CIMH - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

CIMH - Citrate/malate transporter

UniProt:	P94363	Sequences: MGELQTHMQLQTDTIHEGVRKENWFAKAMNIKVGIIPLPVYALLFILITVFVMHHDVKSDILTSIAVMAFFGFTFAQIGKSIPIVRSIGGPAILATFIPSAVVYYHLLPNDIVKSTTEFTENSNFLYLFIAGIVVGSILGMKRETLVKAFMKIFIPLIVGSVTAAIVGLAVGTLLGLGFQHTLLYIVIPIMAGGVGEGAIPLSIGYSDIMPISQGEAFALVLPSIMLGSLCAIILAGLLNRIGKKKPEWTGNGKVDRSEEESPALEESQSGQQMFNLSLFASGGILAVSLYLVGMLAHDFFGFPAPVAMLLLAVLIKLFRLVPASIENGAFGVSRFFSTAVTYPLLFAIGVSMTPWDKLVAAFNLSNIITILSVVVTMMAVGFFTGKWLNMYPIETAIINACHSGQGGTGDVAILSAAERLELMPFAQVSTRIGGAITVSLTLLLLHQFY	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	450 (419)
Sequences:	380 (254)
Seq/√Len:	12.4

BACSU - CIMH MAEN

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
101_A	105_Y	4.967	1.00
290_L	316_I	4.571	1.00
77_Q	81_S	4.228	1.00
97_F	230_L	4.089	1.00
238_L	242_I	4.024	0.99
169_L	179_F	3.739	0.99
129_F	342_T	3.645	0.99
229_S	406_Q	3.271	0.98
171_V	373_S	3.159	0.97
403_H	431_T	3.097	0.97
126_L	196_G	2.944	0.96
231_C	372_L	2.930	0.95
412_V	424_M	2.711	0.93
398_I	418_A	2.692	0.93
172_G	182_T	2.637	0.92
294_G	309_M	2.607	0.92
168_G	187_V	2.545	0.91
120_T	348_A	2.509	0.90
335_R	339_T	2.498	0.90
240_N	244_K	2.495	0.90
190_I	228_G	2.458	0.89
58_K	63_T	2.433	0.88
379_M	397_A	2.394	0.88
247_P	250_T	2.358	0.87
281_A	340_A	2.335	0.86
298_H	305_A	2.247	0.84
317_K	327_E	2.100	0.79
108_L	287_A	2.099	0.79
377_T	381_V	2.059	0.78
296_L	311_L	2.034	0.77
166_I	369_I	2.032	0.77
311_L	315_L	2.009	0.76
223_P	317_K	2.001	0.76
222_L	227_L	1.992	0.76
192_A	431_T	1.978	0.75
149_A	426_F	1.977	0.75
250_T	395_E	1.971	0.75
119_F	346_L	1.962	0.74
141_M	317_K	1.961	0.74
296_L	300_F	1.957	0.74
317_K	425_P	1.926	0.73
219_A	433_I	1.924	0.73
169_L	187_V	1.921	0.73
398_I	421_L	1.918	0.73
224_S	406_Q	1.916	0.73
128_L	433_I	1.911	0.72
351_V	354_T	1.910	0.72
125_F	345_L	1.898	0.72
117_T	352_S	1.892	0.72
199_A	225_I	1.880	0.71
300_F	416_S	1.869	0.71
239_L	354_T	1.858	0.70
46_I	315_L	1.857	0.70
162_V	441_L	1.846	0.70
281_A	337_F	1.839	0.69
101_A	360_V	1.831	0.69
247_P	252_N	1.801	0.68
46_I	376_V	1.797	0.68
304_P	431_T	1.794	0.67
342_T	409_T	1.786	0.67
110_N	114_K	1.768	0.66
128_L	302_G	1.765	0.66
61_I	129_F	1.750	0.65
205_G	439_V	1.748	0.65
46_I	170_A	1.706	0.63
377_T	405_G	1.698	0.63
173_T	179_F	1.681	0.62
350_G	402_C	1.680	0.62
378_M	403_H	1.678	0.62
137_S	294_G	1.676	0.62
42_A	162_V	1.676	0.62
287_A	397_A	1.672	0.62
227_L	371_I	1.668	0.62
248_E	252_N	1.635	0.60
75_F	98_I	1.605	0.58
96_T	354_T	1.579	0.57
76_A	343_Y	1.564	0.56
105_Y	356_W	1.544	0.55
157_L	403_H	1.535	0.55
175_L	366_S	1.518	0.54
42_A	78_I	1.511	0.54
404_S	431_T	1.506	0.53
418_A	422_E	1.503	0.53
61_I	291_Y	1.502	0.53
161_S	378_M	1.499	0.53
223_P	426_F	1.495	0.53
252_N	422_E	1.494	0.53
360_V	430_S	1.493	0.53
186_I	317_K	1.489	0.53
346_L	374_V	1.486	0.52
135_V	433_I	1.483	0.52
285_I	418_A	1.478	0.52
280_F	329_G	1.456	0.51
184_L	439_V	1.443	0.50
152_K	186_I	1.431	0.50
163_T	377_T	1.404	0.48
352_S	409_T	1.404	0.48
376_V	384_F	1.403	0.48
85_V	220_L	1.378	0.47
154_F	399_I	1.377	0.47
154_F	161_S	1.376	0.47
400_N	403_H	1.371	0.47
191_M	199_A	1.369	0.46
414_I	431_T	1.359	0.46
41_Y	74_T	1.354	0.46
315_L	397_A	1.350	0.45
126_L	428_Q	1.343	0.45
293_V	312_L	1.342	0.45
116_T	345_L	1.340	0.45
95_A	199_A	1.336	0.45
261_E	419_E	1.335	0.45
197_E	306_P	1.304	0.43
387_K	393_P	1.285	0.42
33_V	227_L	1.282	0.42
85_V	94_L	1.281	0.42
341_V	440_S	1.273	0.42
250_T	337_F	1.258	0.41
239_L	394_I	1.257	0.41
65_I	78_I	1.255	0.41
404_S	411_D	1.241	0.40
132_G	333_V	1.237	0.40
112_I	365_L	1.236	0.40
90_G	428_Q	1.231	0.40
414_I	439_V	1.230	0.40
319_F	330_A	1.223	0.39
243_G	247_P	1.215	0.39
61_I	348_A	1.213	0.39
195_V	391_M	1.213	0.39
413_A	428_Q	1.209	0.39
96_T	119_F	1.208	0.38
429_V	433_I	1.208	0.38
333_V	395_E	1.208	0.38
284_G	341_V	1.194	0.38
212_I	216_E	1.189	0.38
175_L	178_G	1.187	0.37
222_L	395_E	1.184	0.37
224_S	344_P	1.182	0.37
100_S	355_P	1.180	0.37
218_F	426_F	1.172	0.37
308_A	443_L	1.169	0.37
403_H	414_I	1.169	0.37
298_H	315_L	1.168	0.37
366_S	370_T	1.168	0.37
90_G	133_I	1.168	0.37
33_V	302_G	1.166	0.36
219_A	316_I	1.165	0.36
338_S	346_L	1.157	0.36
201_P	428_Q	1.155	0.36
152_K	317_K	1.146	0.36
235_L	376_V	1.143	0.35
46_I	212_I	1.128	0.35
49_T	102_V	1.128	0.35
41_Y	60_D	1.123	0.34
97_F	208_D	1.122	0.34
332_G	340_A	1.120	0.34
67_V	291_Y	1.119	0.34
372_L	376_V	1.115	0.34
86_R	210_M	1.108	0.34
49_T	53_M	1.108	0.34
281_A	310_L	1.106	0.34
91_P	345_L	1.106	0.34
116_T	211_P	1.105	0.34
121_E	353_M	1.104	0.34
41_Y	395_E	1.104	0.34
342_T	345_L	1.100	0.33
102_V	107_L	1.097	0.33
99_P	307_V	1.096	0.33
82_I	369_I	1.096	0.33
72_G	156_P	1.093	0.33
190_I	430_S	1.092	0.33
171_V	433_I	1.080	0.32
167_V	377_T	1.077	0.32
305_A	355_P	1.073	0.32
186_I	224_S	1.071	0.32
208_D	384_F	1.071	0.32
134_V	203_S	1.067	0.32
199_A	243_G	1.067	0.32
381_V	405_G	1.061	0.32
400_N	414_I	1.061	0.32
46_I	166_I	1.059	0.32
195_V	349_I	1.058	0.32
239_L	250_T	1.057	0.31
304_P	404_S	1.056	0.31
214_Q	359_L	1.056	0.31
191_M	196_G	1.055	0.31
207_S	214_Q	1.050	0.31
425_P	429_V	1.048	0.31
93_I	444_L	1.048	0.31
412_V	436_A	1.047	0.31
190_I	411_D	1.047	0.31
109_P	191_M	1.046	0.31
255_V	429_V	1.045	0.31
233_I	395_E	1.044	0.31
55_H	321_L	1.040	0.31
261_E	392_Y	1.032	0.30
97_F	218_F	1.027	0.30
33_V	38_L	1.025	0.30
363_F	396_T	1.021	0.30
223_P	413_A	1.021	0.30
328_N	389_L	1.017	0.30
36_I	162_V	1.015	0.30
128_L	284_G	1.011	0.29
32_K	78_I	1.009	0.29
263_P	433_I	1.008	0.29
78_I	82_I	1.003	0.29
307_V	439_V	1.001	0.29
239_L	243_G	1.001	0.29
101_A	363_F	1.000	0.29
141_M	426_F	1.000	0.29
82_I	243_G	0.998	0.29
228_G	428_Q	0.997	0.29
182_T	186_I	0.997	0.29
130_I	309_M	0.996	0.29
48_I	52_V	0.994	0.29
429_V	438_T	0.987	0.28
134_V	429_V	0.981	0.28
403_H	411_D	0.979	0.28
118_E	238_L	0.976	0.28
307_V	414_I	0.975	0.28
228_G	409_T	0.974	0.28
338_S	440_S	0.974	0.28
154_F	158_I	0.973	0.28
119_F	195_V	0.970	0.28
192_A	367_N	0.970	0.28
48_I	394_I	0.968	0.28
411_D	431_T	0.967	0.28
310_L	344_P	0.967	0.28
47_L	139_L	0.967	0.28
321_L	395_E	0.965	0.28
269_Q	326_I	0.965	0.28
290_L	303_F	0.961	0.27
239_L	367_N	0.954	0.27
301_F	368_I	0.954	0.27
169_L	183_L	0.953	0.27
211_P	311_L	0.952	0.27
203_S	211_P	0.950	0.27
102_V	329_G	0.948	0.27
71_F	145_T	0.947	0.27
172_G	413_A	0.946	0.27
403_H	430_S	0.945	0.27
301_F	438_T	0.942	0.27
306_P	439_V	0.942	0.27
121_E	419_E	0.940	0.27
142_K	280_F	0.938	0.26
141_M	236_A	0.938	0.26
216_E	249_W	0.936	0.26
424_M	436_A	0.933	0.26
316_I	322_V	0.933	0.26
378_M	431_T	0.933	0.26
76_A	370_T	0.930	0.26
297_A	308_A	0.924	0.26
170_A	174_L	0.921	0.26
430_S	433_I	0.914	0.26
45_F	93_I	0.914	0.26
309_M	336_F	0.914	0.26
416_S	439_V	0.912	0.25
143_R	147_V	0.910	0.25
159_V	388_W	0.910	0.25
166_I	312_L	0.908	0.25
116_T	234_I	0.900	0.25
252_N	351_V	0.897	0.25
128_L	281_A	0.895	0.25
242_I	246_K	0.895	0.25
198_G	201_P	0.890	0.25
225_I	391_M	0.889	0.25
75_F	166_I	0.889	0.25
238_L	271_G	0.888	0.25
124_N	127_Y	0.887	0.24
213_S	300_F	0.887	0.24
238_L	321_L	0.885	0.24
98_I	397_A	0.878	0.24
46_I	50_V	0.878	0.24
39_P	43_L	0.876	0.24
232_A	354_T	0.872	0.24
156_P	233_I	0.867	0.24
67_V	301_F	0.866	0.24
157_L	161_S	0.866	0.24
182_T	313_A	0.861	0.24
348_A	433_I	0.861	0.24
197_E	439_V	0.859	0.23
195_V	327_E	0.858	0.23
99_P	414_I	0.858	0.23
310_L	443_L	0.853	0.23
167_V	418_A	0.853	0.23
322_V	327_E	0.853	0.23
411_D	430_S	0.851	0.23
235_L	379_M	0.851	0.23
222_L	416_S	0.850	0.23
116_T	173_T	0.850	0.23
365_L	369_I	0.850	0.23
106_H	422_E	0.849	0.23
225_I	406_Q	0.849	0.23
320_R	327_E	0.848	0.23
197_E	405_G	0.846	0.23
169_L	213_S	0.845	0.23
142_K	165_A	0.843	0.23
302_G	447_H	0.843	0.23
378_M	414_I	0.841	0.23
128_L	215_G	0.836	0.23
118_E	396_T	0.836	0.23
353_M	359_L	0.834	0.23
116_T	418_A	0.834	0.23
376_V	442_T	0.829	0.22
103_V	365_L	0.827	0.22
57_V	261_E	0.824	0.22
293_V	297_A	0.822	0.22
222_L	440_S	0.821	0.22
37_P	40_V	0.821	0.22
72_G	233_I	0.821	0.22
72_G	95_A	0.819	0.22
170_A	173_T	0.819	0.22
206_Y	236_A	0.817	0.22
306_P	383_F	0.815	0.22
63_T	120_T	0.812	0.22
223_P	446_L	0.807	0.22
26_A	430_S	0.802	0.21
218_F	406_Q	0.795	0.21
408_G	412_V	0.794	0.21
76_A	99_P	0.794	0.21
133_I	430_S	0.793	0.21
188_I	439_V	0.792	0.21
57_V	63_T	0.792	0.21
250_T	298_H	0.791	0.21
349_I	406_Q	0.791	0.21
195_V	426_F	0.790	0.21
99_P	157_L	0.789	0.21
119_F	218_F	0.788	0.21
162_V	354_T	0.788	0.21
223_P	406_Q	0.786	0.21
114_K	173_T	0.785	0.21
58_K	348_A	0.782	0.21
239_L	411_D	0.782	0.21
242_I	249_W	0.782	0.21
186_I	221_V	0.781	0.21
96_T	346_L	0.778	0.21
179_F	370_T	0.775	0.21
96_T	406_Q	0.774	0.20
286_L	369_I	0.771	0.20
147_V	206_Y	0.771	0.20
315_L	447_H	0.770	0.20
77_Q	374_V	0.770	0.20
90_G	229_S	0.768	0.20
129_F	364_N	0.768	0.20
355_P	399_I	0.766	0.20
104_Y	357_D	0.766	0.20
61_I	357_D	0.765	0.20
130_I	196_G	0.765	0.20
350_G	364_N	0.764	0.20
186_I	416_S	0.764	0.20
102_V	216_E	0.763	0.20
228_G	406_Q	0.762	0.20
402_C	427_A	0.762	0.20
135_V	309_M	0.761	0.20
183_L	419_E	0.761	0.20
94_L	228_G	0.761	0.20
157_L	179_F	0.759	0.20
294_G	412_V	0.759	0.20
226_M	406_Q	0.758	0.20
218_F	223_P	0.756	0.20
106_H	179_F	0.754	0.20
257_R	290_L	0.754	0.20
116_T	438_T	0.749	0.20
127_Y	303_F	0.747	0.20
228_G	237_G	0.747	0.20
63_T	350_G	0.745	0.20
315_L	319_F	0.744	0.20
139_L	155_I	0.744	0.20
175_L	246_K	0.744	0.20
174_L	245_K	0.743	0.19
65_I	244_K	0.741	0.19
160_G	202_L	0.741	0.19
49_T	257_R	0.740	0.19
210_M	227_L	0.739	0.19
143_R	246_K	0.738	0.19
66_A	160_G	0.738	0.19
221_V	317_K	0.735	0.19
208_D	301_F	0.735	0.19
240_N	384_F	0.734	0.19
32_K	274_M	0.733	0.19
197_E	304_P	0.731	0.19
38_L	155_I	0.731	0.19
46_I	380_A	0.729	0.19
134_V	290_L	0.728	0.19
87_S	217_A	0.725	0.19
383_F	414_I	0.724	0.19
378_M	399_I	0.723	0.19
40_V	384_F	0.722	0.19
195_V	223_P	0.722	0.19
177_L	416_S	0.722	0.19
108_L	412_V	0.722	0.19
351_V	445_L	0.721	0.19
82_I	213_S	0.717	0.19
399_I	431_T	0.716	0.19
404_S	430_S	0.716	0.19
107_L	117_T	0.714	0.19
182_T	228_G	0.713	0.19
42_A	174_L	0.712	0.18
71_F	78_I	0.711	0.18
195_V	218_F	0.710	0.18
63_T	232_A	0.709	0.18
276_N	373_S	0.709	0.18
363_F	433_I	0.708	0.18
204_I	304_P	0.708	0.18
232_A	239_L	0.706	0.18
410_G	435_G	0.705	0.18
142_K	322_V	0.705	0.18
128_L	337_F	0.705	0.18
260_E	392_Y	0.702	0.18
100_S	418_A	0.701	0.18
260_E	263_P	0.700	0.18
96_T	224_S	0.699	0.18
66_A	285_I	0.699	0.18
95_A	352_S	0.699	0.18
197_E	414_I	0.698	0.18
322_V	385_T	0.697	0.18
37_P	50_V	0.697	0.18
55_H	388_W	0.695	0.18
142_K	409_T	0.695	0.18
106_H	321_L	0.695	0.18
296_L	301_F	0.694	0.18
67_V	116_T	0.692	0.18
304_P	439_V	0.692	0.18
49_T	437_I	0.690	0.18
192_A	217_A	0.688	0.18
32_K	98_I	0.688	0.18
57_V	233_I	0.686	0.18
298_H	302_G	0.686	0.18
45_F	285_I	0.686	0.18
378_M	430_S	0.680	0.18
98_I	307_V	0.679	0.18
47_L	214_Q	0.677	0.17
202_L	215_G	0.676	0.17
154_F	430_S	0.676	0.17
133_I	310_L	0.676	0.17
284_G	416_S	0.672	0.17
75_F	283_G	0.672	0.17
116_T	127_Y	0.672	0.17
55_H	111_D	0.668	0.17
160_G	385_T	0.666	0.17
73_F	343_Y	0.666	0.17
196_G	428_Q	0.664	0.17
134_V	233_I	0.663	0.17
175_L	365_L	0.661	0.17
114_K	360_V	0.660	0.17
243_G	394_I	0.659	0.17
99_P	226_M	0.659	0.17
170_A	290_L	0.658	0.17
46_I	262_S	0.658	0.17
250_T	354_T	0.658	0.17
279_L	322_V	0.656	0.17
201_P	417_A	0.656	0.17
347_F	443_L	0.655	0.17
291_Y	398_I	0.652	0.17
167_V	373_S	0.651	0.17
393_P	427_A	0.650	0.17
412_V	426_F	0.650	0.17
182_T	326_I	0.649	0.17
190_I	442_T	0.648	0.17
48_I	92_A	0.648	0.17
354_T	394_I	0.645	0.17
55_H	107_L	0.645	0.17
99_P	405_G	0.645	0.17
229_S	330_A	0.643	0.16
223_P	428_Q	0.643	0.16
174_L	182_T	0.640	0.16
124_N	306_P	0.638	0.16
43_L	316_I	0.637	0.16
199_A	218_F	0.636	0.16
274_M	361_A	0.634	0.16
152_K	417_A	0.634	0.16
141_M	223_P	0.633	0.16
140_G	310_L	0.632	0.16
154_F	403_H	0.632	0.16
248_E	375_V	0.632	0.16
310_L	413_A	0.631	0.16
47_L	230_L	0.630	0.16
345_L	412_V	0.629	0.16
51_F	347_F	0.628	0.16
41_Y	93_I	0.627	0.16
405_G	411_D	0.627	0.16
415_L	434_G	0.625	0.16
141_M	413_A	0.624	0.16
68_M	353_M	0.622	0.16
64_S	115_S	0.621	0.16
424_M	428_Q	0.619	0.16
129_F	412_V	0.619	0.16
314_V	353_M	0.617	0.16
317_K	346_L	0.617	0.16
224_S	228_G	0.617	0.16
390_N	441_L	0.615	0.16
164_A	329_G	0.614	0.16
257_R	283_G	0.614	0.16
411_D	434_G	0.613	0.16
103_V	127_Y	0.613	0.16
342_T	412_V	0.612	0.16
61_I	364_N	0.610	0.16
345_L	436_A	0.610	0.16
60_D	124_N	0.610	0.16
256_D	338_S	0.610	0.16
108_L	351_V	0.609	0.16
212_I	296_L	0.609	0.16
94_L	308_A	0.608	0.16
119_F	227_L	0.608	0.16
50_V	289_S	0.606	0.15
209_I	446_L	0.604	0.15
291_Y	363_F	0.601	0.15
187_V	439_V	0.600	0.15
205_G	443_L	0.598	0.15
228_G	436_A	0.597	0.15
338_S	364_N	0.596	0.15
36_I	53_M	0.595	0.15
304_P	403_H	0.594	0.15
135_V	219_A	0.593	0.15
60_D	320_R	0.592	0.15
310_L	337_F	0.591	0.15
242_I	444_L	0.591	0.15
202_L	439_V	0.591	0.15
68_M	349_I	0.590	0.15
382_G	448_Q	0.589	0.15
135_V	330_A	0.589	0.15
252_N	289_S	0.588	0.15
140_G	281_A	0.586	0.15
172_G	417_A	0.586	0.15
91_P	214_Q	0.586	0.15
99_P	197_E	0.581	0.15
216_E	263_P	0.581	0.15
75_F	78_I	0.581	0.15
108_L	447_H	0.578	0.15
197_E	355_P	0.578	0.15
113_V	242_I	0.578	0.15
210_M	296_L	0.577	0.15
106_H	283_G	0.576	0.15
37_P	104_Y	0.576	0.15
127_Y	355_P	0.575	0.15
221_V	310_L	0.574	0.15
74_T	115_S	0.571	0.15
36_I	55_H	0.571	0.15
234_I	283_G	0.571	0.15
383_F	386_G	0.571	0.15
195_V	406_Q	0.571	0.15
43_L	320_R	0.569	0.14
342_T	436_A	0.569	0.14
52_V	66_A	0.568	0.14
345_L	353_M	0.568	0.14
356_W	374_V	0.567	0.14
158_I	161_S	0.566	0.14
68_M	350_G	0.564	0.14
192_A	439_V	0.564	0.14
117_T	353_M	0.562	0.14
238_L	369_I	0.562	0.14
38_L	41_Y	0.561	0.14
391_M	414_I	0.561	0.14
149_A	327_E	0.560	0.14
44_L	292_L	0.560	0.14
281_A	285_I	0.559	0.14
284_G	310_L	0.558	0.14
152_K	291_Y	0.557	0.14
107_L	360_V	0.557	0.14
154_F	157_L	0.556	0.14
408_G	428_Q	0.556	0.14
219_A	383_F	0.554	0.14
154_F	162_V	0.553	0.14
286_L	327_E	0.553	0.14
50_V	315_L	0.551	0.14
148_K	322_V	0.550	0.14
61_I	387_K	0.550	0.14
213_S	238_L	0.548	0.14
44_L	280_F	0.547	0.14
322_V	389_L	0.547	0.14
211_P	217_A	0.546	0.14
169_L	173_T	0.545	0.14
100_S	431_T	0.545	0.14
100_S	414_I	0.544	0.14
190_I	287_A	0.544	0.14
221_V	374_V	0.543	0.14
400_N	405_G	0.542	0.14
297_A	395_E	0.541	0.14
145_T	380_A	0.541	0.14
323_P	394_I	0.540	0.14
50_V	396_T	0.540	0.14
298_H	430_S	0.540	0.14
226_M	349_I	0.539	0.14
70_F	395_E	0.537	0.14
413_A	426_F	0.537	0.14
28_A	171_V	0.537	0.14
356_W	414_I	0.536	0.14
115_S	123_S	0.534	0.14
123_S	207_S	0.534	0.14
307_V	400_N	0.531	0.14
248_E	444_L	0.531	0.14
94_L	98_I	0.530	0.14
42_A	80_K	0.529	0.14
405_G	431_T	0.529	0.14
57_V	72_G	0.528	0.13
42_A	234_I	0.528	0.13
65_I	178_G	0.526	0.13
199_A	404_S	0.524	0.13
82_I	94_L	0.524	0.13
368_I	395_E	0.523	0.13
87_S	158_I	0.521	0.13
146_L	398_I	0.521	0.13
69_A	284_G	0.520	0.13
140_G	367_N	0.518	0.13
209_I	375_V	0.518	0.13
226_M	371_I	0.517	0.13
86_R	321_L	0.515	0.13
65_I	265_L	0.514	0.13
125_F	353_M	0.514	0.13
219_A	351_V	0.513	0.13
72_G	395_E	0.513	0.13
111_D	418_A	0.512	0.13
233_I	251_G	0.512	0.13
232_A	405_G	0.510	0.13
48_I	53_M	0.510	0.13
195_V	438_T	0.510	0.13
303_F	387_K	0.509	0.13
76_A	148_K	0.509	0.13
51_F	57_V	0.506	0.13
28_A	286_L	0.506	0.13
329_G	368_I	0.505	0.13
241_R	244_K	0.505	0.13
97_F	222_L	0.505	0.13
191_M	434_G	0.502	0.13
147_V	396_T	0.502	0.13
402_C	405_G	0.501	0.13
355_P	414_I	0.501	0.13
59_S	145_T	0.501	0.13
252_N	387_K	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4bwzA	2	0.7756	95.2	0.962	Contact Map
4czbA	2	0.3689	92	0.967	Contact Map
4cz8A	2	0.3622	88	0.969	Contact Map
1zcdA	1	0.7178	62.4	0.976	Contact Map
4f35D	2	0.8156	44.4	0.978	Contact Map
4r0cA	3	0.8222	27.7	0.98	Contact Map
3zuxA	1	0.3311	21.7	0.981	Contact Map
4r1iA	2	0.8822	17.5	0.982	Contact Map
1pw4A	1	0.3822	11.3	0.984	Contact Map
2nwlA	3	0.6644	9.8	0.984	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0121 seconds.