GLUP - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

GLUP - Rhomboid protease GluP

UniProt:	P54493	Sequences: MFLLEYTYWKIAAHLVNSGYGVIQAGESDEIWLEAPDKSSHDLVRLYKHDLDFRQEMVRDIEEQAERVERVRHQLGRRRMKLLNVFFSTEAPVDDWEEIAKKTFEKGTVSVEPAIVRGTMLRDDLQAVFPSFRTEDCSEEHASFENAQMARERFLSLVLKQEEQRKTEAAVFQNGKPTFTYLFIALQILMFFLLEINGGSTNTETLVAFGAKENSLIAQGEWWRLLTPIVLHIGIAHLAFNTLALWSVGTAVERMYGSGRFLLIYLAAGITGSIASFVFSPYPSAGASGAIFGCLGALLYVALSNRKMFLRTIGTNIIVIIIINLGFGFAVSNIDNSGHIGGLIGGFFAAAALGLPKAGAFGKRLLSAVLLIALAVGFLYYGLHSPSHQESALIQQASELYQEGKYEEVTELLNGEAAQKDASADLLKILAVSDIQIGEYDQAVSLLERAVKKEPKDHASYYNLALLYAEKNELAQAEKAIQTAVKLKPKEQRYKELQRQIENNKES	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	507 (491)
Sequences:	120 (103)
Seq/√Len:	4.7

BACSU - GLUP

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
431_A	447_L	4.359	0.92
318_I	322_I	4.188	0.90
461_Y	480_A	4.132	0.90
184_I	242_T	3.705	0.83
183_F	229_I	3.594	0.81
5_E	48_K	3.454	0.79
12_A	31_I	3.441	0.78
187_Q	338_G	3.370	0.77
228_P	338_G	3.241	0.74
187_Q	294_C	3.124	0.71
280_S	435_I	3.109	0.70
270_I	274_I	3.008	0.68
328_G	336_N	2.914	0.65
242_T	294_C	2.902	0.65
233_I	285_A	2.867	0.64
229_I	266_L	2.797	0.62
428_K	460_S	2.757	0.61
428_K	463_N	2.691	0.59
183_F	338_G	2.687	0.58
294_C	417_A	2.666	0.58
432_V	447_L	2.666	0.58
199_G	202_N	2.659	0.58
192_F	450_A	2.621	0.56
277_F	382_G	2.494	0.52
448_E	481_I	2.404	0.50
187_Q	242_T	2.377	0.49
319_V	323_I	2.366	0.48
292_F	328_G	2.347	0.48
216_L	350_A	2.332	0.47
458_H	494_Y	2.286	0.46
187_Q	228_P	2.275	0.46
270_I	338_G	2.254	0.45
187_Q	337_S	2.197	0.43
183_F	283_P	2.186	0.43
401_Y	494_Y	2.172	0.42
175_G	244_A	2.169	0.42
248_V	332_S	2.147	0.42
270_I	340_I	2.125	0.41
87_F	344_I	2.097	0.40
246_W	321_I	2.087	0.40
244_A	327_F	2.075	0.39
239_A	378_F	2.070	0.39
183_F	266_L	2.063	0.39
265_Y	293_G	2.063	0.39
228_P	294_C	2.062	0.39
413_L	430_L	2.007	0.37
405_K	408_E	1.995	0.37
321_I	338_G	1.994	0.37
226_L	230_V	1.974	0.37
87_F	246_W	1.967	0.36
364_R	367_S	1.942	0.36
183_F	230_V	1.938	0.35
229_I	338_G	1.935	0.35
88_S	420_K	1.925	0.35
274_I	378_F	1.899	0.34
154_F	268_A	1.898	0.34
225_L	273_S	1.882	0.34
430_L	446_L	1.873	0.34
244_A	332_S	1.870	0.34
230_V	338_G	1.839	0.33
228_P	242_T	1.828	0.32
434_D	446_L	1.824	0.32
187_Q	229_I	1.816	0.32
166_K	227_T	1.813	0.32
242_T	325_L	1.802	0.32
246_W	270_I	1.793	0.31
462_Y	471_K	1.784	0.31
62_E	102_K	1.769	0.31
404_G	451_V	1.762	0.31
172_F	175_G	1.753	0.30
280_S	283_P	1.751	0.30
461_Y	481_I	1.741	0.30
259_G	378_F	1.734	0.30
6_Y	191_F	1.730	0.30
407_E	437_I	1.729	0.30
194_L	231_L	1.728	0.30
175_G	195_E	1.693	0.29
230_V	266_L	1.664	0.28
52_D	94_D	1.651	0.28
228_P	337_S	1.629	0.27
294_C	430_L	1.621	0.27
11_I	22_V	1.618	0.27
76_G	186_L	1.608	0.27
51_L	59_R	1.585	0.26
242_T	311_R	1.581	0.26
480_A	483_T	1.578	0.26
300_Y	321_I	1.575	0.26
195_E	244_A	1.568	0.26
179_F	183_F	1.564	0.26
50_D	458_H	1.561	0.26
294_C	446_L	1.551	0.25
181_Y	306_R	1.547	0.25
242_T	430_L	1.545	0.25
280_S	425_D	1.528	0.25
462_Y	484_A	1.522	0.25
268_A	478_E	1.509	0.24
431_A	435_I	1.508	0.24
325_L	430_L	1.492	0.24
310_L	349_A	1.491	0.24
372_I	376_V	1.480	0.24
202_N	243_L	1.469	0.23
344_I	402_Q	1.467	0.23
6_Y	188_I	1.464	0.23
231_L	273_S	1.462	0.23
248_V	295_L	1.458	0.23
228_P	325_L	1.458	0.23
183_F	270_I	1.456	0.23
270_I	317_I	1.448	0.23
431_A	436_Q	1.447	0.23
239_A	274_I	1.431	0.23
20_Y	334_I	1.426	0.22
265_Y	291_I	1.424	0.22
245_L	291_I	1.422	0.22
256_Y	355_L	1.412	0.22
61_I	279_F	1.394	0.22
261_F	328_G	1.390	0.22
410_T	434_D	1.390	0.22
183_F	228_P	1.387	0.22
317_I	328_G	1.386	0.22
307_K	329_F	1.380	0.21
20_Y	228_P	1.374	0.21
187_Q	333_N	1.374	0.21
240_F	313_I	1.363	0.21
488_K	491_E	1.354	0.21
292_F	336_N	1.354	0.21
159_L	481_I	1.351	0.21
246_W	282_Y	1.350	0.21
243_L	321_I	1.348	0.21
430_L	434_D	1.345	0.21
316_N	390_E	1.341	0.21
166_K	317_I	1.335	0.21
294_C	338_G	1.323	0.20
133_R	202_N	1.313	0.20
460_S	463_N	1.306	0.20
13_A	255_M	1.304	0.20
184_I	188_I	1.290	0.20
25_A	306_R	1.288	0.20
311_R	466_L	1.288	0.20
67_R	71_V	1.287	0.20
53_F	295_L	1.280	0.19
50_D	410_T	1.278	0.19
12_A	327_F	1.277	0.19
54_R	167_T	1.275	0.19
225_L	379_L	1.273	0.19
34_E	94_D	1.271	0.19
366_L	490_K	1.271	0.19
325_L	333_N	1.271	0.19
23_I	266_L	1.270	0.19
166_K	171_V	1.266	0.19
197_N	226_L	1.263	0.19
242_T	413_L	1.263	0.19
255_M	396_Q	1.251	0.19
304_S	354_G	1.245	0.19
8_Y	44_V	1.245	0.19
468_Y	480_A	1.241	0.19
325_L	446_L	1.241	0.19
32_W	86_F	1.239	0.19
401_Y	413_L	1.238	0.19
230_V	242_T	1.236	0.19
46_L	150_A	1.236	0.19
30_E	180_T	1.235	0.19
148_Q	256_Y	1.230	0.18
22_V	44_V	1.230	0.18
8_Y	284_S	1.225	0.18
27_E	149_M	1.221	0.18
409_V	427_L	1.214	0.18
313_I	460_S	1.213	0.18
84_N	300_Y	1.209	0.18
278_V	338_G	1.205	0.18
259_G	320_I	1.202	0.18
289_G	293_G	1.197	0.18
325_L	413_L	1.190	0.18
46_L	97_E	1.181	0.18
264_I	334_I	1.180	0.18
245_L	345_G	1.180	0.18
461_Y	468_Y	1.179	0.18
72_R	216_L	1.176	0.17
405_K	465_A	1.174	0.17
307_K	377_G	1.170	0.17
64_Q	72_R	1.168	0.17
45_R	60_D	1.168	0.17
233_I	244_A	1.166	0.17
354_G	358_A	1.164	0.17
461_Y	473_E	1.159	0.17
190_M	294_C	1.155	0.17
156_S	186_L	1.147	0.17
22_V	71_V	1.138	0.17
125_L	256_Y	1.135	0.17
294_C	319_V	1.129	0.17
483_T	492_Q	1.129	0.17
15_L	411_E	1.127	0.17
261_F	353_L	1.126	0.17
318_I	470_E	1.123	0.17
405_K	481_I	1.118	0.16
53_F	64_Q	1.117	0.16
354_G	364_R	1.112	0.16
175_G	285_A	1.111	0.16
77_R	85_V	1.110	0.16
265_Y	285_A	1.107	0.16
212_K	223_W	1.107	0.16
212_K	335_D	1.107	0.16
223_W	335_D	1.107	0.16
88_S	97_E	1.105	0.16
258_S	350_A	1.103	0.16
124_D	127_A	1.102	0.16
169_A	273_S	1.102	0.16
64_Q	109_V	1.098	0.16
43_L	360_A	1.097	0.16
462_Y	467_L	1.094	0.16
284_S	294_C	1.092	0.16
229_I	337_S	1.089	0.16
340_I	369_V	1.087	0.16
350_A	358_A	1.086	0.16
46_L	123_D	1.085	0.16
302_A	428_K	1.083	0.16
214_N	231_L	1.083	0.16
30_E	205_T	1.081	0.16
85_V	398_S	1.079	0.16
216_L	300_Y	1.079	0.16
244_A	248_V	1.073	0.16
115_I	333_N	1.070	0.16
190_M	194_L	1.068	0.16
316_N	381_Y	1.068	0.16
186_L	194_L	1.067	0.16
116_V	369_V	1.067	0.16
283_P	493_R	1.064	0.16
350_A	355_L	1.058	0.15
481_I	485_V	1.058	0.15
211_A	233_I	1.051	0.15
216_L	228_P	1.049	0.15
89_T	334_I	1.042	0.15
215_S	236_A	1.041	0.15
212_K	324_N	1.039	0.15
324_N	335_D	1.039	0.15
223_W	324_N	1.039	0.15
114_A	430_L	1.029	0.15
207_V	332_S	1.019	0.15
71_V	488_K	1.018	0.15
12_A	235_I	1.017	0.15
291_I	455_P	1.015	0.15
428_K	457_D	1.015	0.15
270_I	306_R	1.014	0.15
46_L	139_E	1.012	0.15
327_F	364_R	1.010	0.15
266_L	338_G	1.010	0.15
85_V	325_L	1.006	0.15
242_T	446_L	1.005	0.15
280_S	390_E	1.005	0.15
226_L	270_I	1.004	0.15
344_I	482_Q	1.003	0.15
287_A	293_G	1.003	0.15
227_T	278_V	0.999	0.15
202_N	444_V	0.996	0.14
466_L	477_A	0.996	0.14
266_L	270_I	0.992	0.14
117_R	255_M	0.990	0.14
268_A	465_A	0.989	0.14
414_N	451_V	0.989	0.14
64_Q	226_L	0.984	0.14
157_L	337_S	0.983	0.14
354_G	393_L	0.982	0.14
188_I	192_F	0.981	0.14
157_L	408_E	0.977	0.14
295_L	428_K	0.976	0.14
119_T	481_I	0.974	0.14
225_L	228_P	0.967	0.14
46_L	178_T	0.966	0.14
175_G	233_I	0.965	0.14
188_I	321_I	0.964	0.14
265_Y	289_G	0.963	0.14
291_I	348_F	0.958	0.14
186_L	229_I	0.957	0.14
319_V	417_A	0.954	0.14
166_K	225_L	0.949	0.14
359_G	435_I	0.944	0.14
187_Q	319_V	0.944	0.14
405_K	492_Q	0.943	0.14
462_Y	465_A	0.941	0.14
284_S	321_I	0.940	0.14
473_E	480_A	0.940	0.14
77_R	187_Q	0.938	0.14
195_E	205_T	0.937	0.14
247_S	302_A	0.936	0.14
315_T	321_I	0.925	0.13
175_G	258_S	0.918	0.13
46_L	403_E	0.917	0.13
88_S	262_L	0.914	0.13
204_E	396_Q	0.911	0.13
207_V	364_R	0.910	0.13
16_V	22_V	0.904	0.13
92_P	356_P	0.902	0.13
83_L	338_G	0.902	0.13
67_R	184_I	0.902	0.13
321_I	336_N	0.901	0.13
18_S	219_Q	0.900	0.13
474_L	482_Q	0.898	0.13
244_A	447_L	0.896	0.13
216_L	325_L	0.896	0.13
37_D	408_E	0.896	0.13
294_C	325_L	0.894	0.13
31_I	181_Y	0.893	0.13
43_L	57_M	0.892	0.13
201_T	263_L	0.891	0.13
186_L	357_K	0.891	0.13
362_G	373_A	0.887	0.13
236_A	404_G	0.886	0.13
207_V	215_S	0.882	0.13
340_I	345_G	0.880	0.13
209_F	252_V	0.878	0.13
228_P	306_R	0.877	0.13
10_K	374_L	0.876	0.13
182_L	475_A	0.875	0.13
8_Y	163_E	0.874	0.13
20_Y	30_E	0.869	0.13
45_R	205_T	0.869	0.13
215_S	295_L	0.866	0.13
102_K	318_I	0.860	0.12
60_D	86_F	0.859	0.12
212_K	314_G	0.857	0.12
223_W	314_G	0.857	0.12
314_G	335_D	0.857	0.12
84_N	491_E	0.857	0.12
191_F	343_L	0.856	0.12
54_R	326_G	0.856	0.12
285_A	293_G	0.855	0.12
277_F	298_L	0.854	0.12
247_S	295_L	0.854	0.12
30_E	226_L	0.852	0.12
44_V	313_I	0.851	0.12
244_A	285_A	0.851	0.12
132_F	404_G	0.849	0.12
209_F	353_L	0.849	0.12
139_E	150_A	0.849	0.12
381_Y	483_T	0.846	0.12
94_D	307_K	0.846	0.12
45_R	177_P	0.845	0.12
52_D	93_V	0.845	0.12
309_F	443_A	0.844	0.12
43_L	95_D	0.844	0.12
311_R	333_N	0.844	0.12
201_T	308_M	0.843	0.12
396_Q	427_L	0.843	0.12
188_I	360_A	0.839	0.12
291_I	345_G	0.837	0.12
77_R	228_P	0.837	0.12
294_C	413_L	0.837	0.12
279_F	457_D	0.834	0.12
202_N	348_F	0.833	0.12
400_L	467_L	0.832	0.12
302_A	309_F	0.831	0.12
306_R	396_Q	0.830	0.12
325_L	371_L	0.829	0.12
450_A	476_Q	0.828	0.12
368_A	429_I	0.827	0.12
30_E	45_R	0.822	0.12
143_S	449_R	0.821	0.12
242_T	333_N	0.820	0.12
215_S	332_S	0.817	0.12
44_V	62_E	0.815	0.12
195_E	349_A	0.813	0.12
90_E	476_Q	0.812	0.12
179_F	187_Q	0.811	0.12
183_F	281_P	0.809	0.12
428_K	459_A	0.809	0.12
268_A	293_G	0.806	0.12
79_R	369_V	0.805	0.12
49_H	267_A	0.804	0.12
397_A	413_L	0.804	0.12
157_L	338_G	0.803	0.12
30_E	281_P	0.803	0.12
120_M	123_D	0.802	0.12
164_Q	167_T	0.801	0.12
276_S	287_A	0.799	0.12
352_A	457_D	0.798	0.12
427_L	450_A	0.795	0.12
194_L	394_I	0.794	0.12
216_L	358_A	0.794	0.12
314_G	324_N	0.789	0.12
265_Y	287_A	0.788	0.12
205_T	466_L	0.788	0.12
327_F	336_N	0.788	0.12
116_V	317_I	0.784	0.11
350_A	476_Q	0.784	0.11
239_A	292_F	0.782	0.11
228_P	270_I	0.781	0.11
158_V	227_T	0.779	0.11
50_D	371_L	0.779	0.11
202_N	417_A	0.778	0.11
53_F	198_G	0.777	0.11
20_Y	226_L	0.774	0.11
326_G	331_V	0.773	0.11
87_F	476_Q	0.772	0.11
317_I	325_L	0.771	0.11
105_E	108_T	0.770	0.11
69_E	367_S	0.770	0.11
306_R	389_Q	0.770	0.11
53_F	460_S	0.768	0.11
173_Q	338_G	0.767	0.11
198_G	233_I	0.765	0.11
194_L	390_E	0.764	0.11
199_G	227_T	0.762	0.11
244_A	310_L	0.759	0.11
90_E	153_R	0.759	0.11
57_M	215_S	0.758	0.11
205_T	294_C	0.758	0.11
69_E	338_G	0.757	0.11
44_V	365_L	0.756	0.11
284_S	431_A	0.756	0.11
247_S	428_K	0.756	0.11
53_F	222_W	0.755	0.11
215_S	302_A	0.753	0.11
100_A	446_L	0.752	0.11
225_L	231_L	0.750	0.11
328_G	340_I	0.750	0.11
234_G	324_N	0.749	0.11
23_I	69_E	0.748	0.11
77_R	338_G	0.748	0.11
240_F	252_V	0.746	0.11
403_E	453_K	0.745	0.11
191_F	355_L	0.745	0.11
236_A	247_S	0.745	0.11
39_S	61_I	0.744	0.11
185_A	402_Q	0.744	0.11
324_N	463_N	0.743	0.11
6_Y	184_I	0.742	0.11
247_S	332_S	0.741	0.11
247_S	309_F	0.741	0.11
311_R	409_V	0.740	0.11
27_E	267_A	0.739	0.11
87_F	128_V	0.739	0.11
192_F	370_L	0.739	0.11
344_I	476_Q	0.738	0.11
273_S	285_A	0.738	0.11
176_K	404_G	0.735	0.11
233_I	265_Y	0.735	0.11
53_F	234_G	0.734	0.11
163_E	268_A	0.734	0.11
46_L	471_K	0.733	0.11
255_M	313_I	0.733	0.11
52_D	92_P	0.733	0.11
191_F	234_G	0.731	0.11
301_V	308_M	0.729	0.11
168_E	325_L	0.727	0.11
246_W	318_I	0.726	0.11
43_L	154_F	0.725	0.11
227_T	377_G	0.725	0.11
31_I	354_G	0.725	0.11
45_R	72_R	0.724	0.11
248_V	299_L	0.724	0.11
168_E	311_R	0.723	0.11
147_A	461_Y	0.721	0.11
46_L	179_F	0.721	0.11
133_R	373_A	0.717	0.11
225_L	383_L	0.716	0.11
179_F	377_G	0.714	0.11
252_V	289_G	0.714	0.11
225_L	300_Y	0.713	0.11
251_A	282_Y	0.713	0.11
289_G	328_G	0.713	0.11
488_K	495_K	0.713	0.11
77_R	83_L	0.713	0.11
130_P	134_T	0.710	0.11
61_I	366_L	0.709	0.11
16_V	313_I	0.705	0.11
236_A	240_F	0.704	0.11
185_A	366_L	0.704	0.11
77_R	325_L	0.704	0.11
275_A	327_F	0.703	0.10
213_E	468_Y	0.702	0.10
263_L	344_I	0.701	0.10
310_L	336_N	0.701	0.10
438_G	454_E	0.698	0.10
230_V	275_A	0.698	0.10
289_G	309_F	0.697	0.10
280_S	377_G	0.696	0.10
234_G	298_L	0.696	0.10
233_I	463_N	0.696	0.10
191_F	350_A	0.696	0.10
127_A	364_R	0.695	0.10
245_L	311_R	0.694	0.10
276_S	297_A	0.692	0.10
59_R	208_A	0.692	0.10
18_S	78_R	0.692	0.10
240_F	291_I	0.690	0.10
18_S	321_I	0.689	0.10
377_G	381_Y	0.689	0.10
265_Y	268_A	0.687	0.10
348_F	409_V	0.687	0.10
325_L	329_F	0.686	0.10
195_E	233_I	0.686	0.10
394_I	449_R	0.685	0.10
46_L	182_L	0.685	0.10
278_V	337_S	0.685	0.10
189_L	481_I	0.684	0.10
337_S	395_Q	0.682	0.10
170_A	390_E	0.682	0.10
340_I	344_I	0.682	0.10
195_E	309_F	0.681	0.10
267_A	371_L	0.681	0.10
465_A	477_A	0.680	0.10
219_Q	427_L	0.679	0.10
76_G	327_F	0.677	0.10
147_A	472_N	0.673	0.10
134_T	407_E	0.673	0.10
23_I	417_A	0.673	0.10
68_V	183_F	0.672	0.10
45_R	234_G	0.672	0.10
188_I	425_D	0.672	0.10
21_G	325_L	0.671	0.10
157_L	187_Q	0.670	0.10
54_R	406_Y	0.670	0.10
328_G	479_K	0.669	0.10
172_F	302_A	0.669	0.10
229_I	417_A	0.668	0.10
37_D	431_A	0.667	0.10
102_K	417_A	0.665	0.10
254_R	319_V	0.664	0.10
211_A	335_D	0.664	0.10
211_A	223_W	0.664	0.10
234_G	295_L	0.662	0.10
451_V	481_I	0.659	0.10
228_P	430_L	0.659	0.10
261_F	289_G	0.657	0.10
295_L	332_S	0.657	0.10
145_E	373_A	0.655	0.10
244_A	336_N	0.654	0.10
215_S	247_S	0.653	0.10
333_N	430_L	0.652	0.10
83_L	430_L	0.652	0.10
175_G	309_F	0.652	0.10
227_T	267_A	0.650	0.10
258_S	283_P	0.650	0.10
355_L	400_L	0.649	0.10
21_G	115_I	0.646	0.10
261_F	335_D	0.645	0.10
223_W	261_F	0.645	0.10
212_K	261_F	0.645	0.10
457_D	460_S	0.644	0.10
46_L	226_L	0.644	0.10
24_Q	329_F	0.643	0.10
163_E	340_I	0.642	0.10
128_V	189_L	0.642	0.10
223_W	234_G	0.641	0.10
234_G	335_D	0.641	0.10
212_K	234_G	0.641	0.10
261_F	329_F	0.641	0.10
131_S	238_L	0.639	0.10
135_E	492_Q	0.638	0.10
175_G	312_T	0.637	0.10
289_G	318_I	0.637	0.10
406_Y	462_Y	0.635	0.10
301_V	338_G	0.634	0.10
101_K	433_S	0.633	0.10
83_L	114_A	0.633	0.10
268_A	377_G	0.633	0.10
18_S	186_L	0.633	0.10
351_A	367_S	0.632	0.10
64_Q	266_L	0.631	0.10
129_F	468_Y	0.631	0.10
233_I	293_G	0.630	0.10
427_L	448_E	0.630	0.10
162_E	403_E	0.628	0.10
158_V	338_G	0.625	0.10
103_T	114_A	0.623	0.10
441_D	452_K	0.623	0.10
243_L	323_I	0.622	0.10
83_L	225_L	0.622	0.10
171_V	303_L	0.622	0.10
365_L	375_A	0.621	0.10
285_A	297_A	0.621	0.10
343_L	350_A	0.620	0.10
27_E	239_A	0.619	0.10
283_P	337_S	0.612	0.09
110_S	334_I	0.612	0.09
201_T	283_P	0.611	0.09
18_S	448_E	0.611	0.09
23_I	72_R	0.610	0.09
234_G	343_L	0.610	0.09
47_Y	354_G	0.609	0.09
170_A	396_Q	0.609	0.09
58_V	103_T	0.608	0.09
50_D	494_Y	0.608	0.09
21_G	51_L	0.607	0.09
248_V	321_I	0.606	0.09
411_E	465_A	0.606	0.09
211_A	295_L	0.605	0.09
187_Q	325_L	0.603	0.09
181_Y	184_I	0.603	0.09
132_F	184_I	0.603	0.09
431_A	465_A	0.602	0.09
410_T	430_L	0.601	0.09
157_L	488_K	0.601	0.09
230_V	270_I	0.600	0.09
412_L	419_Q	0.600	0.09
323_I	330_A	0.599	0.09
11_I	142_A	0.598	0.09
350_A	467_L	0.598	0.09
266_L	292_F	0.598	0.09
271_T	492_Q	0.597	0.09
244_A	293_G	0.597	0.09
168_E	216_L	0.597	0.09
328_G	468_Y	0.595	0.09
400_L	427_L	0.594	0.09
195_E	198_G	0.591	0.09
295_L	460_S	0.591	0.09
211_A	324_N	0.590	0.09
183_F	322_I	0.590	0.09
234_G	356_P	0.589	0.09
50_D	115_I	0.588	0.09
320_I	395_Q	0.587	0.09
357_K	400_L	0.586	0.09
65_A	371_L	0.584	0.09
338_G	395_Q	0.583	0.09
284_S	415_G	0.583	0.09
449_R	453_K	0.582	0.09
228_P	446_L	0.581	0.09
302_A	305_N	0.581	0.09
94_D	309_F	0.581	0.09
233_I	324_N	0.581	0.09
464_L	484_A	0.581	0.09
187_Q	230_V	0.580	0.09
294_C	348_F	0.579	0.09
439_E	454_E	0.579	0.09
238_L	292_F	0.579	0.09
200_S	234_G	0.579	0.09
228_P	333_N	0.579	0.09
258_S	337_S	0.578	0.09
212_K	299_L	0.578	0.09
223_W	299_L	0.578	0.09
299_L	335_D	0.578	0.09
415_G	472_N	0.577	0.09
448_E	491_E	0.577	0.09
242_T	338_G	0.576	0.09
180_T	489_P	0.575	0.09
295_L	302_A	0.575	0.09
240_F	293_G	0.575	0.09
148_Q	381_Y	0.575	0.09
95_D	304_S	0.574	0.09
6_Y	27_E	0.573	0.09
139_E	383_L	0.571	0.09
333_N	338_G	0.569	0.09
180_T	220_G	0.569	0.09
16_V	187_Q	0.567	0.09
168_E	413_L	0.567	0.09
188_I	470_E	0.566	0.09
83_L	216_L	0.564	0.09
238_L	336_N	0.563	0.09
256_Y	310_L	0.560	0.09
430_L	467_L	0.559	0.09
38_K	462_Y	0.558	0.09
265_Y	272_G	0.557	0.09
89_T	189_L	0.554	0.09
230_V	294_C	0.554	0.09
183_F	242_T	0.553	0.09
83_L	333_N	0.552	0.09
421_D	427_L	0.552	0.09
225_L	284_S	0.552	0.09
130_P	405_K	0.551	0.09
57_M	280_S	0.551	0.09
16_V	23_I	0.550	0.09
396_Q	400_L	0.550	0.09
376_V	380_Y	0.550	0.09
34_E	312_T	0.549	0.09
50_D	291_I	0.548	0.09
82_L	159_L	0.548	0.09
78_R	448_E	0.547	0.09
188_I	405_K	0.546	0.09
318_I	331_V	0.545	0.09
154_F	282_Y	0.543	0.09
238_L	349_A	0.543	0.09
395_Q	425_D	0.543	0.09
290_A	293_G	0.543	0.09
120_M	326_G	0.542	0.09
362_G	481_I	0.541	0.09
302_A	460_S	0.541	0.09
172_F	356_P	0.541	0.09
53_F	428_K	0.541	0.09
175_G	310_L	0.540	0.09
19_G	266_L	0.538	0.09
74_Q	185_A	0.537	0.09
83_L	103_T	0.536	0.09
280_S	355_L	0.536	0.09
78_R	359_G	0.536	0.09
10_K	16_V	0.535	0.09
248_V	460_S	0.535	0.09
82_L	488_K	0.534	0.09
109_V	134_T	0.534	0.09
5_E	344_I	0.533	0.09
61_I	238_L	0.532	0.09
386_P	437_I	0.532	0.09
83_L	89_T	0.531	0.09
218_A	451_V	0.530	0.09
189_L	411_E	0.530	0.09
303_L	461_Y	0.530	0.09
36_P	379_L	0.530	0.09
261_F	324_N	0.527	0.09
211_A	285_A	0.524	0.09
33_L	268_A	0.524	0.09
242_T	273_S	0.522	0.09
195_E	310_L	0.522	0.09
76_G	168_E	0.520	0.09
278_V	283_P	0.520	0.09
170_A	406_Y	0.520	0.09
23_I	369_V	0.519	0.09
246_W	344_I	0.518	0.09
336_N	340_I	0.518	0.09
297_A	331_V	0.517	0.08
191_F	356_P	0.516	0.08
447_L	463_N	0.514	0.08
22_V	268_A	0.514	0.08
233_I	295_L	0.513	0.08
166_K	352_A	0.512	0.08
90_E	247_S	0.511	0.08
33_L	344_I	0.511	0.08
279_F	284_S	0.509	0.08
168_E	379_L	0.509	0.08
251_A	408_E	0.509	0.08
20_Y	181_Y	0.508	0.08
195_E	294_C	0.508	0.08
452_K	470_E	0.507	0.08
239_A	373_A	0.507	0.08
177_P	347_F	0.506	0.08
444_V	466_L	0.506	0.08
116_V	166_K	0.506	0.08
23_I	44_V	0.505	0.08
94_D	302_A	0.505	0.08
138_S	375_A	0.504	0.08
391_S	441_D	0.504	0.08
443_A	459_A	0.504	0.08
255_M	442_Q	0.504	0.08
407_E	486_K	0.502	0.08
313_I	359_G	0.501	0.08
16_V	330_A	0.501	0.08
366_L	414_N	0.501	0.08
154_F	301_V	0.500	0.08
445_S	456_K	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2nr9A	2	0.3669	100	0.809	Contact Map
4njnA	4	0.3491	100	0.81	Contact Map
2xovA	1	0.3471	100	0.815	Contact Map
1pc2A	1	0.2268	99.8	0.903	Contact Map
4i2zA	1	0.2387	99.7	0.914	Contact Map
1y8mA	1	0.2406	99.7	0.916	Contact Map
4ja7A	1	0.2426	99.7	0.916	Contact Map
2c2lA	1	0.2387	99.7	0.916	Contact Map
4gywA	2	0.2387	99.7	0.916	Contact Map
3upvA	1	0.2347	99.7	0.917	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0128 seconds.