YCLG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YCLG - Uncharacterized protein YclG

UniProt:	P94409	Sequences: MAEFILNAADFGVPRDGKTDSTERINQCLSTAVSKGYHTVWFPKGTYLIDATLGGDLNQRFRNAGIIVPGNLEIMMDPECIMKVIPNSSWGYSAFYVGKQENITISGGQIIGERDEHTYASAGIRSTHEWGFGICIEGCSNVVIDDVKISDFTGDGIIVSPRGLKTNQDYRTSEQIIIRRCEVRRSRRNNISITGCDMVTVEECLIEDAGTGNGTAPKFGIDIEGYGEGDVDYEEPINVSIRNNHFVGNVSSSVTNFNGYGILIEGNHSDNTISYGYGTQTVIKGNILRRPEDAAAAPRVGITGLGVSQGKETSDAVIAGNLITGFSTGIDVRGKSVLVTNNKISNFENTGILVYQSSDVKVDGNQIQNGLSETRRSIGLRAVLSDDIAFLNNCLIQVVDGVNVSGGNMIIKDNLLRKFSRGIWIAQGNAVIEGNTLNPDAFEAVPESYSVSVTNNAGAIIKNNTFKEFKNYPIYCSTSAKTSIIGNHLERSPLLVTIYISAGVHEIFDNTISVNRTAGNPIVIYLNGSAGSIISGNTINNLSAGTATAIQTNTSTNSKIIGNRIFKGTINKHSSDTIDGNMIV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	584 (467)
Sequences:	191 (179)
Seq/√Len:	8.3

BACSU - YCLG YORA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
342_N	365_N	5.924	1.00
244_N	267_N	5.386	1.00
76_M	108_G	4.651	0.99
26_N	30_S	4.256	0.98
204_C	244_N	3.971	0.97
15_R	21_S	3.762	0.96
267_N	286_N	3.729	0.96
12_G	17_G	3.639	0.96
286_N	321_N	3.623	0.96
21_S	24_R	3.488	0.95
464_N	487_N	3.377	0.93
342_N	393_N	3.353	0.93
13_V	24_R	3.287	0.93
71_N	102_N	3.256	0.92
217_P	222_D	3.252	0.92
321_N	342_N	3.231	0.92
15_R	19_T	3.205	0.92
217_P	224_E	3.100	0.90
12_G	16_D	3.096	0.90
365_N	414_N	3.092	0.90
14_P	21_S	3.070	0.90
16_D	21_S	2.893	0.86
206_I	246_F	2.840	0.85
365_N	393_N	2.715	0.83
181_C	204_C	2.430	0.75
74_I	95_F	2.426	0.75
102_N	141_N	2.381	0.73
435_N	464_N	2.380	0.73
414_N	435_N	2.369	0.73
15_R	18_K	2.346	0.72
76_M	107_G	2.314	0.71
159_V	178_I	2.289	0.70
451_V	474_I	2.180	0.66
76_M	156_G	2.172	0.66
351_G	379_G	2.163	0.65
16_D	19_T	2.146	0.65
219_F	224_E	2.076	0.62
13_V	21_S	2.076	0.62
191_I	201_V	2.075	0.62
140_S	174_E	2.067	0.62
14_P	19_T	2.028	0.60
18_K	21_S	2.003	0.59
117_H	188_R	1.979	0.58
283_I	321_N	1.969	0.58
242_R	265_E	1.958	0.57
13_V	17_G	1.958	0.57
509_D	512_I	1.958	0.57
26_N	195_G	1.956	0.57
192_S	224_E	1.934	0.56
390_F	420_S	1.867	0.54
76_M	80_C	1.841	0.53
189_N	219_F	1.827	0.52
144_I	180_R	1.810	0.51
316_A	401_G	1.808	0.51
152_F	186_S	1.807	0.51
117_H	224_E	1.800	0.51
183_V	206_I	1.792	0.50
139_C	142_V	1.778	0.50
43_P	91_G	1.775	0.50
435_N	487_N	1.769	0.50
10_D	20_D	1.729	0.48
11_F	21_S	1.725	0.48
112_G	141_N	1.698	0.47
466_F	474_I	1.672	0.45
361_K	507_I	1.665	0.45
219_F	222_D	1.664	0.45
484_I	524_I	1.620	0.43
380_L	394_C	1.619	0.43
113_E	131_G	1.599	0.42
15_R	20_D	1.590	0.42
252_S	341_N	1.589	0.42
25_I	494_L	1.574	0.41
258_N	264_I	1.573	0.41
318_I	342_N	1.570	0.41
74_I	244_N	1.566	0.41
393_N	414_N	1.564	0.41
97_V	103_I	1.564	0.41
385_S	390_F	1.562	0.41
107_G	241_I	1.562	0.41
466_F	489_L	1.559	0.41
338_L	402_V	1.556	0.41
262_I	341_N	1.556	0.41
192_S	222_D	1.535	0.40
134_I	183_V	1.534	0.40
342_N	414_N	1.531	0.40
107_G	146_D	1.522	0.39
133_G	195_G	1.518	0.39
12_G	21_S	1.509	0.39
131_G	224_E	1.499	0.38
131_G	187_R	1.491	0.38
17_G	47_Y	1.481	0.38
187_R	192_S	1.479	0.38
187_R	222_D	1.473	0.37
221_I	283_I	1.471	0.37
283_I	302_I	1.457	0.37
21_S	41_W	1.454	0.37
18_K	24_R	1.453	0.37
189_N	218_K	1.441	0.36
221_I	224_E	1.427	0.36
365_N	435_N	1.425	0.36
241_I	351_G	1.421	0.35
12_G	24_R	1.417	0.35
127_T	154_G	1.416	0.35
26_N	31_T	1.406	0.35
117_H	131_G	1.394	0.34
188_R	192_S	1.381	0.34
380_L	401_G	1.375	0.34
285_G	386_D	1.368	0.33
12_G	45_G	1.367	0.33
43_P	80_C	1.362	0.33
107_G	262_I	1.361	0.33
367_I	395_L	1.361	0.33
154_G	187_R	1.360	0.33
422_G	449_Y	1.358	0.33
83_K	503_G	1.357	0.33
402_V	422_G	1.353	0.33
529_S	532_S	1.353	0.33
17_G	46_T	1.350	0.33
176_I	486_G	1.346	0.33
318_I	365_N	1.340	0.32
241_I	407_G	1.336	0.32
29_L	464_N	1.329	0.32
80_C	142_V	1.324	0.32
190_N	209_A	1.322	0.32
188_R	224_E	1.321	0.32
203_E	431_V	1.317	0.32
437_L	501_S	1.297	0.31
82_M	108_G	1.297	0.31
266_G	285_G	1.293	0.31
318_I	323_I	1.286	0.30
157_I	183_V	1.286	0.30
43_P	77_D	1.276	0.30
286_N	342_N	1.273	0.30
13_V	18_K	1.270	0.30
180_R	203_E	1.264	0.30
406_G	465_T	1.257	0.29
161_P	285_G	1.252	0.29
113_E	187_R	1.251	0.29
189_N	194_T	1.249	0.29
321_N	365_N	1.242	0.29
393_N	487_N	1.242	0.29
377_S	507_I	1.240	0.29
190_N	194_T	1.234	0.29
416_L	451_V	1.231	0.29
203_E	478_T	1.230	0.29
178_I	204_C	1.229	0.28
173_S	178_I	1.221	0.28
13_V	16_D	1.221	0.28
318_I	411_I	1.219	0.28
129_E	154_G	1.215	0.28
103_I	113_E	1.215	0.28
11_F	31_T	1.214	0.28
342_N	411_I	1.214	0.28
496_V	515_N	1.211	0.28
241_I	259_G	1.210	0.28
110_I	157_I	1.209	0.28
155_D	188_R	1.194	0.27
154_G	195_G	1.187	0.27
419_F	428_G	1.186	0.27
204_C	408_N	1.185	0.27
179_R	202_E	1.176	0.27
197_D	237_I	1.175	0.27
438_N	484_I	1.173	0.27
13_V	20_D	1.163	0.26
153_T	187_R	1.162	0.26
113_E	117_H	1.161	0.26
133_G	152_F	1.152	0.26
21_S	31_T	1.150	0.26
409_M	428_G	1.150	0.26
461_I	484_I	1.149	0.26
133_G	249_N	1.143	0.26
188_R	222_D	1.143	0.26
487_N	510_N	1.142	0.26
68_V	318_I	1.139	0.26
220_G	325_G	1.135	0.25
142_V	199_V	1.133	0.25
302_I	325_G	1.130	0.25
15_R	108_G	1.125	0.25
203_E	509_D	1.125	0.25
136_I	176_I	1.123	0.25
398_V	484_I	1.120	0.25
176_I	243_N	1.119	0.25
24_R	37_Y	1.111	0.25
129_E	222_D	1.107	0.25
108_G	187_R	1.106	0.24
342_N	362_V	1.105	0.24
144_I	157_I	1.089	0.24
533_I	536_G	1.084	0.24
87_N	92_Y	1.077	0.24
26_N	37_Y	1.076	0.24
430_A	476_C	1.075	0.24
71_N	419_F	1.073	0.23
131_G	188_R	1.072	0.23
246_F	321_N	1.067	0.23
402_V	461_I	1.067	0.23
243_N	266_G	1.064	0.23
125_R	266_G	1.063	0.23
190_N	226_Y	1.061	0.23
17_G	45_G	1.059	0.23
136_I	239_V	1.055	0.23
115_D	390_F	1.053	0.23
202_E	242_R	1.049	0.23
11_F	15_R	1.048	0.23
69_P	269_S	1.047	0.23
185_R	208_D	1.043	0.23
39_T	75_M	1.041	0.23
208_D	324_T	1.039	0.22
189_N	192_S	1.037	0.22
148_K	182_E	1.033	0.22
330_I	434_G	1.033	0.22
132_F	154_G	1.030	0.22
201_V	385_S	1.029	0.22
318_I	466_F	1.026	0.22
110_I	134_I	1.025	0.22
245_H	344_I	1.023	0.22
46_T	437_L	1.019	0.22
473_P	516_R	1.019	0.22
29_L	47_Y	1.018	0.22
136_I	139_C	1.017	0.22
223_I	244_N	1.017	0.22
198_M	238_N	1.015	0.22
239_V	336_S	1.014	0.22
381_R	462_K	1.013	0.22
76_M	89_S	1.010	0.22
129_E	187_R	1.010	0.22
343_K	413_D	1.009	0.22
320_G	362_V	1.009	0.22
523_V	534_I	1.003	0.21
264_I	338_L	1.000	0.21
525_Y	535_S	0.997	0.21
528_G	534_I	0.994	0.21
76_M	105_I	0.993	0.21
266_G	382_A	0.992	0.21
159_V	173_S	0.991	0.21
376_R	390_F	0.990	0.21
399_V	405_S	0.989	0.21
178_I	331_D	0.988	0.21
304_G	423_I	0.976	0.21
514_V	527_N	0.975	0.21
48_L	85_I	0.970	0.21
99_K	315_D	0.966	0.20
482_T	487_N	0.965	0.20
186_S	196_C	0.964	0.20
141_N	243_N	0.964	0.20
25_I	261_G	0.963	0.20
339_V	346_N	0.962	0.20
26_N	66_I	0.959	0.20
144_I	249_N	0.958	0.20
219_F	223_I	0.957	0.20
364_G	479_S	0.956	0.20
14_P	239_V	0.956	0.20
142_V	391_L	0.951	0.20
21_S	37_Y	0.949	0.20
391_L	474_I	0.948	0.20
149_I	183_V	0.943	0.20
21_S	38_H	0.939	0.20
158_I	176_I	0.937	0.20
243_N	404_V	0.937	0.20
41_W	75_M	0.934	0.20
278_G	334_G	0.933	0.20
25_I	436_T	0.932	0.20
188_R	219_F	0.931	0.19
129_E	188_R	0.931	0.19
70_G	344_I	0.929	0.19
11_F	82_M	0.929	0.19
221_I	241_I	0.925	0.19
308_S	312_E	0.925	0.19
117_H	217_P	0.924	0.19
437_L	458_G	0.920	0.19
86_P	145_D	0.916	0.19
117_H	129_E	0.916	0.19
47_Y	147_V	0.913	0.19
101_E	528_G	0.912	0.19
105_I	253_S	0.912	0.19
108_G	112_G	0.912	0.19
283_I	291_P	0.909	0.19
267_N	321_N	0.907	0.19
507_I	531_G	0.906	0.19
451_V	469_F	0.906	0.19
113_E	154_G	0.905	0.19
14_P	17_G	0.902	0.19
320_G	404_V	0.901	0.19
248_G	318_I	0.899	0.19
82_M	348_E	0.899	0.19
66_I	223_I	0.897	0.19
82_M	221_I	0.896	0.19
344_I	396_I	0.896	0.19
19_T	42_F	0.894	0.19
70_G	108_G	0.893	0.19
102_N	107_G	0.891	0.18
27_Q	31_T	0.890	0.18
201_V	390_F	0.890	0.18
243_N	264_I	0.888	0.18
73_E	106_S	0.886	0.18
25_I	291_P	0.886	0.18
206_I	259_G	0.886	0.18
531_G	535_S	0.885	0.18
73_E	201_V	0.885	0.18
99_K	317_V	0.882	0.18
458_G	489_L	0.878	0.18
68_V	420_S	0.878	0.18
15_R	38_H	0.876	0.18
17_G	28_C	0.875	0.18
265_E	284_K	0.874	0.18
159_V	401_G	0.873	0.18
203_E	318_I	0.871	0.18
43_P	70_G	0.865	0.18
522_I	528_G	0.863	0.18
360_V	407_G	0.863	0.18
112_G	133_G	0.860	0.18
131_G	192_S	0.860	0.18
416_L	478_T	0.858	0.18
514_V	523_V	0.858	0.18
437_L	489_L	0.855	0.18
175_Q	198_M	0.854	0.18
178_I	285_G	0.854	0.18
30_S	142_V	0.852	0.18
74_I	317_V	0.850	0.17
27_Q	481_K	0.848	0.17
48_L	86_P	0.845	0.17
80_C	105_I	0.844	0.17
159_V	465_T	0.842	0.17
43_P	142_V	0.842	0.17
66_I	266_G	0.842	0.17
321_N	393_N	0.841	0.17
367_I	379_G	0.841	0.17
464_N	482_T	0.840	0.17
29_L	38_H	0.840	0.17
147_V	181_C	0.835	0.17
318_I	321_N	0.833	0.17
119_Y	266_G	0.832	0.17
68_V	201_V	0.825	0.17
142_V	239_V	0.820	0.17
180_R	186_S	0.815	0.17
189_N	209_A	0.814	0.17
192_S	258_N	0.813	0.17
401_G	470_K	0.813	0.17
474_I	479_S	0.811	0.17
261_G	453_V	0.808	0.16
314_S	436_T	0.807	0.16
463_N	491_R	0.806	0.16
117_H	187_R	0.803	0.16
393_N	486_G	0.802	0.16
178_I	200_T	0.801	0.16
86_P	105_I	0.799	0.16
146_D	180_R	0.798	0.16
108_G	189_N	0.797	0.16
193_I	198_M	0.797	0.16
264_I	393_N	0.796	0.16
26_N	267_N	0.796	0.16
201_V	508_F	0.795	0.16
352_I	523_V	0.794	0.16
456_N	460_I	0.794	0.16
201_V	331_D	0.791	0.16
222_D	259_G	0.790	0.16
522_I	525_Y	0.788	0.16
174_E	447_E	0.784	0.16
191_I	196_C	0.782	0.16
532_S	535_S	0.781	0.16
20_D	24_R	0.780	0.16
264_I	271_N	0.779	0.16
102_N	267_N	0.778	0.16
154_G	286_N	0.778	0.16
74_I	258_N	0.778	0.16
133_G	154_G	0.775	0.16
264_I	321_N	0.774	0.16
140_S	283_I	0.773	0.16
40_V	43_P	0.770	0.16
271_N	318_I	0.767	0.16
329_G	365_N	0.764	0.15
17_G	283_I	0.762	0.15
411_I	437_L	0.761	0.15
422_G	474_I	0.759	0.15
345_S	432_I	0.758	0.15
101_E	140_S	0.756	0.15
66_I	108_G	0.754	0.15
344_I	367_I	0.753	0.15
183_V	318_I	0.752	0.15
201_V	281_T	0.752	0.15
332_V	410_I	0.750	0.15
437_L	466_F	0.749	0.15
280_Q	469_F	0.747	0.15
85_I	112_G	0.746	0.15
393_N	435_N	0.742	0.15
410_I	413_D	0.741	0.15
97_V	142_V	0.739	0.15
423_I	464_N	0.735	0.15
199_V	239_V	0.735	0.15
49_I	302_I	0.735	0.15
83_K	249_N	0.732	0.15
92_Y	224_E	0.731	0.15
81_I	282_V	0.730	0.15
102_N	379_G	0.729	0.15
346_N	369_N	0.724	0.15
159_V	206_I	0.723	0.15
455_N	479_S	0.722	0.15
203_E	285_G	0.722	0.15
390_F	477_S	0.721	0.15
224_E	321_N	0.721	0.15
28_C	134_I	0.719	0.15
24_R	28_C	0.719	0.15
87_N	129_E	0.718	0.15
140_S	452_S	0.718	0.15
330_I	486_G	0.717	0.14
66_I	174_E	0.716	0.14
189_N	217_P	0.714	0.14
262_I	320_G	0.712	0.14
380_L	433_E	0.712	0.14
12_G	220_G	0.711	0.14
156_G	206_I	0.711	0.14
407_G	454_T	0.709	0.14
42_F	535_S	0.709	0.14
515_N	521_P	0.709	0.14
455_N	476_C	0.708	0.14
12_G	18_K	0.707	0.14
107_G	266_G	0.707	0.14
19_T	159_V	0.706	0.14
50_D	315_D	0.706	0.14
144_I	388_I	0.705	0.14
92_Y	188_R	0.704	0.14
403_N	434_G	0.704	0.14
154_G	188_R	0.703	0.14
109_Q	149_I	0.702	0.14
278_G	330_I	0.702	0.14
180_R	242_R	0.702	0.14
265_E	269_S	0.702	0.14
474_I	487_N	0.701	0.14
413_D	473_P	0.701	0.14
103_I	177_I	0.700	0.14
42_F	72_L	0.698	0.14
151_D	245_H	0.697	0.14
503_G	507_I	0.696	0.14
263_L	489_L	0.694	0.14
157_I	178_I	0.693	0.14
49_I	246_F	0.693	0.14
31_T	37_Y	0.690	0.14
77_D	80_C	0.688	0.14
153_T	188_R	0.688	0.14
117_H	192_S	0.686	0.14
149_I	157_I	0.685	0.14
470_K	476_C	0.683	0.14
20_D	364_G	0.682	0.14
529_S	536_G	0.681	0.14
239_V	425_I	0.680	0.14
192_S	236_P	0.677	0.14
92_Y	119_Y	0.674	0.14
133_G	259_G	0.674	0.14
29_L	134_I	0.674	0.14
108_G	138_G	0.672	0.14
88_S	113_E	0.671	0.14
145_D	180_R	0.671	0.14
72_L	76_M	0.671	0.14
49_I	321_N	0.670	0.14
521_P	534_I	0.670	0.14
13_V	37_Y	0.669	0.14
453_V	474_I	0.669	0.14
282_V	498_I	0.668	0.14
434_G	469_F	0.667	0.13
364_G	492_S	0.667	0.13
422_G	446_P	0.666	0.13
21_S	66_I	0.666	0.13
26_N	69_P	0.666	0.13
150_S	239_V	0.666	0.13
21_S	118_T	0.666	0.13
421_R	493_P	0.664	0.13
528_G	533_I	0.663	0.13
149_I	259_G	0.662	0.13
11_F	18_K	0.660	0.13
20_D	344_I	0.660	0.13
114_R	188_R	0.659	0.13
144_I	483_S	0.656	0.13
418_K	433_E	0.655	0.13
431_V	509_D	0.654	0.13
411_I	434_G	0.653	0.13
113_E	192_S	0.653	0.13
15_R	453_V	0.652	0.13
428_G	450_S	0.651	0.13
95_F	283_I	0.651	0.13
243_N	483_S	0.651	0.13
190_N	236_P	0.651	0.13
30_S	66_I	0.650	0.13
156_G	159_V	0.650	0.13
81_I	438_N	0.649	0.13
380_L	450_S	0.648	0.13
188_R	194_T	0.648	0.13
80_C	108_G	0.648	0.13
11_F	109_Q	0.648	0.13
193_I	239_V	0.648	0.13
342_N	435_N	0.646	0.13
46_T	134_I	0.645	0.13
454_T	480_A	0.644	0.13
178_I	448_S	0.644	0.13
343_K	401_G	0.644	0.13
14_P	24_R	0.643	0.13
204_C	345_S	0.642	0.13
345_S	366_Q	0.641	0.13
83_K	335_K	0.641	0.13
370_G	410_I	0.641	0.13
417_R	488_H	0.639	0.13
482_T	527_N	0.638	0.13
502_A	512_I	0.637	0.13
523_V	536_G	0.637	0.13
82_M	454_T	0.635	0.13
134_I	401_G	0.635	0.13
70_G	199_V	0.635	0.13
483_S	486_G	0.634	0.13
493_P	496_V	0.634	0.13
105_I	108_G	0.633	0.13
411_I	461_I	0.632	0.13
39_T	74_I	0.631	0.13
119_Y	129_E	0.631	0.13
359_D	426_A	0.631	0.13
70_G	390_F	0.630	0.13
114_R	320_G	0.628	0.13
265_E	428_G	0.628	0.13
343_K	364_G	0.627	0.13
176_I	207_E	0.626	0.13
51_A	326_F	0.625	0.13
429_N	468_E	0.624	0.13
341_N	499_Y	0.623	0.13
522_I	530_A	0.623	0.13
42_F	159_V	0.622	0.13
87_N	131_G	0.622	0.13
196_C	225_G	0.621	0.13
354_V	446_P	0.619	0.13
105_I	209_A	0.619	0.13
95_F	147_V	0.617	0.13
17_G	21_S	0.616	0.13
16_D	525_Y	0.615	0.13
40_V	399_V	0.614	0.12
151_D	278_G	0.614	0.12
322_L	343_K	0.613	0.12
159_V	466_F	0.612	0.12
113_E	224_E	0.611	0.12
264_I	386_D	0.611	0.12
289_R	324_T	0.610	0.12
114_R	117_H	0.609	0.12
49_I	195_G	0.608	0.12
197_D	269_S	0.606	0.12
92_Y	117_H	0.606	0.12
76_M	189_N	0.606	0.12
21_S	131_G	0.606	0.12
113_E	186_S	0.605	0.12
304_G	413_D	0.605	0.12
110_I	248_G	0.605	0.12
50_D	134_I	0.604	0.12
261_G	495_L	0.602	0.12
13_V	119_Y	0.601	0.12
95_F	244_N	0.600	0.12
367_I	435_N	0.600	0.12
112_G	334_G	0.600	0.12
182_E	207_E	0.600	0.12
222_D	225_G	0.599	0.12
23_E	486_G	0.599	0.12
44_K	79_E	0.599	0.12
29_L	147_V	0.598	0.12
132_F	188_R	0.598	0.12
117_H	154_G	0.597	0.12
510_N	514_V	0.597	0.12
179_R	362_V	0.596	0.12
176_I	436_T	0.596	0.12
72_L	481_K	0.595	0.12
241_I	286_N	0.594	0.12
411_I	433_E	0.593	0.12
71_N	477_S	0.592	0.12
364_G	473_P	0.591	0.12
323_I	404_V	0.591	0.12
209_A	222_D	0.590	0.12
49_I	84_V	0.590	0.12
512_I	531_G	0.586	0.12
117_H	127_T	0.585	0.12
524_I	527_N	0.585	0.12
437_L	474_I	0.585	0.12
423_I	432_I	0.584	0.12
222_D	258_N	0.584	0.12
128_H	249_N	0.584	0.12
454_T	504_V	0.582	0.12
451_V	465_T	0.581	0.12
380_L	402_V	0.580	0.12
488_H	496_V	0.580	0.12
101_E	328_T	0.579	0.12
110_I	149_I	0.579	0.12
409_M	489_L	0.579	0.12
131_G	217_P	0.576	0.12
263_L	343_K	0.575	0.12
416_L	437_L	0.575	0.12
76_M	131_G	0.573	0.12
22_T	334_G	0.573	0.12
362_V	415_L	0.572	0.12
527_N	535_S	0.572	0.12
156_G	194_T	0.572	0.12
92_Y	222_D	0.571	0.12
415_L	471_N	0.570	0.12
103_I	198_M	0.569	0.12
352_I	522_I	0.568	0.12
329_G	367_I	0.568	0.12
145_D	179_R	0.568	0.12
180_R	416_L	0.567	0.12
11_F	24_R	0.566	0.12
102_N	334_G	0.566	0.12
46_T	287_I	0.566	0.12
458_G	470_K	0.565	0.12
181_C	286_N	0.565	0.12
258_N	414_N	0.564	0.12
184_R	207_E	0.561	0.12
419_F	450_S	0.561	0.12
392_N	481_K	0.560	0.12
185_R	320_G	0.560	0.12
249_N	252_S	0.558	0.11
293_D	302_I	0.558	0.11
41_W	73_E	0.557	0.11
69_P	79_E	0.557	0.11
220_G	269_S	0.556	0.11
218_K	222_D	0.554	0.11
365_N	400_D	0.553	0.11
92_Y	187_R	0.550	0.11
330_I	475_Y	0.548	0.11
21_S	114_R	0.548	0.11
117_H	195_G	0.547	0.11
237_I	351_G	0.546	0.11
318_I	418_K	0.546	0.11
421_R	426_A	0.546	0.11
49_I	313_T	0.543	0.11
79_E	206_I	0.543	0.11
17_G	24_R	0.543	0.11
510_N	513_S	0.543	0.11
113_E	133_G	0.542	0.11
204_C	223_I	0.542	0.11
92_Y	129_E	0.542	0.11
66_I	310_G	0.540	0.11
424_W	480_A	0.539	0.11
49_I	315_D	0.538	0.11
411_I	430_A	0.538	0.11
503_G	512_I	0.538	0.11
42_F	81_I	0.538	0.11
402_V	492_S	0.537	0.11
507_I	512_I	0.537	0.11
283_I	286_N	0.537	0.11
402_V	435_N	0.537	0.11
25_I	67_I	0.536	0.11
423_I	455_N	0.536	0.11
113_E	119_Y	0.535	0.11
13_V	42_F	0.535	0.11
182_E	271_N	0.534	0.11
42_F	50_D	0.534	0.11
113_E	127_T	0.533	0.11
29_L	82_M	0.533	0.11
422_G	431_V	0.532	0.11
424_W	439_P	0.531	0.11
200_T	282_V	0.531	0.11
119_Y	128_H	0.530	0.11
178_I	191_I	0.530	0.11
148_K	191_I	0.530	0.11
97_V	411_I	0.528	0.11
246_F	269_S	0.528	0.11
117_H	136_I	0.526	0.11
138_G	156_G	0.526	0.11
474_I	491_R	0.526	0.11
274_S	304_G	0.526	0.11
425_I	493_P	0.522	0.11
42_F	71_N	0.521	0.11
178_I	362_V	0.519	0.11
302_I	329_G	0.519	0.11
395_L	411_I	0.518	0.11
48_L	118_T	0.518	0.11
15_R	467_K	0.518	0.11
84_V	189_N	0.516	0.11
10_D	15_R	0.516	0.11
108_G	135_C	0.515	0.11
26_N	38_H	0.515	0.11
72_L	138_G	0.515	0.11
132_F	201_V	0.515	0.11
268_H	396_I	0.514	0.11
385_S	393_N	0.514	0.11
308_S	311_K	0.513	0.11
404_V	415_L	0.513	0.11
87_N	267_N	0.513	0.11
84_V	209_A	0.512	0.11
206_I	526_L	0.512	0.11
466_F	502_A	0.511	0.11
338_L	533_I	0.510	0.11
83_K	114_R	0.510	0.11
99_K	405_S	0.510	0.11
511_T	524_I	0.508	0.11
244_N	408_N	0.508	0.11
127_T	130_W	0.507	0.11
255_T	344_I	0.507	0.11
523_V	527_N	0.507	0.11
451_V	515_N	0.507	0.11
452_S	528_G	0.506	0.11
238_N	344_I	0.506	0.11
71_N	198_M	0.505	0.11
417_R	493_P	0.504	0.11
315_D	362_V	0.502	0.11
509_D	521_P	0.502	0.11
386_D	416_L	0.501	0.11
156_G	183_V	0.501	0.11
154_G	225_G	0.501	0.11
320_G	466_F	0.500	0.11
419_F	452_S	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3gq8A	3	0.8818	100	0.622	Contact Map
2uvfA	2	0.5976	100	0.623	Contact Map
3sucA	3	0.8921	100	0.629	Contact Map
3jurA	3	0.589	100	0.631	Contact Map
2pygA	1	0.5925	100	0.643	Contact Map
4mr0A	1	0.6832	100	0.647	Contact Map
4mxnA	1	0.363	100	0.674	Contact Map
1bheA	1	0.536	100	0.687	Contact Map
1rmgA	1	0.6438	100	0.687	Contact Map
2x6wA	3	0.8339	100	0.689	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0138 seconds.