339_E	348_Q	1.765	0.47
119_L	135_L	1.738	0.46
392_S	396_F	1.700	0.44
297_I	320_S	1.678	0.44
146_G	259_A	1.671	0.43
314_K	374_P	1.670	0.43
228_F	244_W	1.643	0.42
23_F	62_I	1.641	0.42
338_A	342_Q	1.632	0.42
62_I	150_I	1.625	0.41
396_F	400_Y	1.621	0.41
67_F	209_F	1.616	0.41
127_L	183_N	1.600	0.40
160_L	164_L	1.597	0.40
239_L	251_V	1.582	0.40
209_F	213_E	1.573	0.39
98_A	129_L	1.568	0.39
312_T	316_E	1.567	0.39
239_L	255_F	1.552	0.39
39_A	56_P	1.551	0.39
375_I	383_L	1.549	0.38
62_I	255_F	1.543	0.38
111_F	139_M	1.533	0.38
320_S	335_L	1.533	0.38
206_I	267_G	1.525	0.38
67_F	213_E	1.502	0.37
95_E	220_D	1.501	0.37
129_L	178_A	1.498	0.37
38_I	310_I	1.482	0.36
106_I	119_L	1.481	0.36
313_G	346_V	1.473	0.36
176_L	396_F	1.440	0.34
109_M	129_L	1.437	0.34
67_F	229_M	1.424	0.34
182_T	205_S	1.415	0.34
205_S	396_F	1.410	0.33
315_L	360_N	1.405	0.33
42_L	139_M	1.384	0.32
289_Y	367_L	1.379	0.32
131_T	184_A	1.376	0.32
276_M	323_K	1.370	0.32
47_L	398_I	1.360	0.32
63_S	308_L	1.353	0.31
127_L	131_T	1.351	0.31
372_L	375_I	1.349	0.31
109_M	115_A	1.334	0.31
206_I	229_M	1.334	0.31
176_L	182_T	1.333	0.31
74_F	227_Y	1.332	0.31
146_G	315_L	1.331	0.31
22_G	312_T	1.325	0.30
367_L	371_V	1.312	0.30
134_S	175_G	1.310	0.30
194_L	364_L	1.303	0.30
121_L	210_N	1.294	0.29
62_I	230_I	1.289	0.29
238_G	269_L	1.278	0.29
210_N	225_S	1.268	0.28
61_V	115_A	1.268	0.28
179_V	232_F	1.267	0.28
227_Y	230_I	1.266	0.28
240_L	382_L	1.265	0.28
221_D	255_F	1.263	0.28
205_S	392_S	1.262	0.28
62_I	101_G	1.260	0.28
166_L	233_F	1.260	0.28
263_F	289_Y	1.259	0.28
191_I	230_I	1.253	0.28
17_I	132_A	1.253	0.28
127_L	179_V	1.252	0.28
119_L	210_N	1.249	0.28
134_S	151_V	1.241	0.28
359_C	372_L	1.235	0.27
74_F	322_F	1.226	0.27
45_Q	55_I	1.225	0.27
33_F	40_A	1.225	0.27
372_L	383_L	1.225	0.27
210_N	213_E	1.221	0.27
228_F	266_V	1.217	0.27
47_L	364_L	1.210	0.27
19_S	69_I	1.209	0.27
205_S	279_F	1.208	0.26
135_L	210_N	1.204	0.26
100_I	135_L	1.200	0.26
191_I	328_S	1.195	0.26
264_A	268_I	1.191	0.26
164_L	240_L	1.187	0.26
146_G	242_H	1.185	0.26
47_L	357_T	1.184	0.26
201_V	385_L	1.184	0.26
45_Q	386_L	1.183	0.26
21_L	362_M	1.178	0.26
12_L	207_I	1.177	0.26
125_H	308_L	1.172	0.25
68_L	224_F	1.163	0.25
120_N	236_T	1.158	0.25
384_L	403_V	1.154	0.25
114_F	205_S	1.153	0.25
360_N	393_A	1.151	0.25
139_M	296_H	1.150	0.25
208_V	393_A	1.149	0.25
127_L	400_Y	1.146	0.25
236_T	364_L	1.137	0.24
29_L	375_I	1.137	0.24
267_G	342_Q	1.136	0.24
12_L	281_M	1.133	0.24
66_V	364_L	1.129	0.24
247_S	381_T	1.127	0.24
182_T	392_S	1.110	0.24
191_I	402_L	1.107	0.23
335_L	344_V	1.106	0.23
142_F	307_R	1.100	0.23
228_F	374_P	1.099	0.23
111_F	259_A	1.097	0.23
176_L	179_V	1.096	0.23
163_H	395_T	1.089	0.23
78_P	227_Y	1.086	0.23
75_I	140_V	1.085	0.23
103_L	150_I	1.084	0.23
127_L	262_T	1.082	0.23
22_G	36_H	1.077	0.23
107_C	118_V	1.076	0.23
83_F	279_F	1.075	0.23
67_F	235_T	1.072	0.22
237_L	285_F	1.069	0.22
151_V	163_H	1.066	0.22
100_I	370_K	1.059	0.22
132_A	364_L	1.050	0.22
241_Y	289_Y	1.042	0.22
315_L	402_L	1.041	0.22
13_L	16_L	1.040	0.22
71_L	258_F	1.039	0.22
64_G	77_F	1.039	0.22
74_F	78_P	1.039	0.22
18_V	281_M	1.035	0.21
365_I	381_T	1.028	0.21
69_I	398_I	1.026	0.21
25_A	259_A	1.026	0.21
204_A	390_L	1.021	0.21
19_S	234_F	1.021	0.21
346_V	355_E	1.020	0.21
342_Q	371_V	1.020	0.21
108_C	179_V	1.013	0.21
182_T	396_F	1.011	0.21
200_L	338_A	1.010	0.21
199_S	236_T	1.009	0.21
15_N	64_G	1.000	0.20
160_L	402_L	0.998	0.20
205_S	400_Y	0.993	0.20
155_P	160_L	0.992	0.20
365_I	384_L	0.989	0.20
45_Q	390_L	0.976	0.20
152_V	297_I	0.969	0.20
42_L	281_M	0.965	0.20
79_F	82_C	0.964	0.20
288_L	297_I	0.964	0.20
52_R	288_L	0.963	0.20
340_S	357_T	0.960	0.19
175_G	212_V	0.957	0.19
285_F	343_L	0.957	0.19
107_C	115_A	0.956	0.19
143_T	211_L	0.952	0.19
401_Q	404_R	0.946	0.19
45_Q	164_L	0.943	0.19
19_S	238_G	0.940	0.19
321_K	358_E	0.940	0.19
307_R	360_N	0.936	0.19
115_A	129_L	0.931	0.19
228_F	356_F	0.931	0.19
73_C	230_I	0.931	0.19
96_F	122_R	0.927	0.19
52_R	362_M	0.925	0.19
48_N	150_I	0.925	0.19
386_L	390_L	0.924	0.19
61_V	175_G	0.924	0.19
106_I	263_F	0.922	0.18
91_F	272_F	0.921	0.18
132_A	202_I	0.921	0.18
137_L	268_I	0.920	0.18
109_M	179_V	0.920	0.18
16_L	94_H	0.919	0.18
20_L	368_L	0.917	0.18
281_M	397_S	0.914	0.18
98_A	115_A	0.914	0.18
74_F	206_I	0.913	0.18
73_C	387_L	0.913	0.18
202_I	281_M	0.912	0.18
184_A	209_F	0.910	0.18
62_I	236_T	0.910	0.18
69_I	102_A	0.910	0.18
251_V	262_T	0.907	0.18
103_L	165_D	0.905	0.18
178_A	330_L	0.902	0.18
263_F	266_V	0.899	0.18
25_A	35_G	0.898	0.18
35_G	206_I	0.896	0.18
119_L	262_T	0.896	0.18
135_L	385_L	0.895	0.18
38_I	279_F	0.891	0.18
105_A	226_L	0.888	0.18
118_V	135_L	0.888	0.18
128_L	131_T	0.884	0.18
102_A	269_L	0.884	0.18
71_L	228_F	0.882	0.18
309_N	393_A	0.882	0.18
73_C	203_S	0.880	0.17
125_H	374_P	0.878	0.17
120_N	223_V	0.878	0.17
183_N	187_I	0.877	0.17
40_A	119_L	0.875	0.17
175_G	178_A	0.875	0.17
298_I	320_S	0.874	0.17
119_L	298_I	0.874	0.17
47_L	359_C	0.874	0.17
179_V	184_A	0.871	0.17
150_I	228_F	0.870	0.17
114_F	177_L	0.870	0.17
102_A	224_F	0.870	0.17
115_A	142_F	0.870	0.17
400_Y	407_Y	0.869	0.17
105_A	385_L	0.869	0.17
227_Y	322_F	0.867	0.17
47_L	335_L	0.867	0.17
177_L	291_L	0.866	0.17
121_L	175_G	0.863	0.17
224_F	266_V	0.862	0.17
120_N	143_T	0.861	0.17
71_L	129_L	0.861	0.17
97_V	214_L	0.860	0.17
166_L	207_I	0.860	0.17
96_F	206_I	0.859	0.17
128_L	143_T	0.857	0.17
145_F	289_Y	0.856	0.17
22_G	353_D	0.854	0.17
35_G	211_L	0.851	0.17
169_L	307_R	0.851	0.17
31_P	142_F	0.851	0.17
345_T	360_N	0.847	0.17
16_L	285_F	0.842	0.17
111_F	152_V	0.842	0.17
169_L	315_L	0.841	0.17
152_V	196_A	0.839	0.17
175_G	184_A	0.838	0.17
56_P	341_L	0.837	0.16
72_F	224_F	0.834	0.16
30_I	38_I	0.834	0.16
19_S	296_H	0.832	0.16
188_L	289_Y	0.831	0.16
269_L	335_L	0.828	0.16
62_I	70_I	0.827	0.16
313_G	337_V	0.826	0.16
159_I	387_L	0.824	0.16
107_C	208_V	0.824	0.16
109_M	262_T	0.822	0.16
27_V	241_Y	0.820	0.16
61_V	146_G	0.818	0.16
135_L	175_G	0.816	0.16
182_T	262_T	0.812	0.16
335_L	339_E	0.809	0.16
121_L	276_M	0.807	0.16
67_F	210_N	0.807	0.16
259_A	368_L	0.806	0.16
22_G	62_I	0.806	0.16
39_A	45_Q	0.805	0.16
142_F	404_R	0.805	0.16
37_F	374_P	0.804	0.16
79_F	115_A	0.802	0.16
212_V	375_I	0.799	0.16
115_A	121_L	0.797	0.16
189_A	365_I	0.796	0.16
291_L	294_L	0.793	0.16
106_I	213_E	0.790	0.15
298_I	357_T	0.788	0.15
125_H	235_T	0.784	0.15
40_A	206_I	0.783	0.15
110_I	364_L	0.780	0.15
134_S	288_L	0.779	0.15
47_L	201_V	0.779	0.15
68_L	102_A	0.778	0.15
22_G	156_F	0.776	0.15
35_G	333_F	0.776	0.15
108_C	127_L	0.775	0.15
156_F	202_I	0.771	0.15
152_V	157_R	0.770	0.15
47_L	69_I	0.768	0.15
15_N	359_C	0.768	0.15
181_C	264_A	0.768	0.15
179_V	199_S	0.767	0.15
59_Q	404_R	0.765	0.15
50_T	159_I	0.764	0.15
48_N	145_F	0.761	0.15
176_L	205_S	0.760	0.15
239_L	269_L	0.760	0.15
84_V	240_L	0.760	0.15
204_A	233_F	0.760	0.15
203_S	386_L	0.760	0.15
68_L	362_M	0.760	0.15
122_R	189_A	0.759	0.15
37_F	68_L	0.757	0.15
144_N	182_T	0.757	0.15
22_G	323_K	0.755	0.15
103_L	108_C	0.752	0.15
21_L	405_L	0.752	0.15
107_C	179_V	0.750	0.15
288_L	328_S	0.750	0.15
64_G	110_I	0.747	0.15
154_K	194_L	0.746	0.15
100_I	317_M	0.746	0.15
107_C	131_T	0.746	0.15
315_L	391_G	0.745	0.15
108_C	232_F	0.744	0.15
12_L	245_Y	0.744	0.15
354_G	375_I	0.741	0.14
364_L	385_L	0.739	0.14
19_S	310_I	0.738	0.14
71_L	277_L	0.736	0.14
96_F	120_N	0.736	0.14
114_F	182_T	0.735	0.14
206_I	233_F	0.735	0.14
142_F	155_P	0.735	0.14
206_I	276_M	0.735	0.14
320_S	328_S	0.734	0.14
36_H	42_L	0.732	0.14
93_H	96_F	0.731	0.14
179_V	209_F	0.731	0.14
58_S	259_A	0.730	0.14
97_V	262_T	0.730	0.14
23_F	142_F	0.728	0.14
127_L	176_L	0.727	0.14
158_P	312_T	0.727	0.14
209_F	234_F	0.726	0.14
170_Y	280_F	0.723	0.14
101_G	107_C	0.723	0.14
65_A	358_E	0.721	0.14
54_Q	107_C	0.720	0.14
82_C	98_A	0.718	0.14
26_T	238_G	0.718	0.14
91_F	263_F	0.717	0.14
39_A	120_N	0.716	0.14
93_H	166_L	0.713	0.14
307_R	405_L	0.712	0.14
184_A	210_N	0.708	0.14
121_L	223_V	0.706	0.14
132_A	313_G	0.705	0.14
196_A	387_L	0.705	0.14
65_A	139_M	0.702	0.14
296_H	359_C	0.702	0.14
91_F	266_V	0.699	0.14
166_L	276_M	0.699	0.14
394_I	397_S	0.697	0.14
10_M	61_V	0.696	0.14
78_P	111_F	0.696	0.14
230_I	357_T	0.696	0.14
114_F	118_V	0.691	0.13
38_I	50_T	0.688	0.13
128_L	314_K	0.687	0.13
241_Y	402_L	0.687	0.13
65_A	396_F	0.685	0.13
248_R	297_I	0.685	0.13
151_V	228_F	0.685	0.13
228_F	259_A	0.684	0.13
73_C	87_Q	0.683	0.13
360_N	367_L	0.681	0.13
176_L	392_S	0.681	0.13
139_M	323_K	0.678	0.13
127_L	187_I	0.677	0.13
183_N	277_L	0.676	0.13
81_N	84_V	0.676	0.13
33_F	169_L	0.676	0.13
349_S	354_G	0.675	0.13
244_W	381_T	0.674	0.13
47_L	279_F	0.672	0.13
134_S	168_I	0.671	0.13
121_L	184_A	0.671	0.13
118_V	400_Y	0.670	0.13
200_L	248_R	0.670	0.13
92_P	263_F	0.669	0.13
62_I	338_A	0.669	0.13
313_G	376_H	0.668	0.13
118_V	313_G	0.664	0.13
115_A	119_L	0.664	0.13
240_L	335_L	0.664	0.13
102_A	249_V	0.662	0.13
79_F	98_A	0.662	0.13
42_L	134_S	0.662	0.13
164_L	245_Y	0.659	0.13
58_S	147_N	0.658	0.13
120_N	256_C	0.657	0.13
55_I	172_V	0.655	0.13
178_A	364_L	0.654	0.13
55_I	140_V	0.653	0.13
107_C	135_L	0.651	0.13
65_A	111_F	0.651	0.13
106_I	210_N	0.650	0.13
35_G	393_A	0.647	0.13
55_I	164_L	0.646	0.13
362_M	391_G	0.645	0.13
297_I	402_L	0.644	0.13
28_T	398_I	0.644	0.13
191_I	324_T	0.642	0.13
330_L	357_T	0.641	0.13
109_M	205_S	0.641	0.13
338_A	394_I	0.641	0.13
177_L	375_I	0.637	0.13
362_M	403_V	0.635	0.12
217_D	276_M	0.635	0.12
155_P	381_T	0.633	0.12
127_L	392_S	0.633	0.12
151_V	398_I	0.632	0.12
233_F	324_T	0.628	0.12
147_N	234_F	0.627	0.12
259_A	320_S	0.626	0.12
259_A	401_Q	0.625	0.12
87_Q	194_L	0.625	0.12
165_D	406_F	0.622	0.12
224_F	357_T	0.622	0.12
266_V	272_F	0.621	0.12
31_P	133_A	0.620	0.12
165_D	168_I	0.620	0.12
79_F	84_V	0.619	0.12
131_T	182_T	0.616	0.12
53_Q	357_T	0.616	0.12
229_M	266_V	0.614	0.12
267_G	280_F	0.613	0.12
277_L	280_F	0.612	0.12
196_A	271_H	0.607	0.12
184_A	213_E	0.607	0.12
310_I	316_E	0.607	0.12
196_A	237_L	0.606	0.12
262_T	384_L	0.605	0.12
196_A	365_I	0.604	0.12
100_I	110_I	0.603	0.12
19_S	355_E	0.603	0.12
121_L	209_F	0.602	0.12
344_V	393_A	0.601	0.12
97_V	151_V	0.601	0.12
80_L	191_I	0.600	0.12
24_V	368_L	0.597	0.12
166_L	396_F	0.597	0.12
144_N	176_L	0.596	0.12
58_S	104_L	0.594	0.12
128_L	291_L	0.593	0.12
125_H	238_G	0.593	0.12
55_I	383_L	0.593	0.12
398_I	406_F	0.590	0.12
152_V	387_L	0.590	0.12
54_Q	108_C	0.589	0.12
59_Q	147_N	0.589	0.12
100_I	119_L	0.587	0.12
62_I	347_H	0.587	0.12
144_N	400_Y	0.585	0.12
211_L	230_I	0.585	0.12
134_S	178_A	0.584	0.12
155_P	244_W	0.581	0.12
203_S	229_M	0.581	0.12
297_I	313_G	0.579	0.12
121_L	262_T	0.579	0.12
288_L	307_R	0.579	0.12
258_F	269_L	0.579	0.12
114_F	400_Y	0.578	0.11
240_L	279_F	0.577	0.11
247_S	406_F	0.575	0.11
48_N	179_V	0.575	0.11
160_L	237_L	0.574	0.11
191_I	281_M	0.573	0.11
20_L	310_I	0.572	0.11
139_M	281_M	0.572	0.11
120_N	233_F	0.571	0.11
12_L	354_G	0.570	0.11
66_V	142_F	0.570	0.11
50_T	337_V	0.569	0.11
36_H	163_H	0.568	0.11
70_I	244_W	0.568	0.11
24_V	288_L	0.567	0.11
54_Q	150_I	0.567	0.11
21_L	316_E	0.566	0.11
226_L	230_I	0.566	0.11
50_T	53_Q	0.565	0.11
118_V	121_L	0.564	0.11
361_N	377_E	0.564	0.11
108_C	118_V	0.564	0.11
202_I	312_T	0.561	0.11
15_N	78_P	0.559	0.11
285_F	354_G	0.559	0.11
96_F	308_L	0.558	0.11
157_R	160_L	0.557	0.11
38_I	169_L	0.557	0.11
288_L	334_I	0.556	0.11
105_A	109_M	0.555	0.11
26_T	161_G	0.554	0.11
105_A	127_L	0.553	0.11
364_L	390_L	0.553	0.11
114_F	279_F	0.553	0.11
17_I	64_G	0.548	0.11
90_A	152_V	0.547	0.11
137_L	194_L	0.546	0.11
212_V	291_L	0.543	0.11
229_M	276_M	0.543	0.11
229_M	262_T	0.542	0.11
362_M	396_F	0.542	0.11
207_I	353_D	0.540	0.11
19_S	156_F	0.540	0.11
34_R	56_P	0.539	0.11
9_P	405_L	0.535	0.11
155_P	161_G	0.535	0.11
75_I	93_H	0.534	0.11
18_V	118_V	0.533	0.11
23_F	223_V	0.533	0.11
284_V	298_I	0.532	0.11
146_G	326_S	0.531	0.11
179_V	400_Y	0.531	0.11
14_I	47_L	0.531	0.11
313_G	348_Q	0.530	0.11
204_A	334_I	0.530	0.11
166_L	403_V	0.529	0.11
110_I	369_L	0.529	0.11
107_C	121_L	0.529	0.11
76_P	124_R	0.528	0.11
58_S	61_V	0.527	0.11
55_I	288_L	0.526	0.11
322_F	365_I	0.526	0.11
69_I	360_N	0.525	0.11
78_P	202_I	0.524	0.11
8_L	259_A	0.524	0.11
197_G	240_L	0.524	0.11
79_F	407_Y	0.523	0.11
99_L	321_K	0.521	0.11
110_I	317_M	0.520	0.11
128_L	384_L	0.518	0.11
197_G	228_F	0.518	0.11
94_H	259_A	0.518	0.11
62_I	264_A	0.518	0.11
157_R	394_I	0.516	0.11
28_T	368_L	0.514	0.10
64_G	96_F	0.513	0.10
328_S	335_L	0.512	0.10
34_R	403_V	0.512	0.10
78_P	245_Y	0.511	0.10
228_F	354_G	0.511	0.10
387_L	405_L	0.509	0.10
144_N	251_V	0.506	0.10
224_F	299_P	0.505	0.10
122_R	188_L	0.505	0.10
152_V	338_A	0.504	0.10
342_Q	389_I	0.503	0.10
201_V	382_L	0.502	0.10
143_T	289_Y	0.502	0.10
375_I	382_L	0.502	0.10
134_S	259_A	0.502	0.10
205_S	278_L	0.500	0.10
54_Q	149_T	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
5ckr_A	1	0.7506	100	0.831	Contact Map
1wdc_A	1	0.066	5.5	0.988	Contact Map
2k44_A	1	0.0685	4.5	0.989	Contact Map
3dh4_A	1	0.0171	2.9	0.99	Contact Map
4px7_A	1	0.1394	2.6	0.99	Contact Map
4f4s_A	1	0.1638	2.5	0.99	Contact Map
2rky_B	1	0.0513	2.3	0.99	Contact Map
2vy4_A	1	0.0831	2.3	0.99	Contact Map
3mqp_B	1	0.0611	2.3	0.991	Contact Map
3mce_A	1	0.1222	1.9	0.991	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0103 seconds.