URE1 - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

URE1 - Urease subunit alpha

UniProt:	P77837	Sequences: MKMSREEYAELFGPTTGDKIRLGDTDLWIEVEKDFTVYGEEMIFGGGKTIRDGMGQNGRITGKDGALDLVITNVVLLDYTGIVKADVGVKDGRIVGVGKSGNPDIMDGVDPHMVIGAGTEVISGEGKILTAGGVDTHIHFICPQQMEVALSSGVTTLLGGGTGPATGSKATTCTSGAWYMARMLEAAEEFPINVGFLGKGNASDKAPLIEQVEAGAIGLKLHEDWGTTPSAIKTCMEVVDEADIQVAIHTDTINEAGFLENTLDAIGDRVIHTYHIEGAGGGHAPDIMKLASYANILPSSTTPTIPYTVNTMDEHLDMMMVCHHLDAKVPEDVAFSHSRIRAATIAAEDILHDIGAISMTSSDSQAMGRVGEVIIRTWQVADKMKKQRGALAGENGNDNVRAKRYIAKYTINPAITHGLSHEVGSVEKGKLADLVLWDPVFFGVKPELVLKGGMIARAQMGDPNASIPTPEPVFMRQMYASYGKANRSTSITFMSQASIERGVAESLGLEKRISPVKNIRKLSKLDMKLNSALPKIEIDPKTYQVFADGEELSCQPVDYVPLGQRYFLF	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	569 (564)
Sequences:	1096 (350)
Seq/√Len:	14.8

BACSU - URE1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
87_V	129_L	6.655	1.00
29_I	402_A	6.265	1.00
31_V	75_V	5.540	1.00
20_I	75_V	4.850	1.00
419_L	423_V	4.743	1.00
69_L	179_Y	4.619	1.00
288_M	538_I	4.496	1.00
77_L	402_A	4.463	1.00
359_M	416_T	3.728	1.00
382_D	386_K	3.641	0.99
29_I	77_L	3.607	0.99
209_I	241_E	3.600	0.99
23_G	562_L	3.571	0.99
221_L	227_T	3.484	0.99
69_L	89_V	3.388	0.99
120_E	165_A	3.293	0.99
80_T	83_V	3.246	0.99
426_V	434_L	3.138	0.98
239_V	246_V	2.995	0.98
393_G	400_V	2.962	0.98
299_S	359_M	2.887	0.97
403_K	529_L	2.865	0.97
50_I	115_I	2.855	0.97
79_Y	528_K	2.840	0.97
71_I	124_G	2.839	0.97
187_A	196_F	2.763	0.96
26_D	386_K	2.759	0.96
93_R	422_E	2.751	0.96
422_E	514_S	2.708	0.96
560_V	563_G	2.703	0.96
129_L	434_L	2.671	0.95
40_E	106_M	2.622	0.95
491_I	514_S	2.613	0.95
67_L	113_M	2.606	0.95
221_L	231_A	2.583	0.94
182_R	185_E	2.551	0.94
146_M	190_F	2.537	0.94
496_Q	500_E	2.408	0.92
297_L	359_M	2.404	0.92
76_L	97_V	2.395	0.92
184_L	509_L	2.389	0.92
157_L	192_I	2.320	0.90
305_I	360_T	2.293	0.90
444_V	562_L	2.278	0.90
382_D	561_P	2.274	0.90
547_A	552_L	2.258	0.89
557_V	560_V	2.235	0.89
274_Y	360_T	2.230	0.89
499_I	513_I	2.228	0.89
74_V	129_L	2.223	0.88
157_L	370_V	2.213	0.88
305_I	380_V	2.203	0.88
431_L	491_I	2.159	0.87
181_A	507_L	2.159	0.87
43_I	326_D	2.151	0.87
151_S	457_R	2.150	0.87
195_G	217_I	2.147	0.87
502_G	505_E	2.114	0.86
23_G	444_V	2.099	0.85
77_L	406_I	2.085	0.85
146_M	192_I	2.054	0.84
133_G	154_V	2.043	0.84
263_L	290_L	2.042	0.84
494_M	504_A	2.034	0.83
188_E	511_K	2.018	0.83
129_L	436_L	2.014	0.83
378_W	409_Y	2.000	0.82
70_V	100_S	1.998	0.82
138_I	157_L	1.981	0.82
115_I	121_V	1.967	0.81
259_L	263_L	1.963	0.81
67_L	121_V	1.952	0.81
69_L	122_I	1.919	0.79
133_G	374_I	1.906	0.79
190_F	482_Y	1.894	0.79
30_E	397_N	1.882	0.78
129_L	426_V	1.881	0.78
484_K	510_E	1.863	0.77
415_I	522_L	1.857	0.77
490_S	511_K	1.850	0.77
67_L	95_V	1.848	0.77
350_I	554_C	1.843	0.77
62_G	90_K	1.830	0.76
168_S	250_T	1.830	0.76
421_H	514_S	1.827	0.76
197_L	274_Y	1.827	0.76
494_M	503_V	1.796	0.75
158_L	419_L	1.767	0.73
197_L	247_A	1.762	0.73
291_A	536_I	1.760	0.73
213_E	501_R	1.752	0.73
459_Q	475_M	1.749	0.73
201_N	227_T	1.729	0.72
546_F	551_E	1.723	0.71
97_V	428_K	1.714	0.71
138_I	145_Q	1.706	0.71
179_Y	454_M	1.692	0.70
127_K	438_D	1.687	0.70
74_V	87_V	1.679	0.69
87_V	436_L	1.674	0.69
62_G	65_G	1.672	0.69
180_M	216_A	1.650	0.68
110_D	113_M	1.649	0.68
19_K	397_N	1.648	0.68
166_T	169_K	1.637	0.67
288_M	357_I	1.636	0.67
76_L	85_A	1.635	0.67
444_V	567_F	1.635	0.67
337_H	356_A	1.635	0.67
165_A	455_I	1.632	0.67
181_A	185_E	1.627	0.67
67_L	96_G	1.624	0.67
187_A	194_V	1.613	0.66
233_K	237_E	1.613	0.66
229_P	256_A	1.610	0.66
136_T	299_S	1.610	0.66
274_Y	299_S	1.609	0.66
421_H	517_K	1.609	0.66
537_E	546_F	1.578	0.64
16_T	83_V	1.575	0.64
299_S	416_T	1.573	0.64
63_K	177_A	1.562	0.64
387_Q	554_C	1.559	0.63
197_L	218_G	1.552	0.63
131_A	406_I	1.549	0.63
291_A	356_A	1.537	0.62
83_V	528_K	1.529	0.62
152_S	374_I	1.523	0.62
82_I	403_K	1.517	0.61
79_Y	529_L	1.513	0.61
390_A	394_E	1.512	0.61
67_L	88_G	1.511	0.61
58_G	104_D	1.503	0.61
494_M	499_I	1.501	0.60
498_S	504_A	1.495	0.60
518_N	521_K	1.474	0.59
250_T	273_T	1.465	0.58
19_K	30_E	1.459	0.58
350_I	552_L	1.458	0.58
233_K	267_G	1.453	0.58
96_G	110_D	1.449	0.58
62_G	91_D	1.436	0.57
205_K	234_T	1.435	0.57
136_T	360_T	1.431	0.57
454_M	489_T	1.429	0.57
503_V	513_I	1.425	0.56
80_T	528_K	1.402	0.55
544_Q	551_E	1.383	0.54
89_V	179_Y	1.381	0.54
221_L	248_I	1.380	0.54
162_T	175_S	1.379	0.54
518_N	522_L	1.365	0.53
259_L	289_K	1.359	0.53
276_I	290_L	1.355	0.52
3_M	11_L	1.336	0.51
144_Q	460_M	1.334	0.51
138_I	370_V	1.330	0.51
73_N	125_E	1.329	0.51
382_D	560_V	1.325	0.51
499_I	504_A	1.324	0.51
145_Q	370_V	1.321	0.51
185_E	488_S	1.313	0.50
44_F	170_A	1.310	0.50
187_A	486_N	1.308	0.50
69_L	454_M	1.306	0.50
146_M	194_V	1.306	0.50
37_V	40_E	1.301	0.49
491_I	513_I	1.299	0.49
124_G	129_L	1.295	0.49
407_A	529_L	1.289	0.49
421_H	515_P	1.289	0.49
519_I	522_L	1.285	0.49
117_A	207_P	1.281	0.48
375_I	567_F	1.280	0.48
248_I	273_T	1.275	0.48
96_G	113_M	1.274	0.48
11_L	43_I	1.262	0.47
158_L	217_I	1.262	0.47
227_T	231_A	1.260	0.47
50_I	121_V	1.255	0.47
276_I	291_A	1.252	0.47
178_W	454_M	1.250	0.47
189_E	486_N	1.245	0.46
422_E	515_P	1.239	0.46
402_A	406_I	1.237	0.46
145_Q	157_L	1.233	0.46
136_T	359_M	1.233	0.46
42_M	115_I	1.232	0.46
19_K	28_W	1.224	0.45
499_I	515_P	1.223	0.45
360_T	380_V	1.220	0.45
42_M	106_M	1.215	0.45
106_M	511_K	1.214	0.45
263_L	293_Y	1.212	0.44
213_E	242_A	1.208	0.44
49_T	55_G	1.206	0.44
209_I	242_A	1.197	0.44
219_L	244_I	1.195	0.44
181_A	506_S	1.191	0.43
42_M	100_S	1.185	0.43
494_M	513_I	1.182	0.43
74_V	436_L	1.179	0.43
80_T	529_L	1.174	0.42
27_L	402_A	1.168	0.42
76_L	129_L	1.164	0.42
445_K	567_F	1.163	0.42
11_L	326_D	1.161	0.42
201_N	221_L	1.154	0.41
427_E	430_K	1.153	0.41
274_Y	416_T	1.152	0.41
227_T	248_I	1.147	0.41
499_I	503_V	1.145	0.41
212_V	219_L	1.144	0.41
52_D	203_S	1.141	0.41
452_G	489_T	1.138	0.40
240_D	266_I	1.135	0.40
151_S	459_Q	1.128	0.40
42_M	50_I	1.122	0.40
110_D	114_V	1.121	0.40
240_D	522_L	1.119	0.39
276_I	357_I	1.118	0.39
560_V	564_Q	1.115	0.39
126_G	152_S	1.112	0.39
50_I	106_M	1.105	0.39
96_G	428_K	1.103	0.39
134_V	419_L	1.102	0.39
127_K	447_E	1.096	0.38
138_I	274_Y	1.079	0.37
184_L	492_T	1.076	0.37
415_I	528_K	1.074	0.37
393_G	396_G	1.074	0.37
168_S	201_N	1.073	0.37
6_E	10_E	1.070	0.37
37_V	108_G	1.070	0.37
559_Y	563_G	1.066	0.37
559_Y	562_L	1.065	0.37
127_K	436_L	1.056	0.36
166_T	448_L	1.055	0.36
12_F	43_I	1.051	0.36
266_I	296_I	1.048	0.36
122_I	450_L	1.046	0.36
35_F	83_V	1.045	0.36
42_M	113_M	1.039	0.35
375_I	444_V	1.038	0.35
387_Q	555_Q	1.038	0.35
388_R	550_E	1.037	0.35
268_D	523_S	1.031	0.35
170_A	315_H	1.028	0.35
483_G	486_N	1.028	0.35
357_I	538_I	1.027	0.35
170_A	311_T	1.025	0.35
7_E	10_E	1.025	0.35
356_A	533_L	1.022	0.34
3_M	12_F	1.020	0.34
189_E	482_Y	1.019	0.34
40_E	107_D	1.019	0.34
438_D	447_E	1.019	0.34
465_A	479_Y	1.017	0.34
221_L	235_C	1.013	0.34
497_A	501_R	1.010	0.34
319_M	340_I	1.009	0.34
415_I	420_S	1.007	0.34
87_V	434_L	1.004	0.34
383_K	387_Q	1.001	0.33
311_T	315_H	1.001	0.33
449_V	475_M	0.999	0.33
176_G	211_Q	0.995	0.33
176_G	179_Y	0.994	0.33
138_I	364_S	0.994	0.33
412_N	528_K	0.990	0.33
117_A	202_A	0.990	0.33
292_S	407_A	0.984	0.33
250_T	287_I	0.984	0.33
188_E	487_R	0.980	0.32
264_D	267_G	0.978	0.32
356_A	547_A	0.963	0.32
400_V	529_L	0.957	0.31
456_A	490_S	0.956	0.31
151_S	475_M	0.954	0.31
172_T	199_K	0.953	0.31
359_M	527_M	0.951	0.31
205_K	237_E	0.949	0.31
57_N	104_D	0.949	0.31
290_L	357_I	0.947	0.31
291_A	357_I	0.945	0.31
63_K	66_A	0.944	0.31
157_L	194_V	0.940	0.30
93_R	431_L	0.940	0.30
230_S	234_T	0.935	0.30
209_I	213_E	0.930	0.30
480_A	489_T	0.929	0.30
80_T	403_K	0.929	0.30
23_G	375_I	0.915	0.29
380_V	383_K	0.911	0.29
315_H	340_I	0.908	0.29
383_K	554_C	0.905	0.29
120_E	167_G	0.904	0.29
79_Y	83_V	0.904	0.29
415_I	521_K	0.902	0.29
273_T	276_I	0.901	0.29
312_M	337_H	0.900	0.29
350_I	388_R	0.899	0.29
294_A	523_S	0.899	0.29
131_A	426_V	0.898	0.28
44_F	315_H	0.898	0.28
166_T	447_E	0.897	0.28
89_V	122_I	0.897	0.28
346_A	554_C	0.896	0.28
80_T	426_V	0.893	0.28
322_C	465_A	0.889	0.28
44_F	311_T	0.884	0.28
120_E	162_T	0.878	0.28
504_A	513_I	0.875	0.27
106_M	204_D	0.872	0.27
326_D	329_V	0.872	0.27
192_I	449_V	0.871	0.27
150_L	457_R	0.866	0.27
252_T	543_Y	0.865	0.27
221_L	299_S	0.863	0.27
266_I	290_L	0.862	0.27
144_Q	463_P	0.857	0.27
379_Q	470_P	0.853	0.26
66_A	117_A	0.852	0.26
106_M	474_F	0.851	0.26
190_F	194_V	0.849	0.26
536_I	547_A	0.847	0.26
69_L	165_A	0.847	0.26
88_G	113_M	0.846	0.26
370_V	470_P	0.846	0.26
498_S	507_L	0.845	0.26
559_Y	565_R	0.844	0.26
374_I	409_Y	0.842	0.26
232_I	248_I	0.839	0.26
42_M	67_L	0.838	0.26
242_A	497_A	0.836	0.26
425_S	430_K	0.833	0.26
77_L	82_I	0.832	0.26
400_V	403_K	0.831	0.26
392_A	400_V	0.830	0.25
378_W	443_G	0.829	0.25
93_R	512_R	0.827	0.25
512_R	515_P	0.827	0.25
146_M	157_L	0.825	0.25
350_I	383_K	0.825	0.25
357_I	457_R	0.823	0.25
380_V	478_M	0.819	0.25
141_I	168_S	0.819	0.25
527_M	531_S	0.817	0.25
221_L	305_I	0.816	0.25
150_L	456_A	0.812	0.25
498_S	503_V	0.811	0.25
110_D	182_R	0.811	0.25
227_T	322_C	0.811	0.25
343_A	543_Y	0.808	0.25
207_P	210_E	0.808	0.25
417_H	569_F	0.803	0.24
422_E	512_R	0.802	0.24
169_K	468_P	0.801	0.24
178_W	182_R	0.800	0.24
457_R	477_Q	0.799	0.24
305_I	383_K	0.798	0.24
108_G	113_M	0.798	0.24
299_S	360_T	0.797	0.24
317_D	322_C	0.795	0.24
346_A	553_S	0.792	0.24
340_I	349_D	0.792	0.24
151_S	449_V	0.791	0.24
53_G	243_D	0.789	0.24
144_Q	473_V	0.788	0.24
67_L	342_A	0.784	0.24
79_Y	403_K	0.781	0.23
447_E	459_Q	0.780	0.23
76_L	89_V	0.779	0.23
321_V	469_T	0.779	0.23
502_G	532_A	0.778	0.23
505_E	508_G	0.776	0.23
196_F	560_V	0.776	0.23
70_V	115_I	0.773	0.23
292_S	533_L	0.772	0.23
187_A	492_T	0.769	0.23
204_D	207_P	0.768	0.23
141_I	478_M	0.768	0.23
501_R	504_A	0.767	0.23
188_E	509_L	0.767	0.23
49_T	291_A	0.766	0.23
93_R	514_S	0.764	0.23
106_M	274_Y	0.763	0.23
195_G	483_G	0.763	0.23
168_S	227_T	0.763	0.23
379_Q	483_G	0.762	0.23
386_K	557_V	0.762	0.23
19_K	484_K	0.762	0.23
532_A	548_D	0.761	0.23
270_V	523_S	0.760	0.23
390_A	393_G	0.758	0.23
4_S	7_E	0.757	0.23
274_Y	359_M	0.757	0.23
431_L	451_K	0.756	0.22
494_M	515_P	0.756	0.22
324_H	331_E	0.755	0.22
423_V	491_I	0.754	0.22
288_M	291_A	0.754	0.22
227_T	299_S	0.753	0.22
113_M	342_A	0.753	0.22
315_H	349_D	0.752	0.22
273_T	333_V	0.752	0.22
289_K	293_Y	0.749	0.22
273_T	297_L	0.749	0.22
154_V	374_I	0.748	0.22
321_V	468_P	0.745	0.22
346_A	527_M	0.745	0.22
97_V	131_A	0.745	0.22
173_C	270_V	0.743	0.22
422_E	458_A	0.741	0.22
535_K	559_Y	0.741	0.22
240_D	521_K	0.740	0.22
162_T	165_A	0.739	0.22
123_S	324_H	0.736	0.22
59_R	104_D	0.735	0.22
299_S	527_M	0.734	0.22
394_E	400_V	0.733	0.22
62_G	177_A	0.730	0.21
330_P	548_D	0.730	0.21
70_V	208_L	0.729	0.21
52_D	58_G	0.729	0.21
450_L	525_L	0.728	0.21
20_I	31_V	0.727	0.21
188_E	483_G	0.722	0.21
504_A	507_L	0.721	0.21
261_N	264_D	0.721	0.21
240_D	533_L	0.720	0.21
3_M	475_M	0.718	0.21
252_T	538_I	0.717	0.21
30_E	394_E	0.717	0.21
85_A	428_K	0.716	0.21
140_F	196_F	0.716	0.21
463_P	478_M	0.716	0.21
329_V	333_V	0.715	0.21
203_S	243_D	0.714	0.21
312_M	342_A	0.710	0.21
390_A	395_N	0.709	0.21
456_A	481_S	0.707	0.21
16_T	33_K	0.706	0.21
247_A	417_H	0.705	0.21
305_I	456_A	0.704	0.21
85_A	97_V	0.703	0.21
105_I	192_I	0.703	0.21
259_L	290_L	0.702	0.20
287_I	290_L	0.702	0.20
174_T	366_A	0.701	0.20
46_G	321_V	0.700	0.20
113_M	541_K	0.699	0.20
384_M	554_C	0.696	0.20
76_L	428_K	0.696	0.20
495_S	516_V	0.696	0.20
59_R	202_A	0.695	0.20
375_I	450_L	0.694	0.20
28_W	82_I	0.693	0.20
167_G	366_A	0.692	0.20
349_D	383_K	0.692	0.20
229_P	235_C	0.692	0.20
374_I	378_W	0.691	0.20
266_I	494_M	0.688	0.20
28_W	397_N	0.687	0.20
415_I	518_N	0.686	0.20
248_I	287_I	0.685	0.20
274_Y	417_H	0.684	0.20
185_E	484_K	0.684	0.20
340_I	467_I	0.684	0.20
498_S	506_S	0.684	0.20
150_L	192_I	0.684	0.20
106_M	382_D	0.682	0.20
26_D	382_D	0.682	0.20
239_V	379_Q	0.682	0.20
73_N	343_A	0.680	0.20
264_D	497_A	0.678	0.20
110_D	541_K	0.678	0.20
124_G	436_L	0.677	0.20
240_D	520_R	0.677	0.20
459_Q	474_F	0.677	0.20
16_T	19_K	0.676	0.20
320_M	333_V	0.675	0.20
212_V	244_I	0.675	0.20
40_E	109_V	0.674	0.19
371_G	465_A	0.674	0.19
373_V	377_T	0.674	0.19
445_K	483_G	0.673	0.19
294_A	533_L	0.672	0.19
310_N	317_D	0.672	0.19
312_M	345_I	0.671	0.19
25_T	562_L	0.671	0.19
356_A	534_P	0.670	0.19
46_G	253_I	0.670	0.19
33_K	496_Q	0.669	0.19
65_G	91_D	0.668	0.19
167_G	478_M	0.667	0.19
148_V	407_A	0.666	0.19
90_K	114_V	0.666	0.19
195_G	445_K	0.663	0.19
265_A	452_G	0.661	0.19
189_E	487_R	0.661	0.19
87_V	403_K	0.660	0.19
522_L	533_L	0.659	0.19
87_V	426_V	0.658	0.19
202_A	208_L	0.657	0.19
117_A	511_K	0.657	0.19
501_R	506_S	0.657	0.19
58_G	106_M	0.656	0.19
144_Q	477_Q	0.655	0.19
74_V	124_G	0.654	0.19
40_E	88_G	0.653	0.19
31_V	89_V	0.652	0.19
516_V	519_I	0.652	0.19
292_S	536_I	0.650	0.19
52_D	202_A	0.648	0.19
463_P	476_R	0.648	0.19
449_V	457_R	0.647	0.19
260_E	388_R	0.646	0.19
302_T	337_H	0.645	0.18
62_G	66_A	0.644	0.18
535_K	548_D	0.643	0.18
144_Q	478_M	0.643	0.18
12_F	402_A	0.643	0.18
118_G	177_A	0.642	0.18
36_T	125_E	0.641	0.18
462_D	470_P	0.640	0.18
431_L	514_S	0.639	0.18
431_L	506_S	0.638	0.18
379_Q	441_F	0.637	0.18
134_V	423_V	0.636	0.18
136_T	480_A	0.636	0.18
7_E	307_Y	0.636	0.18
319_M	324_H	0.635	0.18
145_Q	365_Q	0.634	0.18
49_T	165_A	0.634	0.18
175_S	319_M	0.633	0.18
56_Q	467_I	0.633	0.18
196_F	289_K	0.633	0.18
38_Y	243_D	0.632	0.18
237_E	267_G	0.631	0.18
227_T	459_Q	0.631	0.18
131_A	428_K	0.631	0.18
133_G	138_I	0.630	0.18
525_L	531_S	0.630	0.18
327_A	384_M	0.630	0.18
459_Q	473_V	0.630	0.18
140_F	195_G	0.628	0.18
273_T	287_I	0.628	0.18
66_A	182_R	0.628	0.18
35_F	85_A	0.627	0.18
449_V	532_A	0.627	0.18
431_L	477_Q	0.626	0.18
80_T	131_A	0.625	0.18
88_G	201_N	0.625	0.18
173_C	203_S	0.624	0.18
151_S	234_T	0.623	0.18
127_K	166_T	0.623	0.18
115_I	393_G	0.622	0.18
406_I	428_K	0.619	0.18
377_T	409_Y	0.619	0.18
168_S	366_A	0.617	0.18
263_L	266_I	0.617	0.18
240_D	540_P	0.617	0.18
100_S	113_M	0.616	0.18
362_S	373_V	0.616	0.18
134_V	154_V	0.616	0.18
247_A	256_A	0.615	0.17
496_Q	517_K	0.615	0.17
67_L	258_F	0.614	0.17
49_T	88_G	0.613	0.17
370_V	384_M	0.613	0.17
377_T	439_P	0.613	0.17
328_K	360_T	0.613	0.17
63_K	515_P	0.612	0.17
312_M	471_E	0.612	0.17
108_G	229_P	0.611	0.17
170_A	340_I	0.610	0.17
422_E	491_I	0.610	0.17
145_Q	462_D	0.609	0.17
379_Q	568_L	0.608	0.17
167_G	380_V	0.608	0.17
63_K	207_P	0.607	0.17
53_G	203_S	0.607	0.17
23_G	559_Y	0.606	0.17
95_V	113_M	0.606	0.17
261_N	356_A	0.606	0.17
95_V	428_K	0.605	0.17
309_V	465_A	0.604	0.17
203_S	234_T	0.604	0.17
2_K	76_L	0.604	0.17
126_G	439_P	0.604	0.17
186_A	485_A	0.602	0.17
234_T	237_E	0.602	0.17
213_E	458_A	0.601	0.17
158_L	197_L	0.600	0.17
148_V	239_V	0.599	0.17
133_G	409_Y	0.598	0.17
55_G	274_Y	0.598	0.17
87_V	124_G	0.597	0.17
333_V	396_G	0.597	0.17
266_I	271_I	0.597	0.17
481_S	490_S	0.596	0.17
31_V	126_G	0.596	0.17
350_I	387_Q	0.595	0.17
44_F	349_D	0.595	0.17
42_M	519_I	0.595	0.17
235_C	246_V	0.593	0.17
157_L	320_M	0.592	0.17
360_T	471_E	0.591	0.17
28_W	421_H	0.591	0.17
379_Q	565_R	0.590	0.17
189_E	402_A	0.590	0.17
192_I	431_L	0.589	0.17
12_F	536_I	0.588	0.17
557_V	563_G	0.588	0.17
43_I	72_T	0.588	0.17
270_V	522_L	0.587	0.17
188_E	356_A	0.587	0.17
82_I	233_K	0.587	0.17
243_D	496_Q	0.586	0.17
33_K	80_T	0.586	0.17
359_M	560_V	0.585	0.17
158_L	195_G	0.585	0.17
67_L	327_A	0.584	0.17
67_L	541_K	0.584	0.17
71_I	129_L	0.584	0.17
258_F	555_Q	0.584	0.17
288_M	397_N	0.583	0.16
320_M	331_E	0.581	0.16
371_G	464_N	0.578	0.16
403_K	528_K	0.577	0.16
232_I	271_I	0.577	0.16
122_I	165_A	0.577	0.16
416_T	500_E	0.576	0.16
535_K	557_V	0.576	0.16
311_T	349_D	0.575	0.16
38_Y	99_K	0.575	0.16
138_I	168_S	0.575	0.16
299_S	337_H	0.574	0.16
53_G	343_A	0.574	0.16
293_Y	533_L	0.574	0.16
168_S	364_S	0.574	0.16
194_V	564_Q	0.573	0.16
219_L	343_A	0.573	0.16
185_E	507_L	0.573	0.16
311_T	340_I	0.573	0.16
456_A	489_T	0.572	0.16
308_T	379_Q	0.572	0.16
171_T	366_A	0.572	0.16
26_D	385_K	0.572	0.16
243_D	518_N	0.571	0.16
180_M	211_Q	0.571	0.16
170_A	373_V	0.570	0.16
217_I	569_F	0.569	0.16
345_I	479_Y	0.569	0.16
454_M	480_A	0.569	0.16
315_H	377_T	0.568	0.16
20_I	74_V	0.568	0.16
188_E	357_I	0.567	0.16
167_G	468_P	0.567	0.16
288_M	292_S	0.566	0.16
412_N	527_M	0.566	0.16
194_V	479_Y	0.566	0.16
400_V	475_M	0.566	0.16
64_D	510_E	0.566	0.16
24_D	379_Q	0.565	0.16
535_K	547_A	0.565	0.16
546_F	550_E	0.565	0.16
99_K	109_V	0.564	0.16
55_G	106_M	0.564	0.16
385_K	398_D	0.563	0.16
235_C	250_T	0.563	0.16
267_G	296_I	0.562	0.16
177_A	181_A	0.562	0.16
158_L	449_V	0.562	0.16
4_S	261_N	0.561	0.16
276_I	370_V	0.561	0.16
415_I	523_S	0.560	0.16
289_K	537_E	0.559	0.16
263_L	474_F	0.559	0.16
308_T	425_S	0.558	0.16
100_S	115_I	0.558	0.16
16_T	30_E	0.557	0.16
415_I	531_S	0.557	0.16
274_Y	361_S	0.556	0.16
46_G	338_S	0.555	0.16
297_L	416_T	0.555	0.16
150_L	227_T	0.554	0.16
122_I	448_L	0.553	0.16
202_A	207_P	0.553	0.16
293_Y	359_M	0.553	0.16
378_W	402_A	0.552	0.16
170_A	467_I	0.552	0.16
198_G	219_L	0.552	0.16
209_I	480_A	0.550	0.15
66_A	312_M	0.550	0.15
498_S	501_R	0.549	0.15
62_G	118_G	0.549	0.15
19_K	390_A	0.549	0.15
107_D	474_F	0.548	0.15
166_T	235_C	0.548	0.15
108_G	268_D	0.548	0.15
485_A	488_S	0.547	0.15
36_T	82_I	0.547	0.15
9_A	237_E	0.547	0.15
552_L	568_L	0.546	0.15
146_M	471_E	0.545	0.15
250_T	450_L	0.545	0.15
154_V	452_G	0.544	0.15
146_M	527_M	0.544	0.15
109_V	184_L	0.543	0.15
93_R	421_H	0.542	0.15
55_G	99_K	0.542	0.15
74_V	552_L	0.541	0.15
492_T	507_L	0.541	0.15
327_A	507_L	0.541	0.15
87_V	97_V	0.540	0.15
171_T	380_V	0.540	0.15
35_F	38_Y	0.539	0.15
67_L	108_G	0.539	0.15
67_L	428_K	0.539	0.15
227_T	460_M	0.538	0.15
146_M	150_L	0.538	0.15
234_T	238_V	0.537	0.15
35_F	76_L	0.536	0.15
7_E	471_E	0.536	0.15
12_F	38_Y	0.536	0.15
390_A	397_N	0.536	0.15
247_A	470_P	0.536	0.15
197_L	288_M	0.535	0.15
148_V	259_L	0.535	0.15
146_M	189_E	0.535	0.15
260_E	319_M	0.534	0.15
79_Y	127_K	0.534	0.15
9_A	240_D	0.533	0.15
315_H	467_I	0.533	0.15
479_Y	567_F	0.532	0.15
37_V	107_D	0.532	0.15
170_A	377_T	0.531	0.15
458_A	478_M	0.531	0.15
382_D	563_G	0.531	0.15
292_S	337_H	0.530	0.15
205_K	241_E	0.530	0.15
366_A	380_V	0.529	0.15
173_C	221_L	0.528	0.15
488_S	500_E	0.528	0.15
80_T	427_E	0.527	0.15
463_P	473_V	0.527	0.15
250_T	274_Y	0.527	0.15
201_N	305_I	0.526	0.15
266_I	291_A	0.526	0.15
116_G	131_A	0.526	0.15
188_E	507_L	0.526	0.15
422_E	517_K	0.526	0.15
170_A	378_W	0.526	0.15
144_Q	365_Q	0.525	0.15
443_G	562_L	0.525	0.15
44_F	56_Q	0.524	0.15
316_L	324_H	0.524	0.15
539_D	544_Q	0.523	0.15
118_G	210_E	0.523	0.15
91_D	227_T	0.523	0.15
90_K	546_F	0.523	0.15
536_I	542_T	0.522	0.15
375_I	523_S	0.522	0.15
161_G	199_K	0.522	0.15
142_C	168_S	0.522	0.15
334_A	543_Y	0.521	0.15
44_F	340_I	0.521	0.15
65_G	90_K	0.521	0.15
487_R	510_E	0.521	0.15
463_P	474_F	0.521	0.15
305_I	350_I	0.520	0.15
184_L	507_L	0.520	0.15
23_G	560_V	0.519	0.15
234_T	307_Y	0.519	0.15
157_L	479_Y	0.518	0.15
136_T	417_H	0.518	0.15
148_V	490_S	0.517	0.15
258_F	263_L	0.517	0.15
185_E	386_K	0.517	0.15
38_Y	53_G	0.516	0.15
313_D	459_Q	0.516	0.15
261_N	507_L	0.516	0.15
64_D	392_A	0.516	0.15
378_W	406_I	0.515	0.15
243_D	343_A	0.515	0.15
219_L	361_S	0.515	0.15
19_K	396_G	0.515	0.15
211_Q	564_Q	0.514	0.14
138_I	227_T	0.514	0.14
290_L	459_Q	0.514	0.14
46_G	335_F	0.513	0.14
95_V	342_A	0.512	0.14
212_V	287_I	0.512	0.14
293_Y	535_K	0.512	0.14
219_L	543_Y	0.512	0.14
100_S	377_T	0.512	0.14
397_N	483_G	0.511	0.14
148_V	356_A	0.511	0.14
502_G	540_P	0.511	0.14
360_T	554_C	0.511	0.14
195_G	419_L	0.511	0.14
500_E	505_E	0.511	0.14
253_I	325_L	0.510	0.14
188_E	484_K	0.510	0.14
12_F	276_I	0.510	0.14
491_I	512_R	0.510	0.14
57_N	519_I	0.509	0.14
436_L	518_N	0.509	0.14
177_A	506_S	0.509	0.14
253_I	302_T	0.508	0.14
180_M	503_V	0.508	0.14
52_D	243_D	0.508	0.14
145_Q	154_V	0.508	0.14
84_K	545_V	0.508	0.14
192_I	491_I	0.508	0.14
250_T	345_I	0.507	0.14
290_L	293_Y	0.507	0.14
165_A	563_G	0.507	0.14
190_F	196_F	0.506	0.14
136_T	221_L	0.506	0.14
351_L	356_A	0.506	0.14
186_A	192_I	0.505	0.14
90_K	110_D	0.505	0.14
274_Y	540_P	0.505	0.14
79_Y	569_F	0.505	0.14
365_Q	460_M	0.504	0.14
36_T	99_K	0.504	0.14
42_M	274_Y	0.504	0.14
313_D	331_E	0.503	0.14
221_L	360_T	0.503	0.14
67_L	350_I	0.503	0.14
148_V	166_T	0.502	0.14
74_V	373_V	0.502	0.14
375_I	562_L	0.502	0.14
120_E	161_G	0.502	0.14
168_S	479_Y	0.501	0.14
19_K	420_S	0.501	0.14
170_A	349_D	0.501	0.14
12_F	551_E	0.501	0.14
555_Q	559_Y	0.501	0.14
221_L	342_A	0.500	0.14
311_T	467_I	0.500	0.14
247_A	456_A	0.500	0.14
12_F	456_A	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4ep8C	3	0.993	100	0.441	Contact Map
4gy7A	3	0.9982	100	0.445	Contact Map
4ac7C	3	1	100	0.472	Contact Map
1e9yB	4	0.9965	100	0.483	Contact Map
3sfwA	3	0.6573	100	0.901	Contact Map
1gkpA	4	0.6555	100	0.903	Contact Map
4lcqA	3	0.6872	100	0.903	Contact Map
4c65A	6	0.6327	100	0.903	Contact Map
1xrtA	1	0.5677	100	0.903	Contact Map
3be7A	5	0.5835	100	0.903	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0145 seconds.