YQCG - BACSU - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

YQCG - Ribonuclease YqcG

UniProt:	P45942	Sequences: MKVFEAKTLLTEAEKRAQEYKDLKSKMVKLKKAFKAVADLDDSEFSGKGANNIKSFYEDQAGIADQWIDLIEMKISFLTSIPGFLEDANLSDAYIEETFLAHELANAYTKSKSIMSEQKKAMKDILNDINDILPLDLFSTETFKNELSSAEKKRKEAIEKMDEVDQNLTSEYGLSEANEQMIQADYQALMNATAKGKSASPIHYNAKAYRDSEIHKMTEDVKKQSTDYISFKDQQAEQRRIAKEQEELANRPWYEKSWDAVCNFTGEVSGYYDYKRAADGVDPVTGEKLTAGQRVAAGAMAAAGYIPIVGWAGKLAKGGKAVYSTSKALYRADKALDVYKTPKTFHALQNSSKGLYGLASANGFSEAITGRDMFGNKVSKERQEQSLSGAMAMLVPFGARGINKKLNAKSSSRVSEASTNTSKKPKVPKTYKRPTYFRKGVRDKVWENAKDSTGSVKDPLTKQVMKKDEPWDMGHKPGYEFRKHQQSAMERNISRKQFLDEHNNPDHYQPELPSSNRSHKGEDMTDDYFGD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	531 (466)
Sequences:	177 (120)
Seq/√Len:	5.6

BACSU - YQCG YWQJ YEEF YOKI YOBL YXID

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
41_D	44_E	4.249	0.94
57_Y	143_F	3.616	0.87
121_A	127_N	3.148	0.78
78_L	85_L	2.926	0.73
318_G	335_A	2.909	0.72
456_V	466_K	2.831	0.70
15_K	82_P	2.815	0.70
426_K	431_Y	2.778	0.69
250_N	253_W	2.678	0.66
66_Q	93_A	2.589	0.63
12_E	37_V	2.446	0.58
442_R	446_W	2.430	0.58
468_D	471_W	2.390	0.56
121_A	128_D	2.370	0.56
446_W	450_K	2.282	0.53
89_N	164_V	2.280	0.53
466_K	470_P	2.266	0.52
124_D	127_N	2.215	0.50
123_K	134_P	2.185	0.49
440_G	456_V	2.184	0.49
420_N	428_P	2.127	0.47
415_S	419_T	2.107	0.47
78_L	204_Y	2.059	0.45
57_Y	93_A	2.053	0.45
331_R	335_A	2.040	0.45
471_W	474_G	2.039	0.44
424_K	430_T	2.034	0.44
432_K	440_G	2.031	0.44
470_P	474_G	2.026	0.44
34_F	78_L	1.999	0.43
446_W	474_G	1.977	0.42
451_D	454_G	1.974	0.42
458_D	465_M	1.962	0.42
467_K	474_G	1.947	0.41
349_Q	361_A	1.929	0.41
460_L	466_K	1.922	0.41
96_E	114_I	1.917	0.40
438_R	458_D	1.912	0.40
459_P	464_V	1.894	0.40
453_T	456_V	1.891	0.40
415_S	422_S	1.877	0.39
64_A	164_V	1.875	0.39
455_S	459_P	1.867	0.39
429_K	432_K	1.864	0.39
94_Y	222_K	1.861	0.39
335_A	361_A	1.849	0.38
461_T	465_M	1.840	0.38
451_D	460_L	1.813	0.37
121_A	134_P	1.786	0.36
438_R	453_T	1.774	0.36
334_K	337_D	1.772	0.36
448_N	452_S	1.761	0.35
129_I	138_F	1.760	0.35
467_K	470_P	1.755	0.35
427_V	452_S	1.753	0.35
448_N	458_D	1.740	0.35
422_S	431_Y	1.740	0.35
283_P	288_K	1.721	0.34
461_T	464_V	1.720	0.34
387_L	402_I	1.708	0.34
78_L	169_T	1.706	0.34
438_R	449_A	1.706	0.34
422_S	430_T	1.690	0.33
37_V	145_N	1.682	0.33
442_R	465_M	1.670	0.33
310_G	375_G	1.667	0.33
15_K	108_Y	1.663	0.32
430_T	434_P	1.656	0.32
448_N	460_L	1.656	0.32
464_V	467_K	1.656	0.32
439_K	448_N	1.648	0.32
465_M	471_W	1.645	0.32
455_S	464_V	1.630	0.31
450_K	468_D	1.629	0.31
440_G	451_D	1.615	0.31
436_Y	452_S	1.613	0.31
109_T	142_T	1.609	0.31
150_A	154_R	1.607	0.31
57_Y	84_F	1.605	0.31
461_T	467_K	1.601	0.31
422_S	434_P	1.592	0.30
319_G	337_D	1.581	0.30
440_G	444_K	1.580	0.30
440_G	445_V	1.576	0.30
319_G	380_K	1.573	0.30
456_V	471_W	1.566	0.30
457_K	467_K	1.551	0.29
450_K	454_G	1.548	0.29
450_K	458_D	1.535	0.29
386_S	406_L	1.534	0.29
361_A	378_V	1.527	0.28
461_T	474_G	1.520	0.28
441_V	447_E	1.516	0.28
116_S	145_N	1.514	0.28
301_A	305_Y	1.513	0.28
152_K	169_T	1.495	0.28
458_D	470_P	1.493	0.28
85_L	113_S	1.482	0.27
440_G	443_D	1.482	0.27
116_S	120_K	1.480	0.27
436_Y	441_V	1.478	0.27
121_A	143_F	1.475	0.27
423_K	430_T	1.475	0.27
430_T	437_F	1.468	0.27
452_S	458_D	1.467	0.27
452_S	468_D	1.466	0.27
313_G	318_G	1.461	0.27
415_S	424_K	1.451	0.26
318_G	331_R	1.445	0.26
444_K	468_D	1.443	0.26
454_G	458_D	1.442	0.26
459_P	465_M	1.440	0.26
436_Y	445_V	1.423	0.26
152_K	183_Q	1.418	0.26
85_L	164_V	1.408	0.25
351_S	366_E	1.406	0.25
442_R	460_L	1.395	0.25
425_P	432_K	1.393	0.25
149_S	183_Q	1.390	0.25
70_L	88_A	1.383	0.25
426_K	460_L	1.382	0.25
446_W	458_D	1.382	0.25
459_P	462_K	1.376	0.24
369_T	373_M	1.374	0.24
458_D	466_K	1.373	0.24
451_D	457_K	1.368	0.24
466_K	471_W	1.366	0.24
438_R	446_W	1.366	0.24
422_S	429_K	1.364	0.24
439_K	444_K	1.362	0.24
456_V	459_P	1.361	0.24
422_S	432_K	1.360	0.24
421_T	424_K	1.357	0.24
319_G	325_T	1.356	0.24
27_M	94_Y	1.354	0.24
120_K	127_N	1.345	0.24
450_K	471_W	1.330	0.23
430_T	442_R	1.319	0.23
354_G	357_G	1.316	0.23
463_Q	471_W	1.311	0.23
314_K	317_K	1.309	0.23
467_K	471_W	1.307	0.23
35_K	85_L	1.306	0.23
454_G	468_D	1.304	0.23
284_V	288_K	1.302	0.23
446_W	460_L	1.301	0.23
81_I	94_Y	1.294	0.22
249_A	254_Y	1.289	0.22
449_A	463_Q	1.287	0.22
416_E	437_F	1.286	0.22
256_K	287_E	1.282	0.22
128_D	144_K	1.280	0.22
258_W	261_V	1.278	0.22
452_S	459_P	1.272	0.22
438_R	447_E	1.270	0.22
313_G	317_K	1.266	0.22
118_Q	122_M	1.262	0.22
68_I	75_I	1.262	0.22
121_A	145_N	1.262	0.22
423_K	456_V	1.258	0.22
440_G	463_Q	1.250	0.21
441_V	465_M	1.249	0.21
445_V	463_Q	1.247	0.21
334_K	338_V	1.246	0.21
118_Q	139_S	1.244	0.21
438_R	466_K	1.241	0.21
464_V	470_P	1.237	0.21
449_A	457_K	1.235	0.21
444_K	447_E	1.232	0.21
128_D	145_N	1.230	0.21
118_Q	138_F	1.228	0.21
461_T	466_K	1.228	0.21
37_V	199_A	1.227	0.21
452_S	462_K	1.224	0.21
447_E	460_L	1.211	0.21
270_G	294_R	1.211	0.21
314_K	334_K	1.210	0.21
447_E	456_V	1.203	0.20
35_K	164_V	1.199	0.20
366_E	371_R	1.194	0.20
458_D	461_T	1.193	0.20
37_V	222_K	1.188	0.20
324_S	331_R	1.184	0.20
64_A	89_N	1.182	0.20
452_S	455_S	1.181	0.20
452_S	461_T	1.180	0.20
333_D	336_L	1.178	0.20
431_Y	434_P	1.171	0.20
321_A	324_S	1.167	0.20
355_L	363_G	1.164	0.20
118_Q	147_L	1.162	0.19
414_V	424_K	1.162	0.19
14_E	82_P	1.161	0.19
459_P	468_D	1.160	0.19
12_E	93_A	1.155	0.19
439_K	443_D	1.143	0.19
434_P	446_W	1.142	0.19
325_T	345_F	1.138	0.19
444_K	462_K	1.138	0.19
450_K	459_P	1.137	0.19
417_A	420_N	1.137	0.19
170_S	191_N	1.136	0.19
145_N	166_Q	1.132	0.19
118_Q	129_I	1.131	0.19
454_G	459_P	1.130	0.19
462_K	465_M	1.130	0.19
3_V	37_V	1.128	0.19
324_S	335_A	1.123	0.19
57_Y	133_L	1.115	0.18
436_Y	448_N	1.113	0.18
317_K	348_L	1.112	0.18
59_D	185_D	1.112	0.18
14_E	25_S	1.105	0.18
188_A	191_N	1.103	0.18
54_K	172_Y	1.102	0.18
37_V	52_N	1.102	0.18
130_N	143_F	1.100	0.18
429_K	456_V	1.088	0.18
78_L	108_Y	1.087	0.18
416_E	420_N	1.085	0.18
450_K	464_V	1.083	0.18
436_Y	456_V	1.077	0.18
143_F	146_E	1.073	0.18
46_S	74_K	1.072	0.18
279_D	288_K	1.070	0.18
328_A	339_Y	1.067	0.18
461_T	470_P	1.065	0.17
116_S	143_F	1.061	0.17
452_S	456_V	1.061	0.17
454_G	460_L	1.059	0.17
445_V	449_A	1.058	0.17
88_A	184_A	1.057	0.17
290_T	293_Q	1.057	0.17
446_W	459_P	1.057	0.17
449_A	456_V	1.056	0.17
250_N	260_A	1.056	0.17
457_K	463_Q	1.055	0.17
323_Y	327_K	1.053	0.17
430_T	445_V	1.053	0.17
440_G	446_W	1.052	0.17
423_K	431_Y	1.048	0.17
316_A	335_A	1.048	0.17
443_D	447_E	1.047	0.17
124_D	133_L	1.046	0.17
415_S	418_S	1.043	0.17
464_V	474_G	1.041	0.17
444_K	456_V	1.037	0.17
460_L	464_V	1.037	0.17
437_F	458_D	1.033	0.17
57_Y	121_A	1.033	0.17
130_N	134_P	1.033	0.17
313_G	324_S	1.031	0.17
251_R	254_Y	1.030	0.17
464_V	471_W	1.028	0.17
127_N	134_P	1.026	0.17
121_A	144_K	1.021	0.17
441_V	445_V	1.021	0.17
22_D	94_Y	1.021	0.17
377_K	380_K	1.019	0.17
286_G	289_L	1.017	0.17
143_F	155_K	1.013	0.16
442_R	445_V	1.011	0.16
454_G	461_T	1.010	0.16
452_S	460_L	1.009	0.16
436_Y	459_P	1.007	0.16
427_V	432_K	1.006	0.16
448_N	459_P	1.004	0.16
331_R	343_K	1.003	0.16
64_A	93_A	1.000	0.16
420_N	438_R	0.997	0.16
121_A	124_D	0.997	0.16
438_R	467_K	0.987	0.16
466_K	474_G	0.983	0.16
456_V	470_P	0.982	0.16
427_V	431_Y	0.981	0.16
169_T	191_N	0.981	0.16
448_N	461_T	0.976	0.16
431_Y	437_F	0.974	0.16
446_W	461_T	0.972	0.16
458_D	474_G	0.970	0.16
57_Y	66_Q	0.967	0.16
317_K	341_T	0.958	0.15
451_D	459_P	0.958	0.15
417_A	422_S	0.953	0.15
116_S	119_K	0.952	0.15
64_A	190_M	0.950	0.15
456_V	460_L	0.944	0.15
22_D	27_M	0.944	0.15
453_T	464_V	0.943	0.15
438_R	450_K	0.943	0.15
431_Y	440_G	0.942	0.15
463_Q	467_K	0.941	0.15
423_K	449_A	0.939	0.15
447_E	468_D	0.938	0.15
457_K	466_K	0.937	0.15
462_K	468_D	0.936	0.15
446_W	452_S	0.934	0.15
251_R	255_E	0.934	0.15
152_K	170_S	0.931	0.15
431_Y	445_V	0.931	0.15
431_Y	442_R	0.928	0.15
443_D	450_K	0.926	0.15
423_K	450_K	0.926	0.15
417_A	434_P	0.925	0.15
420_N	431_Y	0.923	0.15
277_A	281_V	0.923	0.15
337_D	348_L	0.921	0.15
436_Y	442_R	0.919	0.15
255_E	270_G	0.919	0.15
454_G	457_K	0.918	0.15
440_G	460_L	0.917	0.15
460_L	470_P	0.917	0.15
316_A	319_G	0.917	0.15
417_A	446_W	0.916	0.15
95_I	159_E	0.914	0.15
424_K	434_P	0.912	0.15
439_K	447_E	0.909	0.15
445_V	457_K	0.902	0.14
123_K	143_F	0.902	0.14
15_K	158_I	0.901	0.14
406_L	410_S	0.901	0.14
318_G	378_V	0.899	0.14
357_G	363_G	0.899	0.14
434_P	450_K	0.898	0.14
460_L	465_M	0.898	0.14
14_E	85_L	0.896	0.14
130_N	133_L	0.895	0.14
34_F	164_V	0.892	0.14
432_K	448_N	0.886	0.14
460_L	471_W	0.885	0.14
436_Y	444_K	0.885	0.14
376_N	381_E	0.883	0.14
440_G	465_M	0.881	0.14
418_S	422_S	0.880	0.14
252_P	264_F	0.878	0.14
465_M	474_G	0.877	0.14
460_L	468_D	0.876	0.14
451_D	467_K	0.876	0.14
432_K	446_W	0.872	0.14
464_V	468_D	0.872	0.14
445_V	450_K	0.872	0.14
453_T	467_K	0.871	0.14
459_P	471_W	0.870	0.14
455_S	461_T	0.868	0.14
284_V	324_S	0.868	0.14
10_L	21_K	0.868	0.14
424_K	441_V	0.867	0.14
75_I	201_P	0.865	0.14
84_F	141_E	0.860	0.14
436_Y	447_E	0.857	0.14
85_L	95_I	0.856	0.14
465_M	470_P	0.856	0.14
453_T	459_P	0.854	0.14
267_E	289_L	0.853	0.14
452_S	467_K	0.852	0.14
336_L	339_Y	0.852	0.14
430_T	450_K	0.851	0.14
12_E	94_Y	0.850	0.14
456_V	461_T	0.850	0.14
170_S	222_K	0.849	0.14
418_S	432_K	0.849	0.14
37_V	61_A	0.848	0.14
328_A	335_A	0.847	0.14
372_D	377_K	0.846	0.14
283_P	290_T	0.844	0.14
438_R	465_M	0.843	0.14
424_K	431_Y	0.842	0.14
438_R	442_R	0.840	0.13
455_S	470_P	0.840	0.13
425_P	456_V	0.839	0.13
453_T	466_K	0.837	0.13
440_G	447_E	0.837	0.13
34_F	70_L	0.836	0.13
468_D	474_G	0.831	0.13
358_L	375_G	0.826	0.13
313_G	331_R	0.825	0.13
431_Y	453_T	0.825	0.13
124_D	134_P	0.823	0.13
338_V	342_P	0.823	0.13
442_R	450_K	0.822	0.13
462_K	474_G	0.821	0.13
444_K	466_K	0.821	0.13
453_T	457_K	0.821	0.13
422_S	427_V	0.819	0.13
416_E	419_T	0.818	0.13
440_G	455_S	0.816	0.13
41_D	109_T	0.814	0.13
453_T	458_D	0.813	0.13
36_A	68_I	0.810	0.13
453_T	463_Q	0.809	0.13
438_R	448_N	0.809	0.13
434_P	454_G	0.809	0.13
450_K	457_K	0.809	0.13
129_I	147_L	0.809	0.13
185_D	204_Y	0.808	0.13
31_K	61_A	0.804	0.13
426_K	429_K	0.802	0.13
12_E	68_I	0.802	0.13
404_K	407_N	0.801	0.13
446_W	455_S	0.800	0.13
442_R	461_T	0.800	0.13
442_R	451_D	0.797	0.13
16_R	20_Y	0.796	0.13
37_V	170_S	0.793	0.13
108_Y	159_E	0.792	0.13
335_A	339_Y	0.792	0.13
172_Y	201_P	0.791	0.13
318_G	345_F	0.790	0.13
433_R	456_V	0.787	0.13
10_L	35_K	0.787	0.13
457_K	465_M	0.784	0.13
386_S	395_V	0.783	0.13
418_S	444_K	0.781	0.13
451_D	461_T	0.779	0.13
276_R	297_A	0.779	0.13
418_S	423_K	0.770	0.12
273_D	294_R	0.767	0.12
78_L	164_V	0.766	0.12
426_K	430_T	0.765	0.12
354_G	378_V	0.762	0.12
97_E	161_M	0.762	0.12
420_N	456_V	0.762	0.12
441_V	460_L	0.759	0.12
4_F	17_A	0.757	0.12
438_R	441_V	0.757	0.12
441_V	446_W	0.756	0.12
417_A	421_T	0.754	0.12
417_A	432_K	0.753	0.12
452_S	471_W	0.753	0.12
37_V	113_S	0.750	0.12
457_K	471_W	0.750	0.12
317_K	334_K	0.749	0.12
438_R	454_G	0.746	0.12
350_N	386_S	0.745	0.12
449_A	454_G	0.744	0.12
423_K	438_R	0.742	0.12
437_F	464_V	0.741	0.12
424_K	428_P	0.740	0.12
48_K	51_N	0.739	0.12
436_Y	461_T	0.739	0.12
451_D	466_K	0.736	0.12
432_K	436_Y	0.736	0.12
369_T	374_F	0.732	0.12
446_W	451_D	0.729	0.12
453_T	461_T	0.729	0.12
450_K	455_S	0.729	0.12
155_K	158_I	0.728	0.12
417_A	426_K	0.728	0.12
425_P	454_G	0.728	0.12
369_T	378_V	0.727	0.12
424_K	468_D	0.722	0.12
432_K	451_D	0.721	0.12
313_G	335_A	0.720	0.12
422_S	440_G	0.719	0.12
439_K	451_D	0.714	0.12
33_A	98_T	0.712	0.12
419_T	444_K	0.712	0.12
428_P	444_K	0.712	0.12
437_F	461_T	0.711	0.12
449_A	471_W	0.711	0.12
14_E	78_L	0.710	0.12
294_R	306_I	0.709	0.12
111_S	206_A	0.709	0.12
463_Q	468_D	0.709	0.12
415_S	434_P	0.707	0.11
46_S	89_N	0.705	0.11
36_A	94_Y	0.705	0.11
461_T	471_W	0.704	0.11
430_T	447_E	0.703	0.11
440_G	453_T	0.703	0.11
441_V	448_N	0.703	0.11
70_L	82_P	0.702	0.11
425_P	433_R	0.701	0.11
31_K	119_K	0.700	0.11
436_Y	458_D	0.694	0.11
418_S	445_V	0.694	0.11
441_V	459_P	0.693	0.11
433_R	446_W	0.692	0.11
335_A	376_N	0.691	0.11
392_A	395_V	0.690	0.11
450_K	460_L	0.689	0.11
350_N	362_N	0.686	0.11
421_T	431_Y	0.683	0.11
427_V	456_V	0.683	0.11
453_T	460_L	0.681	0.11
146_E	151_E	0.681	0.11
363_G	366_E	0.679	0.11
37_V	68_I	0.677	0.11
444_K	455_S	0.676	0.11
462_K	471_W	0.675	0.11
421_T	430_T	0.675	0.11
432_K	455_S	0.675	0.11
118_Q	130_N	0.675	0.11
68_I	159_E	0.673	0.11
430_T	438_R	0.673	0.11
428_P	432_K	0.671	0.11
436_Y	446_W	0.671	0.11
314_K	318_G	0.670	0.11
453_T	471_W	0.670	0.11
94_Y	137_L	0.665	0.11
116_S	144_K	0.665	0.11
323_Y	372_D	0.662	0.11
116_S	134_P	0.662	0.11
96_E	110_K	0.661	0.11
333_D	337_D	0.658	0.11
252_P	295_V	0.656	0.11
91_S	94_Y	0.656	0.11
426_K	438_R	0.655	0.11
390_A	407_N	0.655	0.11
419_T	423_K	0.654	0.11
459_P	470_P	0.654	0.11
421_T	425_P	0.654	0.11
57_Y	88_A	0.653	0.11
455_S	460_L	0.653	0.11
425_P	428_P	0.652	0.11
313_G	316_A	0.651	0.11
459_P	466_K	0.650	0.11
314_K	325_T	0.650	0.11
438_R	460_L	0.646	0.11
450_K	453_T	0.645	0.11
432_K	461_T	0.645	0.11
420_N	430_T	0.643	0.11
318_G	336_L	0.642	0.11
446_W	463_Q	0.641	0.11
313_G	323_Y	0.641	0.11
311_W	343_K	0.639	0.11
317_K	336_L	0.639	0.11
339_Y	362_N	0.639	0.11
424_K	449_A	0.639	0.11
25_S	51_N	0.638	0.11
414_V	431_Y	0.637	0.11
91_S	137_L	0.637	0.11
307_P	317_K	0.636	0.11
434_P	466_K	0.636	0.11
447_E	452_S	0.635	0.11
427_V	430_T	0.634	0.11
272_Y	286_G	0.633	0.11
120_K	130_N	0.630	0.10
423_K	454_G	0.630	0.10
85_L	89_N	0.627	0.10
21_K	148_S	0.627	0.10
4_F	46_S	0.627	0.10
54_K	118_Q	0.627	0.10
253_W	257_S	0.625	0.10
89_N	93_A	0.625	0.10
120_K	133_L	0.625	0.10
421_T	442_R	0.624	0.10
140_T	147_L	0.622	0.10
428_P	431_Y	0.621	0.10
312_A	315_L	0.621	0.10
82_P	108_Y	0.621	0.10
440_G	457_K	0.620	0.10
447_E	455_S	0.620	0.10
453_T	468_D	0.618	0.10
418_S	438_R	0.617	0.10
452_S	465_M	0.615	0.10
443_D	448_N	0.615	0.10
417_A	423_K	0.612	0.10
50_A	54_K	0.611	0.10
296_A	299_A	0.610	0.10
437_F	454_G	0.608	0.10
425_P	438_R	0.607	0.10
278_A	315_L	0.606	0.10
443_D	454_G	0.605	0.10
419_T	424_K	0.603	0.10
78_L	88_A	0.601	0.10
433_R	465_M	0.601	0.10
78_L	89_N	0.600	0.10
460_L	463_Q	0.599	0.10
430_T	436_Y	0.599	0.10
430_T	444_K	0.598	0.10
143_F	147_L	0.598	0.10
429_K	474_G	0.597	0.10
443_D	451_D	0.597	0.10
459_P	463_Q	0.595	0.10
44_E	198_S	0.595	0.10
413_R	446_W	0.594	0.10
318_G	376_N	0.594	0.10
445_V	474_G	0.593	0.10
448_N	453_T	0.593	0.10
331_R	337_D	0.591	0.10
94_Y	134_P	0.590	0.10
439_K	454_G	0.590	0.10
457_K	461_T	0.590	0.10
78_L	82_P	0.589	0.10
455_S	465_M	0.588	0.10
144_K	202_I	0.587	0.10
424_K	456_V	0.587	0.10
446_W	465_M	0.585	0.10
451_D	456_V	0.583	0.10
449_A	466_K	0.582	0.10
36_A	109_T	0.582	0.10
327_K	336_L	0.581	0.10
450_K	474_G	0.581	0.10
434_P	474_G	0.581	0.10
333_D	340_K	0.580	0.10
36_A	64_A	0.579	0.10
451_D	455_S	0.576	0.10
321_A	332_A	0.574	0.10
458_D	464_V	0.573	0.10
91_S	119_K	0.572	0.10
318_G	361_A	0.571	0.10
462_K	470_P	0.571	0.10
431_Y	446_W	0.571	0.10
31_K	79_T	0.570	0.10
418_S	456_V	0.569	0.10
323_Y	331_R	0.568	0.10
427_V	439_K	0.566	0.10
444_K	453_T	0.565	0.10
422_S	459_P	0.565	0.10
444_K	459_P	0.564	0.10
331_R	347_A	0.564	0.10
358_L	369_T	0.563	0.10
380_K	383_Q	0.563	0.10
424_K	427_V	0.562	0.10
448_N	464_V	0.562	0.10
8_T	82_P	0.561	0.10
445_V	465_M	0.561	0.10
439_K	461_T	0.560	0.10
439_K	455_S	0.558	0.10
451_D	470_P	0.558	0.10
235_Q	244_E	0.558	0.10
447_E	451_D	0.555	0.10
373_M	378_V	0.555	0.10
21_K	156_E	0.554	0.10
430_T	448_N	0.554	0.10
324_S	333_D	0.554	0.10
271_Y	284_V	0.552	0.10
105_A	146_E	0.550	0.09
337_D	340_K	0.550	0.09
451_D	465_M	0.549	0.09
386_S	407_N	0.548	0.09
418_S	449_A	0.547	0.09
319_G	341_T	0.546	0.09
32_K	150_A	0.545	0.09
107_A	207_K	0.545	0.09
149_S	155_K	0.545	0.09
3_V	52_N	0.544	0.09
319_G	323_Y	0.544	0.09
123_K	133_L	0.542	0.09
313_G	336_L	0.540	0.09
434_P	440_G	0.540	0.09
455_S	474_G	0.539	0.09
260_A	265_T	0.539	0.09
418_S	434_P	0.539	0.09
437_F	456_V	0.538	0.09
37_V	188_A	0.538	0.09
429_K	448_N	0.538	0.09
423_K	426_K	0.538	0.09
442_R	453_T	0.536	0.09
434_P	445_V	0.535	0.09
422_S	426_K	0.535	0.09
334_K	347_A	0.535	0.09
446_W	466_K	0.534	0.09
313_G	321_A	0.532	0.09
359_A	363_G	0.532	0.09
68_I	93_A	0.532	0.09
372_D	376_N	0.531	0.09
427_V	437_F	0.530	0.09
59_D	204_Y	0.529	0.09
438_R	470_P	0.529	0.09
54_K	201_P	0.529	0.09
436_Y	470_P	0.528	0.09
447_E	459_P	0.527	0.09
37_V	116_S	0.526	0.09
442_R	454_G	0.526	0.09
377_K	381_E	0.523	0.09
449_A	452_S	0.522	0.09
423_K	442_R	0.522	0.09
458_D	468_D	0.522	0.09
438_R	452_S	0.520	0.09
450_K	462_K	0.520	0.09
432_K	437_F	0.519	0.09
454_G	474_G	0.518	0.09
134_P	140_T	0.518	0.09
438_R	443_D	0.517	0.09
424_K	443_D	0.517	0.09
95_I	220_D	0.517	0.09
421_T	466_K	0.517	0.09
449_A	455_S	0.516	0.09
336_L	340_K	0.515	0.09
426_K	462_K	0.515	0.09
440_G	448_N	0.514	0.09
46_S	70_L	0.514	0.09
89_N	108_Y	0.513	0.09
323_Y	339_Y	0.512	0.09
446_W	454_G	0.512	0.09
417_A	433_R	0.512	0.09
421_T	456_V	0.511	0.09
336_L	376_N	0.511	0.09
434_P	464_V	0.510	0.09
317_K	327_K	0.509	0.09
460_L	474_G	0.507	0.09
447_E	453_T	0.507	0.09
385_Q	463_Q	0.504	0.09
417_A	465_M	0.503	0.09
457_K	460_L	0.502	0.09
392_A	405_K	0.502	0.09
430_T	467_K	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3kwoA	6	0.2712	81.5	0.97	Contact Map
2bk6A	6	0.2787	80.6	0.97	Contact Map
4m32A	6	0.2938	80.2	0.97	Contact Map
1jigA	6	0.2618	79	0.971	Contact Map
1o9rA	6	0.2957	78.1	0.971	Contact Map
3iq1A	6	0.2844	78	0.971	Contact Map
2chpA	6	0.2712	77.6	0.971	Contact Map
2yjkA	6	0.2881	77.2	0.971	Contact Map
1ji5A	6	0.2599	75.5	0.972	Contact Map
2fjcA	7	0.2806	75.5	0.972	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.013 seconds.